1MPBA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA01
2Q2CA 3ECRA 3K6XA 3C34A 4QFOA 2QSXA 4IO4A 4LQ2A 5F7VA 2HXWA 3HHFA 3W9WA 3FGSA 3K6WA 4JWOA 4F29A 3U8QA 5JTYB 3BFUA 4KYSA 1FTJA 2X7PA 3HN0A 4U22A 5HPQA 2RC7A 4YB7A 5FTHA 1M5BA 5FTIA 3RUMA 1Y3NA 4KI0E 3IL1B 2V3UA 3USDA 2HQ0A 2ANJA 3IB2A 2F97A 2XXHA 1WVJA 2VGQA 2XHDA 3R7XA 2ALUA 3L6HA 5LOMA 4YU0A 1SYHA 2PX1A 1JEVA 1Z7ME 3B6TA 4DXBA 2ZYOA 4JWYA 1LFHA 1LSTA 3LC8A 2NXOA 4H67A 3T96B 3VVFA 3UGWA 3HO7A 3KG2A 1B4ZA 4OEUA 3C33A 4JWXA 4LONB 4EF2A 3FD3A 5EHMA 1P1QA 1MXZA 2Y7KA 4R75A 4ZEIA 3IAZA 1GGGA 2QL3A 2F6GA 3FXUA 1OLAA 3MVYA 5L8DA 2DWHA 1AOVA 4YMBA 1B6HA 4N07A 4OENA 1YTVA 5TPAA 3SDFA 1JEUA 1H45A 3S9EA 2I3VA 3BFTA 1MQHA 3MUQA 1EU8A 3MZ1A 4F31B 4YZZA 4BDMA 2THIA 1HSLA 4F19A 4QRZA 1XVYA 4GOTA 5ICTA 4PFWA 3S4UA 3VFJA 2D21A 1N3WA 2I49A 3SERA 3TODA 5FHNA 1UQWA 1YAEA 5HM4B 4ELPA 4KD5A 2I0CA 3R6UA 4RPNA 3V5AA 1M5CA 3KN8A 2R9JA 1SD3A 1MXVA 4DDDA 3N26A 4OEVA 1EZOA 2HZLA 3Q27A 4PE5B 2DXYA 5DVJA 4EXKA 3TTLA 1B52A 3AXFA 3LBSA 4UA8A 1XOCA 4FEDA 4G68B 3B6WA 1LAXA 2ZNUA 4IY5A 2OLBA 5IKBA 3TMGA 2YJPA 3RTFB 1IQ7A 3K1PA 4KYDA 1II5A 3QSLA 5CBSA 3K02A 1QUIA 3KZGA 3K1MA 3LSLA 1B3HA 3QAXA 1OQGA 2Z8FA 3EPEA 1PB7A 1D9VA 4OFJA 1D4NA 3OXNA 2Z23A 2M8CA 3MAMA 3CG1A 1XS5A 2AL4A 4FJPA 4G4PA 4BDOA 4EXLA 3T66A 2E0SA 2XXXA 1S9TA 3OO7A 3TTKA 1AIVA 4XKPA 1XHYA 2RINA 4L17A 2PYYA 3MWBA 4ELQA 3VLVA 3S9MC 1B3LA 4Q5TA 1URDA 4YAHX 3UORA 4NF8A 2VHAA 4HTGA 5CRYA 1L5TA 3RT8A 3V8XB 4BDQA 1USYH 2W7YA 3RTWB 2Y7RA 1HSJA 1O63A 4H65A 4QFKA 3U92A 1M5FA 2DP8A 2OCUA 5DVFA 3U93A 4GIZA 3HSTA 4F1UA 4JXIA 1QVSA 2LAOA 3MP8A 4OFLA 3SEYA 2F5XA 3ILTB 3IOTA 4DCXA 1MQIA 2QS4A 4LQ5A 4QHQA 2I3WA 1B05A 2IEEA 1Q1KA 3MZ9A 4YB6A 2XX9A 3V89B 3FVGA 4FIMA 4HCYA 4LUBA 1N7WA 4F2OA 4F18A 1A55A 2DVCA 1B7UA 3IB1A 1BIYA 2AIXA 4ND9A 3H06B 5FHOA 3SKPA 5AA4B 2B3FA 1R1NA 1FQFA 