1MQIA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with fluoro-willardiine at 1.35 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqiA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqiA01
4KHZE 3Q28A 1B3HA 3VXBA 3ODBA 3TTKA 2HFBA 4XKPA 3QIMA 1UIUA 1B51A 1MXUA 2O7IA 1LCTA 2HQ0A 2OWSA 4PFTA 4ELPA 3HCQA 1JNFA 4OFOA 5I58A 4BDMA 1MPDA 3K1PA 4NEDA 1NNFA 4OETA 1MPBA 5I56B 3K0VA 2ZYNA 5KCJA 2RC8A 5L9SA 1XS5A 4IGRA 1ZMGA 2E1SA 4KYDA 3U92A 3FXQA 3HHFA 2QMXA 2H25A 3B7DA 1ANFA 4H5GA 4QSCA 2OJTA 3OD7A 3V8XB 3C35A 4KR5A 1YPNA 2O1MA 1PB8A 1AL3A 4WEPA 4P0IA 3R7XA 2O51A 2HZLA 2VHAA 5F1QA 1Y1ZA 3IB1A 1NL5A 3D4GA 3AXFA 1SW5A 3G3KA 2P2AA 5K2YA 4ELOA 1OQGA 2ZNSA 5I59A 1LAHE 1US5A 3FUZA 1MY4A 2KLFA 2XHDA 4EDPA 4DIGA 2UVIA 3CR9A 3UK4A 1LAGE 4L17A 5HBCA 2ONKE 4N6PA 2X7PA 3QAXA 3TODA 4N07A 4F2OA 1B0LA 2AIXA 3FD3A 2G93A 3LC8A 1ZKBA 3GBAA 1P1QA 2OWTA 2V3UA 2I58A 5DVIA 4TOZA 4XTCQ 3IB2A 4GL0A 3OELA 1DTGA 4DE8A 3WAFA 2Z8DA 3A3UA 4X9TA 3MVXA 4X1DA 1JVXA 3B6QA 4AB5A 2F5XA 3TCHA 4ND9A 4OTEA 4LZ5A 1ZIUA 5CC2A 1BTJA 2RF1A 2Z23A 3O29A 4H67A 4F22A 4DLDA 4WKMA 4U1OA 4OFLA 2ABHA 1QUJA 2YPNA 3U93A 4RK2A 3W15C 3KBRA 3MAMA 3TYHA 1HSJA 3VVFA 3U72A 1USYE 1A8FA 2XXXA 1N76A 3FGSA 5AA4A 2O68A 3FIRA 2QPQA 4XKQA 4ZZEA 1QW0A 4RXLA 1POY1 3VFJA 3OEMA 2F36A 4YAHX 3U94A 4JSOA 2ZYMA 4XIGQ 3E4RA 4R72A 2YLNA 3QUJA 1M5DA 1URGA 3ZS6A 2F97A 2R71A 3O6IA 1FQBA 3EHSA 4JWXA 2XXPA 3FXUA 5I2KB 2XXWA 4KI0E 3PPPA 3WAEA 5F7VA 3JYRA 5DVFA 5H8SA 4FEDA 3T96B 4H8IA 3TQWA 3VXCA 1MXYA 3IR1A 4E0XA 1MY3A 2F34A 2X26A 4Q5TA 2XX7A 3IAZA 4IGTA 5ELVA 1XVXA 1TFAA 4POXA 1B05A 4R75A 4ZE9A 4QFPA 1AMFA 1PBPA 3DM0A 3T93B 1POTA 3TAJA 3IORA 1XT8A 3R26A 4GFRA 4U21A 1ZJLA 1N0TA 3CI8A 3HV1A 4PQJA 3H06B 2DP8A 3K02A 1D3KA 4OEVA 5TPAA 1ZBMA 4QRZA 3T9HB 3K6XA 4U1ZA 4NF6A 3MUQA 3FVNA 5EHMA 2O1LA 3B6TA 3RT6B 5L9OA 1LCFA 3TTNA 3UA8A 2ZMBA 4HW8A 4FE8A 4GQOA 