1MQJA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) in complex with willardiine at 1.65 angstroms resolution
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords glutamate receptor 2
publication title Structural basis for partial agonist action at ionotropic glutamate receptors
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mqjA01
1XVYA 3QUJA 3MVYA 3KN8A 3IOVA 1LAGE 3LUYA 4QSEA 3EHSA 4JWOA 2P1SA 5FHMA 3GLBA 5I2NB 1YAEA 4POWA 1POY1 1Y4TA 1A8FA 4F2OA 1UIUA 5ITOA 1H43A 1TFDA 2ZNUA 1NNTA 4KYEA 3M3KA 4IY6A 1JQFA 1SW5A 2A5TB 1XVXA 5CBSA 1SVXB 4FORA 3KEIA 5ICQA 5DVFA 3H3GA 4IY5A 2AL5A 1II5A 1LBCA 4NWCA 2V84A 1AMFA 2PT1A 2FYIA 3M8UA 4EXLA 3QIMA 3TUSA 4LQ2A 4PQJA 4FEDA 3G3GA 1GTKA 1N04A 4Q0CA 3O28A 2GRVA 4LATA 3DM0A 1B51A 3FJ7A 3OO6A 4HCWA 5I56B 1DMBA 3O29A 2UVHA 1OLAA 1S7YA 2OLBA 2ABHA 4RNSA 3LR1A 4WEPA 3ECRA 4H65A 3F11A 3OD7A 1MXXA 1AH5A 4ZEFA 3ONMA 5JTYB 4F1UA 3TODA 5AA4B 4OFOA 2P2AA 3B7DA 3RQTA 3SEXA 2XD3A 3R7XA 3M3LA 3OSQA 4LZ5A 3FV1A 3OOAA 1FQEA 2XXIA 1BLFA 1H76A 1R9LA 1R1NA 3VLUA 4H0WA 4LONB 3JV9A 4FE8A 4ELRA 4YKPA 1MPCA 1QKBA 3CFXA 2F7AA 2Q2CA 4XKQA 2DSFA 5H8FA 1OVTA 4YMAA 1MY0A 1B46A 1FQBA 3N6UA 1JW5A 3PD8A 5KCJA 4O3AA 4QFKA 4G77A 4X9TA 4F3GA 3BFTA 4LZ8A 3T9UA 1FQDA 1EZPA 4LA9A 3CSBA 3IOUA 2YJPA 2ONSA 3W9WA 3SEWA 3K01A 5I58B 4EF2A 1ZBMA 1FW0A 4GFRA 4DXCA 2NVUB 3SDFA 1P1UA 3RLFE 1FQAA 4NF4B 2Z22A 1HSLA 3EQ1A 1UTHB 3A3UA 2UVJA 4I62A 1QW0A 4BDQA 1FCKA 4QF9A 1MQIA 4C1UA 1AL3A 4OTEA 4H8IA 1WODA 2OZZA 3G3HA 1R6ZA 1P1OA 5CMMA 1IXGA 4OZ9A 4OETA 5H8HB 4OQOA 3GBBA 3TZAA 2AYSA 1ATGA 3FVOA 4O3CA 3TMGA 1ANFA 2VGQA 2W7YA 3ILUB 3K6WA 1US5A 1SDXA 4XKNA 4KR5A 3DP4A 1ELJA 4YZZA 1UTBA 3E13X 2I4BA 3T66A 