1MPBA

Maltodextrin-binding protein (maltose-binding protein) mutant, with arginine replacing tryptophan at position 230 (trp-230-arg)
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPRAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
publication title Crystal Structures and Solution Conformations of a Dominant-Negative Mutant of Escherichia Coli Maltose-Binding Protein
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
total genus 126
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mpbA01
2Y7RA 3WAEA 3DLNA 4F3GA 3K6XA 5KCJB 2QRYA 4F3BA 1JEUA 3H7MA 4F2QA 2ONRA 4GIZA 4IO2A 2F7AA 1IXCA 3PMWA 3CFZA 3LSXA 4ISUA 4MLQA 4KYDA 4F1YA 1P1UA 4OYVA 1HSEA 3AXFA 1MXUA 2DOJA 2XD3A 1P99A 1IXIA 3IJXB 3C33A 1DOTA 1BLFA 2X7PA 4LZ8A 3CRBA 4ELPA 4G8MA 2F34A 3L6HA 1DMBA 3VLVA 1FQBA 3IL1B 3S9EA 4GXAA 3FASA 1N04A 2V25A 2DE3A 1KWHA 5FTHA 3IX1A 5IAIA 1QUJA 1CB6A 3IJOB 2PT1A 3EPEA 3UORA 3K1MA 3PMVA 4ZEBA 1A40A 3PUWE 1MH3A 2Q8JA 2OBGA 1FQFA 3T9XB 1NNTA 3U72A 2GHAA 2A5TA 2VGQA 3CFXA 4Z7EA 4EQ7A 1EU8A 1LSTA 5DEXB 2OWSA 3TPAA 5ICTA 4NF4A 3MW0A 1EZOA 2IA4A 4AQ4A 4NF8A 3RUMA 1MXYA 3N5LA 2ZYMA 2ESNA 4LVQA 4BDQA 1WDNA 2XXIA 4OEUA 1PBQA 2Q9TA 2ZXTA 5JK4A 4KYSA 1VFEA 3ZSFA 3H6UA 1FQDA 1WODA 3ODBA 3Q27A 4BDLA 5H8HB 4X1BA 2OZZA 1GVCA 2H5YA 4GL8A 3QYTA 3TYHA 4P11A 4JWYA 4RPNA 1OVBA 4NF5B 4YMAA 1PB9A 1JVXA 5I58A 2B3BA 5L9MA 3UP9A 1N7WA 4M4GA 2CZLA 4KR5A 3VVFA 3W15C 5DVIA 1BKAA 2RINA 3ZKKA 1P1WA 3RT6B 4XKNA 1OIBA 3MJNA 2DVCA 1RKMA 4ELOA 1BIYA 1MY0A 1M5DA 3CG1A 3TCHA 1SBPA 1FTKA 1MXWA 3GXAA 1Y1ZA 3MVYA 4YZZA 4ZECA 4GFRA 4GOTA 4NMYA 3M8UA 3B6TA 1N3XA 3OO6A 3HN0A 4EXLA 5CC2A 4ZEIA 2XX8A 3O2AA 3F11A 1B51A 2F7BA 3T22A 3KZGA 3FATA 1EH3A 3W9WA 1SQYA 3BBRA 1SW1A 2UVJA 5I2NB 1TFAA 2R71A 4G77A 3TFLA 5ELVA 5LOMA 3RT8A 4BDNA 5L8DA 2LAOA 1Z7NE 1SW4A 2DE2A 1UTHA 5AA2B 1F9BA 1DTGA 3A3CA 5HPQA 3FJGA 4MLVA 3LSFB 2ONSA 3K6VA 2I3WA 2VP1A 4GD5A 5CMCA 3U8QA 1LLSA 1R6ZA 4LZ7A 3C32A 