1MQHA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with bromo-willardiine at 1.8 angstroms resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEALEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqhA01
2AYSA 3PPNA 4LONB 1XC1A 4ELPA 2UVHA 4TLLB 1O64A 3GZGA 1ZU0A 2H25A 4QSDA 3FGSA 1NNPA 1Z7NE 3TQWA 1QVSA 4C0RA 2O84X 3OELA 1MY0A 3IR1A 3TCHA 4EQBA 3R26A 4OETA 3S9EA 2FNCA 2E0SA 3LBSA 5K2XA 3USDA 2OZZA 3ZSFA 3EHTA 1NNKA 2H9BA 2XXQA 4QSCA 1CE2A 5I59A 2XXTA 5H8FB 2RCBA 1GV8A 2O1MA 5CM6A 1P1QA 3FVOA 3IL1B 5DVFA 2O68A 2I0BA 3IB1A 4QF9A 3VDFA 1Y4CA 1H44A 1SI1A 3C36A 3R6UA 1DMBA 1TFDA 5EHSA 2Q2CA 3H3GA 1N7WA 2UVGA 5F7VA 3AXFA 4LZ5A 2NUVA 4HCYA 3M3FA 2Q88A 1Y9UA 1N04A 4G8NA 1IQ7A 1B6HA 3OO7A 3RUMA 4ISUA 3W9WA 3IJOB 4UA8A 2ZYNA 1MS7A 5H8NA 3O2AA 2I3WA 1TXFA 5EYFA 3MUQA 1J1NA 1PB8A 2B65A 3H6VA 3TPAA 1A40A 4R2FA 4OFOA 4LQ5A 3K1PA 1B1HA 1B2HA 2I6EA 3W9VA 2ZNSA 4R2BA 2Z8EA 1LLSA 4WKMA 1LSTA 2M8CA 2ABHA 1GVCA 1FTMA 1GTKA 3RTFB 4RK9A 4U23A 3G3HA 3KG2A 3FATA 4M4GA 1SW2A 3N26A 3O6GA 4ELOA 3T9HB 4N13A 4KYSA 1SVXB 4L17A 3ZKKA 4E0WA 2ONSA 3A09A 2DXRA 1Y1MA 4DXBA 3IOVA 1YCJA 3UN6A 3PUVE 4OERA 3MP6A 4EUOA 4QSEA 4EF2A 2ZYMA 3N94A 4JXIA 2A5SA 3O9PA 3MW0A 2H5YA 2V3QA 4IO5A 4JSDA 4H5GA 4C1UA 3C9HA 3I6VA 2F97A 4GL0A 1Y3PA 4EF1A 3E3KA 3I3VA 3MC2A 4YICA 1JQFA 5LOMA 4NF8A 4WXJA 3ONMA 1LAHE 1A8EA 1PBPA 4EXLA 2YLNA 4KFQA 1MPCA 2NVUB 2FA7A 1MXVA 1S50A 4IO7A 4LQ2A 3ODBA 3ILUB 4KPTA 5I56A 3V5AA 3K00A 3OENA 3LSXA 3PV0E 3IOTA 4LP2B 2XXUA 2Y7WA 4N07A 4ZDMA 4YAHX 5I58A 3VV5A 1BLFA 3Q28A 5JK4A 1IXHA 5JTYB 3B7DA 2OWTA 3HHGA 3MZBA 4ECFA 4G4PA 3KZGA 2HFBA 5DEXB 3HCQA 3OO9A 4DCYA 1QUKA 4F3GA 3IOWA 2NXOA 3HV1A 1R9LA 1IXGA 2X26A 4OEUA 1JW1A 2WKYA 3S9MC 4LVQA 3H6WA 2H4IA 3SERA 5HM4B 4RJZA 5AA2A 1YTVA 4KD5A 3TTMA 2AL5A 1B46A 4NF4A 1IEJA 2IEEA 3TEPA 2RKMA 1UTHA 3G3FA 5AA4A 4ZEKA 1SDXA 2I49A 4R73A 1WVJA 1TT1A 1ZMGA 3KFMA 1MXYA 3S9LC 5CBSA 2BJJX 3R7XA 3WAFA 2A5TB 1USYH 3LSFB 1UTBA 3LSWA 3EN3A 4GRKA 4GQOA 4AB6A 3HSTA 1Q1KA 2X7PA 2Z23A 3CSGA 4H67A 3SESA 3TTLA 4R72A 2XXVA 4GOTA 1B5IA 2F7BA 3BFTA 3K02A 4GWOA 4H8JA 