1MQIA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fluoro-willardiine at 1.35 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords glutamate receptor 2
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqiA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqiA01
4Q0CA 1LSTA 2ZMBA 1R9QA 4EF2A 5FTIA 4LZ8A 5JTYA 1LBBA 4I62A 3N5LA 3N94A 2H98A 1VFDA 4OEVA 1NMUA 3SEWA 2F6PA 4R2BA 4KPTA 1US4A 1MXXA 5FTHA 3CI8A 3TELA 4OHNA 3PV0E 2RCBA 4K3FA 4ECFA 4NE4A 4DCYA 4H8IA 4LQ5A 1B52A 2QS1A 3IJXB 4JXIA 3QSLA 1OMPA 2AL4A 4GFRA 1RKMA 4LQ2A 4YB7A 4IB2A 3O66A 4YKJA 3MVYA 1MPDA 1MG1A 3KOSA 1B32A 4G8NA 2I3WA 5TPAA 3IK6B 1NFTA 4RPNA 1XOCA 3FJMA 4UACA 3DP8A 2V93A 1GVCA 3G7WA 4GVOA 1YTVA 3HO7A 5AA2D 1IXGA 2UYEA 4AB6A 3O6HA 1UTBA 3RPWA 2V3QA 4IO7A 5I56A 2HXWA 2O1LA 1MH3A 5A5XB 2F5XA 1LFGA 3E13X 5AA2B 3P7IA 1FTMA 4NTLA 3TTMA 4ELRA 3PPOA 1N04A 4PFYA 3S9MC 4KYDA 5HBCA 4F2QA 1KWHA 3Q28A 5I2NB 5DVJA 2QS4A 2D5WA 2X26A 5CMMA 3MVZA 3C9HA 1FQAA 3PPPA 2CZLA 2XXPA 4ELOA 1JVYA 1PB8A 4FJPA 4ZE8A 3B6WA 2F7CA 5DEXA 1S50A 1B3HA 3SEYA 4QSCA 3DP4A 1T0KA 1JEUA 4PP0A 3QUFA 3IAZA 1ZU0A 1MXVA 3MP1A 1IITA 3T9VA 4DXUA 3PUXE 2X7PA 2DWJA 3KOTA 4ZEKA 1WVJA 4H67A 4H1XA 4PFUA 4ZEBA 1B6HA 1FTJA 1Y20A 4KCCA 4P0IA 4IO5A 2RC8A 1ATGA 3LSFB 3O28A 4TLMB 2QMXA 1VSOA 4OFLA 1USYH 1UTHA 3OO6A 1MY4A 3SETA 5TP9A 3FVKA 4GRKA 2XXTA 4KFQA 5H8QB 1XVXA 4IY6A 4O3BA 1ZLQA 1DPPA 4ISUA 1B3FA 1NNFA 2DVCA 5AA1A 3E3KA 2FYIA 1JVXA 1AOVA 4JSOA 4QSEA 4NF5A 1IXHA 3PMWA 2F34A 4IO2A 4ESXA 3FGSA 4F22A 5I59A 1JNFA 3MPKA 4F3BA 1I69A 5JK4A 4NF8B 3IO4A 3KZGA 4U4XA 2DWHA 2I49A 1PB7A 3A3UA 3CG3A 3R6UA 3O2AA 4NWCA 2ZNSA 5KCJA 1TXFA 1IXCA 2DXRA 3OD7A 4O3AA 2DE4A 3RT6B 3PGFA 2I4CA 1A54A 1OVTA 4EQ9A 3OEMA 2DS9A 1B40A 2GHAA 1FQDA 3G3KA 1P1WA 2F35A 3Q25A 1CE2A 3O6IA 5AA3A 3OO7A 1URSA 1BP5A 1QKAA 5KDTA 4G68B 1MDQA 2HZLA 3G3IA 2ESNA 1PBPA 2A5TA 2OWTA 3VLVA 2D3IA 3IOUA 3U1OA 4F3GA 2OJTA 5B70A 4F2OA 3O6GA 1P1OA 2QL3A 3UP9A 1R6ZA 2O7UA 3M3FA 4P11A 1SI1A 4OMBA 5H8FA 4X1DA 2PBWA 2Q8JA 5F7VA 3I3VA 4RY1A 1A40A 2QMWA 3Q27A 3V83A 2H4IA 3HN0A 2AIXA 3GBAA 4M4GA 5JTYB 3B6QA 2QJEA 