1MQHA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with bromo-willardiine at 1.8 angstroms resolution
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEALEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqhA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqhA01
4KPTA 3WAFA 1NNPA 1MXUA 3ILTB 1TT1A 3G3HA 4RPNA 3CG3A 3PUXE 3N94A 2ZMBA 4Z7EA 3H03A 2QS2A 1LCFA 4H0WA 2FA7A 2I48A 4LATA 3K0VA 4RK2A 2XXQA 1EU8A 4DE8A 4NF4B 3RT6B 1PBPA 3MUQA 5JTYB 4X9TA 3O28A 4NTLA 1R9QA 4GIZA 3H4ZA 2VD2A 5FHMA 4YKIA 3C33A 5AA2A 4NF4A 5JTYA 3TEPA 4QRZA 5J1DA 3O66A 4LA9A 4F1VA 3RTWB 3LSLA 4F1UA 1BLFA 2ZYKA 3TQWA 3OSQA 1OLCA 3TQLA 1MXXA 3PUZE 3H6WA 5CBRA 2ESNA 3MC2A 4KCCA 5TPAA 3OEMA 3QXMA 3FVNA 3RPWA 2OK2A 5TU0A 3QUJA 3CRBA 3IOWA 3ZS6A 2Y7WA 4ZE8A 2B65A 1MQJA 5AA4A 5L8DA 3I5OA 2XXIA 1HSEA 4X1DA 4YB7A 1A8FA 1B1HA 2V3TA 3KBRA 5ITOA 2DWJA 1B05A 1A8EA 1FTKA 2Y7KA 3N26A 4RXLA 1LAHE 2IEEA 3VXCA 3O6GA 4GOTA 4QSEA 3SEWA 4GVOA 1N76A 1MY2A 3M3KA 1B32A 1T0KA 1OVTA 2Z8FA 3DLNA 3GBBA 3DP4A 1D9VA 4MH5A 3LBSA 5TP9B 4U23A 1YTVA 3MJNA 1UTBA 3UORA 4U22A 3RGYA 3MPLA 2P0SA 2XX9A 4BDMA 4OESA 1N3WA 3S9MC 4R9FA 3RY3A 3K1NA 3L6HA 3PPQA 1VFDA 3OXNA 1VR5A 5TP9A 4NEDA 4QFPA 4EF2A 5FTIA 3VLUA 3KN7A 5H8FA 4I62A 4F22A 3CSGA 1H3DA 4IY6A 1UTHB 5KZTA 4IB2A 4NE4A 5FTHA 2DE4A 2O51A 4KCDA 1LFHA 1QW0A 2AYSA 3ZSFA 1ATGA 5EYFA 1SW5A 3O2AA 2RF1A 4G4PA 3TODA 3FATA 2F8DA 4GQOA 5DVFA 1ZU0A 4LQ2A 3TMGA 3JV9A 1B7UA 4P0IA 4X48A 3TTRA 2RC9A 1B0LA 2RC7A 1LAGE 1US5A 3MP1A 5CC2A 2QS3A 2UXAA 3MBPA 4FAJA 4TLMB 2HXWA 2Y7RA 3KOSA 1FTJA 3KZGA 2F36A 1MXWA 3IOVA 1VE4A 4GWOA 1J1NA 1LBBA 2G29A 3FIRA 4ZEIA 3SEUA 2PVUA 1MQDA 4ECFA 4X1BA 1H45A 3B6QA 3T9HB 1N7XA 5EHSA 1Z7ME 4QFLA 4FATA 2R6GE 4F18A 2D21A 4EUOA 1XVXA 5EHMA 2V25A 1GGGA 3MQ9A 1SW4A 4NF5B 3KJTA 2F7BA 3PMVA 1IUDA 3DP6A 1JVXA 3M3LA 3GLBA 3EHSA 4JBZA 3RTFB 4M1VA 4GXSB 5CMCA 1VSOA 4XKRA 3IB2A 4NF5A 3D4CA 4H67A 3R6UA 1FQFA 1S50A 3TKDA 4P11A 1NH8A 2PBWA 3VLWA 5CMKA 1NH7A 1IITA 4RK9A 2Q9TA 3H06B 5AA2D 2THIA 4H8IA 1L5TA 4G68B 1NKXA 1IXHA 3KSJA 4HCWA 4BDRA 4HS7A 4G8HA 3QUFA 4KYDA 4U1OA 4XKQA 3R26A 1O64A 