1MPBA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA01
2O69A 1NNFA 3H06B 4ESWA 3VDFA 3C35A 4G8NA 3W9WA 4U21A 2R71A 2UVIA 1ANFA 3CSBA 1B6HA 5I59A 4F1UA 3JV9A 4OEUA 3SKPA 4IO7A 1B58A 2DOJA 4H8IA 4QSEA 5FHOA 3MVXA 4I9DA 4OEVA 3MPKA 4YKJA 2Q9TA 1MPDA 1MDQA 4NF4B 3KN8A 3U72A 2E1SA 2Y7PA 3K6UA 2HZKA 3PPOA 3K6VA 1TWYA 4DDDA 4F3SA 2F7AA 4UACA 2AL4A 3Q25A 4O3AA 2R6GE 3PPPA 2FYIA 3C9HA 2NVUB 5I2KB 3C31A 3IK6B 1MPBA 1WODA 3FVGA 3DM0A 4XKQA 1AH5A 4TLMB 4JWYA 3PD9A 4FATA 1B7HA 1I6BA 3FASA 1SYHA 4YU0A 3A09A 3KG2A 2H25A 3VXBA 4DE8A 2DXYA 4DXUA 1ZLQA 1O7TA 4QFLA 3QYTA 3M3FA 4H67A 4MFIA 2VOZA 4MF3A 3LR1A 1IXHA 3UORA 3CFZA 4XXUA 3P7IA 1T0KA 4JSDA 5H8SA 4LQ2A 3OO9A 3V5AA 3KN3A 3M8UA 4RY1A 3TUSA 1FQDA 4F3PA 4Z7EA 3OSQA 1Z7NE 4EQ9A 1ZTYA 4M4GA 3IOUA 1UIUA 3R7XA 2D5WA 3OSRA 1VR5A 5CMMA 2DVZA 1Y3NA 4KD5A 1H45A 5AA3A 1IXIA 3DP8A 5H8QA 3OEMA 3I3VA 4O3BA 5AE4A 3ILTB 4EF2A 4G2ZA 1DTGA 3Q28A 3N6UA 1OQHA 3FJGA 4L17A 1MH3A 4G68A 4ZZAA 4EXLA 3TODA 3RTWB 5A5XB 1ZKBA 3TZAA 3MZ9A 4FORA 4GWOA 2XXTA 1VE4A 4AB6A 3PMXA 2ZNUA 3FXQA 3R6UA 3K1NA 2RCBA 5H8FB 4FEBA 1A7LA 1N7XA 3S2VA 1MXWA 5KCJA 4BDOA 4F1YA 1NKXA 2GRVA 2PVUA 2V84A 4IO4A 3SEWA 3TFLA 5I57B 1B3GA 4YKPA 5KDTA 1TXFA 2VD3A 4JWXA 1H44A 3KSXA 2DWHA 1IUDA 2F35A 5CBRA 1FW0A 3MZBA 3ZKKA 2LAOA 1LFHA 1UTHA 1M5CA 3CG1A 4NWDA 3MP1A 2OZZA 4R9FA 5ISUA 2ZNTA 2ONRA 4H0WA 4G4PA 3KOSA 2HAVA 4M1VA 1A40A 1LAHE 3BFUA 1FQFA 4JXIA 1B0LA 1RYOA 3RY3A 4EDPA 3HV1A 4H1XA 3TQLA 5TPAB 4ONYA 4MBPA 3FV2A 3RLFE 1Q35A 4QF9A 1B40A 3OO6A 1US5A 3HSTA 5F1QA 1PB9A 2DE3A 5DVFA 1HSEA 3PPRA 1JW1A 5DVJA 2H4IA 5H8NB 4U22A 4JDFA 4H8JA 3GZGA 1SW1A 1M5DA 4LVQA 2XX7A 3I5OA 3K1PA 1B2HA 5L9MA 1SBPA 1VSOA 3GBAA 1PBQA 1SI1A 3QUFA 4LP2B 1MXXA 5ITOA 2G93A 3T9HB 2M8CA 4JB7A 1IEJA 1MQJA 3C34A 1B3EA 1II5A 1JW4A 2XXHA 1D9VA 1M5EA 1BLFA 1NMUA 2REJA 1OLCA 2DYXA 2V93A 3VVEA 3TTLA 5AA4B 