1MWKA

Parm from plasmid r1 apo form
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
b'MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 93
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA01
2Q0RA 5FPNA 1U2VB 4JAXA 1BA0A 4BRQA 1P8ZA 2Q31A 4BGAA 4LC9B 5LJWA 1ATRA 3AAPA 1K8KB 3DWLA 3UKRB 4EFHA 1BWFO 4O5FA 2QM1A 4I6MA 1ESVA 3ATVA 5E84A 4BG8A 5E26A 4JHDB 3U4LA 4QS8A 2CGLA 2YHYA 4QS7A 5KQDA 3SJHA 4WQ4C 4FWQA 2ZGYA 4FOIA 3BEXA 3O1BA 4JNEA 3LDOA 1GLJO 2E20A 1Y64A 3D7EO 2QWOA 4EAHD 2IVNA 1NGHA 1ZXOA 2FF6A 5BRDA 4FWLA 4BQZA 5AQPA 1MWMA 4H5RA 1RDWX 3HI0A 1QZ6A 4J8FA 4FPBA 1J6ZA 3GOIA 4M63C 2P9KB 3U8XA 3ZEUB 3FZMA 3S41A 3TPQA 4FSVA 2P9SB 3H46O 3MN7A 3EN9A 4JHDA 2V7YA 3GG4A 3WEEB 3MN5A 3VETA 3A5LC 3AAQA 3CJ1A 3GL1A 4CZMA 3ZX0A 3P4IA 4FWOA 1SZ2A 1V4TA 2FSKA 4JD2B 4YDUA 4IWVA 4B1VA 3VESA 5BPNA 4CBXA 3MN9A 2YJEA 5JICA 3HM8A 2P9UB 3WQTA 1KXPA 1YXQA 2AA4A 5EX5A 2P9KA 2QWLA 4ISGA 3ULEB 5AQFA 3FFKB 5JLFA 4A2BA 2P9SA 3IFRA 3R8EA 2W41A 5F0XA 2CH6A 4QS9A 1HKCA 3CERA 1D4XA 2V7ZA 3MMVA 4H0TB 1ATSA 3O4WA 3A0IX 5ADXH 3O6WA 4MO4A 1Z6RA 3FZKA 4BREA 4WQ5C 3D2FB 1BG3A 4H5NA 3LDNA 4AM7A 1ZBSA 5KPZA 2QWMA 4JD2A 3LL3A 4FL9A 3VEXA 3A8YA 4BR4A 5LY3A 5AQQA 1QQMA 4BRKA 5BN9A 4RCHA 3SMSA 1NGIA 2P9UA 5LJVA 1LOTB 4CZLA 2Q36A 4BVOA 1E4FT 5F2RA 3M6GA 5AQOA 5AQJA 3H45C 1DKGD 1SAZA 1RFQA 4BR0A 1BDGA 1T6DA 3MDQA 3CJCA 2CH5A 5AQYA 1E4GT 4I6MB 2GEMA 4PKGA 3QDKA 5EXWA 2E2QA 2H3GX 1QQOA 2NRHA 5AQKA 5TKYA 5F1XA 1GLFO 4IJNA 4FWMA 4H0PA 2GWJA 2HOEA 5BRFA 5BR9A 4PL7A 4MLHA 4H0YB 3FZLA 2D1KA 4M7XA 3ENHA 1NBWA 1GLLO 4ISFA 2IVOA 2AP1A 4M7YA 2E1YA 3L0QA 2P9PA 1C0FA 3HSCA 5AQUA 3WXLA 2A41A 2NZTA 2QWNA 4H0OA 3HBTA 1QQNA 1U6ZA 3AARA 2E1ZA 3L6QA 4CZHA 5CE3A 2GUPA 3R9PA 1IJJA 3SK3A 1NM1A 5AQMA 2FF3B 1X3NA 3MK6A 