1MSSA

Large scale structural rearrangements of the front loops in monomerised triosephosphate isomerase, as deduced from the comparison of the structural properties of monotim and its point mutation variant monoss
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTSSHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAGNADALASLKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Three new crystal structures of point mutation variants of monoTIM: conformational flexibility of loop-1, loop-4 and loop-8.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
source organism Trypanosoma brucei brucei
total genus 91
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1994-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1mssA00
3TW6A 4LT9A 3W1AA 1PL9A 2BX7A 3E12A 4Z0JA 1GYNA 3UWVA 3SI9A 4ZQOA 1YLVA 4FNRA 1NF0A 3F4NA 5TBOA 2C0AA 1Q6QA 1NEYA 1QOQA 1G4PA 3GXTA 1M5WA 3RNDA 5J5DA 3TAOA 4QNWA 1SO4A 3BG9A 3T4CA 1TQXA 3W1NA 1KFBA 2NWSA 1WBHA 1OX4A 4QISA 2CU0A 3FIGA 4DO6A 1IGSA 2QR6A 2ZQ0A 2RFGA 2O7SA 5I3IA 1MZHA 1TPH1 4AWSA 5LGXA 3UY8A 3L21A 3OBKA 3KVLA 5BMWA 3BG5A 4H6KA 3SY5A 4HIBA 3EWBX 1DQXA 2A0NA 1DJQA 3W7KA 5DXXA 2CZDA 4EOUA 2PRHA 3HGSA 3W7GA 3ATZA 1F73A 4FB7A 5KITA 4JGDA 5CZ0A 1QPRA 2F84A 3W74A 3CT7A 5E1QA 1IIHA 3GLCA 4HN4A 3A22A 4O57A 1S5VA 2X1UA 3L0GA 1W1ZA 4PODA 3O05A 1IXQA 1I2NA 4IQLA 1SFJA 1UASA 3S0CA 2TMDA 5CZJA 4RLIA 2XN2A 5K9CA 4JYFA 4UNLA 4CCCA 5KINA 4M7TA 1EIXA 4Z1AA 5D30A 3P62A 1DV7A 1ONRA 3K30A 4A2RA 1QAPA 2DZVA 3LCIA 1H7PA 3M1ZA 3PG8A 3RU6A 1KTNA 4WOQA 5C2XA 3UZ5A 1SPQA 4UTMA 3M41A 2TSYA 8TIMA 3S5NA 4ZZ9A 3NL6A 1EWEA 2RDUA 3O6YX 3NQ2A 3LXBA 3KXQA 2E6YA 4Q4KA 5BNKA 4KFNA 4WOZA 5DELA 3G3MA 1YDVA 1W5OA 2JKEA 2OZ0A 2BXVA 4IJBA 1FDYA 1IXNA 3S9YA 3NQMA 3LI0A 4HNNA 5LNVA 3PBVA 2C19A 3BK0A 4MLRA 5HUPA 3GKAA 4PL2A 1RQBA 1YADA 1WOAA 4KKXA 4ADTA 1C29A 4UR7A 1TPUA 2I1OA 4Z08A 1H63A 1DL3A 1FCUA 1EUAA 2J9YA 3ZFHA 2A85A 1IXPA 2Q3RA 2E6FA 3LHUA 4N6EA 5L6UA 3EB2A 1LM1A 4IPIA 1VLWA 1JULA 1DORA 1VJIA 4X3ZA 3LHTA 4RZ6A 4W9TA 