1MTCA

Glutathione transferase mutant y115f
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
PMILGYWNVRGLTHPIRLLLEYTDSSYEEKRYAMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGSRKITQSNAIMRYLARKHHLCGETEEERIRADIVENQVMDNRMQLIMLCFNPDFEKQKPEFLKTIPEKMKLYSEFLGKRPWFAGDKVTYVDFLAYDILDQYHIFEPKCLDAFPNLKDFLARFEGLKKISAYMKSSRYLSTPIFSKLAQWSNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glutathione S-transferase YB1
publication title Local protein dynamics and catalysis: detection of segmental motion associated with rate-limiting product release by a glutathione transferase
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transferase
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2002-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1mtcA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1mtcA01
4HQSA 5KN3A 4EDYA 4IN0A 1ON4A 2JL4A 3IXRA 5IQYA 2CZ2A 4BVYA 1S3CA 4V2NA 4IKHA 2JZRA 5L71A 1YY7A 1R7HA 1E2YA 4KE3A 4MF7A 5IOXA 3IK7A 1WOUA 2B3SA 2YV7A 1F3BA 4HOJA 4WF4A 4AJ7A 1MD3A 4EVMA 2LRCA 1TP9A 3KP9A 1SJIA 2R2JA 5F07A 3FR9A 5A4WA 1K0DA 3C71A 3FRCA 4IGJA 1T00A 1TI1A 5DQYA 3WGDA 2AHEA 4KDUA 5F0GA 4JR6A 2VUPA 1T8EB 2GS3A 3MNGA 1SYRA 4MF5A 4MPFA 5CRDA 5CAXA 1ZGNA 3LXTA 1H75A 4KSOA 1DBYA 3HCZA 1A8LA 2H8LA 2VOCA 1X0RA 1W4VA 2FCHA 2F9SA 2GZPA 3VK9A 1WMJA 4FH8A 2OBIA 2H19A 1JZWA 5F06A 1V9WA 3CRTA 3O6TA 1AIUA 4ZBDA 4PGTA 3DVWA 4D73A 2NDOA 3IC8A 2YJ7A 4V2LA 2LS5A 4EKZA 3VWWA 1PGTA 2LKUA 5ELGA 2PWJA 1FOVA 4ML6A 3HJOA 5E59A 1O8XA 4YAPA 5AIVA 4HU7A 3M3MA 1OC3A 3GKMA 5JWRB 2CX4A 4F0BA 3E9JB 3KIJA 4OMVA 6GSTA 5D9WA 4POKA 3ZRDA 4Q5NA 4L0UA 4RUVA 1XWBA 2KUCA 3TDGA 1R5AA 1BQ7A 2HNLA 2LQQA 4PNFA 4KA0A 4PUFC 4FIWA 4MZCA 3RBTA 3CXGA 5B8AA 4OFMA 2BJXA 2XPDA 3ZMLA 3S9FA 1FAAA 3FHKA 3DD3A 3TB2A 1A2LA 2V32A 2FLSA 3DWVA 1OVNA 2E2GA 5FWGA 5HR3A 2K9FA 4KX4A 1OKDA 3HHVA 1RQMA 4E8EA 5ABRA 5DDLA 1ZMAA 3O3TA 5J3RA 3Q19A 2ZCTA 1OE7A 3EU4A 4MMMA 2YPMA 3QMXA 19GSA 1K0AA 4NAXA 1G0TA 1WJKA 3VLNA 1Q98A 2HI7A 4ECBA 4FYCA 3HJPA 5C00A 1GWCA 3TGZA 1U6TA 2LRNA 4ZILA 4K0NA 2ES7A 