The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTALTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structural and functional effects of apolar mutations of the distal valine in myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen storage
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| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
67
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-06-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FDH A; 1BVC A; 1Y01 B; 1O16 A; 1JDO A; 2MYA A; 3MOU A; 1HGA A; 3UHN A; 4H2L A; 4MPM A; 2ZS1 A; 3UHB A; 1MLR A; 1VRE A; 1YOH A; 1XQ5 A; 2W72 B; 2LH5 A; 1SHR B; 2ZS0 A; 1YEV B; 1DXT A; 5D1V A; 3WFW A; 2D2M B; 1Y0T A; 3PEL A; 1LTW A; 1PBX B; 2R4Y A; 5CN9 A; 1O1P A; 2MGF A; 1Y8H A; 2FRK X; 3NMM A; 4MQH A; 1HGA B; 3UBC A; 4FWY A; 3MKB A; 5EOH A; 4FC3 A; 4H2L B; 2ZS1 B; 3K9Z A; 1JPB A; 3WFT A; 1XQ5 B; 1QXE A; 1CG5 A; 2GKM A; 1YOI A; 2ZS0 B; 1MGN A; 3ARJ A; 3PEL B; 2OLP A; 1GCW A; 3G4U A; 1K1K A; 5EQM A; 1R1Y A; 1O1P B; 1RQ3 A; 3DHT A; 4FWZ A; 3ZJP A; 4FH6 A; 4MQH B; 2AUP A; 2G3H A; 1C7C A; 1XZU A; 3BOM A; 5HLX A; 1NZ5 A; 3K3U A; 1QXE B; 3ZOL A; 1CG5 B; 2H35 B; 1EW6 A; 3WHM A; 3WCV B; 2G0X A; 5SW7 A; 2DC3 A; 5JDO C; 1GCW B; 2GDM A; 2AV3 A; 3ZJH A; 1RVW B; 2SPN A; 1YHU D; 2V1E A; 1RQ3 B; 3DHT B; 4NK2 A; 3M38 A; 4OF9 A; 1HGC B; 3BOM B; 3DUT B; 2SPM A; 1MYM A; 1Y4R A; 2D60 A; 2BNL A; 3WHM B; 1DWT A; 4DC8 A; 5SW7 B; 4IRO A; 4G51 B; 2R4W A; 1FHJ A; 1MLQ A; 1CG8 A; 3R5I A; 1OJ6 A; 7HBI A; 2ZSX A; 3HC9 A; 2VEE A; 2ZT0 A; 1Y4R B; 2LH2 A; 5HLU A; 2D60 B; 3PI1 A; 1VXD A; 4IRO B; 2HBC A; 1XXT A; 4N7P A; 1FHJ B; 3GDJ A; 4LPI A; 1CG8 B; 3R5I B; 2O58 X; 4WJG 1; 4XS0 A; 3WCU A; 1KFR A; 1MYJ A; 3E5O A; 4KMW A; 1IRD A; 1SI4 A; 2ZT4 A; 2QMB A; 3QM8 A; 1HLM A; 3K8B A; 2ZSN A; 3M3B A; 1Y4B A; 4ILZ A; 1YVT A; 2HBC B; 1MLL A; 1CH4 A; 2V1K A; 3GDJ B; 2V1J A; 3AT5 A; 4N7O B; 1N9F A; 3WCU B; 1SPE A; 2DHB A; 1IRD B; 3UHE A; 2VLY A; 2QMB B; 5F2A A; 3K8B B; 4O4Z A; 3P5Q A; 1Y4B B; 3QZZ A; 5C6E A; 106M A; 1YVT B; 1XZ2 A; 4F6F A; 4ESA A; 3AT5 B; 3E4N A; 1J40 A; 1MYG A; 1BZ0 A; 1NXF A; 2HZ1 A; 2BLH A; 2DHB B; 1FLP A; 5JOM A; 3UHZ A; 1GVH A; 3P5Q B; 1IWH A; 5C6E B; 