1SI1A 2REGA 2V93A 3OENA 4OVJA 2O6AA 5CMBA 1SW2A 5EYFA 4C0RA 4C1UA 1F9BA 2P0SA 2X26A 2ZYMA 1XT8A 2UYEA 4WXJA 2AL5A 1FQDA 2KLFA 4ZS9A 5ITOA 1LBCA 3QK6A 3SEUA 1URGA 3EHTA 4KCDA 4QSCA 1VFDA 2HAVA 1IXHA 4K3FA 1NNTA 3QUFA 3GZGA 4P0GA 1P99A 5H8HB 4E0XA 3B6QA 1MQGA 1H44A 3DP6A 4U4SA 4U4XA 3SEWA 1NFTA 2FNCA 5AA2D 3ONMA 4WEDA 2R6GE 4F22A 3CFLA 4EQ7A 3P7IA 3O9PA 2P2AA 2CZLA 3MBPA 2I0BA 1ZJLA 1Z7NE 2O68A 3CFZA 2E1SA 2RC8A 3PV0E 5DEXB 2FA7A 4HS7A 3HHGA 1LLSA 2O7IA 1LCTA 1FW0A 1OVTA 3RY3A 1VFEA 3KN7A 3OOAA 3E4RA 5KDTA 3VLUA 4RA1A 2ONKE 2UVHA 3CRBA 3TTMA 1FQCA 1QUJA 4OERA 1LAHE 2X7QA 2ABHA 3LUYA 1B3GA 1ZBMA 1OIBA 4RPOA 2Z8DA 5L9MA 5TPAB 3MP1A 2H5YA 1LAFE 4ONYA 5H8QA 2D5WA 1BP5A 1J1NA 3H6VA 3PPQA 3LSXA 5DEXA 3ZS6A 5DYHA 1I6BA 4GQOA 2Y7IA 3QUJA 4LZ5A 3KOTA 3CSGA 2Y7WA 3MQ9A 1MM7A 5DTBA 2XXUA 1PB8A 3FASA 1AMFA 3ODBA 3R26A 3QXMA 4N13A 1SVXB 4POWA 1SW5A 3S9LC 2FYIA 4R72A 1EH3A 3FVOA 1JW4A 4MLVA 2UVIA 1VSOA 1GR2A 3SEXA 3T9HB 3QYTA 5BUUA 3KSJA 5I56A 5AA2B 4RYAA 3BBRA 1DPPA 4U1OA 1RYOA 3SEVA 4ELOA 3PD8A 2B3BA 3DP8A 1MRPA 2DE4A 2DWIA 3RGYA 4ZECA 3TUSA 2DYXA 1B40A 3O29A 3MZBA 5B70A 5I57B 1FTOA 1FTLA 4GWOA 3ZKLA 4Z7EA 4OQOA 1TFAA 4IO6A 1MXYA 4MLQA 3A09A 1UTBB 3TCHA 5AE4A 1YPNA 2UYFA 3TCGA 1NNFA 1FTMA 2VP1A 3UIFA 4PP0A 4BDRA 2OK2A 2VOZA 4IO7A 1S50A 3O97A 2HAUA 3VXBA 2PMSA 3CSBA 1LB9A 2RC9A 1A40A 5EHSA 3C4MA 3N6TA 1B1HA 4GLIA 4NMYA 3MW0A 1M5DA 3KGCA 1UTBA 4QSDA 3FUZA 3M3FA 3W9VA 2XD2A 2VD2A 3FJ7A 4F3SA 4KR5A 4C1TA 4DLDA 3HPIA 3EN3A 3PPRA 4G68C 3Q28A 3T22A 3H7MA 4GRKA 1SYIA 4R2FA 2ESNA 3QIMA 4RNSA 1P1NA 4FATA 1N3XA 2R71A 4O3AA 2Z22A 2DOJA 3LSFB 4G77A 1DTZA 4MH5A 1DMBA 2GRVA 4IO2A 1N76A 1ZKBA 3HV1A 1IEJA 4NF5B 1H43A 1AL3A 3CR9A 3OO6A 3PU5A 3OELA 3GXAA 3RNNA 3GBAA 1JNFA 1UTHA 4GXAA 4M4GA 1OQHA 4KHZE 1UIVA 3MP6A 2V3QA 1ANFA 1QKBA 3O6HA 1P1OA 1YCJA 2HFBA 2XXYA 4UACA 3KBRA 3C9HA 1RYXA 