The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
70
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sequence length |
154
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structure length |
154
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Chain Sequence |
MVLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTFLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGNFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| publication title |
Structural and functional effects of apolar mutations of the distal valine in myoglobin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Physeter catodon
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| total genus |
70
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| structure length |
154
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| sequence length |
154
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1994-06-15 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3G53 A; 2R1H B; 3BJ1 A; 1BZ0 B; 3MKB B; 1SPE A; 4ZVA A; 2D2M A; 3UHN A; 4NK2 A; 1DO3 A; 3OO5 A; 1VXB A; 2O5M X; 3QJC B; 1QI8 B; 1Y7D B; 5JDO E; 3UHE A; 1YVQ A; 1YIE A; 1DKE B; 1YCB A; 1M6C A; 1HLM A; 1DO7 A; 4C0N A; 1HGA B; 5E83 A; 1UC3 A; 3O89 A; 3S1J A; 1ECA A; 2MGD A; 3GKV B; 111M A; 1Y83 B; 1BZZ A; 1HLB A; 1OUT B; 1NZ4 A; 1YOH A; 1VXG A; 2VRY A; 1QXD A; 1Y46 B; 3ECL A; 1O1K A; 3DHR B; 2GTL D; 1Y8H A; 3ZJN A; 3WCT D; 2SPM A; 2FRJ X; 1Y7G B; 3IXF A; 4LPI A; 1J41 A; 1JF3 A; 1DWT A; 1A0Z A; 1Y22 A; 1G09 A; 2HZ3 A; 4U8U D; 1YGD B; 1DUO A; 1MYG A; 2HCO B; 1MYT A; 3UHC A; 4JAC A; 1Y2Z A; 3WTG A; 2BWH A; 1OR4 A; 1NWN A; 4O4Z A; 1LH3 A; 2MGF A; 3UHS A; 4HSX A; 4MQH B; 1MBN A; 1O1M A; 2GLN A; 2MYC A; 1FHJ A; 4FH7 A; 2R4Z A; 1JL6 A; 2LH6 A; 2D2M D; 1LFT B; 1XY0 A; 3UHW A; 2ZT4 A; 1I3E A; 1CMY B; 1MLG A; 2HBC B; 2MGG A; 1OFJ A; 3UHX A; 1X9F B; 1MLL A; 3DHT B; 3HRW A; 5EV5 A; 3QJB B; 1HAC A; 4N8T B; 1C7B A; 3TLD A; 1A6K A; 3UHQ A; 1UX9 A; 1LHT A; 4MBN A; 4M4A B; 3W4U B; 5CNC A; 4JYQ A; 3A9M A; 4MQI A; 1XZ5 A; 1XZ2 B; 3QJE A; 4WJG A; 3D17 B; 2MGH A; 1HDS B; 1X9F C; 3BJ2 A; 3RGK A; 5MBA A; 2E2Y A; 2MGA A; 3HEP A; 1HAB B; 1BZ1 B; 1ECD A; 3IC0 A; 4B3W A; 2R80 B; 1MGN A; 1DXV B; 4HHB B; 2QLS A; 1MNH A; 2D2N D; 3QJD A; 1DXD A; 3MJP A; 1Y4B A; 5CNB A; 3WCU D; 1Y4G A; 2AV3 A; 1CIK