1M9AA

Crystal structure of the 26 kda glutathione s-transferase from schistosoma japonicum complexed with s-hexylglutathione
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
216
structure length
216
Chain Sequence
MSPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDEGDKWRNKKFELGLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of the electrophile binding site and substrate binding mode of the 26-kDa glutathione S-transferase from Schistosoma japonicum
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Schistosoma japonicum
molecule keywords Glutathione S-Transferase 26 kDa
total genus 69
structure length 216
sequence length 216
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2002-07-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1m9aA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1m9aA01
4Q5RA 1K0CA 4K9ZA 3IOSA 1GTBA 3LXTA 3QAVA 3NOFA 3QD9A 4MH2A 2HZEA 3I6AA 1S3AA 4NXIA 2R6KA 4AJ6A 3F8UA 4O32A 3UBLA 1TI3A 3E9JB 1YEXA 1GUHA 6GSSA 1XZOA 5IMDA 4K1FA 5E59A 2B6MA 5G5EA 4EC0A 4HOJA 2P31A 4GLTA 5D8IA 4GTUA 1PKZA 1PX7A 1R5AA 4LL1B 1EP8A 1G6WA 2M80A 1DUGA 1FB0A 5HR2A 2LEGA 3VI5A 4MMMA 2PU9C 2C0DA 4AJ8A 2VL9A 3Q74A 2L6CA 4G9HA 4EVMA 4DVCA 2O89A 3GH9A 5G2ZA 4F0BA 5IIZA 3Q19A 3IPZA 2YN1A 3IHQA 5JWOB 4PQIA 4ML6A 3WGDA 2GZZA 3EURA 4GXZA 2DJJA 4YQMA 3ZMLA 2IJYA 2KP2A 2LTKA 1SYRA 5DAKA 2HSNB 2YCDA 4IN0A 2RIIA 3SBCA 4L0WA 3RBTA 3K8NA 5GSTA 5CP1A 3QPMA 2OACA 1DE2A 1A8LA 2H8LA 2GQLA 4KW6A 3EVIA 1W4VA 4TOPA 4TVEA 2JACA 3DVXA 3FZ9A 2KOKA 5ID2B 5FT3A 2CT6A 1T1VA 2VLUA 4WBRD 4G0KA 1GUMA 2GTUA 5DQYA 1T4ZA 2K18A 2V6KA 5ELGA 1M2AA 4ML1A 1K3YA 1PMTA 4V1Ag 3G7JA 4NMUA 1T7PB 5DALB 2XBQA 4L0UA 3IAS2 2CAIA 1ZL9A 3GN3A 1WPIA 2H19A 6GSXA 3F9UA 1AQXA 1ZZYA 4GWRA 4YQUA 4ECCA 2E2MA 1A0RP 1DSBA 1TRVA 2FD3A 4POKA 1SKSB 3UBKA 4TXOA 2WGRA 3GRXA 4BVYB 1RQMA 1EOGA 1K0OA 4BPYA 4TKYA 4MZCA 1URMA 3KM6A 3ZFLA 3QFBC 2JL4A 4I97A 2NTOA 2PMTA 2H6XA 4ZL9A 1GTUA 1OYJA 2HQTA 2MMOA 3GL3A 5ECPB 3M9JA 2IL3A 1QK8A 5DJMA 1XBSA 3IAM2 4J57E 3PPUA 5CRGA 2A2RA 3ERWA 1AW9A 