1MPBA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA01
2F36A 1R6ZA 5I59A 3KFMA 3O6HA 3SERA 3MJNA 2XXYA 3IB1A 1A99A 1TT1A 4R74A 4LZ5A 1UTBA 4KD5A 1RKMA 4RK2A 2Y7RA 5ITOA 3A09A 3IJXB 5HBCA 4M4GA 2I3VA 4R6KA 4EQ7A 5B70A 3G3IA 2I3WA 2HAVA 4O3AA 4GL8A 3N6TA 1P1QA 2HQ0A 3CVGA 4QFPA 4KPTA 2O69A 4U1ZA 1A7LA 2XXRA 1UIUA 2UVJA 2DE2A 4EF1A 5JTYB 2RCBA 3O66A 4XTCQ 3K1NA 3KN7A 3K1PA 2B65A 1ZTYA 2F6PA 5H8QB 1A8FA 2ZNTA 4KQPA 5H8NB 2R6GE 5J1DA 2DWJA 4H8JA 3OO9A 4TLMB 4U4XA 3K1MA 1N0TA 4ZEFA 1FCKA 4BDMA 1NFTA 2O7IA 4OTEA 4GQOA 4DXUA 3BKIB 2PT1A 1MXUA 3TZAA 3VV5A 1LAXA 5HM4B 1IXIA 4QHQA 4IB2A 5CI5A 1OVBA 4KFQA 1IITA 1VE4A 5CBRA 4I62A 5AA1A 2QSXA 1O7TA 2ZYMA 4MLQA 3MW0A 4P0IA 4ISUA 4QF9A 1Z7ME 3IR1A 1WODA 1IXGA 4RPOA 3FV2A 3WAFA 4DCXA 4QFKA 4H65A 2OLBA 5AE4A 3TTNA 2XXIA 3OEMA 4AB6A 1M5DA 3TTMA 2IA4A 3M3KA 1B0HA 4HW8A 3LC8A 3IOWA 3TQWA 2VHAA 4NF4B 5A5XB 2V3QA 3QK6A 2Z8EA 3H6WA 3LR1A 3KN8A 3N5LA 1FQCA 3LUYA 2Z23A 3IO6A 3CFXA 4TOZA 3QUFA 3T93B 3M3FA 1USYH 4RY1A 1NKXA 2I58A 4YMAA 1O63A 3H3GA 4QFLA 1SW5A 3C36A 1FQAA 2NOOA 2F7BA 1B32A 3CFLA 3T9VA 3OO6A 4BDRA 5DTBA 3EHUA 5JTYA 2PT2A 3USDA 3C31A 4LQ5A 1MS7A 3B6WA 3V83A 2A5TA 1MXZA 3HN0A 3CI8A 5H8QA 3EPEA 1MXVA 4H5FA 2RF1A 1PDAA 4QRZA 3K4UA 1BKAA 2V84A 4YICA 1I6QA 1VFEA 4POWA 1HSJA 3GZGA 1VR5A 4NF6B 2THIA 3OEKA 5CC2A 2Z8FA 1EZPA 3OMBA 2G93A 4ZZAA 3KG2A 2QPQA 2QS1A 3W9VA 1QKBA 4OVJA 2B3BA 4PFYA 2DOJA 3UN6A 3FJMA 3TEPA 1LLSA 5FTIA 3VLUA 3PMXA 3O29A 3DP6A 4POXA 2DS9A 4JDFA 1RYXA 4ZS9A 2YPNA 3MZ9A 3O9PA 4NE4A 3N6UA 3FXQA 1Y4TA 4NWCA 2OZZA 3W9WA 4NF8B 2Y7PA 4FAJA 1L5TA 1BLFA 3RT6B 3TTLA 3TCHA 1B46A 4F29A 1N7XA 1WVJA 2F6GA 4P0GA 2AIXA 3H7MA 3C34A 4EQ9A 1A40A 3SETA 5I59B 3M3LA 4ZZEA 3U1OA 3OSQA 1B7ZA 1Y4CA 2XX9A 1MXXA 1PBPA 2R9JA 4IGTA 3FVNA 1ATGA 1BP5A 3JZJA 1LBCA 4OETA 3OO7A 3UIFA 4MH5A 3S4UA 4X1BA 2A5SA 4EXLA 4RXLA 1B5HA 