1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
2Q89A 3OO8A 3O66A 2ZXTA 5LOMA 2I6EA 3DP8A 3O6HA 2Z22A 4BLAA 3BKIB 2DWJA 1BP5A 2F97A 1VSOA 5F7VA 1ZTYA 4MLVA 4R6HA 3V5AA 5CRYA 2F78A 1SI1A 2V25A 1Y3PA 4QSEA 4U1ZA 3SEUA 3WAFA 2OBGA 4AQ4A 1POTA 4I9DA 4G8NA 4NF4A 3GLBA 5IKBA 4MFIA 3H3GA 4GRKA 2XX9A 3VXCA 1I69A 4X1BA 4THIA 1IQ7A 4R2BA 1PBPA 2E0SA 1LB8A 4C0RA 4DXBA 3JYRA 4GLIA 3ECRA 2LAOA 1UQWA 2RINA 1IEJA 3VE1B 4PFYA 2O7UA 3PMVA 2QPQA 1SW4A 3CFZA 4IO7A 3JZJA 5EHSA 4NF8A 3HCQA 4DZ1A 1R9QA 2DYXA 3EHUA 5ISUA 3T66A 4ZZAA 4F31B 3R6UA 3LSFB 1MQIA 1KWHA 2AIXA 2O84X 3AXFA 4GF8A 4YKJA 3HV1A 2H99A 3T9VA 3EF7A 3C4MA 1P1OA 1XOCA 2NWJA 1UIUA 4G4PA 5H8NB 2UVJA 3Q26A 1B9JA 1M5CA 4Z7EA 3E4RA 1S50A 3PD8A 4DXUA 1IXGA 1M5FA 1B3EA 3D4CA 4ELOA 2H5YA 1DPPA 5I56A 4IY6A 1N76A 1Q35A 3K6XA 4C1TA 4KPTA 1EU8A 4IO4A 2B3BA 1Y4TA 1ZMGA 4HS7A 1MRPA 1UTBA 4ZEDA 1O7TA 3MQ9A 1AOVA 1Z7ME 2DWHA 1S7YA 5L8DA 2F34A 1IZ1A 2F8DA 2G93A 4KYSA 1A99A 1H43A 3W15C 2XXTA 3CG1A 1N7XA 2Q8JA 3E9XA 4H6DA 1URGA 3FUZA 2H9BA 3I3VA 3OELA 4KFQA 1OVBA 4ESWA 4H5GA 1MY4A 2I4BA 3RUMA 1B7UA 4GOTA 5ITOA 2DE2A 1B1XA 5ICQA 1B6HA 4ELRA 3QSLA 3FD3A 3ZKKA 4F3SA 2XXHA 1GGGA 1N7WA 1IITA 4DLDA 4LUBA 1QUKA 1DTGA 1JQFA 5L9SA 4NTLA 4F1VA 3CI8A 3SEVA 4OESA 1FCKA 1NL5A 4JSDA 3H03A 4EF1A 2ZYOA 1IUDA 3MAMA 1ZJLA 2ONKE 3IJXB 3SESA 4IY5A 1GTKA 5AA2D 4LA9A 4L17A 3KN7A 4O3AA 3A09A 1GV8A 3CIJA 1XC1A 4GIZA 3G3IA 3CFLA 3ILUB 4BDNA 2AL4A 3U72A 1GVCA 4Q0CA 2F7BA 3C33A 2HQ0A 5HPQA 4R2FA 1MS7A 5H8FB 1NNPA 1Q1KA 4N6PA 1FTKA 3SEXA 4XKNA 1UTHB 2P0SA 1JEUA 3FIRA 2QJEA 4FEDA 3VV5A 2XX7A 3RY3A 4C1UA 5FTIA 2I49A 4R6YA 2RCAA 2Q2AA 3G3GA 1B3GA 4F18A 1TT1A 3P7IA 1HSJA 3FATA 1O63A 5BWJA 2DVZA 2FNCA 1SW1A 3MP6A 1JW1A 1B5IA 2RC8A 1B2HA 4XTCQ 1CB6A 1I6BA 3E3KA 4YAHX 2XHDA 1EZOA 1Y4CA 3MC2A 5I58B 2QMXA 3IR1A 1MM6A 3OSQA 4HCWA 3OO9A 2OZZA 3I6VA 1A8EA 1A54A 3S9EA 1QUIA 4ELQA 2VP1A 3S2VA 1I6AA 1MDQA 4F1YA 4UACA 2O7IA 2XXXA 3TQLA 3Q25A 3TAJA 4F19A 4MH5A 3OD7A 3UK4A 1URSA 4IGTA 4G2ZA 3U92A 4YB7A 2Z8FA 3OOAA 1D9VA 2DE4A 2H98A 1L5TA 2Q2CA 