1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
3B6WA 2B3FA 4E0XA 3K01A 4JDFA 3PUVE 1P1QA 3ZKLA 1B1HA 3UGWA 4FORA 1H45A 4RK2A 5EHSA 5FHMA 3KN3A 4DE8A 1MDP1 4KR5A 4ZECA 4IY6A 3B6TA 1LAGE 5AA2A 2AIXA 3VXCA 3G3HA 4GWOA 5H8QB 1US5A 1B3LA 5AA3A 4PFUA 5H8HB 2H25A 1D9VA 4TQUQ 5I58A 3KOSA 1B2HA 3CVGA 4OYVA 4PP0A 4N13A 4JWYA 1YAEA 2P0SA 1ZTYA 3GBBA 2AYSA 4TOZA 4ELPA 1IXCA 3M3LA 3P7IA 3MAMA 4ESXA 1MG1A 3E13X 1N7XA 3O6GA 1URDA 1B6HA 2XXXA 4Q8RA 1QUIA 3MVWA 3K2DA 4NWDA 3IORA 1IZ1A 4QFPA 4YB5A 4DXCA 3RT6B 4P0IA 4RPOA 2GH9A 3FVNA 1MH4A 3BKIB 4RYAA 3TODA 4Q0CA 1FQAA 4ESWA 4OQOA 1UIUA 2R71A 3UA8A 2QPQA 3CG1A 1SYHA 3M3KA 4G68B 4LP2B 3N5LA 3IB0A 4R2FA 2DWIA 1B52A 3MWBA 3MC2A 3FGSA 4PQJA 4NF5B 5ISUA 3Q28A 3IB2A 1P1OA 5CMKA 3MP8A 2PBWA 1JEUA 4IY5A 2HZKA 4IO4A 1H44A 2PMSA 4WEPA 1AMFA 2FA7A 3CI8A 3MZ9A 1XOCA 4H6DA 5KCJB 4FECA 1SYIA 3HHGA 1LLSA 1H76A 1T0KA 2R6GE 3PUZE 4XKNA 3VVFA 1LAXA 4IO2A 5CMBA 3GLBA 2ONRA 5AA4A 2F5XA 2Z8EA 3KFMA 2P2AA 2OK2A 3C31A 3DP6A 5HPQA 2FYIA 4ND9A 2QS2A 4QFNA 1TWYA 3G3JA 3UORA 2QL3A 4PFYA 1B7UA 5AA2D 1MY1A 4IO5A 3LSLA 4BDNA 1NFTA 3QXMA 3FZVA 2WKYA 3TDJA 2HEUA 1FQFA 2Z22A 3O66A 2G93A 2QMWA 3ECRA 2E1SA 4UA8A 1N0TA 2H98A 3PMXA 5CC2A 2XX9A 1I6BA 1LBBA 5I2KB 4Z7EA 4G77A 3C35A 4ECFA 3U93A 4R9GA 1D3KA 2HZLA 3A3UA 1QKBA 3FASA 4H67A 2HFBA 4H1XA 2F6PA 3PD8A 3KBRA 1LFIA 4I9DA 5I84A 2IEEA 1MQGA 3RN8A 4HW8A 4GF8A 2RC7A 1BKAA 4IGRA 1MPCA 3FATA 4IO7A 4PE5B 5F7VA 4RK9A 3T9VA 2GHBA 2HCAA 2XXPA 1NNPA 1QKAA 4C1UA 2O68A 4G68C 4GRKA 4LATA 1P1UA 2OBGA 4F3PA 1P1WA 2REJA 4FEDA 4LZ5A 2DVZA 3MW0A 3TCHA 1POY1 3PUWE 5ELVA 1TFAA 4EF1A 3USDA 2W7YA 3RGYA 1EU8A 1N04A 4ONYA 4F1VA 1GTKA 4H8IA 4KQPA 2O6AA 4QRZA 2UVJA 3LUYA 4ZE8A 2DXRA 3O2AA 5JTYB 2LAOA 3I3VA 4O3BA 1UIVA 3W9WA 1UTHA 2I58A 3T22A 5TPAA 1POTA 4GIZA 1KWHA 5I59A 4FEBA 1A55A 1VFDA 3KJTA 5H8FA 2RCAA 3FIRA 4R73A 4KCCA 1FCKA 3K1MA 4DDDA 4EQBA 2VGQA 2R9JA 3OD7A 3C32A 3PGFA 1EH3A 1H3DA 1VR5A 5AA4B 4ZS9A 1MDQA 3KSXA 3PV0E 3VV5A 4JSDA 4H5GA 2XXRA 1B46A 3VVEA 4EDPA 1ELJA 3EHUA 1JNFA 3FJGA 1B0LA 4GVOA 