4EXKA 3WAEA 1MPCA 5IKBA 4F18A 4ND9A 3HO7A 1LAFE 3ODBA 3H06B 2GHAA 1DSNA 4U21A 3P7IA 1M5BA 4G8HA 4FATA 4H6DA 2E0SA 1OQGA 2RC9A 4R9GA 1B6HA 1BIYA 5L9MA 2M8CA 2QS4A 4PE5B 4LONB 3RTWB 5KDTB 1UQWA 4OENA 5EYFA 2F34A 1R9LA 3K6UA 3VVEA 1B4HA 4E0WA 3QYTA 5H8HA 3HSTA 5H8FA 4FORA 2GFEA 3OO8A 3EHSA 2F5XA 2DP8A 3KZGA 4FEDA 1II5A 3CSGA 3DM0A 1JNFA 3HPIA 3IB2A 4YB7A 4F19A 4NEDA 3S9MC 4OEVA 5ICQA 2XXTA 1F9BA 4O3CA 4HS7A 1XOCA 3ZS6A 1N04A 2Y84A 3TKDA 1P1WA 3HCQA 2XXQA 4FEBA 5K2YA 1MM7A 5CM6A 4GXAA 4ELRA 1JW1A 3ECRA 3PV0E 4G8MA 4GWOA 1POY1 1H45A 1B5JA 3OENA 4DXCA 2LAOA 1NMUA 1LB9A 1H44A 1MQDA 3FVOA 4NF8A 3MP8A 1JEUA 2DWIA 1Y1ZA 3BFUA 3GBBA 2REJA 4X48A 1IUDA 4ESWA 4K3FA 2P2AA 3DLNA 3U94A 2H98A 4IY5A 1MXYA 3OXNA 1YPNA 4P11A 1Y3QA 1LBBA 1MRPA 2XXHA 3BFTA 1DPEA 4WEDA 2ZYKA 3U92A 3CG1A 2OWTA 1TFDA 4XIGQ 1SDXA 5HPQA 1LGBC 5CRYA 3SEVA 3IJOB 1EZ9A 1OVTA 3KGCA 4R6YA 3Q25A 4G4PA 4H67A 2ZNSA 3GLBA 1IQ7A 3K2DA 3BBRA 1MG1A 1IXHA 4GXSB 5I58A 3K6XA 4NF5A 5ICTA 2PX1A 5KDTA 1QULA 3CR9A 2A5TB 4ZE8A 4GIZA 1B3HA 3CIJA 1LFGA 3TMGA 2UYFA 3C32A 5TPAB 1PC3A 1FTJA 3IK6B 3SEYA 1LAGE 3MQ9A 4LVQA 3C9HA 4H8IA 3PGFA 2O84X 3Q26A 4G8NA 2HAUA 3E3KA 1XT8A 1Y3NA 2PYYA 2CMOA 3TTRA 4I1DA 2RCAA 3O28A 4OYVA 3H4ZA 4RA1A 2DWHA 3W15C 2VP1A 5LOMA 3B7DA 2VGQA 1IXCA 3FVKA 1LFIA 3RUMA 2UYEA 4U23A 4LP2B 3IX1A 3OELA 4WKMA 1B3GA 3UK4A 5CMCA 1JVYA 1LAHE 3RGYA 2O1LA 1IIWA 2QRYA 1B51A 2GRVA 4Q8RA 4LATA 3VLWA 4Z7EA 1B58A 3FZVA 5KCJA 5I84A 1SI0A 1QUJA 4JB7A 3T96B 2I48A 4GOTA 4KCDA 1SI1A 4DIGA 3TPAA 2AL4A 4F1UA 3CFZA 3OD7A 3E13X 2QS2A 1MM6A 2DXRA 1D3KA 3EN3A 3TDJA 2I6EA 4OWDA 3MP6A 4N6PA 2I49A 2H4IA 1S7YA 1JQFA 1H76A 4BDOA 4YB5A 4ZECA 3A3CA 3H6VA 5TP9B 4ZEDA 3V5AA 1MPDA 4X9TA 1N76A 5FTHA 1CE2A 1MY3A 2DVCA 1NNTA 1GV8A 5KZTA 1Y20A 3E4RA 2XD3A 1ZKBA 3KSXA 1UTHA 2XX7A 4IO7A 5TU0A 3S9LC 1FW0A 1MDP1 1OLAA 1FTOA 1OIBA 1R1NA 5CMBA 