4WQ4A 3SMPA 1WUAA 5EVZA 4B1YB 4DHYA 1GLDG 4FOEA 4BRLA 2CGKA 4NB4A 3M1FA 5AQGA 5AQSA 4AM6A 1NGDA 3IMXA 4BQLA 3ENOA 5AQZA 1V4SA 4CD1A 2NLXA 1KAZA 3FE1A 3SLCA 1MWKA 2VCPA 3VF4A 4WYBA 2YHWA 5ADXA 4BC4A 2ASOA 4CZFA 4CBUA 2ZGZA 3O80A 3WXJA 1S3XA 2KHOA 5FPEA 1GLEG 4FO0A 2I7NA 3KZBA 3UB5A 3WT0A 2A5XA 2Q0UA 3U9ZA 4CD3A 3DJCA 3UKUA 2ASPA 1XQSC 4B1ZA 4BRMA 5ELZA 5KPRA 4HTLA 3GBTA 3TU5A 3QBWA 1XC3A 5EOYA 4BRHA 1TYQB 1MDUB 1NGEA 3BUZB 3WXKA 3VENA 4BC2A 4PKHA 1HJOA 3QICA 1HLUA 2QWPA 3C7NA 3G25A 3LM9A 1HUXA 4Y0WA 1SQKA 2QWQA 3ID8A 3LDLA 4BRIA 4FWPA 3VPZA 2V52B 1RGIA 2E2NA 2W40A 2E8AA 1JCGA 1NGBA 2QXLA 3VF2A 3VGKA 5KPTA 4EHTA 5AFUH 1NWKA 2BUPA 1CZAN 2I7PA 4O8KA 2GTDA 2YHXA 4FWKA 1ATNA 5AQLA 5AQRA 4A62A 1G99A 1HX1A 4WQ5A 5AR0A 4BRFA 4H5VA 1TYQA 1Q18A 3CJ7A 3O5BA 1KAXA 2A3ZA 1BUPA 2F9WA 1JCEA 4BC5A 2EWSA 3CHWA 3QFPA 1X9JA 2ASMA 2OANA 3FLCO 3EZWA 4H5WA 4GNIA 2Q2RA 3VGLA 2ZWHA 1YUWA 3H1QA 3IUCA 2HF4A 3UE5A 4BROA 3QFUA 3H6EA 1S22A 3WUHA 3W0LA 5AQIA 5AQHA 2P9PB 4BVPA 4A61A 4BGBA 4PKIA 1EQYA 2FXUA 3B8AX 2VYPA 3FZFA 3QB0A 4Z94A 3ZETB 1YAGA 2D4WA 2QWRA 3MCPA 4H5TA 2Q97A 3RSEA 3QBXA 2WUSA 3ZX3A 2J4RA 3A5MC 3A5NC 3CETA 2BTFA 1GLCG 1IG8A 3GDQA 4K42A 3OHRA 3DXMA 4B9QA 1GLAG 4H0XB 3H3NO 3A5OC 3EL2A 3DAWA 2E2PA 4CZJA 4FWNA 1HKGA 3LDPA 4HWIA 4K41A 4IZ9A 2Q1NA 3AY9A 4IJAA 2GWKA 4EHUA 4RWTA 4BR9A 4ISEA 1XUPO 3ZETA 3LDQA 2ITMA 3ZX2A 2FLOA 1BO5O 1HPMA 3UKUB 5BRHA 4IXCA 5KQ8A 4FWSA 1KAYA 2P9IA 2A40A 5AQXA 3QMLA 2IIRA 3VEOA 3VOVA 1NGJA 4CBWA 4XH1A 4F9OA 3O1WA 2HMPA 1DEJA 2QW9A 3HTVA 2E2OA 2DPNA 3F9MA 5AFUA 1NGAA 4BRNA 3CJBA 3DXKA 3C7NB 3FZHA 4H03B 4BRDA 5FPDA 1MA9B 3CJAA 2A6AA 5FPMA 1NMDA 3KHYA 3O08A 2HF3A 3R6MA 4BRGA 3VERA 5BREA 3VEYA 2P9LB 1T6CA 4BG9A 3D2EA 5AZJA 3O8MA 1DGKN 5AZIA 1NGGA 1LCUA 4BR2A 2FSNA 