The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
17
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3CCQ Q; 1VQK Q; 3CCL Q; 1Q86 R; 1KD1 R; 3G71 Q; 1K9M R; 3CC7 Q; 2QA4 Q; 3CMA Q; 1YIT Q; 3G4S Q; 1QVF P; 3CCJ Q; 1KQS P; 1VQM Q; 1K73 R; 2QEX Q; 1YIJ Q; 1KC8 R; 1VQ6 Q; 1YI2 Q; 1QVG P; 1VQL Q; 1VQN Q; 3CD6 Q; 1Q81 R; 3CME Q; 3CC4 Q; 1M1K R; 3CPW P; 3CCU Q; 3I56 Q; 1VQO Q; 3CCE Q; 3CCV Q; 1N8R R; 1VQ5 Q; 1M90 R; 1W2B P; 2OTL Q; 3CCR Q; 1YJW Q; 3I55 Q; 1VQP Q; 1VQ7 Q; 3CC2 Q; 1JJ2 P; 1Q7Y R; 1Q82 R; 3CCS Q; 2OTJ Q; 1YJN Q; 1VQ9 Q; 1VQ8 Q; 1VQ4 Q; 1YJ9 Q; 1S72 Q; 3G6E Q; 3OW2 P; 3CXC P; 1YHQ Q; 1NJI R; 3CCM Q; 1K8A R; #chains in the Genus database with same CATH topology 4M78 G; 2IG0 A; 4DBR A; 2QQB A; 4C5G A; 4CC3 A; 3G4S Q; 4C92 A; 2JS0 A; 2O4X A; 3JCM V; 1I07 A; 2P0P A; 3QO3 A; 4M7D C; 2AKL A; 1MUZ A; 2F69 A; 1NYG A; 3CME T; 1PKT A; 1FXX A; 2JTE A; 5GAO n; 4KBM B; 4R55 A; 4JJN K; 2YRV A; 4PJO D; 3FJ5 A; 3EG9 B; 1AVZ C; 2K3X A; 5I2M A; 2R58 A; 1YIJ A; 1Q7Y C; 1VQN A; 4B9W A; 1KIK A; 4E7Z A; 4LXC A; 4M77 D; 1K8A R; 2L3Q A; 2J6F A; 1HD3 A; 2C06 A; 2BTT A; 2KYB A; 1U1S A; 5HK0 A; 5GMK j; 5GAN 6; 2FG0 A; 2L3S A; 2VB6 A; 2XU8 A; 3DB3 A; 4ZTJ A; 5GAM f; 1RAG B; 4BUG A; 1OV3 A; 4XU0 A; 2J7I A; 4V2S A; 1T3L A; 2D8J A; 4AT1 B; 1GCQ A; 2DL3 A; 1CKB A; 3CD6 A; 3M4Y A; 3SB2 A; 3E19 A; 1RLQ C; 3SWN A; 3FRN A; 2EAY A; 3RMQ A; 1D0X A; 3NTK A; 1VQP A; 2YDL A; 3O5Z A; 1WFW A; 1YJ9 A; 2O31 A; 2HSP A; 3EGU A; 2LT1 A; 1PRL C; 5CAI A; 1UGP B; 1NE8 A; 3OBY A; 1UEB A; 1VIE A; 1AT1 B; 4C92 G; 2LZ6 B; 4IUQ A; 2EIF A; 4PJO F; 1BI2 A; 4DOV A; 2DXC A; 4PLI A; 2K9G A; 1VQ9 Q; 1Y7X A; 1SG5 A; 3C95 A; 4M77 F; 1IGQ A; 2RJD A; 2HDA A; 3OSS C; 1GFC A; 5GAN e; 1KC8 R; 3LWH A; 3M54 A; 2VAS A; 4J7F A; 1VQL T; 3UF4 A; 1Z9Z A; 1WJR A; 2EGC A; 1D1C A; 2QG9 B; 1QCN A; 2QDY B; 2XKO C; 3OYF A; 4JJC A; 5A0D A; 4M7A B; 4DOW A; 5LJ5 h; 5KYY