1MEKA

Human protein disulfide isomerase, nmr, 40 structures
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
120
structure length
120
Chain Sequence
DAPEEEDHVLVLRKSNFAEALAAHKYLLVEFYAPWCGHCKALAPEYAKAAGKLKAEGSEIRLAKVDATEESDLAQQYGVRGYPTIKFFRNGDTASPKEYTAGREADDIVNWLKKRTGPAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure determination of the N-terminal thioredoxin-like domain of protein disulfide isomerase using multidimensional heteronuclear 13C/15N NMR spectroscopy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN DISULFIDE ISOMERASE
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 17
structure length 120
sequence length 120
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 1996-04-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1mekA00
1V57A 4JZQA 4NXIA 4PNGA 2G2QA 1A2LA 2PWJA 3IK7A 3GL5A 5KN1A 3FZAA 2FHEA 2XHFA 2J23A 2VLVA 3HJPA 3NIVA 3ZIVA 2LNSA 1I5GA 4KCEA 1WWJA 1TKDB 3GUSA 3M3MA 4IJ3A 3ZTLA 3CBUA 4ZXGA 1XPVA 2YNXA 4NV2A 1V98A 2PBJA 3TKSE 2VM2A 11GSA 4I2TA 4EF0A 1Z3EA 1HNCA 3TDGA 22GSA 3L4NA 3MDKA 5EY6A 4EL1A 3TOTA 1PKZA 5B6MA 3ZYWA 2PN8A 3M9KA 1MD4A 5GAPD 3QAWA 3IDVA 3F0IA 1GTBA 2IL3A 3E9JB 2Z9SA 3WT2A 5IMCA 2YPMA 3R2QA 2VD0A 4WF5A 3EMPA 1KEBA 3H8QA 2KUCA 2RM5A 3BCIA 2HT9A 2L6CA 2M72A 5IPHA 4NPBA 1XWBA 4WBRD 4HQZA 1JZWA 1TU8A 5IO0A 3F6FA 4YQMA 1N8JA 4HU9A 3H79A 1M2AA 1LBKA 1X5DA 4OMVA 3KTLA 2WJUA 1U87A 1UVZA 5ECNB 5F06A 3W8SA 1EGRA 1UN2A 5DALA 4X0XA 3C71A 3DYRA 3NOFA 1ERUA 4HI7A 1A8YA 1FB0A 1K3OA 2RM6A 3ZRDA 4ECJA 2MMOA 3JCML 4K8MA 3GURA 1TP9A 3L9VA 1TU7A 2I9HA 2JU5A 2AV4A 4JR6A 3QMXA 5D9WA 3GX0A 2REMA 2LRCA 3IV4A 3I9V2 4IQ1A 2VCVA 4J2FA 5B6NA 1R7HA 2H74A 5J4UA 4MJAA 3F3QA 3KH7A 4P3YB 1XFLA 1O6JA 3RHCA 3HVXA 2P0GA 3BCKA 4WKWA 1OKTA 5DAKA 5INYA 1G7OA 2MBSA 2P5QA 4V2LA 1GH2A 2OADA 5DCGA 1K0MA 1ERTA 4Q5NA 2FWEA 4TR1A 1F3BA 2AJQB 3HYPA 1X9WB 1X0RA 3MAKA 5A4WA 2H0HA 5D9VA 3IAS2 3RBTA 5B8BA 1BEDA 2OBKA 3QR6A 3KMNA 7GSSA 5G30A 3EC3A 2GT6A 2L5LA 1S3AA 1SJZA 4XRDA 4IJIA 2C0EA 3TRPA 5D9XA 4KCAA 4L5LA 5DALB 2I81A 