1SW4A 1USYH 1N76A 3T22A 1NH7A 2CMOA 1D9YA 2ZYKA 4YB5A 4IB2A 2F7BA 4F1VA 1B32A 5L9SA 1MDP1 3ODBA 3K4UA 4EXKA 3G7WA 3SEXA 3T9XB 4MLVA 1SDXA 4GL0A 1N84A 1B51A 1JEUA 1GR2A 2O1MA 1MQDA 1LAXA 1N7WA 3UP9A 2YLNA 4KCDA 3H4ZA 2F8DA 4RYAA 1LFGA 5HM4B 1MRPA 4NF5B 5LOMA 1LB9A 3IOVA 5CMCA 4F2OA 3N5LA 3HN0A 4ZEDA 1SYIA 5BWJA 1NH8A 4JWOA 1LFIA 1MH4A 3D4CA 3FGSA 4U4SA 3RGYA 4YAHX 2D3IA 5IKBA 1TFDA 2PX1A 3B6TA 4Q30B 2ZYOA 2HCAA 1UQWA 3FJMA 4POXA 3FXUA 1ZMGA 4GRKA 3IAZA 3RQTA 2G29A 3BKIB 3K0VA 5DT6A 3FATA 3W9VA 1FQEA 1FTOA 3GLBA 3FVKA 1MG1A 5FHNA 3QSLA 4DZ1A 3C32A 4E0XA 2D21A 2Q8JA 3RNNA 4GQOA 5FTHA 4IO5A 3L6HA 5ITPA 3FIRA 3SEYA 1CB6A 5TU0A 3HO7A 3F11A 3H6TA 2GFEA 1MY2A 4IY6A 2QPQA 2DWJA 5H8HA 1MXYA 3PMVA 1S7YA 1B5JA 4GXSB 4DXCA 1MXVA 2AIXA 1N3XA 4YKKA 1URSA 3RPWA 2OWSA 5I58B 3LUYA 2DWIA 2P0SA 1B46A 1LBCA 2A5TB 2RC8A 5J1DA 1VFEA 1PBPA 2H98A 5B70A 3TYHA 2HXWA 4UA8A 3GXAA 4OETA 1JW5A 4DCXA 4LONB 4LATA 1JETA 2DWAA 2IA4A 3U8QA 1Z7ME 2X7QA 3SERA 2Z8EA 3KJ7A 2Q89A 3TMGA 4DXBA 5A5XA 1P1UA 5CM6A 3MP8A 3MC2A 4KPTA 3N94A 1PDAA 3RUMA 2UYEA 3KSJA 3PU5A 3KBRA 2XD2A 4K3FA 2WKYA 4XKPA 3HHFA 1EH3A 2HFBA 5AA2B 3IB1A 3MQ9A 4C1TA 2QMXA 1JVXA 3EF7A 3G3FA 5I56B 5I57A 3IB2A 1IXGA 2NWJA 3CFLA 4YMBA 1FCKA 4QFNA 4XTCQ 4R6KA 1S9TA 3OO8A 3OMBA 5FHMA 1FQCA 4QFKA 4R2FA 2FA7A 3O28A 3LBSA 1IXCA 2RCAA 1XVYA 3PUVE 3M3KA 3VFJA 4KFQA 1SW5A 4F18A 3SEVA 3Q27A 1XC1A 2ONKE 2H9BA 1XS5A 1D3KA 2O1LA 5BUUA 1UIVA 1Y1MA 3VVFA 2I3VA 1QW0A 3TTKA 4LZ8A 1Q1KA 3KGCA 4ZEFA 3KEIA 3MUQA 3RN8A 3TQWA 1QKBA 3OO7A 3DP4A 3MBPA 4QHQA 3IORA 3MPLA 1I6AA 5FTIA 1DPEA 3T96B 1P1NA 2XXXA 4H5GA 2ZMBA 1LGBC 3G3JA 3IL1B 3H03A 1P99A 3RTFB 3TTNA 4NF6B 2RC9A 2QS3A 1Y4TA 4R72A 3A3UA 4DIGA 4G68C 5ICQA 1TFAA 4TOZA 3WAEA 1DSNA 2QS1A 3TPAA 1MQIA 3KJTA 4ZEIA 1AIVA 3FZVA 3K1MA 1TT1A 2GH9A 5H8NA 2VP1A 5I59B 4FEDA 2O6AA 1FTMA 2ZYMA 2I58A 2RKMA 