1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
2XX9A 4EXLA 2PX1A 4KI0E 5ISUA 1NH8A 2RCBA 3DP8A 1MPCA 4WEPA 3RPWA 5IAIA 5L9MA 5I56B 1RYXA 3AXFA 2ZMBA 3IOWA 2H25A 4HS7A 5CMBA 3RUMA 3U8QA 3VV5A 5I2NA 1MXYA 2UVGA 2V93A 3SEWA 3TODA 4DE8A 3DP6A 4F3BA 2NOOA 4N6PA 3ECRA 3K2DA 4KYDA 4ZEKA 3S9NC 4QSDA 5EHSA 1TFDA 1B0HA 1DSNA 2UYEA 2F7CA 3KN3A 2WKYA 4YU0A 3WAEA 1MH3A 3H03A 3UP9A 1EH3A 5AE4A 2H9BA 1EU8A 5CMKA 1M5FA 2E1SA 3MC2A 4RPOA 5JEIA 1PEBA 3IJOB 1LFIA 2AIXA 3JZJA 4LUBA 1MY4A 3C35A 2F36A 1LB8A 1LBCA 3MW0A 3CSBA 4JBZA 2M8CA 4U23A 4F1VA 1TFAA 1US4A 2VOZA 3K6UA 2Y7PA 1D9VA 4U22A 2O7UA 3DP4A 2O1MA 3SEVA 1MPBA 5I84A 1TWYA 1RYOA 2HAUA 2GHBA 3MZ9A 1H43A 2F35A 4I1DA 1B3GA 1B7ZA 1IXCA 1F9BA 2I4CA 2V3TA 3FD3A 2OBGA 4OESA 4R75A 1VFDA 3S2VA 4ESWA 4IGTA 5H8HB 1TXFA 4EF1A 3PD8A 3OO7A 4Z0IA 3W9VA 3IOUA 1FQEA 4GIZA 5TPAB 2F6GA 4HCYA 4OEUA 4F3SA 4OENA 2DS9A 4MFIA 4RXLA 3RT6B 4FATA 4YKJA 3G7WA 1PBPA 3FVKA 4MBPA 4G8NA 5ICTA 4TLLB 3M8UA 4ESXA 4NF5A 4NTLA 4GQOA 1JW4A 2AL5A 2HZLA 2I3WA 4R74A 3UORA 3K4UA 4DLDA 2Z8DA 4XXUA 3QAXA 4I9DA 1MH4A 4H8IA 4OQOA 3TQWA 3TCHA 3T96B 3MP8A 3KEIA 4BDOA 5KDTB 1Y1ZA 1XHYA 2HAVA 3C32A 2O1LA 3CSGA 1ZJLA 4C1TA 3FIRA 2RC8A 5CI5A 1R6ZA 3PV0E 5DEXA 1JVYA 2Y7KA 3I6VA 4MF3A 2I0CA 4ZE8A 3K6WA 5H8SA 3TTNA 4QFOA 2QS1A 5I59B 2DSFA 5TP9A 4RK2A 1HSJA 2D5WA 1LAXA 2CMOA 3OSQA 4Q0CA 3S4UA 4OEVA 1SW4A 1N0TA 4KCCA 3K1MA 4TLMB 3RGYA 4DXUA 3LSXA 5CM6A 1B4ZA 1DOTA 1SYIA 1IUDA 3FXQA 1MQIA 2NUVA 4G68A 5I57A 1ZU0A 3VLVA 1LB9A 4XIGQ 4PETA 4BDLA 2VD3A 4ECFA 2HFBA 3PPNA 4EQ9A 5FHMA 1GGGA 1MPDA 4IO4A 1TT1A 1US5A 2FA7A 1Q35A 5I58B 1UTHB 3LSFB 5DYHA 3SERA 4XKQA 2H4IA 4G4PA 2REJA 5M2VA 4PE5B 3OMBA 1B3EA 2RC7A 5CRYA 2I58A 4GFRA 2Q88A 4GF8A 3KZGA 4H1XA 3ZS6A 1GTKA 1ZKBA 3SETA 2A5TB 2AYSA 3G3FA 2GRVA 3UA8A 1B52A 3WAFA 3KN7A 3MUQA 4LZ7A 5ELVA 4ZEFA 4LQ5A 3ZKKA 3IK6B 3EPEA 