1MG1A 2Q89A 4G8HA 4BLAA 4EQ9A 2Q88A 1LFIA 2OZZA 3PPOA 4GXSB 3A3CA 4GFRA 3KJTA 1NNPA 5K2YA 1OLCA 4G68A 3N94A 1MXWA 5M2VA 4F1YA 1ZMGA 4TOZA 1B5JA 4NE4A 3JYRA 3H3GA 1SW1A 4KQPA 3F11A 4JDFA 1EZPA 5KCJB 3TYHA 1SDXA 4DXCA 1RKMA 1PBPA 4QFNA 1POY1 4TQUQ 4POXA 1MS7A 1MPDA 2I6EA 3CI8A 1MM6A 1URSA 1QW0A 2DE2A 3IOUA 4NWDA 4MFIA 2REJA 2ZYKA 3IOVA 2VD3A 3BKIB 4JBZA 2DWJA 3W15C 4R6YA 2ZYNA 3PMXA 1XC1A 1NMUA 4X1BA 1A8FA 3ILUB 4FE8A 3S2VA 3N6UA 3G3KA 3U72A 4NTLA 1B9JA 1MH4A 4ESWA 3T9XB 4QFLA 3DELB 4R2BA 2DWAA 1HSEA 1PBQA 2F78A 3TAJA 3H6TA 1QKAA 2F7AA 4QF9A 3O6GA 5JEIA 4Z0IA 3E3KA 2QMXA 3TTNA 4F1VA 5BWJA 1SW4A 2G29A 3H6UA 4GF8A 2V25A 4R6HA 4ZE9A 1R6ZA 2GHBA 5I2NA 1B3FA 5L9OA 1A54A 1JW1A 1XVXA 1Q35A 3I5OA 3LR1A 3V83A 4RK2A 1FQEA 1US4A 1S7YA 4DIGA 1WODA 2YPNA 4NF4A 4PFTA 4EF1A 2O1MA 1LBBA 2NUVA 2WKYA 2O7UA 5JTYA 2F6PA 2QS2A 3FZVA 2ZMBA 4NF6A 3FV1A 3RT6B 4PQJA 5I57A 2RCBA 4H1XA 3O66A 4YB5A 1N04A 1I6QA 2GHAA 3PUWE 4OWDA 3PUZE 4RK9A 3I3VA 4I1DA 3Q25A 4RY1A 3OEKA 4Q8RA 1LCFA 3JZJA 3GBBA 1MQDA 3IR1A 1KWHA 4KPTA 3RPWA 5I59B 4F3PA 3IJXB 4KYEA 2Q8JA 1ELJA 1BKAA 1MY1A 1PC3A 3K4UA 1DSNA 1JW5A 3KEIA 4PFYA 4FEBA 3K0VA 1WDNA 2ZNTA 4G8MA 4NF6B 2DS9A 3DP4A 3PUXE 2RKMA 3T93B 3G3IA 3RN8A 1NH8A 2XXVA 3T9UA 1DTGA 4XKNA 1ZU0A 2ONSA 2XX7A 5AA2A 2QPQA 3M8UA 4NEDA 5AA3A 1MDQA 1BTJA 3MPLA 4YKJA 4AQ4A 1A99A 5I2KA 4X9TA 4AB6A 4ECFA 5H8FA 4M1VA 3CVGA 5CI5A 5F1QA 1O64A 1B7ZA 3CG3A 1B32A 2G93A 4R6KA 5ICQA 2I48A 1A8EA 4NWCA 2OWTA 1QJMA 3IOWA 4OHNA 3H03A 3H6WA 3U94A 4DXUA 4DE8A 1Y4TA 4IB2A 4MBPA 4JB7A 3WAEA 1PDAA 2P1SA 5HBCA 5AA1A 5I59A 1Y4CA 3B7DA 4YICA 2Y7PA 3O28A 5TP9A 4ZEDA 5I58B 1VR5A 5DVIA 2H99A 4F3GA 3VVEA 1ZIUA 1B58A 4PETA 1N7XA 2IA4A 2QS1A 4I9DA 2O84X 1QULA 3MJNA 2PVUA 2A5TB 4GVOA 4EDPA 4ESXA 3K00A 2Q9TA 3THIA 1H76A 3OEMA 4I62A 1OVBA 3PMVA 4HW8A 3WAFA 1EZ9A 3O6IA 1TWYA 2XX8A 3OMBA 4R9FA 1TT1A 