1MH4A

Maltose binding-a1 homeodomain protein chimera, crystal form ii
Total Genus 136
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
136
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDAALAAAQTAAAAAISPQARAFLEQVFRRKQSLNSKEKEEVAKKCGITPLQVRVWFINKRM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Sugar binding, dna binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Insights into binding cooperativity of MATa1/MATalpha2 from the crystal structure of a MATa1 homeodomain-maltose binding protein chimera
pubmed doi rcsb
molecule keywords maltose binding-a1 homeodomain protein chimera
total genus 136
structure length 418
sequence length 418
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-08-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13416 SBP_bac_8 Bacterial extracellular solute-binding protein
A PF00046 Homeodomain Homeodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 1mh4A03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mh4A01
1MRPA 4NF8A 4KCDA 3GBGA 3A01A 2F6GA 3ZQLA 2VP1A 2F7BA 2HOSA 2H25A 3PMWA 4ZEBA 2LP0A 3IR1A 1D9YA 4KCCA 1VNDA 5JEIA 1LAHE 1B1XA 3O6HA 4EEFG 1US4A 2B3BA 1MNMC 2Y2ZA 3KN8A 3BR6A 1X2NA 2OF7A 1GTKA 1M5EA 2HYJA 5I2NB 1I6HJ 3S9LC 1JTXA 1MQDA 2UVIA 4JBZA 2I10A 1JW4A 1FTMA 4A3LJ 4H1XA 5IKBA 1F9BA 1LFHA 3LC8A 4CYCB 2IEEA 2PBWA 3H03A 1E3OC 4BDQA 2HOAA 4QSCA 4RXLA 4IB2A 4QFOA 3FD3A 1EF4A 3Q26A 5I2KB 1XOCA 4KD5A 5IOYA 3T9UA 4QFNA 4GVOA 1ZTYA 2GRVA 4NF5B 1MY2A 1POTA 1FTTA 1MDQA 5M3FJ 4E0WA 4EUOA 2H8RA 5FHOA 4DCYA 3QUFA 4IHWA 2DMQA 2BJJX 1PB9A 1RESA 1D4NA 4DCXA 3OSFA 3TTNA 1GR2A 3QAXA 4FIMA 2EZIA 2F7AA 2O1MA 3TEPA 4DYRA 2THIA 5BUUA 1UTBB 1MBGA 3OO6A 3OEMA 3TTMA 2B3FA 3H7MA 4KHZE 4RK9A 4DLDA 1BIYA 3JREA 3OO9A 5TP9B 1TWAJ 3E3KA 1SW4A 4MH5A 5C4JJ 2JWTA 1SFOJ 4A3BJ 1ETWA 5FLVA 3R7XA 2Y7KA 4EQ9A 4UUTA 3JRCA 3K6UA 2DA7A 2JN6A 5KCJA 3BFTA 1OFCX 2X48A 2O84X 1MBHA 2FQ4A 5J1YA 1Y3PA 4M3DA 5CI5A 5A5XA 3KG2A 4GQOA 3K1PA 1NMUA 1MQIA 3QQAA 1VR5A 3GTGJ 3SERA 3K02A 1FW0A 1U9OA 2Z8EA 3CI8A 4UA8A 1LAGE 1Y20A 4H6DA 4RA1A 1TWFJ 1SI1A 2JA7J 3ODBA 2Z8DA 