3HJMA 2L4QA 4YQUA 5GAND 2JADA 4FYBA 1O81A 2R3XA 4XS1A 3OR5A 4L8EA 5HFIA 2EIOA 1K3LA 1YY7A 2IMIA 5G5EA 3LQ7A 4N0VA 2K8VA 4IHUA 4NWYA 5H5SA 1EP7A 1JZOA 1JZRA 3HZ4A 5ABRA 5EPFA 3C1RA 2ES7A 4KGIA 4ULXA 4JBBA 3LWAA 2PMTA 5KN3A 2PU9C 3HCZA 5DAKB 2LS5A 2VCQA 4FO5A 3UMAA 5IM9A 5CREA 4GXZA 3SBCA 3RHBA 4IW9A 1OKDA 4TR1B 2DMLA 3D6IA 4GCIA 2C3NA 1LJRA 1B4QA 3FR6A 1GUMA 1R5AA 2XBQA 2ZNMA 3FRCA 1PQNA 1CQHA 2L5OA 2LJRA 4DSRA 2WCIA 1YQ1A 1Z5YE 1GNEA 4DVCA 1MDIA 4K1FA 2IPAA 3SWLA 6GSWA 2X99A 3UBKA 1F9MA 1VF2A 2H6YA 4HEA2 2TIRA 1G7EA 2HRFA 4LL1B 4XHMA 2R5GA 4RI7A 1TRVA 4XTSA 5DCHA 3V1WA 2VD1A 3UEMA 1PGTA 1USBA 2BJXA 3FKFA 1JZDA 2WULA 1NHYA 4V1Ap 2YZUA 5CP1A 2OACA 2A4VA 3TKSA 3VPTA 4FYUA 3GA4A 2GVPA 2DJJA 4KDYA 6GSXA 3DVWA 5ECOB 1YJ6A 1V9WA 2OJLA 2TRXA 3GTUA 1SJ6A 4GQCA 8GSSA 1GP1A 3QFAC 4PQ1A 2ON7A 5AIVA 1C72A 1TRSA 2JACA 2RUFA 5EL8A 4MMMA 5HR0A 2YWIA 13GSA 3G9BA 2FY6A 3PR8A 1NM3A 2JZRA 4Q5FA 5E4WA 4FYCA 2B1KA 3UVHA 3A2XA 5D73A 4ZB8A 4HS1A 3CRTA 2P31A 4J57E 1M99A 3L9SA 4MK3A 2C80A 3FR9A 2F3MA 3H1NA 3C73A 4L5OA 4DEJA 3P2AA 3TKQA 1GRXA 1YF1A 4ZBAA 4GTUA 4KDXA 2JSZA 1PL2A 4V2NA 2YZHA 1QXHA 1XCCA 3IXRA 2WB9A 2LJAA 1A0FA 4IN0A 2PVOC 4MH2A 2FLSA 2G0FA 1J0FA 5H5QA 1YKAA 1V2AA 1EEMA 2QGVA 3GSSA 5ELGA 3FZ4A 1Z7RA 4XCSA 2C0DA 2FUG2 2HYXA 3HKRA 3GTUB 4K2DA 3GL3A 2GSSA 4NV5A 2HZFA 3VWUA 2IIYA 2VCTA 5GSTA 3UL3A 3GKNA 4ZB9A 3NZNA 5IMFA 1HNAA 4Z7XA 1T1VA 4I5QA 2IWTA 2WFCA 4TR4A 1IYIA 4TXOA 2OA7A 4MZWA 5B8AA 1DE2A 1M0UA 2ALBA 4WETA 2XBIA 4EUYA 3QPMA 3DMLA 3O76A 1VRSD 1XW9A 9GSSA 1Z7PA 1AQVA 1EOHA 4K9ZA 4L0WA 2H66A 4MA9A 5DJLA 1GSUA 3KD0A 1WOUA 4PXOA 5KEJA 1YDKA 1PKWA 1UC7A 4WR4A 2YWOA 2GSRA 1U88A 2CAIA 2FA4A 4RQRA 3VLNA 4GWRA 5G31A 2QKEA 2O87A 5L71A 2PGTA 3UVTA 5D93A 3HY2A 2H76A 4ID0A 5DVBA 2H70A 5E59A 2L4CA 4NMUA 2HFDA 2L57A 3DEXA 1A23A 5F8BA 5IOWA 2LQQA 5ID2A 3RPPA 2O89A 2H01A 1AW9A 1JHBA 1ZCPA 2AUVA 3CXGA 2YOIA 2XC2A 19GSA 3DGQA 2LSTA 4XS6A 1GWCA 4MDCA 1JFUA 3D21A 5C00A 4LL4B 1FW1A 2PERA 1EV9A 4DSQA 5ENUA 3GV1A 1EP8A 4YAVA 1XIYA 2C0GA 1K0DA 3FR3A 3D5JA 4TXOB 2OE0A 