3GMFA 1K3OA 3LWAA 2H1GA 3GURA 1KEBA 3TRQA 3ZVJD 2YJHA 1PL1A 1ERWA 1USBA 5IPHA 3L78A 1Z3EA 2K8SA 4TR3A 1S3DA 3IOSA 4F0CA 1ZYEA 4HU9A 1M9BA 4BVXA 4EC0A 4F9ZA 3NOFA 5EY6A 3D0ZA 2HQTA 4POBA 2YOIA 5CYYA 4O92A 4OFTA 3TUEA 2H6XA 3ZMKA 4KNDA 2CAQA 3I9V2 2FNOA 4OD7A 1XFLA 3APQA 4XS1A 2R37A 1GTBA 1AQVA 4O5RA 4PURA 1GH2A 1T7PB 5IPGA 3OR5A 2A4VA 4RI6A 3GH9A 4POMA 4MH3A 2C0DA 1UC7A 4QL9A 1GNWA 3DIEA 3TCOA 1U88A 5IOWA 3P8WA 3ZIVA 3UEMA 2YNXA 4MJEA 4JRRA 1SK2A 1PA3A 3LG6A 1M7TA 1Z6MA 2NBSA 3IBHA 2DJ2A 1JLWA 1Y25A 2N5FA 3L9SA 4HZ4A 4HDEA 5D96A 1ZCPA 20GSA 5D73A 2VL9A 3IC4A 2IMEA 4JEDA 4HQZA 3H8QA 1GSSA 3F3RA 5H5QA 4XIHA 1V58A 2IL3A 4NV2A 4I5QA 3EINA 3V1WA 3CSIA 3GSTA 1HYUA 5D93A 2H74A 2HT9A 2IMDA 1G6WA 1XOBA 1EGRA 3ZFBA 1UA5A 4HZ2A 2L6DA 2AUVA 4K9ZA 2C8UA 1TI3A 2YN1A 4NV5A 5ECRB 1GLQA 4LLRA 4ECIA 2DJJA 3H93A 2DBCA 1ERVA 1OC9B 1FVKA 4GQCA 5HFIA 2X8HA 4N30A 2DSAA 2ZUPA 1VF1A 1UN2A 1V40A 3FEUA 2YWMA 4ZXGA 16GSA 1AC1A 3IR4A 3FW2A 3WYWA 4PTSA 2F3MA 1GP1A 3UMAA 1X5CA 2UZ8A 5CRGA 3WT2A 2IPAA 1WIKA 3TOUA 4GTUA 4H86A 5GSTA 4AJ6A 3I43A 4NMUA 4ZIJA 4EE0A 1M99A 4JBBA 3ZIJA 3UIWA 4MABA 3WT1A 1PMTA 3AY8A 2KOKA 4I97A 2RLIA 4F2IA 3PGTA 1CQGA 2OKAA 4EL1A 2DJKA 1O6JA 11GSA 2XBIA 3M9JA 1SL1B 3D22A 5DALB 4K0GA 3UVTA 2OACA 2C3TA 3HA9A 4MF6A 4XRAA 1Y6EA 1FW1A 4IBPA 3LYPA 3GUSA 2PERA 1VF4A 2OE1A 2WGRA 2IFQA 2GQKA 5DVBA 1QXHA 4HUAA 2L57A 4G10A 4NWYA 5DJLA 4KCEA 4OWYA 1VF2A 2LJKA 5ECOB 4AF2A 1THXA 3FZ9A 3GA4A 4O7HA 2EIQA 1SK1A 2P5RA 3TKSE 5ECNB 4N0ZA 2H0GA 2JACA 17GSA 2XHFA 1HNAA 3NZNA 4G2EA 4O32A 4K2DA 3C1SA 4ACSA 4KDXA 4MPGA 4N0VA 3VI5A 2PU9C 3K8NA 3VI7A 3TKQA 4QL7A 4LA1A 1K0CA 2HFDA 5DBQA 4NPBA 2F8AA 4HEA2 1JZDA 1YEPA 3H1NA 1GUKA 4XHMA 1F9MA 2GSSA 3KH9A 2O89A 5IMCA 1Z5YE 2VLUA 4IJIA 3H4KA 5G30A 1PKZA 3KD0A 6GSWA 1TK5B 2WB9A 4FYBA 4GQFA 3EWLA 2O8VB 2R5GA 3M8NA 2VL3A 1YKAA 5AISA 1PN9A 4N10A 2GZYA 3RDWA 2I3YA 3HZ8A 3GH6A 3GKNA 1F2EA 2VM2A 1TRVA 2OE3A 2ON5A 1M9AA 3FZ4A 4KDYA 2LNTA 2YCDA 5LD0A 4Q5RA 2WZ9A 3BBYA 5DJMA 3QAGA 1V57A 4WEYA 1GUMA 4GXZA 4IJ3A 4HI7A 4NHWA 3UAPA 2VCVA 3G7IA 