1MTCA

Glutathione transferase mutant y115f
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
PMILGYWNVRGLTHPIRLLLEYTDSSYEEKRYAMGDAPDYDRSQWLNEKFKLGLDFPNLPYLIDGSRKITQSNAIMRYLARKHHLCGETEEERIRADIVENQVMDNRMQLIMLCFNPDFEKQKPEFLKTIPEKMKLYSEFLGKRPWFAGDKVTYVDFLAYDILDQYHIFEPKCLDAFPNLKDFLARFEGLKKISAYMKSSRYLSTPIFSKLAQWSNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Local protein dynamics and catalysis: detection of segmental motion associated with rate-limiting product release by a glutathione transferase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase YB1
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
total genus 75
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2002-09-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1mtcA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1mtcA01
3MDKA 4NWYA 2C4JA 2MMZA 3DVXA 3F0IA 3APOA 2KP1A 1I5GA 4HQZA 1O7UA 3DMLA 1ZL9A 4MF6A 1THXA 4K8MA 1G7OA 2K18A 3IC8A 1XWGA 1M2BA 2X8HA 1BX9A 3IAM2 1K0DA 2VL3A 1GSYA 5ECRB 2WJUA 2IWTA 3ME7A 4RUVA 1ST9A 4RQXA 2NVLA 3C71A 2BTOT 3KP9A 2YCDA 2FWHA 1YKCA 5EPFA 1X5DA 1K0OA 2FGXA 2MBSA 1V40A 4CDOA 1B8XA 4OFTA 4K0GA 1E2YA 1OAZA 2P5QA 3KH7A 1FVJA 5DQSA 1TRUA 3GTUB 3C7MA 5KN0A 1TRVA 3EINA 2V32A 1SKRB 3U5RE 3KMOA 3I6AA 3A2XA 3RHCA 2H0GA 2WDUA 3GKNA 4KX4A 3TKSC 5HFGA 4DSQA 3E3EA 3HY2A 1MEKA 3TDGA 4BVYA 2E2GA 4N0ZA 3C1SA 3GMFA 3KD0A 1JZDA 3FK8A 2C0GA 4XRAA 2F51A 2HQTA 4PXOA 4K9ZA 1EOHA 1RK4A 3CTGA 3GN3A 3MWHA 2OBIA 4I6XA 4F0BA 2GQMA 2JL4A 5J5NA 4EO3A 3DWVA 1K0BA 2H74A 4WKWA 1B9XC 5B7CA 2B5EA 4H86A 2HI7A 4TR4A 1ERWA 2L4QA 4BWSA 1ERTA 5DCGA 1OC3A 3KH9A 4TXVA 1PGTA 2ZUPA 1G0TA 4L0UA 5IMDA 1A2LA 4ACSA 6GSWA 3RDWA 1SD8A 2OE1A 1FW1A 2KHPA 