A; 106M A; 2RI4 B; 2D6C A; 4MPM A; 1Y0C B; 3OO4 A; 4FC3 A; 1BAB A; 3D1K A; 3PT7 A; 1BBB A; 4O2G A; 5EOH A; 1URY A; 1A3O A; 1Y0W A; 3R5I A; 4MQJ A; 4MQK A; 103M A; 1F5O A; 1Y31 B; 1O1N A; 2W6V A; 4C44 A; 1Y4F B; 4HRR A; 1O1I A; 1A4F A; 3GLN A; 2GNV A; 1CLS A; 1F65 A; 1J3Y A; 5JGG B; 2ZSY A; 1VRE A; 1J3Z A; 4O1T A; 1JEB B; 1RVW A; 3WCT C; 2V1I A; 2WY4 A; 3ZJS A; 1K1K B; 1MYJ A; 1HBA A; 1X3K A; 3D1A B; 3UH6 A; 1MLH A; 1LFY A; 4U8U C; 2QSP A; 5KDQ A; 3SZK B; 2DXM A; 1O1L A; 2DN2 B; 3AQ7 A; 4N7N A; 1YEQ A; 2XKH A; 1S5Y A; 2GKN A; 1NPG A; 3OJ1 A; 4MQC B; 3UI0 A; 4H2L A; 1HBH A; 3MBA A; 4ODC A; 4AVD A; 7HBI A; 1Y45 B; 2G3H A; 1MLK A; 3PI9 B; 1Y8K A; 1LFQ B; 1R1X A; 1NS6 A; 5EET A; 2HHD A; 1IRD B; 3AQ5 A; 1B86 A; 1Y8H B; 1EWA A; 3ZJR A; 3MOU A; 3OZU A; 2NSS A; 2DHB B; 5M3S A; 2G11 A; 1NIH B; 2ZSP A; 1YGF A; 2G0X A; 1FAW A; 1ECO A; 1Y0T B; 1MTJ A; 1Y0D B; 4KMW A; 2ZLT A; 1LH7 A; 2HBS A; 1Y4Q B; 1LFV B; 3ZJI A; 3NL7 B; 1A0U A; 3BJ3 B; 2R4X A; 1MLM A; 1A00 A; 3NG6 B; 1MYI A; 3HHB A; 3PIA A; 1J7W A; 4YU3 A; 2PEG A; 1SWM A; 5AZR A; 1CP0 A; 3VRE B; 2H35 A; 3K8B A; 2GRF A; 1A9W A; 1KR7 A; 3UHI A; 2Z85 A; 110M A; 2AUQ A; 3S65 A; 1MOA A; 5B84 A; 5HY8 B; 1MTK A; 3QMA A; 2EB9 A; 2H8D B; 1VXC A; 5HBI A; 1QXE A; 3OZW A; 1O16 A; 3UHG A; 3HF4 B; 5HU6 B; 1RTX A; 1FLP A; 2OH8 A; 1IBE A; 1MBC A; 5E6E B; 3MJU A; 4XDI A; 5EE4 D; 2HBG A; 4PQ6 A; 1C7C A; 2OLP A; 3M39 A; 1S0H B; 4NI0 A; 1BIN A; 3BA2 A; 1SPG A; 3ZJH A; 1Q1F A; 5C6E B; 4UZV A; 1RQ3 A; 3UBC A; 1LFZ B; 3K3U A; 1KD2 A; 3OGB A; 3AQ9 A; 2C0K A; 4ROL B; 4IRO A; 5F2A A; 2AV0 A; 1MLF A; 1OFK A; 1CQ2 A; 4O35 A; 2O5S X; 1XZU B; 1YEV A; 3P5Q B; 3UGY A; 1S5X B; 1JP6 A; 1H97 A; 1B0B A; 2ZFO A; 4FWY A; 2ZT1 A; 2LH2 A; 4FWZ A; 1AJ9 A; 2Z6S A; 3NFE A; 1U7S A; 1YHR B; 2Z6N A; 1NZ3 A; 1S6A A; 3WCP B; 1S61 A; 1XXT B; 5CN7 A; 1DXC A; 1Z8U B; 1PBX A; 2D60 A; 3HEN A; 2H8F A; 1SDK A; 3B75 B; 3ZJJ A; 1N9F A; 3QZZ A; 3VRF A; 1O1I B; 1CO9 A; 4ZVB A; 1MWC A; 1J40 B; 1HBS A; 1Y5J A; 2R4W A; 1RQA A; 3HXN B; 2LH3 A; 3ECZ A; 1GCW B; 4FWX A; 1Y0A B; 3TM3 A; 1VWT A; 1JY7 B; 1YE0 B; 3GQP A; 2MGJ A; 4KN3 A; 1YFF B; 1CO8 A; 1CG5 A; 4H07 A; 1QSH A; 1Y4V A; 5CN6 A; 2MBW A; 1Y5F B; 1Y8W A; 4F68 A; 3WCW B; 2DN3 A; 2EKU A; 2NRL A; 1XZ7 B; 1V4U B; 2HBF B; 3GQG A; 4YU4 A; 1FSX B; 2ZLV B; 1YHE B; 1Y4P A; 2ZLU A; 3HYU A; 1THB