3H3GA 1SDXA 2OZZA 2Z8EA 1M5CA 2XX8A 1GV8A 3GLBA 5AA2B 3OO9A 3A09A 3OD7A 2XXHA 4YAHX 2Q89A 2OWTA 4IO7A 1SD3A 4YICA 5DVIA 4NF4B 1GR2A 5JK4A 1M5BA 1DMBA 4ZDMA 1CB6A 1XS5A 2XXIA 4TOZA 3W9WA 3CVGA 4FORA 4LZ5A 2DVZA 4N07A 4YB6A 2QS3A 4DCXA 1MXXA 4HCWA 1UTBA 3G3KA 3CG1A 3EHTA 2CZLA 2F78A 4YZZA 4RY1A 4R73A 4F2OA 1B58A 5I58A 1A99A 3RT8A 3UK4A 4KD5A 1MRPA 4PFTA 2D21A 3CI8A 4JDFA 3KN8A 4ELQA 5HBCA 1B5HA 2QS4A 5EYFA 3FXRA 2FYIA 4JWYA 4F29A 4FE8A 5JTYA 1FQBA 1ELJA 4G68B 5AA4B 1B05A 2XXWA 4YB5A 4U2RA 3Q28A 4JSOA 5KCJA 2O6AA 3L6GA 3T9VA 1Y20A 3IJXB 3DELB 3QXMA 1DTGA 1P1OA 4WXJA 1D3KA 4U4SA 1UTHA 1SI0A 3FGSA 3PD9A 4LQ2A 2DVCA 1FTLA 2Y7WA 3HHGA 1H76A 1MQGA 3PPPA 4DDDA 4K3FA 4EDPA 1WVJA 2F6PA 3F11A 3C4MA 1JEVA 4R6YA 4POWA 1VR5A 1MQHA 4EUOA 1RKMA 4GXAA 5FTIA 4O3CA 1H45A 1LCTA 4ZEIA 4YMBA 3CFLA 3KFMA 4ELRA 3C34A 3D4CA 3DM0A 3TKDA 4OYVA 3PPRA 3TDJA 3ILTB 3S9MC 3IB2A 2VHAA 1NKXA 1D9YA 2XD3A 3K00A 1SQYA 4ZEBA 5CBRA 1MY0A 2XXRA 3M3LA 3PGFA 4IO6A 4NF5B 1A55A 2Q2CA 4YKPA 2B3BA 2I6EA 3FZVA 4JWOA 1MM6A 3FUZA 3K1NA 4OERA 3SEXA 2V3UA 1H3DA 1MDP1 2QS2A 3O28A 4FEBA 2REGA 1URSA 4FECA 3VLUA 1NFTA 4GLIA 4QFNA 3PMWA 3QUJA 3K6XA 4IB2A 4TQUQ 3U72A 5H8HA 5HM4B 3V83A 3PMVA 1HSLA 3BKIB 1JEUA 4KYEA 5JTYB 2V3QA 3IL1B 4DIGA 4F19A 4UACA 4POXA 2F34A 2UVIA 2XXUA 3OOAA 4PFWA 3P7IA 2NVUB 1URDA 3OEMA 4JXIA 3VXBA 5KZTA 2H99A 2O69A 3IO6A 1FTJA 4R72A 3MVWA 3TELA 3QK6A 4OFOA 2PT1A 3M3FA 1B2HA 1DTZA 2V84A 3MJNA 5H8FA 4BDMA 3KOTA 2PBWA 4HW8A 3IR1A 2HZKA 1QUJA 1Y4TA 1FTKA 3I3VA 3TTKA 4I8CA 3IB0A 2B3FA 4G2ZA 3GXAA 4H8JA 4OZ9A 4YKIA 2Q8JA 4ELOA 5AA2A 2H98A 1LSTA 1ATGA 4G8HA 3LUYA 3T66A 5ITPA 4ONYA 2DXYA 5H8NB 1PB7A 4DCYA 3KOSA 1P1UA 5F7VA 1A8FA 3B6TA 4RYAA 4C1UA 3C9HA 5I56A 1B4HA 2DP8A 2PYYA 4GOTA 4OFJA 1O64A 1SBPA 4PP0A 1XC1A 4U4XA 4ZEDA 2Z8FA 5K2YA 4KPTA 2W7YA 3OELA 3BFTA 2HXWA 2FNCA 4YMAA 1P1WA 3TQLA 4F22A 