1MWKA

Parm from plasmid r1 apo form
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
b'MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
molecule keywords ParM
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 93
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA01
3G25A 3BUZB 4I6MB 3U8XA 1SQKA 5KPZA 1HKBA 1IJJA 3FZHA 3M3ZA 3ZX0A 4BC3A 1ESVA 4XH1A 4ISFA 4PL8A 1NGAA 3D2EB 3QB0A 3F9MA 4H5RA 4H03B 1ATSA 1HLUA 2ZGZA 4QS8A 1C0GA 1IG8A 4C23A 4GNIA 4CBUA 4K42A 4B1XB 1HX1A 2GELA 4O5FA 2FSKA 3D2FA 4BRFA 2IIRA 2GTDA 1KXPA 3VF6A 4BRHA 5AFUH 3VEYA 4XH4A 4CZHA 3WXLA 4CZFA 3I33A 5AQKA 3VEVA 4AM6A 3FFKB 3M1FA 4ISGA 2KHOA 2YHYA 2QWOA 5BRFA 2I7NA 5F0XA 2BTFA 2ZWHA 3DAWA 3AAQA 3P4IA 3O1WA 4H5WA 5E26A 1NGJA 4J8FA 5BRHA 3M6GA 3FZKA 4JHDA 1GLBG 5JLHA 2W40A 1ZC6A 4L3QA 4BRDA 5LJVA 1X3NA 3D2FB 4CJ7A 4RTFD 5AQLA 3U9DA 4H0OA 3DWLA 2D0OA 4FSVA 4M7XA 2QWMA 1BG3A 3CQYA 1Q18A 3ENOA 3O08A 3WXKA 3CERA 4EIAA 1HPMA 1K8KA 3RSEA 4PKGA 4PKIA 2QWLA 4B1ZA 4BGAA 5I9EB 3HBTA 4BRAA 5AQHA 2GWJA 3O1BA 1KAYA 1U6ZA 1X9JA 4CZMA 2NRHA 5AZIA 2E2OA 3EZWA 2ASMA 4IO8A 5F1XA 4FWQA 1HKGA 3WXJA 2QW9A 3WEEA 4BRMA 1NMDA 3VOVA 3TPQA 1NLVA 4FWRA 3TU5A 3VETA 1OKJA 3I8BA 2QM1A 2PAVA 4H0XB 4CZIA 3IUCA 1T44A 4QS9A 4CZGA 1K8KB 5JLFA 4EAHD 3HM8A 4EFHA 3U4LA 3MMVA 2E2NA 1QZ5A 4EHTA 4XH5A 1XUPO 1Y64A 4MO4A 3S41A 5AZIB 4BRPA 2E88A 1WOQA 1BWFO 4FWPA 3WEEB 2HF3A 3QBXA 3MN9A 4H5NA 5EY4A 3VGMA 4FWLA 2IVOA 4FWKA 5AQNA 2PBDA 3VGKA 3R8EA 4WQ5A 3VF2A 1P8ZA 3L6QA 4BVOA 4B9QA 2F9TA 2P9KA 3CJBA 4K41A 2YCHA 3GE1A 4LC9B 2QWPA 5AQGA 4CD3A 2A40A 3MN7A 4BR5A 4IXCA 2HF4A 3CJ1A 1MWMA 4IZ9A 1BUPA 4Z94A 1TUUA 3SLCA 1TYQA 3CQXA 3QDKA 5EX5A 5F2RA 4ISEA 3U9ZA 2NZTA 2QWRA 2A42A 3MK6A 5AQWA 3VENA 3ATVA 4BRIA 3VEOA 3EKSA 3L4IA 3W0LA 1T6DA 5AFUA 1MDUB 2P9KB 2V52B 1RDWX 3IFRA 4FOEA 2Q2RA 4FO0A 5AQTA 5JMVA 4JAXA 3LDLA 2FLOA 1JCFA 4WQ4C 4Y0WA 3ZX3A 1ZXOA 4CI6A 1QQNA 3R6MA 1NGGA 3EKUA 2E8AA 3UKUA 1QQOA 1V4SA 4BR2A 1JCGA 1E4GT 