3KEBA 3FZ4A 1XIYA 1SYRA 2CQ9A 2H1GA 3C1RA 3Q18A 4GSNA 4ZL7A 4XHMA 2BMXA 3IK9A 1AQVA 11GSA 5G1LA 5ECNB 1XW9A 2ES7A 2MYGA 5LCZA 1O8WA 2O89A 5CRGA 2RUEA 3JCML 1YDKA 2C3TA 4XS1A 1AC1A 1CQHA 5BMUA 3QCPA 3F6DA 4ZB8A 3FR3A 3F9UA 3HZ4A 4HU7A 1TU7A 1PKZA 3RBTA 4CW9A 5IMAA 2YWOA 1GLQA 3OR5A 3KCMA 3M9JA 2C8UA 1ERUA 1TOFA 1TTZA 4I2TA 2H71A 1QQ2A 3SBCA 2GSRA 2AYTA 5CP1A 4NHZA 1JHBA 3ERGA 3HZ8A 2GZZA 2LEGA 3A2VA 1O8XA 2I3YA 5IMFA 4KDUA 1EGOA 1GNEA 1J9BA 2KLXA 10GSA 3N9JA 5F8BA 1R4WA 1K0MA 3P90A 1DE2A 2PPTA 1GTUA 3UARA 1SL0B 4KCAA 1U88A 3G7IA 3GUSA 4KH7A 2HSMB 2KUCA 4GWRA 1GSFA 1J08A 3WD6A 3KJYA 2AB6A 2YOIA 3ZREA 1AXDA 1PX6A 2EIRA 1DSBA 1YZXA 1X5CA 1GRXA 1SK2A 5GAPD 3CXGA 2HRKA 3IDVA 4GQFA 2JZSA 1A0RP 4QL9A 2J9HA 4IQ1A 2CVDA 2DLXA 4POLA 3UOMA 4GRFA 1GUKA 3G9BA 5CRWA 2ZNMA 2QGVA 1YF1A 2B5YA 1TI3A 2P5RA 1GSSA 3L4NA 3LSZA 3DIEA 4KSOA 3KXOA 2FUG2 4NXIA 2H8LA 4HZ4A 2RIIA 1THOA 4JE1A 2LRCA 5F07A 4KDXA 5GSSA 2AV4A 1VRSD 1T8EB 4ZL8A 2E2MA 2H6YA 1JZRA 4J56E 4TR0A 4MCUA 4EUYA 4K2DA 2DJKA 1XWAA 1Z6MA 2DIZA 1I9DA 1EGRA 2HSYA 5DQYA 1X5EA 1FG4A 2CAIA 3TKSE 2MBTA 2J23A 3M8NA 2PN8A 12GSA 1A8LA 2GDRA 4QQ7A 2NBSA 5HFKA 1XWKA 1PL1A 2CAQA 1XBSA 3HJPA 2HZFA 3TJKA 3QOUA 4LA1A 4PQIA 2DJJA 1Y25A 1MDIA 1LU4A 5CO3A 3IK7A 5ECOB 4ISDA 4HZ2A 3VI5A 4AGSA 2H1DA 3CBUA 2O85A 4F0CA 1KBNA 2CA8A 4GQCA 4KGIA 4KDYA 1LJRA 2GTUA 2MZCA 2DC5A 5FWGA 2HRFA 2O7KA 1FOVA 2C0FA 1R5PA 4NMUA 4V2NA 1R5AA 2A2SA 3D0ZA 3TJJA 2YJ7A 1PA3A 3TJGA 5G1KA 3UVTA 4Q5FA 2IMKA 2YN1A 1V98A 4YQUA 4BVYB 3Q19A 1QMVA 1AIUA 4D73B 5F06A 4ECJA 3IA1A 4G0LA 2VD0A 2OBKA 4AJ7A 3C8EA 2H6ZA 4JEDA 1MTCA 3IAS2 4WF5A 3DXBA 1X9MB 4MA9A 3LYPA 4HOJA 14GSA 3KGKA 5L71A 5KN3A 3ZVJD 2L6CA 1PKWA 1QUWA 1Z9HA 2YWIA 1TK8B 1U3AA 