4ZZAA 4OVJA 1B5HA 4Q5TA 1MY1A 4G68A 3RUMA 5A5XB 1LCTA 3KJ7A 3K6VA 1EZOA 2DVCA 3OEKA 3O6HA 3PPOA 5H8HB 1PB8A 1EH3A 1SW1A 4FEDA 1TFDA 5A5XA 3TYHA 3E4RA 3G3FA 3T22A 2H4IA 5KDTB 3MZBA 3T9XB 4KQPA 3H6TA 1XOCA 2VHAA 3HSTA 5H8HA 1SQYA 2HQ0A 1A55A 1P1WA 5IKBA 2RINA 5KDTA 1PB7A 3Q27A 4I8CA 5L9OA 4DXBA 3K6WA 2XXPA 4OTEA 2DXYA 2DWHA 1N04A 4BDNA 4NWCA 1FQCA 2Z8DA 1AMFA 3OO8A 4HTGA 1PB9A 4LVQA 3G3IA 2Q2CA 4IO4A 3VDFA 4JB7A 4JXIA 4IGRA 1XS5A 1SYHA 3R7XA 1SBPA 5CRYA 4LP2B 4U4SA 1B46A 5F1QA 4ONYA 2QMXA 3K6UA 3IO6A 1I69A 3S9LC 4UACA 2X26A 3IL1B 3ZKKA 4OXVA 2AL5A 3IOUA 3FGSA 3UN6A 3PMWA 3TUSA 1M5CA 3T93B 3FXQA 1Y9UA 4KR5A 3MP6A 2H9BA 3EF7A 2UVIA 1VFEA 1H43A 2F5XA 3THIA 4ESWA 2O7UA 1POY1 4O3BA 2XXRA 4FORA 3IK6B 1LGBC 3OO7A 2XX8A 5I58A 3O9PA 4EQ9A 1URDA 4IGTA 4EQ7A 4F3SA 4YMAA 2UVHA 2UVGA 2Q88A 3TCHA 3UA8A 3U72A 3ILUB 2E0SA 1B5IA 3HN0A 3OSRA 3S2VA 1FW0A 5AA2B 3RN8A 3MVZA 1MQHA 2F97A 4YAHX 1UQWA 2ZYNA 3FVOA 3SKPA 1NNTA 2OBGA 3FXUA 4R6KA 2QPQA 1FCKA 1DSNA 5H8NA 3CI8A 5M2VA 3MZ1A 4OZ9A 1RYOA 3K2DA 3CFXA 4JSOA 2I58A 5TPAB 5L9SA 4FIMA 1Y4CA 2PT2A 4KI0E 4OMBA 2ZYMA 4YKKA 1BP5A 4PFTA 2XX7A 2DYXA 3KG2A 4OERA 2DXRA 2I3VA 1H76A 1USYE 1OIBA 4ELPA 3PU5A 4Q30B 5AA4B 2NVUB 5FHOA 4ZECA 2H25A 2OJTA 4PETA 1ANFA 4N07A 1FQEA 1QUKA 4G77A 4Q0CA 5HM4B 4F2OA 4OYVA 1ZMGA 3TCFA 1QKBA 1EZ9A 1ZBMA 5JEIA 1B1XA 3U94A 4BDOA 4RPOA 3QSLA 3Q28A 1IIWA 2I3WA 3EPEA 1D4NA 3B7DA 4ND9A 4ZS9A 1MM7A 3PPRA 1B7ZA 3TFLA 1MY4A 4I9DA 3K01A 4ZZEA 3EHUA 4XIGQ 1UTBB 2P1SA 3RQTA 2I6EA 3PPPA 1HSLA 3K4UA 4IO5A 3SEVA 3IO4A 4O3AA 3MWBA 4RY1A 3OO6A 1DTZA 3C36A 4QFNA 3CFLA 2V3UA 2Q2AA 3EHTA 3MVYA 1S9TA 3CG1A 4LQ5A 5H8FB 5ISUA 3PUVE 1MY3A 3E13X 4ZEDA 1MDP1 5I57A 2FNCA 3SETA 2UYEA 5HPQA 2RCAA 3MVWA 1Y20A 3IX1A 2F7AA 2F35A 1R9LA 3V8XB 1LB8A 1P1QA 3LC8A 3B6WA 3QIMA 4HCYA 4ELRA 1ZKBA 2B3FA 3G3KA 1A99A 4H8JA 1R1NA 5B70A 1IXGA 3N6TA 4G8NA 2X7PA 1N84A 4U1ZA 3O6IA 5I2KA 1IXCA 1MXZA 3A3CA 4XTCQ 3VV5A 2NWJA 5I2NA 1N7WA 3AXFA 1B4ZA 4IY5A 4DCYA 1JNFA 4AB5A 3SDFA 1Y1MA 4U4XA 4OHNA 3LUYA 3FUZA 2AL4A 4M4GA 1LB9A 1UIVA 2YJPA 2I4BA 3HHGA 2Z22A 4F3PA 1PEBA 4WXJA 4QHQA 1QUIA 