1MQJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with willardiine at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA01
3FXRA 3RN8A 5AA4B 3I6VA 5CBRA 4YAHX 2XHDA 4ND9A 4OZ9A 3USDA 5I2KB 2GH9A 5TU0A 1PBPA 4F2OA 1OMPA 4F1YA 4H5GA 1VR5A 4DXCA 5ICQA 3PMWA 2X26A 1RYXA 3RPWA 1VFEA 4GVOA 2QS3A 4F3PA 4KYSA 3OOAA 2XD3A 1MDP1 2XXPA 1AL3A 4AB5A 3FVNA 1OQGA 3O66A 3FGSA 2RINA 4OQOA 1I6AA 4ZEBA 1H45A 4YMAA 2REJA 4NEDA 2O7UA 3GLBA 1PEBA 4F29A 3HN0A 5H8FB 5I59A 2BJJX 3O97A 4HS7A 1N3XA 4QFLA 3EPEA 1NMUA 3KFMA 4MBPA 1A99A 3MWBA 2PT2A 1B7HA 4KCDA 3UIFA 4JWOA 1Q1KA 1MS7A 1MQDA 3RT6B 1M5DA 3K1PA 4LP2B 2UVHA 4YICA 1IZ1A 2ONRA 3IAZA 3TZAA 1NFTA 3A3UA 3G3GA 4U1OA 1FTLA 4PFTA 1MXWA 2XD2A 3K6VA 4Q30B 4ZEDA 4IO4A 4KHZE 4U4XA 2H25A 5ITPA 3GXAA 1SW1A 3FJ7A 3DP6A 1MY1A 2RC7A 3VVEA 1JW5A 1M5EA 1URDA 4IB2A 4OTEA 4DDDA 4M1VA 3R6UA 2Q89A 3P7IA 2Y7RA 1MY0A 2F5XA 3MPLA 3PD9A 5DVFA 4YU0A 4DIGA 1BLFA 4ZS9A 1XOCA 2QS2A 3EHUA 3ONMA 3QIMA 4X9TA 4H65A 1LB8A 4RJZA 2YJPA 2OCUA 4WXJA 3UK4A 5CM6A 4JXIA 2V84A 3K6UA 3CSGA 3N6UA 2ZMBA 4GXSB 2VD3A 4XKRA 2ESNA 2D3IA 4EXLA 4DZ1A 4DXBA 2ONKE 4F3BA 3IOTA 4FJPA 4YKKA 1HSEA 5H8HB 4O3AA 4KCCA 4LA9A 1DSNA 3TCGA 4ESWA 4QF9A 1XT8A 3TFLA 3CFXA 4HCYA 2VHAA 5FTHA 4R6YA 4M4GA 2O51A 3OO6A 1P99A 4G68A 4C1UA 3OEKA 4I9DA 2F6PA 3KSJA 4JBZA 3UA8A 1LBBA 1P1UA 2F6GA 4OESA 1QUKA 4GF8A 4RK2A 4IGTA 1LBCA 3PUYE 2AIXA 3K1NA 2ZYOA 3B6TA 1YAEA 3FD3A 4XXUA 3N6TA 1AIVA 4Q5TA 2AL4A 2B3FA 1M5FA 4EQ9A 2P2AA 5KDTA 2QMXA 3DELB 5CMMA 2QJEA 1D3KA 1T0KA 1DPEA 3UN6A 4QFNA 1JVYA 4OMBA 1FQAA 2O69A 2DWJA 1MY3A 3HO7A 2F7BA 4I1DA 3VVDA 1FTOA 1M5CA 5JK4A 1MH3A 2Q2CA 2XXXA 2Q8JA 3C9HA 2ZYMA 3LSWA 2NOOA 2OLBA 2QRYA 1GVCA 2NXOA 4EQ7A 1B51A 1B40A 2RC8A 1A7LA 2PYYA 3TYHA 3MP8A 4DE8A 4ELPA 3TTLA 5A5XA 1ANFA 1LCFA 5AA2D 1MM7A 2I6EA 3DP4A 3ZKLA 2G93A 1VFDA 3IOVA 1SW4A 4GL0A 1EU8A 4EF1A 5I56A 3W9WA 3QK6A 3TQWA 3N5LA 2LAOA 2DWIA 3PPOA 4I8CA 3TMGA 3IORA 5DEXB 1Y20A 2KLFA 3G3HA 5TPAA 1OIBA 3TTNA 1B32A 4C0RA 1MXVA 4G4PA 4QRZA 3H6UA 5JEIA 1MQHA 3PUZE 3Q28A 3VDFA 4G68B 3RNNA 3RGYA 4FEDA 3S2VA 