3M3KA 1D3KA 3PUXE 1IXCA 3IOVA 4O3BA 1MQHA 3TUSA 3KEIA 3TZAA 5H8NA 3OXNA 3RT8A 2I3VA 3TQWA 4KHZE 4F39A 1CE2A 3G3JA 3VLUA 5KCJB 3TTLA 2R6GE 3VXBA 3CSGA 4R75A 4LQ2A 3N26A 2Z23A 4N07A 3N6TA 3FVKA 3KSJA 3V83A 3TKDA 3O6IA 1JEVA 1P1UA 1JW4A 3B6WA 3K1PA 1MDP1 1SDXA 3G3KA 3FJ7A 1H44A 3C36A 1NMUA 3L6HA 2ONRA 1QUJA 4NF5B 3H6TA 1A8FA 1VFEA 5H8HB 1B3LA 3KSXA 3EPEA 3JV9A 3BFTA 3C32A 2HEUA 2QL3A 4M1VA 5CMBA 4QFNA 2A5TB 3DLNA 4WKMA 4PETA 4WEDA 3MVZA 4QHQA 1JETA 4F3BA 3S9NC 5I2NB 4XKRA 3DP6A 3CG3A 2I3WA 1NH7A 3KJTA 4RNSA 1O64A 1B7ZA 1MY3A 1SW5A 3UA8A 4EXKA 2PMSA 1YPNA 2F6GA 3IL1B 4G8HA 1OQHA 2XXQA 3MVYA 2D21A 3KOTA 2DVCA 2GRVA 1SQYA 2HAUA 1US5A 4KYDA 5DTBA 2QMWA 1USYH 1PEBA 4R9FA 4H8IA 4POWA 1B3FA 5EYFA 4BDQA 1NNKA 2R71A 4POXA 1FQDA 2PX1A 3TFLA 4PP0A 2GFEA 3VVFA 4RY1A 3FASA 3MP1A 4P11A 4TLLB 4F3PA 2F6PA 4N13A 3VDFA 2V3TA 1A40A 3FJGA 4PQJA 3SKPA 1QKBA 1RKMA 5AA3A 2YPNA 2ZYNA 5B7DA 1SVXB 3H06B 2GHBA 4BDMA 1B05A 1EZ9A 3PPOA 4ONYA 2ZNUA 5DVIA 5H8QB 3TDJA 5H8FA 4GXAA 2F36A 4GVOA 5TPAB 4U4SA 4OYVA 2VGQA 3USDA 2HFBA 5M2VA 1UTHA 2X7PA 5AA4B 5I59A 1MH3A 3RNNA 4JWOA 3DELB 3KZGA 3CRBA 4GL0A 3PUZE 3G7WA 4QSCA 5CI5A 3UORA 2QS1A 3IJOB 3EQ1A 3OENA 4EQ9A 2I4CA 2V3UA 1I6QA 1MXWA 4U22A 1TFAA 4IO3A 2WKYA 5KDTB 5L9OA 1S9TA 1N0TA 1M5DA 2I58A 1BLFA 1DOTA 4YKKA 2I0BA 4GWOA 2V84A 3RTWB 3O2AA 1B1HA 2G29A 2PVUA 4Q8RA 4QFPA 5I58A 3LSXA 1QJMA 4FECA 5AE4A 3KBRA 1QULA 1OVTA 2XXVA 1FTOA 4YKIA 4Q5TA 2DSFA 4EQBA 4YICA 1FTLA 1JNFA 4E0XA 3K2DA 3TELA 4E0WA 3M3LA 3IAZA 3W9VA 1AMFA 4OEVA 1N84A 3T9HB 3C34A 2O69A 4HCYA 4ZEBA 3IORA 3V8XB 3G3HA 4FIMA 4R74A 4ISUA 5HM4B 4WXJA 1VFDA 4F22A 4RPNA 3B6QA 4KQPA 2XXUA 3B7DA 1LCFA 1PBQA 1FTMA 5KCJA 2ZYMA 1NNTA 2XXRA 1MY2A 3QUJA 3K02A 2VHAA 1BKAA 4G77A 1IIWA 1SBPA 3PPPA 1B46A 1SI0A 4NF5A 2X26A 5ICTA 5H8HA 4M4GA 5CBSA 5K2YA 2PT1A 3FV2A 2HZKA 2ONSA 3QXMA 2XXPA 2REJA 3DP4A 4AB5A 3IB0A 5DYHA 1J1NA 1MXZA 2CMOA 2A5TA 1N04A 3FJMA 4F2QA 4F2OA 4RYAA 5CMCA 4YB5A 4G8MA 4KR5A 4OFJA 5I2NA 3WAEA 4YKPA 1XS5A 5CBRA 3RQTA 1SW2A 4TOZA 1B4ZA 2HAVA 1B5JA 3C35A 3MW0A 