3C36A 1ATGA 4JSDA 5IAIA 2XXRA 2HEUA 3MVZA 3DM0A 2AYSA 2DVZA 2XXTA 2RF1A 3K01A 2UXAA 1T0KA 3M3LA 3G3HA 1Y3QA 3CIJA 1TFDA 1USYE 3FXQA 2ZNSA 2DE3A 1B51A 3VXCA 5B7DA 3MVXA 2QRYA 4R9GA 1MY2A 4F39A 1MPBA 1B7HA 1JETA 5H8QB 2GH9A 2I58A 1B1XA 1Y3PA 3EF7A 3OO9A 1OMPA 3TPAA 3U1OA 4DCYA 2V84A 2OJTA 4FAJA 3HCQA 3D4CA 4OFOA 3FJMA 1AH5A 4IO3A 4Q0CA 2A5TA 5L9SA 3FVNA 4AB5A 1DOTA 1MY0A 3TFLA 4NF8B 4FECA 3RQTA 2DSFA 2D3IA 2ONRA 3MC2A 3K2DA 4OESA 1GV8A 2F8DA 3TCFA 3UK4A 3H4ZA 1NKXA 4F3BA 1JQFA 1A7LA 1CB6A 1I69A 1LB8A 4IO5A 4H8IA 4GD5A 1PEBA 3K1NA 5CBRA 1BLFA 2PBWA 4OXVA 5CMCA 3PGFA 4EQBA 1MH3A 3GLBA 4LZ8A 1MY3A 2A5SA 1NH7A 4TLMB 3TQLA 3Q26A 4U1ZA 3RLFE 5A5XB 3S9NC 4LP2B 1FQAA 1IUDA 1ZLQA 3G7WA 4E0WA 1M5EA 5ITPA 1MY4A 5I2KB 4IGTA 3OSRA 1GVCA 4H6DA 4H0WA 2F7CA 3C31A 3OSQA 2H98A 4X1DA 5H8NA 4WEPA 3VV5A 4YKKA 4OETA 3UP9A 1D3KA 1N0TA 2B65A 2ZXTA 1P1UA 3IK6B 3G3JA 1GTKA 2DXRA 2F34A 4XXUA 4N6PA 2H4IA 1DPEA 4BDNA 1FCKA 2NWJA 3KOSA 3TZAA 5KCJA 4ZE8A 4FORA 3UN6A 2HZKA 4EUOA 2H9BA 2GFEA 3T9VA 5H8NB 3SESA 3TTRA 1SI0A 1JVXA 4NF4B 4O3BA 4DZ1A 4ZDMA 4XKQA 1MXUA 3OD7A 1NL5A 4ZEKA 2HCAA 4IGRA 3A3UA 4LVQA 3C35A 3MPKA 4KCCA 3VE1B 1LGBC 5I2NB 5I56B 3OO8A 1Y20A 4QSEA 5CM6A 2UVGA 3IO6A 1TXFA 2QJEA 1IXIA 2PT2A 4ISUA 4BDLA 3EHUA 5H8HA 1B0HA 1IXCA 3G3GA 3TELA 1B0LA 3D4GA 1UTHB 1FTKA 1B3EA 2RCAA 1O7TA 3EHSA 3LSWA 3MVWA 3PUVE 1IXGA 4RXLA 5J1DA 3M3KA 4XTCQ 3KFMA 4I8CA 4XIGQ 2O51A 1UIUA 3E13X 5FHMA 5CC2A 3SETA 2Y84A 4TLLB 1LFGA 1CE2A 2XXQA 4O3CA 2V3TA 4P0IA 4YKPA 4ZZEA 2XXWA 3FXRA 2XXIA 1B5HA 1MQJA 2I4CA 3IB0A 2Q2AA 3O2AA 4PFUA 3TDJA 4U23A 3JV9A 4MF3A 3K6UA 2H25A 3FVKA 3IX1A 4THIA 5I84A 3Q29A 4LZ7A 1Y9UA 3PPPA 4ZEBA 1SQYA 1PB9A 3IJOB 1R9LA 3EQ1A 1QUKA 3K6VA 3KSXA 3PPNA 2Z8EA 5KZTA 1JVYA 4OYVA 4OMBA 4OTEA 5ISUA 3VLWA 1IZ1A 3TQWA 1Y1MA 3I6VA 1B46A 3FIRA 3KJ7A 3N5LA 4H8JA 5K2XA 3UA8A 5I58A 2QMWA 5KDTB 