1MPPA

X-ray analyses of aspartic proteinases. v. structure and refinement at 2.0 angstroms resolution of the aspartic proteinase from mucor pusillus
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
357
structure length
357
Chain Sequence
GSVDTPGLYDFDLEEYAIPVSIGTPGQDFYLLFDTGSSDTWVPHKGCDNSEGCVGKRFFDPSSSSTFKETDYNLNITYGTGGANGIYFRDSITVGGATVKQQTLAYVDNVSGPTAEQSPDSELFLDGIFGAAYPDNTAMEAEYGDTYNTVHVNLYKQGLISSPVFSVYMNTNDGGGQVVFGGVNNTLLGGDIQYTDVLKSRGGYFFWDAPVTGVKIDGSDAVSFDGAQAFTIDTGTNFFIAPSSFAEKVVKAALPDATESQQGYTVPCSKYQDSKTTFSLVLQKSGSSSDTIDVSVPISKMLLPVDKSGETCMFIVLPDGGNQFIVGNLFLRFFVNVYDFGKNRIGFAPLASGYEND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acid proteinase)
molecule keywords PEPSIN
publication title X-ray analyses of aspartic proteinases. V. Structure and refinement at 2.0 A resolution of the aspartic proteinase from Mucor pusillus.
pubmed doi rcsb
source organism Rhizomucor pusillus
total genus 79
structure length 357
sequence length 357
ec nomenclature ec 3.4.23.23: Mucorpepsin.
pdb deposition date 1992-02-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1mppA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1mppA01
1HTGA 2RKGA 2CEMA 4L6BA 2FDDA 5HCTA 5P1KA 2QZLA 3O9AA 2VIYA 5P2WA 1FB7A 1C6YA 4AA9A 5DQ2A 5P19A 4X7IA 1FMBA 2V13A 1YTIA 4TRWA 2NPHA 4EP2A 3JW2A 3KDDA 2AOGA 3NDUA 5JG1A 3ZKMA 2A1EA 2ER6E 4HDFA 3LNKA 5SY3A 1NSOA 4YD3A 5P3OA 4A6CA 4GYEA 2HB4A 3FKTA 5P6EA 3DJKA 3NXEA 4GJAA 5OZXA 1AJXA 3D3TA 2IKUA 5P3YA 2B7FA 7UPJA 1HEGE 3D20A 5P65A 3R0WA 3TL9A 5P4EA 5P25A 2FMBA 4Y5NA 2O4SA 5P61A 3OAGB 3QP0A 3R0YA 3ZKSA 3TTPA 4DUSA 1CMSA 2OHNA 3K1WA 5P4TA 4ER1E 1IVQA 2JJJA 3GI6A 3KT2A 5CONA 1PPKE 3VF7A 2QD6A 2ZJNA 1UH8A 5P0ZA 5P77A 4ACXA 1EPPE 2QNPA 3EKYA 3OOTA 5P57A 5P60A 4NKKA 3LINA 1FQ4A 1BAIA 2P3AA 5OZCA 5ISKA 1YM2A 3PMYA 4FGXA 7HVPA 4HVPA 4R92A 4CMSA 1AZ5A 2VNMA 4EJLA 4I0GA 1D4SA 2AVOA 2Q54A 5P7GA 4RVXA 1KJ4A 1SMEA 4J0VA 1T6EX 3IXKA 3OU1B 5P4FA 4APRE 5P04A 3TLHA 5P4AA 5P22A 1E5OE 3EKQA 2QU2A 2PSGA 4J17A 1G0VA 5P2UA 3O9HA 5OYSA 3QBHA 5E5KA 2QCIA 1META 2AOHA 4DQEA 2I4UA 1VIKA 3IXJA 4YCYA 1EEDP 1W5VA 6UPJA 4Y37A 1K6PA 