1MQJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with willardiine at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule keywords glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA01
5KDTB 4JB7A 1M5EA 3A09A 2RF1A 2O1MA 1KWHA 1VE4A 2F5XA 1EU8A 2NVUB 2Y7RA 3KFMA 1MH3A 1P99A 5DYHA 3AXFA 5TPAB 1AOVA 4LVQA 3C35A 3IOUA 5H8QB 2W7YA 1YCJA 4YMBA 1O64A 4HCWA 2ONKE 4DXBA 3DP8A 2RC9A 4RYAA 3MZ1A 4YKKA 5A5XB 3KSJA 4C1UA 2XXRA 2ABHA 3O28A 2DS9A 3DELB 4LP2B 2GRVA 2H4IA 1M5CA 3T9HB 1ZKBA 3FVNA 2XHDA 1HSEA 3OMBA 4RNSA 4POWA 1QKBA 3U92A 4ESXA 2NXOA 4X9TA 4E0XA 1XHYA 4OTEA 3RN8A 4NTLA 4GXSB 4TOZA 4R75A 5ITPA 1QUKA 1MXYA 5JK4A 5I2NB 4KD5A 1WODA 3ILUB 2RKMA 2X26A 4PFUA 1JEUA 4IY5A 4QSDA 1BKAA 3JYRA 1SYIA 5H8FA 1IXHA 4PFWA 4BDRA 4ZEIA 1R6ZA 1I69A 4EXLA 4R73A 1A7LA 4RA1A 3VLVA 3MZ9A 2Z8DA 1MQHA 3PV0E 4ZDMA 2ZYKA 2P2AA 2AL4A 3KJ7A 5I59B 2PYYA 3PUXE 1LAFE 2O68A 3IO4A 1B52A 1B9JA 4EDPA 1FTKA 1Z7NE 4KFQA 3H4ZA 3E4RA 2B65A 1LSTA 1N7WA 1URGA 2HQ0A 4DZ1A 4PQJA 4E0WA 1B7HA 5J1DA 3T22A 3HCQA 1NNFA 3RPWA 1ZJLA 3TPAA 1B3EA 1B4ZA 2O51A 1N76A 3Q25A 1R9QA 1P1QA 3R7XA 1MQJA 1POY1 1B3GA 2O6AA 3RY3A 5DEXB 4LUBA 2Q8JA 3S9NC 4YU0A 1JW1A 5DEXA 3ZSFA 4KPTA 4TQUQ 1LB8A 2XD3A 4U1ZA 3V89B 1TT1A 4YB7A 4H65A 3H7MA 1ZIUA 4OXVA 4XKPA 2A5TA 3K6VA 1MM7A 1PB8A 4JWXA 2KLFA 3IJXB 1R9LA 4ZECA 4X1DA 5H8HB 1UIUA 1FTOA 3IOVA 4WKMA 4U23A 1MXZA 4JDFA 5L9OA 1N7XA 1II5A 1NKXA 4GFRA 3A3UA 4BDMA 3K00A 3L6HA 4R6HA 3KSXA 3OENA 4OETA 3TKDA 1PC3A 3MVZA 3DP4A 1YPNA 3WAFA 2DSFA 4YKIA 3CFXA 2OCUA 3GXAA 4LATA 1TWYA 1QKAA 1B40A 5L9MA 1ZLQA 1S50A 2FNCA 1Q35A 3HSTA 4OYVA 3IB1A 4H8JA 3I5OA 1MPCA 2H25A 2XXTA 5EHMA 3TFLA 3USDA 1WVJA 1OIBA 4R9FA 2UVIA 1ZTYA 2VOZA 2F78A 1POTA 4JXIA 1B0LA 4F3GA 4BDLA 1FQAA 4PETA 2NUVA 4IO3A 1FTMA 5ITOA 1NNTA 5CMCA 3TEPA 1H76A 1CB6A 3FIRA 2IA4A 2ZNSA 4G8MA 2PBWA 1FCKA 4ZE8A 4OZ9A 4NF5A 1CE2A 1Y4TA 1A54A 1SI1A 3Q29A 2YLNA 2QSXA 3HHFA 3H6TA 2B3BA 4G68A 3PGFA 2AYSA 2QS4A 1SVXB 1M5BA 4GL0A 3KEIA 2V3TA 1SBPA 2F7AA 2P0SA 3UIFA 1BIYA 3PD9A 4OERA 3OOAA 2RINA 1H3DA 3TTKA 4NF4A 2XXXA 2OBGA 4M4GA 4ISUA 1B32A 