3M3KA 1URGA 3PU5A 3SEWA 4ONYA 2F7CA 1ZJLA 4QFOA 4JWXA 3PGFA 5AE4A 4FAJA 2XXPA 1B5HA 3G3IA 2M8CA 1UTBA 2OWTA 5I59A 2I0CA 2BJJX 1HSLA 1DPPA 1R9LA 5H8FA 1IZ1A 2HZLA 3RY3A 4RJZA 4L17A 3FXUA 1FQCA 4GLIA 3A09A 3PPRA 3KSXA 3O97A 3OSRA 3T66A 3IK6B 3BFTA 3OMBA 5L9SA 1FCKA 1LB8A 1LAGE 3OO8A 1B3GA 3FZVA 4R6YA 3BKIB 4EF2A 5H8SA 4R6KA 2V3UA 4OXVA 5I56B 1B5JA 1B0LA 5JTYB 3GLBA 1AIVA 2O51A 3D4CA 3P7IA 4FORA 4WEDA 2QS2A 3KSJA 2UXAA 1LBCA 3DP6A 1NNKA 1N84A 3WAFA 1R1NA 4KPTA 1B4ZA 1ANFA 5DVFA 1DSNA 2QL3A 4H8IA 1YTVA 2HZKA 2HEUA 2VHAA 3N6TA 3OO7A 5A5XB 3O6IA 3RPWA 4KYEA 4ESWA 4BDOA 4PQJA 3H4ZA 4Q5TA 4LP2B 3LR1A 3QK6A 4YKJA 1SW5A 1NH8A 2P1SA 4MBPA 3E4RA 1S7YA 4RPOA 1QULA 3S9NC 3SEUA 4PFUA 2Y7WA 3SKPA 2XX9A 1N3WA 4RXLA 1MH4A 4UA8A 2QMXA 5DEXA 3Q28A 3T9VA 3KEIA 1FW0A 4JB7A 4XXUA 2R9JA 1JW5A 5IKBA 4IO4A 4YAHX 4XTCQ 3U92A 1DTZA 1MXZA 4THIA 2ONKE 1URSA 2F6PA 4N07A 1S9TA 4ELRA 5KDTB 3FJ7A 4JWOA 3H3GA 1URDA 2Q2AA 4IY6A 3EHTA 1NH7A 3EF7A 3TTRA 3TUSA 1B4HA 5FTIA 3HHGA 5TPAB 2Y7IA 5CM6A 4OTEA 2AYSA 3H06B 1USYH 3T93B 1LFHA 3A3UA 3MPLA 3K0VA 2DWHA 1EZPA 4NF5A 3E13X 4H5FA 1MG1A 2F35A 4F1VA 2Y7KA 4POWA 5CI5A 1LAHE 2XX7A 1ZTYA 1MQJA 1NNFA 3PUZE 4LUBA 1TT1A 4C1UA 2RCBA 1B6HA 3TQLA 2ZYKA 3C9HA 2W7YA 1B40A 3K1PA 1BP5A 3RTFB 3OELA 4TLMB 2B65A 3KOTA 4MF3A 4IGRA 5KZTA 4PFYA 5M2VA 4PE5B 4RK9A 1JW1A 3LSWA 1TFDA 1UIVA 4ND9A 2OLBA 5HM4B 5I2NA 1ZLQA 4R9FA 4I8CA 4YKKA 4R74A 5F7VA 3I5OA 5AA1A 3JYRA 5B70A 4YKIA 1MQGA 3IOVA 5ICQA 2P2AA 1QW0A 1MY1A 4KHZE 5AA2A 2F36A 4FIMA 2I4BA 4ZEFA 3PV0E 3L6GA 1QUKA 2UYEA 4XIGQ 4HCYA 2X7QA 4R2BA 3G7WA 2F5XA 3T96B 5CMBA 3MQ9A 3LBSA 1B1XA 5DYHA 4ELQA 2GRVA 3MP1A 5CBRA 1Q1KA 2YLNA 1MDQA 3SETA 1LB9A 4F19A 3V89B 4DDDA 1MM6A 4I62A 5I57A 3OEMA 2V3TA 1LAFE 3BFUA 3LUYA 2G29A 1MXVA 3OEKA 3H03A 3SESA 1QKBA 3ZS6A 3FV2A 3UIFA 1MPBA 2I4CA 4OWDA 1XVXA 2V3QA 3K6UA 3PD8A 4NTLA 4ZEKA 3Q25A 3N94A 3IORA 3TDJA 4Q0CA 3IO6A 5K2XA 1ZU0A 3K01A 3PPNA 4Z0IA 2GHBA 3QXMA 4P0GA 4F2OA 