3DXKA 2E2QA 3QFUA 3ENHA 4BRQA 5LJWA 4H0YB 4MLEA 3A5LC 4EHUA 1BU6O 5ELZA 1SZ2A 1X3MA 5FPMA 2E2PA 4BG8A 3VESA 4AM7A 3OHRA 1ATNA 2Q0RA 4JD2A 1GLEG 3MN5A 3ZETA 5BN8A 1E4FT 2P9UA 4WQ4A 1NGCA 2CGKA 1S22A 3VEWA 5BPMA 4M7YA 3AAPA 5BPNA 3A5OC 4NB4A 2A41A 1BDGA 1QHAA 2OANA 3UE5A 1DEJA 3FLCO 2E1ZA 3HSCA 5AZJA 4JHDB 3O6WA 4K43A 3ZX2A 3DJCA 3WQUA 3H45C 4BC5A 2YI1A 3QICA 5EXWA 4DQ8A 1QZ6A 2D0PA 2CGLA 1RFQA 3CI5A 4B1VA 3ZEUA 1LCUA 2YHWA 3BEXA 3GL1A 4JD2B 4YDUC 5AQRA 3VEZA 3H1VX 4WQ5C 3UB5A 5CE3A 3RSEB 2P9UB 3O4WA 4BREA 2Q36A 4FWNA 2CH5A 1BO5O 2P9IA 2ZGYA 2VWBA 4FPAA 1NGDA 3SMPA 5FPEA 3LDOA 1JCEA 3SJHA 4BRCA 3LM9A 3DXMA 2ASOA 5EVZA 4FWOA 3EN9A 5AR0A 1DGKN 1MA9B 3FGUA 5AZJB 4CD1A 4E1JA 5AQOA 2HMPA 1TUYA 2J4RA 3GBTA 4MO5A 4RCHA 5ADXH 5AQIA 1GLAG 2VYPA 3C7NA 3KHYA 2NLXA 5AQXA 4WYBA 3ZEUB 2GUPA 1U2VA 5AQJA 3D7EO 4JNEA 2FSJA 1BA1A 4MLHA 4KBOA 4YDUA 1NGFA 2E1YA 4JN4A 4BRNA 4DCHA 3QFPA 4B1YB 2P9IB 1CZAN 2YHXA 2Q1NA 3L0QA 5AQPA 1YXQA 3JS6A 4FPBA 5BR9A 5KPRA 3WQTA 2V51B 3AARA 1D4XA 3VGLA 3DXMB 4H0VB 1ZBSA 3H1QA 1GLLO 5BRDA 2Q97A 3D2EA 3W3DA 3MDQA 1ATRA 1GLDG 1NM1A 5AQFA 3C7NB 2QXLA 2VCPA 2EWSA 4BRLA 1KAZA 5EOYA 4K25A 3LDNA 4BR7A 1U2VB 4QS7A 1QQMA 4BC4A 2ITMA 1XC3A 3MCPA 3H46O 5AQSA 1BOTO 5KQ8A 4BR0A 1RGIA 2YJFA 4FOIA 3FR0A 4H5TA 4A61A 4PL7A 5LY3A 3CHWA 3WT0A 4CZEA 2A3ZA 5BPLA 4BC2A 3WXIA 4CZLA 4M63C 3CJCA 3VPZA 3B8AX 5TKYA 2HOEA 2IVPA 3ULEA 3O5BA 1G99A 1TYQB 2E20A 3KVGA 5AQVA 4H0PA 2F9WA 1YVNA 1V4TA 3CJAA 5AQYA 3A5MC 3J8AA 1SAZA 3JXUA 3VF4A 2V7ZA 3QMLA 4BVPA 1EQYA 4XEIA 2AA4A 3ATUA 4IJNA 3ID8A 3CJ7A 3O8MA 4B1WB 2IVNA 5AQUA 4BR9A 3EO3A 1MWKA 4CZKA 2P9LA 5FPDA 5E84A 1H1VA 5AQQA 2UYTA 5FPNA 3IDHA 2A5XA 3QBWA 3SK3A 3ULEB 4BG9A 3WUHA 1NBWA 1XQSC 1LOTB 1R59O 1C0FA 2QWQA 3H3NO 5KPTA 2Q0UA 5JICA 2CGJA 4NO7A 1YAGA 2GEMA 2YJEA 3EL2A 3UKUB 4DHYA 3H6EA 4BRGA 4H0TB 3DXKB 3MN6A 3IMXA 4HWIA 3UKRA 2DPNA 3H3OB 3HZ6A 2FSNA 1NGEA 2P9LB 3ZETB 1BA0A 4BQLA 5AQZA 5AQMA 4B1UB 2FF3B 2BUPA 2FF6A 