1KJFA 2APRA 3SA3A 3UDHA 5P6AA 3SA4A 4I8ZA 1D4KA 5P8KA 1CZIE 1MTRA 3A2OA 1E82E 5JFUA 5OZFA 2NTRA 5P0IA 3INDA 5P6HA 5AH6A 1XL2A 3S85A 4M8XA 3UPJA 4LHHA 3UDYA 3URJA 5P4JA 4JP9A 3O9DA 5P3JA 1APUE 2BJUA 1YX9A 3URLA 3APPA 1F7AA 1F34A 5P4PA 4OD9B 5P08A 5OZ8A 2R5QA 4MC9A 4EHCA 3PBDA 3MXEA 1T7KA 3OHFA 5P3MA 4DQGA 2ZHRA 4Y4TA 3LIYA 3QPJA 2R3WA 5P7AA 3NYGA 5P5UA 4OBGA 3PWWA 2QP8A 3OU4A 1BWBA 1D4HA 5P14A 3FIVA 3SA9A 5P2VA 2V10C 5P5QA 3BXRA 3S7MA 5P51A 1DP5A 5P45A 1FMXA 1FQ6A 4KE0A 4L1AB 5P4YA 5OZWA 1IZDA 3Q4BA 2AOJA 1HSIA 1QBRA 4H3IA 2QI4A 5P85A 4DJPA 4XKXA 5P7TA 4YOAA 3SFCA 3UCBA 2G1SA 2ZJKA 4Y3QA 4Y3YA 3OHHA 5P6BA 1YTJA 5KQFA 5HDZA 4B00A 3QRVA 5P6RA 2P4JA 1LF3A 4FIVA 2F80A 6APRE 5P8LA 5P1YA 4GJDA 3SA8A 5P80A 4EQ0A 1LV1A 4ZEAA 5P0AA 2OHKA 1DAZC 3CKTA 1WBMA 5P4KA 1A8GA 3NDWA 1T6GA 2R5PA 1EC2A 1MRWA 5DGUA 3D1XA 4B70A 4B0QA 4Q1NA 5EZXA 3PI5A 1ZLFA 4DJRA 4H1EA 2I1AA 1HWRA 5ER1E 4U8WA 5P27A 5P3LA 3UQWA 2O4PA 4Q1YA 5P4RA 1HVKA 1SDUA 4Y3MA 1B6JA 4NJUA 5P0EA 1TZSA 4GJ6A 4ZSRA 3M9FA 5P8JA 2QI7A 4J0PA 5P0OA 3CYXA 3NDXA 2I4VA 3I8WA 4YCKA 3GI5A 1HOSA 5AH9A 5P2EA 5P2HA 5ER2E 5P7JA 4JOOA 4Y47A 3ER5E 5P1WA 2B60A 5AH8A 3C9XA 5I3XA 5P72A 5P0XA 3EL9A 2EWYA 5P3CA 5P5YA 2BBBA 1HXBA 5KR8A 4I1CA 5P4BA 3EKVA 3HW1A 2VJ7A 3S56A 2FGVA 4HDBA 3FX5A 3T3CA 5P7LA 4YD4A 2BPZA 3U6AA 5P68A 3ZKIA 5P40A 2P3BB 2HPFA 1G6LA 1QS8A 1B6PA 5P8BA 1Q9PA 4J1EA 4JPCA 1Z8CA 2WECA 2HS2A 3AIDA 4PZWA 1MVPA 5P2LA 4J1FA 5P3KA 3OGPA 4Y4UA 5DR3A 1B5FB 3PRSA 5P30A 3SKFA 5JFPA 2PK6A 4I0JA 5F00A 5P03A 2WF4A 1M0BA 3GGUA 3UFLA 5P8GA 3BXSA 5OZUA 5P29A 5P01A 4GB2A 2G24A 5P74A 2AOFA 1EC3A 3RTMA 3PM4A 2G94A 3PGIA 3TPPA 3S43B 5P8IA 5ENMA 5P1UA 3MSKA 4I12A 1UPJA 5P1BA 4QJ8A 5P8HA 1BV7A 5P1FA 5ISJA 5OZ7A 3MSJA 3O9EA 1APTE 2HB2A 5P42A 2AVQA 2NMYA 5I3YA 5P82A 5PEPA 4FRSA 5E5JA 4I0IA 3FNSA 5P44A 2A4FA 5P47A 5P36A 3ECGA 1FG6C 3TPRA 3UDKA 1W50A 5P37A 5TOLA 5P0UA 1SMRA 4CP7A 4Y3RA 3DCKA 1MTBA 2Q63A 5C9DA 2QHZA 2XFIA 3EKXA 5P2OA 4DFGA 4JPEA 2IL2A 2WEDA 1K2BA 1PSOE 3U7SA 5P5HA 3PLLA 2J9JB 4HEGA 2BKTA 4NJSA 3VCMA 5I3WA 5SZ9A 3GW5A 1HVIA 3KDBA 2ZJHA 5KQYA 1IIQA 3SACA 2QHYA 5IE1A 2BPVA 5OYXA 1BWAA 4A6BA 5FIVA 