4XXUA 1LSTA 2QMXA 1B32A 3KGCA 1MXWA 1H45A 1FQFA 4H5FA 4JSOA 3B6TA 1DPEA 4R72A 5L9SA 1Y3PA 5I59B 4TOZA 3KJTA 4YKJA 3SESA 2ALUA 2DE3A 5J1DA 4F31B 4I1DA 2HAVA 3USDA 3QUFA 3U8QA 5I2KA 4DXUA 4R74A 5DEXB 1QUJA 2E1SA 4RK2A 3K4UA 3V8XB 1H44A 1MY4A 1IXHA 3KFMA 1O63A 3S9NC 2NXOA 3LSXA 4NF6B 4OWDA 1MDP1 3FV2A 1EH3A 2ZNTA 2I6EA 4OHNA 2OWTA 1M5FA 4ECFA 3FASA 3T93B 3WAEA 3RGYA 4IO4A 1R9QA 1QUIA 4DLDA 2ZYMA 3VLVA 1Z7ME 2DQVA 4JXIA 3ZSFA 2PYYA 1H3DA 3K1MA 5TPAB 2VP1A 4ZE9A 2DP8A 4QSCA 2F6PA 1ZIUA 3L6GA 2F6GA 4NMYA 4XTCQ 3PGFA 5BWJA 3Q26A 3A3CA 3U94A 2VD3A 1A7LA 3HO7A 1YCJA 1PDAA 1IQ7A 2GHBA 4FIMA 1YTVA 4N6PA 2QS1A 1B7HA 3SKPA 3U92A 4ESXA 2DWIA 1TFAA 2DE2A 3DLNA 3IORA 3FUZA 3PMWA 2XXXA 3O6HA 3E3KA 4C0RA 3IB1A 5FHOA 4F19A 1B58A 4U4XA 4OYVA 3MPKA 4ZDMA 5K2XA 4QSDA 3S2VA 1B0LA 4ELOA 4H5GA 2H5YA 1O64A 3OSRA 1L5TA 2ZNSA 1Y3QA 3OEKA 1JW1A 5I84A 4QHQA 4DXBA 1P1NA 1RKMA 5H8NA 1Q1KA 3CR9A 3TCHA 4U2RA 3ODBA 3MVZA 2PBWA 4G4PA 4G68C 2R9JA 3UIFA 2XD2A 1VE4A 2RF1A 1XHYA 2HZLA 2XHDA 4YICA 4G68A 2Y84A 5KDTA 1IIWA 4EQ9A 3BKIB 1B3HA 5AA1A 4DCXA 1FTJA 3Q25A 3HPIA 3BFUA 2I0CA 3MZBA 4AB5A 4Q30B 5DYHA 2ONKE 1A40A 4MF3A 3GZGA 1S9TA 3B6QA 2V3QA 3IX1A 2D21A 4XKRA 1US4A 1Z7NE 2I3WA 4AB6A 2HCAA 3OO7A 3IL1B 4GF8A 5EHSA 2X7PA 1GGGA 4H67A 5AA3A 3W9VA 2OCUA 1LFHA 5L8DA 3N26A 5FHNA 3PD9A 4JWXA 4ZECA 1O7TA 5HPQA 4TLLB 2DWHA 4F1YA 3D4CA 1NNPA 3PU5A 1GR2A 3E4RA 3CRBA 1B3FA 3OO8A 3V83A 3TTNA 2O1MA 2XXQA 2O1LA 2NOOA 1LCTA 2FNCA 3VE1B 1HSJA 2O84X 2H99A 2G29A 1NL5A 1SW1A 5H8FB 2PVUA 4BDMA 1VSOA 1JEUA 5KCJB 4LZ7A 4R6YA 4X1DA 4RK9A 3KG2A 1B7UA 3M3FA 3VLWA 1DSNA 1I6AA 2Y7IA 1XOCA 2AIXA 4ND9A 1Y20A 4H1XA 1VFDA 3IK6B 1SW4A 3EHUA 1B5HA 3SETA 2Q2AA 4H8JA 4OENA 