1MQGA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with iodo-willardiine at 2.15 angstroms resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords glutamate receptor 2
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqgA01
1IITA 2OCUA 1NH7A 3Q28A 4R2FA 1A40A 3N5LA 2AL4A 2ZXTA 3I3VA 4QSDA 3OSRA 3OO6A 1UIVA 2DWIA 4H8JA 3H7MA 4NEDA 2B3FA 4YICA 5CC2A 1AIVA 1WDNA 1TWYA 3O6IA 1XHYA 1R1NA 1N7XA 2ONSA 2H98A 2HZKA 3FIRA 2Y7IA 3GBBA 4OEVA 3TTKA 2XXVA 3VXBA 3ECRA 1B4HA 1RKMA 4POWA 1PBPA 1ZTYA 1DMBA 4NWDA 5EHMA 1EH3A 2ONKE 3K6XA 3TAJA 4DCYA 4F3PA 1ZU0A 4F1VA 1GV8A 1IXIA 2FA7A 1URGA 2I3WA 4I9DA 2VGQA 4QHQA 5DEXB 2HFBA 1ANFA 4OWDA 1MG1A 4Z7EA 1FTOA 4QSEA 1SW1A 1IIWA 2YPNA 3RY3A 3QUFA 2XXRA 1QKAA 4KHZE 2Q88A 5AA2D 1B52A 1XVXA 1I6QA 4MFIA 3EF7A 5AA2A 5AA3A 2DWAA 1LLSA 1YAEA 5I56B 1D9YA 4G8HA 3KJ7A 4Q5TA 3FVOA 1DTZA 2F8DA 1Y1ZA 3BFUA 3Q27A 3KGCA 3THIA 1IEJA 5H8NA 4U1OA 4G8NA 3LSFB 1HSLA 3OELA 1DSNA 1MY4A 2FNCA 3VFJA 3IO4A 1ZBMA 2GFEA 1LAFE 3O9PA 4DE8A 4TQUQ 4NF8A 3VVDA 5J1DA 2WKYA 1M5DA 1OVTA 5AA4B 3I6VA 5I58B 2F6GA 3IB0A 1D3KA 2YLNA 1CE2A 4G68B 3CFZA 3U94A 3B6QA 4IO6A 4DCXA 2REGA 2Y84A 1OLAA 4IGRA 1US5A 1FTJA 2H4IA 3CSBA 3RT6B 3BFTA 3D4CA 4IY5A 1LAHE 1FQFA 2R9JA 1MH3A 4R73A 3VVEA 2DS9A 4BDMA 3PUZE 5EHSA 1P1NA 3K1NA 4GL0A 1LSTA 1MRPA 3PMWA 2UYEA 1B32A 5A5XA 4X48A 4NF5A 1TFAA 5DVFA 3HN0A 4BDOA 1A7LA 2HAVA 3S9LC 3T9HB 4OFLA 2F36A 3FVKA 2F7AA 3VE1B 4U22A 1BIYA 1Y20A 3IL1B 4IGTA 1USYE 2F5XA 3T9UA 3P7IA 1MQIA 1Y3QA 4HW8A 4F3BA 3L6GA 5I59B 3V8XB 5TPAB 5EYFA 1SI1A 3K02A 3O6HA 4BDRA 3F11A 1IZ1A 1JW1A 2O6AA 1MY2A 4AQ4A 3K00A 4H5FA 4R2BA 3IOVA 2DVCA 1URDA 1B4ZA 4RJZA 2ZYNA 4JBZA 5DVIA 1XT8A 2ZYKA 5DTBA 5TP9B 2ZMBA 1DOTA 3QSLA 4IB2A 1T0KA 4IO2A 4KFQA 3SEWA 4H67A 5I2NA 4NF4A 3BKIB 3DM0A 3FZVA 4OVJA 2QS4A 1POTA 4KYEA 4MF3A 1S50A 3BBRA 4LONB 4ESXA 4EXLA 3IO6A 3MVWA 4GLIA 1A8EA 2A5TA 4ZEBA 2OJTA 4LZ5A 4ZEDA 2RCBA 1GVCA 4R9GA 2O84X 3LR1A 3DP6A 5FHOA 3ILUB 1UQWA 3CFLA 3M3FA 2D21A 2Q8JA 1IUDA 1N3WA 1OVBA 2P0SA 2QMWA 3G3GA 1ATGA 4G4PA 2QSXA 3RT8A 3V89B 2PYYA 3B6WA 1LFHA 5ITPA 3S4UA 2HXWA 2OWTA 