3EHUA 4NF5B 2XX7A 4R9GA 2H98A 3PUWE 1B7ZA 3K6XA 3CI8A 3QSLA 4DXUA 1OMPA 3B6TA 3RT6B 1A8FA 4G68C 3MPKA 2Z22A 1BP5A 1Y3QA 4O3AA 4G68B 4OXVA 3LUYA 3OSRA 2PMSA 4KHZE 3PU5A 1QUJA 1FQAA 1MQGA 1I6BA 5H8HB 4F31B 1B3FA 3PMVA 3VLWA 4QFLA 1B3EA 1URGA 1MXWA 3G3IA 1OLAA 5I2NB 1M5DA 1NNTA 2O7UA 3A3UA 1MDP1 3VFJA 1B40A 2DVZA 4OTEA 3V83A 4FJPA 4U2RA 5JEIA 1QKBA 4U4SA 1N7XA 2O69A 3W15C 3GBBA 3SEUA 1LAXA 1VE4A 2DVCA 1IZ1A 4DZ1A 1LFIA 3VXCA 1YAEA 3FV2A 3HN0A 2HQ0A 1IUDA 4PFYA 5H8QB 5B70A 3FASA 5A5XB 1ELJA 2CMOA 3FXQA 5BUUA 5L8DA 1DOTA 2Y84A 3UIFA 4NMYA 5M2VA 3MP1A 2GHAA 3T9XB 2G29A 4ZE9A 1N0TA 2I3VA 2UVIA 2ONRA 3QYTA 3K6WA 2DP8A 3QXMA 4NTLA 2QRYA 1GR2A 5IKBA 5I57A 1B3LA 4FATA 4HS7A 3MPLA 4FORA 4Q30B 4QFOA 4NEDA 2Q9TA 2DSFA 4JDFA 5KDTA 1LCFA 4RNSA 5TPAB 4G8MA 5CBRA 4BDRA 3N6UA 5DTBA 3M3KA 2X7QA 4P0IA 1TWYA 3MVXA 1ZJLA 3C4MA 4ESXA 4LA9A 4PFTA 2PBWA 2I58A 4YKJA 2F8DA 3PUXE 4IB2A 3PD8A 4QFPA 4KI0E 4YU0A 3RY3A 4KCDA 2VP1A 2R71A 2Z8DA 3T96B 1FCKA 3FVNA 2DWJA 1QJMA 3U92A 1NMUA 4K3FA 1YPNA 1LFHA 2XD2A 4I62A 4LUBA 4KYDA 4F3BA 4Q0CA 1MPDA 3SEXA 1B7HA 1MY2A 5CI5A 4IO4A 2B3BA 3L6GA 5ICTA 2W7YA 1LCTA 1RYXA 2LAOA 5H8FA 4F1UA 2DXYA 3UORA 3N5LA 2XX8A 1LAGE 3IX1A 3CFLA 1CB6A 1F9BA 5I59B 1ZLQA 4TLMB 1AH5A 4PFWA 4F39A 5DT6A 2NOOA 2KLFA 3WAEA 2ANJA 1B9JA 1B52A 1B5HA 2QSXA 4OZ9A 4OHNA 3VLVA 1TFAA 2V3UA 3S4UA 3CFXA 1M5EA 3CVGA 2HZKA 3SEYA 5CMKA 1FW0A 1LB9A 1JNFA 4QFKA 3E9XA 2PT1A 3LSLA 2GH9A 4QHQA 1H3DA 4GVOA 1OQGA 1DTZA 2Q89A 1OLCA 1PB7A 4QRZA 5ITPA 2R9JA 1HSJA 4JBZA 3B6QA 2XXHA 1LBBA 4NF6A 3MVYA 3H06B 3IO6A 2NWJA 1B5JA 4YB6A 3SETA 3K1NA 1ZKBA 4ZZAA 3RNNA 3PPRA 1DSNA 2OCUA 3TFLA 3G7WA 3FD3A 4PFUA 2RINA 4G8HA 4F3SA 2VD3A 4GXAA 3T66A 4XKPA 2D21A 3G3KA 1MG1A 1B4HA 2D5WA 1WDNA 4EQ9A 3M3LA 1QULA 1SW1A 3TELA 1Y3NA 2ZNUA 2Q2AA 4RA1A 3K6VA 1N3WA 4FEDA 3TKDA 3ZS6A 1P1NA 3MAMA 3BKIB 5H8SA 4ZEFA 5ELVA 2O1LA 4OFLA 3T93B 4KCCA 4POXA 3C33A 3CG1A 3RN8A 4DLDA 4LATA 2DE4A 3TODA 3T9VA 3EF7A 4RY1A 3BBRA 3S2VA 4G2ZA 1EH3A 2FYIA 3U94A 4U22A 3FXUA 3FJ7A 1BKAA 2F35A 3TCFA 4F1YA 3TTRA 2UYEA 4EDPA 3VVEA 1NL5A 1NH8A 3G3GA 1XHYA 1FQEA 