1Y1MA 2XXTA 3D4GA 1MSFC 1NH7A 3T9HB 2XXYA 3TW6A 2D21A 3LSGA 4N13A 2ZYKA 3K1NA 5AA4A 2H4IA 1T0KA 3N6UA 2PMZN 1B4ZA 3DELB 4G8MA 3H06B 3JRAA 1LFBA 1FQDA 5GP9A 1PDAA 2Y7IA 3S9EA 2P81A 3B6QA 3B6WA 1JVYA 1NKXA 1LB9A 1Y3QA 1FQCA 1B8IB 3S9NC 3C4MA 5AA2A 3S2DJ 1Y3NA 2G0EA 3MP1A 2I0BA 3FVNA 5I58B 1B3HA 1PUFB 2XXRA 4F39A 4ZEDA 3M3LA 1M5CA 4R6HA 1TWCJ 1X58A 2CUFA 2W48A 3IOTA 5EGOA 3ZQHA 1CE2A 4OZ9A 2WV1A 3MKLA 2N8GA 2UXAA 5FKOA 2O69A 4Z0IA 2RAEA 3Q0VA 4IO5A 3B6TA 3OXNA 3IOWA 2DQVA 2NVTJ 3H6VA 1HSJA 4BDRA 3HHGA 1ETQA 1Y1ZA 3TCGA 4PQJA 1OVTA 2HZLA 5K7HA 4ELOA 2GM4A 1AKHB 4MLOA 3IJOB 1HCRA 3O2AA 3UIFA 1S7EA 5GPAA 1A8FA 3PGFA 5KDTB 2MGQA 4M3GA 4A3FJ 2XPWA 1MM6A 3HOXJ 1SBPA 1OVBA 1LBBA 2Y31A 3BG5A 2EH3A 1QKAA 2QMWA 2R7ZJ 4C2MJ 3Q28A 1DSNA 1LCTA 4YMBA 4JWXA 5HBCA 4YKIA 2ID3A 1B7ZA 1B5JA 4D7MA 2AL5A 3TEDA 2QF7A 2R71A 4G8NA 3CFZA 3FZVA 3FXQA 5IP6A 2VD3A 4XK4A 2XX8A 4U21A 4OHNA 1ETVA 4DXCA 3TYHA 3GLBA 4HTGA 4GXSB 3CR9A 4LZ5A 5J1DA 1ZTRA 5JK4A 3N6TA 3ZQFA 1N3XA 2HAUA 4ECFA 3BBRA 4F3GA 2QL3A 4RJZA 2F8DA 3JYRA 1ZR4A 4X1EA 3EHTA 2P0SA 5C4XJ 4KR5A 2ONSA 3C9HA 1S50A 2JK3A 1FQFA 3CVGA 4G68A 2YS9A 3CIJA 3CSGA 3A09A 4FEBA 5K7FA 4ISUA 5EYFA 1LAFE 2CJJA 3TP0A 1APLC 3RZDJ 2OLBA 5H8HB 3WHBA 1XVYA 2DA6A 2Q89A 4P11A 4JWOA 4IGRA 3HOWJ 2DE4A 1SYIA 2XD3A 3TFLA 2CZLA 1K61A 1ANFA 1OLCA 2E2HJ 3JRBA 2K40A 5EF6A 2I6EA 3G3KA 1Q35A 1B58A 4JX4A 4Q8RA 1JUSA 5A5XB 4FATA 1SDXA 3JR9A 1MXWA 1I50J 3VPRA 1UTHA 4XTCQ 1YPNA 3UK4A 4MBPA 3CG3A 4WXJA 3OO7A 3H3GA 1R9QA 3S9MC 1D5YA 3U72A 4NMYA 3KOSA 3WHCA 4L17A 4YICA 3LOCA 2UVGA 3O8GA 2DOJA 3OEKA 2NUVA 1QUJA 2DMNA 5I2NA 1MH4A 3PD8A 3A3CA 1MPCA 3MVPA 4CYCA 1MBFA 1OQHA 4MO7A 2VOZA 3S1RJ 4I6ZA 3S15J 3O97A 3R26A 4P0GA 2I0CA 2F78A 3RZOJ 4X6AJ 1ZU0A 1TWHJ 1MXYA 4LA9A 2REGA 5I2KA 3JRIA 2LD5A 2V84A 4IEJA 1US5A 2RF1A 2ABHA 3LSFB 5CM6A 2JA5J 4ELQA 3MP6A 4NF5A 4U1ZA 1Y1WJ 4N6PA 1VFCA 3ZS6A 2K9QA 3GTKJ 4PETA 1BTJA 2V3TA 3RT8A 2AHQA 4JSDA 1BW6A 3M3KA 5L9SA 4QSEA 2Q8JA 2HI3A 2GFEA 1LFGA 1YRNB 3OSRA 4DE8A 2XPUA 4Z7EA 2E1OA 4M6VA 1JEUA 3PPNA 4JX6A 2DA5A 1ETKA 3G7WA 4XRSA 4OETA 3E9XA 4YB6A 2DN0A 1NFTA 4C1TA 