3O6HA 3KJ7A 2ONKE 3O6IA 4R2BA 2ONRA 3H4ZA 4NEDA 4QSCA 3LSLA 3O6GA 1B51A 4LA9A 2BJJX 2QMXA 5DVJA 3MVZA 5I57B 1I6BA 5L9SA 1FQAA 3FJMA 3TTRA 1A7LA 3LR1A 1Q1KA 3E9XA 4X1BA 1EZ9A 2OWSA 2Q2AA 2QMWA 4R2FA 4H5FA 5J1DA 2Q9TA 5CBSA 3FATA 3KSXA 1R9LA 1QW0A 2RINA 2RKMA 1DPPA 3MPLA 3CFXA 3VLWA 4ZECA 2ZYMA 1LLSA 3RLFE 3T93B 5I59A 1P1NA 2ZNUA 1O63A 3C33A 1XVXA 3LSWA 2I0BA 3HCQA 4OMBA 5A5XB 1AIVA 4P0GA 3TCFA 3VVDA 3RTWB 1SW2A 1B0LA 2X26A 5L8DA 4U1ZA 5I2KA 4ZE9A 2QSXA 1WDNA 1XT8A 3TYHA 2QL3A 2ONSA 3C36A 5TP9B 2DYXA 2F97A 3H7MA 4PQJA 4RJZA 2RCAA 1USYH 3MPKA 2R6GE 4M4GA 5H8NA 3ODBA 4U1OA 3DLNA 3H6WA 3IORA 2RC9A 1CE2A 3K02A 4LVQA 4UA8A 4GWOA 4L17A 1OVBA 2OK2A 2PT2A 3R6UA 4R9GA 4QRZA 3B7DA 5A5XA 5KDTA 3QSLA 1GVCA 4ZZEA 3GZGA 3IB1A 2DWHA 1NNPA 4OETA 1B7HA 2ZNTA 3M3KA 4G77A 4MH5A 4FAJA 2RF1A 1ZBMA 4PFUA 3V8XB 3FVNA 4O3BA 3U1OA 2DE3A 4YB7A 3IO4A 5ICQA 3QYTA 1II5A 2F5XA 1B3FA 2XXTA 1AH5A 1PC3A 4IO3A 4G68C 3T22A 4KHZE 1JQFA 3CR9A 2I3VA 5BWJA 5HPQA 1L5TA 3EQ1A 2DXRA 3TPAA 2QRYA 2I48A 4ISUA 3CRBA 4QHQA 3S9LC 2THIA 2XXYA 1NL5A 2P0SA 1B3HA 4OVJA 3KG2A 4ZS9A 3H06B 3HPIA 3U92A 4C0RA 2DOJA 3OSRA 2UXAA 3E3KA 1IITA 1FCKA 2IA4A 1IEJA 4R6HA 5FHOA 3TAJA 3N26A 1BLFA 1IXIA 1XVYA 4NE4A 5CC2A 1B3LA 1URGA 1WODA 4IGRA 1B9JA 2KLFA 1A40A 4LP2B 3TTLA 5B70A 4NWCA 4F18A 2A5TA 1NNKA 2E0SA 3H6VA 1BP5A 1MXVA 4NF6B 3VVFA 4E0WA 4EXKA 2VP1A 3U93A 4RPNA 1MS7A 5EHMA 1JVXA 4AB5A 3FV2A 4XKPA 4KQPA 1LAHE 3PUWE 4NMYA 4FJPA 4E0XA 1Y9UA 2YLNA 3CFZA 1N84A 1M5DA 5CMMA 1YPNA 4X9TA 4X1DA 5FTHA 1AMFA 4BDNA 3RY3A 1EZPA 1MM7A 3KGCA 4MLVA 4H0WA 1YCJA 5H8FB 3FJGA 5AA1A 5K2XA 5B7DA 3JYRA 2X7PA 2VGQA 3RQTA 1IQ7A 3HV1A 1MY3A 3THIA 3TZAA 3G3JA 1OMPA 3T9XB 3GBAA 3IAZA 3VFJA 5ITOA 4BLAA 2AL4A 3KSJA 4G8MA 5L9OA 3UIFA 2XX7A 3OEKA 3HHFA 4R6KA 1Y3QA 3Q27A 3SDFA 3SESA 4H6DA 4QFKA 2DWAA 4JWXA 4F31B 4GL0A 3PUZE 2F7BA 2ABHA 2O68A 2ZNSA 