3W15C 4I9DA 2B3FA 1SW1A 4RXLA 3G3FA 1IUDA 3K6WA 3PPRA 4C0RA 1SQYA 2OCUA 3IX1A 3PMVA 1LAXA 4U4SA 4ELPA 3PUZE 3CFXA 3S9NC 5I84A 1SBPA 3SERA 3RN8A 1QVSA 3AXFA 1LFIA 1N3XA 1YPNA 1MXZA 3TMGA 4JB7A 4FEBA 3KG2A 2I6EA 2YJPA 4ZEFA 3ZS6A 5CRYA 4LA9A 3T9UA 5TPAB 2QS2A 1LAFE 3GBBA 5IKBA 4GIZA 3SESA 2QPQA 5F1QA 2Y7IA 2UVJA 5ICTA 1N7XA 1POY1 4RK2A 1UTBB 3R7XA 3PUYE 3TAJA 1ZJLA 4YZZA 5I56B 1M5EA 2GRVA 4R6KA 3MBPA 4PFTA 3KSJA 4MLQA 4O3CA 4WEPA 1SDXA 2XXYA 3MW0A 3EHSA 5DT6A 2NVUB 5M2VA 3GLBA 1CB6A 2IEEA 4MLVA 4C1UA 2FA7A 4RYAA 3V5AA 1MRPA 2V3TA 3BBRA 3PPQA 2ZNUA 2WKYA 4BDRA 3WAEA 1GV8A 3IR1A 2XD3A 3H4ZA 1FTOA 2H9BA 2VGQA 4QHQA 3K02A 4MFIA 2HZKA 3CSGA 3A09A 1N0TA 2XXVA 4G8MA 2NOOA 4NF6A 4P0GA 2I3VA 3H03A 5DEXB 1NKXA 2CMOA 4DXCA 4XKRA 3L6GA 4G68C 4WKMA 4OYVA 3C36A 3TFLA 1WODA 2HCAA 2Q2AA 1I6AA 3OO9A 1A99A 2G29A 1MDP1 4R2FA 1OQGA 1PB9A 1Y4TA 1ZBMA 3TCHA 1EZOA 3LSWA 2QSXA 5LOMA 1TFAA 1A55A 3MQ9A 2O6AA 4OXVA 1IEJA 2FNCA 1B0LA 1SYIA 1UTHB 4PFWA 4G77A 4YKKA 3TCFA 5TP9B 1MY2A 1ZTYA 2F36A 3MZBA 1ANFA 1XT8A 1XC1A 4JWYA 2VD3A 3FD3A 3OEKA 4Z7EA 3HPIA 1MPCA 5I2KA 3UGWA 3FXRA 1OQHA 4NF5B 1MXWA 1IQ7A 2Y7RA 3CSBA 4LVQA 4QRZA 3S4UA 1N76A 5I59B 4U1ZA 5I58A 1DSNA 1R1NA 5B7DA 2DSFA 1JW1A 3EHUA 1DPEA 1MS7A 1JW5A 1XHYA 3KEIA 5L9OA 4NWDA 3FUZA 2I0BA 3RLFE 3RUMA 5KCJB 3OMBA 1SD3A 1J1NA 4ESWA 3MZ9A 3H3GA 1D9YA 4JSDA 3FVNA 1IXIA 3ZKLA 3MC2A 5HM4B 3VVEA 1FTKA 2Y7KA 1QUJA 2RINA 2DWAA 2DOJA 5AA4B 1DMBA 5KDTB 4POXA 1B3EA 1MM7A 3MVXA 4EXKA 1D3KA 3S9EA 1PBQA 4OFJA 1SYHA 2HAUA 2A5TB 1JW4A 4YB5A 3N6TA 1GGGA 4YMBA 4YMAA 5CBSA 1Z7ME 3LR1A 5CM6A 2XXRA 2HEUA 3K1PA 3VV5A 1FQEA 3KBRA 4N07A 1ZKBA 3SDFA 4ZE9A 4RPOA 2AL5A 3OOAA 3CVGA 3VLWA 3MP6A 5H8FB 1LBCA 4X9TA 1AH5A 2XXQA 1ELJA 1FQFA 4UA8A 4HCYA 1O63A 3K4UA 1M5BA 3V89B 3FJ7A 1QKBA 2Z23A 4EQ7A 2Y7WA 3ECRA 1SI0A 1LB9A 4PETA 1RYXA 3VE1B 1B5IA 2Z8EA 2HAVA 1VFEA 3UORA 4BLAA 3PUVE 3IOTA 3UK4A 1DTZA 2AYSA 4OWDA 4YKPA 2DVZA 3PPNA 4N13A 1Y9UA 4DE8A 2F8DA 4XKQA 3PU5A 5IAIA 4F3SA 5H8HA 3E9XA 3G3JA 1QUKA 1Z7NE 3VLUA 4TOZA 2PT1A 4XTCQ 3TYHA 5ELVA 3CFLA 2NUVA 1L5TA 4KCDA 3T93B 5FHOA 4DZ1A 4ZECA 1RYOA 