1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords glutamate receptor 2
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
1UTHA 4U23A 1CE2A 4Z7EA 4E0WA 5I84A 2I6EA 5JTYA 3G7WA 1EZ9A 4GRKA 4PFWA 3LR1A 2QSXA 2ZXTA 3H03A 5I59A 3N6TA 3WAEA 1ZIUA 2HAUA 1GV8A 3T9VA 3MJNA 4KYEA 3KGCA 2Q8JA 3PPRA 5H8FB 2QL3A 3MP6A 2H9BA 1D4NA 2E1SA 3FD3A 5DYHA 1B5JA 4DXCA 4P11A 4KCCA 3T9HB 1B5IA 1GTKA 3S2VA 4PFTA 5B7DA 1OLCA 2B3FA 4H5FA 3N26A 3C35A 4TOZA 5ITPA 1ZJLA 4G2ZA 3PUXE 2UVIA 2XHDA 1KWHA 1URGA 4M1VA 3VV5A 1MDP1 4OXVA 4OWDA 3E3KA 4U4XA 2B65A 3IJXB 1MPDA 3JYRA 4YAHX 3TDJA 4RYAA 3FXQA 1NFTA 1ATGA 4OQOA 3OD7A 5AE4A 4G8NA 2RC9A 3EHSA 2RCAA 3H6TA 5BWJA 4OFJA 3TTNA 5HBCA 4FORA 3MQ9A 3PUZE 2F5XA 2BJJX 3I6VA 1N04A 1B3EA 3IR1A 1EZOA 5H8HA 2I3VA 2V84A 4O3BA 3QUFA 3RQTA 3KEIA 4FE8A 3W15C 4NF8B 1JEUA 4ONYA 3V89B 3KN3A 4XIGQ 3EQ1A 4YMBA 2A5TB 3K6XA 4P0IA 5ICQA 3MAMA 3SETA 2AIXA 1M5EA 4I62A 4H8IA 4WEDA 1M5FA 4THIA 1TXFA 4DCXA 4IO2A 4ESWA 2IA4A 2RF1A 3SKPA 1WODA 3MUQA 2FA7A 4R6KA 4FIMA 1AH5A 3PD9A 4BDRA 1A99A 1UIVA 3S9LC 5L9SA 4F1VA 3BFUA 4RXLA 1TWYA 1DTGA 1I6BA 2O51A 2QS1A 3MP1A 1JQFA 4F19A 3U8QA 4G68A 4RJZA 3AXFA 1Y3QA 1BP5A 2DQVA 1DTZA 3EN3A 5CMBA 2Z8FA 1PEBA 1EH3A 1B52A 4O3AA 3M3LA 5A5XB 1NH7A 1SW4A 3D4CA 1ELJA 5TPAB 1MQHA 1UQWA 3PMWA 3EPEA 1B9JA 5I58A 3UORA 3MBPA 1Y3NA 2NUVA 2OBGA 4GOTA 1A40A 4LZ5A 1QJMA 2ZYNA 3IOWA 2PYYA 3EF7A 1Q1KA 4NWDA 2I0BA 3K02A 3T9UA 1I69A 2QRYA 3RTWB 1XVXA 4MLVA 5I2NA 2OZZA 3S4UA 3QK6A 1OQGA 5IAIA 1B32A 1LCTA 4KR5A 1USYH 5J1DA 1PB9A 1FW0A 3CSBA 3USDA 2LAOA 1MPCA 2HQ0A 1N7XA 4HS7A 2NVUB 1ZKBA 2Y7WA 1Z7ME 3BKIB 1JW5A 2Y7RA 3Q27A 4FECA 3K01A 2O1MA 3HV1A 4HW8A 1A54A 1MH3A 1FCKA 2Q89A 3FXUA 4JWOA 1AMFA 3T9XB 4XTCQ 2V3UA 1L5TA 2Q88A 5CI5A 1PBQA 2XXIA 4KYDA 3PUVE 1LAGE 1LGBC 4IO5A 1BIYA 3UIFA 4N13A 3IB0A 1POTA 1OQHA 5K2XA 5ITOA 3TPAA 2QS3A 2ZNSA 4R75A 3FASA 2DOJA 3KOTA 1XOCA 4U21A 3HO7A 3U92A 5FTHA 1OLAA 2OCUA 1HSEA 4L17A 3EHTA 4MH5A 2DP8A 1TT1A 1NNPA 1A7LA 2AL5A 2DE3A 2F7BA 1TFDA 5FHMA 4F39A 4LUBA 2H25A 1URSA 3IX1A 5AA2B 1IXIA 3L6GA 4X1BA 5JEIA 