1MWKA

Parm from plasmid r1 apo form
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
320
structure length
320
Chain Sequence
MLVFIDDGSTNIKLQWQESDGTIKQHISPNSFKREWAVSFGDKKVFNYTLNGEQYSFDPISPDAVVTTNIAWQYSDVNVVAVHHALLTSGLPVSEVDIVCTLPLTEYYDRNNQPNTENIERKKANFRKKITLNGGDTFTIKDVKVMPESIPAGYEVLQELDELDSLLIIDLGGTTLDISQVMGKLSGISKIYGDSSLGVSLVTSAVKDALSLARTKGSSYLADDIIIHRKDNNYLKQRINDENKISIVTEAMNEALRKLEQRVLNTLNEFSGYTHVMVIGGGAELICDAVKKHTQIRDERFFKTNNSQYDLVNGMYLIGN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ParM
publication title F-actin-like filaments formed by plasmid segregation protein ParM
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Structural protein
total genus 93
structure length 320
sequence length 320
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06406 StbA StbA protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1mwkA01
2V51B 1IJJA 3GOIA 5AQTA 4L3QA 5AZIA 3QMLA 3VEOA 4CBUA 3QFPA 3H1QA 4WQ5C 4FL9A 5AZJA 3QB0A 4H5NA 1GLEG 3A5NC 3AAQA 3C0BA 3LM9A 3WUHA 1ATSA 1DEJA 4YDUC 1YVNA 3LL3A 3FZFA 1U6ZA 2ZGYA 1MDUB 4H5RA 2P9UB 4CZEA 3GE1A 4H5TA 1JCEA 5B8HA 3DXMA 2ASPA 2FLOA 1QQOA 5JLHA 3RSEA 2YI1A 3WQTA 3P4IA 4IZ9A 4WQ5A 2P9PA 5EVZA 4BVOA 3VOVA 2E2PA 4BRMA 4FPAA 5AQMA 1DGKN 3GL1A 4YDUA 1Z6RA 4FPBA 4LC9B 2W40A 5EX5A 1U2VA 5BPLA 4H0TB 1LCUA 4B1XB 2E2OA 3VPZA 1HUXA 5EY4A 2W41A 4BREA 2Q36A 2A40A 3ZETA 4BRNA 1G99A 2QWOA 3A5MC 1P8ZA 4EIAA 4EAHD 2ITMA 2YHYA 1HLUA 3CJBA 5JICA 2QWNA 4B9QA 2QWLA 4EHTA 4M63C 2P9NA 1K8KA 3FZLA 2HOEA 2P9SA 3GG4A 4FWNA 1T6CA 4BR4A 2ZF5O 1ESVA 2ASMA 2FSNA 3DAWA 2AA4A 2QWQA 4BRGA 3O4WA 4IO8A 4FOIA 2P9LA 3MN6A 5AQXA 4H0VB 4JHDA 4DQ8A 5FPNA 4IWVA 3VETA 4H5VA 4BR7A 3D2EB 1KAZA 3IDHA 1NGIA 5AQHA 3ULEB 2FF3B 1HPMA 4BG8A 2EWSA 1NBWA 4JD2B 3UE5A 3JXUA 1GLBG 1KAXA 3ZEUB 3GBTA 3FGUA 2V7YA 2GUPA 1TUUA 5AQYA 3VF6A 2P9IA 4FWQA 4CBXA 1Y64A 3L6QA 4BQZA 1XC3A 5AQUA 4AM6A 5AQPA 5F2RA 4BRCA 2AP1A 4BR5A 2E88A 4MLHA 4B1UB 4NO7A 5BN9A 3VESA 5BPMA 3C7NA 3M6GA 3WXIA 3HM8A 2A41A 3WXLA 4XH5A 2Q1NA 1YUWA 4FOEA 4HTLA 4A2BA 5AZIB 3MN7A 3DWLA 2FF6A 5F0XA 5BRFA 1NGAA 2ZGZA 4BRHA 3WEEA 3UKRB 4BGAA 2Q0RA 4JAXA 4DCHA 3QFUA 3WXKA 4FWLA 5BPNA 4K42A 4H0XB 3IFRA 5AQNA 3VENA 4BR2A 1YAGA 1BUPA 1S3XA 3CERA 4ISFA 1NGJA 4PL8A 2A5XA 2E8AA 4MO4A 4BR9A 2NZTA 1MWMA 1NMDA 1YXQA 3CQXA 3ATVA 2P9PB 3CJAA 2E1YA 3L4IA 3ID8A 1CZAN 2D0PA 1NM1A 2CGKA 4H0YB 5FPMA 3BF1A 5EOYA 2BUPA 1T6DA 1X3MA 5EXWA 3TPQA 3BUZB 2F9TA 3IMXA 2ASOA 3BEXA 2I7PA 3FZHA 3LDQA 2PBDA 3CJ7A 4MO5A 3VEYA 5AQOA 1U2VB 2CGJA 3ENHA 1KXPA 2IIRA 4RCHA 3O6WA 4FWSA 5KPTA 4XEIA 4ISEA 5KQDA 2P9KB 4CZJA 3KZBA 3O80A 3H6EA 3L0QA 4PKGA 4RWTA 5AQRA 3S41A 4QS9A 1GLJO 2CGLA 