1MWKA

Parm from plasmid r1 apo form
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 93
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA01
2ZF5O 3QBXA 2E2QA 2BTFA 1G99A 3QFPA 3DWLA 5AZIB 5EVZA 2CGKA 4BREA 2IVPA 5FPNA 4GY2B 3BP8A 5EOYA 4EHUA 3H46O 5JLFA 5JLHA 3VEOA 3LDLA 2QWOA 3WXIA 1LOTB 2FSNA 2Q36A 1U2VA 5AQIA 2FF6A 2V7ZA 3FE1A 3GG4A 1KXPA 2YJFA 2FF3B 1KAXA 5AQHA 4H5TA 5AZIA 2BUPA 1X3NA 5KPZA 3IFRA 5AQNA 2AP1A 3RSEB 3LDQA 4CD3A 4YDUA 3VEXA 1NGAA 2Q1NA 5AQLA 4BRDA 3EO3A 5JICA 3VF4A 1NGIA 1GLJO 3SJHA 5I9EB 4B1WB 1QHAA 1IG8A 4FWPA 1NM1A 3CI5A 3SLCA 3RSEA 3H6EA 3SMSA 4ISGA 4BRKA 1RGIA 3BUZB 3AARA 3O1BA 1D4XA 3TPQA 3W0LA 1MWMA 3R9PA 2H3GX 3C0BA 5AQSA 2GWJA 2YCHA 3GBTA 1NGEA 2W41A 3D2FB 3VF2A 4EFHA 4FWLA 2E20A 1RDWX 1NGDA 3ZX2A 2QWLA 5BPLA 2E2OA 2E88A 1XC3A 2ZGZA 4FWRA 4M63C 3O80A 2QWNA 1WUAA 2A6AA 3F9MA 5BREA 2WUSA 4K41A 1T6CA 1BWFO 2D0OA 3VEWA 1KAZA 1X9JA 5AQJA 4B1VA 1S22A 3ATUA 3D2FA 3VEVA 3CHWA 1GLLO 3G25A 4BRHA 2GUPA 4JHDB 4CZFA 4BQZA 3U4LA 3DXKB 4BVOA 1GLAG 3VPZA 3DJCA 3I8BA 4DB3A 5EY4A 3H45C 3KZBA 5F2RA 3L6QA 1NGCA 4MLEA 1BDGA 1ZBSA 4XH1A 5EXWA 4IJAA 3A0IX 3AY9A 2KHOA 4JHDA 1DGKN 2CH5A 1U6ZA 5BRFA 4CZEA 4A2AA 5JMVA 1JCEA 4K43A 4BRPA 1X3MA 5LY3A 4JN4A 1HKBA 2F9WA 1BG3A 2D0PA 1ATNA 2ASOA 1HKGA 4WYBA 4CI6A 3A5LC 3ENOA 3HI0A 3FZLA 4CBWA 1EQYA 4CZKA 4DQ8A 2ASPA 1H1VA 2E2NA 4CD1A 5BRDA 5ADXA 3O1WA 4JNEA 4BR9A 3LM9A 2P9LB 4H0PA 5AR0A 1GLFO 1MA9B 4FWKA 3L4IA 5BR9A 4B1ZA 3IDHA 4H5WA 4IXCA 4LC9B 3SK3A 3WT0A 3ZEUA 3LDPA 2GEMA 4BRCA 3ULEB 2IVNA 3AAPA 3A5OC 4B1YB 2QM1A 4IWVA 4JD2B 5LJWA 4XEIA 4HWIA 2CGLA 2NZTA 4ISFA 1Z6RA 4C23A 1YVNA 3DXMB 2P9LA 3FR0A 3HSCA 3M6GA 4H0XB 5KQ8A 2Q97A 3ULEA 1TUYA 1P8ZA 3CJ1A 4H5VA 3GDQA 4JD2A 4RWTA 4BRFA 1T44A 5AQKA 3VEYA 3EN9A 1Z05A 3MK6A 4FO0A 1SAZA 2A41A 1YXQA 1GLDG 3O6WA 4FPBA 2Q0UA 4A61A 3EZWA 1NGFA 4XH5A 1NGJA 3DXMA 4EAHD 2VWBA 3GOIA 4FL9A 4DCHA 4BR5A 1T6DA 1RFQA 2I7NA 4PKIA 