2RC7A 4GOTA 3FV2A 4H65A 1II5A 2UYFA 3TEPA 3HHGA 3QXMA 3CIJA 3JYRA 4ND9A 3G3HA 3IORA 5K2YA 4EQBA 4YKIA 3TQLA 3I5OA 3TCGA 4FIMA 4RNSA 3IO6A 2O84X 5AE4A 1EZPA 3H6UA 4QFKA 1XS5A 2V3UA 5AA4A 4AQ4A 4OEUA 4KI0E 3C31A 2XX9A 4RA1A 1B4ZA 4NF6B 2GH9A 3UA8A 3Q26A 4MH5A 1I6BA 3VDFA 4ZDMA 2VOZA 4U22A 4LP2B 4GF8A 3N26A 1Q35A 2GHBA 4I8CA 3V8XB 3F11A 3H7MA 1B7ZA 1PDAA 4DIGA 4R74A 1LCTA 1P1UA 3PD9A 3MUQA 1B05A 3TPAA 2V25A 2F6GA 1OVBA 3M3LA 1Y1ZA 1MH4A 1Y3QA 5I57A 4RJZA 4KD5A 2VHAA 2REGA 3K00A 3R26A 4R72A 4TQUQ 3OO8A 2UVHA 5CMBA 2XXWA 1DTGA 1VE4A 1ZIUA 5BUUA 3UIFA 3WAFA 2XXIA 1UIVA 4XXUA 3N6UA 4H0WA 4GXSB 3DLNA 3E4RA 4F18A 4HS7A 1POTA 1JEVA 5DTBA 3RY3A 1LAHE 5I2KB 3FZVA 3EHTA 1EH3A 4KYEA 1B0HA 1OIBA 2I0CA 2O68A 3KJTA 1B7UA 3T9XB 3U94A 5I58B 4IO3A 1B51A 5J1DA 1WDNA 2XX8A 3MJNA 2X7QA 5K2XA 2NWJA 2H99A 3FVGA 3TTNA 1SW4A 2R71A 3MWBA 4F29A 1FTLA 1I6QA 4QFOA 1IZ1A 1N3WA 2XXXA 3TTRA 3RGYA 4C1TA 3K2DA 2M8CA 4Q5TA 4KR5A 3Q29A 3BKIB 3RTFB 3RTWB 1OLCA 1BKAA 3KSXA 3T96B 4FECA 2ZYNA 1O64A 3FV1A 4DCXA 2VP1A 4IO4A 3KN8A 4R73A 2H5YA 3TTLA 1B5JA 1PEBA 4IGTA 4H6DA 1GR2A 4KYSA 2Y84A 4NEDA 1R9LA 2ALUA 4OETA 3TQWA 4JWOA 1A7LA 4R6HA 2Y7PA 2E1SA 4QSDA 4OERA 1JETA 5DVIA 1NNTA 4R6YA 3IB0A 3KN3A 3GXAA 4U1OA 4Z0IA 3W9WA 4I1DA 4PQJA 3U72A 2O1MA 3ZKKA 3FATA 1FQBA 4YICA 3SEXA 4XKPA 2ABHA 3RNNA 3SEUA 2QRYA 4U23A 4FE8A 2GFEA 1Y3NA 4U21A 3KN7A 3FIRA 1H43A 4TLLB 2P2AA 3K0VA 1QULA 5DYHA 3TZAA 3C34A 1AMFA 1MY1A 4ZEDA 4GL0A 4GQOA 4PE5B 1FCKA 4POWA 4NF4A 2E0SA 4R9FA 4BDOA 3CFZA 3MP8A 4JDFA 2VD2A 5H8NA 1F9BA 4GWOA 1Y3PA 5TU0A 2RC9A 5EHMA 5H8HB 3OENA 2R6GE 3TDJA 2PT2A 1M5DA 3T66A 4LATA 2Z8DA 4F1YA 3K01A 3OELA 4OTEA 4R9GA 1BTJA 1AIVA 1US5A 3FXUA 4WEDA 2DE2A 4MBPA 2YLNA 2ONKE 1NNKA 2UXAA 1N7WA 1TFDA 3PD8A 1P99A 2XXUA 3SEVA 4HTGA 1H76A 3O97A 3C35A 3LBSA 2XD2A 2I4BA 2F78A 1D4NA 4HW8A 1Y1MA 5CMCA 1MM6A 2F97A 3HSTA 1H44A 2QS3A 5CMKA 5CI5A 4M1VA 2H25A 3EPEA 4EF1A 4XKNA 1LAGE 3BFUA 3FXQA 4ZZEA 1EZ9A 3M3KA 4H8JA 2LAOA 4H5FA 1NH8A 2Q9TA 3OSQA 4ZS9A 4MF3A 1B3LA 5EYFA 3JZJA 4QFNA 3LUYA 3HV1A 3QYTA 4BDLA 1LFHA 3ODBA 4F31B 4DXBA 3H6TA 1D9VA 1JQFA 1XVYA 4FEDA 