2QS2A 4YMBA 1F9BA 3PPRA 5DT6A 2Z22A 1CB6A 4LP2B 5I58B 4OVJA 3FASA 4ZEFA 3W9WA 5EYFA 1Y4CA 5JEIA 1P99A 2RKMA 3N94A 5FHMA 4FATA 3H6UA 3VVDA 4OESA 2UYEA 5KCJB 3CFZA 4G77A 4BDOA 3SEYA 4QFLA 4PP0A 4QFNA 5IKBA 5ICQA 4OFJA 4QF9A 4THIA 1LAXA 1NNPA 1NNKA 3OSQA 4RK9A 1QKBA 1B3FA 1DOTA 2RCAA 4O3BA 4X1BA 1MQHA 3T9XB 1ZLQA 2A5SA 2W7YA 3G3IA 5I84A 4K3FA 5J1DA 3PMVA 3S2VA 1MXVA 1D9YA 4R6KA 4EXLA 1Y3NA 3I5OA 1DPEA 3GBBA 1D4NA 5I59B 1SDXA 1S7YA 3DP6A 4IO4A 3G7WA 1D9VA 2H99A 3PMWA 4RNSA 1MXZA 1XC1A 3MQ9A 3MZBA 1MQJA 1B5IA 2GH9A 3FVGA 1XVYA 3BFUA 1M5EA 1LBCA 1MQDA 1P1NA 3TQLA 4MFIA 4P0GA 4OYVA 1LSTA 4QFKA 4NF5A 5I2KA 4FECA 3O28A 1H44A 2UVGA 1Y20A 4H0WA 5DYHA 3IJXB 4HTGA 3K01A 1HSLA 3N26A 3FJMA 1IXHA 4OERA 2GHAA 3RGYA 1UQWA 2GFEA 3S9LC 2ONSA 2HAUA 4N13A 2V25A 2ANJA 1Q35A 5LOMA 3TCFA 1R9LA 2XXTA 3FJ7A 1JQFA 4PFWA 4YICA 3OSRA 2A5TA 5CRYA 3MPLA 1OMPA 1T0KA 5AA4B 3KN8A 3C33A 3ONMA 5H8HA 4M1VA 4QFOA 4UACA 4OEUA 3LUYA 4G8MA 2Y7KA 4C1UA 4ESWA 4DCYA 1B3GA 3VV5A 4FAJA 4I62A 4RPNA 4F18A 4GIZA 4I8CA 3SEUA 3S9MC 3RUMA 2DVCA 4MLVA 4YKJA 1SW1A 3MZ1A 3K00A 1FQAA 4NF4B 4R6HA 2HCAA 3TMGA 4FIMA 4KFQA 4DZ1A 1A99A 4R2FA 3N6TA 1LGBC 5AA2D 3DP4A 4WEDA 4IY6A 3VDFA 5DTBA 1N7WA 3ZSFA 4YU0A 2REGA 3VVEA 2D3IA 1VSOA 5M2VA 3PUWE 3LR1A 2NXOA 4F2QA 1JEVA 3I6VA 1ATGA 4JWOA 5ITOA 3IL1B 1I69A 3F11A 1MM7A 2V3TA 3MBPA 4IY5A 4R74A 2H98A 5AA1A 5TPAB 3PD9A 1FTMA 3G3GA 5CM6A 3RPWA 1FCKA 1N7XA 5JK4A 3UN6A 4NF6B 1MS7A 2Y7PA 5FTHA 4F3SA 2I4BA 1P1UA 5EHSA 4EF1A 2ESNA 1WDNA 1FQCA 2B3FA 2HZKA 3KG2A 1SQYA 3IOVA 5L9MA 3DELB 2DE2A 1J1NA 2H5YA 3H6WA 2BJJX 5B70A 2AYSA 2WKYA 3SETA 3GZGA 2UXAA 3FJGA 4BDNA 4YB7A 1VR5A 1M5CA 4HS7A 3ILUB 5I57A 3TZAA 2IEEA 2Q2CA 5HM4B 4MH5A 2GRVA 5TU0A 3M3FA 3MJNA 2QS4A 4RYAA 3JZJA 2UYFA 3E3KA 4QHQA 1FTKA 1R9QA 3OO8A 3GXAA 4TLLB 4OWDA 4OHNA 4U4SA 1B7ZA 2THIA 4H65A 2F35A 4F29A 3R6UA 1NH8A 2FA7A 4E0WA 3TCGA 3UIFA 4DXUA 3QSLA 