4WQ4C 2FSJA 2Q2RA 3B8AX 3FGUA 4BR4A 3U9ZA 5TKYA 3OHRA 3CJ9A 5KPRA 4FWSA 5EX5A 3R8EA 3VEZA 5AFUH 2YI1A 2Q0RA 4CZLA 1YAGA 3VERA 1KAYA 5AQUA 2QWMA 3LDOA 4A2BA 4MO4A 5KPTA 4BC4A 2D4WA 3ZX3A 5F1XA 5B8HA 1C0FA 5KQDA 4H0YB 4F9OA 3WEEB 2VCPA 2ZGYA 3WUHA 3C7NB 4BVPA 4J8FA 3JXUA 3UKUB 4PKHA 4RCHA 1V4SA 3M3ZA 5AQQA 5AQYA 4BR7A 3S41A 3MN9A 2OANA 2QWPA 5AQPA 3UB5A 1WOQA 3U9DA 1HPMA 2UYTA 3GE1A 1ATSA 3MN5A 3HM8A 4O5FA 4AM6A 5CE3A 2YHYA 2V7YA 4FWQA 3WEEA 1ESVA 4BR2A 1BO5O 2E2PA 3VOVA 3C7NA 1NMDA 1ZC6A 3WQUA 3TU5A 3UKUA 1NGGA 3H1QA 1JCFA 4L3QA 4H03B 4O8KA 4BRQA 1ATRA 2YJEA 4RTFD 4FOEA 4WQ4A 3D7EO 4M7YA 2I7PA 3A8YA 4H5NA 4H5RA 2QWRA 3DXKA 3QB0A 2PBDA 2GELA 3MDQA 3CERA 1GLEG 4FPAA 5AQTA 3HBTA 3QICA 1E4GT 2PAVA 3BF1A 4B1XB 4M7XA 1XQSC 4H0OA 3FZKA 2EWSA 3SMPA 3CIPA 2AA4A 4GNIA 3DAWA 2A3ZA 4Z94A 3MN7A 3W3DA 3ZX0A 4CZGA 3WXLA 2QW9A 5AZJB 4BRGA 4PL7A 3IMXA 5BRHA 2HF3A 2P9KB 3KHYA 1BOTO 4BC3A 5BN9A 3HZ6A 4BRLA 2P9NB 5AQMA 4I6MB 1HJOA 5FPMA 5F0XA 3CJAA 5AQGA 4BR0A 4EIAA 3QFUA 4NB4A 1BA0A 5AZJA 3LDNA 4FOIA 3H3OB 5AQXA 2P9KA 2P9PB 3VESA 4BRAA 2IIRA 2YHWA 3VGLA 2P9NA 1JCGA 4I6MA 4CZMA 3P4IA 4H0TB 3U8XA 2YHXA 4CJ7A 2E8AA 2W40A 3FLCO 4A62A 2DPNA 2J4RA 3JS6A 4ISEA 1S3XA 1BU6O 4B9QA 1CZAN 3D2EB 2P9PA 3FFKB 2CGJA 2VYPA 3WQTA 1NBWA 4DHYA 2ASMA 4B1UB 3O08A 1R59O 2E1YA 5AQZA 1V4TA 4BRMA 3EKSA 1ZXOA 2D1KA 4IO8A 4JAXA 4BQLA 4WQ5C 1NLVA 1MDUB 1QZ5A 2ITMA 1GLBG 3ZETB 3UKRB 3VGKA 4BGBA 3MCPA 1C0GA 3D2EA 2E1ZA 4HTLA 1MWKA 2IVOA 4IZ9A 2QXLA 3CETA 1J6ZA 3HTVA 1HLUA 3QDKA 5FPDA 2A40A 3AAQA 4Y0WA 1YUWA 2NRHA 1NGBA 3CJ7A 1TYQB 2HF4A 3CQXA 2A5XA 2QWQA 4FWNA 5AQRA 2F9TA 3ATVA 3ZETA 2ZWHA 1Y64A 2V51B 3UKRA 3ENHA 3CQYA 3ID8A 1BUPA 2NLXA 1K8KB 1OKJA 1QQNA 4CBUA 4BRNA 5AFUA 4K42A 2GTDA 1DEJA 1TYQA 3CJBA 3MN6A 1QQOA 2FLOA 3O4WA 4CZIA 2HMPA 3EL2A 1K8KA 2P9IB 3EKUA 4FSVA 2HOEA 4MLHA 4QS7A 1LCUA 5AQWA 4CZHA 4H0VB 1Q18A 5FPEA 5BPNA 3FZHA 3A5NC 3VETA 4CZJA 3A5MC 3WXJA 4QS9A 