1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
4YKIA 3JYRA 4R2FA 2OWTA 5CC2A 5I56A 4G68B 2I0CA 2XXIA 1XS5A 2OK2A 4OMBA 1AMFA 1LB8A 4Q8RA 3CVGA 2F5XA 3FATA 4GD5A 4DIGA 1I6QA 4R73A 1Q35A 5L9MA 4JWOA 3T22A 4QSDA 2HAUA 2XXRA 2DQVA 2XXHA 3T66A 4Z7EA 2D3IA 3V8XB 4NTLA 5JTYB 1UQWA 1QJMA 3MZ1A 2QRYA 2R9JA 3U94A 3A09A 1R6ZA 3U72A 1JEVA 1H44A 1RKMA 2DWIA 1M5DA 1Y9UA 2VD2A 1LAXA 2IEEA 3I5OA 3MAMA 3T9HB 3TTNA 4EXKA 2PT2A 3RT8A 1LLSA 1NNPA 4RK2A 1A55A 2QL3A 2R71A 4FJPA 3QK6A 4I9DA 1NH7A 3VVEA 1IQ7A 3TQWA 1GTKA 1UTBA 3OO9A 5AA1A 4GQOA 3PUYE 2F78A 2ZNSA 1VSOA 3H6WA 4WEPA 5F7VA 4QFNA 3VLVA 1O63A 4IGTA 2E0SA 3KJTA 5CBRA 4N07A 2QMWA 4XKRA 1WODA 2DXRA 3FVGA 4QSEA 4DDDA 1H3DA 1MG1A 1IXIA 3FV1A 4F39A 5I57A 1MQJA 2YLNA 4TQUQ 1ZU0A 1B4ZA 4KHZE 2O7IA 1B7UA 4WKMA 3ZS6A 3K6UA 2ZYKA 4P11A 4DXBA 3RTFB 1Q1KA 4GL0A 5FHOA 4R75A 3HHGA 1QKAA 3O6HA 1PB7A 2P2AA 2UYFA 4KPTA 5DVIA 4G8HA 4C0RA 2AL5A 1A7LA 2QMXA 4H0WA 1QW0A 1N7XA 3Q28A 3R7XA 4BDLA 4ELQA 2I49A 5I58A 4K3FA 4ZEDA 5I59B 4F31B 3OO8A 1LAHE 1ZLQA 1MXYA 1N04A 1PBPA 3ILTB 1WVJA 2IA4A 3IORA 3K6WA 1USYH 4QFLA 5F1QA 5TP9B 4QSCA 1EZ9A 2XXWA 3ECRA 2Z22A 4NF5A 4PE5B 4Q0CA 5AA2D 3FUZA 4KYEA 3O2AA 2Y84A 2HZLA 1A54A 1AH5A 2XXPA 3LSFB 5CMCA 2ZXTA 1QULA 1TFDA 4YU0A 5H8FA 1RYXA 3IOUA 3HSTA 4OZ9A 1B58A 2O1MA 2F35A 2A5TA 4HCWA 4P0IA 1HSEA 2PYYA 3QUFA 2DWHA 5ELVA 1YPNA 2RC7A 1UTBB 4AB6A 1US4A 3KSJA 1P1WA 1D9VA 4NF8B 4F22A 2QS4A 4XKQA 5KZTA 3EHUA 3H4ZA 3K00A 4ZEKA 3MZ9A 3PD9A 1POY1 2ZNUA 1M5CA 1IITA 2UYEA 2DYXA 1JVXA 3MZBA 5BWJA 2P0SA 5JK4A 1US5A 3TEPA 2O68A 1YTVA 3HHFA 4G4PA 1MM6A 1EZPA 4EF2A 4F3BA 5KDTA 3BBRA 2RINA 2XXXA 5HM4B 5CI5A 1IZ1A 3MP6A 3PMVA 4OYVA 2V3QA 4OHNA 3UA8A 3FZVA 2P1SA 2RC9A 2DVZA 3W9WA 5I57B 3KGCA 3KN8A 3KN3A 2Z23A 3RTWB 1LGBC 3FVOA 1N0TA 5ICTA 1Y1ZA 4R6YA 4F1VA 1BIYA 1MQIA 3QIMA 2PBWA 4PFUA 5I2NA 1ZTYA 2GHBA 2DXYA 