3V5AA 1QULA 3RNNA 2O84X 1N3XA 3H6UA 3Q29A 2Z22A 5CMCA 2IEEA 4OXVA 1LFGA 1KWHA 1PDAA 1I6AA 1A54A 2A5SA 1Z7NE 2UVHA 3GBBA 3OO8A 3MWBA 3VDFA 1Y1MA 3UGWA 4NF8A 4DXBA 4MLQA 4XKNA 1YAEA 4GVOA 1MY2A 1JW1A 3CIJA 3TCGA 1B46A 1BTJA 3L6HA 1IXHA 2XXPA 1ANFA 3ZSFA 2GFEA 1PB9A 4GXSB 4RK9A 4XTCQ 4AQ4A 1BIYA 1MQDA 1ZIUA 3HO7A 4I62A 5F1QA 4H65A 2D3IA 3TTMA 2GH9A 2ANJA 2LAOA 1OQGA 2HEUA 1QJMA 2R9JA 2ZXTA 3MVXA 3MZBA 3MQ9A 4GL8A 4KCDA 2YPNA 5DEXB 4DXCA 1SYHA 1FTMA 1A8EA 2XHDA 3PMXA 4KR5A 4OFLA 3SEUA 1MQJA 1FQDA 3MZ1A 3PU5A 5DT6A 1N7WA 4FIMA 1ZTYA 4BDQA 5AA3A 1P99A 1Z7ME 3E4RA 3K6VA 1LAGE 3MP1A 1B32A 4F1UA 2ZYKA 1M5EA 1DPEA 5FHNA 1VFEA 3PUVE 3A3UA 4N13A 3UN6A 2NXOA 3JV9A 4P0IA 4Q30B 1XOCA 3R7XA 1JETA 3QIMA 3N5LA 1MXUA 5TPAA 3Q26A 3PUXE 3HN0A 2V25A 3OENA 4ND9A 1OLAA 2X7QA 3K1PA 2OCUA 1SI1A 1UIUA 2QPQA 2DE2A 4H67A 4KYSA 4Q5TA 3SEYA 1B5JA 2DQVA 3N6UA 4OHNA 1NMUA 3IOVA 4PFYA 3O29A 2Y7RA 5H8QA 1LFHA 1N3WA 1QKBA 2H5YA 1SW1A 4JB7A 4HTGA 4F1YA 1UTBB 2YJPA 4THIA 4EF2A 1N76A 1MG1A 1AL3A 3A3CA 3G3IA 3BFUA 2NWJA 2UYFA 3K0VA 2F8DA 2VD2A 5DVFA 3T9HB 1MXWA 4NF6A 3E13X 3OXNA 3PPOA 3MP6A 1I6QA 4WEDA 2OJTA 1O7TA 4LONB 4NF4A 1NH7A 4Q8RA 3B6QA 1MY1A 2R71A 1B1HA 1H44A 1LCFA 4H5GA 2PVUA 2ZYNA 1N04A 3ILUB 3TMGA 1POTA 3R26A 3TEPA 3IOTA 1IZ1A 2DWIA 3FVGA 4IY5A 4Z7EA 4DZ1A 4F3GA 1B40A 3MVYA 3VVEA 4QF9A 1OVTA 4KFQA 2Z23A 5IKBA 3BBRA 4RNSA 1D4NA 1J1NA 3C31A 1OIBA 3O9PA 4IO2A 4OWDA 5BUUA 3RTFB 3EN3A 2P1SA 1HSEA 4YKKA 4BDRA 5AA2D 5I2NB 3B6WA 1EZOA 2HQ0A 4LATA 2PMSA 1USYE 3ONMA 1Y4CA 3KJTA 4U21A 4AB6A 2GHAA 2O7IA 2I49A 2Y7IA 5H8QB 3TFLA 5TU0A 3EHSA 3FXUA 4F3PA 5DTBA 3T9UA 3RN8A 1S9TA 2F7AA 1QKAA 2UVJA 1FQFA 5LOMA 2ESNA 2XXQA 3O66A 4WKMA 1LAFE 4IO5A 1SVXB 1MDQA 2Y84A 3ZKLA 4O3AA 2ALUA 3USDA 2HCAA 4ZZAA 1IXGA 4X48A 1ZMGA 3FASA 1S7YA 1PBQA 4P11A 2XXVA 3FV1A 3FVOA 4M1VA 3MAMA 1N7XA 2XD2A 1SW5A 3G3GA 