2CH6A 4AM7A 4BRIA 4WQ5A 5BN8A 3QMLA 3I33A 3O5BA 2P9SB 4PL8A 2A42A 3BF3A 3QBWA 4PKGA 1HKCA 4BGAA 4CBXA 2P9IA 5BPMA 4KBOA 1XUPO 2FXUA 5E26A 4MO5A 5E84A 3H1VX 3LL3A 1BA1A 5ADXH 2P9UB 4BC2A 1NGHA 4FWMA 2V52B 2FSKA 3CJCA 4IJNA 4XH4A 5LJVA 2Q31A 2P9SA 3L0QA 4BC5A 4BG8A 4YDUC 3J8AA 4QS8A 1E4FT 3BEXA 1DKGD 1IJJA 1TUUA 3VGMA 3UE5A 2P9UA 2GWKA 3MMVA 3VF6A 3ZEUB 4K25A 3GL1A 5ELZA 3R6MA 3FZFA 3LM2A 4E1JA 3IUCA 4EHTA 1GLCG 4BROA 1NWKA 5AQFA 4BG9A 3WXKA 3O8MA 1QZ6A 4NO7A 4FWOA 5AQVA 3VENA 1HUXA 1QQMA 1SQKA 1HX1A 1SZ2A 3KVGA 5AQOA 3FZMA 1U2VB 3H3NO 3M1FA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DU1A 3I0RA 1G99A 5AZIB 2NRXA 3B6PA 4GY2B 3P38A 1BL3A 3LAMA 4M3WA 4Y1CA 3RTVA 3AA2A 4OKJA 3ALYA 3LDLA 1BCOA 2IS3A 2V7ZA 3FE1A 1QSLA 2YJFA 2FF3B 2HNDA 1X3NA 1W2BM 5AQNA 1NGAA 2Q1NA 4I9QA 2HHQA 4FCYA 1L3SA 2UUAK 4BRDA 3EO3A 3VF4A 4UQGA 1X1PA 1NJWA 3IG1A 3DRPA 1GLJO 4KTWA 2RF2A 3L2VA 4RW6A 1RT2A 4CGGA 5I9EB 3C6HA 3PSIA 3PIPL 3HL8A 3I56N 4NXNK 2X78A 3RSEA 3H6EA 1SV5A 3SCXA 4ISGA 3SI6A 3BUZB 3AARA 1IBKK 1D4XA 5FRNA 3OYGA 5GAGP 2RKIA 3HPHA 3AVNA 3GBTA 1TK5A 1NGEA 4EFHA 3F9KA 1CXUA 2G8HA 3ZX2A 5BPLA 1UWBA 2OTLN 2KKZA 1XC3A 4CJEA 2E6LA 1K9MO 2A6AA 3F9MA 4KAZA 4FM2A 2D0OA 1ASUA 3VEWA 3V9UA 3ATUA 3CHWA 1GLLO 1S1TA 3SUOA 1NK5A 3NVKA 1W7AA 4JHDB 3SNNA 4IOXA 3U4LA 2R7YA 3DMJA 1WSEA 1GLAG 1VSHA 4HUEA 3KKRA 3AVCA 3KZBA 5F2RA 4Z4FA 1RBTA 4MLEA 1C0TA 5M1QA 3P31A 4FLYA 4KHNA 1SL1A 4K43A 3BY5A 1L5UA 1BG3A 2Y1IA 3CC2N 4WYBA 4CGIA 2G8FA 3A5LC 3T69A 4CBWA 4CZKA 4DQ8A 2ASPA 4Z4CA 5JVHL 1VAZA 4HHTA 4DF4A 4DTXA 4F2RA 4CD1A 5BRDA 4FLTA 4B9UA 4H0PA 3VQPA 1HQEA 3I0SA 2I5JA 3IDHA 3WT0A 4B3SK 3ZEUA 3OYKA 3L2WA 3QESA 3LDPA 1RTIA 4BRCA 3AAPA 2VG6A 3HP9A 1NKCA 3OYAA 3MXMA 4XEIA 3DLEA 1YJWN 4KREA 1B9DA 2YKMA 2RN2A 4C1NK 4HVJA 4DUYK 1YVNA 2W6KA 1O1WA 3KD1E 3FR0A 3M6GA 3THWA 3AVMA 3ULEA 3CJ1A 2PFUA 4DFPA 1TL1A 2JLEA 1RBUA 4AILC 1Z05A 3MK6A 2A41A 1GLDG 3O6WA 5HRSA 