1H1VA 3I8BA 3KVGA 4H0VB 1U2VA 4BR5A 5BN8A 3MN6A 5AQVA 1K8KA 3UKRA 4CJ7A 4XEIA 1WOQA 3J8AA 2E88A 1GLBG 5JLHA 3C0BA 1TUYA 3CJ9A 4JN4A 3WXIA 1OKJA 4B1WB 3FGUA 2P9LA 3BP8A 2GELA 3BF1A 1ZC6A 2UYTA 5I9EB 3H1VX 4NO7A 5AQNA 4YDUC 3EKUA 3LM2A 3VEZA 2V51B 4A2AA 1NLVA 5B8HA 1HKBA 3RSEB 1BA1A 4K43A 1NGCA 3ATUA 3CQYA 4XH4A 4K25A 1YVNA 3ZEUA 4B1UB 3EO3A 3DXMB 2F9TA 1C0GA 4DCHA 4IO8A 1JCFA 4CZIA 4XH5A 2ZF5O 3WEEA 1NGFA 4B1XB 4L3QA 3JS6A 2D0PA 3VEWA 4CZKA 4CI6A 4FPAA 4E1JA 3VGMA 4CZGA 2IVPA 4GY2B 3GE1A 2FSJA 3IDHA 4CZEA 2YI1A 5EY4A 3L4IA 1QHAA 3I33A 5BPMA 3HZ6A 2P9NB 2P9IB 3JXUA 3ULEA 1BU6O 4EIAA 4BR7A 3EKSA 4MLEA 3U9DA 3W3DA 2YCHA 5AQTA 4KBOA 4BRPA 3H3OB 3DXKB 1R59O 3WQUA 4BRAA 3M3ZA 2PBDA 3VEVA 2YJFA 5JMVA 3BF3A 4RTFD 3VF6A 3CQXA 1TUUA 3D2FA 1Z05A 5BPLA 3CI5A 2D0OA 4DB3A 4MO5A 1QZ5A 2VWBA 2CGJA 4FWRA 4BC3A 1X3MA 4C23A 3FR0A 2A42A 3D2EB 1BOTO 4PL8A 5AQWA 1T44A 5AZJB 4BRCA 4DQ8A 2P9NA 5AZIB 3CIPA 2PAVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CCEN 4KHNA 5FPNA 3E9OA 1NK6A 4NCBA 4GVMA 3T69A 4H4MA 1P8ZA 4CJLA 4LC9B 5LJWA 4HVJA 4RW6A 3D0PA 1ATRA 3HPGA 4FW1A 3T3FA 4I6MA 3G0ZA 1X1PA 2QEXN 1ESVA 5FROA 4GVEA 4CIEA 4LD0A 3U4LA 2YHYA 4QS7A 1HNWK 1WNSA 3SJHA 2ZGYA 3BEXA 4EP5A 4FLZA 2KKZA 1ZBUA 1S1UA 3VQAA 1GLJO 3CFRA 1NK9A 3HP9A 1Y64A 3D7EO 5HRRA 3SUQA 4WCEL 5C2DA 4CGFA 3SI6A 1GOBA 2FF6A 4EP4A 2OCEA 3OBYA 4BQZA 1VAZA 1YIJN 3J7AP 2Z1JA 1MWMA 4H5RA 3T1AA 3ZSXA 1LW2A 3C6TA 4J8FA 1VSMA 3ZEUB 3SAHA 2Z1HA 3H08A 3S41A 2P9SB 4KH4A 3AA4A 4YY3K 4FK0A 3AVHA 3WEEB 4OX9K 3VETA 3A5LC 3GL1A 3P4IA 1SZ2A 3DM2A 1F21A 1RBTA 3LZIA 5J2MA 1D9FA 1Q7YO 3TAFA 2YJEA 3OW2M 3VQ5A 1C0TA 3HYFA 3WQTA 2JWKA 5EX5A 2HHTA 2F7TA 4E0DA 1YVUA 4BE1A 1VQMN 3R8EA 3SBTA 4DV1K 3ZSRA 3C95A 4F2SA 3SNNA 5LMUK 1D4XA 4H0TB 1ATSA 3O4WA 