3ZKLA 4QFKA 4ZDMA 3E13X 3I5OA 3UN6A 1P1WA 2ZMBA 3PV0E 2FA7A 1OQGA 1LAHE 2M8CA 4I62A 1MPCA 4FEBA 5DVJA 1D4NA 4YZZA 3O6GA 4ZZEA 3S9MC 5DEXB 4NWCA 4ELPA 3MP8A 1ZIUA 2PBWA 4IO2A 3CFXA 3TPAA 3PMXA 4OWDA 3SERA 4XKQA 3K00A 1WVJA 1NH8A 1LAXA 4H67A 2OWSA 3THIA 4ZEIA 4XIGQ 4LVQA 4ZE8A 2I0CA 5J1DA 4NEDA 4U23A 5H8QA 3KOSA 3EHTA 5TPAA 1HSEA 3TMGA 1B0LA 4FE8A 3FVOA 2ZNSA 5B70A 3TYHA 4KCDA 4JB7A 3FVNA 3ZS6A 5AA4A 3IX1A 1LFIA 4LP2B 3O29A 3N6UA 3S4UA 4PE5B 1XT8A 1MPDA 4PFWA 4FATA 3EN3A 2OJTA 4DDDA 1WDNA 3OMBA 4ZS9A 3LSWA 5KDTA 5FTHA 1YCJA 1QVSA 1JVXA 4O3CA 1B58A 1FQFA 4ZEKA 1Y9UA 3HPIA 4OHNA 3H6WA 1IXHA 5CMMA 3V89B 2DXRA 2PT2A 4EF2A 1PB7A 1OIBA 1ZBMA 2D3IA 3KGCA 2Y7IA 1POY1 3QUFA 2ESNA 3TTMA 4H0WA 1B0HA 1LFHA 4LATA 3UIFA 4IB2A 4RK9A 4NF6B 2W7YA 4OETA 2I48A 3KJ7A 2FYIA 1LBCA 2RF1A 3SEWA 3R26A 2H25A 4GQOA 1MXXA 3CSBA 3IOTA 3IO6A 1ATGA 3ZSFA 4P0GA 3IO4A 2DWIA 2F5XA 3MUQA 1B7HA 1XHYA 2UVHA 4G68B 1H3DA 3VVEA 3KN3A 2A5SA 2NXOA 3MJNA 5I84A 1F9BA 4R73A 5DT6A 4BDOA 5JK4A 3KG2A 2HCAA 1FQEA 3VVDA 1YTVA 1T0KA 4F1UA 3RGYA 4ESXA 2YJPA 2ALUA 1US4A 1M5BA 3OO6A 5CM6A 1MY1A 2DXYA 2KLFA 2THIA 3N5LA 1FQCA 1USYE 3ONMA 3K1MA 3PUVE 4YMAA 4G68C 1EZPA 2Y7KA 3PU5A 3HSTA 1DTZA 3QAXA 2Y84A 1JW5A 3K6UA 1BIYA 3MBPA 1URDA 3OEKA 3T22A 3Q29A 3RTFB 2UVGA 1LGBC 3IOWA 3MPKA 2O1LA 2QS4A 3KN8A 1MQJA 2GH9A 1N3XA 2OLBA 4IGRA 3FXRA 4R72A 3G3FA 1MH4A 2OCUA 2RCBA 3BFUA 2DP8A 5AA2B 3O9PA 2AYSA 4LZ8A 5HBCA 4EXLA 1AIVA 3QK6A 4YU0A 3RPWA 2QS2A 1FW0A 2Q88A 5A5XB 4F29A 1MQDA 2AL5A 3CR9A 4LZ5A 2OWTA 5KZTA 3QYTA 3MZBA 2UVIA 4NWDA 1Y3NA 3H6UA 4BDLA 4ZEFA 1LSTA 5TP9B 4X9TA 1Y3QA 5DVFA 4K3FA 3GBAA 3M3FA 5DEXA 3BBRA 4RA1A 4NE4A 4QSDA 1MY0A 4DCYA 2Y7PA 3K0VA 3K6WA 2F7AA 4X48A 3Q28A 1FQAA 3SEYA 4HTGA 4KCCA 5L9MA 3HO7A 4TLMB 3MVWA 4XKPA 3K6VA 4JWYA 1B3HA 1NKXA 4JXIA 1XVXA 4LONB 4OZ9A 3C31A 3MZ9A 1IXIA 3L6GA 5I2KB 1A55A 2QSXA 1Y20A 3GBBA 2Y7WA 3K1NA 2UYFA 1ZLQA 1P1NA 1R9LA 1Y1MA 2REGA 4LZ7A 1P99A 4OTEA 4BDRA 1FQBA 1EH3A 4EDPA 4F3GA 4YMBA 5IAIA 1OLAA 2O68A 4ND9A 2NUVA 3UGWA 5FHMA 1PB9A 3C9HA 1Z7NE 4U2RA 