1HSHA 2G1OA 1FFIC 3RSVA 5P87A 1HTFA 5P6CA 5OZSA 4NJTA 1BDRA 2UXZA 3N3IA 5SXNA 3LIZA 2QAKA 3NR6A 4OBFA 1GVTA 5AH7A 4DJVA 1ZSFA 2OHTA 4KB9A 5HDXA 1ODXA 3HVPA 4YBFA 3EC0A 1XN3A 5P1IA 4H3GA 4I0DA 3WB4A 3TKWA 5OZBA 3R2FA 1ODYA 3IA9A 5P2TA 3PSUA 2Q64A 1MRXA 5P5MA 4QJ9A 4Z2ZA 5OZRA 4RRNA 4Y50A 4I0HA 5OZOA 3VLBA 4Y4DA 1HPOA 1MSNA 3CIBA 3KT5A 4B1DA 4R93A 1LYBA 5P81A 3CMSA 1HPVA 3U71A 2PYMA 3QVCA 1RPIA 3QI1A 3NWXA 3ZKQA 3PWMA 5P1NA 2WHHA 4FRJA 2J9JA 3O9FA 2PMAA 1KZKA 3PLDA 1UH9A 5P2ZA 5P5WA 2AOCA 3PB5A 3D1ZA 4LBTA 4BFBA 5HVPA 2BQVA 4I0EA 5P2IA 5HTZA 1IZEA 1HVLA 5P7HA 3CICA 5P8QA 5P7EA 3UQUA 3PHVA 5P1PA 1DMPA 3JVYA 5OZ2A 4FE6A 1W6HA 2IGXA 3DK1A 3VF3A 3OK9A 4Q5MA 2OHLA 4I8WA 3QROA 3LPKA 3D1YA 3OUAA 4HLAA 2JE4A 2PK5A 2AOIA 4Y6MA 3VFBA 1NPVA 5CLMA 4BELA 1J71A 4QJ7A 5P71A 1B11A 3GI4A 4RVIA 2G69A 1B6MA 5P83A 1Z1HA 2QZKA 5OZIA 5C9FA 3HZCA 5P3EA 3DM6A 2PH6A 1M4HA 5P6GA 4ZPGA 3PWRA 1FGCC 2QU3A 4Y4GA 5DR7A 3EKPA 5P2MA 5P5DA 4CPTA 1ZBGA 3OUCA 3TNEA 2UY0A 1PPME 2FS4A 5P3DA 1BV9A 5P2AA 1GVVA 1MPPA 4WY6A 5P7YA 5P5AA 5P2YA 4XX4A 4K9HA 3VF5A 4DJWA 4Y3PA 3UDNA 1EC1A 4RGHA 1OEXA 5P8SA 1EC0A 1MEUA 5P2KA 4DJXA 3IAWA 3BGBA 2I0DA 1EBKC 5P3SA 5P28A 3ER3E 4K8SA 2ER7E 3L38A 1E81E 4XXSA 5OZ9A 2F8GA 3Q6YA 2QI3A 5P2QA 4RCEA 5P1CA 4B05A 4Y9WA 3KF0A 3ST5A 5P7VA 3VYEA 3SPKA 5P8RA 2H6SA 1ENTE 3RU1A 1K2CA 5P7QA 3T7QA 5P2DA 5IVSA 1MESA 5OZJA 5OZVA 3G72A 3UDPA 5OZGA 1ZP8A 5COKA 5OZZA 3ZKGA 5HU1A 4RRSA 5P7IA 3OU4B 1FQ5A 3SAAA 4JECA 5AGZA 2G1RA 5P0MA 3UF3A 5P0YA 1APWE 3NWQA 1C70A 4YD5A 1BVEA 1HIHA 5P07A 4D83A 3VV7A 1HEFE 1AJVA 1RL8A 4Z4XA 4Y3WA 3LZUA 4DJYA 2NXLA 5P6PA 3SKGA 1OEWA 5P0QA 4YCTA 5P8UA 3AUPA 4Y3AA 2FIVA 3LITA 5P5JA 2B8VA 1QBSA 3KFRA 4FAEA 4Y45A 2ZE1A 2ZGAA 5P2CA 1EAGA 3TH9A 1XL5A 5P00A 2NR6A 2NXMA 4U7QA 4FL8A 4DPIA 1IZHA 3MWSA 5OYZA 2Q15A 4Y38A 5OZPA 2FGUA 4Y3LA 3IN4A 5P3FA 4D88A 1LS5A 5P5RA 1TCWA 3OXCA 1AM5A 5AHAA 1BXQA 3PCZA 1NPAA 3L59A 2QI5A 5P1DA 5P5VA 3DOXA 3VLAA 4EJ8A 2QD7A 1QDMA 5BS4A 1XN2A 5P46A 4F73A 4U7VA 5HD0A 4B78A 5OZKA 3HD8A 3PEPA 3S7LA 4Y53A 2SAMA 2UPJA 1LEEA 4GMIA 4CPSA 5P52A 2AZ9A 3FSMA 1VIJA 1A9MA 1QBUA 3KFSA 2O40A 5P4WA 4BEKA 1ER8E 3UDQA 