2O6AA 4XKNA 1SI0A 3MZ1A 2ZXTA 2YPNA 1HSEA 2QS2A 4MBPA 4F18A 5CMBA 3RPWA 1B3HA 1MXXA 1UQWA 5DEXA 1MM7A 5HBCA 4BDNA 2DE3A 2RC7A 3VVFA 5TP9B 3K0VA 2GHBA 1QW0A 4PQJA 2VGQA 2VHAA 1MH3A 4GL8A 4YKKA 1ZBMA 3HHFA 4R6HA 4WEDA 1MDQA 3O29A 3RT8A 4GF8A 2PYYA 3KBRA 2Z8FA 2H99A 3KN7A 2VOZA 5CMMA 3KJ7A 2OLBA 2A5TA 4YMBA 1O63A 3FXRA 1FQBA 4EXKA 4BDQA 2ZYOA 4NF4B 2OJTA 3QUFA 1FTKA 4FIMA 3DLNA 3C34A 1SW4A 1JW4A 2Y7KA 5FTIA 4GIZA 3CSBA 1H43A 5I2KB 4R74A 3IORA 4P0GA 4ONYA 1P1OA 3GLBA 4PE5B 3K01A 3VVDA 3KN8A 1UIUA 2QJEA 1FQDA 4NF5A 3Q26A 1POY1 5F1QA 3G3JA 2QPQA 4R6KA 1NH7A 1URSA 1MY1A 4OQOA 4AQ4A 4RK2A 2DWIA 4YB5A 1L5TA 1B3GA 3SDFA 1RKMA 2QL3A 4JSOA 1EZPA 3OEMA 1WODA 3CG3A 1Y20A 4TQUQ 4F22A 3FV1A 2ZMBA 3JZJA 5DVIA 5H8HA 1BTJA 3IK6B 3TUSA 3EHSA 3OO6A 4G77A 3CFZA 1OQHA 2RCAA 5TU0A 4LZ8A 1NNFA 5L9MA 2GRVA 5I2NA 3Q27A 1XT8A 3GXAA 2DQVA 2XHDA 4TOZA 3TTKA 4GXSB 1JEUA 2ESNA 1B51A 3S9NC 3OD7A 1Q35A 3C31A 5BWJA 3VE1B 1A55A 3O28A 4F19A 4IGRA 3SEVA 4DIGA 1B4ZA 1IITA 1LGBC 2THIA 1N76A 3H7MA 1MQJA 3KSXA 2GFEA 5H8QA 5ICQA 3KN3A 5IAIA 2DOJA 4JB7A 1ATGA 3CIJA 4DCXA 1XS5A 1B05A 1MH4A 3DP4A 4OEVA 3OMBA 1M5FA 3KSJA 1DPEA 3FUZA 3IAZA 4BDMA 3TCGA 5L9SA 2DWAA 4X48A 4F29A 1VSOA 2F7AA 4WEPA 5K2YA 4ZZEA 3P7IA 4ZE8A 1S9TA 1DTGA 4JWOA 5ISUA 3OEKA 5TPAA 1T0KA 3RQTA 3TMGA 1M5CA 5AA2D 1A54A 2D3IA 1B58A 1OVTA 4NWDA 1MQIA 3VLUA 3KOSA 3TQLA 5KCJA 1QUIA 1POTA 1MY3A 4DXCA 3MVZA 4OWDA 4KYEA 2HZLA 4X9TA 3PMXA 3VXBA 3KGCA 4UACA 4HTGA 1B32A 4THIA 1O7TA 1PDAA 5AA3A 4R9FA 4P11A 1RYOA 1LBCA 1R9QA 2DYXA 3MQ9A 2F6PA 3RLFE 1R1NA 2HXWA 1IXIA 2XX9A 4OENA 4GD5A 4XTCQ 1IXCA 4Z0IA 3FVKA 3OSQA 5AE4A 1II5A 1P1UA 3U72A 5EHMA 3EPEA 1R6ZA 4PETA 5FHMA 3PD9A 4YZZA 3CR9A 2ZNTA 1SYIA 1ANFA 1NKXA 1AIVA 4RPNA 2HCAA 4IY6A 3QUJA 1P1WA 4OVJA 1D9YA 2F34A 3THIA 3H6TA 3DELB 3PUYE 5B7DA 4RPOA 2XXWA 1IIWA 4ND9A 2REJA 4MFIA 3LC8A 3OO8A 2I4CA 2PX1A 2DE2A 2F5XA 3O97A 1Y4TA 5ITOA 3SEWA 4M1VA 1MXUA 2V93A 3C35A 1H45A 3LR1A 2OBGA 2F6GA 2Y7RA 1GGGA 3K1MA 4ESWA 1JEVA 1US4A 1NFTA 4ELQA 4R75A 1AMFA 4EQ7A 2QMWA 3JYRA 3E4RA 2QS1A 4MLQA 5H8NB 3BFUA 2UYFA 4IO3A 2V25A 