4JSDA 1FTLA 2H5YA 2W7YA 2UVGA 3CSGA 3FVKA 3S9EA 4FECA 2E1SA 3SESA 3SERA 5CRYA 3VFJA 4DXCA 3K6VA 3K1MA 4ESXA 2DOJA 1PDAA 4OQOA 1PEBA 1MXZA 2X26A 3E13X 3IAZA 4MF3A 1S9TA 3S2VA 4G8MA 4KYSA 4MBPA 5K2XA 1FTJA 2H9BA 2XD2A 2Q88A 3IO6A 3KSXA 4FEBA 4JDFA 3MJNA 4RNSA 5TU0A 5CMKA 3FASA 4IGRA 5CMMA 4ZECA 2THIA 3M8UA 2FNCA 5CMBA 3G3HA 3B6QA 1DPPA 3C32A 1Y3QA 3W15C 4EUOA 5FTIA 2PX1A 4GFRA 3OOAA 3FJGA 3WAEA 1DOTA 3V5AA 3C9HA 1P1UA 2LAOA 4MLVA 4POXA 4KCDA 3JZJA 4FEDA 4H1XA 4ZE9A 2Q8JA 1AOVA 5I59A 1SQYA 1MPCA 1O7TA 3Q29A 2YPNA 4HTGA 5DT6A 2Q2CA 3TUSA 3V83A 3H3GA 1EU8A 1QVSA 2HZKA 2VD3A 3IB1A 2F97A 3IR1A 3KOSA 3C31A 3MPLA 1NMUA 4RA1A 3BFUA 2O84X 3MVXA 3FXRA 3G7WA 1A8EA 3KBRA 5CBSA 5A5XA 2AIXA 2PT1A 3C33A 3ODBA 4XIGQ 1OQGA 4E0XA 2I3WA 3UK4A 2F7CA 3MP1A 4IO3A 2QSXA 1MPDA 3KEIA 5DYHA 1BP5A 2YJPA 4RXLA 4KFQA 2HEUA 2GRVA 2UVJA 3IX1A 1IXGA 1MRPA 1MQGA 4H6DA 4R9GA 4YKPA 1A99A 5JEIA 1SVXB 4MFIA 3R26A 4F19A 5AA2B 4G8NA 1LB9A 2H99A 1SYIA 1B5HA 1GV8A 3FD3A 3T9UA 1XVXA 3IK6B 4LP2B 1SW5A 1B2HA 1NL5A 2ABHA 1JEUA 2ONKE 3RNNA 4NF4A 3K4UA 4FE8A 3H06B 2OBGA 3EF7A 3N26A 1OLCA 3PPQA 1B3EA 4LZ7A 4QHQA 1B40A 3KZGA 3T9XB 2HQ0A 1Y3NA 1ZKBA 3IOVA 1GGGA 4L17A 3PUZE 4HS7A 1MY0A 4PP0A 3FGSA 1PC3A 2D5WA 1B52A 2I6EA 3MP8A 4JB7A 4JXIA 4ZS9A 3TDJA 5DEXA 3VVFA 3B6TA 1SD3A 2OJTA 3PD8A 3O66A 4JBZA 4OERA 4TLMB 4IO5A 3GLBA 4PETA 4YKJA 5B70A 3TQLA 4F18A 1B46A 1UTHA 4OXVA 3H7MA 2F36A 1NFTA 3TTKA 1FQEA 2GH9A 4U21A 2GHAA 1D3KA 1FQCA 3MVWA 5H8NB 1NNFA 3ZSFA 2DSFA 1AL3A 1B7HA 2VHAA 2XXVA 5I2KB 3OSQA 5KCJB 1B0LA 3KJ7A 1LFIA 3N6TA 5H8QB 3IB2A 3CFLA 4U22A 1D4NA 4F2OA 4QFKA 5FHMA 1MS7A 5AE4A 1B3FA 2FA7A 4KYDA 1FTOA 4H5GA 5FTHA 4GWOA 5KCJA 4OESA 5H8NA 4G68A 3MVZA 2HCAA 1N84A 2ZYOA 4OFOA 3PPOA 2I48A 3BKIB 3RUMA 3H6UA 5AA3A 4FORA 4ELOA 2Y7IA 3OSRA 5L8DA 1LFHA 2Z8EA 4YMBA 2O1LA 3KFMA 1SDXA 2Q9TA 2M8CA 3G3IA 2NVUB 3EN3A 