1M5EA

X-ray structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with acpa at 1.46 a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Structural Basis for AMPA Receptor Activation and Ligand Selectivity: Crystal Structures of Five Agonist Complexes with the GluR2 Ligand-binding Core
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-07-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5eA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1m5eA01
3TCGA 3RY3A 5I56B 2NXOA 4IO5A 1AL3A 1EU8A 3O9PA 5DYHA 5JK4A 1BLFA 3E9XA 4F1VA 2H9BA 1II5A 3B6WA 2NUVA 4GQOA 4AB6A 1OVTA 3CVGA 3O6GA 3G3IA 2DP8A 4GL0A 2HXWA 4JXIA 1A55A 1B5HA 1VE4A 2B3BA 1LSTA 2F6PA 2RF1A 2ESNA 2XXHA 5H8HA 3MUQA 3OXNA 1PEBA 5H8QA 3LSWA 4EUOA 1MS7A 4O3AA 4RYAA 2ALUA 3GBAA 2VD2A 4JSDA 4EQ7A 5EHMA 5H8QB 4ZE9A 3CR9A 1MY3A 3I6VA 2E1SA 2H5YA 5I57B 4IO7A 4EDPA 1FQDA 2DWIA 2Z8EA 3R26A 2O68A 4NEDA 2A5SA 3K6UA 4ELPA 1AMFA 4R9GA 3IAZA 1B1HA 1H76A 4NF5B 1PB7A 5CMMA 5DEXA 3MZ9A 4ECFA 1MDP1 2ANJA 3IO4A 3ZSFA 1P1OA 1SBPA 1H45A 2ONSA 4RA1A 3MVZA 1Y3PA 4F1UA 3KBRA 3IB2A 1Y3QA 2CZLA 3C4MA 2V25A 3EN3A 4PFYA 4H67A 4P0GA 2HZLA 4QSDA 4L17A 5CMCA 1LB8A 2AL4A 3MWBA 3FIRA 4QHQA 2DQVA 1IEJA 1Z7ME 4OMBA 4LQ2A 2Q8JA 3KJ7A 1MY0A 4OWDA 5H8NB 2DE4A 3HV1A 4F3BA 3T96B 3K4UA 1MPCA 3BFTA 1XHYA 4ZEKA 3UN6A 3CSGA 1UIUA 1FQFA 1IXIA 3HCQA 3T93B 3SESA 2GH9A 4AB5A 4DDDA 2XXTA 3FV1A 2ZYNA 3IL1B 1ZKBA 4H1XA 1QW0A 4KD5A 1J1NA 4OXVA 4NE4A 3CI8A 4H0WA 3MW0A 3KN8A 1HSJA 5CBRA 4IO3A 3EF7A 5DVIA 3PGFA 1MY2A 4KYDA 4OFLA 4I62A 4KFQA 4YKIA 2XX7A 4QSCA 5H8FA 3TFLA 1B4ZA 2GHBA 2F97A 1QVSA 1EZPA 1P1WA 2F7BA 4IB2A 2I3WA 2I3VA 2V3UA 3U72A 3QUJA 5H8FB 3RUMA 2F7AA 3KSJA 1B7UA 3OO9A 4BDOA 4GF8A 1LAXA 4PE5B 