1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
2FNCA 3K4UA 2Q2AA 4PFWA 1DMBA 3B6TA 3FVNA 2NVUB 3U94A 1B7ZA 3TELA 1Y1MA 4GIZA 3RLFE 1SVXB 4F1YA 1AIVA 3N94A 2RF1A 4TQUQ 4Q5TA 1MG1A 4HTGA 3FZVA 2DWHA 1N84A 4POXA 1EU8A 1P1OA 1S7YA 1LLSA 1PB7A 1NFTA 1UTBB 3M3LA 3O2AA 1Q35A 4I8CA 4R9FA 2Y84A 2DWAA 4H0WA 2OK2A 4LZ5A 3T66A 5I57B 2QMXA 4XKQA 2REGA 1B3LA 1JETA 3C35A 1B6HA 2H9BA 3ILUB 3O6IA 1EZPA 1SI1A 3G3JA 1QUIA 1MQGA 4IO7A 1DTGA 5KZTA 3IR1A 3OMBA 4H8JA 2H98A 3OEKA 1NMUA 1MQHA 5FTIA 1ZLQA 3IJXB 4FE8A 5I56A 2V84A 1MQIA 1UTHA 3O97A 3D4CA 3D4GA 4JWOA 1O7TA 1VSOA 5FHMA 5K2XA 2F7CA 4N13A 4BDRA 4G68C 2HAVA 1A7LA 1MRPA 1B51A 4OESA 3C4MA 1B58A 4G8MA 4YKKA 2DS9A 4GVOA 5H8QA 4ESWA 1BKAA 3OSRA 1WDNA 5HPQA 3B6QA 1Y1ZA 4X1BA 2HZLA 4ZEDA 1FTKA 4IO2A 1FQAA 4F31B 1PEBA 3V89B 1LB9A 2GH9A 2GRVA 2PT2A 1Y20A 3E13X 2O1LA 4R72A 4DZ1A 3VDFA 3MZ9A 3R6UA 1LCTA 3IB0A 1GTKA 3QSLA 4WEDA 3K0VA 2AL4A 2XXYA 3UP9A 4UACA 4X1DA 1UIVA 3OEMA 4ELPA 1NH7A 4MH5A 2B3FA 3PU5A 3TKDA 4E0XA 3K6XA 1O63A 2Y7IA 4YAHX 5CRYA 1BP5A 1D9YA 1RKMA 1DPPA 3CFLA 1LAHE 1OVBA 2ONRA 1LFHA 3G3IA 3KFMA 4RY1A 1WVJA 4IGTA 3TTNA 3OO8A 1XVYA 2H5YA 4R2BA 1DSNA 3H03A 4EF2A 2UVHA 2F5XA 1FTMA 2DXYA 2QS2A 1WODA 3TTMA 1FQDA 4I1DA 3T9XB 2XX7A 4NF6A 1QKAA 3PUXE 1SYIA 5KDTB 4LA9A 2XXQA 3TTLA 2UVGA 2VD3A 4ZEFA 1MQJA 1SW5A 3MZBA 5TP9B 4THIA 2A5TB 2Y7RA 1SBPA 3KBRA 3K01A 3KJ7A 5ITOA 5LOMA 5TPAA 4LQ5A 3JZJA 2QSXA 4F1VA 4G8HA 2I4CA 1A8EA 3MPLA 4EQBA 3C33A 1SD3A 3G3GA 4DDDA 4OZ9A 4TLLB 1B0LA 3FVKA 3GBAA 5H8FA 2NXOA 3GZGA 2PVUA 4YMAA 2Y7WA 2DWJA 2I3WA 4U21A 1UQWA 4QFOA 3ODBA 4YZZA 2W7YA 5L9OA 4KPTA 1FTLA 1EZOA 1QW0A 3OENA 2O68A 1QVSA 1UIUA 3Q28A 4MLQA 3W9WA 2QPQA 3ZSFA 1H76A 1GV8A 3LUYA 3VFJA 1B46A 4F19A 4KFQA 4G68A 1URSA 4XIGQ 3FASA 1II5A 4LONB 3FATA 4GL8A 4P11A 4MFIA 1Y4TA 2ANJA 5L9MA 4GXAA 2F36A 1B3FA 3S2VA 1B0HA 2XXTA 3K02A 3DM0A 5J1DA 2Q9TA 4EQ9A 1AMFA 1ANFA 1Z7ME 2OWTA 4EDPA 2O7IA 1S50A 4Z7EA 2O1MA 3UK4A 4H6DA 4KI0E 1HSLA 3MPKA 3CG1A 4NF5B 4ESXA 3KN3A 3RT8A 3IB2A 2H99A 2V25A 1F9BA 4QFLA 1LSTA 5HBCA 4OEVA 