1H3DA 1ZTYA 2OBGA 2UVJA 2YLNA 3G3FA 4JSOA 2O1LA 4X48A 1B5IA 2XXPA 3CFXA 4ZEFA 1B2HA 1VE4A 3TKDA 4YMAA 4Q30B 3VDFA 3FATA 5TP9B 2OWSA 1NNKA 5DT6A 1IIWA 4HCWA 4XKRA 4QFPA 5H8FB 4NF5A 5TU0A 5H8SA 4LA9A 3ZSFA 4YKIA 3IORA 4ELRA 1P1WA 4KFQA 2I4BA 2QS3A 4GL0A 4IY6A 5A5XA 4G8NA 4U2RA 3TEPA 1I6AA 5ELVA 5AA4A 5CMKA 1SBPA 2F7BA 2F36A 4H5FA 1MXXA 2XD3A 3PD9A 1R9QA 1LAGE 2BJJX 2DQVA 2NOOA 2O69A 1POTA 4U21A 3E9XA 2CMOA 4H5GA 4ZZAA 1IITA 1D9YA 3C32A 1MDP1 4R73A 4WKMA 3PMWA 3ZKKA 2F35A 3KN3A 1N84A 4P11A 3DLNA 4GL8A 1US5A 3IO4A 4G2ZA 4R74A 3VVDA 1MPCA 1B4HA 4RJZA 3PUYE 5CMMA 4F2QA 5JK4A 2NVUB 4LATA 3L6GA 1Y1ZA 3FV2A 2PT1A 3FJGA 4OZ9A 1FQBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F7VA 2QSXA 4PAKA 3HHFA 4F29A 3BFUA 1FTJA 3HN0A 5HPQA 4U22A 3RUMA 1M5BA 3IL1B 2V3UA 4PF8A 2XHDA 2VGQA 5LOMA 3L6HA 2PX1A 1LFHA 4JWYA 1LSTA 3T96B 1P1QA 2DDKA 2WX9A 4R75A 5EQ8A 3FXUA 1OLAA 4YMBA 4N07A 3MZ1A 1EU8A 4F31B 4YZZA 4BDMA 2V4CA 4QBAA 4PFWA 3S4UA 3VFJA 2D21A 2I49A 5HM4B 4RPNA 1M5CA 2R9JA 4OEVA 1EZOA 4PE5B 1LBVA 3LBSA 4UA8A 4O7IA 5ET8A 3K1PA 3K02A 2F3DA 3KZGA 3LSLA 2OWZA 4BDOA 1S9TA 1XHYA 4L17A 4ELQA 3UORA 3ISPA 1FPIA 3RTWB 2JJKA 2Y7RA 1RDYA 2OCUA 5DVFA 4F1UA 3ILTB 3IOTA 4YB6A 2XX9A 1DCUA 1A55A 1BIYA 2AIXA 5FHOA 5AA4B 2PFYA 5EYFA 1SW2A 1F9BA 2P0SA 2X26A 4WXJA 1XT8A 3TTRA 2AL5A 1FQDA 2GQ1A 1URGA 4KCDA 4QSCA 5IM2A 2HAVA 4P0GA 1DBZA 4OVTA 4U4XA 1NFTA 4F22A 1NUWA 3CFLA 2P2AA 2O68A 1Z7NE 2RC8A 1LLSA 1FW0A 3RY3A 4RA1A 3CRBA 1LAHE 2X7QA 2ABHA 4MIJA 3MP1A 1LAFE 5DYHA 1I6BA 3KOTA 5DTBA 2XXUA 1PB8A 4AS5A 3ODBA 4POWA 3S9LC 2FYIA 4MLVA 3SEXA 5BUUA 3KSJA 2PCRA 3SEVA 5B70A 1FTOA 4OQOA 1MXYA 5AE4A 2UYFA 3UIFA 4IO7A 1YYZA 1LB9A 1A40A 4P8BA 1UTBA 3FUZA 3CHGA 3EN3A 3Q28A 4GRKA 1SYIA 4GBWA 2R71A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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