2P9NA 3O80A 4F9OA 3BP8A 2FXUA 3HTVA 4IJAA 4RWTA 2V7YA 2A6AA 1KAXA 2WUSA 4O8KA 1YUWA 3VERA 5ADXA 3LM2A 4GY2B 2P9PA 3A5NC 1GLFO 1NGBA 5BN9A 3SMSA 3C0BA 2D4WA 3FZLA 3LL3A 3HI0A 1HJOA 3LDPA 4IWVA 4BQZA 1HKCA 3VEXA 3UKRB 4CBXA 4FL9A 4BROA 4BRKA 2Q31A 3CJ9A 2CH6A 1GLCG 4BGBA 3GOIA 2P9SA 1Z6RA 2GWKA 3GG4A 1HUXA 2QWNA 3GDQA 4DB3A 3KZBA 2H3GX 2ZF5O 1T6CA 2W41A 2P9NB 4CBWA 2ASPA 3FZMA 4I6MA 4CZJA 1Z05A 4A2AA 3R9PA 5BREA 4PKHA 5KQDA 2P9PB 3FZFA 2AP1A 3CIPA 5B8HA 3A8YA 1NGHA 4H5VA 1DKGD 3LDQA 1GLJO 3AY9A 2D1KA 2P9SB 1J6ZA 3A0IX 4FWMA 4A2BA 1NWKA 4A62A 3BF1A 3FE1A 4HTLA 3CETA 4FWSA 3BF3A 1S3XA 2I7PA 1NGIA 1WUAA 4BR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5AJ3K 3G25A 4F2RA 4M3TA 1SQKA 3DOLA 3M3ZA 3DRRA 2RPIA 3V1QA 1VQ6N 4FJJA 4B9NA 2HBKA 1ATSA 1BQMA 4OLBA 1RT6A 4CBUA 3SUPA 3ZYYX 4CW7B 4CGJA 2WC9A 1RT2A 2FSKA 3D2FA 2UXDK 4DQRA 3CCUN 4IOXA 3O9QA 1HR0K 1JLQA 3I33A 2YV0X 3CMEN 4ISGA 5HRNA 5CY4A 5C12A 2YNIA 4KHNA 2KLAA 3P31A 1EWQA 3OS1A 2WBNA 1C6VA 3ITHA 4IFYA 3IRXA 4M45A 4EP4A 3KLFA 3M6GA 3FZKA 3VQCA 1GLBG 1ZC6A 4L3QA 3EY1A 4CJ7A 4RTFD 1ASUA 3U9DA 1ZYQA 4H0OA 3DWLA 2D0OA 4AILC 3HXMA 2QWMA 1XHZA 1BG3A 4WE1A 3AVIA 3O08A 3VQQA 4CF1A 4CEOA 1HPMA 1K8KA 5CR4A 1ZBIA 4FM1A 2OTLN 2Z1JA 4BGAA 2F7TA 1YT3A 2OYQA 2GWJA 1N36K 1U6ZA 4ZTFA 4O55A 4BRMA 3WEEA 4DTJA 1NMDA 3H08A 1EP4A 3I8BA 1JL1A 5FRNA 3SUNA 4CZIA 2JLEA 1VRTA 1T44A 4QS9A 4OO1J 4CZGA 2FC0A 4CECA 4EFHA 3RWUA 3VQ7A 1BIZA 2E2NA 1XUPO 3WXMB 4Z4FA 1IV0A 5IWAK 1NJZA 5AZIB 1ASVA 2E88A 3LPTA 4DTSA 1BWFO 4FWPA 4KHQA 4CHOA 2X6SA 4AHSA 3DLLL 4FJLA 1X9MA 3NBPA 3QESA 3J7YP 4LFAK 5HP1A 3WNEA 1TKZA 3OS2A 1A5VA 1HQEA 1L3SA 4AHCA 2YCHA 3GE1A 4LC9B 1RDBA 2QWPA 1GOCA 3BZKA 3MN7A 4I7FA 3AVNA 5C42A 4Z94A 2F4VK 3SLCA 1LV5A 1ASWA 3U9ZA 1L3UA 1S9EA 4KTWA 1S1UA 2NZTA 3OYFA 2QWRA 1IO2A 4FZYA 3TAQA 1Y97A 2P9KB 4FOEA 1J9AA 2IS3A 4IO9L 4FLYA 4JAXA 2FLOA 4JKGA 3DYAA 2JWKA 1BCOA 3L2QA 3LPUA 1TKXA 4Y1DA 3CFRA 1W97L 2P5GA 3ENBA 1NGGA 