3TTKA 1LGBC 3ILUB 1PC3A 3A3CA 1IIWA 1H3DA 4R75A 4FAJA 5DVFA 2UVGA 1OLAA 5ICQA 1B46A 1EU8A 2ONSA 2DWIA 2IA4A 2DYXA 3JV9A 3QK6A 1Q1KA 3K6UA 2DP8A 3K6XA 3TKDA 5HPQA 5I57B 1Y4CA 4F39A 3IJOB 3L6HA 2Q88A 3LC8A 5L8DA 1B7HA 2R9JA 1M5CA 1B9JA 3G3GA 2OBGA 1LB8A 1MXYA 5H8SA 2XX7A 4GL8A 4DDDA 4F19A 2OZZA 4JBZA 5JEIA 1MY0A 4G2ZA 2O51A 5FHMA 3ZSFA 3U93A 3U92A 1DOTA 2I48A 1TT1A 4BDMA 3IL1B 3CR9A 1NH7A 2PYYA 2W7YA 5L9MA 2XHDA 3QIMA 2REJA 3VFJA 3M8UA 4QFLA 3DP6A 2XXHA 3PMXA 2ZXTA 2ZNTA 4LZ7A 3KJ7A 4AB5A 4OENA 3QUJA 3W9VA 1TWYA 3QAXA 5ITOA 4ONYA 2HFBA 1S7YA 1QJMA 3THIA 2PX1A 3H06B 2P1SA 3FASA 3ONMA 3I6VA 2NXOA 4BDNA 4BDQA 2OK2A 1GTKA 2OLBA 1MQHA 3VVDA 3B7DA 1N84A 3T22A 1B4HA 4YB6A 4Q8RA 1QUIA 2PVUA 4EXLA 4JWXA 4OESA 1NNPA 3LSLA 2OWSA 3T9HB 3MAMA 4N6PA 2PMSA 1LCFA 2ZYMA 1NL5A 2O7IA 3B6TA 5A5XA 4HCWA 4G4PA 3UN6A 3DM0A 1FW0A 5AA2A 2RF1A 4F3PA 1URGA 1MY3A 1SVXB 5ISUA 1B1HA 4LONB 2I58A 4EDPA 3O9PA 3GZGA 2BJJX 3OSRA 1MQIA 3S9LC 3CRBA 1S9TA 5FHNA 3LSXA 3MVWA 5EHSA 5I2NA 1UQWA 4IO6A 5CBRA 4Q30B 1B5HA 4GD5A 3U8QA 3IB2A 3ILTB 5ITPA 4IGRA 3HHFA 4NF4B 3KGCA 4L17A 5H8NB 1BLFA 3KFMA 5BWJA 1MQDA 3IOWA 2UVIA 1B2HA 1HSEA 1A8EA 5KZTA 2RKMA 2ZYOA 1B1XA 2F7BA 3EQ1A 3FJGA 4KQPA 4OZ9A 2Q89A 4U2RA 3MZ1A 3S2VA 4EUOA 3USDA 4GXAA 4THIA 4YU0A 4NMYA 1MPBA 2HQ0A 3K1MA 2Z8FA 1UIUA 3EF7A 3IB1A 3RQTA 1SW5A 4XIGQ 4ZZAA 1B3GA 3K6VA 1P1QA 4IY5A 1LLSA 3HCQA 1H45A 3RT8A 3D4CA 5H8QA 3VVFA 3TODA 2V84A 3C32A 3CG1A 3MPLA 5CC2A 3H6VA 3EN3A 4KHZE 4QF9A 4FORA 4OVJA 4OQOA 1HSLA 4X1BA 3BFTA 4WXJA 4GLIA 1USYE 4ZEIA 2D21A 2O69A 4RK9A 3H6WA 1P1NA 2Z22A 2RCAA 1ZMGA 4LZ5A 4NF8A 2DQVA 2B3BA 1MQJA 4F1UA 2DE3A 3VXCA 1YCJA 1QW0A 1MQGA 1YAEA 2G93A 2ANJA 1SW2A 3C33A 4G8HA 3C4MA 4ELQA 3FVOA 4OFOA 3IOVA 1URDA 1O7TA 4DLDA 2B65A 3SKPA 1FQCA 3DELB 1A8FA 1VR5A 4X48A 3VXBA 2ONRA 3OXNA 4G68A 1M5FA 4H5GA 4QFPA 2KLFA 2YPNA 3TUSA 4YAHX 5L9SA 4E0XA 3K1NA 4FATA 1HSJA 3D4GA 4F1VA 4LUBA 2Q2CA 3PUWE 2F7AA 2DXYA 1MXUA 2P0SA 3O29A 1BIYA 1AL3A 2A5SA 2THIA 1B58A 4E0WA 2ZYKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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