4DLDA 1SBPA 4GF8A 3H6WA 2H5YA 2PVUA 1MXUA 4YKPA 2A5SA 3TUSA 4WEPA 4XKNA 3LSLA 3VLWA 2XXIA 3KSXA 2PT1A 1UTBB 3MZ1A 1B3EA 1N84A 2F35A 3PUXE 1JVYA 3ONMA 1DPPA 2R6GE 3FJ7A 4MLVA 3RGYA 4WKMA 5JEIA 3IAZA 3B7DA 1EZPA 4F19A 3H6VA 3WAEA 3HSTA 3C36A 4X1DA 3K6WA 1L5TA 2X26A 2CZLA 4NTLA 5H8FB 5KCJA 4POXA 2DE2A 3PUYE 3T9XB 1QJMA 3W9VA 4IY6A 4L17A 4K3FA 3PPNA 5DVJA 2I48A 1LCFA 2P2AA 3T66A 4U1ZA 3O29A 4LUBA 1AMFA 4F29A 3T9VA 2DSFA 3K6VA 1SYIA 2DP8A 2GRVA 3PPPA 4NWCA 2ALUA 2RINA 4R74A 1B05A 5H8SA 3GBAA 4HCYA 4KCCA 3MP6A 3FJGA 2REJA 1VR5A 5BWJA 1SW5A 2F97A 1P1OA 2XXTA 3K01A 4LQ2A 4EQ9A 5FHNA 3PGFA 2RC7A 3O28A 1MQGA 4WXJA 3SKPA 3U8QA 5H8HA 3LC8A 5AE4A 2XXHA 4FJPA 3UIFA 5ELVA 2OWSA 2GHBA 1BTJA 1LAXA 4P0GA 3WAFA 1WVJA 2DE4A 4ZE8A 1MM7A 4FAJA 1MPBA 5CMBA 1SDXA 2DWJA 3TDJA 4QFOA 4PFWA 2NXOA 3DP8A 4LZ7A 1VSOA 3O97A 3TCGA 1POY1 2X7QA 4FECA 3GZGA 2DVZA 1Q1KA 4F3SA 3EHSA 4FE8A 4KYSA 1B3FA 4OHNA 3SEVA 3CR9A 3Q25A 2X7PA 3K1MA 1R9LA 4JXIA 2I0BA 2VD2A 3SESA 5I2KB 3FVGA 1Y1MA 1Z7NE 5FTHA 2F34A 1UTHA 2ZNUA 4M1VA 1O64A 4GQOA 1LBCA 1MY1A 3VLUA 3PD9A 2O51A 4FIMA 4EF1A 3EQ1A 1LBBA 1QVSA 1USYH 5K2XA 2R71A 3UORA 4PFYA 2GHAA 4JDFA 3RTFB 2XX8A 5JTYA 1B0LA 2Q89A 3L6HA 1VFDA 3B6TA 4AB6A 1MQHA 1LB9A 3MW0A 3G3HA 4GXAA 1D4NA 4ZEFA 3CG3A 3G3FA 1KWHA 4YZZA 4F1YA 2V3TA 3T93B 3IJOB 3KN3A 1OQGA 3FGSA 5IKBA 3LBSA 1SVXB 1NH8A 5H8QB 5FTIA 3RLFE 1B3HA 3PD8A 3CFXA 4G8MA 3KSJA 5HM4B 4MLQA 4YMBA 1H76A 3MPLA 4YB5A 3MUQA 4R6YA 4QF9A 3PU5A 3O6GA 2I4CA 4YAHX 1EZ9A 5KZTA 3QK6A 1B1XA 5IAIA 3G3IA 3PPOA 1VE4A 4ELOA 2RC9A 5CM6A 2G29A 3OMBA 4MBPA 5H8HB 3RPWA 3FJMA 4ISUA 4R6HA 4JWOA 1GGGA 2NWJA 4EF2A 2GH9A 4JSOA 3CIJA 1MXZA 2D5WA 3G7WA 1I6AA 4N6PA 1S7YA 3S9NC 3RNNA 2Z23A 3TFLA 3FVNA 4F1UA 4ZE9A 2PX1A 4BDQA 4XKRA 1R9QA 3JYRA 1JW4A 1Y9UA 2Y7WA 2O1LA 4LZ8A 1MPCA 2ANJA 3GLBA 2Y7RA 4HCWA 1SYHA 3C9HA 4P0IA 3VV5A 4GD5A 1I69A 1DPEA 1BP5A 3AXFA 3K2DA 3MQ9A 3OO9A 3S2VA 3K4UA 1EU8A 4RK2A 3S9EA 4EXKA 3A3CA 2XXYA 5DYHA 5I57A 1QUKA 4QFNA 2ABHA 3IJXB 5F1QA 1OIBA 1II5A 3TKDA 4C0RA 3C35A 2HZLA 1MQJA 4JWYA 1DTGA 2Z8DA 3OOAA 3UP9A 4ESWA 1FQDA 3N6UA 5CRYA 5B7DA 