1SD3A 3G7WA 3IOUA 4YKIA 5AA2B 5M2VA 1B2HA 3MUQA 1QW0A 2B3FA 1FTMA 5CBSA 2ONKE 2D5WA 5F7VA 3K02A 2AYSA 5IAIA 3LSXA 3VVDA 1SW1A 2FNCA 4GVOA 3IOTA 1PB9A 1B3LA 3VFJA 4FIMA 2HCAA 3K0VA 1SW2A 3VE1B 1B05A 4GFRA 1M5CA 5TPAA 4YMBA 4R6HA 3PPPA 5H8HB 5H8FB 3O2AA 4C0RA 2HEUA 4ZE9A 2X7PA 4OESA 3VLVA 2VD3A 1I6AA 5FHMA 2O51A 3RT8A 2ALUA 3G3FA 2YLNA 2UVIA 3I3VA 1D9YA 3LBSA 3N94A 4PFTA 4RYAA 1ZU0A 3CSBA 1MPBA 1QUKA 4LZ8A 2OJTA 4KI0E 4QFNA 2RKMA 3L6HA 4QSCA 3GBAA 1M5FA 4DE8A 3TAJA 5DVJA 2DXYA 2Y7KA 2XX8A 3SEWA 4G77A 3ZKLA 3K00A 2QS3A 2I4CA 1IEJA 4JXIA 4YKPA 4OXVA 4IGRA 2H9BA 3MWBA 3PPOA 1H43A 3IOVA 4KR5A 4NWDA 3IAZA 4U1OA 1H3DA 3C4MA 4IO5A 4R2FA 1B52A 4PFUA 1POTA 5ISUA 4N07A 1PB7A 5TP9A 4RNSA 3PPRA 4GL0A 4FECA 3FGSA 3MVXA 1N3WA 3MVYA 4LA9A 1URGA 3LSFB 4DDDA 1PEBA 5I57A 1EZOA 2ABHA 1ANFA 2HFBA 4GD5A 3T9XB 3HHGA 3UGWA 1AIVA 4RPNA 3C35A 4F39A 1A54A 4GF8A 2HZKA 3LSLA 5AA2A 3KBRA 3MVWA 1SQYA 3T22A 1N84A 3SDFA 3RLFE 3DP4A 4ESXA 4OERA 2NUVA 3KEIA 3RQTA 1MY4A 3SEXA 4IO6A 4ZEIA 3F11A 4OFOA 2CZLA 2Q2AA 5I58B 4NF5B 3TYHA 1A8EA 1KWHA 3MZ1A 1B9JA 1SVXB 5AA4A 1RYOA 2UXAA 1I6BA 3FVGA 1Y3PA 4OEUA 2BJJX 5I2KA 1TXFA 1YTVA 2D3IA 4OFJA 4RK9A 1NH8A 2DWAA 4MLVA 1GR2A 2IEEA 4F1VA 3O97A 4AB5A 2RC7A 1IZ1A 4C1TA 2V3UA 2GH9A 1D4NA 3FASA 3R7XA 2F7AA 5CMKA 3IL1B 2P0SA 3RY3A 3MP1A 1YCJA 5KCJB 2QJEA 2VD2A 4EQBA 1OMPA 3G3GA 3E9XA 3TCGA 1MXWA 1JETA 2PVUA 5ELVA 2NWJA 1AL3A 1HSLA 3Q27A 5ITPA 2PBWA 3RN8A 4M1VA 1P99A 4F1YA 4G2ZA 1B5IA 4ELOA 4YB6A 3U93A 3MZBA 1ELJA 2Q8JA 1AOVA 3T9HB 1NL5A 3TCFA 1S9TA 3CRBA 3KJTA 3U72A 3KOTA 2OK2A 1Z7NE 3FIRA 2ESNA 3PUYE 4EUOA 1UTHB 3PPNA 4F2QA 1DMBA 1DTZA 1XC1A 3K6WA 3Q28A 4MFIA 4LUBA 5L8DA 3ZKKA 2Z22A 1SYHA 4YAHX 4UACA 1SBPA 3H6TA 4U2RA 2F35A 5H8SA 2P1SA 3B6TA 3FD3A 1MY1A 5F1QA 2H25A 4H0WA 3QUJA 1QVSA 2ZYNA 3Q29A 2OWSA 2E1SA 4WEPA 1JEVA 3QXMA 2Q2CA 2ZMBA 4DCYA 3PPQA 3EHTA 