4JWYA 1P1OA 2XX8A 2I3WA 4NF6B 4NEDA 1SI0A 2Y7KA 3S4UA 1B3HA 4GWOA 1YTVA 1J1NA 3MP8A 5DT6A 2I6EA 4Q30B 5ICTA 3VVEA 2HAVA 2GHAA 1Y4CA 4DCXA 4R2FA 5KCJA 2RCAA 1UTBA 3OO7A 4N07A 4I9DA 2PT1A 2CMOA 3IOWA 3U8QA 4F3BA 4ZE9A 4DXCA 4U22A 1RKMA 2HZLA 3B7DA 4XXUA 4KCDA 4P0IA 4DE8A 4F2OA 3IX1A 2R9JA 5KZTA 1NMUA 2DE2A 2ZYNA 1B05A 4X1BA 2Y7PA 4LONB 3C34A 3LSFB 3CG3A 2ALUA 2ZMBA 2F6PA 1OLAA 2AIXA 4R6YA 3TCGA 1N3WA 2ESNA 1QW0A 4KYEA 4NWDA 1BP5A 5AA3A 4HS7A 3MUQA 2Z22A 2I48A 2FA7A 4OFLA 4QFNA 5DTBA 1DTZA 1UTHB 3VVFA 1FTJA 2RC7A 3FVOA 1IITA 4R2BA 4RXLA 4GRKA 2LAOA 1Y3PA 2GH9A 3VV5A 3SERA 4AB6A 1EZ9A 1Y9UA 3KJTA 3T66A 3G3FA 1PEBA 1MDQA 2IEEA 3TTNA 4GF8A 3LBSA 4RJZA 3W9WA 3SETA 2F6GA 4LZ7A 3OSQA 3LUYA 1OMPA 1OVBA 3EHSA 4H0WA 4FE8A 2Y7WA 3TDJA 4RPOA 3O29A 1B6HA 5JTYA 1VSOA 2ONSA 3IL1B 1USYE 2D3IA 3TAJA 5DVIA 5BUUA 5I56A 4LQ2A 2Q89A 1XT8A 2DOJA 2V25A 5AA2A 4IO4A 4OEVA 1MY3A 1PDAA 4MLVA 1MY1A 4KR5A 3KN7A 3CFLA 3VLWA 5I58A 3KZGA 1MY4A 3TTMA 1ANFA 4FJPA 4Z7EA 1DPPA 1L5TA 3RTFB 1PB9A 1SDXA 5B70A 4NF8A 3W9VA 1O63A 4O3BA 3TZAA 4Z0IA 3IB2A 3QYTA 1A40A 3EHUA 3IOTA 4F22A 4G8NA 3GLBA 5ICQA 1XVXA 5K2YA 2OWTA 4F2QA 1B58A 4OESA 3FZVA 2REGA 1Y3QA 4H1XA 3I6VA 2A5SA 2DWIA 4IO6A 2I58A 2AL5A 3QK6A 2I0BA 3UGWA 5H8FB 4YMAA 3FVKA 2DXYA 2D5WA 5CC2A 4IB2A 4F1UA 4ELRA 3K2DA 1IEJA 1LFHA 1MXVA 5CMBA 4KCCA 5FTIA 1OLCA 3BKIB 1Y3NA 3LR1A 3TELA 4OENA 2Q88A 1MDP1 3O9PA 4HTGA 2E0SA 3K1NA 5IKBA 3R26A 5L9SA 1P1WA 2NOOA 4IGRA 1I6AA 1ZMGA 5TP9B 1PB7A 3H06B 4OQOA 5TP9A 3Q28A 2ZYOA 1B5JA 2ZXTA 1MRPA 3RGYA 1B7ZA 2VD3A 4RPNA 4UA8A 4EXKA 2HAUA 3U94A 1JETA 4XKNA 3C36A 5CI5A 1MY2A 3FVGA 1B7UA 4NMYA 3B6WA 2RCBA 3OEKA 1T0KA 1USYH 4H5FA 1B3LA 2I49A 3OD7A 4O3CA 2FYIA 3BBRA 5BWJA 2F97A 1JQFA 3N5LA 2G93A 3HO7A 5AA2D 1XVYA 3H3GA 2A5TB 2V84A 3K1PA 4ND9A 4UACA 1MY0A 3CIJA 4PFTA 2DP8A 4ZEDA 4KI0E 3RUMA 1GGGA 2ZNUA 1NNKA 3ILTB 2UVHA 3CRBA 3RLFE 2PX1A 1Z7ME 4BDNA 2V3QA 2UYEA 1US5A 3EPEA 5FHMA 4HCYA 3PD8A 1JVYA 4TLLB 2UYFA 3PPPA 1MH4A 2PT2A 3CSGA 3PPNA 3OXNA 3P7IA 4RK2A 4O3AA 1FQBA 1D9VA 4P11A 2HCAA 1ELJA 3A3CA 2O1LA 2Z8FA 1PBPA 2E1SA 1XC1A 