5JWOB 5CYYA 5HR3A 3LYKA 2OE3A 3DD3A 5ECKB 4MZBA 1XWAA 12GSA 3GMFA 1WMJA 4ZL7A 2V32A 2XPEA 2VOCA 5A5KA 4IVFA 1SL0B 4JE1A 2C3TA 1XBSA 4GQFA 2NPBA 2LKUA 6GSSA 2DLXA 1GL8A 4TOPA 1VGLA 1SJIA 3IA1A 2IFQA 2V41A 1U3AA 5CNWA 3FEUA 1FB6A 2C3QA 3GRXA 5COHA 1O8WA 1XWGA 1PX6A 4WBJA 1F2EA 3UAPA 4PUAA 3VK9A 1ZOFA 4IELA 2IJYA 3TJKA 1THXA 2DC5A 2HNLA 1TXXA 1M2DA 5ID2B 2YJ7A 3GYKA 1OVNA 5CRDA 4KUNA 4HJ2A 3FK8A 4KNDA 3I69A 2VAFA 3N5OA 1E6BA 2O8VB 3IR4A 3ZLPA 4LLRA 3GKKA 4YAPA 2X8GA 5HFKA 3IC4A 1JLWA 2LTKA 4JRRA 1H4OA 4PGTA 3LJRA 3UBLA 2QSIA 2KP2A 2DMMA 3I6AA 1SL2B 4ECIA 5J41A 2NBSA 5J9CA 1KTEA 5DDLA 1FVJA 4GSSA 2FA8A 2YV9A 2HSHA 4CW9A 2FD3A 3G7IA 3GN3A 4OO5A 3BOAA 1A24A 1HYUA 1DSBA 2CZ2A 3VURA 3G7JA 2VLUA 4BWQA 5FHIA 4HZ4A 3C1SA 2A2SA 2HXKA 4GSNA 3APOA 2H1DA 1SYXA 2IFQB 5LCZA 3HVSA 1ZYEA 1TK8B 3VFIA 1OC3A 4EDZA 2WRTA 3HVVA 4XRAA 1GUHA 1MTCA 2GT5A 3LFLA 2DJKA 3KMOA 2CQ9A 4TXVA 2R2JA 1B9XC 4MZCA 2VCZA 1TW9A 1T7PB 1S3CA 2ZUPA 1I9DA 4NAXA 1RW1A 3QDNA 2CZ3A 3EURA 4TRXA 5C04A 2EC4A 2HI7A 3DRNA 2VM1A 2HZEA 4TR0A 2RLIA 1WJKA 1GSDA 2E7PA 2KHPA 3F8UA 5AIXA 1NSWA 1VF3A 1SK0A 2B1LA 5ECHB 4OD7A 3TKPA 5IMZA 1F6MC 2LEGA 3KGKA 3CTGA 3LXTA 1MD3A 5G5FA 3U5RE 1ML6A 1FHEA 3BBYA 1Q98A 5CAXA 2H1AA 4GLTA 5DJMA 2H30A 2D2ZA 3CRUA 3G7YA 2H0IA 3L9UA 3H93A 4MH3A 4GF0A 2DJ1A 1NHOA 4K7OA 1A0RP 1DUGA 2GGTA 3LEFA 1B8XA 3TKSC 1U6TA 1PD21 20GSA 1AQXA 4ZBDA 5HR2A 2K6VA 5CRGA 1ERWA 2H73A 2C4JA 1U3IA 3HD5A 4EKZA 1SU9A 2GQLA 1GSYA 4AJ6A 3IOSA 2IMFA 1J9BA 18GSA 3ZITA 3F4TA 1FVKA 1ZMAA 2P5RA 2V1MA 1BX9A 2DJ2A 3F63A 4PQHA 4PX1A 3QCPA 3EINA 3P7XA 2N5BA 4RI6A 2CV4A 2VCXA 2HZEB 5IMAA 3GH9A 1PN9A 2AAWA 1AUCA 4MF7A 4JR4A 2LRNA 3TKRA 1GSSA 2MMAA 2R6KA 1CQGA 4RUVA 1M7TA 4ILFA 2F51A 1SYRA 2PPTA 3UARA 2L59A 1MDKA 1O73A 5CRWA 2IMKA 2FWFA 1TOFA 1QUWA 2OE1A 2N5AA 5KN2A 5JWRB 1B4PA 1X5CA 1GSEA 4PQIA 2VIMA 1TRUA 1WP0A 1TRWA 4O32A 1ZL9A 3KP8A 2MZCA 3AY8A 1X9MB 2A2RA 2LV3A 4IP1A 3CYNA 1TI3A 2X8HA 1EZKA 3MWHA 1XW6A 3L78A 4I97A 1PL1A 1R26A 4NHWA 1BYEA 3IRAA 3VI7A 2CAQA 4ZILA 1K0CA 6GSUA 4MP4A 4K7IA 1AXDA 2JSYA 