4G19A 2YNXA 5LD0A 4IBPA 1ZOFA 3W8JA 3M1GA 2M72A 1NHOA 4I97A 2WCIA 4N10A 5D93A 4MZCA 4KNDA 5JWQB 1URMA 1RQMA 4GF0A 4V2MA 5HR1A 4XTSA 1O73A 2DMMA 4HU9A 2LRTA 2N5FA 1M9BA 4TR3A 4BVXB 1EP8A 3TOUA 4NV2A 3QPMA 3KM6A 1K3LA 3VWVA 4HI7A 5B8BA 4L0WA 4G10A 1TI1A 4OO5A 5G5EA 1T7PB 3DGQA 2PBJA 3H1NA 1A23A 3K8NA 4FO5A 4ECCA 1GNWA 2B1KA 4HJMA 1H4OA 1XPVA 2JU5A 3GV1A 1OKDA 3LXTA 5ECIB 2YWMA 1SENA 3E0UA 5C00A 2IMIA 1GL8A 3LFLA 3W6GA 2F3MA 2WZ9A 4I2UA 3U6VA 2MMNA 1GWCA 4PNGA 5JCUA 2R5GA 1Z7RA 3LYKA 4I8BA 3G7JA 2PVQA 4KAEA 3A5WA 3WT1A 3NZNA 2B5XA 1XVWA 1GH2A 1ZGNA 3GKMA 2C3QA 1B4QA 3TRQA 3F3QA 2PERA 1GTBA 2IN3A 4J57E 1F3BA 2B7KA 1X9WB 1F2EA 3AY8A 3I9V2 2FHEA 4PUFC 5IOWA 1K3OA 6GSYA 1WMJA 1USBA 3EVIA 4MABA 4EXJA 2EIOA 1AQWA 3FW2A 5JCGA 4DSSA 3TKPA 2OACA 1VF4A 2OA7A 2CX4A 1FVKA 1NHYA 1Z5YE 5JCWA 1VF2A 3VPTA 4KB3A 1CQGA 3J7Yb 3GSTA 3G7YA 3ZITA 4JRRA 3ZIJA 1GULA 2V1MA 4Q5NA 4NAXA 3I43A 3ED3A 2HRKB 2R2JA 1SU9A 3EURA 2D2ZA 2I1UA 4X1UA 2XHFA 2VLTA 4CHSA 4XS4B 4D73A 1SYXA 2FWGA 3TJBA 4HUAA 3QAGA 1M2AA 1YY7A 1PQNA 2FD3A 3BBYA 3J7Yk 3D22A 3EC3A 3GL5A 4O5RA 4FYUA 2RUFA 4LMVA 4IHUA 3FY7A 1R26A 2I9HA 3Q74A 2K8VA 4GCIA 4F2IA 4F9ZA 4PX1A 2H1BA 1SJ6A 3GX8A 4XRDA 2H1AA 3ZYWA 5GAND 1WWJA 1C72A 2E0QA 4K7IA 3GURA 3TJFA 1YJ6A 2I81A 1TRWA 1MD4A 3DD3A 5HR3A 2YZHA 1XXUA 3HD5A 4TRXA 3TUEA 1NSWA 3F4TA 19GSA 4ECBA 4ZIJA 2M80A 4BVXA 2GZYA 2VLVA 5CAXA 1EEMA 5J4UA 2F9SA 1BQ7A 2LJRA 3QR6A 4FQUA 3EMXA 4WR5A 3HDCA 3KTBA 4L8EA 1ERVA 1ZZYA 2LNSA 3O76A 1K0CA 2H66A 3P7XA 1FHEA 5C04A 4I5QA 2GLRA 1U3IA 2V2GA 2TRCP 3M3MA 2PGTA 1V2AA 5AGYA 5G2ZA 1Y6EA 2FY6A 5E4WA 3HVSA 1M7TA 2HLSA 4AJ8A 3LQ7A 5IPHA 4MZBA 4MZWA 3KZQA 2WULA 5B8AA 2C0EA 1AAZA 1KEBA 1M9AA 2L57A 4RI6A 3F3RA 2VL2C 