2Y7RA 4OFLA 1N3XA 1IUDA 4R9FA 3MVZA 1Y1ZA 1S9TA 3A3CA 2YJPA 4TLMB 1MY4A 1YCJA 3PPOA 1F9BA 3R7XA 3IOVA 4F22A 3S9LC 4DIGA 2DXYA 4LA9A 5DVIA 5FTIA 2UXAA 5K2YA 5J1DA 1LGBC 2RINA 2Y84A 3TCFA 1OVTA 1VSOA 2PYYA 4C1TA 2E0SA 2XXQA 4EXKA 4ZDMA 3DM0A 1NNKA 1R6ZA 2HXWA 1II5A 3PPNA 1A99A 1FW0A 3MPKA 1BP5A 3IAZA 2RC9A 1AL3A 2GHAA 4LUBA 3V83A 3FVGA 3CFZA 4OERA 2D21A 2Z8DA 3PU5A 4YB7A 4OXVA 2ABHA 1DTZA 4YB6A 5ITPA 1TT1A 4PFWA 1JW1A 3MZ1A 4U4SA 3RPWA 1I6AA 3KSJA 4ZEKA 2F7AA 2H5YA 4X1BA 3H6UA 1FTMA 1M5FA 3A09A 1A8FA 5I56A 1AIVA 3C36A 3VLUA 3LC8A 5ICQA 4BDRA 1AH5A 4G8NA 2Q2AA 1VFEA 2BJJX 1QUJA 2DOJA 3OEKA 1XHYA 3RLFE 4ELQA 1A40A 2I3WA 2F6GA 4KYEA 3V8XB 2OJTA 2O84X 3THIA 4M4GA 1UTHB 1B0HA 5TPAB 3T66A 3H7MA 1B5IA 5I59B 1SW1A 4OEVA 5KDTA 1N7WA 5L8DA 2ZNSA 2V84A 1USYE 5JEIA 1D4NA 5H8FB 4OVJA 4P0GA 2XD3A 4ISUA 4X48A 4F2QA 4GLIA 2DSFA 4XKRA 2CZLA 5IAIA 4GXAA 1MS7A 1MXVA 4I8CA 1IITA 1PBPA 1I6QA 1O7TA 3PPQA 2OWTA 3B7DA 1LBCA 4NE4A 1Q1KA 2PT2A 4NMYA 3MZBA 4AB5A 3Q25A 1QJMA 5HBCA 4RY1A 1OMPA 4H65A 2O7UA 2ESNA 1Y9UA 1B1XA 2I6EA 3SEYA 1IXGA 1NH7A 3ZKKA 1MM7A 2O69A 4U22A 1B5JA 3TMGA 1QULA 3VDFA 1P99A 2AL5A 3CRBA 4AB6A 1R9LA 4QHQA 4NF4A 5L9MA 2ONKE 4R72A 5TU0A 3R6UA 1Y1MA 3HN0A 2V25A 4QSCA 1B40A 4M1VA 5I2NB 1MXWA 2ALUA 4F29A 2XD2A 2Q88A 3ILTB 5JK4A 1USYH 3SEVA 2D3IA 3KZGA 3IOUA 4KHZE 3C33A 4NF8B 1PB7A 2VP1A 3VLWA 4F31B 5F1QA 3FXQA 4IB2A 3LSWA 4DXUA 3H06B 3PMWA 1WDNA 1IIWA 1ZIUA 4L17A 1TXFA 1WVJA 4K3FA 3ILUB 3HO7A 1P1NA 2XX7A 1S50A 4MH5A 3CR9A 2VHAA 5AE4A 3UP9A 3K6XA 3N6UA 4X1DA 1N84A 1XS5A 1SBPA 1FTOA 5I56B 4KD5A 3K0VA 1PEBA 3K6WA 3Q29A 4MBPA 4NWCA 1SW5A 3IO6A 4I1DA 2V3UA 4WKMA 3VFJA 5H8SA 2Q8JA 2XX8A 3TFLA 5FHOA 3AXFA 3DELB 1LFGA 3TTRA 1Z7NE 3FV2A 1Z7ME 2VOZA 3C4MA 1BTJA 2Y7PA 1LAHE 1GR2A 5ITOA 2Q2CA 3FUZA 4PETA 1CE2A 3CG3A 4N6PA 3C9HA 3N26A 3H4ZA 3TEPA 3KN7A 3OXNA 2REGA 4ZEFA 2HAUA 2A5SA 4ZEIA 3SEUA 5AA2B 1OQGA 1BLFA 4QFLA 4THIA 5I58B 2ZNUA 2GFEA 4LQ2A 4U21A 5CBRA 3TCGA 1MQJA 2VD2A 1DMBA 4F2OA 3VLVA 4HTGA 3IJOB 3VVDA 3FXUA 3GBAA 2OZZA 3KOTA 4Z0IA 4QFKA 2Y7WA 