3M0FA 4TN8A 1QFNA 1M9BA 2EIRA 2GQKA 5D96A 1K0BA 5IMVA 4QQ7A 2RIIA 6GSTA 4Q5QA 1B48A 2VL2A 4L0UA 3LG6A 1V40A 1EEJA 2H1BA 3TCOA 1IYHA 3GH6A 4HUAA 1XW5A 2H8LA 1SKRB 4BVXA 3TRXA 3J7Yk 3KEBA 4TVEA 2PVQA 3HA9A 4HZ2A 4KSMA 1VF4A 3ZVJA 4OWYA 2CT6A 4I8BA 4MJCA 2EIQA 1EGOA 4X1UA 3HXSA 5CRHA 1HD2A 1AAZA 2R4VA 3PH9A 1WIKA 2CVBA 4TW5A 4G10A 1SK1A 2ON5A 1Q4JA 4POLA 1OE8A 4ECBA 4OFNA 4POBA 3KH9A 4HU7A 4F03A 1TTZA 4G2EA 3EMXA 3HHVA 4AF2A 2IMEA 5FWGA 3IPZA 4XIHA 2GSQA 2LQOA 3MNGA 4ML6A 1RK4A 1RQMA 4H86A 2GQMA 4HDEA 2YCDA 1YEXA 2I4AA 3TJBA 3HZ8A 3QD9A 3HJOA 2VLTA 2YWNA 1SL1B 3KCMA 3TRQA 1YZXA 2HSYA 3QFBC 3LGCA 4YQVA 2CA8A 3ISOA 1X9SB 3IK9A 4EXJA 2K8SA 3WGEA 2CX4A 3TGZA 1FO5A 3WT1A 5G1LA 4EDYA 1WRYA 4TR3A 1QQ2A 4G19A 2E2MA 1GTIA 1Z9HA 4ZL8A 4LMWA 2H0GA 2GLRA 4TKYA 4IGJA 4J56E 2DJ3A 5FT3A 1WE0A 1SENA 3CSJA 2NVLA 2E2GA 1R5PA 3WGXA 5A4VA 2I3YA 3H4KA 4DSSA 1OC9A 4KE3A 3L0HA 3I43A 4POKA 4I6XA 4OFTA 2B7KA 3O6TA 2OKAA 1ON4A 1KBNA 1K0AA 2GZZA 2DIYA 5JCGA 1YKCA 2YWMA 3KTBA 3EE2A 1T00A 1ABAA 3ERGA 1XVQA 2DBCA 3PINA 2B7JA 3C7MA 1NW2A 3F4RA 3GKXA 2VL3A 3EU3A 2N5FA 1GULA 1EOGA 5ECPB 5IO2A 4HQSA 4YH2A 2H6XA 1EWXA 1DE1A 1MEKA 3WGDA 1GNWA 1ILOA 3ZZXA 3O3TA 4BA7A 4N0ZA 1AC1A 5JCUA 2NTOA 4OO4A 1N2AA 3KP9A 1DBYA 3F6DA 1THOA 1Z6NA 5IOXA 3RAZA 1HNBA 1URMA 1Z6MA 3ED3A 3MSZA 2GSTA 3LORA 3Q18A 1VF1A 3F4SA 4V2MA 3DXBA 3J7Yb 5J5NA 3E3EA 5LD0A 1WPIA 1BJXA 2FWGA 1W4VA 4DSSB 1OC9B 5IQYA 2M46A 3BJ5A 4MCUA 3ERWA 4F0BA 2KLXA 3IBHA 1ZYQB 1ACVA 4MF5A 5AGYA 1XXUA 1ST9A 4HOJA 3FZ9A 1AQWA 2VUPA 3GNJA 1UA5A 1OAZA 6GSVA 1KNGA 3Q6OA 3DIEA 3GSTA 4K0GA 1B9YC 2H6ZA 4K7NA 4V1Ag 2KOKA 4O5RA 4E8EA 4CDOA 3FW2A 2YN1A 3GKMA 5ECMB 3F3RA 1BAYA 3WYWA 2VL9A 4MABA 3ZIJA 2JZSA 3W8JA 4OCEA 2B3SA 4K6XA 5AISA 1X5EA 3EU4A 1XWCA 4KAEA 2B5YA 4WF4A 1GUKA 3C8EA 2HRNA 2GTUA 16GSA 2WDUA 3LSZA 5JCWA 3ZFBA 4N30A 2JZTA 1V58A 5AN1A 1XWKA 1A2MA 3E0UA 2C0FA 1S3DA 1E2YA 2MMZA 1K0NA 4WXTA 5ECSA 4D73A 4O92A 1TI1A 2F9SA 2E0QA 4PNFA 2C1YA 3UIWA 5HR1A 1F37A 3UJ1A 3APSA 4GRFA 3IHQA 5DQYA 2F8AA 2AHEA 3IAM2 2DJ0A 3KIJA 2H72A 3BD2A 