1QSH A; 4HRR A; 1XZ2 B; 2H8F A; 2MGB A; 1XY0 A; 1F63 A; 2C0K A; 4ESA B; 4ODC B; 4SDH A; 1J40 B; 1YDZ A; 3ASE A; 1YHE B; 1JEB A; 1BZ0 B; 1O1N A; 2V1F A; 4KMV A; 1BUW B; 3S48 C; 2XYK A; 1JZM A; 1Y0D A; 3FH9 A; 1XZ5 A; 3OZV A; 4G1V A; 2LH7 A; 2ZLT A; 1CIO A; 1IWH B; 3ECL A; 103M A; 1A9W A; 1J3Z A; 3HEN A; 5CNC A; 1BZP A; 2NSS A; 1QSH B; 2H8F B; 1G0B A; 1XY0 B; 1Y2Z A; 5CN5 A; 1A6G A; 2G0V A; 4NZI A; 2PGH A; 2ZS0 D; 1YDZ B; 101M A; 1JEB B; 3S1I A; 1O1N B; 2PEG A; 2VYZ A; 3FH9 B; 1KR7 A; 1XZ5 B; 1CP5 A; 1CH7 A; 2ZLT B; 1DXU A; 107M A; 1MYH A; 3VRG B; 1Y4G B; 1B0B A; 1NAZ A; 1J3Z B; 2CMM A; 1LHT A; 1UIW A; 1YZI A; 1G0B B; 1Y2Z B; 3UHG A; 3GQP A; 2PGH B; 3WCV D; 2EB9 A; 1UFJ A; 2R80 A; 3TLD A; 1DWR A; 1Y22 A; 3AQ6 A; 1JF3 A; 2EKT A; 1DXU B; 1Y46 A; 3U3E A; 1UIW B; 1ITH A; 2R50 A; 2LH6 A; 1YZI B; 1HAC A; 1OR6 A; 4VHB A; 3IXF A; 3GQP B; 2O5T X; 2VEB A; 4UUR A; 1G9V A; 3HEP A; 3AQ5 A; 1YHU A; 3D4X B; 2ZSZ A; 2R80 B; 2XKG A; 1Y22 B; 1GBV A; 2ZLU A; 1BIJ A; 2HBS A; 2GRZ A; 1CP0 A; 1XYE A; 1Y46 B; 2MBW A; 4ROL A; 1JY7 B; 1HAC B; 1MNK A; 2W6W A; 3WFX A; 1MTJ A; 1DO4 A; 1QXD B; 2V1I A; 1HV4 A; 1G9V B; 1FDH G; 3QQQ A; 2MGD A; 1YHU B; 1MBC A; 110M A; 4MQI A; 2R4X A; 2Z6S A; 3QJB A; 3UH5 A; 1HSY A; 1GBV B; 1FSL A; 2ZLU B; 1BIJ B; 2HBS B; 1XYE B; 2DN2 A; 3BJ3 A; 1Y0C A; 4PNJ A; 2BLI A; 1A0U A; 2Z6N A; 2NX0 A; 3ZOM A; 2VYY A; 3ZJI A; 2SPL A; 2D2M C; 1KD2 A; 1MLO A; 1HV4 B; 5F0B A; 2ZT1 A; 3PI8 A; 4MBN A; 3DHR B; 4YU3 A; 4MQI B; 3QJB B; 3O89 A; 5MBA A; 2HBE A; 3GYS A; 4JYQ A; 1Y8I A; 1O1J A; 2ZFO D; 2ZS1 C; 2DN2 B; 3BJ3 B; 1Y0C B; 6HBW B; 5IKS A; 1A0U B; 1YG5 A; 1COH B; 4MQC B; 1MLH A; 2D6C A; 2EB8 A; 3MJU A; 3PI8 B; 1MYT A; 3QM7 A; 2MGM A; 1SPG A; 4YU3 B; 2HBE B; 3GYS B; 3PIA B; 4C0N A; 1Y8I B; 3AG0 A; 1O1J B; 2RI4 A; 1MKO A; 1LFQ A; 4MU5 A; 1O1M A; 1JL7 A; 1YG5 B; 4HRT A; 5CN6 A; 3SZK B; 1CIK A; 1UC3 A; 3MJU B; 1BZR A; 1SPG B; 1BZ1 A; 3LB2 A; 4M4B A; 5EE4 C; 4MQK A; 2ZSS A; 2RI4 B; 3HYU A; 1MKO B; 1LFQ B; 3MVC A; 1GBU A; 1O1M B; 1GDJ A; 5D5R A; 4HRT B; 4U8U D; 3UHI A; 1NIH B; 4H07 A; 3MBA A; 3ZJR A; 1V5H A; 2HBG A; 1BZ1 B; 5KER B; 1RTE A; 1TES A; 3HRW A; 108M A; 4M4B B; 2OHB A; 3UHR A; 3PI2 A; 4MQK B; 3E5I A; 