3M3MA 3PINA 1MD3A 3ZYWA 5CAXA 1E2YA 1PL2A 1Q4JA 2IMIA 4FO5A 4KE3A 1FW1A 2G0FA 3GX0A 4MLYA 5J3RA 2EIRA 4KA0A 2B1LA 1XPVA 1MD4A 2FNOA 3R2QA 4G2EA 4IKHA 4MCUA 4FYCA 4MJCA 1T00A 1ERUA 3C8EA 6GSTA 1H4OA 5HR3A 1PRXA 1RW1A 5KN2A 5HFGA 1XWKA 5IMZA 3FZ5A 3VPTA 3F3QA 3UEMA 3KD0A 4LLRA 1FB6A 4D73A 3RPNA 2C3TA 3HVSA 3IRAA 2OKAA 3LGCA 1YY7A 4NHZA 2LQOA 1WJKA 3ZLPA 5D96A 2V41A 2EC4A 4ZB9A 5IMFA 3MSZA 3F4TA 2H0GA 4WKWA 3DD3A 14GSA 2AHEA 5ECKB 3C1RA 1GSUA 4OD7A 4XS4A 2HXKA 2GGTA 3TJKA 1XIYA 2DJKA 1GSYA 3ZMKA 3ZRDA 5EY6A 3J7Yb 5A4VA 2VM2A 4HU9A 1IYIA 3P8WA 2GQKA 1A23A 1KBNA 3BJ5A 2WZ9A 2D2ZA 1N8JA 1SU9A 3GUSA 1X9MB 3VWVA 2O85A 3ED3A 4EUYA 4KSMA 5F0GA 20GSA 2CX3A 3NZNA 4TR3A 1TDIA 3FRCA 4L5LA 4NHWA 2VD0A 1ZGNA 4X0XA 4JRRA 2VM1A 5HR1A 2N5AA 1A0FA 4PQ1A 4OFNA 1J9BA 1YJ6A 1LU4A 3H1NA 2YZUA 3EU4A 4TR1A 5G5FA 3QMXA 4HS1A 1M9BA 1V58A 2MBTA 3F6DA 4BL7B 5B8BA 1EP7A 1F9MA 4DSSB 1K3LA 2B7KA 3H93A 5AIVA 1PKWA 3G7YA 4PGTA 1HNCA 2LJAA 2P0GA 1BG5A 2KP1A 1TK8B 2X99A 1GH2A 4E8EA 1U88A 4MDCA 5B6MA 1NHOA 4ULXA 2VLVA 1YQ1A 1OC9B 1G0TA 1O85A 5IOWA 3GNJA 2HSMB 3FR9A 4JBBA 4ECBA 4GF0A 2P5RA 3KEBA 2C4JA 2VCWA 5DVBA 1GSQA 3TOTA 5FWGA 3GV1A 1VF4A 6GSVA 2XC2A 3FHKA 4MF5A 5IO0A 3J7Yk 5CNWA 2F8AA 3DVWA 2OBIA 3APQA 2IN3A 1GTAA 3IA1A 2AAWA 5HR0A 2J23A 4PURA 4N10A 4NV5A 3GURA 2LNSA 3DKSA 2PPTA 1AAZA 3F4SA 3APSA 1ZCPA 5ELAA 3VWXA 2BTOT 4HI7A 1Z6MA 1O81A 2JU5A 3BBYA 1A2MA 2GS3A 3I43A 1AQWA 3ME8A 4Z7XA 3F4RA 2X8GA 2LQQA 5DDLA 2Z9SA 8GSSA 2RUFA 1XOAA 1Y25A 3TUEA 1TU8A 1CQGA 2LKUA 6GSUA 2GSRA 4OMVA 2L6DA 1O6JA 5GSSA 1SK1A 4KNDA 1OE8A 2UZ8A 2QC7A 4EKZA 3DIEA 3TJFA 1M0UA 1TW9A 1PQNA 1S3DA 2VIMA 2IMFA 3DEXA 2VCTA 1THOA 4XTSA 4YQVA 2RM6A 1T4YA 4ZL8A 5DCHA 1ZYQB 1YF0A 2FWHA 1FAAA 2MBSA 4XHMA 1OE7A 4NAXA 2K8VA 3TJBA 5A4WA 3RHBA 2GZYA 1QXHA 2H0IA 3IDVA 4N0VA 1HD2A 1U6TA 2MZCA 3F63A 4EDZA 1DBYA 2OE1A 1XVWA 4N0ZA 2HRKB 3KXOA 5GZZB 5ECIB 2IFQB 5AIXA 3TKSC 2BJXA 1GUKA 1GSEA 3CSHA 4ACSA 3TJJA 4BVXA 4I2TA 1PA3A 1M2DA 2NBSA 3V1WA 3PR8A 4FYBA 3ZREA 2WCIA 2C80A 2LSTA 3KMNA 1MDIA 2DIYA 2GSQA 3LORA 1C72A 4XCSA 1MEKA 