1MQGA 2OZZA 2XD2A 2REJA 4ZDMA 3PUYE 2RC8A 1P1OA 5H8QA 2O84X 4KFQA 3SERA 3FJMA 3OELA 4EXLA 4GL0A 1Y1ZA 3FVKA 1FQDA 5I56B 4OEUA 3S9EA 2HZLA 3VFJA 3OD7A 4H6DA 3G3GA 3IOTA 2YPNA 1IZ1A 4C0RA 3H6UA 4DIGA 4OFJA 1Y3QA 1JVYA 3VXBA 4DXUA 3N6UA 3ECRA 3HCQA 5I56A 4GD5A 1JW4A 3UGWA 1IXIA 2I0BA 2A5TA 3KGCA 2HFBA 3JZJA 3IORA 1MPDA 4FE8A 1IQ7A 4U2RA 5DTBA 1FQBA 2G93A 1B3FA 2NOOA 3C9HA 4I1DA 1B7HA 1YAEA 2DOJA 3KOTA 1QJMA 1ZLQA 3DM0A 1D9YA 1D3KA 5AE4A 4P0GA 3C31A 4WEDA 4Z0IA 1JEVA 1LLSA 2DSFA 4IO2A 2REGA 1GVCA 1SVXB 3UK4A 3FASA 4PFWA 4QSCA 2I49A 3GZGA 3SESA 3MPKA 1PC3A 3IJOB 3B6TA 3QYTA 2CMOA 3T96B 1II5A 1MY0A 3U92A 3MW0A 3RNNA 4GF8A 3L6GA 3C34A 4F3BA 4IO6A 4EDPA 5AA3A 3BFUA 1A7LA 5DT6A 4ELQA 5ELVA 2DP8A 4DLDA 2Q8JA 2OCUA 5ICQA 4N6PA 1I6QA 2ALUA 1ZTYA 1DPEA 2LAOA 3KN8A 4DZ1A 3ONMA 3VVFA 1H44A 1FQAA 1LBCA 4PQJA 3PPNA 4G2ZA 3CIJA 2V84A 1FTMA 1PDAA 3H3GA 2F78A 3A3UA 5CBSA 4QF9A 5HBCA 1JETA 1DMBA 2H98A 3CSBA 1B3EA 1CE2A 1MH4A 4R9GA 2XXTA 4YKPA 3C4MA 1FTOA 3D4GA 3EN3A 2F6PA 4RJZA 4EQBA 1I6AA 1SW2A 1MXVA 4DXCA 5DEXB 2QSXA 5BUUA 1EZPA 5DVJA 5DVIA 2DE3A 3M3FA 3I6VA 4PFUA 2ONSA 1JEUA 3V89B 4YZZA 4KHZE 2RCBA 5DEXA 1QKAA 2AIXA 4JWYA 4LUBA 3G7WA 1N3XA 4AB6A 3PD9A 3W15C 3S4UA 1NFTA 3UP9A 3TDJA 3CVGA 3RT8A 4NWDA 1A40A 3FZVA 5ITPA 2CZLA 2VOZA 3F11A 1AOVA 1KWHA 2RKMA 5I58B 4KYEA 5CM6A 2UVJA 1JW1A 2NXOA 3IAZA 2YLNA 4EF1A 3GXAA 2HCAA 1R6ZA 4R2FA 2ONRA 3DP8A 1QUJA 2XHDA 1LAXA 3FV1A 3Q29A 2Y84A 1GV8A 4L17A 2H99A 2QRYA 1M5EA 1AL3A 3LSWA 3UIFA 3DELB 1MQIA 2F7CA 3O97A 5H8NB 4RYAA 4C1UA 4H65A 1AH5A 2UYFA 3BBRA 1Q35A 5KCJA 4XKNA 3GBAA 2M8CA 1ZIUA 5F7VA 2ZNUA 2R71A 3HHFA 3W9VA 2HEUA 2IA4A 2ABHA 3HPIA 2OWSA 3PD8A 2DQVA 4OFLA 2OLBA 4TQUQ 5CI5A 1MDQA 3QAXA 5FHNA 2DVZA 1POTA 1MXYA 3IB1A 3CFZA 3K1PA 1OLAA 1N0TA 4F1YA 4ZEFA 3TELA 1O7TA 3IR1A 4NF8B 3V83A 4MBPA 1MS7A 2O1MA 1BKAA 2F6GA 2VD3A 3SEYA 4R2BA 1MPBA 4LONB 1M5FA 2Y7PA 3Q25A 2XXVA 3ZKLA 2VGQA 3FD3A 3USDA 1B52A 1LFIA 1B9JA 1NNKA 3TPAA 4NF8A 2XXXA 3N5LA 4E0XA 1AIVA 4FEBA 2BJJX 4QSDA 3VLVA 5K2YA 4JWOA 1RKMA 3E3KA 4RNSA 3U93A 4Q8RA 3BKIB 3S9NC 1B2HA 5L9MA 4R6YA 4OFOA 3KFMA 4GXAA 3OOAA 