B; 1RAA B; 1GBR A; 2R5M A; 3CCS A; 2JMC A; 4RTV A; 4XU3 A; 3VU3 C; 5LL6 S; 2ED0 A; 1YIJ T; 3KXT A; 2BE9 B; 1VQN T; 4M7D E; 4IUP A; 3RIR A; 1C0M A; 1VQK A; 2FPF A; 2QA4 A; 2L3P A; 3H0H A; 2KVQ G; 1R0C B; 2D6F A; 1MNE A; 4D6W A; 1XJW B; 5LJ5 g; 3RNJ A; 2PUK B; 2RQW A; 4IUT A; 1D1A A; 2XG8 D; 1BB9 A; 2KRN A; 2L5Q A; 1RAI B; 5KYW B; 2EQM A; 3CD6 T; 1G5V A; 4DQ2 A; 2DFU A; 1K4U S; 5IHK A; 3V7R A; 3EGX B; 1AD5 A; 1VQP T; 3RKX A; 1BYM A; 3HHT B; 1RAE B; 2ESW A; 2E12 A; 1M1K U; 1ZUY A; 3I56 A; 4C8Q A; 1SSF A; 2KRO A; 5HKC A; 4HVW A; 4Z8A A; 4ZGD B; 3JCM f; 3CMA Q; 3MO8 A; 2RH2 A; 2COW A; 2QTX A; 2ZPI B; 3RER A; 4DBQ A; 1JQQ A; 3CCE Q; 4QVD A; 1J3T A; 1TTH B; 2QQS A; 3OMG A; 2WSE E; 5GJW B; 2BZY A; 3OW2 P; 3V7S A; 2AKK A; 1X2K A; 2AIR B; 3FB9 A; 3L2U A; 5KH6 A; 3ZBD A; 2H8H A; 2KBT A; 4B9X A; 4DBF A; 1YWP A; 1Q86 U; 1JB0 E; 4XTW A; 4M75 A; 1X27 A; 5LJ3 d; 3A5Z B; 3CCS T; 2FZK B; 2KNB B; 1QLY A; 1VQK T; 1UGV A; 2F5K A; 1WIE A; 2QA4 T; 4RTX A; 5LJ3 e; 3FLG A; 3MEU A; 2GQI A; 4OMO A; 3OYK A; 3H0F A; 2DBM A; 5A0G A; 5HCK A; 3V8K A; 2M1H A; 2MMP A; 2E10 A; 5CQX A; 4C5I A; 4J6X A; 2RD1 A; 4VUB A; 4E7L A; 4BI3 A; 2RJC A; 1LOJ A; 3REA B; 2DM1 A; 4C0G A; 1OQK A; 3OW2 S; 5CCA A; 4XTX A; 3RES A; 1UFF A; 2FPE A; 2QEX Q; 1MV3 A; 2C0I A; 1KD1 U; 3I56 T; 2K7A A; 3A8L B; 3JCM W; 3H8Z A; 1JJ2 P; 5DLO A; 2JM9 A; 1YJN Q; 1WHK A; 2JTM A; 1MND A; 2CGH A; 4F7U G; 2E65 A; 1UUE A; 1YJW A; 1ABQ A; 1WDX A; 4CI0 C; 3L42 A; 4WCI A; 1ARK A; 3LX7 A; 2RHU A; 4MDX A; 4A54 A; 3N5B B; 3CCR Q; 2RJF A; 2JM8 A; 2HBP A; 4AFU C; 3EAE A; 5GAM h; 3UA7 A; 3P8B B; 4OMN A; 5CKD A; 2HAX A; 4HXJ A; 2JVV A; 2GQV A; 1K9M C; 3OYN A; 3MJX A; 3M5A A; 1NJI U; 3EH2 A; 1OPK A; 5I11 A; 2B8A A; 1K0S A; 4QW2 A; 1G3S A; 2HMA A; 1IB8 A; 2EYQ A; 5GAM g; 5GAN j; 3M58 A; 2CH4 W; 1BCM A; 1TG0 A; 4C5H A; 3GP8 A; 3GBQ A; 2BUD A; 4A4E A; 2YT6 A; 1CKA A; 3LW5 E; 3EG0 A; 3JB9 