1PGTA 3ZVJD 2H72A 4ILFA 3AY8A 1SJZA 2PN8A 1HNBA 1M9AA 4KB3A 1SJIA 2QSIA 5HFKA 4GRFA 2LRTA 3WGEA 1ILOA 1NSWA 3EE2A 3DWVA 1O8XA 5F05A 4I8BA 2CVKA 22GSA 2P5QA 3G9BA 3CTGA 2LJRA 3CRUA 2WDUA 5AN1A 5IO2A 5G30A 1WP0A 3VFIA 2XPEA 3P7XA 1X5CA 2FWFA 4PTSA 3IC8A 2NPBA 1XCCA 2H73A 4TW5A 4G0IA 5EVOA 2HRFA 3OR5A 4POMA 4GSSA 4OWYA 3TJGA 2AUVA 4LMWA 2CVBA 5H5QA 1TU7A 3HHVA 2B7JA 2OADA 4EXJA 5H5RA 18GSA 2PVQA 3HXSA 2LRNA 1SL0B 2IMDA 2WJUA 4MABA 2FWEA 1GNEA 3ISOA 5CREA 4YH2A 3ZFBA 4POBA 3QFAC 1PSQA 2V2GA 3H4KA 2YV9A 1XOBA 3GX8A 4J2FA 5ENUA 2V6OA 5AISA 4KGIA 2HZFA 1V98A 3GIXA 2EIOA 4ECJA 3P90A 3ME7A 4EE0A 3LQ7A 1B9YC 4GSTA 2JZRA 1ZOFA 5CO3A 5J41A 3EYTA 4V2MA 4EDYA 6GSYA 1JZWA 4K6XA 2GT5A 2OBKA 4CW9A 4DSSA 2AV4A 2FA4A 1SYXA 5ECSA 2PBJA 4ZB8A 4ZIJA 1Z3EA 4IBPA 3MDKA 2LUSA 2QKEA 2MYGA 1ML6A 2FCHA 1OVNA 4FQUA 4QL7A 5KN3A 4G0LA 3GTUB 5IMCA 4V1Ap 3EINA 5BMUA 1UA5A 1EV9A 3CRTA 5DCGA 4TN8A 1SK2A 3QAGA 5CRWA 3L9VA 3ERFA 1FVKA 10GSA 3EMXA 3GKNA 5A4UA 5G31A 3WT1A 1G7OA 1B4PA 3ZTLA 1XW6A 1A24A 3DRNA 1UVZA 2HSYA 2DLXA 2M72A 2YJHA 4HEA2 1VF1A 1FVJA 3M0FA 2VLTA 1HNAA 4N30A 2EIQA 2ZCTA 2B3SA 5JCWA 1ST9A 4F9ZA 1M7TA 3PH9A 1J08A 2FLSA 3A2WA 4G10A 1MTCA 2DJ1A 3TKSA 3L9UA 2REMA 3FEUA 3N5OA 3HD5A 2IWTA 1EEMA 2K8SA 2X8CA 2AJQB 1BX9A 2I4AA 5KN0A 3D0ZA 3RDWA 1GSDA 5B8AA 2GDRA 4ZL7A 9GSSA 2HRNA 2RM5A 1O7UA 2H1BA 2HLSA 3NIVA 2RUEA 4YAPA 2GZPA 1F3AA 4JU5A 3CSIA 2FWGA 2HZEB 3QAWA 4IQ1A 4KCAA 3BCIA 2XHFA 3CTFA 3D5JA 2L4QA 1Q98A 1K0DA 3TOUA 1DE1A 3HVVA 4KCEA 2CA8A 3LJRA 1AC1A 1BYEA 2YV7A 2H1DA 1JZRA 4MZBA 3FR3A 5IPHA 4P3YB 1AXDA 2TIRA 1Z7RA 1FG4A 3P2AA 1EGOA 5DBQA 3W8JA 4XRDA 4ZB6A 3C1SA 2TRXA 1XWGA 4XIHA 2CZ3A 1EOHA 4FYUA 4V2LA 4EO3A 7GSSA 2O87A 3HZ4A 3UOMA 5CYYA 2L5LA 3GH6A 3IR4A 1OKDA 1Z5YE 2JZSA 1G6YA 1SL1B 4HUAA 3D22A 3C73A 4JZQA 5DAKB 2H6YA 5LD0A 3HJPA 4HU7A 1V57A 1U3IA 3LYPA 2CX4A 4OFTA 2CAQA 1ERTA 1QMVA 4CHSA 4AJ7A 5D9VA 3U5RE 3ZIVA 5L71A 1GSFA 4DSQA 2DBCA 3ZL5A 2C0GA 4IP6A 5KN1A 4HJMA 1XW5A 3F3RA 5IOXA 2N5FA 1SL2B 1SENA 4AF2A 2A2SA 1T8EB 4LA1A 5C00A 3CSJA 3GL5A 4WF5A 2H75A 2F51A 1NM3A 