1ZMGA 5TU0A 4KI0E 5I56A 4JXIA 5JTYA 1BTJA 1A54A 3EHSA 3S9LC 4JSDA 1YPNA 3FXQA 4O3CA 1MY2A 1Q35A 1GGGA 3G3GA 2RCAA 1IITA 1CE2A 1TXFA 4FEBA 2VD3A 3VVDA 2DQVA 4P0IA 4EUOA 1B7HA 3MVZA 1M5EA 3KOSA 1SI0A 2DE4A 3EN3A 3JZJA 2V93A 5A5XA 4F22A 3CIJA 1UQWA 1MY3A 4BDMA 4IO5A 1MQIA 2NOOA 1MPDA 4QHQA 1AH5A 4DIGA 5HBCA 2WKYA 3O9PA 4LONB 4ZZEA 3T9UA 4QFKA 3FVGA 3CVGA 1L5TA 3CSGA 4LA9A 3JV9A 2HQ0A 4QFNA 3V8XB 3TTMA 2DXRA 4PFWA 4H0WA 4QSDA 2NVUB 2UVIA 2IEEA 2RC7A 4ZDMA 4G68C 1OLCA 3VLWA 2F8DA 1POTA 3O6GA 4FATA 2DP8A 4PFTA 3G3KA 4O3BA 3OENA 1JETA 3FVKA 2FNCA 4DXCA 5BUUA 5ITOA 1XT8A 1QUIA 1MS7A 2NXOA 1A55A 4FEDA 1VFDA 2XD2A 2R6GE 3H6WA 1EZ9A 4TQUQ 2ANJA 4EQBA 1OQHA 2DVZA 2ZNUA 2E1SA 5H8NB 4KCCA 1OQGA 3S9MC 5TPAA 1AL3A 3V5AA 4X1DA 3PPQA 4R73A 3K2DA 1A99A 4KD5A 2NUVA 4YB5A 1IIWA 4OETA 3ZKLA 1NNPA 4I1DA 3U93A 1JW4A 5AA2D 2FA7A 1QVSA 4LATA 1MDP1 1N76A 2QMWA 3MVXA 3DM0A 1MQHA 5KCJA 4JBZA 1Y1MA 3TODA 1QJMA 3O28A 4EF1A 4R2FA 1B0HA 2ZYNA 3E3KA 5H8QB 5CMKA 1ELJA 3IR1A 4QFPA 1LCFA 1GV8A 2H9BA 3DP4A 4U2RA 4R9GA 1P1QA 2P0SA 3W9VA 3B6QA 1B1HA 2HAUA 4E0WA 3V83A 3E9XA 4TLLB 4EDPA 4RY1A 3MPKA 3ONMA 1B7UA 1SW2A 3SEVA 4U4XA 2O69A 3IAZA 1NKXA 1TWYA 1WVJA 2ABHA 3MVWA 3I3VA 1Y20A 2AL5A 1M5CA 4OEVA 1OLAA 2Z22A 4NE4A 1GTKA 3HO7A 1XC1A 5AA3A 3C4MA 4X9TA 1I69A 4DLDA 1B3EA 3CI8A 2AIXA 4RA1A 3FUZA 1A7LA 5L9OA 3OOAA 3PUYE 1B05A 1ATGA 4IB2A 4H6DA 4Q8RA 3Q29A 3IOWA 3K00A 3C36A 4Q30B 1SYHA 1JNFA 5BWJA 3GBBA 1PC3A 3R7XA 1FTMA 3TMGA 2REJA 4O3AA 1O63A 3KGCA 2UVHA 2Y7PA 3G3HA 2NWJA 1IXGA 1SVXB 2I3VA 3CFLA 4R6HA 3HPIA 3IOUA 3PD9A 2D3IA 3THIA 4GRKA 1PDAA 5TP9B 1RYXA 3UK4A 2H25A 2Z8EA 1NL5A 2XXVA 1IUDA 2REGA 4IGTA 2OJTA 1USYE 4NF6B 4LQ5A 3N26A 4TOZA 5H8HA 1MM7A 4GF8A 1Y3PA 2PVUA 3IOTA 4WEPA 5K2YA 3UN6A 3RTWB 4QF9A 2CMOA 4IO6A 3EHUA 4YU0A 1ZBMA 3FD3A 1US4A 2Y84A 2I48A 4YB7A 2DS9A 1P1NA 1I6BA 1A8FA 2XXQA 3OXNA 4ECFA 3QIMA 4UACA 2YJPA 1Y9UA 4U23A 3S2VA 4MFIA 4F39A 3VXBA 2PT2A 4KCDA 3C34A 1DPEA 4U22A 