4ILJA 4A61A 3EZWA 3CCJN 3TAEA 3KD5E 4N41A 5JVGL 3ZSRA 4WQ4C 3T3FA 2FSJA 3FGUA 3B8AX 3ENBA 4BR4A 5KGXA 3MAQA 3V4IA 3U9ZA 5TKYA 1WAFA 3Q7BA 3CJ9A 4AHVA 3TAFA 4YOUA 3JAMO 4FWSA 1RBRA 4CFCA 3R8EA 2DFEA 3G4SN 1KD1O 1YIJN 1ZBIA 4CF2A 4KHQA 3NF6A 4HTUA 1MU2A 4JK9A 1L3UA 1X9WA 1NK7A 3ISNC 3ZSYA 5KQDA 4H0YB 4F9OA 3O4NA 3DOKA 1GOBA 4JI5K 3C7NB 4BVPA 2RPIA 1BI4B 5AQQA 4BR7A 4RW4A 1LAWA 4X64K 1JKHA 3U9DA 3IKMA 1KTQA 2G8KA 4DR6K 5HLFA 4FWQA 4JKDA 4M3ZA 1ESVA 4JKGA 1RT1A 4LF4K 3UKUA 4KKOA 3LP3A 3D45A 3H1QA 3JSMA 1JCFA 4IBNA 4L3QA 3D6RA 4H03B 4O8KA 5GAEP 5C42A 3TSUA 3QLHA 1JXEA 1QSSA 3NBPA 3S3OA 3OW2M 1QSYA 4JV5K 3NH2A 1SKSA 3A8YA 2A1SA 5DM6L 4CJ5A 4CCHA 4MDBA 5C15A 3CQ8A 4HCBA 1KFSA 4IG3A 1GLEG 4Z4IA 4FPAA 5AQTA 3BF1A 2Z1JA 2F8TA 4FK2A 3FZKA 1F21A 1OH5A 5M1NA 2AA4A 1M90O 3DAWA 3KK1A 2A3ZA 3M8SA 4AHRA 1B92A 1L3TA 4CZGA 4OPKA 3WXLA 1K8AO 2HBKA 2HBJA 1JJ2M 3ZT0A 2HF3A 2P9KB 4JS4A 1BOTO 3AVLA 4ID1A 3LZJA 2B5JA 2VG5A 4KFBA 5AQMA 2UXCK 3DLBA 3ID6A 3PO5A 5FPMA 4BR0A 4NB4A 1Q86O 5D3GA 5AQXA 4NLBA 2E6MA 3VGLA 2W42A 4HCCA 1QTMA 3P4IA 4H0TB 3SAHA 3OYJA 3U8XA 2OPRA 1WBDA 1A5VA 5M1PA 1BGXT 2DPNA 4CJRA 3OYHA 3JS6A 1S1XA 3PY8A 3TAQA 2HHTA 1BU6O 3D2EB 2P9PA 4DU4A 1ILYA 2CGJA 1X9SA 3A2FA 3O08A 2E1YA 1KQSM 2YNGA 4MFBA 3AO4A 4O0JA 5A2QO 3DOLA 3MWTA 1NLVA 3MXIA 2ZJPL 1GLBG 1U49A 3PV8A 4CJ3A 3MCPA 4HTLA 4IZ9A 4FJNA 1Z25A 5FPDA 1UA1A 1J6ZA 1HLUA 3M5RA 2A40A 4Y0WA 3CD6N 2NRHA 1K6YA 3VTIA 1NGBA 3TTFA 1NJZA 2A5XA 2UXBK 2F9TA 2QI2A 4A59A 5IT9O 3MWPA 3ENHA 3KK3A 2O8CB 4KHWA 4BRNA 2GTDA 4CE9A 1S72N 1TYQA 3CJBA 4BE1A 1VSEA 2YX6A 3ZT4A 3O4WA 4DTUA 5JS1A 3VQ8A 1YJ9N 2YNHA 4FSVA 3VQEA 3KK7A 2NRWA 1LCUA 2XY5A 3BGRA 3THYA 1Q18A 4LY7A 5C2DA 5BPNA 1HJRA 3NF7A 4ELTA 3O4QA 4WQ5A 4C1NI 2A42A 4BGAA 4CBXA 1HKCA 4O0IA 3NF9A 4OKKA 3V9XA 4FJ7A 4KI6A 4I9LA 3F73A 1NG9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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