3CG3A 1Q1KA 1LBCA 4DXBA 3TCHA 5H8SA 3Q29A 2VOZA 3O66A 1N3XA 1FW0A 4ZE9A 5BUUA 4OWDA 2DQVA 3FJGA 3K6UA 3KEIA 3SDFA 3T22A 4O3AA 1TT1A 3KGCA 2F7BA 1M5CA 1M5DA 1ELJA 4GWOA 4XKNA 5I2KB 3USDA 4FECA 3C9HA 3A09A 3A3UA 3MWBA 1LAXA 1OLAA 4JWXA 2D3IA 3FVOA 1IXGA 3IOUA 5I58B 3M8UA 4HS7A 3KG2A 1R9LA 3T9VA 2A5SA 3K2DA 3QXMA 1B32A 3TCFA 4YU0A 3VLWA 4KQPA 3MVWA 1YPNA 3PV0E 3LBSA 3O29A 4RNSA 2E0SA 2Z8DA 4H5FA 1MDQA 5I59B 4AB6A 1ZKBA 4YKJA 1IXCA 1MXZA 1CE2A 1UTBA 2DVZA 4ELOA 1D9VA 5AE4A 1CB6A 1MQDA 3KN8A 2I58A 3OSQA 3K6VA 1OVTA 4EUOA 5IKBA 5CM6A 2PYYA 3VLVA 2V3UA 4FJPA 5DEXB 3IO4A 1IIWA 1QUKA 1SI0A 4AQ4A 2I49A 2XXIA 4M4GA 1NKXA 1PB8A 4H1XA 4U4XA 1ZU0A 2G93A 1QULA 3LSWA 4TLMB 2ABHA 3G3KA 4F22A 4RK9A 4KYSA 2PMSA 3M3KA 3MAMA 4O3CA 2R6GE 3PPOA 3Q27A 3KSXA 3OXNA 4R75A 5AA1A 2YLNA 3TFLA 3BFUA 4F3BA 3K00A 2UVJA 5H8NB 3KOTA 4P0GA 3U72A 1QKBA 5AA2D 3H6TA 5F7VA 2F78A 3F11A 3FD3A 3K1PA 4PE5B 4GD5A 3CIJA 1SW4A 1TFDA 4KCDA 3EHTA 3A3CA 1B1HA 3E4RA 3G3HA 3N5LA 1MPDA 3RGYA 3TPAA 4I62A 2Q2CA 1ZIUA 2Q89A 3TUSA 3BFTA 3PUWE 3K6WA 2RKMA 1M5EA 4AB5A 3MBPA 1BIYA 1JEVA 1R1NA 1FTOA 4ISUA 2I4BA 5KCJA 2I0BA 4H8IA 2Y7KA 3CSBA 1PB9A 3Q26A 4IO6A 4P0IA 4ND9A 1N0TA 3QIMA 3DP4A 4OXVA 4XXUA 3RY3A 4X9TA 4IB2A 2AL5A 3SESA 1M5BA 4ELRA 2QJEA 4FATA 3ILTB 3JV9A 3EF7A 2D21A 1FTJA 4HCYA 1ZJLA 3DP6A 3SERA 3IX1A 1FQCA 3TMGA 2DSFA 4K3FA 4RYAA 1FCKA 2D5WA 2X7PA 3MVZA 1DOTA 1SDXA 2PBWA 1N7WA 4I9DA 4NWCA 5AA4B 5CMCA 1FQFA 2UVIA 3MJNA 3CSGA 2F8DA 2CMOA 3L6GA 3MP8A 1B5JA 5K2YA 3SKPA 3ONMA 5CBSA 1POY1 3UA8A 5I2NA 2I48A 5FTHA 4IO4A 2DWIA 2OWSA 4NWDA 4DXUA 3T9HB 4F1UA 3V5AA 2E1SA 1IUDA 1MY3A 5KDTA 3HN0A 3HPIA 3RN8A 3SETA 1IZ1A 3N26A 1B7UA 5CMMA 2X7QA 2QL3A 1B9JA 2NOOA 3RUMA 2A5TA 3T96B 3TODA 4EXLA 4NE4A 4ELQA 1UTHB 1B3GA 3TQWA 4RK2A 4BDMA 3UN6A 1USYH 5JTYA 4Z0IA 4NEDA 1MDP1 4R6HA 1NNKA 2YPNA 3HV1A 1Y3QA 3DLNA 5H8QB 1MY4A 2FYIA 4FIMA 4H65A 2O6AA 4RPNA 3QUJA 3GXAA 1D4NA 1USYE 4RXLA 3L6HA 3IO6A 4H67A 2VP1A 3ZS6A 3IOTA 2H25A 1A54A 4WXJA 1LAFE 5A5XB 1TFAA 3KSJA 2R9JA 4PP0A 3K1MA 4HCWA 4EQ7A 1MPBA 4YKIA 