2B1KA 2JSYA 2PVOC 2VCXA 2E0QA 3UIWA 4IELA 1B4QA 3LG6A 3DXBA 1R26A 2V32A 4WR4A 4WETA 2BMXA 4KX4A 1Y6EA 4TR0A 4QQ7A 4MK3A 4TXOB 1Z9HA 2C0EA 1TK0B 5KEJA 1WIKA 3F6FA 1A8YA 1YDKA 1LBKA 5D9TA 4HZ2A 1TTZA 1HQOA 1EEJA 1JZOA 1T3BA 4JEDA 1K0AA 2VCQA 2VD1A 3DGQA 1YF1A 3GMFA 3L0HA 5G1KA 5ID2A 3ZITA 3GA4A 1I5GA 2F9SA 3BD2A 5DQSA 5E4WA 2B5XA 3TCOA 5LCZA 1ON4A 3UAPA 3TGZA 2VCVA 4RI7A 2H0HA 5GAND 5F06A 1B9XC 3GKMA 5DALA 3Q18A 5IPGA 5B7CA 4LMVA 2OA7A 5ECLB 1LJRA 3WYWA 2OE0A 1QQ2A 4F82A 2B5EA 3UL3A 4MH3A 4AGSA 3QCPA 2YWIA 4BVYA 4GCIA 4ZBBA 3D4MA 5DJLA 1UN2A 3FYGA 3CXGA 5ABRA 4XS1A 4PQHA 4RI6A 1XVQA 4D73B 4KDUA 4NV2A 4PUFC 3D21A 3KIJA 6GSWA 1WWJA 2ZUPA 4ECIA 4XRAA 1TRWA 1F37A 2GT6A 2ON5A 1QFNA 2FY6A 3H79A 5AGYA 3TB2A 3VLNA 4NWYA 2X64A 4WEYA 4K7OA 3GSSA 1VF3A 2ON7A 4KDYA 5JWRB 4K2DA 4HQSA 3CBUA 4XS4B 2YWNA 1PL1A 3UVHA 2HYXA 2V1MA 19GSA 4TRXA 2L59A 2WS2A 4I5QA 3C7MA 3ZZXA 5CRDA 2R4VA 3IK9A 1GLPA 4O5RA 1PN9A 2GVPA 2ALBA 2H70A 2R5GA 2C3QA 4XS6A 3L4NA 1IYHA 1GL8A 5JWQB 2R2JA 1F2EA 1WOUA 4IQAA 1XW9A 3EWLA 2KLXA 4KH7A 3UMAA 1ACVA 1ZMAA 3VWUA 2FHEA 1GSSA 4WBJA 2PWJA 1EV4A 1JLWA 2C8UA 3RPPA 1X0RA 1THXA 3VWWA 3MWHA 5IMAA 2YWMA 2YNXA 4N11A 3UVTA 2CQ9A 1A2LA 3I69A 4X43A 4WXTA 1ZYEA 1M2BA 5C04A 1SK0A 3R3EA 4X1UA 2L4CA 4TR1B 3S9FA 4GSNA 1AIUA 4JR4A 1N2AA 2HT9A 2WFCA 3EU3A 1KNGA 1YEPA 2G2QA 2IPAA 3D4TA 1X9SB 3EMPA 2K9FA 3RAZA 3G7IA 1JZDA 4O92A 1ERWA 2DMMA 1KEBA 3A3TA 2MMNA 1FOVA 2LJKA 1GLQA 1VF2A 2DJ0A 1SD8A 3FR6A 4Q5FA 5ECRB 4K0GA 3L9SA 1TP9A 1K0MA 5EPFA 2CZ2A 1U3AA 4IJ3A 1TI1A 3H8QA 5D93A 2HNLA 4MP4A 1EWXA 2JADA 3W8SA 3N9JA 3CYNA 2GSSA 4YAVA 4JE1A 2FUG2 3GKKA 5LNKe 4K7NA 5CRHA 4HJ2A 2NVLA 3O6TA 1NW2A 2H74A 3A2XA 4V2NA 3UJ1A 1WMJA 2H1AA 3M9KA 3Q6OA 1R4WA 4K8MA 1J0FA 5D9XA 4H86A 4OO4A 1SKRB 4GQFA 4USSA 4BL7A 1TK5B 11GSA 2H6ZA 3E0UA 2WRTA 1NHYA 1WE0A 5COHA 3DYRA 1JLVA 4I6XA 3VURA 1GULA 3E3EA 2HSHA 2DIZA 2R3XA 3KTBA 2ZNMA 3IXRA 3KTLA 1GRXA 1EGRA 5JCUA 5H5SA 1O8WA 2J9HA 2H66A 3KCMA 3APOA 4ZILA 4FH8A 3WT2A 1OC9A 1OC8A 2HSMA 2VUPA 2LV3A 3A5WA 1BAYA 2AB6A 4G19A 1S3CA 3HY2A 4PNGA 1TJDA 