3K4UA 4KCDA 4JB7A 4LQ2A 1IIWA 5CI5A 2B3BA 5L8DA 3U1OA 4OENA 3SERA 3CFXA 1OVTA 4G68C 3IOTA 3H7MA 3PPOA 1JVYA 4QSDA 3MP8A 4IO7A 4F1UA 5B7DA 2I0BA 4PFUA 3E13X 3OENA 4NF5B 3H3GA 4DCXA 2Y7WA 1DPPA 4NF4A 3TTLA 3LSWA 4YB6A 4X48A 4JWYA 1A7LA 2QMWA 2R6GE 5CBSA 1SW4A 4GOTA 2H9BA 1MXXA 2E0SA 1B1HA 4R73A 1MY0A 5DEXA 4NTLA 3VE1B 1IQ7A 3TEPA 1IXGA 3O6HA 4ECFA 3PUYE 2QS3A 1OQHA 4U2RA 1Z7ME 1GTKA 2I49A 1WODA 3CSGA 2OCUA 3Q25A 4R9FA 1MDP1 2A5TB 3BFTA 3TTMA 5K2XA 5H8HB 1QUKA 4YMAA 3G3HA 3KSXA 4JBZA 1Y1MA 2LAOA 3S9NC 2AL4A 3THIA 1EZPA 4KQPA 3O97A 1FTLA 4YKIA 3FV2A 2FYIA 3EPEA 1FQDA 1AH5A 1HSEA 1Y3PA 3M3KA 4GWOA 4GVOA 2XX8A 1CE2A 5DVJA 1FQFA 3HPIA 3V83A 4U4XA 3MW0A 4F1YA 1SBPA 2ZNUA 3CG3A 4YZZA 2DXYA 2D21A 2F7BA 2O69A 4RA1A 2PYYA 4PFYA 1O7TA 3RQTA 2XXUA 2UVJA 3M8UA 5TP9A 2FNCA 4LVQA 1NNTA 1H3DA 1DMBA 4F39A 4Q8RA 2DQVA 2F8DA 1SYIA 1B7HA 1IXCA 1QULA 4U23A 2RC9A 1XOCA 2ZXTA 3VLUA 3K6VA 1AIVA 2DE4A 4KPTA 3KEIA 2XXRA 4AB6A 3A3CA 2DWJA 2XD2A 3B6WA 2DXRA 4DXCA 1MQIA 3OMBA 2REJA 4R6YA 1QUIA 1LLSA 3LBSA 3O66A 4ELRA 1BP5A 3TPAA 1B46A 1B40A 2P0SA 3KSJA 4LZ7A 3RLFE 2PT2A 4G8NA 2NUVA 4ZEKA 3V5AA 3V89B 3QXMA 3IX1A 2XXHA 1TT1A 4PETA 4YKPA 3Q26A 3MPKA 3KZGA 5JTYA 5AE4A 2O6AA 3FVKA 1GV8A 5CMMA 2OBGA 2QL3A 3IK6B 4EXKA 1LB8A 2VOZA 1XHYA 3RTWB 2OZZA 1ELJA 3UORA 4G68A 1TWYA 2XXIA 5I57B 1AOVA 1B5HA 4QSEA 5CMBA 5BWJA 4MLQA 3QK6A 1URDA 4NE4A 1MY2A 1LAFE 5HPQA 1NFTA 3RNNA 1GGGA 4ZE8A 1Y3QA 3S9EA 3KJTA 1UTBA 3EHTA 1UTHB 4NMYA 4YKKA 2XD3A 5ISUA 5KDTA 2Z8EA 5A5XB 2HEUA 5I2NA 5AA3A 1MQGA 2F6PA 3EN3A 1LBBA 2DS9A 1IITA 2Z8FA 3O9PA 4I1DA 1ZTYA 2DOJA 1JEUA 1A54A 4RPOA 4IO2A 2I3VA 5CMKA 3OXNA 1MDQA 2Y84A 3K6UA 1A8EA 1B58A 1USYH 4IO5A 1JETA 4XXUA 2GHBA 4OMBA 2OLBA 5H8NA 4ZEDA 3MVYA 1B52A 4EQ7A 3IB0A 1YTVA 3C34A 4IO6A 3FV1A 1Y4TA 4I9DA 4IB2A 2Y7RA 3I3VA 3CG1A 5DEXB 1PB9A 3MWBA 1B3EA 1P1WA 1FTOA 3U8QA 3TELA 1B7UA 4FORA 4C1TA 3T22A 4XKNA 