4RK2A 4F29A 3TTKA 5EHSA 4DCYA 4F18A 2HXWA 3PMXA 3DELB 1XVYA 2F78A 2ZMBA 3K4UA 3MZ9A 3R26A 2X26A 3O66A 4QSCA 4DZ1A 4IO7A 4BLAA 1MQDA 4NEDA 4U1ZA 5CMMA 2XXRA 2DYXA 5DT6A 4HS7A 1Y3QA 1SDXA 2VD2A 3GZGA 2HFBA 4GL0A 2O1MA 5ITPA 5FHNA 3VLUA 1B3HA 2Z8DA 4LQ2A 2XXHA 1MY4A 2ALUA 3SEYA 1B32A 2F97A 2HAVA 3OD7A 2ZNSA 3VVEA 4OENA 2I6EA 3PUXE 3N6UA 3GBAA 3MUQA 5DVJA 4C0RA 1J1NA 4YMBA 1Y4CA 3ECRA 4PETA 4H5GA 3RQTA 2V84A 2QS1A 1S50A 3TZAA 2VOZA 2XXTA 4OERA 1YCJA 5H8NA 2GFEA 4POXA 3TCFA 5FHMA 3MWBA 4G68B 1MXXA 1I6AA 4FE8A 3KN7A 1B3LA 4OMBA 2RC9A 1QKAA 4YKPA 2DWJA 4U4SA 2XXYA 1YAEA 2KLFA 3TQWA 4NWDA 2QS4A 3MZ1A 3HHFA 1B58A 4GXSB 2XHDA 2Z23A 3TEPA 5H8QA 2O84X 3O29A 4R72A 5FHOA 4YICA 2H99A 2HCAA 3KJTA 4OFOA 5AA4B 2I49A 1N0TA 3UA8A 1ZIUA 3USDA 1VR5A 4ESXA 3TKDA 2XXUA 5EHMA 2H4IA 4OESA 5J1DA 1O7TA 4OVJA 1JVYA 3FVNA 2O1LA 5EYFA 3R6UA 2Q2CA 3G3JA 3QUFA 2O7IA 4ZE8A 1FTJA 4JSOA 1M5FA 2DSFA 2Q89A 2DXYA 2A5SA 2PMSA 1SI1A 3C35A 3KBRA 1SD3A 2RKMA 5I2KB 3TELA 2O6AA 4ZZAA 3VV5A 4HW8A 2F6GA 4IY5A 4IO3A 1JQFA 2AL4A 1H44A 1LCTA 3B7DA 1IEJA 1D3KA 1T0KA 1FTOA 3D4GA 4F3PA 4EQ9A 3H6VA 1B3FA 4OHNA 1VE4A 3O6HA 4DCXA 3M3LA 4NWCA 1RYOA 2Q88A 3B6WA 3FGSA 3U1OA 4EXKA 4F3SA 4WXJA 2G93A 1I6QA 1A8EA 4F1UA 4HTGA 4OFJA 3HCQA 4QRZA 3Q26A 4GVOA 2O68A 2UVGA 2QJEA 5DTBA 2Z8FA 1FQEA 1NMUA 3IO4A 3TAJA 1LBBA 1ZKBA 3I6VA 3IB2A 2H98A 1IXHA 5CBSA 4G8NA 2YPNA 1HSJA 5KDTA 5TP9A 4X48A 4ZS9A 4PP0A 3T9HB 1LFGA 3KJ7A 5JEIA 4G4PA 2UYFA 3K1NA 1VSOA 4GWOA 2QSXA 3QSLA 4NF6A 1D4NA 2FYIA 1H76A 1JEVA 4QFLA 1B52A 1H3DA 4ZEDA 2A5TB 4KFQA 1LFIA 4LZ5A 4MH5A 1IQ7A 3OSQA 1OMPA 3M3FA 2QS3A 3S4UA 1B2HA 4FJPA 1PBPA 5I57B 1XOCA 4NF4B 3TTLA 3RNNA 3CG3A 3G3FA 1PEBA 4QSEA 4RYAA 3HSTA 3TTNA 2THIA 4H1XA 4NF8B 1B7ZA 3TCGA 3SDFA 2D5WA 3K6WA 5B7DA 1N7XA 4AB6A 3UGWA 3FIRA 1H43A 2PYYA 1Z7ME 3QUJA 2RF1A 3HV1A 1FTLA 5ISUA 3FXRA 2QPQA 3PPPA 4F31B 4H67A 2ZYOA 4GQOA 2E0SA 1XS5A 2D21A 3EQ1A 1XHYA 3SERA 3MAMA 5CRYA 1LGBC 4G2ZA 4WKMA 1MRPA 