3S9LC 3K6XA 4MBPA 1SYHA 2Y7RA 1NFTA 4IO3A 4F29A 3GXAA 3OO9A 1UIVA 4P0GA 4IB2A 5BUUA 3TAJA 3R26A 4G8HA 4HCYA 1A54A 2F97A 3DP6A 1LFIA 3I3VA 3I6VA 4OEVA 1A55A 2HEUA 1HSEA 3VVEA 1TWYA 5JK4A 3CSGA 4ELPA 2XXVA 2RKMA 4Q8RA 5H8QB 1EU8A 3N5LA 4RPOA 5I2NA 2RC9A 4GD5A 4L17A 2RC8A 4R9FA 1OIBA 1ZTYA 3HHGA 5DVIA 5FTIA 4QFLA 2P0SA 1VR5A 4GXAA 3O6GA 3O97A 2M8CA 5CMCA 3A09A 4U1ZA 1B2HA 3KN7A 4GLIA 2O6AA 1B5IA 1UTBB 3FJMA 4JBZA 3IO6A 4P11A 1PBQA 4YMBA 3S4UA 5CI5A 2HQ0A 3E9XA 1USYE 3RN8A 2VD2A 2O68A 2REGA 1QVSA 2PT2A 4H6DA 2BJJX 4G2ZA 3MC2A 3O6IA 3LSWA 3PUXE 3K1NA 1MM7A 4THIA 3TELA 1B1XA 3TKDA 2Z23A 5I2KB 1Y1MA 1MQGA 4PP0A 2CMOA 1Y1ZA 3TYHA 3QAXA 2RCBA 3EN3A 2DXYA 2O51A 4BDRA 5H8SA 4NEDA 2THIA 2PX1A 4F2QA 5CM6A 3SERA 3KJ7A 5CC2A 4EUOA 4R6KA 2XXYA 1MDQA 5JTYA 2I49A 5CMKA 1Q35A 3L6HA 1NMUA 3C4MA 1KWHA 4IGTA 3CI8A 1N3WA 2PMSA 3TCGA 3LBSA 2UYFA 3K00A 3OXNA 4GXSB 4ZEIA 4MLVA 3H6VA 2O69A 1MQDA 2ESNA 1WDNA 4I9DA 3MVWA 3KSXA 1QULA 1RYXA 3UGWA 1NH7A 4HS7A 5TU0A 2ANJA 3C34A 2XXUA 2QS3A 5ITPA 3ILTB 4RYAA 2F5XA 3MWBA 2Q89A 3TTMA 3QK6A 3UA8A 2HFBA 1B1HA 3MP1A 1AOVA 4UACA 4YB5A 5AE4A 2KLFA 3JZJA 2F35A 1S50A 4Q5TA 4FJPA 1FTKA 1LB9A 3SEUA 4TLMB 1P1QA 2ZMBA 2GFEA 3PPNA 4NF4A 4PFWA 4KQPA 1UTHA 5TP9B 5B7DA 1N84A 2O7UA 1SI0A 3H4ZA 1OMPA 3PUYE 2HZKA 3BBRA 5I57A 3ZKLA 3ZKKA 4E0WA 2RINA 3MZ9A 3U1OA 2LAOA 1MY2A 2NWJA 3FXRA 2I48A 1PEBA 5H8NB 3MJNA 1RYOA 2QRYA 3B6WA 3CIJA 2NUVA 1ZJLA 4MH5A 3EPEA 3Q27A 5HM4B 1MXZA 4GL8A 5ELVA 2Y7WA 3RNNA 2QL3A 4KD5A 3FVGA 1XS5A 4G68B 5KDTB 1URDA 3UORA 2H98A 2Y7PA 3H6TA 3TTRA 1B3LA 2ZXTA 2Z8EA 3KZGA 3TPAA 2E0SA 2X7QA 5F7VA 4DCYA 3Q29A 5CMBA 4FEBA 4NF5B 3HCQA 2FA7A 1CB6A 1B40A 2DWAA 2F34A 3H6WA 5EYFA 2CZLA 3H6UA 4YB6A 