4G8HA 2A5TB 4OFLA 4R2FA 3UGWA 2IEEA 3KN8A 3HCQA 1VSOA 3CRBA 4JDFA 3OELA 1Y1ZA 5I2KA 1PB7A 1BKAA 2RKMA 3C32A 2Z8DA 3R7XA 1OVBA 3VXBA 3U93A 4NE4A 2DS9A 1TWYA 3BFUA 2PMSA 2ONSA 3TAJA 2PX1A 3CSBA 4KQPA 2AL5A 1JEUA 1B7UA 4K3FA 1B3LA 3EF7A 2F34A 5BWJA 5I57B 1QKAA 1ZKBA 3O28A 1S7YA 3MQ9A 3WAEA 4PFUA 4U4SA 5H8FA 4WKMA 4Z0IA 1SI0A 3ODBA 3ILTB 4EQBA 4BLAA 3IJOB 4IO2A 2M8CA 4KFQA 4NF4A 1ZMGA 2B3BA 3VE1B 4R74A 1LFGA 2DWHA 3H06B 2H99A 3KEIA 3FV1A 4X1BA 2GHBA 4OEVA 4BDMA 3SKPA 4EXKA 2H5YA 3FUZA 3PMVA 3T96B 3B6WA 3CFZA 4LZ5A 2XXVA 3SEYA 4P0IA 4U2RA 3FXQA 1DMBA 2Y7WA 1B3EA 3PUVE 5CC2A 2QPQA 4NF8B 3DP8A 1B4ZA 3O6IA 3CR9A 5TPAB 2NUVA 2HZKA 1NKXA 4NWDA 4E0WA 1Z7NE 4P0GA 2UXAA 2ZNTA 4QSDA 1JEVA 4OWDA 4H5FA 1URGA 5J1DA 3K6XA 1HSLA 2I48A 3ZSFA 5CBSA 1A54A 2A5SA 3KZGA 3O29A 3TELA 3RQTA 3S9EA 1HSJA 3IO6A 4IO3A 1LCTA 5AE4A 3H3GA 1QKBA 4U1ZA 3OSRA 3V8XB 2V3TA 4FORA 1BTJA 1US5A 1LAGE 1FQFA 5I58B 1AH5A 5CI5A 3BFTA 3UP9A 2O7IA 4OFOA 4QHQA 4KYEA 5DVIA 5K2YA 4XKQA 1N7XA 3K0VA 4H1XA 1PB9A 3PGFA 1SDXA 3LC8A 5H8HA 3QUFA 4P11A 4RNSA 2I4BA 3MPKA 1A40A 1ZBMA 2F8DA 2V25A 4N07A 2W7YA 3FJMA 1MY4A 3IOUA 4NF4B 5HM4B 4Q8RA 2I58A 1ZLQA 3TCFA 1Y1MA 2I49A 3U1OA 2HQ0A 2O84X 4WEPA 3LSLA 4QSEA 1GGGA 3ECRA 3F11A 5HPQA 5L9OA 4LZ7A 1EZPA 4PFYA 4E0XA 1MPBA 1UQWA 1O63A 3MZBA 2V93A 1ZU0A 1IIWA 4G8MA 4YKPA 2ZYNA 2GRVA 4H67A 4RPNA 4QFKA 4R75A 3V89B 3KN3A 4BDLA 2PT1A 4X48A 5FHOA 4Z7EA 4ONYA 3FVKA 3V83A 3T9UA 4ZEIA 4MLVA 5B70A 3ILUB 3MZ1A 3IR1A 4YKJA 3KJTA 2PBWA 3O6GA 3KN7A 2HAUA 4L17A 2RCBA 3K1MA 3GBBA 2XX8A 3IL1B 3KSXA 2VD2A 2O1MA 3FXUA 1R9LA 4YKIA 2E0SA 3OO7A 3FIRA 4R6HA 1B3FA 1CE2A 5KZTA 4GRKA 1R9QA 1XS5A 3Q27A 1PDAA 2QMWA 5I84A 1UIUA 3LBSA 5DTBA 1POTA 1TT1A 2OBGA 1SBPA 1MXXA 3OEMA 2DE2A 1B1XA 3MVYA 1URSA 3T9VA 2QS4A 2NVUB 1D9VA 3M3FA 3IO4A 1AMFA 4GQOA 2UVGA 2F7CA 1LFHA 5DEXA 3PMXA 3T9XB 4FAJA 4O3BA 2I3WA 4IO7A 1SYIA 1IXCA 3B7DA 4TQUQ 4ESXA 3T9HB 5DT6A 3RY3A 2HAVA 3QSLA 1B3GA 4XKPA 2XXRA 1US4A 4LONB 3EQ1A 1ZJLA 1Y4TA 5CRYA 3SEUA 2A5TA 5ELVA 1MH4A 1LAFE 1USYE 2V3UA 5JTYA 4GD5A 5L9MA 3G3IA 3HHGA 1H76A 1TFAA 