4MMMA 16GSA 4V1Ap 2CVBA 3BCIA 5LNKe 2GT5A 4IW9A 2REMA 3MSZA 1U87A 2PMTA 5HFIA 2VIMA 3RPPA 2R3XA 5ID2A 4ML6A 4KW6A 3LORA 4V1Ag 1GTIA 3CSHA 2VM1A 1BJXA 1Q4JA 1OC9A 1T1VA 5A4WA 3GIXA 2KP2A 17GSA 4ULXA 1GSQA 2LUSA 1YQ1A 2L59A 2IIYA 4AJ6A 1W89A 8GSSA 4PQ1A 3H8QA 1TK0B 5ABRA 2H70A 1Q98A 4JBBA 1ZMAA 3LG6A 1ZCPA 2OADA 1X0RA 4IELA 1OC8A 2UZ8A 1BEDA 5J9BA 1ON4A 2LKUA 5IOXA 3QAVA 4XS4A 1A8YA 4TN8A 5GZZB 3IXRA 1JFUA 2IPAA 1E6BA 2KOKA 3LXZA 4YH2A 4EVMA 5CYYA 2G0FA 4JZQA 2IL3A 2LTKA 2CV4A 2L4CA 4IP1A 4WETA 1GSUA 2H76A 1O6JA 1WPIA 1VF3A 2H73A 4V2LA 1DUGA 4YQVA 2LSTA 3GKXA 1QK8A 4TW5A 1A2JA 3D5JA 3WGXA 1IYHA 5D9WA 4K0NA 2C80A 2OJLA 5AN1A 2HRNA 1KNGA 2H6XA 3QFBC 4PNFA 5KN1A 4OFMA 1K0NA 4K1FA 5H5QA 4ZB6A 1AUCA 1IYIA 1XW5A 2VL9A 5EVOA 3VFIA 4BWQA 1EV4A 3BJ5A 3F4RA 2WGRA 3A2WA 2GT6A 3D6IA 1QGVA 2XPDA 5CREA 2PVOC 3HJMA 5J3RA 4IN0A 2V6KA 3EMPA 2QKEA 2QSIA 3TKRA 4Q5QA 3TKQA 1MDJA 3KTLA 2HT9A 3UBKA 1OE7A 4KSMA 1SK1A 3GYKA 3V1WA 3PH9A 3EU3A 1TDIA 3L9UA 1S3CA 2B1LA 4NPBA 4QL7A 3APSA 4HDEA 1XOAA 4GXZA 13GSA 1T3BA 1WOUA 1SKSB 3WGEA 1NM3A 3ZLPA 3A3TA 5ECKB 4DSSB 1SD9A 1SK0A 2X8CA 2N5AA 3PINA 1PRXA 4J2FA 5EY6A 2L5OA 3US3A 1UA5A 2HXKA 1EOGA 1M2DA 3LGCA 5IMZA 4N0VA 1QFNA 2IFQA 3MAKA 1SL2B 2FNOA 3E9JB 5CRHA 3GSSA 5ECLB 4BPYA 6GSVA 2XC2A 5IO0A 2CZ2A 4GTUA 5KN2A 3VWWA 1DE1A 4LL1B 3HCZA 2CZ3A 3D4MA 5B6NA 3H79A 5ECSA 1GTAA 4K7NA 4IS0A 1YEXA 3ZRDA 1N8JA 2H72A 3UAPA 2H0IA 2V6OA 5J41A 2L6DA 1ZYEA 3RAZA 2ON7A 2AAWA 3VWXA 3TRPA 2OE3A 2LRNA 1J0FA 4GSTA 4NHWA 2HE3A 2HZEA 4ZILA 2A2RA 4GLTA 1V57A 2C1YA 3ZL5A 5DJMA 3GRXA 3FZAA 4MPGA 2FA4A 2XBQA 3CTFA 3M0FA 1W4VA 3FKFA 4FH8A 4G9HA 1N2AA 5DCHA 5IQYA 4KE3A 2DJ3A 1MD3A 4MPFA 1F37A 2CX3A 4Z7XA 4N11A 3HHVA 5ECPB 4PTSA 7GSSA 