4R8YA 1SIPA 4Z22A 4FRIA 1TSUA 1IDAA 2HIZA 3R4BA 4YDFA 4LXKA 5EZZA 2FXDA 4RZ1A 2NMZA 5P84A 2BPWA 5P4IA 3OQDA 3FNTA 3QBFA 5P7NA 4NPTA 4FCOA 5P5NA 5P76A 2WF0A 3EL1A 2F3FA 3T7XA 1KJ7A 4KE1A 3QAAA 5P5SA 2QMGA 4FM8A 3O9CA 2ZJIA 4HA5A 5P1ZA 1HVSA 4F74A 5P75A 3UFNA 3I6OA 2BKSA 4EP3A 4PYVA 5P3HA 5P53A 1PROA 5P70A 3LZVA 3O9LA 4OC6B 1HBVA 1CPIA 1HIIA 2XFJA 5DGWA 2VA7A 5P63A 1W5XA 1T7IA 1XDHA 3OQKA 4WY1A 4GIDA 3PCWA 4MC6A 3L3AA 3INHA 3NDTA 4J0TA 5P5TA 5P7SA 4IVTA 5IVQA 5OZ0A 1FLHA 1W6IA 2QNNA 3HLOA 4B1EA 2AOEA 2VIJA 3OADA 5OYUA 1ZSRA 1SDTA 5P6KA 3K5FA 5P10A 4TVHA 8HVPA 5P62A 5P79A 5P6SA 1FF0C 5P7MA 4OBZA 3BVAA 3S45A 3LZYA 4RROA 2FDPA 5P1GA 2O4LA 4DH6A 3QN8A 1EPRE 2OHUA 3ZLQA 5P4SA 1HRNA 5P8NA 5P4OA 2HM1A 2V0ZC 3LIXA 5P0JA 2V00A 4CPXA 3UTLA 3BUGA 2QZWA 4LC7A 1OHRA 2WL0A 5P4MA 5P6DA 4F76A 1YT9A 3BGCA 2I0AA 5F01A 5P23A 4ER2E 4Y58A 4ZE6A 4ZPEA 2NNKA 4RLDA 2QK5A 2PC0A 1UH7A 5P6OA 5P0NA 3RSXA 4OC6A 2WEZA 2ZJLA 5KAOA 2QMPA 5HU0A 3EXOA 4PHVA 5P18A 2IQGA 3K5CA 1XE6A 2QD8A 1BDLA 4D8CA 2VKMA 4AMTA 4Y5BA 4PZXA 5P3IA 4KUPA 2VA5A 4ZPFA 1BXOA 3IVHA 1A30A 2Q3KA 5P1EA 5P16A 4Y43A 1W5WA 1ZPAA 5P0VA 3MSLA 4APEA 3S2OA 3ZOVA 3OQ7A 5T4SA 4A4QA 2JXRA 1IVPA 4Y3FA 5P4VA 1FFFC 3ZMGA 3UQXA 1D4IA 3KMXA 1E80E 4Y4ZA 1HVRA 2HPEA 3I2LA 5P4XA 3F9QA 5P8EA 2FNSA 2I4QA 5P3NA 4BFDA 3K5DA 5P69A 2PH8A 1DPJA 4GJCA 5P2JA 3ZPSA 4Y5LA 3OOZA 5P7OA 4Y57A 5P26A 5P6XA 5P4ZA 1BBSA 3EM6A 5P09A 5DQ4A 4J5JA 2OHMA 5OYYA 5P1SA 3LIVA 2ZJJA 5P7UA 2B8LA 5P0CA 5P58A 5DR8A 4QJAA 3TPJA 1T3RA 5OYVA 3H5BA 2IEOA 2H6TA 5P3QA 3IVIA 2WF3A 4J0ZA 4F75A 3S53A 1HTRB 5P4HA 3TOHA 4EJKA 4J0YA 4FAFA 3HAUA 4DJUA 2HC0A 4Q1WA 3T7PA 5P1VA 5KR0A 5P0TA 1GNNA 5HDVA 2P8HA 2ZHUA 3RTNA 4FSLA 4R5NA 5OZ3A 3LPJA 2OAHA 2QI6A 4HE9A 1Z1RA 5P5XA 5P4LA 4FM6A 2RENA 1YTGA 3SO9A 5P4CA 2VS2A 5P1OA 4Y51A 3SM2A 3EMYA 1TSQA 3Q70A 3N4LA 1LYBB 5P43A 2CENA 2ZHVA 1KJGA 2WJOA 5P55A 1NH0A 1W5YA 3HBOA 1ZTZA 3WZ6A 1SIVA 4Y3EA 1ME6A 4Y39A 5B18A 5OZNA 4L7GA 3EL4A 4DPFA 5OYQA 3RVIA 3CIDA 2JYSA 3H0BA 4DQFA 2PQZA 1HTEA 4I0FA 2AZBA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1HTG A;  2RKG A;  2CEM A;  4L6B A;  2FDD A;  5HCT A;  5P1K