5H8SA 3FXRA 2V3QA 3FJ7A 3PGFA 1QVSA 4ESXA 1RYXA 2DWIA 1XHYA 3IB0A 3T9VA 1NNFA 4RA1A 4ZE9A 1S7YA 3PV0E 5I57B 3C32A 3MAMA 1PBQA 2Q89A 3PUWE 4F31B 2WKYA 1F9BA 5JK4A 4BLAA 2GRVA 4GRKA 3U1OA 1GTKA 3K00A 4LZ8A 3M8UA 4NF6B 2A5SA 3FVGA 5I2KB 3MZ9A 4YU0A 2Z8EA 5I2NB 1US4A 2GHAA 2GFEA 3OMBA 3VVDA 4NF6A 2QMWA 1XC1A 3TTLA 1B5JA 2XXUA 1WDNA 1Y3NA 4ZEBA 4F2QA 2I4CA 1B3HA 1TXFA 4NMYA 3TTNA 3K1MA 1XVYA 2O6AA 4LZ5A 2R9JA 4JSDA 3KEIA 3RLFE 4MLVA 1Y4TA 4GFRA 3TCGA 3Q26A 1UTHA 4U21A 1P1UA 1M5BA 4XKPA 5H8QB 3LR1A 4OWDA 2OWTA 4ZEKA 5CMMA 1B3LA 1DPPA 2B3BA 4F29A 2O1LA 1QULA 1SD3A 2DS9A 1ELJA 3I3VA 3MP8A 1MPCA 4POXA 4GLIA 3QK6A 4H5FA 3W9WA 4AQ4A 3VE1B 2A5TB 1SYIA 2V93A 3LSFB 4DCXA 4O3CA 1MH3A 4ELOA 2QS1A 3KSXA 4R74A 1FTLA 2XXHA 3FV2A 4KD5A 3T66A 1B0HA 3OENA 1CB6A 1A54A 3G3JA 1URGA 1Z7NE 2PT1A 1OQGA 4R73A 4POWA 2D3IA 3E9XA 1SI0A 1NMUA 2QJEA 1P1NA 4WKMA 4BDLA 2ZNSA 3K6XA 2H5YA 2QS4A 1JQFA 3H6VA 2HZKA 3TZAA 3SEXA 2NUVA 4OQOA 2ZXTA 1B51A 3OO9A 4R75A 5I84A 3CR9A 4F3GA 1DTGA 1YCJA 5I59B 2XD3A 4FJPA 4QFKA 4R72A 4EXKA 4K3FA 4OEVA 1MG1A 1LSTA 2PYYA 4C1TA 4HW8A 1M5DA 4F19A 1SDXA 4FECA 1B6HA 1O63A 1XT8A 2O68A 5I59A 4YMBA 3C35A 3TTMA 1LAFE 3T9UA 4PP0A 3KN3A 2VP1A 4QFOA 4JWXA 3IJXB 4E0WA 3U8QA 2DE2A 5CMBA 4N13A 4KYSA 1GR2A 1LFGA 1B58A 1UIUA 2HAUA 3FJGA 4BDQA 4H5GA 3BFTA 5BWJA 2FYIA 4TLLB 2W7YA 4TOZA 3K02A 2Y7IA 2PMSA 5DYHA 4WEPA 1JW5A 4OENA 4H1XA 5K2XA 2D5WA 2O7IA 1Q1KA 1ZJLA 2F34A 1WVJA 1OMPA 2QL3A 4PFYA 4LZ7A 2XXWA 4UA8A 4DDDA 1P99A 5AA1A 3TTKA 3MVXA 2ANJA 2DWAA 4PE5B 2X7QA 3H7MA 2GHBA 4YICA 3O29A 1OQHA 2I0CA 2ZYOA 3A09A 3P7IA 4F39A 1WODA 4G8MA 3ODBA 2GH9A 4IO7A 4MF3A 4THIA 1YPNA 1TWYA 4GL8A 3LSXA 2E1SA 1B4HA 3EQ1A 4MLQA 4ISUA 5B7DA 2ZNTA 2Z23A 3HV1A 1MM6A 2HAVA 5IAIA 4XXUA 1HSJA 1SI1A 3HO7A 4G68C 3PMXA 1I6BA 4IO3A 5LOMA 2KLFA 1USYH 1DOTA 3V5AA 1TFAA 1OVBA 4YB6A 3TAJA 4OETA 2P2AA 1NL5A 1BIYA 2O69A 3VVEA 1BTJA 1MRPA 1Y3PA 3WAEA 5KCJB 1URSA 1IEJA 1B40A 2PX1A 4MFIA 2XXYA 4R6HA 4YKJA 1B3GA 4YB5A 4JDFA 3JYRA 5ICTA 2ONKE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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