2PT2A 2F78A 1US5A 2ALUA 3MJNA 1ZTYA 1FTLA 1MY4A 3RGYA 3K2DA 4BDLA 3T22A 4OMBA 4YKPA 4ZECA 1Z7ME 1MXZA 1XVXA 3T9UA 3MWBA 3OOAA 3MVWA 3ECRA 4GLIA 2P2AA 3O66A 4NF6B 3ZKLA 4JWXA 2XXXA 3PPPA 1D9VA 1VR5A 1VFEA 1PB9A 2RC9A 3M8UA 5FHNA 4LZ7A 4I9DA 4FECA 3UGWA 4RYAA 2Y7IA 4O3CA 1PC3A 4I1DA 2YJPA 1JVYA 3IB0A 1D4NA 3V89B 4FE8A 4Q8RA 4ZEBA 4BLAA 3DP8A 3Q29A 1FTJA 4ELRA 3B6WA 1VFDA 1SQYA 1LB8A 1H76A 4NF8B 3KEIA 4F1VA 3MBPA 3H4ZA 5J1DA 4F2QA 4IO6A 5DYHA 3K6UA 4OESA 5FTHA 1JW5A 4H0WA 1XOCA 3O6HA 1MQDA 1EZOA 3O6IA 1JVXA 3TZAA 5I56B 3RTWB 1XVYA 2XXIA 2ZYKA 1UIVA 2CZLA 3GBAA 5JTYA 2I48A 2DS9A 4BDOA 1D3KA 2IA4A 2O7IA 3FJMA 3HO7A 4OFJA 2G93A 2QMXA 1A99A 3D4GA 2RF1A 5I58B 3A3CA 2F7CA 1FQFA 4AB5A 5TP9A 4PP0A 1SBPA 2ONKE 1PBQA 1SD3A 4DDDA 2VD2A 4GFRA 3IJXB 1ZIUA 1LAFE 3PGFA 1BIYA 3K4UA 4H5FA 4XIGQ 2R6GE 3KOTA 3QAXA 4F2OA 3EQ1A 1HSLA 5AA1A 3H03A 1A7LA 1MRPA 3PPOA 4HW8A 1N3XA 4XXUA 1Y1ZA 3V8XB 2F36A 3E13X 4IY5A 5AA2B 2HEUA 4H6DA 1B1XA 4N6PA 1URDA 2PVUA 3FIRA 4YKIA 5KZTA 4C1TA 2B3FA 4POWA 4Z7EA 5HPQA 1UTHB 5AA4B 4U21A 5I2KA 3MP8A 2RC8A 2V3TA 3UP9A 2OWSA 3KJTA 4YB7A 2V84A 5CMCA 4KR5A 1UTBB 1M5BA 3MZ9A 2UVJA 3FVGA 1PEBA 3U8QA 4NWCA 3HPIA 4O3BA 5DVJA 2I4BA 3FZVA 2QS3A 4KQPA 2XD3A 4JWYA 4MH5A 2XXRA 4G68A 2O51A 1S7YA 4DE8A 3CRBA 4QFNA 3IOUA 2Q8JA 2I0CA 5CRYA 3U93A 2AL4A 3D4CA 4Q5TA 2Y7PA 1FTOA 4MLVA 3N6TA 4H8IA 3TDJA 3IO4A 2XXPA 4IGTA 3PUZE 3OXNA 4NE4A 3PPQA 1FQCA 1LFGA 4X1DA 3DM0A 3DP6A 4X1BA 5I84A 2HAVA 1P99A 1N84A 3QK6A 3PMWA 4F3PA 4H1XA 1MQHA 4OYVA 3UA8A 3JV9A 4YMAA 1SYHA 3U1OA 3IB2A 1I69A 4XKQA 2DWHA 1I6AA 3ILTB 1USYE 1MPBA 4FEBA 5A5XA 4IO2A 1I6QA 1OVBA 1AL3A 2E1SA 4XKRA 3F11A 4ZEIA 5CC2A 1B0LA 5FHOA 2OK2A 2REGA 2P0SA 1MM6A 1B0HA 1SW5A 2P1SA 5L9OA 4MF3A 4FAJA 3TTNA 1DPPA 1QKAA 4U1OA 5I57B 4U1ZA 3QIMA 4R6YA 3UK4A 3L6HA 3SKPA 3Q25A 4HCWA 1AOVA 3I5OA 5KDTB 2AIXA 2XXYA 3C32A 4H65A 4RXLA 2HAUA 3TYHA 4E0XA 4ZEDA 2UXAA 3TAJA 4I8CA 1JETA 1EZ9A 1B7UA 3H6UA 5KCJB 2QS4A 4ZS9A 1OIBA 1EU8A 1KWHA 4U4XA 3FJGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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