4Y90A 1UUOA 3WJXA 3FJ6A 1LRNA 5F1VA 3W7MA 3W7CA 1TYGA 2E5BA 4CCDA 4TO8A 4M6VA 1FWTA 4FF7A 4NXKA 5EA9A 3TV8A 3P84A 4JTGA 4A22A 2WOQA 4S2CA 3KRUA 2GQ9A 1FWSA 3MHGA 4MUZA 4IXHA 5A5WA 3MP4A 4GWEA 1DHPA 5EBUA 4ZL1A 2VEMA 1UBSA 1OF6A 4UTTA 2LLEA 3R12A 5AHFA 3EX4A 3NQAA 3F1QA 5TIMA 5I3GA 3LRLA 4EWND 2FJKA 1QOPA 5AHIA 4CLMA 1GG1A 5CKSA 3M5VA 4G1KA 4MY9A 3C3NA 1H51A 3G1HA 4MIMA 3CIXA 5KSWA 4JTJA 2ISVA 2X16A 3LCLA 1BWKA 2NV1A 3B03A 3VE9A 5BOOA 3W84A 4O54A 5HJLA 1H1YA 3SW6A 3BGJA 4LC8A 4UTWA 2GQ8A 3SZ8A 3C2VA 4LS1A 4Y8FA 1D9EA 3GDTA 5F2MA 2RKXA 1ZY9A 4YWIA 3FFSA 3H55A 1SO5A 5HMSA 2VENA 1UUMA 3HB9A 2ABAA 1TPB1 3MO7A 3PY2A 2ZZ2A 3WJYA 2CZ5A 4LY8A 3EX3A 1TMHA 3HF3A 3NPWA 3ANYA 4LV4A 3KRZA 4AWTA 3W23A 3NO5A 2YCEA 3GYEA 1XM3A 3TJLA 5HQEA 1QMLA 2QCCA 3LCFA 4LVAA 1ZALA 3C6CA 2I14A 3TXVA 3L65A 3DAQA 1RVGA 2ZZ3A 4JS3A 1KV8A 3W1LA 1HO1A 4UTLA 1J4EA 4ONVA 3E96A 5I3KA 1N7KA 1BWLA 1RZMA 3W7IA 3LXAA 7TIMA 1OFOA 3BPWA 1H1ZA 2WPBA 4KFOA 4XZ9A 1LYXA 1TJRA 3LRMA 1KBIA 4NT0A 3M6YA 2A7PA 2QJGA 3GZ3A 4ICNA 3N73A 3N3MA 1JCXA 4NX5A 1JVNA 3MBFA 1V5XA 4N4QA 3O07A 1OX5A 3LI1A 3UZJA 2DZSA 2ZRWA 5LZLA 3L5AA 3AJXA 3P60A 2ATMA 3NNTA 4GBUA 4UFHA 3O63A 4LVDA 4YCOA 2Y7DA 1AG1O 4GFSA 3GR8A 3NQFA 4MYAA 5EMUA 3G1XA 4UCGA 1JCLA 2NX1A 3W2JA 1L2UA 1GZGA 2NWRA 1EEPA 3IGSA 2DZXA 2GPTA 4MVAA 4PCFA 2EAWA 4JTKA 1BKSA 5FI8A 1KV5A 2NUYA 3PUOA 1JUEA 3G24A 1P0NA 3BVJA 4LS0A 1AL7A 1RPXA 4U4MA 1G6CA 1Q6LA 1OYBA 1JR1A 3BV4A 3W1UA 4M5PA 3PF3A 4AB4A 5HR7A 3GDLA 1KLYA 4R53A 4O17A 2FIQA 3C0JA 1QWGA 2JGQA 4RR4A 3FOKA 4H4IA 3IIVA 3IVSA 3R13A 6ALDA 1LP6A 1LLWA 4JY9A 3UXAA 3P8JA 3I7SA 3QF0A 5LKYA 3GKFA 5LHFA 1XFBA 2ZZ7A 4O19A 4TMCA 4HPJA 2NZLA 4HNTA 4IX2A 3JS3A 3DXIA 4C1LA 5D09A 1TPWA 3IV3A 4OE7A 1K8YA 1THFD 1W3NA 2BTMA 2P0OA 4IUOA 5J5RA 4O1CA 3E49A 3TFCA 4BI5A 3WK3A 4AEOA 3W9ZA 4LU0A 3QZEA 1TTIA 3DENA 3OHIA 3P82A 3I7QA 4N2YA 4LTSA 4OU1A 1O5XA 4CQ8A 3L9CA 1O60A 1SU5A 4JTLA 5FF3A 5G1YA 4PFMA 4Z1BA 4DO5A 5D05A 2YDAA 4DELA 3R8RA 1EP3A 1TV5A 2YPIA 3PVFA 5DCDA 4E2DA 1SZEA 3U8GA 3DBPA 5FF7A 1JCYA 