1FG4A 4KW6A 3VPQA 3DKSA 4HJMA 5F07A 1O7UA 5F0GA 4MJEA 2O85A 3RPNA 2J9HA 3KZQA 4ISDA 4KSOA 4OFMA 4BWSA 4MLYA 4O7HA 5HFGA 1G6WA 4ACSA 4PUFC 3TJFA 3ZMLA 3TJJA 4ZIJA 2V6KA 1GLQA 5EVOA 3A2VA 2F8FA 1TJDA 3Q74A 4EC0A 1FOVA 3K8NA 3ZFLA 4N10A 2B5XA 4MF6A 3EWLA 3S9FA 1MDJA 2LJKA 2V2GA 5B7CA 4KX4A 4QL7A 4KB3A 3N9JA 1HQOA 4XS4A 3W6GA 4NHZA 3Q19A 3FY7A 3CTFA 1AIUA 2KP1A 2B5EA 4D73B 4ZB6A 2WZ9A 3A2WA 1ERVA 3US3A 5GSSA 3ZREA 5G1KA 2NDOA 4AGSA 3ZL5A 1BG5A 4BPYA 1PRXA 2IN3A 4MJBA 4MPFA 2L6DA 1XVWA 2IMDA 3FZ5A 4I2UA 1SD9A 4ZBBA 2WGRA 4KA0A 5HQPA 1XOAA 1K0OA 3P90A 2FGXA 4WR5A 2XPDA 2K9FA 2MMNA 2YJHA 2MBTA 4F82A 3D4MA 5ECQB 1O85A 1OYJA 3DVXA 1O8XA 4KDUA 1PA3A 2VL2C 1SK2A 4F9ZA 2YANA 3M9JA 1PSQA 3EYTA 4LA1A 3GIXA 3A3TA 2MYGA 4Q5RA 4IBPA 3UOMA 3U6VA 17GSA 3F9UA 2R37A 1PX7A 5GZZB 1T4ZA 4ML1A 1Y6EA 2K18A 5D8IA 1SD8A 4IQAA 1GTAA 1A2JA 4GSTA 2CX3A 2M80A 3LXZA 5D9TA 4BL7A 1LU4A 3PGTA 4FIWA 2HE3A 6GSYA 4EE0A 2LUSA 3P8WA 14GSA 1Y25A 5LNKe 3ERFA 2ZCTA 2AYTA 4XS4B 3KXOA 2GZYA 1EV4A 4CHSA 2DIZA 3D4TA 2FWHA 1ZGNA 3VWVA 5CO3A 4AJ7A 3TJGA 4K0NA 1H75A 3KM6A 1ZZYA 3ZMKA 2VO4A 2H71A 3KJYA 3CSHA 2QC7A 1FAAA 1XZOA 1T3BA 1XOBA 3GFKA 2BMXA 4POMA 4LMVA 3VI5A 1GSQA 1YF0A 3TOUA 3M1GA 3FYGA 2BTOT 3HDCA 1A8LA 5ELAA 3VWXA 3WD6A 3CSIA 4FH8A 5IIZA 2GS3A 3LYPA 1YEPA 1PMTA 1K3YA 5DBQA 1R4WA 3GHAA 5J3RA 4WEYA 2H19A 1F3AA 3FHKA 5IMDA 1GTUA 1OC8A 1M2BA 1OE7A 2RUEA 4PURA 4AJ8A 2TRCP 4F0CA 2LNTA 3ZVJD 5G2ZA 2GZPA 5ECRB 2LRTA 4RQXA 3CMIA 2YV7A 1TDIA 3ME8A 3GX8A 1GSFA 2X64A 2HLSA 3A5WA 2V6OA 3IE3A 1G0TA 5DQSA 2JL4A 2OBIA 4JEDA 2GDRA 3M8NA 2CVDA 4MPGA 4ZL9A 5J9BA 1BQ7A 1TK5B 1W89A 2VCWA 2YP6A 4IS0A 5ECLB 2FCHA 5JWQB 4EO3A 4KH7A 3TUEA 2AB6A 4IKHA 1SKWB 5A4UA 2WS2A 4IP6A 3RDWA 3D22A 3QOUA 1QGVA 3TB2A 5F05A 4G9HA 3QAVA 4JU5A 4N11A 1JLVA 2H75A 2C8UA 4QL9A 4ECCA 1T4YA 3D0ZA 3DWVA 1TK0B 1T8EB 3VWWA 2PUKC 4EVMA 5H5RA 2O7KA 3APQA 1QK8A 5ECIB 3EVIA 4OCFA 1M9AA 2X8CA 2H1GA 2CVKA 1G6YA 3QAGA 2FNOA 4E8HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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