3SEUA 3FV1A 1M5BA 2UVHA 3H6UA 2ONSA 2V3UA 4F19A 2THIA 2I48A 2QMWA 1DPPA 4PFUA 4KCCA 1GV8A 3PUXE 3V83A 3OEKA 1A54A 4HCWA 3OENA 3KN7A 4X1DA 5K2XA 4LUBA 1IIWA 1YAEA 3CFXA 2O7IA 2V25A 1LAGE 5I2NB 1R1NA 3MP6A 4WEPA 1RYXA 5CMBA 4TQUQ 1B5IA 1QVSA 3MAMA 1A8FA 1B4HA 3PUWE 1Y9UA 4RK2A 3K01A 1FTLA 2F36A 1EZPA 4KYSA 4R6YA 5TP9A 4G77A 4I8CA 2CZLA 4HCYA 2AYSA 2O7UA 1NFTA 1ZIUA 3TEPA 4R73A 2XD3A 5KZTA 3O9PA 4FIMA 3MVYA 2DVCA 1QJMA 2R9JA 1VFDA 2QL3A 4EQ7A 2RINA 3FJ7A 1L5TA 1N3WA 3O6GA 4AB5A 3E13X 3UA8A 4YMAA 2X26A 5IAIA 5H8QB 2RF1A 3H3GA 1D4NA 1Y3PA 4P0GA 1ATGA 4HW8A 5HPQA 3MJNA 2DE4A 4THIA 2I3WA 4JSOA 4ELRA 1A8EA 5DEXA 4U4XA 4ND9A 4TLLB 2Y84A 1B1XA 2F5XA 3T93B 4KHZE 4F31B 3O66A 4NWCA 2NXOA 4P11A 4QFOA 3ZSFA 1B0HA 4JBZA 2HQ0A 4KQPA 4PE5B 5KCJB 4KYDA 4LZ5A 3PV0E 3DELB 1MY0A 1SW2A 2DSFA 2FNCA 1GGGA 2HEUA 4FE8A 3JZJA 1RKMA 2OK2A 5KDTB 2XXUA 3TELA 3LSLA 5K2YA 2A5TA 4IO3A 2DE2A 2DP8A 3Q29A 4YB6A 3VE1B 1P1OA 1MQHA 4QSDA 1WVJA 3MW0A 2Y7WA 2BJJX 1OVTA 1URGA 4GXAA 3U1OA 4F29A 3UGWA 3PMWA 3V89B 1NNKA 2QS4A 5EYFA 1UTHB 1OVBA 1ZU0A 2A5SA 4H6DA 1B05A 4GVOA 2F34A 5CI5A 4OZ9A 3KFMA 1B52A 2UXAA 2XXQA 2Q2CA 3B7DA 2I0CA 4IO6A 1SI0A 2Q88A 1URDA 4GD5A 3PPQA 1HSJA 3IOWA 5I84A 4FECA 4NF4A 3ECRA 5CRYA 3QUJA 3A3CA 2V3QA 3LC8A 2NOOA 1XVXA 4BDNA 1MQGA 4RA1A 4HS7A 1NL5A 3EHUA 1HSLA 1B7UA 1DOTA 5I2KA 4LQ5A 4OWDA 3IO4A 5I56A 3VLUA 3LSWA 2W7YA 4OFOA 4OESA 5L8DA 4AQ4A 3ZS6A 3CR9A 3PUZE 3SETA 1QUJA 2XX8A 2Z22A 2ALUA 4PFWA 3VV5A 3MZ1A 3WAFA 3T9UA 1BKAA 3H6VA 4Z0IA 2XXWA 4LZ7A 1B3FA 2DQVA 4WEDA 5B7DA 2HAUA 3EPEA 4KI0E 3TDJA 4OYVA 3N26A 3UIFA 3D4GA 3FUZA 4YICA 5JTYB 1FTJA 3TTRA 4N07A 1QUKA 2QJEA 4ELOA 4G8MA 1MY4A 4PQJA 4C1UA 4HTGA 3EQ1A 3QK6A 4GL8A 4U23A 3B6QA 4YKIA 4OHNA 1B3LA 1I69A 3Q26A 3IJOB 2XXVA 4NMYA 2O84X 2Q2AA 4OVJA 1B1HA 4U1ZA 3FVNA 3MVWA 3TKDA 4ZE9A 3RT8A 2ESNA 1OMPA 4ELQA 2GHAA 2IEEA 5M2VA 