3FVNA 3S9MC 3ZS6A 3C36A 1IXIA 4POXA 3TFLA 4GWOA 4OFLA 2Q88A 2OJTA 3N94A 1PB9A 1A8EA 2UVGA 2QPQA 1IEJA 3PUWE 1YPNA 1USYH 2UXAA 3I5OA 3U72A 3LC8A 5M2VA 2ZYKA 3GBAA 1N3XA 3IJXB 3K0VA 1I69A 1SI1A 1B5JA 5FTHA 3C32A 1MXUA 5F1QA 3LSLA 2D3IA 3QXMA 4PE5B 1OLCA 2F8DA 4LVQA 3P7IA 1SYIA 1NNFA 5TPAA 3PMXA 4UA8A 3PV0E 1LGBC 3MQ9A 4Z0IA 3IOTA 4DE8A 2ZYNA 5B70A 1MQJA 5IAIA 5KZTA 1UQWA 3VXBA 2XXPA 4X48A 4U21A 5DT6A 1QKAA 1CE2A 4DIGA 2O7IA 3PPRA 3T22A 1D4NA 4ESWA 3CVGA 3G7WA 3EF7A 2Z8FA 3W15C 1IITA 2OBGA 4AQ4A 1LBBA 3MVXA 4R2BA 4BDLA 5ICTA 5HBCA 3Q28A 1Y9UA 4U23A 4KI0E 2I4CA 3FGSA 4HTGA 2X26A 3SEVA 4N07A 2AL4A 4WXJA 3DELB 2B3FA 2GHAA 3HV1A 4ONYA 1BKAA 4PFYA 1JVYA 1DPPA 3DP8A 4RXLA 3O9PA 4OMBA 2Y7KA 2R6GE 4DDDA 4EQBA 2G93A 3IOWA 4EF1A 4MLQA 2UYEA 1LB8A 2OWSA 4RPNA 1D9YA 4NTLA 2VHAA 4QRZA 3RUMA 4NF8A 3G3JA 4IO6A 3H7MA 3FVKA 2DXRA 3MZ1A 3IR1A 3T96B 4R73A 4ZEKA 1GV8A 1GVCA 1PB7A 4R75A 2XX7A 4NE4A 2I0BA 3C33A 3MP6A 1URSA 1ZMGA 4RY1A 4F39A 5L9MA 4BLAA 1NKXA 5LOMA 3PMVA 1I6QA 2ONRA 1MM6A 2VOZA 5ISUA 5AA2A 4ELQA 2RCAA 4U22A 3O2AA 3G3IA 4R9GA 3CFZA 5A5XA 4KFQA 4GL0A 3PPOA 2XX8A 3K2DA 1IUDA 1TXFA 1N0TA 4N13A 1B4ZA 2R71A 3H06B 3RT8A 4G8NA 3C35A 3V5AA 1EZOA 1M5EA 1N7WA 1MH4A 4BDOA 3HHFA 3PPPA 1P1WA 3IAZA 1Y3NA 1N7XA 4F3BA 3CG3A 4EDPA 4NWDA 3TTLA 4ISUA 3TCFA 4OESA 3G3KA 4IGRA 2XXWA 3MBPA 3PPQA 1MXVA 1PC3A 2A5TA 3T9HB 3RY3A 1B4HA 5L9OA 4C1TA 1IZ1A 1LAXA 3PUZE 2IEEA 2F78A 4DZ1A 1PBPA 3QSLA 3VXCA 3THIA 1A99A 3IB0A 3V89B 4OXVA 4RJZA 1DOTA 4JSDA 3QYTA 2F7CA 3FJGA 4WEDA 2B3BA 4F3PA 4MFIA 1WVJA 3N6TA 1AIVA 3TTKA 2B65A 5I56A 1ZLQA 3D4GA 1I6BA 2H9BA 3OELA 3RPWA 1MXYA 1FTMA 2QS4A 5I57B 1JNFA 1POTA 1SQYA 1M5CA 2DVCA 4GRKA 5AA4A 1BIYA 3G3FA 4GOTA 