5KCJA 5M2VA 2G29A 2QJEA 3H3GA 3MC2A 4EF2A 1FTMA 3E3KA 2XX9A 4YAHX 3Q29A 4HTGA 1URDA 1IXHA 3RTFB 1N3WA 2PYYA 2DXRA 5KCJB 1JVXA 3E13X 2M8CA 4ZEDA 3N5LA 1QKBA 2RC9A 1MH3A 2Z8FA 3VV5A 3FJGA 3AXFA 3U94A 1SW1A 5A5XA 4MLVA 2RINA 3VVDA 1Y1MA 4F3GA 4F18A 1UIVA 4KHZE 1S9TA 1PBPA 4F29A 4U1OA 4R2FA 3S9NC 3LUYA 3MP8A 2HAVA 4RPOA 5AA2D 5A5XB 2O7UA 3PD9A 1JETA 2XXRA 1NNKA 1JVYA 4DE8A 1H3DA 2R71A 1SI1A 2ZYMA 3FUZA 3TEPA 4R73A 4JSOA 3VXBA 2H4IA 1RYOA 4GOTA 4LZ8A 2RCAA 4ND9A 2AL5A 3OO7A 2IEEA 3Q26A 5TPAA 3BBRA 1P1UA 3FASA 5L9MA 3CFLA 3ODBA 2QMXA 4I1DA 5L9OA 1B52A 1JW5A 1QJMA 1B2HA 1IQ7A 1Q35A 3K2DA 1B3HA 2OJTA 3EQ1A 4NF8B 1NKXA 1NNTA 3D4CA 4FECA 4I9DA 1MM7A 3K1PA 3T9HB 5BUUA 4GVOA 3SETA 3FVGA 3TTRA 2AIXA 4MBPA 3L6HA 4TLLB 4F31B 1DTGA 2PT1A 4QFKA 4TOZA 3RNNA 3T9VA 3MPKA 1QULA 3S9MC 1B5IA 3T66A 4FAJA 4QFPA 3ONMA 3MP1A 3LR1A 1MXZA 1QKAA 1FTLA 3TPAA 1LFHA 1XVXA 3LC8A 4OQOA 1PB8A 4O3BA 3B6QA 1ELJA 1FCKA 4OTEA 5CRYA 5AA2B 3K00A 1LGBC 1A40A 4OZ9A 2F7CA 1P99A 3DELB 3W9WA 1IUDA 4RK9A 2OK2A 1ATGA 1HSLA 3RPWA 1A99A 1M5FA 2YPNA 4XKPA 1OIBA 1I6AA 4C1UA 1MQHA 2PT2A 2RC7A 1UQWA 4F3SA 3OD7A 1LB9A 1MQGA 5DVFA 5LOMA 5JEIA 5I2KB 1FQBA 3O28A 3EHSA 3TCFA 4FATA 2NVUB 1SYIA 2I58A 2KLFA 3PPQA 4XKRA 1GV8A 3H06B 3K01A 3S9LC 3T9XB 3KJTA 2XXPA 3EHTA 1B6HA 2XHDA 4C1TA 2H99A 3H6TA 3A3CA 1SDXA 1OMPA 4GXSB 4MF3A 1Y9UA 3Q28A 1D3KA 5AA3A 2I4BA 4RJZA 3CFXA 3V83A 4GLIA 2UVJA 3DP6A 3C35A 2NOOA 4DXUA 1R1NA 1YCJA 4R6KA 1M5CA 3VLWA 1Q1KA 3N94A 1N0TA 3ILTB 4TQUQ 1LBBA 4OERA 1O7TA 5CBSA 2Z23A 1PC3A 3MBPA 4R72A 2UYFA 3IOTA 1M5DA 1P1NA 1TFAA 5H8SA 3OEMA 2R9JA 2XXUA 4G77A 5H8HB 1LFGA 1XS5A 3LSLA 2XXYA 4FORA 4GWOA 2F35A 3B7DA 1MXXA 2ZXTA 3KZGA 1OQHA 2GFEA 2DXYA 2A5TA 3FZVA 4OEVA 4XTCQ 1GR2A 