1B7ZA 4F22A 4GLIA 1LBBA 5H8FA 2YJPA 3PD8A 2F78A 4RPNA 1FQBA 4BLAA 4XIGQ 2B3BA 1YCJA 2B65A 4N6PA 3IX1A 4PP0A 3THIA 1J1NA 4U1OA 4FAJA 4G8HA 5AA2D 4BDMA 3MWBA 5F7VA 3SESA 3PGFA 3IB0A 3T9VA 2NUVA 1OLAA 1AMFA 4ZEBA 1GVCA 3VXCA 1R9QA 3K2DA 4C0RA 1PC3A 1XHYA 1O63A 5DVIA 5I2NA 4ZECA 1MS7A 1UTBB 4XKNA 4NF8B 1JQFA 5ICTA 3S9NC 1N04A 3CIJA 2ZNSA 3BBRA 4NE4A 4E0WA 3HPIA 3DLNA 4WKMA 1MM7A 1SD3A 4GIZA 5ELVA 3AXFA 2OLBA 1FTKA 3OOAA 2I4BA 4ISUA 4ZE8A 4N13A 3C33A 5H8HB 1SVXB 4OENA 3QAXA 2I4CA 5TPAA 4YZZA 3GBBA 2AL5A 4Q8RA 2QSXA 3O6HA 1WDNA 3KOTA 2HZLA 1LCTA 2I6EA 5CMKA 4OTEA 1AL3A 3O97A 1QUIA 2OBGA 3KZGA 1OIBA 3FVOA 3UN6A 3G3HA 1EZ9A 2I0BA 2XHDA 3BFTA 3E3KA 2Z8DA 3MVZA 4U2RA 3ILUB 4H5FA 4OERA 1XOCA 1PEBA 5HBCA 4GF8A 3HHGA 1O64A 4RK9A 3CVGA 2QRYA 1GTKA 2PMSA 3TCGA 4PETA 5CBSA 4I62A 2PT2A 2Y7KA 3G3KA 4BDRA 2E0SA 3S9EA 3C4MA 4RXLA 3VVDA 3IOTA 4MH5A 2UVGA 4PFTA 5AA4A 5CC2A 3S4UA 3UK4A 4Q5TA 2VHAA 3CRBA 4R74A 1IZ1A 1Y20A 1AOVA 2PT1A 2VGQA 3PUYE 5AA1A 4RNSA 1KWHA 3K6WA 1B3HA 2PBWA 3EHSA 2XX9A 2Y7RA 4EUOA 4X9TA 2UYFA 1BIYA 4QRZA 4X1BA 4NTLA 1NNTA 4OQOA 4F3BA 3TCFA 1H76A 3SDFA 1EU8A 4RJZA 4NF5A 4OFLA 3S9LC 2V3TA 2REGA 4EF1A 2UVJA 4XKRA 3DP6A 4DCYA 1B5HA 1Y4CA 4KYEA 3E4RA 4OXVA 4ZS9A 4ZZEA 3K02A 3USDA 2O51A 1IITA 4GOTA 2P1SA 5DYHA 4F3GA 2Z23A 1QKAA 2F6GA 1BP5A 1LAFE 2F7CA 1B4ZA 4MLQA 3H6WA 1US4A 1MXUA 5JEIA 1NNPA 1FQAA 1DMBA 1A99A 4LA9A 4GFRA 1JNFA 1PB8A 3EN3A 3IJXB 4G68B 3OD7A 4R9GA 3ONMA 1POTA 4WXJA 4BDQA 4PFYA 1CE2A 3FD3A 3M3LA 4QSCA 2B3FA 3C36A 4POWA 3VLVA 3R26A 1MY1A 4ELPA 3I6VA 1POY1 1Y1ZA 3OELA 2O68A 3N6TA 2DS9A 1ZJLA 1Y3QA 2Z8FA 1F9BA 2XXYA 2F97A 3VLWA 4Q0CA 3TCHA 1SQYA 1MXZA 5I58A 5JTYA 2ZXTA 3S9MC 4O3CA 5EHMA 1H3DA 3EHTA 1M5FA 2Y7IA 1B9JA 3QXMA 4YB7A 3FXRA 3W15C 1QULA 4QFPA 4ZDMA 3QIMA 1N0TA 5EHSA 2ZYNA 1LSTA 1BTJA 4ESXA 2DXRA 4DLDA 5TP9B 3U93A 2GHBA 4R6HA 4R2BA 1IQ7A 