2VAFA 4MLYA 2IJYA 4OFNA 3IC4A 5D9VA 4MJCA 1V9WA 4IVFA 4LMWA 4XIHA 1PMTA 3FYGA 1TRSA 2YZUA 1BAYA 4KCEA 4K6XA 4LLRA 4TR1A 1H75A 1SJZA 1HD2A 3CSJA 5IMCA 5A5KA 5E59A 1Z7PA 5AIVA 5DALA 4HS1A 4BA7A 3CRTA 3BD2A 2TIRA 4IGJA 3CSIA 4G0KA 3O3TA 2TRXA 2O87A 2VUPA 1OKTA 1GSDA 1XWCA 3QAWA 2B6MA 2H0HA 1TXXA 1WIKA 1B9YC 2RM5A 4JR4A 4ZXGA 3C73A 3FR6A 4MH2A 4MF5A 4O7HA 4PURA 4WEYA 2LJAA 3L9SA 1OVNA 3UMAA 1EV9A 2EIQA 5AISA 5J9CA 4ZL9A 4USSA 5ECHB 2V41A 3TB2A 3L78A 5ID2B 4WR4A 2R37A 1YKAA 3MNGA 2H30A 5F0GA 4TXOA 2B7JA 4OCFA 3QFAC 1OC9B 2K6VA 1M99A 2X8GA 1XW6A 4TVEA 1NW2A 3CRUA 1FAAA 4FYCA 3IRAA 5IPGA 1ABAA 3GH6A 2M46A 3Q6OA 4WF4A 1EZKA 3EE2A 4WBRD 2K9FA 4EC0A 4OWYA 4JU5A 3HVVA 1TP9A 3I69A 3HKRA 2HNLA 4RQRA 3GL3A 5IMVA 1B48A 1G7EA 3TGZA 4X0XA 4ZB9A 2VCQA 4BL7A 3UIWA 2A4VA 1T00A 1BYEA 4ILFA 1BG5A 2CT6A 5ECMB 1A24A 1Z3EA 5H5RA 4POBA 4EKZA 4TOPA 4EF0A 4MDCA 2FCHA 3IBHA 4KA0A 1TK5B 5AIXA 4WXTA 3ZIVA 3DRNA 3IOSA 3VPQA 2F8FA 2VCZA 3HXSA 1JLVA 4P3YB 3KMNA 2GSSA 1V58A 1K0AA 5IM9A 3ZMKA 3DVWA 2DJ0A 1A0FA 3GFKA 3QD9A 4ECIA 4OCEA 3UBLA 5DAKA 5A4UA 3APQA 2XPEA 2OKAA 1JLWA 3S9FA 2YWNA 2VD1A 2DSAA 2VOCA 1F6MC 1HQOA 1KTEA 1TKDB 2LQQA 2FWEA 5DBQA 1WP0A 4K7OA 3P2AA 20GSA 1GUMA 1GP1A 3VK9A 3FEUA 1SL1B 2JSZA 4EDZA 3RPNA 2VCXA 2PWJA 5JWOB 3TKSA 2GSTA 3O6TA 4MP4A 4ZBAA 3KIJA 1O85A 5D8IA 2B3SA 2AUVA 4FYBA 2PU9C 1T4ZA 3ME8A 3LJRA 1FB0A 3LWAA 1AQXA 1WE0A 3ZVJA 4YAPA 2YJHA 4EDYA 4OD7A 4XS6A 2AJQB 5GSTA 3ISOA 1HYUA 5IO2A 4IKHA 2YV7A 1FB6A 2DIYA 5EL8A 6GSSA 2CVKA 5KEJA 5FT3A 1PD21 1G6YA 2DJ1A 4OMVA 1XCCA 1GSEA 5CNWA 3N5OA 2LJKA 3WGDA 2LNTA 2IFQB 2JZTA 5G5FA 4IQAA 3EU4A 2R6KA 1HNCA 1AW9A 4LL4B 4ID0A 4IP6A 3HYPA 5D9XA 3D21A 4G2EA 2IMFA 3EYTA 5CRDA 3GH9A 1PL2A 2FA8A 2P31A 