4OTEA 4ELPA 1S50A 4F39A 3OO6A 1B1XA 1JW5A 3LBSA 4GRKA 3G3HA 1Y3PA 3EHUA 4FEDA 1B7UA 4NF8B 3VE1B 3LC8A 1POY1 1FQCA 1UQWA 3D4GA 4IY6A 5AA4A 1BKAA 1B5IA 2OLBA 3EF7A 2B65A 3U94A 1QUKA 1NNFA 3VXCA 3N6TA 3W15C 1VSOA 1OLCA 2G29A 2G93A 2I4BA 3O2AA 1NNTA 3N94A 4R9FA 4EQBA 3O97A 2QJEA 3V89B 1VE4A 3CG3A 1FTOA 1PB8A 4QSEA 3HSTA 1QVSA 1QUIA 3QUFA 1LGBC 4EQ7A 3TUSA 1MXZA 4QFLA 4LZ8A 4QFPA 2ZYOA 1JNFA 5I2KB 4XKRA 2P2AA 1R9QA 3IX1A 1OQHA 4NWDA 2DWJA 1I69A 1ZLQA 3I5OA 3PPQA 5KCJB 1B6HA 1T0KA 3H6TA 1UIVA 3SKPA 3K01A 2O51A 3PUYE 3Q25A 1FW0A 1R1NA 3KBRA 2XXXA 1AOVA 4F2QA 1Y3NA 3FJ7A 3S9EA 1LBBA 1P1QA 4JSDA 4RA1A 2DE4A 4GD5A 1IIWA 3MBPA 1YTVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QMFA 4KI0E 1NH8A 4WEPA 1MPCA 1RYXA 4HS7A 5CMBA 3VV5A 5I2NA 3SEWA 3DP6A 4FBPA 3K2DA 3S9NC 5EHSA 1TFDA 4GX6A 3KN3A 2F7CA 4YU0A 2WKYA 1MH3A 4PF8A 5CMKA 2H9BA 1EU8A 2E1SA 3JZJA 1LB8A 4U23A 1US4A 2Y7PA 3SEVA 4U22A 2O1MA 2GHBA 1F9BA 2OBGA 4R75A 4PTKA 5ESYA 3W9VA 1YZ0A 4PBHA 5EYGA 5TPAB 4HCYA 4OEUA 2DS9A 1NUZA 4NTLA 3K4UA 4XXUA 4H8IA 4OQOA 2V4CA 3C32A 1IMAA 5LDZA 2DDKA 4N17A 5IZ3B 5I59B 4RK2A 2D5WA 2HXRA 3OSQA 4Q0CA 4MIJA 1FBHA 3LSXA 5CM6A 1SYIA 2NUVA 4G68A 1ZU0A 3VLVA 4XIGQ 2VD3A 2HFBA 5FHMA 1GGGA 4IO4A 3LSFB 2REJA 5CRYA 1DK4A 2I58A 2Q88A 4H1XA 2A5TB 3G3FA 5J16A 3EPEA 3H3GA 1SDXA 3OO9A 3SDFA 4IO7A 1CB6A 4N6DA 4FORA 1BK4A 3MSTA 4DCXA 2BJIA 3CG1A 3EHTA 2F78A 2HPGA 4MNPA 1A99A 3RT8A 4KD5A 4ELQA 1NUWA 5HBCA 5EYFA 4FE8A 4U2RA 3Q28A 5KCJA 3QXMA 1P1OA 1NV0A 1IMEA 4EDPA 2F6PA 3F11A 1RKMA 4GXAA 5FTIA 1H45A 4YMBA 3C34A 3DM0A 3IB2A 2VHAA 3K00A 1MY0A 2XXRA 3M3LA 1A55A 2Q2CA 3FZVA 4JWOA 3SEXA 4OERA 2V3UA 4FEBA 1MDP1 3VLUA 4GLIA 4IB2A 5HM4B 5H8HA 5EQ7A 2B4MA 1JEUA 3BKIB 2WBBA 4F19A 3TELA 4I3EA 3B50A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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