A;  2QZL A;  3O9A A;  2VIY A;  5P2W A;  1FB7 A;  1C6Y A;  4AA9 A;  5DQ2 A;  5P19 A;  4X7I A;  1FMB A;  2V13 A;  1YTI A;  4TRW A;  2NPH A;  4EP2 A;  3JW2 A;  3KDD A;  2AOG A;  3NDU A;  5JG1 A;  3ZKM A;  2A1E A;  2ER6 E;  4HDF A;  3LNK A;  5SY3 A;  1NSO A;  4YD3 A;  5P3O A;  4A6C A;  4GYE A;  2HB4 A;  3FKT A;  5P6E A;  3DJK A;  3NXE A;  4GJA A;  5OZX A;  1AJX A;  3D3T A;  2IKU A;  5P3Y A;  2B7F A;  7UPJ A;  1HEG E;  3D20 A;  5P65 A;  3R0W A;  3TL9 A;  5P4E A;  5P25 A;  2FMB A;  4Y5N A;  2O4S A;  5P61 A;  3OAG B;  3QP0 A;  3R0Y A;  3ZKS A;  3TTP A;  4DUS A;  1CMS A;  2OHN A;  3K1W A;  5P4T A;  4ER1 E;  1IVQ A;  2JJJ A;  3GI6 A;  3KT2 A;  5CON A;  1PPK E;  3VF7 A;  2QD6 A;  2ZJN A;  1UH8 A;  5P0Z A;  5P77 A;  4ACX A;  1EPP E;  2QNP A;  3EKY A;  3OOT A;  5P57 A;  5P60 A;  4NKK A;  3LIN A;  1FQ4 A;  1BAI A;  2P3A A;  5OZC A;  5ISK A;  1YM2 A;  3PMY A;  4FGX A;  7HVP A;  4HVP A;  4R92 A;  4CMS A;  1AZ5 A;  2VNM A;  4EJL A;  4I0G A;  1D4S A;  2AVO A;  2Q54 A;  5P7G A;  4RVX A;  1KJ4 A;  1SME A;  4J0V A;  1T6E X;  3IXK A;  3OU1 B;  5P4F A;  4APR E;  5P04 A;  3TLH A;  5P4A A;  5P22 A;  1E5O E;  3EKQ A;  2QU2 A;  2PSG A;  4J17 A;  1G0V A;  5P2U A;  3O9H A;  5OYS A;  3QBH A;  5E5K A;  2QCI A;  1MET A;  2AOH A;  4DQE A;  2I4U A;  1VIK A;  3IXJ A;  4YCY A;  1EED P;  1W5V A;  6UPJ A;  4Y37 A;  1K6P A;  1KJF A;  2APR A;  3SA3 A;  3UDH A;  5P6A A;  3SA4 A;  4I8Z A;  1D4K A;  5P8K A;  1CZI E;  1MTR A;  3A2O A;  1E82 E;  5JFU A;  5OZF A;  2NTR A;  5P0I A;  3IND A;  5P6H A;  5AH6 A;  1XL2 A;  3S85 A;  4M8X A;  3UPJ A;  4LHH A;  3UDY A;  3URJ A;  5P4J A;  4JP9 A;  3O9D A;  5P3J A;  1APU E;  2BJU A;  1YX9 A;  3URL A;  3APP A;  1F7A A;  1F34 A;  5P4P A;  4OD9 B;  5P08 A;  5OZ8 A;  2R5Q A;  4MC9 A;  4EHC A;  3PBD A;  3MXE A;  1T7K A;  3OHF A;  5P3M A;  4DQG A;  2ZHR A;  4Y4T A;  3LIY A;  3QPJ A;  2R3W A;  5P7A A;  3NYG A;  5P5U A;  4OBG A;  3PWW A;  2QP8 A;  3OU4 A;  1BWB A;  1D4H A;  5P14 A;  3FIV A;  3SA9 A;  5P2V A;  2V10 C;  5P5Q A;  3BXR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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