D; 2K79 A; 3CPW A; 4AMC A; 2RK1 A; 5CIU A; 1F1B B; 3PIO A; 2DIQ A; 3QJY A; 5GAO p; 1K73 U; 2F2V A; 3FEO A; 5DM7 R; 2P0K A; 4C8Q D; 2EWN A; 1OX9 A; 1FMK A; 1KJW A; 4ZTF A; 2LNH B; 3L2V A; 3M0Q A; 2X4J A; 1T3S A; 2O2O A; 2YXY A; 1H64 1; 2JS2 A; 1YJW T; 1CSK A; 1QVP A; 1RI9 A; 3UDC A; 1WPY A; 2CZ0 B; 2EVR A; 2D1X A; 3CC7 Q; 2HZY A; 3CCL Q; 4CC4 B; 1JXM A; 3HP9 A; 2PVG B; 3JB9 F; 4QQD A; 2L3R A; 1VQ9 A; 4GY5 A; 3OYE A; 2QK0 A; 4C5E A; 1M1K R; 2E5K A; 3EG9 A; 1UG1 A; 2HNI A; 2CT4 A; 4HCZ A; 4M75 D; 1PD1 A; 3M59 A; 5J26 A; 1VOM A; 3PIP A; 3CC2 T; 1N9R A; 2JXB A; 3X20 B; 5ECA A; 3VS5 A; 2KXD A; 4C8Q F; 2MF2 A; 1JBM A; 4M77 A; 1OPL A; 3VS2 A; 1Y96 B; 2KR3 A; 4RTT A; 4Q5W A; 1V76 A; 3QDF A; 4HKE A; 3REB B; 5LJ5 f; 2DRM A; 2OTL Q; 3M0S A; 2FZG B; 1M3C A; 3JCM h; 2HEQ A; 3BDU A; 4KUL A; 2K5I A; 4MZP A; 1I5L A; 1Q82 C; 1SF9 A; 1MHN A; 2F1L A; 1JRI A; 3P8D A; 3CCQ Q; 1Q86 R; 3NTH A; 4JUV A; 2WAC A; 4L6V 5; 1AWO A; 2CH4 A; 3THK A; 1FWZ A; 3PVQ A; 1N27 A; 2ZCF B; 4A63 B; 3RUX A; 2X35 A; 1OEB A; 2A7Y A; 5CKH A; 4M75 F; 3JCM g; 2VV5 A; 1ZSZ C; 4RUG A; 2FRW A; 4J9H A; 5LJ3 j; 4ZGE B; 3OYC A; 2V8I A; 2DXB A; 1BCO A; 4PJO G; 2LP5 A; 2DK3 A; 4E7J A; 4PNO A; 3CBO A; 2E3H A; 1IRX A; 4M77 G; 1WLP B; 2DL7 A; 3CMA A; 3QWX X; 4E6R A; 2EGA A; 1M8M A; 4M7A A; 5KYY A; 2EYW A; 1T0J A; 2E41 A; 1VQ9 T; 2HKN A; 2EQU A; 1MMG A; 4XTZ A; 2LC4 A; 1QP3 A; 2GBQ A; 3JV3 A; 1KD1 R; 1SPK A; 2P4R A; 1NLP C; 2Z0W A; 1KQS P; 3JRZ A; 2VVK A; 7AT1 B; 1H3H A; 2KE9 A; 2LJ1 A; 1TWB A; 1IGU A; 2JOY A; 3LYI A; 2VUB A; 4FIB A; 2FB7 A; 1D3B B; 2K5F A; 4N4H A; 4QQG A; 1NEB A; 3D7S B; 1ZBX A; 2WSF E; 2YHT A; 1AZG B; 4F7U E; 2F5T X; 2I0N A; 2K2V A; 3J80 E; 2C0T A; 2V8J A; 1E7O A; 3NHN A; 5GAN 7; 3AT1 B; 4PJL A; 3EGX A; 2YUN A; 4F16 A; 3JCM c; 2EJG A; 4LDV A; 2RHX A; 4Z02 A; 4OMP A; 2DX1 A; 4M4Z A; 2E64 A; 1NJI R; 1OX8 A; 3CCM Q; 1N6A A; 2GTO A; 4E47 A; 2KT1 