1JUPA 4MIMA 2OWSA 4WEPA 4GFRA 1UTBA 4L5EA 3GZGA 2FJ1A 4EF1A 4R6YA 2I4CA 3C34A 5K2YA 1J1NA 2JMWA 3GBAA 1URDA 5TP9A 4HS7A 1IDYA 3C2BA 1JT0A 1OIBA 4A3DJ 4KYEA 2KT0A 4KYDA 1N76A 3H6WA 4FE4A 1A5JA 3L1PA 1FTKA 3LSLA 4POXA 1XT8A 5JTYB 1TWGJ 3DCFA 4IHVA 3BT9A 2E1SA 2HCAA 2ZXTA 3FXRA 4NTLA 1BL0A 3K6VA 1HOMA 4GXAA 3JRFA 3MWBA 2OBGA 2L0KA 2AIXA 5DEXA 2O1LA 4WEDA 3TW7A 3UKGA 5FKNA 3H0GJ 1MQHA 3OMBA 4Q5TA 3AXFA 3UP9A 4QHQA 2ZB9A 2JJ7A 3BFUA 1GV5A 2H99A 2AO9A 1EH3A 2Y9ZA 4THIA 2H9BA 3T66A 1Y1VJ 3K2AA 1SW1A 3G3JA 4R72A 3VVFA 2XHDA 3HHFA 1B8IA 3FK7A 2M2EA 3TTRA 3TZAA 1WODA 5J3LA 2RC9A 1BA5A 3H6UA 3C32A 3F11A 4Y52J 2DSFA 3JRDA 1N3WA 5F0CA 5L8DA 3FIWA 1EZPA 3OIOA 1MG1A 4ZZAA 1SQYA 3WAFA 3RT6B 1A99A 1SYHA 4NF4B 1XS5A 5F1JA 3O8HA 2VGQA 3Q25A 3CRBA 2CRGA 3VFJA 4J19A 4DXBA 3SESA 3LSXA 1B51A 1AOVA 4IO6A 1GDTA 1TWYA 1OQGA 2LR8A 1IXHA 1MS7A 3O6GA 1ETXA 3QSLA 1VI0A 4DZ1A 3BQZA 4HNVA 4OXVA 3VXCA 3MZ1A 5EYRA 4OYVA 1DOTA 2XXUA 1AKHA 1UTHB 2O9LA 3EN3A 3IH2A 1HDDC 3I4MJ 1QVUA 2M8GX 3HCQA 5DTDA 3K1MA 5FKLA 4F3BA 5K7ZA 2NXOA 5C44J 4DZJA 3HB9A 1B5HA 4PFYA 5KDTA 1ENHA 4LATA 4M3FA 2F6PA 4FCYA 4A69C 3HGGA 4RK2A 1B1HA 1WCMJ 2NS8A 5IYBJ 1MXXA 4DDDA 5K2XA 2E19A 2XGDA 5TPAB 3MVXA 5LOMA 3U8QA 1ATGA 3SDGA 1POGA 2HEUA 2XXPA 3O9PA 1EZOA 4ZEKA 4ESWA 1N7WA 3B6AA 3HM5A 3VDFA 2LFBA 3LUYA 3C35A 2QSXA 5IYDJ 4QF9A 1U9NA 2R0QC 4AC0A 4A3MJ 4X9TA 4H8JA 2Q9TA 3QIMA 3DP6A 3MQ9A 1IXIA 4LVQA 3K2DA 2WKYA 4BDNA 5ISUA 3D1NI 4YB7A 2A5SA 3PMXA 2VPRA 1R9TJ 3OENA 5DVJA 5I59B 1ZMGA 1Y4CA 1MPBA 2ZMBA 1NK3P 9ANTA 4QRZA 2UVJA 3HO7A 3S16J 3B6CA 5HODA 3E13X 3U92A 3FV2A 2AL4A 4QFLA 1ZBMA 2XXIA 4G77A 3BTJA 3SFIA 3CQZJ 4S0HB 2CQQA 4RPNA 2OK2A 2VD2A 1RYXA 3MVYA 2PMSA 3IH3A 5H8HA 4C3IJ 4DYQA 4OEVA 1NH8A 3MBPA 1GVDA 1MM7A 2DTZA 1B32A 4BDOA 3C33A 1GV8A 2DXRA 1IG7A 5FHMA 3TQWA 4MFEA 4KQPA 4U23A 4HCYA 2TRTA 2QJEA 4YKKA 3S1MJ 2OPTA 3NARA 2Z23A 2NS7A 3B7DA 1BLFA 4IO4A 2ZNTA 2DJNA 2DWIA 2F36A 2RKMA 3KGCA 3ECRA 2R9JA 1VE4A 3V83A 4BBRJ 2DP8A 3H3VK 1A7LA 4Q30B 4RNSA 1AIVA 2L7MP 5DEXB 2IBDA 1B46A 3FJGA 4YZZA 3RY3A 3SJMA 2B63J 2XSDC 3W9VA 5F04A 5M5WJ 2EZHA 1RR7A 