4DSSA 3F6DA 4MZBA 1XCCA 4ILFA 18GSA 3P7XA 5LNKe 3A2VA 3IV4A 3J7Yb 2LJRA 3WGEA 1HQOA 2CVDA 22GSA 1GSUA 1PRXA 3DGQA 1B4PA 1R4WA 4NXIA 4WF5A 3R3EA 3VWVA 3N5OA 1G6YA 1ZOFA 5KN1A 2XPEA 3E0UA 2REMA 2DJ0A 3F6FA 1VRSD 1B9YC 2MMNA 5IM9A 2V6OA 1FVJA 2VD0A 3DVXA 4I2TA 2WFCA 3F0IA 3CTGA 1AQWA 4DSRA 2DJ3A 5KEJA 1HNCA 4HJMA 2J23A 1XZOA 4BL7A 2C0GA 4V1Ag 2N5BA 1QMVA 3UJ1A 4ECCA 4L8EA 3M1GA 2FGXA 2LEGA 4KB3A 2H1BA 4K7OA 5IMFA 3LEFA 5BMUA 4MJAA 2H1AA 1GSYA 3FZAA 1T1VA 4KSMA 5COHA 2BTOT 2LSTA 5IMDA 4GCIA 2C3NA 2H73A 4IHUA 2H0IA 1GSDA 2YWIA 3L9VA 1J0FA 5JCUA 2VCXA 2R6KA 1NHOA 2LRTA 3IPZA 2FHEA 1XXUA 1GNEA 4K7NA 5GZZB 4X1UA 4OCEA 1MTCA 1OC9A 4TVEA 2IFQB 4XS6A 2IJYA 4K8MA 2L4CA 1XW6A 1NHYA 3Q74A 3BD2A 3KXOA 3MWHA 1K0MA 3U5RE 5A4UA 4ID0A 4EDZA 4YH2A 5ECHB 3GX0A 5ECIB 3TKRA 3IHQA 1DSBA 3C1RA 4WR5A 5EL8A 1OYJA 3FR3A 5DCGA 2VM1A 3Q6OA 1NSWA 3F4TA 3C73A 5J41A 1PX7A 2DIYA 4I8BA 1WE0A 3CSJA 4KUNA 4PQIA 2OE0A 4XS4A 3TKSC 3TOTA 1EGOA 2HRKB 2VLVA 1SKWB 2B5XA 3D6IA 5DALA 1M2DA 1XWAA 2CX3A 4WBJA 3GSSA 4I6XA 2C4JA 4L5OA 4LL4B 5EVOA 1BX9A 2HXKA 3IK9A 3W8JA 1PD21 3ZYWA 4DEJA 4K7IA 3PR8A 3FR6A 1TW9A 4KW6A 1HNBA 1JLVA 2GSTA 3H79A 2H72A 4IP6A 2RUFA 2MMOA 2KP2A 2N5AA 3BCKA 4CDOA 1EEJA 2EIOA 1EOGA 3RHCA 2M80A 3EMXA 1TOFA 1JHBA 1FO5A 4MCUA 4G9HA 1FB0A 4JR4A 4PQHA 1HD2A 4BWSA 1BJXA 12GSA 1Z7PA 3ZL5A 1OAZA 3VWUA 2VL2C 2L4QA 1EV9A 2CZ3A 4PX1A 4DSSB 2QKEA 2YWNA 4TR1B 1MEKA 4K6XA 1T3BA 1DE1A 4FYUA 2ALBA 5ECMB 3R2QA 1QGVA 3DXBA 4TR0A 4DSQA 5CO3A 3D4MA 1SD8A 2HZFA 2A2RA 2YWOA 1AQXA 3IAS2 1IYHA 3HDCA 3VPQA 5B6MA 3UARA 4IQ1A 2IWTA 3GKKA 3HXSA 2XC2A 3D4TA 1BG5A 4GWRA 2EC4A 1ACVA 3TJGA 1IYIA 1TDIA 5H5RA 2J9HA 4BL7B 4N11A 4MLYA 3L0HA 1EWXA 2VIMA 4CW9A 5B8BA 1U87A 1YQ1A 4MDCA 2HSMB 2H6ZA 3RPNA 4MA9A 1MDJA 2X64A 2VAFA 4TXVA 4WETA 1QFNA 2B1KA 2VCZA 4V1Ap 1GL8A 5ECSA 1LU4A 4IW9A 5ECLB 1EP7A 1GTUA 4GLTA 4QQ7A 1TRUA 2HSNB 3GV1A 4HS1A 3ZZXA 1SD9A 2ZNMA 3FK8A 1ZZYA 2FWFA 5IO2A 2FA4A 5A4VA 3HKRA 2YANA 3ZFLA 1SJ6A 4F03A 2GT6A 2GVPA 3LSZA 1PX6A 1GSQA 2IMIA 1A8YA 1X9SB 3FKFA 3Q18A 3APSA 2WJUA 4FQUA 4MZWA 5GAPD 