4GL0A 4RJZA 2DE4A 4U4SA 3RNNA 3KJTA 1PBQA 3TCGA 4QFKA 2OBGA 4EF1A 1ZTYA 1LFGA 3FXQA 3PUYE 4XTCQ 4MLVA 4ONYA 2Q88A 3G3FA 3IL1B 2LAOA 3EQ1A 2VD2A 3H7MA 1B4ZA 1MY1A 3Q25A 3T9UA 1H43A 4G77A 4OQOA 1MXXA 3FV1A 4BDNA 3QK6A 2V3TA 3RTFB 4F3PA 4Q0CA 4C0RA 4NF5A 3N6UA 4ZE8A 2RINA 5DVIA 1XOCA 3UIFA 3VVFA 1MXVA 3CI8A 1POTA 1URDA 4IO3A 4M1VA 2I0CA 4QFNA 3FIRA 2KLFA 2PX1A 3S9MC 3SEYA 4R6KA 3MVYA 1FQBA 2I3VA 4JSOA 2V3QA 1HSJA 1SYHA 2X26A 3GBBA 1P99A 5I2KA 4O3BA 1B1XA 4OVJA 1RYOA 1DTZA 4L17A 1MXUA 1BTJA 1TXFA 1VFDA 4LZ8A 1T0KA 3PUVE 1Y9UA 5I58A 3SEVA 1YTVA 2NUVA 4QRZA 4ECFA 2I6EA 1XT8A 4QSEA 1URGA 1EZ9A 3OELA 1XC1A 3BBRA 1JW1A 4F3SA 2HFBA 1A55A 2DP8A 4G2ZA 4QHQA 2RC7A 4OMBA 4NF4B 1B5IA 1SW2A 3UORA 3O28A 1LB8A 2UYEA 3KZGA 5DEXA 3U1OA 4C1UA 5DVJA 3HCQA 4WKMA 3E3KA 5H8HA 4KR5A 3VV5A 4F39A 1Y4CA 4FEDA 1AL3A 1PBPA 2IEEA 1I6AA 3FGSA 3IAZA 1P1WA 4YKPA 2XXVA 2Y7PA 2ZYMA 4ZZAA 4IY6A 2HEUA 3ZKKA 2GHAA 2OCUA 5ITPA 4IGRA 3QUFA 4KD5A 4R2FA 1MH4A 4PFYA 5H8NA 3T93B 3I5OA 4QSCA 2DYXA 3MQ9A 3UGWA 1VR5A 4U22A 1I6QA 4YB7A 2DOJA 1KWHA 2XD2A 4ZECA 3V8XB 4PFTA 3R26A 3PPQA 4U1ZA 5TU0A 4GQOA 5I57A 2CZLA 1IXHA 2B65A 3HSTA 4U2RA 3PMWA 3OO6A 1LAGE 5BWJA 3S9EA 2HXWA 3MZ1A 2Z23A 3LSXA 1OLCA 3MVXA 4GXSB 1OMPA 4YB5A 5B7DA 3MC2A 2GHBA 4OFLA 2ZXTA 2F35A 3FV2A 1NNTA 2DE2A 3DP8A 1Z7NE 5JEIA 4NF8B 3FJ7A 1A99A 1US5A 2G29A 4MBPA 3I3VA 1IQ7A 3S9LC 4JSDA 5L9SA 2Z8FA 4XKRA 1GR2A 3CR9A 4JDFA 5DYHA 3MW0A 2ZNTA 2XXPA 3H6UA 2F97A 4GLIA 4QSDA 1AOVA 4OEUA 1JVYA 1LBBA 3TTRA 3TAJA 3ECRA 3B6WA 4BLAA 2ONSA 5AA2B 2XXRA 3PPNA 1MXWA 5DTBA 5AA4A 2RC9A 2O51A 1L5TA 2ZMBA 2XXXA 4POWA 3S9NC 1HSEA 3PD9A 5DT6A 4DCXA 2OZZA 3U93A 2ZNUA 1M5FA 2PT1A 1H44A 3LR1A 2UXAA 4XKPA 2YJPA 4F2QA 3R7XA 3TEPA 3OOAA 1MY2A 4OENA 4YMBA 1SQYA 3QYTA 3G7WA 1AH5A 3MP6A 1XVXA 1MXYA 2THIA 3WAFA 2O7UA 3ZKLA 2XXWA 2O69A 4LVQA 3FUZA 3RTWB 1FQEA 1XHYA 4F2OA 2Q8JA 3W15C 4KCCA 1JQFA 5DVFA 3TQLA 3IK6B 4N6PA 2ONKE 1JEUA 2P0SA 3GLBA 3HHGA 5CC2A 1ZBMA 1B7HA 3K1NA 4OHNA 3TDJA 4RPOA 4OETA 2QS1A 2NWJA 1N04A 1YAEA 1DPEA 5ISUA 1J1NA 2QS3A 3PMVA 