3L6GA 4F2OA 2V93A 1QUIA 3KN3A 3RTFB 2F7CA 4DLDA 4U22A 3ONMA 4GLIA 4H5GA 1ZIUA 3CG3A 4PETA 3JYRA 4R9FA 3HHFA 3A3UA 2Z8DA 1YAEA 3MBPA 3TELA 4JWXA 1A55A 4G68A 2PMSA 5I56B 1MQHA 2G29A 1XHYA 4JBZA 1MY0A 3AXFA 5JEIA 4XKQA 2F97A 4F3GA 4KYSA 4YKJA 1FTLA 1Q1KA 2ZXTA 2ZYOA 3PD8A 4IO3A 4O3BA 3FXUA 4NMYA 4R75A 4F3PA 4TQUQ 3PUXE 5L9SA 4OHNA 2Q89A 4R2BA 5DVFA 2QL3A 5I2NA 1TFAA 1Y9UA 4ELQA 4XXUA 3MVZA 4RJZA 4KYEA 2UVHA 2AL5A 3ILUB 3TTKA 2XXUA 3OSRA 3IB0A 5L9OA 4OFLA 3FJGA 2ONRA 3G3KA 2V25A 3D4CA 4EDPA 2R71A 5DEXA 1MDQA 3MC2A 3O6IA 3K01A 3S9EA 3PUVE 1R9QA 2ONSA 5I57B 3IO4A 2DVZA 4KYDA 2XHDA 4PQJA 4Q5TA 1JW4A 5DYHA 4N13A 4ELPA 4ECFA 4OQOA 3KOSA 2X26A 4JSOA 1EU8A 2QMWA 4C1UA 4F3SA 1AMFA 3PU5A 3PMVA 4JWOA 1EH3A 1FQEA 5CMMA 3I5OA 4KCCA 1B0LA 1FQDA 4TLLB 3GXAA 3PUZE 2O1MA 3M8UA 1B3FA 1USYE 3R26A 1B1XA 3FUZA 3KSJA 4ZEKA 1NNFA 5AA4B 1LCTA 4FJPA 3VXCA 1CB6A 5AA2D 5BUUA 3B6QA 4THIA 1B1HA 1JW5A 4HCYA 5DVIA 2I0CA 1OLCA 4YU0A 4Q30B 2NVUB 2YJPA 5I2KB 5FHOA 5JK4A 4XKRA 1J1NA 1TWYA 4JSDA 3S2VA 4UA8A 5EHMA 5H8NA 1DPPA 4L17A 3K6VA 4PFWA 2V3TA 2VOZA 3DP8A 5I56A 2I0BA 1B4ZA 1ZMGA 2XD2A 1HSEA 5AA3A 3SKPA 3MPLA 3I6VA 1BTJA 1MQGA 1S50A 3G3JA 1FTKA 3H6UA 4FE8A 3EQ1A 3MPKA 4BLAA 3QSLA 4DZ1A 2XXWA 1MH3A 3G3HA 1LSTA 2HXWA 2RINA 4MF3A 2KLFA 4HCWA 1VSOA 3SEUA 3SESA 1UIVA 1GVCA 2O6AA 2Y7IA 3QIMA 1US5A 1GGGA 3JV9A 4PP0A 1MQJA 1US4A 2F78A 2GHBA 3PUWE 4E0XA 4Z0IA 3RPWA 3H03A 4NTLA 1FQBA 4BDLA 3FATA 2W7YA 1AH5A 3D4GA 1URSA 4F3BA 2H5YA 2XXVA 4U4SA 1MQIA 3TODA 1B7UA 3S9NC 3OOAA 1PB8A 1UTBB 4LZ7A 1SW4A 1MH4A 2HZLA 4QSEA 4WXJA 4NF4A 1D9VA 1NNKA 5A5XA 3V89B 5DT6A 1NNPA 1DOTA 1B7HA 4R73A 1XS5A 3LSWA 3U8QA 2O68A 2DE4A 4IY6A 4KHZE 4IO4A 4OMBA 1LB8A 5FHNA 1FQFA 3ILTB 1MY2A 4XKPA 2OCUA 4X1DA 2DE3A 2XXXA 4JWYA 2NXOA 1Q35A 2Q9TA 5B7DA 2XXPA 1VFDA 2DYXA 3UA8A 4ONYA 3THIA 4H1XA 2FYIA 3IORA 1ZJLA 1JVXA 1XVXA 1PBQA 