4EXJA 1R26A 3PH9A 3ISOA 4IVFA 2MBSA 3IAM2 4G19A 1YDKA 1YEXA 3PINA 2R4VA 1MDIA 1DUGA 4XS4B 4F82A 3QDNA 3GRXA 3GNJA 13GSA 3LQ7A 3TJKA 2H6YA 4RI7A 1ML6A 3PPUA 1SENA 2GLRA 2CQ9A 1SK0A 1AUCA 3N9JA 2H1DA 3DRNA 3HZ4A 5G2ZA 2GGTA 3L4NA 1K0OA 3KGKA 2FWHA 4TXOA 4TW5A 2GQMA 2VCWA 3GL3A 4ZB9A 4Q5QA 2I81A 2L5LA 2O87A 3TJBA 5HFKA 2L59A 4L5LA 5CREA 1K3LA 1W89A 1A2MA 1NM3A 1A23A 4DVCA 4POLA 2VD1A 1ILOA 4OO5A 1A0FA 2GTUA 3P90A 3LGCA 1QQ2A 1F37A 5IMVA 4ML1A 4K1FA 1KBNA 1OKTA 2O85A 1NW2A 5JCWA 5CNWA 3D5JA 2HRKA 1TRSA 1XIYA 2P0GA 2G0FA 2H70A 2R3XA 4G0LA 4KGIA 4YAVA 4ZBAA 2FA8A 5LCZA 1WPIA 3F9UA 2V41A 2K18A 2QGVA 1BYEA 3IDVA 4XRDA 1AXDA 1QUWA 2MMZA 6GSSA 2H66A 1XOAA 2MYGA 2IMKA 4KAEA 2KLXA 3HVSA 3F3QA 1OC8A 1I5GA 3J7Yk 4IP1A 6GSXA 3VPTA 3M9KA 1SL0B 2HRNA 4LL1B 3L9UA 3QFAC 2WULA 5B6NA 2MMAA 1O8WA 3HVXA 3ERGA 2AV4A 1V98A 4IS0A 1F3AA 4USSA 1RW1A 2L5OA 1GULA 4IQAA 3TJFA 3KM6A 2HSHA 2M46A 3HD5A 2CT6A 1B48A 1RK4A 2HRAA 3LYKA 1LBKA 2IN3A 3GIXA 2DIZA 4ISDA 5DAKB 4XTSA 4TR1A 2LQOA 3P2AA 5JCGA 3HYPA 3IA1A 1WP0A 1I9DA 1M2BA 2RIIA 5AN1A 5CRHA 2XBQA 1XVQA 5H5SA 1O81A 3A3TA 4BPYA 5J9CA 3E3EA 2C3QA 5GAND 3GL5A 4X43A 5ENUA 3TRPA 1BEDA 1XWCA 2ON7A 1EZKA 1K3YA 2QSIA 4NHZA 1F6MC 2VL2A 3KH7A 1UVZA 2MBTA 3KMOA 2LTKA 5AGYA 1GUHA 1E6BA 1M0UA 2PMTA 3KZQA 1MD4A 1H4OA 2F51A 1PQNA 2HSMA 4IELA 5G1KA 5FHIA 1YF0A 3ZITA 3ZTLA 1WWJA 4Q5FA 4TOPA 1KNGA 4ZL9A 2I1UA 3VFIA 1G7OA 1OE8A 3I69A 3ED3A 5ID2B 2X99A 1GTAA 4J57E 1AW9A 2E2MA 1FHEA 2DMMA 3MAKA 2PUKC 3TKPA 3A2XA 1PKWA 2VCQA 3RHBA 1SKRB 3GX8A 1SKSB 5INYA 2H71A 3UBKA 2AB6A 2JADA 5D9TA 2E7PA 4EO3A 1LJRA 4EF0A 4ECJA 2YZHA 2CVBA 1TU8A 2PBJA 3APOA 4TXOB 5G1LA 3VWXA 1ST9A 2VO4A 4HJ2A 3IRAA 3GHAA 2FUG2 3CYNA 1SYXA 1J9BA 2C1YA 4GSTA 1VF3A 8GSSA 3F8UA 4L0WA 2K8VA 1ZYQB 5EPFA 2DMLA 5IMZA 3CTFA 2MZCA 1X9WB 1O85A 1A2JA 2FY6A 2O7KA 1TKDB 2I9HA 5DCHA 3C7MA 3GYKA 3EYTA 3W8SA 2PVQA 2HZEB 5HR2A 1GLPA 1U3IA 3JCML 3BOAA 5IIZA 2H0HA 3IE3A 1A24A 1QK8A 3FY7A 5ELAA 1SJZA 1U3AA 3ZVJA 1TK0B 2H76A 1XBSA 3TRXA 4GSSA 2JZTA 2D2ZA 2OADA 6GSUA 2BMXA 2HYXA 1GTIA 2AAWA 2X8GA 4WKWA 