4OZ9A 4XKQA 3MP8A 4KQPA 3RN8A 5I58B 1US5A 4BDRA 1Y4TA 2B3FA 3KN3A 3LC8A 3PUVE 3RGYA 3LSLA 2PBWA 4OQOA 3QAXA 4N13A 1AMFA 4U21A 3IB1A 1R9QA 2DWAA 2I58A 3FVOA 3FV1A 3C31A 4DE8A 4XKPA 3MP6A 1B46A 2GH9A 3RLFE 1FQAA 3K02A 4R75A 1LAXA 2OK2A 2XXXA 1O64A 4E0XA 1NFTA 4FECA 1B9JA 3VE1B 3MZBA 2XXWA 2ZNTA 4G68A 1PB7A 1M5BA 4JDFA 1D9YA 4K3FA 1OVTA 3DP8A 4DXUA 1B5IA 2OCUA 4H65A 1Y3NA 4HCWA 3ILUB 3OO9A 3VXCA 5I84A 1P1OA 1UTHB 3FJMA 4ZE9A 3PPOA 2I0BA 2PX1A 4N6PA 1POY1 3CR9A 3U94A 3SEXA 3MBPA 4OFLA 1H45A 5AA4A 1II5A 3H6TA 4G8HA 4YB6A 3VFJA 1GR2A 1SYIA 4H8JA 4XKRA 3CSBA 5F1QA 1AOVA 4I9DA 1D9VA 1PB8A 4AB5A 2O7UA 2RC8A 4DXBA 4M1VA 3ILTB 3VDFA 1UTBB 3KG2A 4C1TA 3KFMA 4RNSA 5I59B 2DWIA 1UIUA 3MC2A 1MPCA 3KN8A 5H8FB 4U1OA 3IB0A 5I2KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Y7RA 1LBVA 3WAEA 3DLNA 4F3GA 3K6XA 5KCJB 2QRYA 4F3BA 1JEUA 3H7MA 4F2QA 2ONRA 1BK4A 2XA5A 4GIZA 4IO2A 2F7AA 1IXCA 3PMWA 3CFZA 4UABA 3LSXA 5EYGA 4ISUA 4MLQA 4MEVA 1FTAA 4KYDA 4GBVA 4F1YA 1P1UA 4OYVA 1HSEA 3AXFA 4NG7A 4MMPA 1MXUA 2DOJA 2XD3A 1P99A 1IXIA 3IJXB 3C33A 1DOTA 4PF6A 1FPBA 1BLFA 2X7PA 4LZ8A 4OVQA 3CRBA 4ELPA 5I3SA 4G8MA 2F34A 3L6HA 1DMBA 3VLVA 1FQBA 3IL1B 3S9EA 4GXAA 3FASA 1N04A 2V25A 4LN5A 2DE3A 1KWHA 5FTHA 3IX1A 2WEFA 5IAIA 4NQ8A 1QUJA 1CB6A 3IJOB 2PT1A 3EPEA 3UORA 3K1MA 3PMVA 3CHGA 1K9YA 4ZEBA 1A40A 1VDWA 3PUWE 1MH3A 2Q8JA 1NUZA 2OBGA 1IMBA 4PFBA 1FQFA 3T9XB 1NNTA 1FPGA 3U72A 2GHAA 2A5TA 2VGQA 3CFXA 4Z7EA 4EQ7A 1EU8A 1LSTA 5DEXB 2OWSA 3TPAA 5ICTA 4NF4A 3MW0A 1EZOA 2IA4A 4AQ4A 4NF8A 3RUMA 1MXYA 3N5LA 2ZYMA 2ESNA 1KZ8A 4LVQA 4BDQA 1WDNA 2XXIA 1NV0A 4P9KA 4OEUA 5ET6A 1PBQA 4PDHA 2Q9TA 2ZXTA 5JK4A 4KYSA 1VFEA 3ZSFA 3H6UA 1NV1A 1FQDA 1WODA 3ODBA 3KC0A 3Q27A 4BDLA 5H8HB 4X1BA 2OZZA 1GVCA 2H5YA 4KXPA 4GL8A 3QYTA 3TYHA 4P11A 4JWYA 4RPNA 1OVBA 4NF5B 4YMAA 1PB9A 1JVXA 5I58A 3GYYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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