3O6WA 1Z6RA 3G10A 1NOYA 4BREA 3D2FB 3I0SA 4H5NA 3EE8A 1ZBSA 2QWMA 1FKPA 4JD2A 4FL9A 1WAJA 4BR4A 2XRIA 1UWBA 1IBKK 1TL3A 3SMSA 1NGIA 2P9UA 4CE9A 4CEZA 1LOTB 2Q36A 1RFQA 1S1TA 4LFAK 1J5EK 3TWHA 3QDKA 1JXBA 2YNIA 1QQOA 1EXQA 4B8AB 3ZSYA 1C0UA 2GWJA 4IDHA 5BR9A 2OPSA 3DRRA 2EHGA 3QEPA 1VQ6N 1NBWA 4M45A 3CM6A 4ISFA 4M42A 2WBNA 3MEEA 1S9GA 3DRPA 4CHNA 3CCMN 1HPZA 4AHRA 3HSCA 1J53A 4FJHA 3HPHA 5M1QA 1BCOA 2QWNA 3T1HK 1KVBA 1EX4A 2E1ZA 3L6QA 2KQ2A 2GUPA 3R9PA 1IJJA 3QINA 5C42A 4Y1CA 1X3NA 4CEEA 3PO4A 3K57A 2P5OA 3L2UA 4CGDA 1OVQA 1C0MA 3KWIA 5LMNK 3F9KA 1Z25A 2Y1IA 5GIPA 2NLXA 3FE1A 1MWKA 2ASOA 3CCUN 2Y1JA 4CBUA 5M1NA 3QEIA 2I7NA 3UB5A 3WT0A 2Q0UA 2HW3A 3DJCA 2YNGA 1BIUA 1BGXT 1N34K 3MCAB 1XQSC 4UQGA 1TKXA 3F2KA 3JYTA 2VQEK 1Q9YA 4LF8K 4BDPA 4CF9A 3TU5A 4BDYA 4BRHA 4JRQA 4J2DA 2VQFK 2YKNA 3WXKA 1X9SA 3QICA 4Z4IA 2D5RA 3ZT4A 3C7NA 3G25A 3OJUA 3LM9A 3NE6A 4KTQA 4Y0WA 1SQKA 3ID8A 1T03A 1NKEA 2V52B 1R0AA 1RGIA 1LV5A 1NJYA 2W40A 2E8AA 1NGBA 2QXLA 3VGKA 4EHTA 2BUPA 1CZAN 4DUZK 2BDPA 2YHXA 4FWKA 4O5BA 5AQLA 3V1QA 4A62A 4BRFA 1TYQA 1IKVA 5C10A 3O5BA 2F9WA 4DKWA 4FK4A 1RDDA 3QFPA 1X9JA 3AVGA 4CIGA 3V6DA 1TK0A 1Q9XA 3QERA 4M3ZA 3P1GA 4DQRA 1YUWA 1FKOA 3H1QA 3K5MA 2HF4A 3UE5A 5HP1A 2ATQA 3O9TA 3QFUA 1ZBLA 4JKGB 1XC9A 4GKJK 4OKKA 4Z4GA 4JI3K 4CJ3A 3AA3A 2UXBK 3O4NA 2Q97A 4IFVA 4FYDA 3LANA 3A5NC 3CETA 3AVAA 2Z1IA 3NF6A 2BTFA 3HM9A 2O8EB 3GDQA 4K42A 2HB5A 3TAGA 3MWTA 4AHTA 2GUIA 1TKZA 1NK0A 3DRSA 3SBGA 3QETA 4CZJA 4FWNA 1HKGA 2O8DA 4OKEA 3V9UA 1KSPA 2Q1NA 3L4QA 2GWKA 4RWTA 1ILYA 3MAQA 3UIQA 3O4QA 2QKBA 1NK8A 2R7YA 4Z0UA 1G15A 4CK3A 3KLEA 4KHPK 4GV3A 4DFMA 2AJQA 4LH5A 4LFBK 4DU1A 3CMAN 4O0JA 3NVMA 4C1NK 3AVMA 2OZSA 2DY4A 4BRDA 4DFPA 4YORA 3OBWA 1GOAA 3KHYA 1YITN 1DT9A 4CGHA 3OS0A 1X9MA 