2D5WA 1QUIA 1M5DA 3CG3A 4KI0E 1H76A 4POWA 4YU0A 1LFIA 3RT6B 4JWXA 4IGRA 3TTMA 4R74A 1B7ZA 3FV2A 2O7IA 4IO3A 1MG1A 2GHBA 4X9TA 3TMGA 4OFLA 4YMAA 2ZNTA 5AA4A 2I0CA 1B05A 4QSDA 4YICA 1GVCA 1QKBA 2Z8EA 3DM0A 1P1NA 4G68C 1D9YA 5JK4A 2PX1A 3S9EA 1SDXA 1FTKA 3TFLA 2YLNA 3Q25A 5AA2D 4ND9A 2ZYMA 5CBRA 4E0XA 2HZKA 4G8HA 4F1UA 4ZEBA 4G8MA 2FYIA 3F11A 1UTBA 4ZEFA 3TTRA 2NWJA 5KCJB 2GFEA 4QFKA 2ONKE 1B2HA 5CMMA 4F3SA 1Y20A 3MPKA 5TP9B 4FEBA 3FJGA 4LA9A 3JV9A 1NKXA 2R71A 4I8CA 4ZZAA 3CSGA 2Z22A 1IXGA 1SW5A 3CFLA 2DWIA 3LSWA 3Q28A 4IGTA 1MY1A 5F1QA 2REGA 3SESA 3KSJA 4F29A 2E0SA 2KLFA 1S9TA 1UTHB 3V83A 4XKPA 1Y4TA 4Q30B 1EU8A 1IZ1A 4NWCA 5JTYB 2XXXA 4OVJA 3O6GA 5I59B 1N7WA 2XXWA 4RK2A 2F35A 3KJTA 1ZMGA 2PT2A 2W7YA 1GGGA 3IL1B 3PPOA 1MXWA 4N6PA 3ONMA 3E4RA 1RYOA 4PFUA 1US4A 1OIBA 3RTFB 1IQ7A 1LSTA 1EZPA 4EUOA 4R6YA 2I48A 1ANFA 4LQ2A 2OLBA 4PQJA 3E9XA 2O6AA 3H06B 2R9JA 3RPWA 1P1UA 4YB6A 3TKDA 2F8DA 3K2DA 1XS5A 3IORA 3TCFA 1Y1MA 1SI1A 3B6TA 1US5A 3OSQA 4AQ4A 4OERA 4F3PA 3DP6A 4IY5A 3O97A 2ABHA 2UXAA 4TLLB 1YCJA 4NMYA 3K00A 3MZ1A 1ZLQA 3JZJA 3PMXA 4ZEIA 4EXLA 4OYVA 1POY1 1B3FA 1B40A 1OVTA 2XXQA 5DVFA 4F1YA 1BKAA 4NF6A 3H4ZA 3KFMA 1B0LA 1SW2A 2XXUA 3MZBA 5H8HB 3ILUB 2RC8A 4ZECA 5BUUA 4ZS9A 4OETA 3LSFB 5DT6A 4FATA 2DVZA 3V5AA 4GXAA 3IK6B 2AL4A 3SEXA 1NNKA 3S9MC 4GL0A 4JDFA 1HSJA 4NF4A 2QMWA 1SD3A 4U1ZA 3RUMA 1QKAA 4QSEA 2H4IA 4R6HA 3TQWA 3QAXA 2PT1A 3M3FA 4GLIA 3OXNA 2F6PA 5K2YA 1FTJA 3U1OA 2F97A 4WEPA 2HAVA 4H65A 1YPNA 2DWHA 1B4ZA 2HEUA 3RGYA 1QUKA 4LP2B 1B46A 3OO7A 2A5TA 4C0RA 4BDOA 2XXRA 3R26A 4OZ9A 1PB8A 2I58A 4EF2A 3I5OA 1F9BA 3CVGA 3FVOA 2PMSA 2XD2A 1AIVA 1DPEA 4G68B 3KOSA 3C32A 3M8UA 3GBBA 3GBAA 3T66A 4NF5A 4EDPA 1D3KA 1ZBMA 1FQBA 3Q26A 2AYSA 1Y9UA 2ONSA 3R7XA 3O66A 4OEVA 2Z23A 1I6QA 2F34A 3OOAA 3FVGA 3SEWA 1JW4A 4BDQA 2D3IA 3O29A 2GHAA 3MVZA 3FVNA 3TODA 2M8CA 5LOMA 1FQDA 4KD5A 5I58B 4GFRA 3ZS6A 1MXVA 1SBPA 3LUYA 4UA8A 1MS7A 4LQ5A 3RNNA 2ZYKA 5DEXB 3OO8A 5I56A 4LZ8A 3GZGA 5I2KA 3MP8A 5I2NB 1B3GA 3K6WA 1Q35A 1LFHA 3FJMA 2QS4A 4GVOA 2Q2CA 4ELRA 1B1XA 3H6WA 1N84A 