3HYU B; 3UHU A; 1YVQ A; 5ILE A; 3WFU A; 1MBI A; 1GBU B; 1MTK A; 2ZLX B; 1LFL A; 5E29 A; 1NWI A; 3QJE B; 1Y7D A; 3SDH A; 3DR9 A; 1S0H A; 1MLJ A; 3KUN A; 5EUI A; 1CO8 A; 3HRW B; 2R1H A; 1MLN A; 1IRC A; 1Y35 A; 2W6X A; 3LR7 A; 1YVQ B; 1A6K A; 1A01 A; 2OH9 A; 3UHS A; 1Y5J A; 1MBD A; 1BZZ A; 5EET A; 3WCT A; 1LFL B; 2QSP A; 5E29 B; 3E55 A; 1Y7D B; 2O5L X; 4BJA A; 1G08 A; 4NXA A; 3V2V A; 1S0H B; 2H35 A; 3BCQ A; 3WCV A; 2GL3 A; 4F6D A; 5EUI B; 1M6C A; 1UVX A; 2R1H B; 4UIQ A; 1YE0 A; 3WCU C; 1VXC A; 2ZLV A; 4GZG A; 1RVW A; 1Y35 B; 2QLS A; 5HAV A; 5CN8 A; 1YMB A; 3IA3 B; 3ARK A; 2HHB A; 2YRS B; 3QJD A; 3ZJN A; 5B85 A; 1A01 B; 3A5A A; 3AQ7 A; 1Y5J B; 1HGC A; 1BZZ B; 3WCT B; 2QSP B; 4G1B A; 3DUT A; 1MBS A; 1G08 B; 1VXH A; 1EBT A; 3BCQ B; 1AZI A; 4N7N A; 1XZ4 A; 4G51 A; 4L2M A; 1NQP A; 1YE0 B; 2ZLV B; 4B4Y A; 2QLS B; 1N9H A; 1YCA A; 2H8D A; 3PI3 A; 1HBG A; 1A3N B; 5CNF A; 2HHB B; 1Y7C A; 3QJD B; 4F4O A; 4WJG A; 4F6J A; 1A3O A; 1CO9 A; 4NS2 A; 1JL6 A; 1LH6 A; 2D2N A; 4L7Y A; 4PQ6 A; 2MB5 A; 1SDL A; 4N7N B; 1XZ4 B; 1DO1 A; 2MGJ A; 1NQP B; 1H1X A; 5E83 A; 1DXC A; 3NG6 A; 1V4X A; 3ZJQ A; 1I3E A; 1Y4P A; 1MBN A; 2H8D B; 3UH7 A; 4NI0 A; 3QJC A; 1Y7C B; 3A5B A; 4F4O B; 1A3O B; 1C40 A; 2VM0 A; 1OUT A; 2ZSR A; 2D2N B; 3OGB A; 2G12 A; 1J7W A; 1S69 A; 4AVE A; 1ECO A; 4L7Y B; 3NL7 B; 1URV A; 1JZK A; 1SDL B; 2O5B X; 1MCY A; 2FRJ X; 5E83 B; 2ZFB A; 3NG6 B; 1V4X B; 2BW9 M; 1D8U A; 1Y4P B; 3QZX A; 4N7O A; 1WVP A; 1I3D A; 1UX8 A; 4NI0 B; 2OHA A; 2GRF A; 3QJC B; 1CH2 A; 4PQB A; 2ZFO A; 1C40 B; 1MYZ A; 1OUT B; 1MOH A; 4TWU A; 1J7W B; 4O2G A; 2BWH A; 2MGI A; 1WMU B; 1IT2 A; 3H58 A; 3QM9 A; 1OFJ A; 3W4U A; 4ZVB A; 1MOD A; 2ZFB B; 1K0Y A; 4UZV A; 3UHW A; 1HGB B; 3OO4 A; 1YEU A; 1OUU A; 3WCW D; 1Z8U B; 2G14 A; 1MZ0 A; 2ZT2 A; 2ZFO B; 1V75 B; 1VXA A; 1MNH A; 3H57 A; 1VRF A; 1S6A A; 4C44 A; 2XKI A; 2W31 A; 1MOC A; 3W4U B; 2ZST A; 3D7O A; 1Y4Q A; 3G4Y A; 1O1O B; 2R4Z A; 1LFY A; 1BBB B; 4XDI A; 1K0Y B; 3A9M A; 4ODC A; 4MQG A; 3OO4 B; 1YHE A; 1UT0 A; 5AZQ A; 1GDI A; 1YEU B; 1OUU B; 1CH3 A; 5CHQ A; 1BUW A; 1YH9 A; 2NSR A; 2WY4 A; 5ILM A; 2VHB A; 1LFZ A; 1A0Z A; 4NI1 B; 3MJP A; 4U8U A; 4HHB B; 2GNW A; 3MYM A; 3QM6 A; 2MGL A; 3D7O B; 1UFP