A; 2EJ9 A; 1MGQ A; 2FVU A; 2LX7 A; 3OYM A; 4FSS A; 3RKW A; 3JAM E; 4AFZ C; 3C4S A; 2ROL A; 4IUV A; 4NS5 A; 4RKU E; 3JSC A; 1WHL A; 2JW4 A; 1G83 A; 1QMC A; 2QEX A; 3QWY A; 3CXC P; 3NFC A; 4Y91 A; 4ZN3 A; 1R0B G; 3UWN A; 3QKJ A; 1D0Y A; 2D0N A; 3CMA T; 4HT8 A; 5LJ5 e; 1K73 R; 2XID A; 3OB9 A; 3QPH A; 1IO6 A; 2PUO B; 2QGG A; 3EH1 A; 3HRT A; 2QTV A; 1TUG B; 3VS7 A; 3HPW A; 3OW2 A; 2LQW A; 3PT9 A; 3SHW A; 4EMK C; 2PVD B; 1Y07 A; 2DKG A; 1X75 C; 2DYB A; 3M0P A; 4YTL A; 4PJO C; 3CCR A; 4M7D B; 2M0Y A; 1O9S A; 3PMI A; 2COY A; 4JZ3 A; 1P92 A; 1EFN A; 2XMF A; 2YRC A; 3A8M B; 2DIL A; 3NTI A; 2RN8 A; 2A28 A; 3VUB A; 2CP3 A; 3E2U A; 4EMK B; 2QQA A; 4FT4 A; 3HRS A; 4JZ4 A; 2KSS A; 4FYY B; 3CXC S; 1K8A C; 1W4S A; 4J83 A; 4XQ3 A; 1UEC A; 2JN0 A; 4PJN A; 1QVG P; 4HCC A; 4FM4 B; 1K9M U; 5C6S A; 1W2B P; 1WJS A; 2JJ9 A; 1ACM B; 5KYX B; 4X34 A; 3C0C A; 5IHI A; 5GAN d; 3GIB A; 4M7D F; 9ATC B; 2AK5 A; 2ED1 A; 3VJP A; 3UT1 A; 1TSF A; 4E7I A; 4N4I A; 2QEX T; 3PTA A; 1RAC B; 3MCA B; 3G1J A; 1VQ5 Q; 1JJ2 A; 1PG5 B; 2RQR A; 4OB2 B; 4XTU A; 2DER A; 1BK2 A; 3EG3 A; 2DBK A; 4M7A D; 4AFS C; 2QI2 A; 2HD0 A; 2G6F X; 2P4T A; 2ABL A; 2MIO A; 1B34 A; 2L8D A; 1YHQ Q; 2KDS A; 4JS4 A; 4A53 A; 1D09 B; 5CQY A; 1PCX A; 4HVU A; 1I1J A; 2CZ7 B; 3NPF A; 1SRM A; 3INZ A; 5AT1 B; 3EGD B; 2DNU A; 5GMK m; 1KC8 C; 3G6E A; 5IXB A; 1QVG S; 3CCV Q; 3CC7 A; 3UPU A; 3CCL A; 5CKB A; 4OB1 B; 3CCR T; 4RCB A; 2MWO A; 1VQ8 Q; 4LE9 A; 2A37 A; 1LCK A; 2OTJ Q; 5D6W A; 2L89 A; 2OX7 A; 3I5R A; 4M78 C; 1VUB A; 4PJO E; 2RK2 A; 5CO7 A; 1RAB B; 2PVO B; 5D7U A; 4JRP A; 2LMJ A; 1VYT A; 1M3A A; 2EYX A; 4MDW A; 4A4H A; 2CZ6 B; 4M7A F; 3WXM B; 1KQ1 A; 5GAO m; 1YJ9 T; 1WA7 A; 4JRQ A; 4JJD A; 2OTL A; 2LQN A; 3LWI A; 1VQM Q; 2O01 E; 4OF1 A; 4FL6 A; 3RBB B; 1BBZ A; 5FU7 C; 1YBY A; 3Q1J A; 2ZPG B; 2M16 A; 5GAM d; 4JPB W; 4WTO B; 5EC7 A; 2DVJ A; 1RUW A; 1UE9 A; 2YRD A; 1AWX A; 5M9O A; 