1Q35A 3N94A 3IJXB 2P1SA 2UYEA 3MQ9A 2Y7KA 2ZNTA 4H8JA 2DP8A 1MQIA 3S2VA 4EF2A 1MXUA 2THIA 3OO6A 4FAJA 3OENA 5DVFA 1OVBA 3FV1A 3ZS6A 2B3BA 3OSRA 1GV8A 3WAEA 4OENA 4BLAA 1O63A 1EZ9A 4XXUA 2NXOA 3SEWA 5LOMA 3TTLA 1M5DA 3U1OA 3V89B 1IXIA 4EQ9A 4BDLA 1M5CA 3L6GA 3SKPA 4R74A 3M3FA 3OO7A 1ZLQA 3HSTA 4F1YA 4KI0E 3QYTA 3VE1B 4QSEA 4DCYA 1DPEA 1SD3A 4G8HA 1EZPA 2PX1A 3QAXA 4JWXA 4X9TA 4LONB 5TP9A 2NOOA 4EXLA 1SW2A 1N76A 1AOVA 3K6VA 3QIMA 3PD9A 2ZYMA 3G7WA 5CBSA 2I0CA 1TFDA 3MP6A 1BIYA 2YPNA 3MUQA 2DE2A 4OEUA 4EUOA 4BDMA 5L9OA 2UVIA 1LSTA 3Q27A 2XXUA 1UQWA 2X26A 4H5FA 3CFLA 3EHSA 4QFOA 1JVXA 3U8QA 5EHMA 5BWJA 5ICTA 4XKQA 3FD3A 3CSGA 4IO6A 2ZYKA 2F35A 4WEDA 2UYFA 2NUVA 4F1UA 2I48A 2I4BA 4EQ7A 1XVXA 5H8HA 2DWHA 3BFTA 2RKMA 1XVYA 2DE4A 2F36A 4GD5A 4GQOA 1CB6A 1ZMGA 5CRYA 1L5TA 5I57A 1B9JA 2O7IA 2I3VA 1ANFA 1B51A 4YKKA 4JWOA 4PFTA 4U2RA 4OESA 5DYHA 1M5BA 4TLLB 2F34A 5CI5A 4KYDA 3T93B 4KCDA 1IQ7A 1YPNA 2F78A 4OZ9A 2O1LA 4G4PA 1MQHA 3IL1B 3QUJA 1RKMA 1NH8A 1URGA 2H9BA 1B32A 5HM4B 5B70A 1PDAA 1UTBA 2V3QA 1SI1A 3G3GA 4KYSA 4ZE9A 1JW5A 2VD3A 3H03A 4N07A 2XXYA 2QS3A 2X7QA 3H3GA 1Y4TA 5EYFA 2XXIA 2H99A 5DTBA 3HV1A 1JETA 1R1NA 4ZEBA 1OQHA 3TELA 2KLFA 2XXHA 4FIMA 3KG2A 4ZZEA 3D4GA 3FVOA 2ONSA 4H0WA 2Z23A 3RTFB 3K1NA 1PB8A 4NF5A 1D9YA 1Y3NA 3OO8A 2YLNA 3KJ7A 4NTLA 4GOTA 2HAVA 1B4ZA 4LQ5A 4F3GA 3ZSFA 1ZKBA 2UVGA 1QVSA 4R6HA 4U23A 3T9UA 1US4A 3CFXA 3HHFA 4NF6A 3RT8A 3U94A 5KCJA 4YZZA 4JBZA 1URSA 1Y20A 4F3BA 3TAJA 1MH3A 3PUYE 2Q9TA 1S7YA 2ZMBA 1B3HA 4Q30B 1R9QA 3UIFA 4OFOA 4XIGQ 3TQLA 1ATGA 5TP9B 3FVKA 3K02A 3JYRA 3LR1A 4MLQA 1LAFE 2ZYOA 4QF9A 3BFUA 4RA1A 2Y7IA 3TUSA 5DEXA 3G3IA 2OLBA 3RY3A 4YKIA 3G3KA 3EN3A 1SI0A 1NNTA 1ZBMA 4R2BA 4GFRA 1B3EA 3TPAA 4FATA 1WODA 1PB9A 2DWAA 1SW4A 3GXAA 3IOTA 4O3CA 4WXJA 3E9XA 2XXTA 3IR1A 5I2KA 3I5OA 1GVCA 2DQVA 4XKPA 2O1MA 3QUFA 3U72A 3T96B 3K4UA 3ODBA 5I57B 1OLAA 1RYXA 4R6YA 3W15C 3OMBA 4F39A 1JW4A 2DYXA 4IO3A 4LZ8A 4LZ7A 1MXXA 1PBQA 2I4CA 4F19A 5FTHA 5DVJA 3UN6A 3TTNA 2Q89A 2A5TA 4G8MA 3U92A 2RCBA 1JEVA 1NMUA 1UTBB 3MJNA 