1MWKA

Parm from plasmid r1 apo form
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
molecule keywords ParM
molecule tags Structural protein
source organism Escherichia coli
total genus 93
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA01
4XH1A 4K25A 4JN4A 3J8AA 3LDNA 3CETA 3MN6A 1KAYA 1BA0A 2AP1A 1JCGA 1H1VA 3MDQA 4H0XB 5AR0A 2GEMA 3H3NO 3VENA 2Q0UA 2HMPA 4K42A 3QBXA 5AQVA 3MMVA 1X3MA 4HWIA 1K8KA 3H1VX 3A0IX 2BTFA 3L4IA 3UKUB 3CJ9A 4BR4A 1U2VA 4CD3A 3ENOA 1HLUA 1E4GT 3SK3A 1DEJA 3H46O 4H5WA 4WQ5A 4B1XB 3C7NB 4M7XA 3TU5A 1QQOA 4RWTA 4XH5A 5AQSA 4BRIA 2CGLA 5AQZA 5EXWA 3WUHA 2YHYA 3M1FA 1BU6O 4GNIA 5AQJA 2P9PB 1QQNA 1QHAA 4FPAA 3U9ZA 5KPZA 2GELA 1NGIA 3O4WA 1WUAA 1GLCG 4FOEA 5F1XA 4IXCA 4IJNA 4MLHA 1NGDA 2YJEA 4GY2B 3S41A 5ADXH 2P9SB 3W0LA 3LM9A 5JLHA 1GLEG 2P9NB 3MCPA 1NWKA 3WXKA 4B1VA 3U4LA 2E20A 1KAXA 5BN9A 4B1WB 4BRCA 2AA4A 3ZETB 4DQ8A 3HBTA 5BRDA 1V4TA 1NGFA 2I7NA 5JMVA 1GLFO 3QMLA 2J4RA 2P9PA 2W41A 3A5NC 3EN9A 4M7YA 2NRHA 4BC2A 4MO4A 4BRMA 4CZHA 1D4XA 4CD1A 4CZLA 1IG8A 1NGHA 4A62A 2A42A 3BF3A 4JHDB 5AQXA 3RSEA 2Q36A 3HZ6A 3ULEA 4BR2A 3UKRA 2Q31A 4H0YB 2YI1A 4CZGA 1XUPO 4K41A 2E2NA 3DXMA 3M3ZA 2QWNA 3M6GA 4FSVA 3IUCA 1E4FT 1NGCA 3O8MA 4DHYA 5F2RA 3H1QA 3FZHA 2A6AA 1RFQA 1RGIA 3FZLA 1NGEA 4E1JA 2WUSA 3FLCO 4NO7A 4A2BA 4O8KA 1HX1A 2CH6A 4BR7A 3AY9A 3ENHA 4BRDA 1T6DA 2F9WA 4FOIA 4BGAA 1X9JA 3VEWA 2E2QA 3LDQA 4BRQA 1XQSC 1ATRA 1SZ2A 4BRHA 3KZBA 1BO5O 5EOYA 1T6CA 4FWPA 5EY4A 1ZBSA 1TUYA 1YUWA 2ZF5O 3O80A 1K8KB 1WOQA 3ZX2A 3FZKA 1X3NA 3MN9A 4O5FA 5AQPA 1HJOA 1U2VB 2CGJA 3O1WA 4RCHA 5AZJB 3R9PA 2ASOA 3L6QA 5FPEA 5AQKA 3FGUA 3VETA 4EIAA 3WXIA 3DAWA 3WQUA 2QWRA 3U8XA 5AQUA 3EKSA 3CJAA 3QFPA 3W3DA 4CZMA 4CBUA 1Z05A 2IIRA 1ZC6A 5I9EB 3SMPA 4FWKA 3CJCA 4M63C 1NM1A 5AQTA 4BR9A 5AZIA 4ISEA 4PKGA 5AQGA 2FSNA 2QWOA 1XC3A 4QS8A 5FPNA 4MO5A 4BGBA 5BR9A 4BQZA 3GDQA 1JCFA 4I6MA 3QFUA 1R59O 2IVOA 3VEVA 4BG9A 5CE3A 3MK6A 5AQIA 1QQMA 3IMXA 5AZJA 