4TQUQ 1R6ZA 1Y1ZA 2DQVA 3MWBA 2QS3A 4JSOA 1B51A 1LBBA 4MLQA 3T9XB 4EQ7A 1YAEA 4QFLA 4NF6A 2ABHA 3TTNA 3SETA 1B52A 4DE8A 3TTKA 4DCXA 1B40A 4WEPA 4OFLA 4U21A 3U1OA 5AA1A 3KFMA 4OXVA 1ZU0A 1II5A 1RYXA 4JBZA 4G68A 1B5HA 3FVGA 3MVXA 3CVGA 4I1DA 4IO6A 3U8QA 5BUUA 5CMKA 4QRZA 3T9UA 2B65A 3O28A 1HSLA 4XXUA 2VD3A 1GR2A 4RPOA 3D4GA 3ODBA 2D5WA 2VD2A 3B6TA 3LR1A 4U4XA 1UIVA 3OSRA 3MPLA 3DM0A 4H1XA 4PFTA 1AL3A 1H45A 3U94A 2DWAA 5JTYB 3A3CA 3FV1A 1VR5A 2DE3A 5I57B 1OLCA 4YB6A 2YLNA 3A3UA 1ZKBA 1ELJA 3UP9A 1MXYA 3M8UA 1H76A 4RJZA 3PPQA 3RN8A 4U1OA 4OQOA 2V3QA 4GFRA 2ZNTA 3GXAA 1SYHA 3QIMA 2O51A 4QF9A 2F35A 3PMWA 4GL8A 1MPBA 4JWXA 2V93A 2DOJA 1JVYA 3U93A 4GXSB 1DSNA 1VE4A 2ANJA 3O97A 2X7QA 2P1SA 2GHAA 4MF3A 3SDFA 2R9JA 2B3FA 3FXUA 5AA2A 4HW8A 1MM7A 2E1SA 4KYEA 4GD5A 5ELVA 4NF4B 1N3WA 4R9GA 3OEMA 3TTRA 4EUOA 1QW0A 3IB1A 1PB8A 5A5XA 2DS9A 4P0IA 3TCGA 1ANFA 3HN0A 2IA4A 4FJPA 4OEUA 4IO5A 1TWYA 1DPEA 4H65A 5I59B 4RK2A 5TP9A 4NMYA 1NNFA 3ILTB 2QRYA 2UXAA 3RLFE 2Y7RA 1TXFA 1TFDA 4NF8B 2XXWA 3VLVA 3PPNA 3PUWE 1LB9A 4X1DA 3K01A 3VLWA 1LAGE 3TCFA 3R7XA 1P1QA 4H5FA 3IK6B 3TCHA 2HZLA 3IOUA 1MG1A 5I2KA 4FAJA 3T96B 1RYOA 2RKMA 5ITPA 3Q27A 3HHGA 3LBSA 5H8SA 1MQGA 5K2XA 5TU0A 4OENA 3PPRA 5I56B 3H6VA 2Z8DA 3K4UA 1QKAA 3TODA 3VFJA 1B32A 3FZVA 3H7MA 1PC3A 2RC9A 2NOOA 5FHNA 4DIGA 4ZECA 1OMPA 2UYEA 2HXWA 2NVUB 1UTBB 3MZ1A 1R1NA 3LC8A 4I8CA 1LFGA 4QFOA 1MXUA 4DXCA 4OMBA 3IB2A 4UA8A 4JDFA 1A7LA 1B4HA 5FHOA 5CC2A 2CZLA 1M5EA 3EHSA 2PYYA 1LAFE 2XXYA 4FORA 1WODA 4R6KA 5EHMA 2XXIA 3T93B 3N94A 3S9LC 5JEIA 2XD3A 2ZYKA 2O6AA 1MXVA 2P2AA 4OERA 2Z8EA 4H8JA 2BJJX 1XVYA 3FGSA 4OFOA 4KD5A 3W9WA 3PD9A 4Z0IA 3PGFA 3FXQA 4RXLA 4LQ5A 3F11A 4KI0E 4AB6A 4ECFA 2F7CA 1FTJA 1SYIA 4ZE9A 4Q30B 2XD2A 3GZGA 2IEEA 3TEPA 3H4ZA 2H4IA 1LCTA 5JTYA 3OO7A 4MBPA 3LSLA 5F1QA 1LLSA 5I57A 2RC7A 3LUYA 1D9YA 3RT6B 1NFTA 4OVJA 1SD3A 3PUYE 2OK2A 2Q9TA 1DMBA 4PFUA 2VOZA 2XX8A 3HHFA 2O1MA 1AH5A 1PDAA 1BTJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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