1BQ7A 2VL2C 3IC4A 3GFKA 2QGVA 1FO5A 2HRAA 4KSOA 3BCKA 3VI7A 4TXVA 1YZXA 2IIYA 4BA7A 2YANA 5JCGA 3LEFA 4KF9A 3FZ4A 3HKRA 3FY7A 4ID0A 2X8HA 4HQZA 2IMEA 3KJYA 1XXUA 4Q5QA 2HE3A 2YOIA 2WULA 1M99A 3TRQA 1UC7A 3TDGA 3TRPA 1G7EA 4KDXA 1XWBA 3GKXA 3KP9A 3IBHA 1F3BA 1O73A 1PD21 4HZ4A 1VGLA 2E2GA 2FGXA 2C1YA 2GLRA 5ECHB 3ZVJA 1Z6NA 1F6MC 3KZQA 2H1GA 4OO5A 2HI7A 3HVXA 2YWOA 4MA9A 5ECMB 2R37A 4EF0A 3QOUA 1JFUA 4BVXB 4MJBA 4RQRA 4ZXGA 2K6VA 2H76A 4ZBAA 3GSTA 2A4VA 2C0FA 1MDJA 4KUNA 4IGJA 3LXZA 3QDNA 2I81A 4IVFA 1R7HA 4BWQA 1ABAA 1MDKA 1USBA 5J5NA 5ECOB 2YJ7A 4LL4B 4PX1A 3LFLA 4MPGA 1XWAA 1K0NA 1AQVA 1V9WA 4QL9A 2OJLA 2HFDA 3KMOA 3HDCA 1GNWA 5IMVA 4EL1A 3O3TA 1XWCA 4RUVA 2MMAA 1PX6A 4HDEA 1OKTA 2KHPA 3M1GA 3UARA 2JSZA 1X5EA 2YPMA 4NPBA 1JHBA 2PGTA 1OC3A 2HRKA 3JCML 3LWAA 3KP8A 3PGTA 2IFQA 1SKWB 1FHEA 4KAEA 2L57A 1V2AA 2PUKC 2GQMA 2O7KA 2O8VB 2I3YA 4E8HA 3CMIA 2DJ2A 2MMZA 1TOFA 2LS5A 1BJXA 4MF6A 3BOAA 2DC5A 3HA9A 5HFIA 3MNGA 4IS0A 2KUCA 3US3A 2DMLA 4Q5NA 4MZWA 2YZHA 3M8NA 5ECNB 1AUCA 13GSA 3IE3A 4MJAA 2C3NA 2B5YA 4DEJA 2CVDA 1HYUA 3O76A 5IM9A 3GYKA 3U6VA 4F2IA 1VRSD 3I9V2 2E7PA 17GSA 5J9BA 2CV4A 2ES7A 4F03A 2RLIA 1TKDB 1WRYA 4OCFA 3W6GA 3DMLA 4FIWA 3FKFA 2XBIA 4JR6A 3ZIJA 5B6NA 2VL2A 3RHCA 3TKRA 5INYA 4MPFA 1SJ6A 2VAFA 3HCZA 3L78A 2WB9A 4IHUA 3IK7A 2PERA 4K0NA 1X5DA 3HJMA 5IQYA 5J4UA 4ISDA 4K7IA 3F0IA 2LNTA 5G1LA 2YP6A 3KH9A 2AYTA 4F0CA 1BEDA 3KGKA 3MAKA 4IP1A 4MJEA 1TRUA 3LYKA 3IV4A 2H01A 1GTIA 3FK8A 4I2UA 2H71A 4TR4A 1YKAA 1A2JA 2XPDA 1U87A 4O7HA 2TRCP 4OCEA 4POLA 5ECQB 3TKPA 3WGXA 2VL3A 2VOCA 4CDOA 1GWCA 4OFMA 3TRXA 4WR5A 16GSA 1K0BA 3D6IA 2I9HA 5HQPA 1QUWA 2H30A 5F07A 3ERGA 1B8XA 1R5PA 1OAZA 2N5BA 4GQCA 1EZKA 4WF4A 1YKCA 5GAPD 5EL8A 3GTUA 4MF7A 3GHAA 3A2VA 2L5OA 2M46A 3C71A 3QR6A 3EC3A 5D9WA 1TXXA 4PNFA 4L8EA 5F8BA 4PXOA 4IJIA 4IW9A 1GP1A 1XFLA 3SWLA 1K3OA 3LSZA 2JZTA 1I9DA 1SD9A 4BWSA 3VK9A 4ZBDA 4PUAA 3TKSE 4RQXA 2IMKA 5A5KA 3HZ8A 1W89A 1B48A 1X9WB 3TKQA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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