1GLPA 2VCWA 4OO4A 4ML1A 2X99A 3HA9A 2H19A 2GVPA 2X64A 2YP6A 5ENUA 3PR8A 4KF9A 4KUNA 3GKKA 2ZCTA 18GSA 4YAVA 3GTUA 1YF0A 2VO4A 5JWRB 2DMLA 4E8HA 2HZEB 4N30A 1TU8A 2HYXA 2WRTA 6GSUA 3FRCA 2JADA 4PUAA 2AHEA 3M9KA 3NOFA 1XOBA 5DJLA 3DKSA 1ACVA 5D73A 2R4VA 3F6FA 5B6MA 1SJIA 3GA4A 4DEJA 3VLNA 5ELGA 1B4PA 4L5OA 3GHAA 6GSXA 1EP7A 3LEFA 1LBKA 3ERFA 3W8SA 1QXHA 2ALBA 2RM6A 2VCTA 3D4TA 3KP8A 2DJ2A 1F3AA 3TRXA 1F9MA 4PQHA 1O81A 2VL2A 3PPUA 3R2QA 9GSSA 2GS3A 1JZWA 3IHQA 2MMAA 4G0IA 4GSSA 3WYWA 5ELAA 3BOAA 4MJEA 5H5SA 1ILOA 2XBIA 1SKWB 2YPMA 3UJ1A 3QDNA 2P0GA 3FR9A 2N5BA 4WBJA 4TR1B 3UVHA 2LQOA 5DALB 3RHBA 1VGLA 1HNAA 2JSYA 1WJKA 3BCKA 4XCSA 3NIVA 4MH3A 2IMDA 3F63A 2GZPA 3DYRA 22GSA 2H75A 1OYJA 5G31A 4E8EA 1JZOA 1K3YA 2ON5A 2K8SA 2HSNB 1R7HA 1RW1A 2HRAA 1UC7A 3ERWA 4ZBDA 2DBCA 3TCOA 1XFLA 6GSTA 4DSRA 3ZMLA 4POKA 4X43A 4MJBA 3PGTA 5A4VA 2BJXA 2VM2A 2C3NA 4HQSA 3L9VA 3IPZA 4O32A 4L5LA 3UEMA 2GGTA 1XVQA 4O92A 1XWBA 4TXOB 3IR4A 2VCVA 3ZZXA 3L0HA 3QMXA 1PSQA 1TW9A 2HFDA 5HQPA 3VURA 5D96A 3IV4A 2LV3A 1X9SB 1TJDA 3VI7A 1G6WA 1OE8A 3P8WA 2G2QA 2WFCA 1PX7A 5HR0A 3ZFBA 3GX0A 2O8VB 1ZYQB 4HJ2A 1UVZA 4MF7A 3DEXA 2L5LA 1DBYA 2FLSA 2JZRA 5D9TA 3FZ5A 3IE3A 4IJ3A 2H01A 3HJOA 3F4SA 3FZ9A 4FIWA 5FHIA 1ML6A 2RLIA 3R3EA 5ECQB 1EEJA 3WT2A 5COHA 1FO5A 3FHKA 2LS5A 4BL7B 4HEA2 5INYA 1WRYA 2HSMA 2HSHA 3CYNA 5DVBA 4YQMA 4Q5RA 2WB9A 2F8AA 4MK3A 3ZFLA 2JACA 2C0DA 4F03A 2YV9A 2IMEA 1T4YA 4POMA 4DVCA 4EE0A 1A2MA 5IIZA 1EWXA 1U6TA 2FWFA 2NTOA 2WS2A 4ZBBA 2GSQA 5DAKB 3SWLA 2NDOA 3H93A 4EL1A 4IJIA 2MMOA 4MJAA 2QC7A 3UL3A 5F05A 3CMIA 2EC4A 4AF2A 2E7PA 1M0UA 1YEPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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