3ONMA 2O6AA 1PB9A 3PV0E 4F1UA 1P99A 3U93A 5AA2A 3Q27A 4R2BA 2F7BA 3A3CA 1LBCA 3PPRA 3CIJA 5H8SA 3U1OA 2I4CA 1L5TA 3HV1A 3VLWA 3RQTA 1OVBA 2Z8DA 5DVJA 1HSLA 3E9XA 3QXMA 4UACA 4H5FA 3K1NA 3N94A 4H67A 4E0WA 5ITPA 3M3LA 4F3PA 1VFEA 1MPBA 3K0VA 1TFAA 1MXXA 1ZIUA 3OELA 1FQDA 3Q26A 5DVFA 3G3KA 3N6UA 5CM6A 4F1YA 1AIVA 4MLQA 1IXCA 1BLFA 2RF1A 3I3VA 2NOOA 4XKPA 4F3GA 2OZZA 4H8JA 5ITOA 1YCJA 3E4RA 2REJA 5AA4B 4NF6A 1QKBA 3SDFA 1MM7A 1SW1A 2UVHA 3TKDA 3RY3A 2B65A 3KOTA 3FJ7A 5HBCA 3SEWA 4PQJA 1OVTA 1CE2A 1NNTA 1HSJA 2Z8FA 3V89B 5LOMA 3S9MC 3OEKA 3TPAA 4LUBA 4THIA 2PMSA 4NE4A 1SW4A 4QRZA 2X7QA 4GIZA 1OMPA 3DP4A 2DS9A 3O6IA 1FTKA 4GRKA 2V84A 4H65A 4ZEIA 2Q89A 3T9VA 3VLUA 3SETA 2OLBA 3MPKA 3OD7A 3UORA 1MQHA 1DTZA 4EQ9A 3K02A 1XHYA 1I6BA 1JVYA 1ZJLA 2DP8A 2G29A 1P1QA 4KD5A 1Y20A 4NF6B 3LC8A 3TCHA 1MH3A 3B6WA 4NMYA 1H45A 3PUWE 2ANJA 3ILUB 1Y4CA 3T96B 1JW4A 2CMOA 1FCKA 2QPQA 2CZLA 3GZGA 4RPOA 4RY1A 5L9SA 2Q2AA 4OENA 4OEUA 1TT1A 4BLAA 1XVYA 4KR5A 4YMAA 4EQ7A 4PFTA 3TODA 2XX9A 2NUVA 4ZEBA 3PUXE 5I84A 3K1PA 1FW0A 4RJZA 1PB8A 3CFZA 4PFYA 5DEXB 2I3VA 1S50A 4ISUA 2NWJA 4R74A 1ANFA 3H03A 3LSXA 2H25A 2XXQA 1Z7ME 3G3JA 4ECFA 1NH8A 2DVCA 4N13A 3IOTA 3ZKKA 4YKKA 1P1OA 4YB6A 4AQ4A 1B51A 3RPWA 4BDQA 2F6PA 1MQDA 3GBAA 2Y7KA 3A3UA 3C35A 3O9PA 3R6UA 3T93B 4EF1A 2X7PA 2RCAA 5EHSA 3UIFA 4X1DA 4I62A 3U92A 4BDNA 4X48A 3SEUA 1IIWA 1DSNA 1WDNA 2VOZA 1O64A 2HXWA 5H8HB 1IXHA 3IOWA 2RKMA 1MDP1 4G2ZA 3VXBA 5M2VA 1MDQA 3S9NC 2RCBA 5KDTB 2DWAA 2V3TA 1MXVA 4NWCA 2O7UA 4U23A 3LBSA 3L6HA 1PBQA 3O97A 3OO6A 4FIMA 4M4GA 5J1DA 3SEYA 4BDMA 2ZYNA 1ZMGA 3LSLA 3GBBA 4DCYA 1URGA 3FV2A 5ISUA 2F6GA 3MW0A 1IUDA 4U1OA 5H8HA 3C4MA 2HAVA 2V93A 4LONB 4LQ5A 3PMWA 4DXUA 2VGQA 5ICQA 4M1VA 1B3HA 3RLFE 1JETA 2FYIA 1XC1A 1UTHB 1TXFA 2UXAA 3LUYA 1ATGA 1JQFA 1XT8A 3UGWA 1MXUA 4IO7A 5B7DA 3W9VA 3HO7A 4NF4B 1M5EA 2WKYA 1BKAA 