3RTFB 2PMSA 3PGFA 4EQ9A 4LA9A 2NOOA 3IOWA 1PC3A 2OK2A 4LZ8A 3TFLA 4PE5B 3GLBA 1EH3A 1MY1A 3MP6A 2XXYA 3VLWA 2ZYKA 3KJ7A 4ZS9A 1SI1A 1OLCA 5H8FA 2F78A 3HO7A 2F6GA 3DP8A 4MF3A 3SEVA 1N84A 3LSLA 4GL8A 4ESXA 2DWIA 3LSXA 4U22A 1B3LA 1Z7NE 3EF7A 1MG1A 5CBRA 1TFDA 1FW0A 3UP9A 1EZ9A 1LFHA 1II5A 2UVHA 3OO7A 4F1VA 1WVJA 5TP9B 3FVOA 4ELQA 1Q1KA 1BIYA 3C4MA 2RCBA 2I3WA 2PX1A 1S9TA 1R1NA 2ONRA 4RY1A 2O84X 5H8QA 3TDJA 4H6DA 4GF8A 3FATA 4O3AA 1A55A 3SDFA 4H8JA 1YAEA 3K1NA 1IXIA 1OIBA 1I6AA 3KOSA 1M5FA 2I4CA 3PUZE 1RYOA 4M4GA 3H4ZA 4ISUA 1L5TA 2G29A 3Q27A 3K6WA 1NKXA 4H5FA 4ZZAA 3OO9A 3OO6A 1QVSA 1US4A 1JW1A 1SD3A 2VD2A 4GXAA 2XXQA 3KN3A 3H6VA 3K1MA 4NF8A 4Z0IA 1UTHA 4BDRA 4KYSA 4JDFA 3C31A 3HHGA 1RYXA 2DE3A 3ECRA 1OLAA 4G2ZA 4RJZA 5A5XA 1BLFA 2H4IA 1B0HA 4ONYA 2X7QA 5JTYB 4BDQA 1B6HA 2HAVA 1S50A 5AA2A 1B4HA 4GLIA 2V3QA 2Q2AA 3ZKKA 2V93A 1UIVA 4F19A 2O7UA 3PUXE 4MBPA 4LONB 2XX9A 5FHNA 4HCYA 1QJMA 1OVBA 2PBWA 2V84A 3C9HA 4TQUQ 3Q29A 3UGWA 4G68B 1I6BA 3VLVA 2QJEA 1FQEA 4H1XA 4NWDA 3KOTA 3OEKA 3IO6A 3O2AA 1H43A 3O6GA 3H03A 2QSXA 1B9JA 4GXSB 3T9VA 2RINA 4EUOA 4C0RA 1FTJA 1LFGA 3CIJA 1O63A 5I56A 3SKPA 1UTBB 2RC7A 2DSFA 4EQBA 5FHOA 4BDLA 5KDTB 4TLMB 3QYTA 3CSBA 3CFLA 4POWA 4F3GA 1LFIA 1MPCA 3C36A 5I2NB 5BUUA 4G8HA 3RN8A 2Q88A 4KYEA 4HCWA 3SEWA 1ZU0A 4FJPA 4OXVA 3DLNA 1JW5A 5IAIA 4G4PA 1P1OA 3OOAA 1B2HA 5FTIA 3E9XA 3P7IA 4JSDA 3S4UA 1B32A 2B65A 2AL5A 3KGCA 5H8NB 4ZEBA 3MVZA 3TTRA 2P1SA 3T9UA 4KD5A 4R9GA 4WXJA 4LQ5A 3USDA 3FZVA 2ALUA 2QRYA 3W9VA 3RY3A 3H6TA 1DSNA 1BKAA 5ICTA 3PUVE 3PV0E 4Z7EA 4ZECA 1B1XA 1MH3A 2ZYOA 3FXRA 4DDDA 3QUFA 1Y9UA 3PPNA 2DYXA 1DTZA 2NVUB 1QKAA 3PU5A 1TXFA 2QS1A 1R6ZA 1URSA 1N3XA 3CVGA 3PD8A 2ZNTA 5H8FB 3MC2A 3D4CA 2M8CA 3T66A 1KWHA 2Q8JA 3N6UA 1EU8A 1N04A 3IOUA 1B5JA 1LB9A 1SI0A 3SESA 4EF2A 3K2DA 1MRPA 3TUSA 1NH7A 3C32A 1JW4A 1VE4A 3TKDA 2R9JA 3G3JA 3IO4A 1MM6A 1GR2A 3MZ9A 