2VFDA 4WQ6A 4IMCA 3P80A 3TR2A 4N9DA 4XWUA 2B7OA 2B7PA 4DPPA 2QUUA 3MYOA 4X22A 5F2LA 1H7OA 3FYPA 4JTFA 2G95A 3C56A 3S1XA 3OVPA 2RDWA 1X1ZA 1VYSX 3SFKA 1N55A 4TX9A 3TK7A 2G96A 2X2GA 2QAFA 2CZFA 2V30A 2FPYA 1JCNA 4MFDA 4JDBA 1F2JA 4QIUA 1P5BA 2Y63A 3W7PA 5LSMA 1JQVA 1W56A 2VFGA 3A9IA 3RMJA 5LNUA 3ABRA 4I9AA 3I7RA 1SO6A 3M0ZA 4I7VA 4MJZA 3U2OA 5C5YA 2ATSA 2EKCA 1QCWA 1J5TA 1KA9F 3CB8A 4R34A 1U83A 1TREA 3W1PA 1ME8A 4QJ1A 4JR5A 1TIMA 1LLZA 5EL1A 2V81A 4A29A 4K38A 5CZTA 4ORIA 2FQIA 4QSHA 1G4TA 1W8SA 4FNPA 3CQ0A 1GOXA 3EXRA 1W5PA 3N34A 3LOTA 3QFEA 1H60A 5AB3A 1F7BA 3C2OA 5EY5A 1P1XA 4DEFA 3NM3A 3DU0A 1D3GA 3P5YA 4GC4A 3DH7A 3TDFA 4QQ3A 1K7EA 4JYDA 5FEXA 3DFTA 1O94A 5HUOA 2C1HA 3WJZA 3EKZA 2WJZA 4NVTA 3IVUA 3SJ3A 2GUUA 3LGEA 3KVJA 5AOUA 1EA0A 3BLEA 2Y7EA 3MHFA 1ADOA 1JQXA 5LNSA 4O1AA 2OT0A 3W7HA 4LOCA 3PG9A 1VQTA 2Y88A 3S8HA 5K2ZA 3PR2A 3EWXA 3GX9A 2ZZ1A 1FXQA 1I2PA 1Z41A 3GIYA 4JTHA 1FWNA 4Z0SA 4AWUA 3RF9A 3W7QA 5DBUA 4XBSA 3PBYA 2CFFA 4RX0A 5A8GA 3TQVA 3DKLA 2V2HA 5G5IA 2DZWA 3OVQA 4YL2A 1QNVA 3PM6A 3LHWA 3QH2A 1KBJA 3KHJA 2RHGA 1YXYA 4NUWA 3WJWA 1DVJA 4J9JA 3PAJA 1T96A 1MO0A 4X2RA 1A5SA 3ABQA 2J9XA 3UWZA 1F5ZA 4ZQMA 1ICQA 3UXDA 4JTIA 3NM1A 3NQCA 3P5ZA 1J2WA 4WXYA 3TMQA 2E5CA 4O0ZA 4EF9A 2EF9A 3LHVA 3KFTA 1PCWA 3IGUA 1B3OA 3A23A 3NL5A 3LHZA 3UYCA 2OJPA 1E51A 3F4WA 3QC3A 3QM3A 4Y9AA 3IRDA 3S5OA 5C6MA 1T8XA 4UFJA 1OFAA 4YLWA 4S2BA 3VCRA 2PE4A 3INPA 4NXSA 4O10A 4LVGA 2KZHA 4PTNA 3NAVA 1Q6RA 4MLJA 1FWRA 4UTTC 5D2WA 2E09A 5BW6A 3W87A 3IGXA 1ME9A 3B8DA 3GVGA 1TSIA 4Y6GA 1OYAA 1LZOA 3BW3A 2R8WA 2ZRUA 1AW5A 3M9YA 4JICA 1XBYA 2A6LA 3VFLA 4DPQA 5D38A 3L68A 2ZA3A 2EPHA 1VCFA 2XN1A 4O52A 4FX8A 3DFQA 2DU2A 1F74A 5D32A 4UTWC 4Q32A 4OWGA 4B5NA 3OVRA 1JRBA 1F05A 3SSJA 3C2RA 3HJZA 2I9EA 2YXGA 1JUBA 3OEXA 1PIIA 1A5CA 2VFFA 2NXGA 3NPVA 5D2VA 3TSDA 2AQWA 1GT8A 2NX3A 3HO8A 3E0IA 2FB2A 4N02A 1QPQA 5KTLA 1QPNA 3A24A 4PH6A 1KM4A 1XL9A 2A1YA 4XKYB 4OGZA 4HSNA 3PUEA 3DHFA 4DBDA 4IWWA 3C2FA 5AHLA 4OV9A 3R2GA 5E0KA 3TSMA 5I3FA 1L9WA 3NQ8A 4Z1DA 1KM2A 4LNYA 