5HQPA 4G0KA 1XPVA 1TXXA 3UVHA 4PQ1A 1A0RP 5E4WA 2B1LA 4KCAA 3F4RA 2FWGA 3RPPA 1KTEA 4WBRD 3C8EA 3ZLPA 1TU7A 2YZUA 1MDKA 3US3A 1DE2A 4MP4A 2LNSA 4PNGA 5JWOB 5ECPB 2H75A 1O7UA 2F8FA 2WDUA 3G7YA 4OFNA 2HRFA 4TN8A 5D9VA 4BA7A 2JSZA 2NTOA 3A2WA 3DKSA 1BAYA 3VURA 9GSSA 2K6VA 3D21A 5JWQB 4JZQA 2JSYA 2PGTA 5D9XA 2EIRA 2RM5A 3SBCA 2X8CA 2VCTA 1Z7RA 1FG4A 4E8HA 4BVYB 4ZB8A 1Z9HA 4I2UA 2TRXA 1N8JA 2HLSA 3UBLA 5J4UA 4BWQA 4GSNA 4MK3A 2TIRA 3QAVA 1YKCA 2OBKA 3LORA 5HR1A 4FO5A 4X0XA 2LJAA 3GN3A 1XWKA 3TJJA 3QR6A 1ERUA 3F63A 1TK8B 5KN2A 4ZB6A 1WRYA 1XWGA 4GF0A 5DAKA 3ERFA 3LFLA 3DYRA 1Z6NA 3GTUA 1FB6A 1C72A 2JU5A 2LUSA 2B7KA 2YP6A 2DJ1A 2GSQA 2AYTA 3EURA 1YZXA 4V2MA 2QC7A 4TR4A 3DMLA 1V2AA 2DC5A 1XW9A 4JE1A 1K0BA 5F8BA 1M2AA 1X5DA 5CP1A 1R5PA 4EUYA 4D73B 3BCIA 2V2GA 5G5EA 5HFGA 1AAZA 4ULXA 3UL3A 2KP1A 1GSEA 4J56E 1ABAA 5G31A 4KH7A 1PSQA 3G7JA 5C04A 4ZL8A 1CQHA 2B5YA 3DEXA 3KJYA 1B4QA 3LXZA 3CSHA 3GKXA 2I4AA 4OO4A 1T4ZA 4GRFA 4MJCA 2CV4A 4RQXA 2PN8A 2TRCP 4ZL7A 5IO0A 5F05A 2B7JA 5GSSA 3ME7A 5G5FA 2V6KA 3ERWA 2WRTA 1VGLA 3QCPA 1ZL9A 3SWLA 3QPMA 2V1MA 5ID2A 3FYGA 5HR0A 3EMPA 2GDRA 2C0EA 3WGXA 2GSRA 3O76A 3A5WA 2NPBA 2LV3A 7GSSA 1PL2A 1YJ6A 1X5EA 4AGSA 3GFKA 3KTBA 4MH2A 4WXTA 2L6CA 2KHPA 3W6GA 2PVOC 1JFUA 2YV9A 1TJDA 1ERTA 1THOA 3QAWA 3BJ5A 3M0FA 5AIXA 3F4SA 2OJLA 5A5KA 1B8XA 4OCFA 2A2SA 1J08A 3I6AA 2IMFA 3UOMA 3HVVA 5DQSA 2B5EA 2CA8A 3EVIA 2HSYA 2FWEA 1G7EA 3KP8A 3MSZA 2C0FA 5KN0A 3HY2A 5ECQB 2FD3A 2GZZA 3CBUA 2E0QA 3MDKA 2P5QA 2WCIA 2CVKA 5ECKB 3QOUA 6GSVA 1GRXA 2P31A 4LMVA 4WR4A 2H01A 3FZ5A 1JZRA 2RUEA 4PXOA 3HJMA 2GQLA 4G0IA 1EP8A 1T4YA 4ZBBA 2HZEA 2B6MA 1URMA 4CHSA 4Z7XA 4BVXB 3G9BA 2VLTA 1N2AA 3CRUA 5J5NA 1B9XC 5CRWA 1K0NA 4XCSA 1YF1A 2PPTA 2OA7A 1SL2B 3LJRA 2JZSA 5FT3A 1EEMA 4LMWA 1JZOA 4J2FA 3U6VA 2AJQB 4P3YB 14GSA 3ZREA 2C80A 2Z9SA 6GSYA 1TRWA 2G2QA 4YQUA 3CMIA 3QFBC 4JU5A 1O73A 3EU3A 4RQRA 2WS2A 2DLXA 4MJBA 2IIYA 2GT5A 1XW5A 3TKSA 4YQMA 1Q4JA 3RAZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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