4HCYA 3MWBA 3C33A 3IB2A 1MY3A 2PBWA 4MFIA 3K6VA 5FHNA 2Y7PA 2NOOA 4QF9A 4GWOA 1JW1A 1R9QA 1VE4A 4DIGA 2VP1A 1VR5A 3FVKA 2NXOA 3C9HA 4XKNA 3OO9A 5H8QA 4ECFA 1FTMA 4OHNA 1DPPA 3PPQA 2UVHA 3THIA 3VLVA 5KDTA 3KN7A 4WKMA 1MQIA 1T0KA 3O2AA 3TCGA 1M5CA 4HCWA 4XKQA 2VGQA 3RY3A 1R9LA 2H98A 1CB6A 1JETA 5I57A 3OO6A 1NNTA 4ISUA 1XT8A 3LBSA 4YB7A 2ZMBA 2V93A 5HM4B 1B7HA 4EXKA 2P0SA 4HTGA 2R6GE 1FQFA 3QYTA 1JNFA 5EHMA 4OTEA 3OMBA 1IITA 4KFQA 1IXCA 4ELOA 2H5YA 3UP9A 4IO6A 1AOVA 4R9FA 2RKMA 2REJA 2V25A 4QFLA 2UVJA 2O7UA 1FTLA 3PGFA 4GF8A 4NTLA 3DP4A 4UACA 3G3HA 2VD2A 3FXRA 3IJOB 2XX7A 4H8JA 1AL3A 1JVXA 4PFYA 1MQJA 1Y4CA 1VFEA 5H8NA 4R72A 4RPOA 1OVBA 1P1QA 1A8FA 1QUJA 1J1NA 4H6DA 2YJPA 2QMXA 4O3CA 3TUSA 4GQOA 4PP0A 1A8EA 3FIRA 3GLBA 1MXZA 3IO6A 4FEDA 1B4HA 1P1WA 1S50A 2DWAA 1MQDA 3EHUA 3ODBA 2P1SA 3MZ9A 1LB8A 4AB5A 3PD8A 4G4PA 3UK4A 3W9WA 1UTBB 3PMVA 3CI8A 1B5HA 4R2BA 2FNCA 4DXBA 3FV1A 4U22A 3MVWA 3VLWA 1LLSA 3HHGA 1MY2A 3TAJA 1LAFE 3VXCA 5AA1A 4TLMB 4ESXA 3TZAA 1QULA 1SW1A 3K1PA 3SDFA 3O28A 4LZ7A 4RNSA 5CM6A 1LAXA 3RLFE 2PVUA 2XXHA 1JEVA 1NL5A 1LB9A 4F18A 1RKMA 2DYXA 2QS2A 4IO4A 5KZTA 3C4MA 3S9NC 3C34A 5EYFA 4YKKA 1QVSA 5HPQA 4JXIA 3DELB 4DZ1A 3O6IA 3G3KA 1Y1ZA 4POXA 4XXUA 4Q5TA 4U4SA 2X7PA 1DMBA 3WAFA 4JSDA 4DE8A 2DWJA 4NEDA 2CZLA 4YKPA 5AA3A 2DXRA 5M2VA 1N3XA 4QFOA 1ZTYA 4OENA 1SVXB 2RCBA 1H43A 2UYFA 1SI0A 3H6VA 1RYXA 5ELVA 1ZU0A 3PPNA 4H67A 4PE5B 4GXSB 3VE1B 1B6HA 3TYHA 2F78A 3H7MA 4ELPA 3BBRA 3G3JA 4RK9A 4IY6A 2V3QA 3N5LA 3HPIA 2XXVA 2F7CA 4FAJA 5H8FA 3KBRA 4C1TA 5L9MA 2XXYA 1R6ZA 1IEJA 1LBBA 3QSLA 4MLQA 1MXXA 1O63A 5CC2A 1MPBA 2I3WA 4K3FA 2O1LA 1MXUA 2HFBA 2ONRA 4FJPA 5H8SA 1LAHE 1PDAA 1B1HA 1URDA 4QFNA 4LONB 5EHSA 4NF6B 2F6GA 4DCYA 4NE4A 3TELA 1Z7NE 4EQBA 4QHQA 3BFTA 4H5GA 1A55A 1MXYA 1R1NA 5L8DA 5CBSA 3PPPA 2THIA 3N6UA 4N07A 1TFAA 1IIWA 3MVYA 4JB7A 1MRPA 3H6UA 4NF4B 4YZZA 3KSXA 4WXJA 3K0VA 2O68A 2O69A 3IOVA 1N0TA 3O9PA 2QJEA 1P99A 2ZYOA 3B6WA 3TTLA 2YPNA 2CMOA 2DE2A 4IB2A 4U1OA 4M4GA 4ELQA 2ANJA 4RY1A 3IOTA 3RN8A 3DP8A 4NF8A 4P0GA 1B58A 1PBPA 4R9GA 3CG1A 3PUWE 