2E88A 4H5RA 2P9KA 2VYPA 3LM2A 1SQKA 2NLXA 5BRHA 3O08A 2A41A 2QWMA 4CZKA 3GE1A 1NGGA 4L3QA 4NB4A 3WEEB 2E1ZA 5F0XA 5EX5A 4CZFA 2H3GX 3CJ7A 4ISFA 4CZJA 2Q97A 3HTVA 5AQYA 1GLBG 3FFKB 5AQRA 3WXJA 3RSEB 3FZFA 2Q2RA 3BUZB 3ULEB 2QXLA 5FPDA 2P9LA 3QICA 4BQLA 3UKRB 1HUXA 4A61A 3DWLA 4YDUC 4B1UB 1CZAN 1TYQA 3DXMB 3U9DA 3ATUA 4H03B 4PL8A 4BR0A 5BPNA 4BG8A 5TKYA 2GTDA 4EAHD 3A5MC 1NGAA 1T44A 1LOTB 3WEEA 5AFUA 1KAZA 2CH5A 3AAPA 1C0FA 3DXKA 4JD2A 4MLEA 4Z94A 1ATNA 2QWPA 2BUPA 3CJ1A 3HSCA 4CJ7A 2YHXA 4FO0A 2ZWHA 4XEIA 1G99A 2P9UA 4B9QA 2V51B 4WQ4C 1BA1A 1ESVA 3CHWA 4BRPA 2E1YA 1DGKN 2YJFA 4LC9B 3HI0A 3VEZA 3BEXA 3VF6A 5ELZA 3FZMA 4H5TA 4PKHA 1YVNA 3R8EA 3ATVA 1QZ6A 3H6EA 4PKIA 4AM7A 2QW9A 1BOTO 1MDUB 1NBWA 1YAGA 2PAVA 2Q0RA 3GBTA 1V4SA 4B1ZA 5KQDA 5AZIB 5AQHA 3D2EA 3LDLA 3CIPA 4BRAA 4H0VB 4K43A 3VESA 3GOIA 4WQ4A 1JCEA 1HKCA 1MWKA 4IJAA 4CBWA 3L0QA 4I6MB 2YCHA 1NLVA 2FSKA 4BREA 2A5XA 2P9KB 1Y64A 4KBOA 3JXUA 3F9MA 4JAXA 4XH4A 2W40A 4FWMA 3ID8A 3O5BA 3VF2A 3JS6A 3QBWA 2CGKA 3VF4A 3VGKA 2P9IA 5ADXA 4EHTA 3D7EO 2V7YA 1GLDG 1IJJA 3GL1A 1BG3A 3D2FA 5BPLA 2ASPA 3EL2A 2ASMA 3B8AX 4J8FA 4H0OA 1Z6RA 3R6MA 3EKUA 3TPQA 5KPRA 3SLCA 4WQ5C 3G25A 2P9LB 3H45C 2F9TA 1HKBA 2GWKA 4ISGA 2HOEA 4IO8A 4BR5A 2HF4A 4H5VA 1RDWX 3ZEUA 4FWRA 3IDHA 2IVNA 1TYQB 3VEOA 2D4WA 1BUPA 1QZ5A 5LJWA 2ZGYA 1S22A 1GLAG 3CQXA 1EQYA 1GLJO 3CQYA 3DXKB 4BRLA 3WXLA 4CZIA 4JD2B 3MN5A 4CBXA 5BN8A 2FSJA 5AQLA 3BF1A 3EO3A 5BRFA 2FF3B 4QS7A 3A5OC 4QS9A 2QM1A 2YHWA 5AQMA 2NZTA 4A2AA 4DB3A 1S3XA 1NGJA 2PBDA 1GLLO 4C23A 2P9UB 2Q1NA 3I33A 4IZ9A 4FWSA 3VGLA 2HF3A 3AAQA 3LDOA 3MN7A 4BC4A 4RTFD 2FF6A 3HM8A 4FL9A 5KPTA 1NMDA 3H3OB 1NGBA 4H0TB 4BRKA 5JLFA 1HPMA 4F9OA 2ITMA 2D0OA 1Q18A 3IFRA 3VERA 1J6ZA 2GWJA 3DJCA 3VOVA 1KXPA 5E84A 4IWVA 2OANA 5KQ8A 5LY3A 3VPZA 3VEYA 4EHUA 3I8BA 1TUUA 3OHRA 4BROA 3UKUA 4EFHA 2QWQA 1YXQA 3C0BA 5AQOA 3D2EB 3C7NA 4FWLA 3FE1A 3P4IA 3GG4A 4YDUA 1U6ZA 3LDPA 4FWQA 4DCHA 2V52B 5AQNA 