5JTYA 2Q9TA 1LAGE 4BDLA 5ISUA 2I48A 1DPEA 4TLMB 2A5TB 1PBQA 4AQ4A 1DOTA 3F11A 5I58A 3GXAA 1ZTYA 1B51A 3CFZA 1QUIA 5JTYB 2ZNSA 4RK2A 1B05A 3PUVE 1AH5A 3O6IA 3H6UA 5IKBA 1GTKA 3FV2A 1N7WA 4X48A 3FVNA 5DEXB 4F2OA 4FEDA 2DWJA 4R74A 4GRKA 3TQLA 3U1OA 5I58B 3A09A 1SYHA 1MM6A 5TP9A 3IB1A 4LZ7A 3SERA 3OENA 1UTHA 3RTWB 1OQGA 1TT1A 4ZEFA 3PMWA 2Z8DA 1LBCA 2UXAA 1ZIUA 5L9SA 1EH3A 3MVWA 5TP9B 3L6GA 1MXUA 3OMBA 5CC2A 1POTA 1UTHB 4DCXA 2DYXA 4M1VA 3QUFA 3DP8A 3PV0E 1BKAA 1AOVA 2XD2A 5L8DA 3Q27A 1LCFA 4QFOA 5ICQA 3E4RA 4G68A 2O7IA 5B7DA 3HO7A 1OLAA 3DP4A 2XXVA 4U21A 2F78A 3SEYA 4OFJA 4I8CA 3KN7A 3PU5A 5AA1A 1UTBA 1B46A 4MFIA 3GLBA 4IY5A 2DE2A 3M3LA 3FJMA 1R9QA 1NNPA 5ITOA 3JZJA 4G68B 1Y20A 1S7YA 1VFDA 3KGCA 2XXWA 2QRYA 3W9VA 3G3JA 2I6EA 4RNSA 3CSBA 1POY1 1AIVA 4R2BA 4R6HA 3MAMA 3C32A 1XOCA 1UTBB 3K02A 5KDTA 4ZEBA 4HCYA 4F2QA 1D9VA 4E0XA 2VGQA 3R6UA 2XXXA 1WVJA 2UVIA 3SEUA 4XKQA 4GD5A 3RGYA 3G3HA 4ESWA 3H7MA 2XXQA 5FTIA 1SI0A 3DM0A 1NNFA 5FHNA 5I2NA 1WDNA 3IOWA 5I59A 4QRZA 4QSEA 3FD3A 3KN3A 4X9TA 1LCTA 4M4GA 2QS4A 2QL3A 1SW2A 3KOTA 3TTMA 1T0KA 3HHGA 5I2NB 3VFJA 1H43A 4H6DA 3SEWA 5I59B 4NWDA 1GVCA 2D3IA 4F22A 5EYFA 2OBGA 1S50A 1B5JA 4YMBA 2ZYOA 3THIA 3OO6A 3ZS6A 5HPQA 1PDAA 4MLQA 1URSA 3TAJA 1B1XA 4F1YA 2PX1A 3RLFE 2F8DA 2IA4A 1SW5A 2RCBA 3S2VA 5HM4B 4FIMA 1MQDA 4K3FA 2V3QA 4N13A 3O29A 3TELA 1D9YA 1JNFA 2W7YA 2G93A 3PUXE 1XT8A 2DOJA 3PUZE 3TZAA 3IB0A 4JWYA 4QFLA 1B58A 4Q30B 3K1NA 3G7WA 5CMKA 5FHMA 4NWCA 3QK6A 1SQYA 3C31A 3K1MA 1MG1A 2DWHA 3O6HA 3FXQA 1US5A 4POWA 2LAOA 2O1LA 3H4ZA 1B3EA 3OSQA 5CMBA 2PVUA 3VLVA 1ANFA 3WAEA 2GHAA 2PBWA 1QUJA 2XXIA 4ISUA 1JW1A 4FJPA 2WKYA 3C34A 2UYEA 3HHFA 1MRPA 5F1QA 5TPAB 3SEXA 2QSXA 4OHNA 5TU0A 4ELRA 4X1BA 