3FASA 2XXHA 3H03A 3FATA 2Q9TA 3H6WA 3KG2A 3RLFE 5F1QA 1B9JA 3OMBA 3K2DA 1Y3PA 1JQFA 2B65A 4JWXA 2HFBA 3H6VA 2H4IA 5I57A 4DCXA 1JW4A 3PUXE 3MP1A 3GZGA 1ZTYA 4MF3A 4OFJA 3C34A 4TLMB 2XXWA 2ALUA 4BDQA 1MM6A 2OZZA 2X7PA 4FIMA 3M8UA 2I0BA 2IA4A 2Z23A 4KR5A 5TP9B 3IB1A 4QFOA 4NWCA 4UA8A 3SEXA 3THIA 3A09A 1LSTA 1EH3A 4ZEKA 2FNCA 3EN3A 3M3LA 2ZXTA 3KBRA 4G2ZA 2WKYA 4JB7A 4WEDA 1B4HA 4RK9A 1XVXA 4R6KA 2RCAA 2ZYKA 1MQGA 1SYHA 2ZNUA 3G3KA 2E1SA 3CG1A 5EHSA 1II5A 3O2AA 5FHNA 3N94A 4NF8A 3C36A 1B7ZA 3IOWA 5ICTA 1D4NA 3MUQA 5AA3A 4FATA 2H9BA 5I2NB 3HSTA 1USYH 1JVXA 1P1WA 1DTGA 5H8QA 4IO5A 1B5HA 4OYVA 3C33A 1OLCA 1XC1A 4R72A 3VLVA 2OK2A 3I3VA 2DSFA 5AA2B 5JTYB 3PD8A 3VXCA 3PPRA 3DLNA 3K01A 2OWSA 4POWA 1TFDA 4BDNA 2OWTA 4GOTA 1H3DA 3IK6B 1UTBB 1N0TA 1OQHA 3JV9A 1B52A 3OSQA 3CFLA 3E3KA 1ELJA 5I58A 1EZ9A 3HV1A 1OLAA 1FQBA 3TTRA 2F36A 4FEBA 1BIYA 2R71A 4OERA 4Q0CA 2XXUA 1IUDA 4H8IA 1ZIUA 5HBCA 4XIGQ 4RYAA 2QSXA 3EHSA 3MP6A 2DP8A 2PVUA 3H6TA 3PPNA 1IQ7A 4ZECA 4HTGA 4EF2A 1IXIA 4UACA 3O9PA 5IKBA 2THIA 1WVJA 1FW0A 4TLLB 4C1TA 1Y3QA 3AXFA 1WODA 5FTIA 4ZDMA 5K2XA 3SERA 4GLIA 1YTVA 1RYOA 3IX1A 4LATA 3CG3A 3CIJA 2DE3A 3L6HA 5IAIA 3ZKKA 1AOVA 3C4MA 4F3SA 1B3HA 4PQJA 2R6GE 4GWOA 3WAFA 1EZOA 1JNFA 2RC9A 4F18A 2DYXA 3SETA 3EHTA 4NF5B 1B5JA 3FVGA 4FE8A 3BKIB 1N3WA 3RT8A 3A3CA 3S9MC 4ZE9A 4KI0E 5H8QB 1R1NA 2I0CA 4EDPA 3FJGA 4JWYA 1J1NA 2UVJA 3VLUA 4R9GA 2F97A 1GR2A 1DTZA 3R26A 4MLQA 3TODA 4RY1A 3C31A 1P1QA 4POXA 2UYEA 2VP1A 1ATGA 4R73A 4G8NA 3VVFA 1H43A 2DVCA 3U94A 4MFIA 3TPAA 2Q2AA 1FQDA 1LLSA 4JSOA 1N7WA 1LGBC 3LR1A 4NF6B 2ZNSA 1B0LA 4GXAA 4EUOA 1O64A 1XHYA 5M2VA 3SEWA 2YLNA 4ELRA 3C35A 4XKNA 1NNKA 2Z8FA 3GBAA 1MXZA 2RF1A 4R9FA 4I62A 1JETA 1NL5A 1B1HA 3KOTA 1IXGA 4TOZA 4DLDA 3TKDA 5EYFA 1QJMA 4GFRA 5ISUA 1QVSA 1SW2A 1MPCA 1OVTA 4YB6A 1GTKA 4U22A 1NH7A 1PB8A 5H8NB 2Y7IA 4MH5A 1I6QA 2OJTA 1P1OA 4THIA 1JW1A 4N13A 5BUUA 1Z7ME 4KD5A 3SESA 1UTHB 4YZZA 3MZ9A 1SD3A 3U72A 4RPOA 3KJ7A 2HCAA 4LQ2A 3I5OA 2XXIA 1VE4A 3Q26A 1Y9UA 2ANJA 3PV0E 4F31B 4GL8A 3O6HA 1MG1A 3K02A 1CB6A 1QUJA 4DXUA 