3CSGA 4EQBA 3PPNA 4IY5A 3V8XB 4FJPA 4R75A 4OFJA 3B6WA 3CG3A 2QS2A 1S50A 1DTZA 3G3GA 3E9XA 4IGRA 3JYRA 1MY3A 3HCQA 2ANJA 5DTBA 5AA2A 3IR1A 3O29A 3L6GA 4F2QA 1P1QA 4NEDA 3H7MA 1LLSA 4F39A 3U94A 1JEVA 2YPNA 1ELJA 3G3IA 1YPNA 2KLFA 3TAJA 1EZOA 1UTBA 4BDLA 1H43A 3T66A 4NF8A 1JVYA 4I1DA 1P1WA 2ABHA 5DEXB 3TTMA 2H5YA 3K6XA 3ZKLA 2F6PA 3OXNA 4P0IA 4IGTA 2I49A 1PB7A 4H65A 1R9LA 5JK4A 3U92A 3LSFB 3O6IA 3IO6A 1XT8A 4KR5A 1USYE 4OMBA 4IO2A 4ZEKA 1ZBMA 3O2AA 2OCUA 2OJTA 2XXIA 2H99A 2P2AA 2VD2A 3LSXA 2X7PA 1LB8A 2PYYA 1LCFA 1R6ZA 4ECFA 2OWTA 2RC7A 4NF6A 2XXPA 4RPOA 2XXRA 1I6QA 1OQGA 3CI8A 3K00A 1A55A 5L9OA 1MPCA 3RT6B 1MM6A 4X48A 1YTVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O69A 1NNFA 3H06B 4ESWA 3VDFA 3C35A 4G8NA 3NOHA 3W9WA 4U21A 2R71A 2UVIA 1ANFA 3CSBA 1B6HA 5I59A 4F1UA 3JV9A 4OEUA 3SKPA 4IO7A 4GBVA 1B58A 2DOJA 4H8IA 4QSEA 5FHOA 3MVXA 4JVCA 4I9DA 4OEVA 2R8TA 3MPKA 4YKJA 4N6DA 2Q9TA 1MPDA 4GX3A 1MDQA 4NF4B 5ET6A 3KN8A 1FPGA 3U72A 2E1SA 1NV2A 2Y7PA 4N8GA 3K6UA 2HZKA 3PPOA 3K6VA 1TWYA 4DDDA 4F3SA 1DK4A 2F7AA 4UACA 2AL4A 3Q25A 4O3AA 1FJ6A 2R6GE 3PPPA 2FYIA 3C9HA 2NVUB 5I2KB 5LTCA 3C31A 3IK6B 1MPBA 1WODA 3FVGA 3DM0A 4XKQA 1AH5A 4TLMB 4JWYA 3PD9A 4FATA 4MHFA 1B7HA 1I6BA 2CZIA 3FASA 1SYHA 4YU0A 1NV6A 3A09A 3KG2A 1YXIA 2H25A 4PAKA 1IMEA 3VXBA 4DE8A 2DXYA 4DXUA 1ZLQA 1O7TA 4QFLA 3QYTA 3M3FA 4H67A 4MFIA 2VOZA 1NV4A 4MF3A 3LR1A 1IXHA 3UORA 3CFZA 4XXUA 3P7IA 1T0KA 5IZ3B 4JSDA 5H8SA 4LQ2A 3OO9A 3V5AA 3RPLB 3T1BA 3KN3A 1FPBA 3M8UA 4RY1A 3TUSA 4P1LA 1FQDA 1NUXA 4F3PA 4Z7EA 3OSQA 1Z7NE 4EQ9A 2JJKA 1ZTYA 1FPDA 1LBYA 4M4GA 4MAGA 3IOUA 1UIUA 3R7XA 2D5WA 3OSRA 1VR5A 5CMMA 2DVZA 1Y3NA 4KD5A 1H45A 5AA3A 1IXIA 4I3EA 3DP8A 5H8QA 3OEMA 3I3VA 4O3BA 5ET8A 5AE4A 4NQ8A 3ILTB 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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