1QW0A 2KLFA 2YJPA 3KJTA 1LAGE 3FV1A 5AA2B 4GFRA 2V3QA 1BKAA 3W9WA 4XTCQ 2PMSA 3MVXA 4RPNA 1M5EA 2XXQA 3E9XA 5M2VA 1FQAA 3QXMA 2LAOA 1YTVA 4R72A 3KBRA 3LSWA 3FD3A 4DZ1A 1B7ZA 5H8NB 2Q2AA 3OO7A 3TTMA 3JV9A 4PE5B 4OTEA 1LFIA 5JK4A 3KN7A 3U92A 1B9JA 4NF8B 3PV0E 4R9FA 4R75A 3HV1A 3VVFA 3TQLA 3ZS6A 3KOSA 3TYHA 4RPOA 1FTMA 4JSDA 1FQBA 1JNFA 3M3LA 4ZZEA 3EPEA 3K0VA 3VXCA 2O7UA 1B3LA 3V83A 1N7WA 4AB5A 5K2YA 3MAMA 2B65A 3TPAA 2XXWA 2E1SA 3HPIA 1B7UA 1QUJA 2DWHA 3Q29A 4TLMB 3M8UA 4Z0IA 2ZNTA 5ICQA 4N07A 3TCHA 2RF1A 1MM6A 3TZAA 3K1PA 1P1UA 1NFTA 1ZKBA 2Y7KA 3MC2A 1JEVA 2V84A 3OSQA 2I3VA 1H3DA 1MPDA 5A5XB 3U1OA 4OFJA 4O3CA 4NF5B 3C31A 5LOMA 2H99A 4KYDA 1MQDA 2NVUB 3C33A 2H25A 2OLBA 2QMXA 3N6TA 3EHTA 2W7YA 3R7XA 1EZOA 2IA4A 3TTNA 1TFDA 1J1NA 3SETA 4KD5A 5KDTA 3SEYA 4F2QA 2M8CA 4G77A 1UIUA 1PBQA 4THIA 1MXYA 1P1QA 4H0WA 2QS3A 2XXXA 2NUVA 4Q8RA 3TEPA 4OZ9A 3KEIA 3VDFA 1WODA 3MBPA 4MH5A 3K6UA 1R6ZA 1B40A 1Q35A 4XKPA 1MS7A 4I62A 4N13A 4TOZA 1IXGA 1PC3A 3TMGA 1F9BA 1OQHA 2RCAA 3FV2A 4OMBA 5L8DA 3DP4A 5DEXA 1H44A 2F7CA 1ZLQA 2I49A 3KN8A 4YKIA 2VOZA 3IORA 3FXRA 2QS2A 3HHFA 3UA8A 1Z7ME 3ILTB 1M5BA 1B6HA 4I1DA 1QUIA 1JVXA 4YB6A 1MY0A 4OYVA 5L9OA 5I2NB 2E0SA 3IOUA 4NF4B 2F78A 2UVGA 1RYXA 4KQPA 2AIXA 2HAUA 3TTRA 4FORA 1NNKA 1Y4TA 2ESNA 2A5TB 4F2OA 4H8IA 4LVQA 2H9BA 3LSXA 1B51A 4PETA 4ELPA 4LP2B 4ECFA 4OFOA 1XC1A 1Y3NA 1JETA 2P1SA 3RQTA 2DYXA 3SDFA 3MWBA 3MVYA 3RN8A 4ZZAA 3H6TA 4OETA 1NL5A 4GXSB 4XXUA 4LATA 4YKJA 1XVYA 3E13X 2F6PA 4BDNA 5AA4A 5I58A 4OENA 2I0CA 3CVGA 4H6DA 4G68A 1XS5A 3H6UA 2HEUA 1FQCA 3DELB 4I8CA 3EHUA 5ICTA 3HCQA 3ZKLA 4FATA 3O66A 4HS7A 4U4SA 3M3KA 1B5HA 2XXUA 4C1UA 4H1XA 2QS1A 5CI5A 4RNSA 3TQWA 1YCJA 3MP8A 1N04A 3O2AA 4X9TA 2DXYA 1B1HA 2O69A 3QYTA 3MZ9A 4FEDA 1H43A 4ND9A 2THIA 5CMMA 2QPQA 4OEUA 2PBWA 5KDTB 2D3IA 2XD3A 2I4BA 3T22A 5KCJB 3T96B 1Y3PA 1LFGA 2ZYOA 3S9MC 1P99A 4BLAA 2F7BA 4IO3A 4U23A 1NNFA 3RUMA 2QRYA 5I59A 1P1WA 3FXUA 4KCDA 1MXWA 4NE4A 2FYIA 5TPAA 1QULA 3TCFA 5AA1A 4DDDA 1IQ7A 5ITOA 3N94A 1NKXA 4IO5A 5CBSA 3HO7A 3G3JA 2IEEA 2Z8FA 4C1TA 2UVJA 4LQ5A 5DT6A 1I6BA 3OO8A 3RTWB 