1UIUA 4O3CA 1B1XA 4I1DA 1SI0A 2V25A 3CFXA 1DMBA 2UVIA 3FIRA 1R1NA 3MVYA 4JWXA 3THIA 1LAGE 4BDRA 4OFLA 1B5JA 4KI0E 4JWYA 1GR2A 1B1HA 1QUIA 3C36A 3G3GA 3JV9A 2QJEA 3EQ1A 4GXSB 4IO2A 2DE4A 4U4SA 5EYFA 4C1UA 2XXYA 4OTEA 3KN7A 1FQFA 1YAEA 1MXWA 1OQHA 1Y1MA 3CR9A 1UIVA 4IO6A 1OLAA 2F34A 3QSLA 4IY6A 5TP9A 5AA4A 1I69A 4EXLA 3EHTA 3QAXA 3WAFA 1R9LA 1FQBA 1S7YA 1N3XA 2AYSA 2F8DA 2PVUA 2XX8A 3AXFA 3F11A 1URSA 3N5LA 5TPAB 4HW8A 4F3SA 1NNKA 2I58A 2NXOA 3PUVE 4NF8A 1FQAA 3USDA 1EH3A 5DTBA 3U8QA 4EQBA 2Y7PA 1B5IA 1ZBMA 4OEVA 4ZE8A 5IAIA 4XKNA 4YAHX 1F9BA 1Y4TA 1LAFE 2F7AA 3LSWA 4G68C 3H6TA 4ZZAA 5TPAA 3TTLA 1A8FA 1A40A 4RK9A 5L9OA 1Z7NE 4OVJA 4EDPA 3MWBA 1TWYA 2QS1A 3DP6A 4RPNA 3QUJA 3E3KA 5A5XB 2V3UA 1URDA 1MY3A 3OEMA 3IO4A 4DCXA 2B3BA 1LCFA 3DM0A 5HPQA 2ESNA 4R6HA 3GXAA 1B05A 1MH4A 1RYOA 2I0BA 4KCCA 4NEDA 4ZDMA 2H4IA 3VXCA 2DE3A 4H8IA 5EHMA 1QUJA 3PPPA 3UP9A 4YZZA 2XHDA 4R9FA 4RYAA 2AL4A 4ELRA 3CRBA 1ELJA 3MC2A 3O28A 4IB2A 2Y7WA 3FXUA 4ESWA 5IKBA 1MY1A 3OENA 3RT6B 3BFTA 4C1TA 2ZNTA 3C34A 3SEXA 3CG3A 3HPIA 4ELPA 3RGYA 2DWJA 1Y3PA 1QUKA 2I4BA 2Y7RA 2O51A 4TOZA 1H76A 1LSTA 2KLFA 2O69A 2ALUA 5H8QA 4U4XA 2RC8A 4DE8A 5I2KA 2VP1A 1OIBA 3I6VA 1D9YA 4P0GA 3TTMA 5K2YA 3KG2A 3MUQA 3DP8A 4U1ZA 3S4UA 4LQ2A 4IY5A 4R6KA 4GL8A 4O3AA 4LA9A 3IL1B 5JTYA 2XX7A 4R72A 1B32A 2R6GE 2ONSA 3P7IA 3PU5A 3K6XA 4F29A 3TYHA 1VR5A 2REGA 3CSBA 3RN8A 3TZAA 1T0KA 1P1NA 1B3GA 2B3FA 4POWA 4GF8A 2HFBA 3SKPA 3HCQA 3CI8A 2ZMBA 4KQPA 3S9LC 4O3BA 5I2NB 1B4HA 1M5BA 3IJOB 4Q5TA 4MH5A 4ZZEA 3TMGA 5I56B 1II5A 3OMBA 2OCUA 4JSOA 4YICA 4OFJA 5FHNA 3HN0A 4GVOA 3TCFA 4GXAA 4DZ1A 4ZEFA 1LFGA 1VE4A 3IJXB 3CG1A 1SYHA 3M3FA 4NWDA 3B7DA 4DLDA 5BUUA 3TTRA 2XD3A 1XOCA 3K01A 3EPEA 1LCTA 1M5FA 4OWDA 4FAJA 4PFWA 3G3FA 4LZ5A 2DE2A 4G77A 1MY4A 3VE1B 4TLLB 1N7WA 4QF9A 1KWHA 1JW1A 3D4CA 3LR1A 3K2DA 4QFOA 1SBPA 1B6HA 4U2RA 