2HAUA 1ZU0A 1FTOA 3K6VA 2F7BA 4ZEDA 3FIRA 5H8QA 4JB7A 2XXRA 5AA2D 3RTWB 3MAMA 3IJOB 4R6HA 3AXFA 1JETA 4PETA 1MPDA 3K02A 4FAJA 4TQUQ 1MPBA 1PB8A 2DYXA 3C31A 2Q9TA 1SD3A 1J1NA 1D3KA 2DE4A 1ZKBA 3JYRA 4KPTA 1N76A 4PFTA 3FXUA 4EXKA 1MY3A 3T9VA 1OVBA 2GH9A 1FTLA 3FZVA 4YAHX 1Y4CA 4Z7EA 2QMWA 3CFLA 4LUBA 3UP9A 1B05A 5I58A 4IO7A 3SEYA 3UK4A 3MUQA 3T9XB 3RT6B 4YKIA 3RTFB 1LFGA 4F22A 3U93A 3KBRA 3KSJA 2V3UA 1URGA 4U4SA 4FECA 4KYSA 2XX9A 4U1OA 4XIGQ 1MQHA 1TT1A 1T0KA 3FXQA 3MW0A 2DOJA 1EZ9A 4FATA 2Z8DA 1SW2A 5JEIA 2ZYOA 4JDFA 3HN0A 1M5BA 5H8HA 4OEUA 4OFJA 1IXCA 3R6UA 1MH3A 4O3BA 3VVFA 5IKBA 4K3FA 4LQ5A 1XC1A 4QFPA 1B3EA 2QS2A 5CBRA 4LP2B 2Q8JA 3KOSA 4P0IA 3TQLA 3FATA 1DTZA 2A5SA 4I8CA 4IO2A 3VFJA 2WKYA 1QJMA 1NH8A 5I59A 4M4GA 3KOTA 4GVOA 1B52A 1SBPA 4KHZE 2OK2A 4BDNA 4M1VA 5DVJA 4KCDA 1BTJA 2I58A 4KCCA 4GIZA 3O66A 4R2FA 2D5WA 5DEXA 2IA4A 1DTGA 1LAFE 1M5DA 3CG1A 3KN3A 2QSXA 4OVJA 2V93A 2DWJA 5TP9A 5EHMA 4ZZEA 1MY1A 3EHTA 4ZEBA 3VDFA 4NF6A 2YLNA 1XT8A 1VFEA 2I3VA 4RA1A 5CRYA 1QUKA 1JW4A 4ZZAA 4OERA 4KYDA 4NF8B 4WKMA 1P99A 3PUVE 4F1VA 4YU0A 2UVIA 4JWYA 2XXHA 4YKKA 4F3SA 3TEPA 2XXTA 3TQWA 1JVXA 4IO5A 1B0HA 3K1PA 3H03A 3OMBA 1B3GA 5DTBA 1LCFA 4PFUA 1LAHE 3VV5A 1MG1A 3C9HA 1OQGA 4G8MA 4XKPA 4YB7A 2RC7A 2DVZA 1JEVA 4F18A 1D9VA 3S9EA 5AA2B 4X1BA 1MRPA 4HW8A 4EQ7A 1OQHA 3IB2A 4NF5A 3OENA 1F9BA 1B7ZA 2REJA 3TDJA 2HXWA 4ZE8A 2F36A 2QJEA 3IO4A 5A5XB 3VVDA 2H4IA 2V3TA 2H25A 2DS9A 2YPNA 3UN6A 1FQCA 3K6UA 3MP8A 4GQOA 4QFNA 1B6HA 3FD3A 1MS7A 3OEMA 3HSTA 1LLSA 1BP5A 4E0XA 3LSFB 1B9JA 1NNKA 4ZS9A 5K2YA 4QFOA 3WAFA 2V25A 3MPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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