2KTQA 3F73A 1V4SA 3QEPA 3RMAA 4O0JA 3KWGA 4JI6K 3L2RA 3M8SA 4H0YB 4BG8A 3OHRA 2Q0RA 1KFSA 4KB0A 3EEQA 2PYLA 3DI6A 1S22A 4FCYA 4CCHA 3AAPA 3OYHA 5KRTA 1M1KO 5M1PA 4DFJA 1VSMA 1QHAA 3UE5A 1TVRA 3HSCA 4JHDB 3BZCA 3O6WA 4CJFA 4TSXA 3OYAA 2F96A 4JKHA 4OPKA 5EXWA 4DQ8A 2RF2A 1W9HA 2CGLA 3IG1A 1RFQA 3CI5A 3S9HA 1LCUA 2YHWA 4JD2B 3VEZA 4UY8O 1IH7A 4CJUA 2Q3SA 2FBYA 3V1RA 2P9UB 3DLRA 4KHYA 2CH5A 1BO5O 2ZGYA 4OKKA 3K57A 4FPAA 5FPEA 3SMPA 3LDOA 1JCEA 3V81A 4EP5A 2ITGA 3DXMA 1NK4A 3L2UA 5SWMA 4E1JA 2O4GA 2G8HA 5AQOA 5E41A 3GBTA 3MAQA 1VSKA 2NLXA 3THWB 2ETJA 4JK7A 4WYBA 4GV3A 4Z4CA 1NMNA 3IKMA 2QXFA 3C6AA 4MLHA 3LAKA 2HMIA 2E1YA 4ELVA 3M8QA 2ZM6K 4DCHA 2YKMA 1A5WA 3NGZA 1CZAN 2Q1NA 1YXQA 3JS6A 3THVA 2B6AA 2O8CB 3I56N 3PX0A 3WQTA 4BE1A 3ZSZA 2HHQA 5I42A 1RBVA 3CYMA 1EKEA 4FM0A 4FJ9A 3TSQA 4W5TA 2EWSA 4C8KA 4AHVA 5EOYA 2E5LK 4JV5K 4OLAA 4OVLA 4CJWA 4CK3A 1E3MA 3DRSA 1OH8A 1RT5A 3MCPA 1TK5A 3MXMA 3KK3A 1RGIA 4H5TA 2A3ZA 5GAEP 4BC2A 3WXIA 1S72N 4CZLA 4NXNK 1LW0A 3CJCA 4JI5K 1RT1A 3VA0A 1OVQA 1WSIA 3O3GA 4XIUA 3V9ZA 2F8SA 3O5BA 1G99A 4FJNA 3OJSA 1NK7A 1UA0A 2O8FA 3KVGA 3L3UA 5AQVA 4H0PA 3OJUA 2QKBA 1KCFA 1SAZA 2VG7A 3JXUA 1IBKK 3QMLA 1EQYA 2O8BB 2AA4A 3ATUA 4KH6A 3ID8A 3ZT2A 1HYVA 4LD0A 4CZKA 4BR9A 4E7LA 3EO3A 5FPDA 1C1BA 1WBDA 1H1VA 2OZMA 3HPHA 4O0IA 3K5LA 2GBZA 2NRRA 1VSIA 5FPNA 4BG9A 1XQSC 2NNWA 1TL1A 1U49A 1RBUA 4HUFA 2F8TA 3SV4A 3EE8A 4NO7A 3TANA 1D8YA 4M3ZA 4H0TB 3IMXA 1NGEA 4DTNA 1YIJN 1N8RO 4CF9A 4JKCA 2XHBA 4F4KA 3P5JA 3DLGA 3OA9A 5CZ2A 1BA0A 3ULDA 3NHGA 4FJ7A 1K73O 3PIPL 5AQMA 4AHUA 2FF3B 1LWFA 4F9OA 4C8MA 4RWTA 1FW6A 3RR8A 4X64K 1KAXA 2WUSA 3CM5A 2OPPA 2P9PA 1GLFO 5TKWA 2Z1GA 3SMSA 3C0BA 1VQMN 3FZLA 4IWVA 3CC4N 4BQZA 3G71N 1RDCA 3CJ9A 2GWKA 4DB3A 3E01A 2ZF5O 2YNFA 4OPJA 1REVA 2ASPA 3FZMA 4JYAK 2BE2A 4I6MA 4R79A 1T8EA 3EYZA 4DQSA 5J1EA 2WONA 5DMRA 4ELTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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