A; 1IOP A; 1T1N A; 1UIW A; 4TYX A; 1ASH A; 1SI4 A; 1VXA A; 1LH6 A; 2AUP A; 2W72 B; 2ZSX A; 2DN1 B; 1I3D A; 1MBS A; 2V1E A; 3WHM A; 1YG5 B; 4TWU A; 4UIQ A; 1BZ6 A; 1NQP B; 1SHR A; 1DM1 A; 2VYY A; 3D7O B; 5EE4 C; 3BCQ A; 1ABY A; 5CMV A; 5EQM A; 3HC9 A; 1O1P A; 3DUT A; 3CIU A; 1Y85 B; 1QPW B; 1NWI A; 1LH1 A; 1C7D A; 1DO4 A; 3AT6 B; 1YEN A; 3WI8 A; 3EOK A; 1MDN A; 1MCY A; 2ZS0 A; 1RSE A; 3FS4 A; 1MBA A; 1Y5K B; 1N9X A; 1NGK A; 1A6M A; 3UHV A; 3WCV A; 4DWT A; 1MKO B; 1XZV A; 1LFL B; 3LQD A; 1O1J A; 1G0B B; 2HHB A; 1YVT A; 4X0L B; 1DXU A; 1DXT A; 107M A; 2ZFB B; 3PI1 A; 1NS9 A; 5D5R A; 1C40 A; 1HV4 A; 2V1G A; 4HRT A; 1CH4 A; 1OBM A; 1DTM A; 104M A; 1V4W B; 3LB1 A; 1YZI B; 3WR1 B; 1WMU A; 5ILM A; 1XZ4 B; 2QMB A; 2ZLX B; 2BLI A; 1BUW B; 4M4B B; 1YE2 B; 2OIF A; 5EUI A; 1TU9 A; 3FH9 A; 3ZJM A; 2QSS B; 1M9P A; 3PEL A; 2W6X A; 4HBI A; 1Y35 A; 1W92 A; 4G51 B; 2RAO B; 1YEU A; 1K0Y B; 1BJE A; 1MNK A; 1ABW A; 1CH7 A; 3A0G A; 1XCH A; 5CN4 A; 3ZH0 A; 4F6J A; 1F5P A; 4MXK A; 1HDA B; 2HBD A; 4MU5 A; 108M A; 2D2N A; 1A3N A; 1G08 A; 5SW7 B; 4QAU A; 1EBT A; 4IT8 A; 1HCO B; 3WCU A; 1HDB B; 3ZJO A; 1H1X A; 2VEE A; 1VXF A; 3OZV A; 1XQ5 A; 2ZS0 D; 1GCV B; 3S48 C; 112M A; 2HBE A; 1RPS B; 3MN0 A; 3WCV D; 2D5Z A; 1G9V B; 1YH9 B; 3GQR A; 2MHB B; 1FN3 A; 3ZJP A; 2ZS1 A; 2QU0 B; 1BIJ A; 5HAV A; 2O5B X; 1WVP A; 1Y09 A; 2ZFO C; 1ITH A; 1NEJ A; 4HSW A; 1YOI A; 1HBB B; 1Y7C B; 1Y8I B; 1GBV B; 1GLI A; 3ODQ A; 1MNJ A; 2MGM A; 3G4R A; 3GOU A; 2BK9 A; 5ILE A; 4ROM A; 1CG8 B; 1HGC A; 2LHB A; 2AA1 A; 3M3A A; 2M6Z A; 5KKK A; 1GZX A; 1O1O B; 3ARL A; 1A01 B; 1J7S A; 4ESA A; 2B7H B; 3ASE A; 3PT8 B; 1HBI A; 1QSI B; 1RQ4 B; 2MYE A; 1IWH B; 2R50 A; 4WCH D; 2QRW A; 3K9Z A; 2OHB A; 3BOM B; 2ZSO A; 2W6Y A; 1CQX A; 2V1F A; 2MYA A; 3GK9 A; 3S66 B; 1NZ5 A; 2EB8 A; 2SPN A; 1IRC A; 5AZQ A; 4NI1 A; 3GYS A; 1X46 A; 1YHU A; 1Y4R A; 2MYB A; 1HBR A; 3AG0 A; 5CND A; 1NPF A; 2PGH B; 4XS0 B; 4L7Y B; 1MBD A; 2GTL B; 3ONZ B; 3NMM A; 3WCT B; 3GDJ A; 1JPB A; 1YEO A; 2BW9 M; 1SDL B; 3UHR A; 3EU1 B; 2ZS1 D; 2IG3 A; 1YCA A; 3IC2 A; 3AT5 A; 3ZHW A; 4U8U B; 1R1Y B; 4MAX A; 4NXA A; 1Y7Z B; 2YRS A; 1COH B; 2EF2 A; 5KER B; 1V4X A; 3E5I A; 1XYE B; 1OUU B; 3LHB A; 1A9W E; 2ZSS A; 3UHH A; 3PI8 A; 2NSR A; 3UGZ A; 1N9H A; 1CIO A; 2VYZ A; 3BJ1 B; 5EYS A; 2GTL C; 1YIH A; 2Z6T A; 2ZT2 A; 4N7O A; 