4EF1A 1QVSA 4XKRA 1LLSA 1A55A 4EQ9A 2OJTA 3VDFA 4FATA 1SQYA 3UORA 4QRZA 2HZKA 3ONMA 1LFIA 5ELVA 4AB5A 4KHZE 3EQ1A 1FTLA 3K1MA 4R6KA 2O84X 3SKPA 3MAMA 4DXUA 3KOTA 4F29A 2XX9A 4YKJA 1JEVA 3OELA 1DTGA 4NF5B 4H8IA 3MC2A 1QULA 2PVUA 3S9MC 3VXBA 5I57A 1IUDA 4GQOA 3T9VA 3MP1A 3K4UA 3MPKA 4G68B 3DP6A 3ZKLA 3CFZA 3K6UA 3M3FA 3EN3A 3TUSA 4PE5B 1DPEA 2OZZA 2ZYMA 3MWBA 2YJPA 4NF4B 2XXQA 3FASA 3HV1A 3BFUA 4G2ZA 4H5GA 4JSDA 4ELPA 5H8NA 1BLFA 1NL5A 2VD2A 3QUFA 1IXIA 4TLMB 1UIVA 1I6QA 3THIA 3CVGA 3PPQA 3UK4A 1RYXA 4N13A 5ISUA 3OSRA 5KCJB 2O7IA 1UTBB 4FIMA 1N84A 4DLDA 1FQEA 4C1TA 1M5DA 1LGBC 3D4GA 3C32A 3CI8A 4BLAA 4H67A 2ZNTA 3O66A 2I0CA 1QJMA 3I3VA 3LC8A 4MLQA 1XOCA 4N6PA 1VR5A 3MPLA 4F19A 2ONRA 1LAHE 3C4MA 4KQPA 4KYSA 1GR2A 1JW5A 1TXFA 1B3FA 4MFIA 4AQ4A 5H8SA 2DE4A 2QMXA 2QRYA 4WEPA 1B46A 1H43A 4YB5A 4U4SA 4RK9A 1MS7A 1UQWA 2Z8EA 1IXGA 3IORA 4QSCA 5CM6A 3O6GA 5I2KA 3G3GA 5CBSA 2X7PA 4F1VA 1N3XA 2QS2A 3FV1A 4JSOA 5M2VA 1GVCA 3RQTA 1P1NA 4ELOA 1QUJA 1EZOA 3FUZA 1MXWA 5TU0A 1B5HA 1TFDA 2O69A 3QAXA 3VVDA 1DMBA 2Y7IA 4OWDA 4R9GA 3H6UA 3RNNA 4L17A 1FW0A 2GFEA 4I1DA 5JEIA 1JW4A 1M5FA 3ODBA 5EYFA 1NH7A 2H99A 3K02A 2XXWA 4IO5A 4FAJA 4FORA 2Y84A 3B6TA 2F34A 2V3UA 4R72A 3VXCA 4G77A 3PMWA 1P1UA 1VFDA 4EQBA 1US4A 3MQ9A 5AA4A 2Z23A 1URDA 5JTYB 1JNFA 2REJA 3ECRA 3IO6A 2ANJA 3SEUA 3IR1A 4P0GA 3S9EA 4QFPA 3KN3A 4IO2A 2NWJA 2F36A 3QXMA 4OEUA 5I56B 2QJEA 3T9UA 2VP1A 3SESA 5AA2B 4THIA 1OQHA 3U1OA 4DIGA 3MZBA 1AL3A 2DVZA 2UXAA 5KDTA 5I58B 4PP0A 1AMFA 5DVFA 4QFLA 2XXHA 4LZ8A 3PUYE 3KOSA 3N26A 3GZGA 4ESWA 4Q0CA 2F7BA 4NF8B 4F3SA 3S2VA 1VFEA 5TPAA 5HM4B 3IB0A 4ZEBA 2OLBA 5H8QA 1IIWA 2DWAA 2DWJA 4LZ5A 3FXRA 1AIVA 3O6IA 1PBQA 2XD2A 1SW1A 2HXWA 1N04A 5A5XA 4MF3A 3OO6A 1FQDA 1TFAA 4IGTA 1AH5A 3UN6A 3EHTA 4K3FA 3E9XA 3M3KA 1A8EA 3HPIA 3BFTA 4Q8RA 1QUIA 1MQDA 2QL3A 4LQ5A 2WKYA 4ZEKA 4DCYA 3H6VA 3MBPA 1D9YA 4POXA 5I84A 4QFOA 2B3FA 3K01A 3PMVA 3MVXA 3KGCA 3FJGA 4F31B 4F18A 4GOTA 5IAIA 3HHGA 2OK2A 4G8HA 1ZU0A 4I62A 4XKQA 1XS5A 2Q2AA 4U4XA 4QF9A 5I2NA 4HW8A 3TTLA 1ZBMA 1A99A 3LSXA 3H6WA 3M3LA 2I4CA 1LCTA 3V83A 