4BDQA 1FQBA 5A5XA 2CMOA 2DE3A 4MF3A 1IXHA 1A8EA 3SESA 1QW0A 3PPRA 3FXRA 3OO9A 3PMVA 3IOWA 1HSLA 1PC3A 1M5EA 3H6TA 2B65A 1MRPA 1MPDA 2DVCA 1Y3QA 4AQ4A 1FQCA 2ANJA 2ZYNA 1OIBA 5JTYA 2M8CA 2H4IA 3IK6B 1ZJLA 4ZEDA 4JXIA 4HCYA 4JSOA 3VXBA 5K2XA 2UVHA 3CIJA 2PVUA 3HPIA 3QSLA 5CMMA 3K1PA 1LB9A 1SQYA 3DP8A 4E0WA 4RJZA 4KPTA 4NF6B 3TQWA 1YTVA 4RNSA 1FTKA 1XT8A 3IX1A 1B4HA 5KZTA 3S9EA 3H6WA 2RF1A 1B7HA 1B7ZA 2PT1A 2DWJA 3O6HA 3D4CA 2F7BA 5KDTB 4ELOA 1FQEA 3LBSA 5DEXB 5H8NA 3OELA 1DOTA 4MLVA 3T9HB 4YU0A 5M2VA 1MY0A 3MBPA 3Q26A 2O51A 3TTMA 1IEJA 2OWSA 1B5HA 4DXBA 2I0BA 3H6VA 1LCTA 4POWA 3W9VA 1B3GA 1ZU0A 3O28A 3R26A 1RYOA 4YMBA 3JV9A 3K00A 4DLDA 3N6TA 3KEIA 1QUKA 3SEXA 3RUMA 5BUUA 2AL4A 3PUXE 3TYHA 2F7CA 2QSXA 2Z8FA 1FTLA 3F11A 4NF4B 3TKDA 1A54A 1FTJA 1NNFA 2A5TB 1B58A 1FQDA 1VE4A 1GGGA 1DSNA 3O29A 1MY2A 3SETA 4FE8A 4I62A 1I69A 1B05A 4G2ZA 4OFJA 1MY3A 4KFQA 4ELRA 3M8UA 4BDOA 1J1NA 4YKPA 5A5XB 2QJEA 1N3WA 3L6HA 4R6KA 3S9MC 4F3SA 1NKXA 1H43A 1MXZA 3O97A 1EZOA 1JVYA 4OHNA 1OLCA 5B7DA 3FJMA 3BBRA 4C0RA 4UACA 3JZJA 3IB1A 1XC1A 2IA4A 1LCFA 4POXA 2ZXTA 3SDFA 4LVQA 4RPNA 2GRVA 4U1ZA 3OEMA 4GL8A 2V93A 4NEDA 4OMBA 3MPLA 3PPPA 2G29A 1SVXB 3EHTA 3RQTA 1HSEA 3IO4A 5H8QA 3HCQA 1DTGA 3MVYA 4OWDA 3DLNA 2D5WA 2XHDA 4JB7A 3WAFA 3V5AA 3B6QA 2I49A 3QK6A 1MQDA 2XXWA 3E3KA 5L9SA 5H8NB 4U1OA 2F97A 4HS7A 4YAHX 5FHNA 4HCWA 4IGTA 4MFIA 4XTCQ 3O9PA 1DPPA 4YKJA 1SDXA 1A7LA 1MM6A 3ONMA 2QRYA 3MP1A 3S4UA 1O64A 3UK4A 3S9NC 4DZ1A 4Q5TA 4ZZAA 3KN8A 2DS9A 5I2NA 2HQ0A 3EQ1A 3OSQA 4DCXA 4GXSB 4FJPA 3LSXA 4U4XA 4RXLA 3TZAA 1B3FA 1HSJA 5CM6A 3G3FA 1MXYA 5AA1A 4F18A 4G68A 2RC8A 4QSDA 1LB8A 3K6UA 3MVXA 4NF8A 3EF7A 1NL5A 5IKBA 4GL0A 1Y4CA 3RTWB 2F8DA 5CMCA 3SERA 1LFHA 5DT6A 2NVUB 1Y3PA 3I6VA 3E4RA 4OTEA 3CSBA 3GZGA 2QMXA 4YICA 2QS4A 4R75A 3C34A 2QS1A 2OCUA 3KGCA 1MPBA 2NWJA 3EPEA 3OOAA 3T9XB 2FNCA 3DP4A 3FJ7A 4P11A 1JQFA 2X7PA 4YMAA 2XXVA 3RNNA 4OETA 3O6IA 2V3TA 4O3AA 3LSFB 3TTKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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