4BC5A 2D1KA 1ZXOA 1C0GA 4H5NA 3VGMA 4FPBA 5AQQA 5BPMA 3SJHA 4BRGA 3O1BA 2EWSA 5B8HA 3SMSA 3UB5A 4B1YB 5JICA 2GUPA 2P9IB 4BVPA 4BC3A 2A3ZA 4CZEA 5AQWA 2P9SA 3D2FB 3KVGA 4Y0WA 4WYBA 2P9NA 3A8YA 3VEXA 3A5LC 4AM6A 4BRFA 1BWFO 2QWLA 2UYTA 3WT0A 1DKGD 2E2PA 3BP8A 3ZETA 2IVPA 1SAZA 1MA9B 4CI6A 3KHYA 1LCUA 3O6WA 4BVOA 4FWOA 3QDKA 3ZEUB 2FXUA 5EVZA 2DPNA 4PL7A 2E2OA 4BRNA 5LJVA 1BDGA 3LL3A 3UE5A 1OKJA 2D0PA 3FR0A 4HTLA 2VWBA 4JHDA 5AQFA 1HKGA 1P8ZA 3QB0A 4FWNA 4H0PA 5FPMA 5E26A 1MWMA 1ATSA 2I7PA 3CERA 3WQTA 5AFUH 2ZGZA 3ZX3A 2E8AA 2VCPA 3AARA 3ZX0A 3CI5A 3CJBA 4JNEA 2KHOA 2FLOA 3EZWA 5BREA 2V7ZA 2A40A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EWRA 3EYZA 3F73A 3K9KA 3AVGA 3O9TA 1HNVA 5CYQA 4G9ZA 3J8AA 3QINA 3SQ1A 4WFAL 1BA0A 4GMJB 3L8BA 3NVKA 5CY4A 5AR0A 4K42A 3QBXA 1VQPN 4WF9L 1K8KA 2A1SA 2BTFA 4JKGB 4X64K 4GKKK 1RBRA 4ID1A 3HYFA 3L4IA 3O3HA 3PLAA 4ZTFA 3OBWA 3ENOA 4TSXA 1DEJA 1ASVA 2O8CA 4WQ5A 1IBMK 3HRGA 1QQOA 3C6AA 4CGDA 4N76A 2YHYA 1VSIA 1BU6O 4GNIA 5AQJA 5E41A 1Q9XA 2P9PB 2ITGA 3U9ZA 4FLWA 4LY7A 2PZSA 3Q7CA 2GELA 1GLCG 4OO1J 4IJNA 1NGDA 1OVYA 4GY2B 3DMJA 5ADXH 3NF6A 2HNZA 4LF7K 1NWKA 3M8RA 5BN9A 4CFAA 4BE2A 3ZETB 5H1SQ 4DQ8A 4H4MA 4GVEA 3ZCMA 5BRDA 3OY9A 1V4TA 4E0DA 3E9LA 4CECA 4CD1A 2W6KA 4A62A 3BF3A 1WSIA 3HZ6A 3ULEA 1WNSA 4B08A 4FJLA 3KJVA 4BR2A 3C6UA 1HYZA 2RHKA 4H0YB 4I2PA 1F21A 2YNFA 3DLGA 2E6MA 4DSLA 3SNNA 3V9UA 2F8SA 4IEEA 3IUCA 4N41A 1E4FT 2HHTA 3FZHA 1RFQA 2NRZA 4DFMA 1NGEA 4ZHRA 4A2BA 4M41A 3AY9A 1M1KO 4Z4EA 1VQKN 1KLNA 4BGAA 1A5WA 3VEWA 2E2QA 3LP3A 3P1GA 3G0ZA 1XNRK 1XQSC 4HUEA 3OJSA 5EY4A 3JAMO 1TUYA 3CM6A 2ZF5O 1K8KB 3NAEA 4FW2A 5AQPA 3S9HA 3O1WA 5AZJB 3K9JA 3NH0A 2O8CB 3AVJA 2O8BA 3FGUA 1WAFA 1K6YA 4CIGA 4KHPK 3DI6A 2QWRA 4LF9K 3U8XA 5AQUA 3QNOA 2XO7A 3LZIA 3CJAA 3QFPA 3OYBA 4KFBA 4CZMA 4CBUA 3B6PA 4FWKA 2OPSA 3NGZA 1NM1A 1HR0K 4ISEA 4YOXA 4JKFA 4HCBA 3O9QA 4B9NA 3I8DA 4QS8A 3MXMA 2HMIA 1ZBFA 2UXDK 4K0KK 4JI4K 3CFOA 2JWKA 