4Q0CA 1TXFA 1MH4A 4BDRA 3ILUB 2DWAA 3TCHA 4O3CA 3MP6A 1OVBA 1FQEA 2Y7WA 1VR5A 4KQPA 4G8NA 4ZDMA 4ZZAA 2B3FA 4MH5A 4H5FA 3N26A 3TKDA 4U2RA 1B9JA 4PFTA 4U1ZA 4WEPA 3R7XA 3O2AA 3MZ1A 4G8MA 1F9BA 2O84X 4XIGQ 3PMXA 3KG2A 4YB5A 4EXKA 1IXCA 4BDQA 4OVJA 3PPOA 1A54A 3C36A 4X1DA 3U93A 4WXJA 2ZNUA 3P7IA 3RN8A 5DT6A 4GIZA 2VP1A 4G2ZA 2Y7PA 1FTKA 1LAHE 3C9HA 3LSFB 5FHOA 2UVGA 4ZEIA 2Q88A 3IOVA 2OCUA 1BIYA 4DCYA 2Q2AA 2YLNA 2NWJA 2QPQA 3PD8A 1I69A 2F34A 1WODA 3I5OA 1CB6A 2D5WA 3TTNA 5B70A 3D4GA 4R75A 1MY1A 3M3FA 1L5TA 4IGRA 2VD3A 4U23A 3MQ9A 1ZLQA 1JEUA 4HCWA 3N6TA 4DXBA 3RT8A 3VDFA 4RPNA 3CIJA 3FJ7A 3OSRA 3U8QA 4ZE8A 2DE3A 4IGTA 1US4A 4ELQA 3SEVA 3G3FA 3FXUA 3FXRA 1BP5A 4R9FA 5ICTA 4YB6A 3JV9A 3OEKA 4GL8A 1N84A 3TUSA 3OO8A 4OEUA 2QMWA 2HQ0A 4NMYA 3SKPA 1M5EA 2I49A 2ZYKA 2ZMBA 2UVHA 2ABHA 1A8EA 3TMGA 2Y7RA 3O66A 4H65A 4H8IA 2X7QA 2FYIA 1Z7NE 3M3KA 3TODA 3MJNA 4PFWA 3PUWE 2HAUA 1B3GA 4BDNA 2ZNTA 4G68C 1M5BA 1MQIA 3USDA 1CE2A 4P0IA 1FQAA 2D21A 1NH7A 5I57A 1VFEA 4JB7A 3S4UA 4U4XA 2X7PA 3VE1B 3HSTA 1A7LA 2FNCA 4LVQA 4THIA 2HEUA 3V5AA 4NF5A 3FVOA 3PPNA 4EXLA 1ZMGA 4YMAA 4Q5TA 3TDJA 1NMUA 2P0SA 3VVFA 4YZZA 4YICA 2I0BA 3ZKKA 3V89B 1MXVA 1LFIA 1JW4A 3IO6A 4KPTA 1EZOA 3RQTA 1N76A 1DMBA 2AYSA 1B4HA 1IITA 1ZBMA 4PQJA 2HFBA 2OLBA 3I3VA 3JYRA 1RKMA 2QS1A 3IR1A 4XKNA 2VHAA 4OENA 1SVXB 2F5XA 1USYE 1DTZA 1N7XA 2H98A 4H8JA 4KYSA 5IAIA 1FQCA 2PMSA 2RC8A 2GRVA 3KOSA 1URGA 5F7VA 2O51A 3TQWA 4R6YA 1OLCA 5H8NA 3UORA 4XXUA 4KCCA 1B3FA 2R6GE 3A3UA 3K6WA 5ELVA 3ECRA 3EPEA 1MXWA 2H25A 1P1QA 2DVCA 3PMVA 3IJOB 4H5GA 2REJA 3TTKA 3IJXB 4IO6A 3FVKA 5AA4A 2Z22A 1XC1A 4UACA 3VVEA 1B3LA 1LLSA 2E0SA 4U4SA 3QIMA 3G3KA 1HSEA 1I6QA 2F6GA 1LAFE 5ITPA 3MZBA 1Y4CA 4HW8A 5AA4B 4RY1A 