2Y84A 1D9VA 4YB5A 3H3GA 3ZSFA 4MBPA 5DVIA 4R73A 3B6QA 2HXWA 4DDDA 1MY0A 4KYSA 3FUZA 3G3FA 4NF5B 3QXMA 3K4UA 3CIJA 2DE4A 1S7YA 2B3BA 3T96B 4KHZE 4U2RA 1IXHA 4QFPA 2VHAA 4F2OA 1XC1A 4F22A 1B3HA 2A5SA 3A3UA 3T93B 1NNFA 5ICTA 4F3BA 4G77A 3TEPA 1BLFA 3HSTA 3DLNA 4Z0IA 4BDMA 4GL8A 3QIMA 1N3WA 3U72A 3U93A 1P1OA 3FATA 3LSXA 3KN8A 5CMCA 5A5XA 4I9DA 3N94A 5I56B 1XVYA 4XKRA 5I2KB 2RINA 2WKYA 3PUYE 3FGSA 4OESA 1DOTA 1XHYA 2P2AA 4F3GA 4JWYA 1FQEA 5TPAA 4BLAA 1FTOA 4F31B 3OENA 3PV0E 4LATA 3E13X 3L6HA 2X26A 1N76A 4LVQA 3G3IA 1NMUA 4R2FA 3A09A 1MY4A 3KG2A 4ZDMA 5DEXA 3KJ7A 2DXYA 3GXAA 4AB6A 2UYEA 5DTBA 2Y7IA 4F2QA 4ZZEA 1M5BA 2OWSA 2O84X 3IOUA 5L9OA 1QW0A 3M3KA 1I6AA 2OJTA 4TQUQ 3P7IA 5H8QB 2XXPA 3MC2A 3CFXA 3UA8A 3MPLA 2XD3A 5KDTB 3VFJA 1H3DA 2GH9A 1B0HA 3SEUA 2XX9A 4OFOA 1YTVA 3ZKLA 3K1MA 5I57B 4ZE9A 1HSLA 4H1XA 1II5A 3RT8A 4C1UA 4YKJA 5TU0A 1FQAA 1VSOA 4Q8RA 3SERA 3MW0A 2G93A 4EQ7A 2VOZA 3V8XB 3K1NA 4EQ9A 3I3VA 5F7VA 1MDQA 4YKIA 2I4CA 2I49A 1MM6A 1FQCA 5IKBA 5FHOA 2UVGA 2Z8DA 2Y7KA 3UGWA 3PU5A 3QUJA 4QRZA 4I1DA 1DSNA 1Y3PA 3VDFA 2F7AA 1MH4A 3A3CA 3IB1A 2DS9A 3SEYA 3VVFA 1SQYA 1OMPA 2HZLA 5FTIA 3TQLA 3OEMA 3C31A 1WDNA 3MVXA 2F36A 1PC3A 1H44A 5CRYA 1JVYA 1VFDA 4JBZA 3OSRA 2V3TA 5H8NB 1LCFA 2QPQA 2GRVA 3B7DA 4ZE8A 3ECRA 3TCHA 3HHFA 3HN0A 1NH8A 3IAZA 2G29A 5AA4B 5AA2A 4QSCA 1USYE 3CFZA 1O64A 3SEVA 5ISUA 1H45A 3OEKA 1SYIA 2XX8A 1UIUA 2ALUA 2VD3A 2DSFA 3W9VA 2H99A 4IO7A 3VLUA 2RC7A 3OELA 3T22A 2IEEA 1MM7A 2XXTA 3UN6A 4JSOA 3K6UA 4KCDA 5DVJA 5B70A 3O6HA 1O7TA 2D21A 1WVJA 4X1DA 3LSLA 2OK2A 2Q9TA 4BDLA 1BTJA 3IO4A 3CRBA 4BDNA 2X7QA 1B3LA 2OWTA 1B7UA 3TTKA 4X48A 4MF3A 3Q29A 2ZNUA 4RA1A 3KZGA 3CR9A 1LFGA 3R6UA 3FJ7A 5KCJA 1SYHA 2HCAA 3ILTB 3U94A 1LBCA 4KQPA 2ESNA 5TP9A 4RPNA 2DVCA 1MQGA 3LC8A 3HCQA 4OEUA 1B51A 3VVDA 1YAEA 4KPTA 2Q2AA 4ZEKA 3ZKKA 3VXBA 2I4BA 4ZEDA 5CMKA 4DXUA 1PB7A 4Q0CA 3VVEA 4PETA 3D4GA 3FZVA 4EF1A 4GIZA 3G3GA 3C36A 1IUDA 4GD5A 4DLDA 1GR2A 4OMBA 4H0WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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