3FXRA 1H3DA 4U23A 3HHFA 2M8CA 1TWYA 1MM7A 5IAIA 5A5XA 4DLDA 1Y3PA 2QMWA 2GFEA 3CRBA 1OQHA 5KCJB 4ZEBA 3OD7A 3WAEA 2BJJX 4YICA 5TP9A 5B70A 1QJMA 1IXIA 1US4A 4R74A 4GOTA 1XS5A 2H4IA 2P2AA 1B05A 1N3WA 5F1QA 5I56B 4Q8RA 4R6YA 4GRKA 3U92A 3RT6B 5M2VA 4PQJA 3O9PA 3PMXA 4R73A 1B3EA 4G8NA 3PGFA 3LC8A 1N7XA 3N6TA 3AXFA 1JNFA 3SEUA 4BDLA 5CMBA 3P7IA 2QS4A 5I2NB 3VE1B 2VHAA 3IORA 4NMYA 2RCAA 4ZDMA 1JW5A 3H06B 3BKIB 1YCJA 3KOSA 3DELB 4QF9A 3SEXA 1I69A 4ZEKA 4PETA 3C31A 2RCBA 1B4HA 4BDQA 1LCFA 4ZS9A 2ZYOA 2HZKA 2O84X 3W9VA 1MY0A 5EHSA 3VVDA 4DE8A 5ICQA 4G4PA 4IO5A 4R9GA 3TYHA 1ZMGA 3IOWA 2ALUA 5I84A 3KN7A 5CI5A 4F29A 3C32A 4OERA 3MP1A 1Y3NA 4KYEA 4LATA 4LZ7A 4LUBA 4PFUA 1H45A 3OO9A 5ICTA 4UA8A 4TOZA 2QRYA 2B3BA 2AIXA 4GF8A 5JTYB 1B5HA 3S4UA 2FA7A 5CBRA 4EXKA 1GVCA 2P1SA 4F18A 1B52A 2ZNSA 2UYFA 4NF6B 1A8FA 4F3GA 2XX8A 4JXIA 4QFPA 1JVXA 2R71A 2DVCA 2ZYNA 3V83A 4DIGA 2XXHA 4JWYA 3M3FA 1NNFA 4NF4A 2ZYKA 4LP2B 5EYFA 3VVEA 3E9XA 3H6WA 1PDAA 3OO7A 4OYVA 5TPAB 1I6BA 5L8DA 2XX9A 1QUJA 3IB1A 1IEJA 3IJOB 1R6ZA 3PPRA 2V93A 4RA1A 4X48A 4HW8A 2OJTA 5H8FB 1D3KA 4KYDA 3H6VA 2F6PA 1PC3A 4C1TA 1MM6A 4BDOA 2HAUA 4GFRA 4OTEA 4WEPA 2HQ0A 3THIA 1ATGA 1MPCA 4LQ2A 5FHOA 3FJMA 4IY5A 4E0WA 5I59A 2DXRA 3O6HA 4Q30B 2F7AA 3MUQA 5FHNA 3EPEA 5JK4A 4JB7A 1LFIA 1B3HA 2XXUA 2REJA 4FEBA 4KHZE 5HM4B 1P1QA 2XD3A 5AA3A 3VLUA 2VGQA 1RYXA 1GGGA 1NL5A 3PD8A 1B2HA 4G68B 4DCYA 1NH8A 1VE4A 4N07A 3VXCA 3QAXA 5EHMA 3C36A 2IA4A 4MF3A 3JYRA 3CFXA 4OFOA 3SEWA 1MS7A 2F6GA 1N76A 1BLFA 1NNPA 4YB6A 1EH3A 4NF8A 3CVGA 2RC8A 5ELVA 1R9QA 3H4ZA 3TTKA 2Z8EA 2DE3A 3EHSA 3TZAA 4NTLA 1VFEA 2AYSA 1MH3A 4ZZEA 2Z22A 1OQGA 1S9TA 4FORA 3VXBA 2OLBA 4DXCA 3PUZE 4U1OA 3FVGA 5AA2A 1P1UA 2ESNA 3FXUA 1OIBA 3O6GA 3PPPA 4ZEIA 3HO7A 5CMKA 1LGBC 1SW1A 4H5GA 1O64A 3LSFB 1JW4A 3H3GA 3CFZA 3EN3A 3B7DA 3EHUA 3U8QA 3C34A 1B40A 2F34A 4OFJA 3LSLA 2WKYA 3RPWA 2XHDA 4JBZA 1IITA 2HCAA 5H8HB 3IOVA 1A40A 1P1NA 4FAJA 3RQTA 3I6VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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