4E0WA 3MPLA 4PFUA 3IK6B 2DSFA 2RKMA 3T9UA 4YKJA 3M8UA 4PETA 1B32A 4Z0IA 3HN0A 3K6VA 3T22A 5DVJA 1RYXA 1PB9A 5KDTB 3DLNA 3K6XA 3N6UA 4OETA 1MPDA 2V84A 3CG1A 4JDFA 5EHSA 1O64A 1NL5A 4KR5A 1B7ZA 4Z7EA 3OOAA 3IORA 2Y84A 2BJJX 4LZ5A 4IY6A 3MVXA 4ZZEA 3O97A 1R6ZA 1ZJLA 3ZKLA 4HS7A 4YU0A 4ELOA 3W15C 5K2XA 3BFUA 3C33A 3LSXA 1NFTA 4UA8A 3KEIA 4FEBA 1Y3NA 4DZ1A 4IO2A 1XVYA 4KYEA 2HZKA 1FTOA 3PUYE 4GXAA 2OWTA 2YJPA 2HCAA 2XD3A 1N04A 3B6TA 2I4CA 1I6BA 3V8XB 1VSOA 2DS9A 1ZU0A 5HBCA 5DTBA 3VXCA 4RXLA 1NH8A 2OWSA 4POXA 4QFNA 4F39A 2F36A 2ONKE 4LATA 1N3XA 2DVZA 1MDQA 3KSXA 2Q2CA 4ZECA 1YAEA 1JEVA 3QXMA 2QS2A 4OYVA 3UP9A 1SD3A 4IO4A 4GFRA 5FTHA 4ZS9A 3H6WA 5BWJA 4U22A 4LP2B 4OFOA 4N6PA 1MQJA 4FE8A 2V93A 5K2YA 4JWOA 4C0RA 1JQFA 3OELA 3H03A 1IIWA 3G3GA 1Y4TA 3IX1A 1MXYA 1D4NA 2O1MA 3WAFA 4NF8A 3UGWA 5KZTA 3KFMA 1O63A 5AE4A 1B0LA 3QAXA 4NF4A 5J1DA 4LA9A 2Q89A 3EHUA 3BKIB 4YB7A 3K0VA 3HPIA 4P11A 4N07A 3PPPA 3QSLA 1YPNA 4DXCA 4LQ5A 2V3TA 3QYTA 4NF4B 4ONYA 3S9EA 4G8HA 4DIGA 1H44A 2XX8A 1DPPA 2ONRA 4NF6A 4DLDA 1KWHA 4EF1A 4KI0E 3IOUA 1QUKA 2B65A 2QS3A 3FATA 3Q25A 4BDMA 1IZ1A 3VLUA 4LONB 2CMOA 3UIFA 4NF6B 5I84A 2Y7KA 2O69A 3CG3A 1IXGA 5AA2A 1DSNA 1A8FA 4YKPA 3UA8A 2P2AA 2I0CA 1R9LA 2FA7A 2VOZA 2OZZA 3LBSA 1TWYA 2X26A 1TFDA 4QF9A 3MVYA 3PPRA 3H6VA 4LUBA 3UK4A 1B7HA 4F19A 4YKKA 1MY4A 4PP0A 1Y1ZA 5I2KA 3SDFA 2P1SA 3GZGA 4EQBA 3TYHA 1GGGA 1MPBA 1BTJA 1SW4A 1B0HA 3CRBA 2REGA 4WKMA 3FGSA 1USYH 4BLAA 4ESXA 3RT6B 5CM6A 1FTJA 2Y7IA 4JBZA 2THIA 3U92A 1B40A 5I56A 4KCDA 1YTVA 5CI5A 4G4PA 4OESA 4EQ9A 2O6AA 3GBBA 4WEDA 4Q8RA 4F3PA 1FW0A 3TTLA 4NTLA 1EZ9A 4JWXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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