1SHF A; 2CP5 A; 1RAH B; 4J9E A; 2ZPF B; 2ZGW A; 3H9N A; 4LUD A; 5GAM e; 4BE0 A; 1X43 A; 4IUR A; 5FU7 B; 2QGF B; 1IHW A; 3MP1 A; 2DTO A; 4C92 C; 3ER0 A; 2CDT A; 2LDM A; 3JB9 G; 3QUI A; 4IKF A; 4HT9 A; 2YLC A; 3X25 B; 4J6W A; 3A98 A; 4K11 A; 3HL8 A; 2LCS A; 1Y96 A; 4XTV A; 2L2P A; 1C6V X; 3G6E T; 5HK3 A; 2KI7 A; 3S3O A; 3CC7 T; 3CCL T; 4ATO A; 3M0U A; 1PRM C; 1AWW A; 4ZNX A; 1EIF A; 3L2Z A; 4C0D C; 2O4X B; 1OI1 A; 2DD5 A; 4FW1 A; 4C8Q G; 5A2Q E; 3JCM b; 1RI0 A; 1B07 A; 2KGT A; 3OQ5 A; 5GAN 5; 1R8O B; 1UGS B; 2RHI A; 2X3X D; 3H6Z A; 1ZX6 A; 4X9D A; 1Y0M A; 1RAF B; 5CKF A; 4RTU A; 3BW1 A; 3S3M A; 1WQW A; 2XK0 A; 2EGE A; 4C0D B; 4BI4 A; 2F2W A; 4M78 E; 1GCQ C; 2DIG A; 4ZN1 A; 2E70 A; 2PZ1 A; 3VKI A; 3SWN C; 1VQO Q; 2X4X A; 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2MYS A; 2LCC A; 4BB7 A; 1N9S A; 1GL5 A; 1M2O A; 2QAZ A; 1Y57 A; 2R5A A; 1X69 A; 1ZBJ A; 3UAT A; 4II1 A; 3A8O B; 4ELY C; 3FC3 A; 4MML A; 2DE0 X; 5FRM A; 4N0A A; 1Q95 G; 3CCM T; 3QXE B; 2HL5 C; 1QQJ A; 3I9Q A; 2LQK A; 5FU6 C; 1B3Q A; 2DYI A; 5D6X A; 1JO8 A; 3FJP A; 1PKS A; 1NBE B; 2MI6 A; 4F17 A; 1M90 C; 2DA9 A; 3CXC A; 5KCO A; 3QHS A; 1AWJ A; 1QCF A; 1VQ4 Q; 2K5L A; 4FYV B; 4XU2 A; 1GFD A; 3U23 A; 4M7D A; 4PKC C; 1VQ5 A; 4F14 A; 2FHD A; 1IXD A; 1BI3 A; 2LTO A; 4JRI A; 5KE3 A; 3DLL A; 4E7K A; 5FU6 B; 3ZFJ A; 3G4S T; 1YHQ A; 2BZX A; 3WVD B; 3L1A A; 3P8H A; 1M1K C; 3FDR A; 3PNW C; 3CPF A; 1N8R C; 3VRZ A; 1AZE A; 1G8X A; 3HKS A; 5GAN 4; 4IIO A; 1NG2 A; 4A4K A; 4F7U B; 4QT7 A; 5A0L A; 4AG1 C; 5GAM j; 4JRK A; 2W10 A; 1VYV A; 1GXI E; 1UDL A; 3MP6 A; 3F70 A; 2EYZ A; 1VQ8 A; 1O75 A; 1LJO A; 4BE2 A; 3CC4 Q; 1FMV A; 2EKH A; 1M1G A; 2GFA A; 4J7I A; 2OTJ A; 4RTZ A; 5KYX A; 1FYN A; 1OU9 A; 5GJV B; 2CUD A; 3E9F A; 3PVL A; 2L0A A; 4OMF B; 2EW3 A; 3VYH B; 2VC8 A; 1S72 Q; 1RAD B; 2E6N A; 4HVV A; 4LUE A; 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