1SVXB 3M3LA 1A40A 2F7CA 1GVCA 1PEBA 1I6QA 3KN7A 3RT8A 4GD5A 4ZEIA 2IA4A 4JXIA 2CMOA 2I0CA 1O64A 5H8QB 1B4ZA 2CZLA 1RKMA 1H76A 3G3FA 2VP1A 5KZTA 2I48A 1MXWA 2Q89A 2D5WA 1MH4A 4AQ4A 2Q9TA 4GRKA 3L6GA 1SYHA 2VGQA 2VD3A 1M5BA 2YJPA 3N5LA 3ILTB 4ZDMA 3JV9A 1IZ1A 3ZKLA 4OZ9A 4YB5A 1H45A 3IJOB 1EZOA 1YCJA 4F3PA 1IUDA 3MP1A 3BBRA 3CRBA 4NF8B 4P11A 2I6EA 3HN0A 2XXVA 4KCCA 3L6HA 1PDAA 2DVZA 4F3BA 1SW2A 4NWCA 3SEXA 4FEBA 3PMXA 3KFMA 4LATA 1N3WA 5AA2B 4R2BA 4IO3A 4O3CA 2DWHA 4OQOA 4UA8A 2F7AA 2NWJA 1PB7A 4DXBA 4BLAA 1PBQA 2DWAA 4F31B 4Q0CA 2Y7IA 5ITPA 3PPQA 3HSTA 2PVUA 3A09A 3LSFB 2PT1A 5CMCA 3EQ1A 1NMUA 1VFDA 2HXWA 4XKRA 4Q30B 1IEJA 4LUBA 3BKIB 3EHUA 3MVWA 1VFEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4KHZE 3Q28A 1B3HA 3VXBA 3ODBA 3TTKA 2HFBA 4XKPA 3QIMA 1UIUA 1B51A 1MXUA 2O7IA 1LCTA 2HQ0A 2OWSA 4PFTA 4ELPA 4NG7A 3HCQA 1JNFA 5ET7A 4OFOA 5I58A 4BDMA 1MPDA 3K1PA 4NEDA 1NNFA 4OETA 1MPBA 5I56B 3K0VA 4AS4A 2ZYNA 1DK4A 5KCJA 2RC8A 5L9SA 1XS5A 4IGRA 1ZMGA 2E1SA 4KYDA 3U92A 3FXQA 3HHFA 4HE0A 2QMXA 2H25A 3B7DA 1ANFA 4H5GA 4N15A 4QSCA 2OJTA 3OD7A 3V8XB 3C35A 4KR5A 1YPNA 2F3BA 4P8BA 2O1MA 1PB8A 1AL3A 4WEPA 4P0IA 3R7XA 2O51A 2HZLA 2VHAA 5F1QA 1Y1ZA 3IB1A 1NL5A 3D4GA 3AXFA 1SW5A 3MSTA 2HXRA 3G3KA 2P2AA 5K2YA 4NN3A 4ELOA 1OQGA 2ZNSA 1K9ZA 5I59A 1LAHE 1US5A 3FUZA 1MY4A 2KLFA 2XHDA 4OVSA 4EDPA 4DIGA 2UVIA 3CR9A 3UK4A 1LAGE 4HE2A 4L17A 5HBCA 2ONKE 4N6PA 1NUXA 2ZZWA 2X7PA 3QAXA 3TODA 4N07A 4PC9A 4F2OA 1B0LA 2AIXA 4OVQA 3FD3A 2WX9A 2KR0A 2G93A 3LC8A 3BIHA 1ZKBA 3GBAA 1P1QA 2OWTA 2V3UA 2I58A 5DVIA 1Q9DA 4TOZA 4XTCQ 3IB2A 4GL0A 3U65A 3OELA 1NUYA 1DTGA 4DE8A 3WAFA 2Z8DA 3A3UA 4X9TA 3MVXA 4X1DA 1JVXA 3B6QA 4AB5A 2F5XA 3TCHA 4ND9A 4OTEA 1YXIA 2QFLA 4LZ5A 2GQ1A 1ZIUA 5CC2A 1BTJA 2RF1A 2Z23A 3O29A 4H67A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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