2IQTA 3FYOA 4GRSA 3W85A 2A7RA 3CU2A 2HSAA 5D2YA 4GNJA 3HG5A 4LVBA 1K8ZA 3GK0A 5EYWA 4MJMA 1QFEA 1LBLA 5K7JA 2B4GA 1FUYA 5DBTA 3MBDA 3FKKA 2Y6ZA 3I6RA 2NUXA 4NNCA 1LDCA 3CPRA 2A2IA 2YFNA 4XBKA 1EP1A 1YYAA 2B7NA 2UV8G 1C9DA 4MZ1A 5LGZA 2QCLA 5K9XA 4WX2A 3UWYA 2Z1BA 4O14A 2C18A 3LHYA 3PULA 2PCQA 5I3HA 3NPXA 3LXCA 3ZS4A 3QSRA 1K02A 1LROA 3VNDA 1UJPA 2YX0A 1HO4A 4ALDA 2QCFA 4M6QA 1GQNA 5CPOA 3TXZA 1JCJA 1PE1A 4MKNA 4MZYA 1V7YA 2QCHA 3RLVA 4DO4A 5KMYA 1TRIA 4FNTA 3W2KA 5HNRA 2VXNA 3M5XA 3W70A 4A3UA 3W1QA 3W7RA 1YTKA 1VHNA 2ZYFA 4JTEA 4TR9A 4JX5A 2X30A 3NGJA 3VE7A 3EX2A 2VELA 3W73A 4BFAA 2ZA1A 4R33A 1D3HA 1W3TA 2NX9A 4JIQA 5DY3A 4IMGA 2QF7A 4FX6M 1LRTA 4O1DA 1QR7A 4OHQA 2GJLA 1KTCA 1G69A 2OMAA 3THAA 4D2JA 4FIQA 4HHPA 4BWLA 3WK0A 3P8IA 4ML9A 4TIMA 3FJLA 3NZ1A 4PA8A 1R2TA 4O11A 3NOEA 1XDLA 3G1VA 2Y7GA 4O13A 3FS2A 4NX0A 4WJEA 2V2DA 1ME7A 3QMRA 4YCPA 4LUIA 3S1UA 3EWZA 1XUUA 1XDMA 4FXRA 5AYYA 4I7UA 3CEUA 2NUWA 3L2IA 2TRSA 2YZRA 1CW2A 2YSWA 4ORMA 1GPWA 1LBMA 2DP3A 1XBVA 2QCMA 1L6WA 5HR6A 3EX1A 1OG0A 1TQJA 1MEHA 4UFMA 3QEZA 2WQPA 2PURA 3T55A 4O1BA 2BLEA 4HNVA 1HTIA 4DF1A 3SIZA 3O6CA 3IEBA 1TB3A 3M47A 3NQ7A 4UMBA 2QAPA 4O4VA 5D2TA 1FX6A 2XN0A 4EIVA 1SZNA 1Y0EA 1I2OA 1OFPA 3QSTA 5T26A 1TTJA 3NEVA 3PBWA 3G1FA 2VFEA 1TPC1 3MJYA 3B0PA 4JX4A 5AC8A 1S5WA 4UTIA 3W83A 3LV5A 4M6PA 1H62A 1KTBA 4PL1A 4UFIA 4JXCA 3TC7A 1W5QA 3P67A 1RD5A 3KVMA 4HSOA 5H2ZA 3C52A 2FLIA 3QRHA 1CX9A 1SSDA 3HBLA 4FEZA 2OX1A 1OK4A 3FLUA 2WO5A 4O16A 5KZDA 2J27A 3W7NA 1S5TA 4I7WA 1K3UA 4NJJA 1KFEA 5FF0A 1VC4A 1BTMA 2BSLA 1LCOA 2CLMA 2XFWA 4YMZA 2ZTKA 3F03K 3STGA 4AHOA 3LERA 5CPLA 4AHQA 1FCBA 3P7YA 3MP3A 1A50A 4RKAA 2JK2A 1WX0A 3R89A 1RV8A 4GXMA 4ZQCA 4DBEA 3TA6A 3G3DA 1DOSA 3C4UA 2PRLA 2YW4A 3W86A 3ZWTA 1U5JA 3L5MA 5SWUA 4MY1A 5CG7A 3W3OA 3MW7A 4HKPA 4GUFA 3TKFA 5IBXA 2V82A 1VGAA 1P4CA 3TW7A 1S3HA 1KFCA 3W7LA 1A53A 2H90A 1YDNA 4R7JA 4RXGA 1FXPA 4UC5A 3NQ6A 3PS7A 3SR7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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