2YLNA 1Q1VA 2HXWA 4BDLA 5CBSA 1IXGA 4OFJA 1RKMA 3CSBA 3MPLA 2YJPA 1VSOA 3I5OA 3HPIA 1R6ZA 1P1WA 3VE1B 1RYOA 4A3CJ 4OTEA 2H5YA 2DMPA 2Z8FA 3T93B 1DPPA 2X9DA 5AE4A 3RQIA 3IV5A 1I6QA 1QJMA 1Y9UA 3U1OA 3RTWB 1PBPA 3OOUA 2K9SA 2F7CA 4ZZEA 1IQ7A 5ICTA 1JGGA 4XXUA 4HW8A 2ME6A 4O3AA 4LUBA 1NNKA 1AH5A 1N7XA 1FTJA 1CQTA 3IH4A 4OFOA 1HSEA 4H67A 4M1VA 4D7NA 1IGNA 5CC2A 4FISA 4D5FA 1YRNA 2HXIA 1EU8A 1H44A 1I69A 4FE7A 3ZQCA 2V93A 2F34A 1NL5A 3O29A 3O6IA 3TODA 3JV9A 1UQWA 1LSTA 3S2VA 1HDPA 2XXWA 1IJWC 2Y0SN 1DU6A 3SEWA 4G68C 3GTMJ 1JTYA 1WVJA 1NTCA 1P7JA 1U78A 4W1UA 2JA6J 1I6BA 2KLFA 3IOUA 4XIDA 3M4OJ 4XKPA 1F36A 2P1SA 4ZS9A 2NVXJ 1IEJA 4F31B 3M8UA 2DWAA 1MY4A 1SD3A 1IC8A 5JTYA 5E3NA 3PD9A 1FCKA 4D5CA 3FVKA 1VF9A 3FJ7A 3EF7A 4HCWA 1IDZA 5DVFA 4IO2A 4E0XA 1M5BA 4XRSG 2R5YB 3MAMA 1FEXA 1I3QJ 4OVJA 1SVXB 4FEDA 3PM1A 4TLMB 4U2RA 1T56A 1YAEA 3HBLA 1LBCA 3SEUA 3U94A 4A3GJ 2ALUA 3HEFA 2RC8A 2GHBA 1LLSA 1UHSA 4AYBN 4G2ZA 2QPQA 2Y7RA 3E7LA 3I3VA 3VVDA 2XXXA 1XG1A 4JB7A 5E3LA 2DWJA 2RC7A 2DMTA 3FVOA 1MY3A 1WH7A 3LSRA 1GVCA 5ITPA 3HKZN 3PO3J 2Y84A 1BJZA 3LNQA 1P1OA 1B7HA 1ZK8A 4NF6B 1JKPC 1B6HA 1QULA 3RKQA 1T33A 4X48A 2MSYA 4ONYA 3QXMA 4C0RA 4F29A 2P2AA 1B0LA 4FTHA 4OENA 1ZR2A 2GLOA 4NF4A 1B9JA 4BDMA 3FXUA 3CMYA 1M5DA 2XGEA 1CB6A 4Y7NJ 4JDFA 2LY9A 4F1VA 2EZLA 1XHYA 4GOTA 2Y9YA 4G4PA 4ZEIA 4NE4A 1P7IA 5E3MA 2QMXA 3G3HA 1POY1 4H65A 4Q0CA 2NVYJ 4I76A 2DVZA 1YTVA 3USDA 3BR3A 3KJTA 4F19A 1QVSA 2V3UA 3MUQA 5AA1A 1JKOC 1JEVA 1ETOA 1BP5A 4R75A 1TT1A 1PBQA 2EBIA 2ESNA 3ZKLA 1FIAA 1MY0A 5J1UA 1B4HA 4NWDA 1URGA 3JRHA 3PV0E 1Z7ME 1P99A 1M5FA 3W6VA 4OFLA 5AA3A 5TPAA 2QS3A 3H4ZA 3RGYA 1II5A 2VKVA 5AA2D 1A8EA 2E2IJ 1XVXA 1TFDA 5ICQA 3KFMA 1MBEA 4F3SA 4FECA 2ME0A 4QTRA 5HPQA 3V5AA 5IPAA 1FQEA 1FIPA 1GGGA 2X26A 4QIWN 1IRZA 5M3MJ 4U22A 1Z77A 3TCHA 4FJPA 5FKMA 1H3DA 3TKDA 1QKBA 2QCOA 1DU0A 1QVTA 3IB1A 2CMOA 1LE8B 4OERA 1K83J 3NAUA 1ZIUA 5I59A 5H8SA 1URSA 5F08A 2ZNUA 1IV6A 2ONRA 4F1UA 2G29A 2TCTA 2VI6A 1FQBA 3FJMA 1B3LA 1RKTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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