3PUVE 3F11A 3VFJA 3M8UA 1MQIA 3UA8A 1IQ7A 4GLIA 2XXUA 3G3JA 1NFTA 5I59A 3MW0A 4ZZEA 3IAZA 4YB6A 3L6GA 3VLUA 3RT8A 2CZLA 2Q9TA 2XXVA 3T96B 4H6DA 4FEDA 2HEUA 2I4BA 3E13X 3G7WA 2F35A 2F8DA 3MVWA 3TMGA 1ATGA 1D3KA 1SW5A 3TYHA 1FQCA 4KYDA 4WEDA 2P1SA 2R71A 3OO9A 1OVTA 1MPDA 2VGQA 5AA1A 1HSLA 2V93A 1BTJA 2DQVA 4NE4A 4ZS9A 3EF7A 4WXJA 5HBCA 3GBAA 4YICA 2I3VA 1B5IA 1B1HA 2M8CA 3FD3A 2XXYA 3SEXA 4FEBA 2RC8A 1LBBA 5CMMA 1MG1A 1DSNA 3B6QA 3SDFA 5CBRA 4QSEA 4OMBA 3OO8A 3K0VA 4GIZA 1LAGE 3PPOA 1F9BA 2H98A 2OWSA 5H8HA 2R6GE 4YAHX 1R1NA 3FATA 1SD3A 4GVOA 3QUJA 3CG1A 3N6TA 4PFYA 1N0TA 1S9TA 1NH8A 3K6XA 1JVXA 3SEYA 5DVJA 3CR9A 4BDQA 3D4CA 2X7QA 4BDOA 3IK6B 4ZZAA 3UP9A 1H45A 2QMWA 3V8XB 3ZS6A 4MBPA 4MH5A 3S9LC 3KBRA 2BJJX 4IY6A 3G3IA 5K2XA 3DM0A 5B7DA 3H03A 5F1QA 3DLNA 3TQWA 3Q26A 5I57B 3TTRA 5LOMA 5F7VA 1D4NA 1LAXA 3OEMA 4EF2A 3U93A 1LFGA 3QIMA 1S7YA 4I8CA 1OQGA 2UVGA 4YZZA 5L8DA 3TQLA 3Q27A 2DWHA 4G68C 1B2HA 4ELQA 3VE1B 5H8NB 1MXXA 4FECA 2DVCA 3C31A 4F3PA 4U2RA 3ZKKA 2D21A 3FJ7A 4NWCA 1NNPA 1SW2A 1URSA 3O6HA 4Q5TA 4G4PA 3W15C 1Q1KA 4GL8A 4GD5A 3N6UA 3RTWB 4U1OA 1Y1ZA 1GTKA 5FHNA 2QS1A 3TCFA 3MP6A 3WAEA 1YAEA 3CSBA 4ZEFA 5HPQA 3G3HA 4F39A 2DYXA 3PPRA 4RY1A 1WDNA 3GBBA 4QHQA 4ONYA 4XIGQ 4NF6A 4DDDA 3LSWA 2QPQA 1I6BA 1B1XA 5FTHA 3SEVA 1Y20A 2DXRA 2DE3A 3PMXA 3C9HA 4QFKA 2HFBA 5AE4A 3PU5A 2H5YA 4OVJA 4LA9A 3FXUA 2H9BA 5I2KB 3FJMA 2GHBA 3K6WA 4IO7A 1SYHA 4ECFA 4OHNA 1A8FA 3PUZE 4JBZA 3QSLA 5FHOA 3PUWE 1GV8A 1FQFA 1B4HA 1B51A 2F7CA 4EUOA 2VHAA 3MVYA 2QS3A 1MQGA 4C0RA 3N94A 4M1VA 4R74A 4F1YA 2THIA 3R6UA 3FV2A 1LB9A 4OFJA 1MXUA 1SW4A 3IJOB 5CMKA 1IXCA 3C33A 4OFOA 1O7TA 4U21A 3SEWA 3FXQA 5CRYA 4JWOA 3JV9A 3T93B 1LBCA 4YKPA 3JZJA 3MJNA 3V5AA 1UTHA 2G29A 3O2AA 3U72A 2XXIA 1EZPA 5EHSA 1RYOA 3HN0A 3LSLA 4EQ7A 3E3KA 4XTCQ 2Q2CA 3FGSA 5AA4B 3TODA 2XX7A 1B0HA 2PMSA 1MPBA 3RT6B 1EH3A 3T9XB 2YPNA 3O97A 4GXAA 3G3KA 1H44A 1MM6A 1IZ1A 3KG2A 3KN8A 2O7UA 4X48A 3TCHA 1LCFA 2XXPA 1HSJA 1DOTA 2UVJA 1Y1MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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