2D2M B; 2GRZ A; 2LH7 A; 6HBW A; 3OO5 B; 5E29 A; 1U7R A; 3VRG A; 1S69 A; 1VRF A; 4PNJ A; 1J7Y A; 1UFJ A; 1YVQ B; 1YIE B; 1LH2 A; 5JDO D; 5E83 B; 2D5X A; 1FSL A; 1JP9 A; 1GBU A; 1BZZ B; 2CMM A; 2D2M C; 4NXC A; 3UHD A; 3A59 A; 3G4Q A; 1YHU D; 4GZG A; 3CY5 A; 4NZI A; 3KUO A; 1QXD B; 1G0A A; 1EW6 A; 1J3F A; 2ZSQ A; 1YDZ A; 1O1K B; 3O7N A; 5ILP A; 1GDL A; 102M A; 2ZLW A; 1NAZ A; 1J41 B; 1WLA A; 1CH1 A; 1A0Z B; 1D8U A; 1Y22 B; 3EDB A; 1G09 B; 1CH9 A; 4N7P A; 1FCS A; 1HHO A; 2WTH A; 4VHB A; 1HGB A; 1Y2Z B; 2ZT3 A; 3WTG B; 105M A; 3UH7 A; 1V9Q A; 4MBA A; 1O1M B; 4F4O A; 1FHJ B; 2GKM A; 1V75 A; 1XY0 B; 1JL7 A; 2O5O X; 1MYH A; 3UHK A; 1LA6 A; 4MQG A; 1LJW A; 2GDM A; 1DO1 A; 2EVK A; 2HHE A; 2VLZ A; 2D2N C; 1ABS A; 1MYM A; 2R1H A; 2BMM A; 3HRW B; 3WCU C; 1BZ0 A; 1HAC B; 3MKB A; 3LB4 A; 1C7B B; 1LH5 A; 1MOC A; 3ECX A; 2FAL A; 2ZST A; 2BNL A; 2G0V A; 3A5G A; 1LTW A; 3QJC A; 4MQI B; 1QI8 A; 1Y7D A; 2ZS1 C; 3KMF A; 3UH5 A; 2QFN A; 1XZ5 B; 2KSC A; 1DKE A; 3QJE B; 1HGA A; 2ZWJ A; 3BJ2 B; 1JDO A; 2XKG A; 3GKV A; 4DWU A; 1Y83 A; 1OUT A; 3IC0 B; 1HSY A; 2MGK A; 3MVC A; 3EDA A; 2QLS B; 1Y46 A; 3QJD B; 3MJP B; 1Y4B B; 1Y4G B; 2V1H A; 3DHR A; 4FH6 A; 3OO4 B; 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2PEG B; 1Y31 A; 2H35 B; 3K8B B; 1MLN A; 1Y4F A; 2JHO A; 3UH3 A; 1L2K A; 1X9F D; 2OHA A; 3S65 B; 1DLW A; 1JF4 A; 2BKM A; 5IKS A; 3A5A A; 1JWN A; 1QXE B; 2VYW A; 5JGG A; 3R0G A; 1BVC A; 1JEB A; 1YOG A; 1K1K A; 1IBE B; 3D1A A; 3MJU B; 1F63 A; 1IT3 A; 1RTE A; 3QZX A; 3SZK A; 1EMY A; 3UHZ A; 1UVY A; 1C7C B; 4NI0 B; 1VXD A; 1DWS A; 1BZR A; 1JZM A; 2GL3 A; 1VHB A; 1UVX A; 2DN2 A; 1SPG B; 4TWV A; 1RQ3 B; 1ECN A; 4MQC A; 1JZL A; 1HRM A; 1KD2 B; 4IRO B; 1M6M A; 5D1V A; 5HLQ A; 1YEV B; 3ZJQ A; 1Y45 A; 2O5L X; 1N9I A; 3KMF C; 3H58 A; 3A5B A; 3PI9 A; 1LFQ A; 1MBO A; 1TES A; 2ZFO B; 3UBV A; 1IRD A; 1AJ9 B; 3NFE B; 2Z6N B; 2DHB A; 2BLH A; 1NIH A; 2MB5 A; 1PBX B; 2D60 B; 1Y0T A; 1Y0D A; 2H8F B; 1SDK B; 3QQQ A; 4OF9 A; 1Y4Q A; 1LFV A; 2O5Q X; 1MYF A; 3NL7 A; 3VRF B; 3BJ3 A; 1MBI A; 3QM5 A; 1HBS B; 3NG6 A; 2ZSR A; 2NX0 A; 4PQC A; 1Y5J B; 1YMC A; 1RQA B; 6HBI A; 1CPW A; 2MGI A; 3VRE A; 2W6W A; 2SPO A; 1JZK A; 1HBG A; 5HY8 A; 1VWT B; 2H8D A; 1VXE A; 3GQP B; 1CG5 B; 3HF4 A; 5HU6 A; 1AZI A; 2WTG A; 1QSH B; 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