A; 1Y4Q B; 1YHU C; 1QI8 A; 1LFY B; 3ECX A; 2QU0 A; 4MQG B; 1ABS A; 1X9F D; 2GNV A; 2AV0 A; 3EDB A; 3RJN B; 4O35 A; 1YH9 B; 2VLZ A; 3IC2 A; 1LFZ B; 1A0Z B; 3VHB A; 1Y0W A; 3MJP B; 1Y4G A; 3VRG A; 4U8U B; 3B75 A; 1MLS A; 3ZJS A; 1W92 A; 1NWN A; 1H97 A; 4DWT A; 3KUO A; 2FRI X; 1QI8 B; 3VAU A; 1MLF A; 3UHV A; 1EWA A; 3UI0 A; 2QU0 B; 1URY A; 2QFK A; 2GTL D; 3BA2 A; 4HBI A; 1OFK A; 1THB A; 3IC2 B; 5CHR A; 1Y0W B; 1NPF A; 3B75 B; 2GKN A; 2E2Y A; 4F68 A; 1BVD A; 3WCT D; 1AJ9 A; 3WCP B; 1VXG A; 5AZR A; 4DC7 A; 3D4X A; 2NRM A; 3ZJL A; 1U7R A; 1THB B; 3M39 A; 3VRF A; 102M A; 3WR1 B; 2HHD A; 1A9W E; 1Y85 B; 1JY7 A; 1AJ9 B; 4MBA A; 1LH3 A; 1BJE A; 1QXD A; 3A5G A; 1MTI A; 2NRL A; 4HSW A; 2DN1 A; 3UHY A; 1MNO A; 2MYB A; 1NS6 A; 1NEJ B; 1FAW A; 3OZU A; 3VRF B; 3KMF A; 3ONZ A; 2HHD B; 5CMV A; 2O5S X; 1O1K A; 1HBS A; 1Y45 A; 1JZL A; 2D2N D; 3CY5 A; 1WLA A; 1Y4F A; 1VXB A; 2HCO A; 4TWV A; 2DN1 B; 1BAB B; 1CH9 A; 1HDA A; 3DHR A; 3GQR A; 5MBN A; 3V2Z A; 1VHB A; 1NS6 B; 2O5O X; 1FAW B; 3ZHW A; 3D1A A; 3ONZ B; 2KSC A; 1O1K B; 2W72 C; 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2GRH A; 1SDK B; 2EVP A; 1ABW B; 3UHD A; 2ZLW B; 5CN4 A; 1A00 B; 1RQ4 A; 1J3Y A; 1HCO B; 1LJW A; 3G53 A; 3S66 A; 1FN3 A; 3PI9 A; 3UHQ A; 4KJT A; 1RPS B; 3UHK A; 2HBF B; 3G4V A; 2BLJ M; 3UH6 A; 4KN3 A; 1X9F B; 4N8T A; 3EOK B; 1HBA B; 4O4T A; 3EDA A; 1YCB A; 2GTL A; 5M3S A; 1RQ4 B; 1Y31 A; 1J3Y B; 3CIU A; 2YRS A; 1LJW B; 1Y5K B; 3S66 B; 3TM9 A; 1FN3 B; 1HAB A; 3UHT A; 3PI9 B; 1NZ4 A; 4MAX A; 1GDL A; 2AA1 B; 1ECA A; 3HHB A; 1VWT A; 4N8T B; 2AUO A; 1YEO A; 1NZ3 A; 2D5X A; 1DM1 A; 1RSE A; 2GTL B; 3WTG A; 1Y31 B; 4H0B A; 2ZFO C; 5CNE A; 5CNB A; 1A3N A; 1AJH A; 2FAL A; 3CIU B; 1UMO A; 2GLN A; 5KDQ A; 4F6I A; 1HAB B; 2LHB A; 1V9Q A; 1M9P A; 1DXT B; 1Y0T B; 3LQD A; 1J52 A; 3ORD A; 3OZW A; 1O1L A; 3HHB B; 1VWT B; 1Y8H B; 1RQA A; 1YEO B; 3NMM B; 2D5X B; 4MQJ A; 3WTG B; 3HF4 A; 3MKB B; 4FC3 B; 1CLS A; 1FCS A; 5KDQ B; 3OK5 A; 1M9P B; 2MGG A; 3A0G A; 3LQD B; 4FH7 A; 2QFN A; 2DN3 A; 3D17 A; 1O1L B; 3NL7 A; 1LA6 A; 1K1K B; 1R1Y B; 1RQA B; 4MQJ B; 1MWB A; 3QM5 A; 1C7C B; 1DKE A; 1XZU B; 3HF4 B; 4OOD A; 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