4RYAA 5F7VA 1GR2A 5TP9A 4EUOA 1FTLA 1NNPA 3UGWA 4DXCA 1S9TA 1MH4A 3LUYA 2QJEA 1MXVA 3PMVA 3OD7A 3OEMA 3I5OA 4WEDA 4G68C 1O63A 2UXAA 4M4GA 3U72A 4GRKA 4KR5A 3H03A 4OERA 2HCAA 2DQVA 3PPRA 1FW0A 5CBRA 1RYOA 2DE3A 1HSEA 4XKQA 1PB7A 2Q2CA 1ELJA 2Z22A 4UACA 2OBGA 4OESA 1A8FA 2OK2A 2DXRA 4G2ZA 4BDLA 5I84A 2PT2A 1B46A 2VP1A 3TTLA 4YMAA 2RC8A 2CMOA 3C34A 3CG1A 4HTGA 1N76A 3N26A 3DLNA 4GOTA 1SI0A 1PB9A 4GVOA 3TELA 1UTBA 1M5CA 3QIMA 1TT1A 4DIGA 1LB8A 3C4MA 3R6UA 1UTHB 3E4RA 3FASA 3QUJA 1A99A 4Q30B 5HBCA 3KG2A 1HSJA 3SEXA 4QRZA 1XOCA 5JTYB 1Y4CA 2QL3A 1AOVA 2AL5A 3A09A 3G3KA 2HQ0A 3IB1A 4U2RA 3OEKA 4X1BA 2O1MA 1FCKA 5H8FA 2UYFA 2UVHA 3H3GA 3PUWE 4RA1A 4RK9A 4F39A 1JEUA 5FHMA 4TLLB 4GL8A 4DXUA 3E3KA 1SD3A 4ONYA 2XXPA 4ELQA 3EN3A 3HHGA 4ZEKA 4QSCA 3ODBA 5HPQA 4EQ7A 2ONRA 4NF6A 5ISUA 1NMUA 4KI0E 4IO7A 1IXHA 3Q26A 1CB6A 3H06B 4UA8A 1OLCA 1PEBA 2VD3A 5L9SA 2ZYMA 4RXLA 3UN6A 3IR1A 1YPNA 1MXXA 3W15C 2V3UA 4LA9A 1AH5A 5L9MA 5BUUA 1TXFA 3FXQA 1ZIUA 1A54A 4JWXA 4U4XA 1SQYA 4ZS9A 1B58A 4E0WA 2UVIA 1AL3A 2I6EA 4ZECA 1M5FA 2OZZA 1B5JA 4O3BA 2O68A 4Q0CA 2XHDA 2ZNSA 4E0XA 3IB2A 3PMXA 1SW2A 1MDQA 4NMYA 2NOOA 3GXAA 2Y7PA 4PFTA 4YU0A 4ZDMA 3V5AA 1LCTA 2Q9TA 4QFPA 4P11A 4FEBA 4PP0A 3UK4A 4OQOA 1SW4A 3PUVE 3SERA 4F22A 3QAXA 4EDPA 1IXCA 3U93A 4YB7A 1US4A 4ZEIA 1VFEA 4EQBA 4F18A 4ELRA 2DOJA 4PQJA 5TU0A 3IOTA 3TODA 3OENA 1ZJLA 3MJNA 2B3BA 4RY1A 3IK6B 5I2KA 1O7TA 3MZBA 1B7HA 4IO4A 3H4ZA 3JZJA 4GIZA 5I57B 1B5IA 1B0HA 1H45A 4JB7A 3ZSFA 4OXVA 2Z8EA 4F3GA 4PFUA 1N0TA 3CI8A 1D9VA 4H5GA 4GWOA 1A55A 3R26A 1GTKA 1N3XA 2VHAA 3CSGA 3A3UA 3VLVA 3FATA 2O7IA 4QFLA 1PDAA 4R6KA 3CRBA 4DXBA 4NF6B 3OXNA 3KFMA 4XIGQ 1ZMGA 1JW5A 4O3AA 1JQFA 4F31B 3MPKA 3PPQA 3ZKKA 5CMCA 5H8QA 2G93A 5B70A 4U21A 5I56A 3KZGA 1MDP1 2V25A 1LGBC 2V93A 3IOWA 1B3GA 1QKBA 3KOTA 4YKKA 3SEUA 1URSA 3USDA 4KPTA 2RKMA 1MY3A 2BJJX 1PB8A 3MVZA 2AYSA 1FTKA 3C32A 1OMPA 5CMKA 2XD2A 1BLFA 3FUZA 3D4GA 2XX7A 3MP1A 2I58A 4QFKA 3IX1A 4H65A 1NNTA 1FQEA 1B2HA 2XX9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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