3HXMA 1HYSA 1GOCA 3NVKA 3TARA 4WFAL 3SAFA 2QXFA 1RTIA 3PLAA 3NGIA 2VWJA 4A5AA 2QI2A 3AVLA 4F2RA 2UXDK 2X74A 5AZIA 4FJIA 4K8XA 4OPAA 2B5JA 3E01A 1Q8IA 2E6MA 4H0VB 1U2VA 3AVNA 1RBVA 3LP1A 3VQEA 3OYJA 4IO9L 5AQVA 5DK5A 1K8KA 4CJ7A 4N56A 1S5JA 3HVTA 1WLJA 3OYBA 3SYZA 5SZTA 1TUYA 2RE2A 3ASMA 3M8PA 2P9LA 4B9MA 3BP8A 2WFBA 1VSJA 2LSNA 4LSNA 4KAZA 3H1VX 4ILGB 4FJKA 3THYB 4C8KA 5JS2A 1HYVA 1NK5A 3CQYA 4OJRA 2F9TA 3OJSA 5A2QO 4DCHA 4IO8A 1NKCA 4U7BA 4BE2A 1TL1A 2ZF5O 4DR4K 1TKDA 3O9UA 2YX6A 3CYMA 3RMBA 4E19A 4L3QA 4JKAA 2FBTA 4E1JA 3VTHA 4DTRA 4GY2B 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2V7ZA 1D5AA 2VG5A 2HMIA 4MO4A 3CCSN 3E9PA 2G8UA 4AM7A 2ZQBA 1RDAA 1CXQA 4CIFA 3LL3A 4PUOA 3VEXA 5AQQA 4BRKA 5BN9A 3TTFA 3QNOA 1BL3A 4CZLA 4DV0K 4AHSA 1E4FT 3CPWM 1S72N 5F2RA 1U47A 3KJVA 3CJCA 2CH5A 3CCQN 4JK8A 1E4GT 4EZ6A 2GEMA 2JWLA 3AO1A 5KRTA 2E2QA 5TKYA 5F1XA 4YOUA 4FWMA 4KPYA 3KKRA 3PO5A 5BRFA 4FLYA 3M8RA 4PL7A 2F8TA 4H0YB 3HJFA 4M7XA 4AHVA 1U48A 4B08A 2IVOA 1P90A 3JSMA 3AO4A 2AP1A 3DLBA 4OPJA 4C8LA 2GV9A 3L0QA 3NH2A 4X64K 1NK4A 3O9SA 2HVHA 5AQUA 4JS5A 3ENBA 3V1OA 2D0BA 4NXMK 1RT4A 2NZTA 3IRXA 4H0OA 2EX3A 4DU4A 1YHQN 3AARA 3M5RA 3KLIA 2HNZA 4KB1A 5AQMA 3MK6A 1EWRA 1WUAA 5HRSA 4DR1K 4B1YB 1KFDA 4DWIA 3KKSA 1GLDG 4FOEA 4DG1A 2HHHK 3CC2N 4GMJB 4NB4A 3M1FA 3NF9A 5AQSA 4CJFA 1OH7A 4BQLA 1VSIA 4CJUA 4CD1A 1LW0A 1N6QA 3TSPA 1TV6A 2WC9A 4FVUA 4WYBA 5ADXA 2VG6A 5M1OA 1U45A 4I9QA 3K9KA 2RPIA 4DSKA 5FPEA 4DSIA 4KHQA 4CD3A 3SQ2A 4JI0K 1RTJA 4CEDA 5KTQA 3VTIA 4KHSA 5KPRA 4DUYK 3GBTA 1XC3A 1TYQB 3AA5X 4ZTFA 1XNRK 2IOCA 3BUZB 3BDPA 1SV5A 1L3SA 3NCIA 1C1CA 3B6OA 2QWQA 4BRIA 3J80O 3LDLA 4B9UA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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