3QAXA 3VXBA 1ZLQA 2DQVA 4F22A 2OBGA 3DELB 2O7UA 4Q0CA 4R72A 1P1UA 3TFLA 1N7WA 2D21A 4MBPA 1N3XA 3FJ7A 1OQHA 4G68B 5K2XA 4I8CA 4GRKA 3HV1A 3FXRA 4IO2A 3TQLA 4EF2A 2FA7A 4NF6A 5BWJA 5EHSA 3UP9A 4BDQA 1P1NA 3N26A 2REGA 4HTGA 1QJMA 4ZEBA 4AQ4A 1O64A 2QMXA 3KJ7A 1B3EA 2Q88A 4F31B 1LFHA 1T0KA 4I9DA 2UVGA 4QFOA 3VDFA 3TUSA 4OZ9A 1ZBMA 3ZSFA 5I2NB 3FV1A 3T9UA 2Y7WA 4LQ2A 1SYIA 1QKAA 2WKYA 3T66A 3O6GA 2X7QA 2DSFA 1B40A 4YKKA 1WDNA 3EF7A 4QSDA 2ZNUA 4BDNA 2ANJA 1P1OA 3R6UA 1I69A 2H99A 3RNNA 1URDA 1LCFA 4XKNA 2RC8A 4YZZA 4ZDMA 1NH7A 1XVYA 1Y1MA 1DTGA 2I4BA 1M5EA 1GTKA 3PD9A 3PMWA 4DXBA 5DEXB 4G68C 3V8XB 2F8DA 3UORA 3VVFA 3C33A 3MAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F36A 1R6ZA 5I59A 3KFMA 3O6HA 3SERA 3MJNA 2XXYA 3IB1A 4MNIA 1A99A 1TT1A 1YYZA 2XWVA 4R74A 4LZ5A 1UTBA 3IFAA 1IMFA 4KD5A 4QBAA 1RKMA 4RK2A 2XXKA 2Y7RA 5ITOA 3A09A 4DI3D 3IJXB 5HBCA 4P3LA 4M4GA 2I3VA 4R6KA 4P56A 4EQ7A 5B70A 3G3IA 4I3EA 4MHFA 2I3WA 2HAVA 4O3AA 4GL8A 2HPGA 3N6TA 5J16A 1P1QA 1NV2A 2HQ0A 3CVGA 4QFPA 4KPTA 2O69A 4U1ZA 1A7LA 2XXRA 1UIUA 2UVJA 2DE2A 4EF1A 5JTYB 2RCBA 3O66A 4XTCQ 1NV1A 1G0IA 3MYUA 4OVRA 3K1NA 4GWUA 3KN7A 3K1PA 2B65A 1ZTYA 2F6PA 1FRPA 5H8QB 1A8FA 2ZNTA 4KQPA 3RPLA 5H8NB 2R6GE 5J1DA 4NN3A 2DWJA 4H8JA 2PFYA 4N17A 3OO9A 4TLMB 4U4XA 3K1MA 1N0TA 4ZEFA 1FCKA 4BDMA 3FXBA 1NFTA 2O7IA 4OTEA 4PTKA 4P47A 4GQOA 4DXUA 3BKIB 2PT1A 1MXUA 3TZAA 3VV5A 1LAXA 5HM4B 1IXIA 5DW8A 4QHQA 4IB2A 4P9KA 5CI5A 1OVBA 5EQ7A 4KFQA 1IITA 1VE4A 2OX3A 4GX6A 5CBRA 1EYJA 4I62A 5AA1A 2QSXA 1O7TA 2ZYMA 5EYHA 4MLQA 4GWWA 3MW0A 4P0IA 4ISUA 4QF9A 1Z7ME 3IR1A 4PBQA 1WODA 1IXGA 4RPOA 4HE2A 3FV2A 3WAFA 4DCXA 2GQ1A 4QFKA 4H65A 2OLBA 3LUZA 5AE4A 3TTNA 2XXIA 3OEMA 4AB6A 1M5DA 4MX6A 3TTMA 2IA4A 3M3KA 1B0HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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