2Z8EA 2XXQA 1MQIA 1A8FA 3FZVA 4ECFA 3VFJA 2DWAA 3B6QA 1BP5A 2HZLA 3LUYA 2P0SA 1FTMA 3CVGA 5TP9A 4YB7A 5DYHA 4BDRA 3E9XA 4LQ5A 2P1SA 2DQVA 3MVZA 1S9TA 1MRPA 1B0HA 4OHNA 3W15C 2QS1A 4H8JA 5LOMA 3QYTA 3N26A 4F22A 4OENA 2O6AA 2GFEA 4LVQA 1A8EA 5CMKA 3L6GA 4PFWA 3SEVA 3PPQA 5KCJA 1Q35A 5FHMA 4ELOA 3MVXA 2ABHA 4AQ4A 4F3GA 3LSFB 4X1DA 3H7MA 2Z22A 3QUJA 1IITA 4H6DA 3D4CA 5I2NA 2HXWA 1MY2A 2F7AA 4KYDA 1D9YA 4F1VA 5I59B 5H8SA 4HCWA 2Y84A 2XX7A 3JZJA 3HPIA 1LFIA 4F1UA 3TQLA 4RA1A 2Y7KA 1LAXA 1NNPA 5ITOA 1XVYA 4FECA 5AA2A 1H44A 3G7WA 1R6ZA 4IO6A 3M3KA 1UTBA 1SQYA 2NWJA 4JSDA 5CMCA 5EHMA 3ZS6A 2DVZA 1O7TA 4F19A 3G3JA 1N04A 1RKMA 1YCJA 3OXNA 4NTLA 1QW0A 1F9BA 2V3QA 1FCKA 1B46A 3DM0A 2DE4A 1POY1 4F2QA 5AA1A 1B5IA 2Q88A 2I4CA 2O1LA 3PUWE 3OO9A 3W9VA 1MQJA 4O3CA 1MDQA 3KGCA 3LSXA 3Q29A 3HHFA 2XXYA 3K4UA 1FQCA 4GIZA 3PPPA 4PETA 3QAXA 4RXLA 3RTWB 2CZLA 1B2HA 1MXUA 2XX9A 3T93B 1FTJA 3MC2A 2F78A 1M5BA 1IXHA 5KCJB 1YPNA 3G3FA 3TDJA 1WDNA 2CMOA 2DOJA 1B6HA 1NNFA 1P1NA 2X7QA 2D5WA 5B7DA 2REGA 4NF5A 4H0WA 4IGRA 1UIVA 2VOZA 4ZZEA 5CMBA 1NNTA 5DVJA 3TTKA 2UVIA 3TEPA 4HW8A 3KOSA 3MVWA 3BBRA 4IY5A 3FVOA 3TCHA 1PC3A 4PE5B 4ZZAA 1B58A 1B05A 1DOTA 1I69A 4XTCQ 4BDOA 1SI1A 5L8DA 1LAHE 3MBPA 2H98A 3V5AA 2I3VA 1QULA 4IY6A 3S9NC 4ZE8A 4OXVA 4ZEFA 3K00A 5AA4A 1TXFA 4N6PA 1N84A 3T66A 3MAMA 3TTMA 2UYFA 2FYIA 1NH8A 1N76A 3OD7A 3IB0A 4NF6A 4YB5A 3T22A 1SW5A 3MW0A 2R9JA 3K6WA 1Y4CA 4OETA 5KDTB 3FV2A 3CI8A 3TUSA 4KPTA 3JYRA 3E13X 4ELQA 4U23A 1LB9A 4NMYA 2VGQA 3RTFB 2DXRA 1DPPA 3RUMA 3IJXB 4LZ8A 2AYSA 3S9LC 4AB6A 2FA7A 4ISUA 2GHAA 5H8NA 3SDFA 4G77A 4YMBA 3Q25A 4QSCA 1IEJA 3E4RA 1SVXB 2G29A 1UTHA 1MPDA 4PP0A 2D21A 3S4UA 4U21A 5A5XB 4OVJA 2HEUA 1GV8A 1PBQA 4R2BA 4DCYA 3MJNA 1I6BA 3H4ZA 5L9SA 1A55A 1Y3NA 5I56B 1FQEA 3D4GA 2XXTA 4F39A 1FTKA 3OENA 3VV5A 3QXMA 3VLWA 1QUIA 3UORA 2YPNA 3OO8A 3U92A 3IB2A 2F35A 1MXYA 4LUBA 2Y7PA 2DXYA 2QL3A 1KWHA 1S50A 4G68C 4OEUA 3U8QA 1L5TA 4QFPA 2O68A 3PU5A 5F7VA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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