4F2QA 3DLNA 4YB7A 1BTJA 3IB0A 2A5SA 1H43A 3MBPA 3OO7A 4LZ8A 3PPNA 4N6PA 4WXJA 4XXUA 2A5TB 5I58B 1R9QA 1VFDA 3TELA 1B7ZA 2ZYMA 4LATA 5H8FB 3UN6A 1B0HA 2D21A 1CB6A 1J1NA 3L6GA 3OXNA 1POTA 2OWSA 4IO4A 1FTMA 1N3WA 2ONRA 3FVNA 3MQ9A 3PMXA 2XXTA 4UA8A 4BDOA 1MY2A 4FATA 1JNFA 2QS2A 3TCGA 3O6GA 4NF5B 3TAJA 4I8CA 4AB5A 2XXUA 1B9JA 3ZKLA 1NKXA 4YB5A 1SW2A 2QS3A 2BJJX 4Q30B 2GFEA 2G93A 3QYTA 4WEDA 4QFPA 3D4GA 4X9TA 1IEJA 3EHSA 4XTCQ 1LBBA 3Q25A 4OETA 3VV5A 1EZOA 3M3KA 1B3LA 3TFLA 3FJMA 1DTGA 3FXQA 3DELB 3VDFA 1JW5A 3H6VA 4GLIA 4GOTA 4ONYA 4Z0IA 1GVCA 1SI1A 3SEVA 3O29A 3VVDA 4X1BA 4LVQA 1N76A 3PGFA 1USYE 4HCYA 1DPEA 4ND9A 1I6AA 2H98A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4OESA 4OFOA 3H6UA 4FORA 5ET7A 5L8DA 4YMBA 2M8CA 4NG7A 2NVUB 3ONMA 3PV0E 2F3BA 2OWZA 4F1UA 1P99A 4JVCA 3KBZA 3HV1A 3VLWA 1OVBA 4MNPA 3QXMA 3K1NA 3N94A 4H67A 4E0WA 1TFAA 1MXXA 3Q26A 5DVFA 4F1YA 4O94A 5AA4B 3CHGA 2UVHA 1HSJA 2Z8FA 2PMSA 1SW4A 4QRZA 2X7QA 1FPIA 3DP4A 2V84A 3UORA 2VT5A 1MQHA 4EQ9A 1ZJLA 1Y20A 3B6WA 3QMFA 4NMYA 1JW4A 4RPOA 2CZLA 5L9SA 1TT1A 4EQ7A 2XX9A 1PB8A 1S50A 4ECFA 4N13A 4AQ4A 4YB6A 2R8TA 2F6PA 4HE0A 3GBAA 3A3UA 3T93B 5EHSA 4BDNA 4I62A 3U92A 3SEUA 1XI6A 2HXWA 5M2VA 3S9NC 2RCBA 5IZZA 4NWCA 4O8MA 1FPFA 3LBSA 5J1DA 4BDMA 1NUXA 4GWZA 4JVDA 3IFCA 3GBBA 3FV2A 2F6GA 1IUDA 5H8HA 4LQ5A 3PMWA 4DXUA 2VGQA 4M1VA 3RLFE 4PTKA 2FYIA 4P3LA 5EQ7A 1UIUA 4I1DA 4PFIA 3FIRA 4KI0E 1B1HA 1QUIA 3JV9A 1LBVA 1FBFA 1FQFA 1MXWA 1NI9A 5TP9A 4EXLA 3WAFA 2F8DA 2HPGA 2PVUA 3F11A 1URSA 2NXOA 3PUVE 5EQAA 4NF8A 3USDA 5IAIA 4YAHX 3TTLA 3H6TA 1A8FA 4RK9A 5L9OA 4EDPA 3MWBA 3QUJA 2MKZA 2WYKA 1MY3A 3IO4A 2ESNA 4R6HA 1RYOA 1LBZA 4KCCA 3VXCA 2KQZA 2DE3A 4H8IA 5EHMA 1QUJA 3PPPA 4IB2A 3OENA 3RT6B 2ZNTA 3CG3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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