3MWTA 3QFUA 1R59O 2IVOA 3VEVA 1ZBLA 4GVMA 4E7HA 1BIUA 1C0MA 2P9KA 1SQKA 2XY8A 1TL1A 4DUYK 2QWMA 3HSTB 4XIUA 4FK2A 5C2FA 2Z1GA 2QK9A 4NB4A 3WEEB 5F0XA 4ISFA 3T3FA 3HTVA 3MXIA 5AQYA 3QEXA 4KAZA 4N5SA 4HUFA 4AH9A 5HRRA 2Q2RA 3FZFA 4RW8A 4Q5VA 3ULEB 4MQ3A 2O4GA 4Y1CA 2X74A 4JK7A 4B1UB 2HBKA 3KD5E 2HHSA 2EHGA 4B3SK 3AVCA 3OYFA 2HNDA 4PL8A 1N34K 3SUOA 4BR0A 1NJXA 4FJJA 1IKXA 3ZSRA 1S1TA 3A5MC 4HVJA 1U49A 4KI6A 3RTVA 4YOUA 1C0FA 2F96A 4MDAA 4FJ8A 2Y1JA 4CFBA 3SQ2A 4LF6K 1W9HA 4IOCL 5HRSA 4KHQA 4CJWA 4CJTA 1TKTA 4DV0K 1HYSA 2BUPA 3HSCA 3V1OA 4FO0A 3V1RA 1LAWA 4LH4A 1TK0A 4CJSA 2HW3A 3Q7BA 4B9UA 1UOCA 2YJFA 1C1CA 1VSJA 3CC2N 3CPEA 3VEZA 3THYA 4C8LA 3VF6A 2P5GA 2OPPA 2F7TA 4CEEA 3PX4A 4A5AA 3FZMA 4I7FA 1YVNA 3R8EA 4KH4A 3HOSA 1GOBA 2R7YA 4AM7A 4BE1A 4K8XA 2ZD1A 4E19A 2QW9A 1DT9A 3E01A 3AO2A 3N4QA 3GBTA 4FLVA 4FCYA 4NLCA 5KQDA 4LFCK 3PY8A 3LDLA 4CGGA 3CIPA 1JLCA 1JCEA 1HKCA 5CHIA 3L0QA 4DV7K 4X66K 2YCHA 4F8RA 1NMNA 2P9KB 1Y64A 4O44A 3JXUA 2LSNA 2W40A 3O5BA 3RR8A 5KGXA 4O0JA 3ALYA 5ADXA 4DFJA 4DQPA 2FBVA 5KRTA 4ELUA 3D2FA 4FXDA 4ILHA 4CJ4A 4J8FA 3TPQA 3G25A 3OYNA 3LP0A 3H45C 2G8VA 3SCXA 1XC9A 3J81O 4OPJA 4J2DA 4ISGA 2HOEA 4IO8A 3DLKA 2HF4A 4BR5A 3KLGA 2KKZA 3ZEUA 1NJWA 3IDHA 4FLTA 1I39A 4LFAK 2GX9A 3L3UA 3V6DA 4JI5K 1Z26A 1BUPA 4DR3K 5GIOA 1NNEA 1JLBA 4KTZA 3CQYA 3NHGA 1HJRA 4JK9A 3J80O 2FSJA 3ZSOA 3BF1A 3EO3A 2FF3B 3A5OC 4DR5K 1WSGA 2NZTA 3LPUA 1S3XA 1A5XA 1NGJA 3L2VA 4HUGA 4BC4A 4RTFD 4JK8A 2FF6A 1B9FA 3ULDA 1NMDA 1ZBUA 3THYB 1NK9A 2ITMA 5C12A 1Q18A 2WBNA 1TAQA 1J5EK 2HVHA 5E84A 4IWVA 3T7ZA 3KIOA 4EHUA 2DFFA 1TUUA 1QSLA 3OYGA 5CR4A 3VQQA 4DFPA 1CZ9A 5I42A 2A1RA 1L5UA 3IS9A 2D0BA 3NBPA 3CXCM 4B3RK 4H8KA 3PUFA 3C7NA 1VQ9N 3VMFB 4DR2K 1U6ZA 1U04A 2G8UA 3SUPA 1ZXOA 3OYIA 3C95A 3VGMA 4FPBA 5AQQA 5LL6Z 2YHBA 3OYMA 5KGWA 1EX4A 3PX0A 1EO1A 1IV0A 3F2KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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