2NRHA 3D2FB 5AFUH 1NGDA 1QQNA 1D4XA 4BR0A 3EKSA 1HKCA 1TUYA 1IG8A 3I8BA 2NLXA 2P9NB 3DJCA 4QS7A 3A0IX 2J4RA 1GLAG 1ZBSA 3EN9A 3VF4A 3LDLA 1X3NA 4B1ZA 5LJWA 2Q97A 5AQWA 2H3GX 1WOQA 2HF3A 3LDPA 2WUSA 3ENOA 3WQUA 3ZX2A 3MMVA 4JN4A 5BRHA 3H46O 4JHDB 3CJ1A 5AQJA 5E26A 1GLFO 5AR0A 3A8YA 4JNEA 2GWKA 3IUCA 2A42A 1LOTB 4BC4A 1QQMA 2UYTA 4K41A 4XH1A 4CBWA 3FLCO 1OKJA 4I6MA 5AFUA 5AQGA 3KVGA 3O1WA 4FSVA 2YJFA 1S22A 3MDQA 5ADXH 1HJOA 3HTVA 2P9IB 1GLLO 1KAYA 4GNIA 4H0OA 1E4FT 5AQLA 5TKYA 3VGMA 1NGHA 4BRPA 2QW9A 3J8AA 3UKUA 3SLCA 5LJVA 3FFKB 2PAVA 4FWMA 4BRQA 4Z94A 3BF3A 3A5LC 4CZLA 1MA9B 3C7NB 4H5WA 2QWRA 4ISGA 2HF4A 3O1BA 1RGIA 3W0LA 4BRAA 3EL2A 3DXKA 3QBXA 3MK6A 4BRIA 4CI6A 4J8FA 5E84A 3TU5A 1ATRA 4MLEA 3WEEB 5BR9A 2BTFA 1BWFO 5JMVA 3JS6A 4IJNA 3LDOA 3D2EA 2IVNA 2FSJA 2IVPA 5KPRA 3VERA 1BA1A 3ULEA 5AZJB 2VWBA 1NWKA 3EKUA 4JD2A 3AAPA 3H3OB 3QBWA 3SMSA 5ADXA 5BREA 4Y0WA 5AQKA 4PL7A 2QWMA 3HSCA 3U9DA 5KPZA 4B1YB 1HX1A 4CZIA 1TYQA 3MCPA 3OHRA 3H1VX 2QXLA 4FO0A 3DXMB 1Q18A 3RSEB 3R6MA 3FR0A 3H3NO 2CH5A 1BO5O 4F9OA 2FSKA 1NGBA 1H1VA 3CI5A 1V4TA 3FE1A 3UKRA 3VGKA 5AQZA 3ZX0A 4FWOA 3U9ZA 4BRDA 4A2AA 4BC2A 5LY3A 2HMPA 3CIPA 5AQVA 2GEMA 4A61A 4GY2B 4DB3A 3O8MA 1R59O 2KHOA 1EQYA 4CZMA 2D0OA 3O08A 5BN8A 1NGCA 3CETA 1V4SA 2Q31A 3ZETB 3HI0A 4CZGA 2E20A 1HKBA 3R8EA 4FWKA 1XUPO 4M7XA 1RFQA 4BQLA 1ATNA 3QDKA 2P9UA 3QICA 3VEWA 3UB5A 3B8AX 1K8KB 1BG3A 2P9SB 2DPNA 4WYBA 4C23A 2OANA 2E1ZA 3SK3A 4RTFD 1C0GA 2YHWA 4O5FA 3CQYA 3U4LA 3EO3A 4BC5A 4K25A 3VF2A 2F9WA 4CZHA 5CE3A 1DKGD 2P9LB 1XQSC 3ZX3A 5AQFA 3O5BA 2ZWHA 3A5OC 4AM7A 1SAZA 2P9KA 2GTDA 3R9PA 2A3ZA 3MN9A 4I6MB 4PKIA 1BU6O 2Q2RA 1NGEA 4HWIA 3SJHA 3WT0A 3BP8A 3KHYA 3D2FA 4CZKA 2D4WA 4H03B 3SMPA 4CZFA 1T44A 3VEZA 1JCGA 4NB4A 3VEVA 3CHWA 1BA0A 1J6ZA 3UKUB 4BC3A 4FWPA 4A62A 2QM1A 2A6AA 1RDWX 3WXJA 3U8XA 1X9JA 3HBTA 3DXKB 4XH4A 5FPEA 4WQ4C 4EFHA 4H0PA 3VEXA 3GDQA 2QWPA 3FZKA 4CD3A 4KBOA 1BOTO 3FZMA 4B1VA 4E1JA 3CJCA 4BRKA 1Z05A 4M7YA 4IJAA 1NLVA 4BRLA 2FXUA 5KQ8A 1QZ5A 2YJEA 1BDGA 3I33A 1SQKA 4EHUA 5AQIA 2I7NA 4CD1A 1QZ6A 2YCHA 2V7ZA 2E2NA 2D1KA 3M1FA 4FWRA 3G25A 2VYPA 3VGLA 2GWJA 3LM2A 2E2QA 5F1XA 1GLCG 5AQSA 3EZWA 1MWKA 1E4GT 4QS8A 3W3DA 3MN5A 4O8KA 1NGFA 4WQ4A 2V52B 3ATUA 1GLDG 1SZ2A 5I9EB 1TYQB 1WUAA 4DHYA 3AARA 4IXCA 3LDNA 4K43A 4BRFA 5ELZA 4BVPA 2Q0UA 2VCPA 2YHXA 3F9MA 3ZEUA 4CJ7A 3CJ9A 1HKGA 1JCFA 5JLFA 3H45C 1C0FA 2GELA 2CH6A 4PKHA 3D7EO 1NGGA 3AY9A 5AQQA 5FPDA 1QHAA 1ZXOA 4BGBA 2IVOA 4B1WB 4BG9A 3M3ZA 1ZC6A 3HZ6A 4BROA 5BRDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THWB 2V51B 1IJJA 3GOIA 4HCBA 1FJGK 3DLRA 3C94A 3VTIA 4CJRA 2KZZA 2IAJA 3QB0A 3TWHA 3TSQA 2HHTA 4JLHA 2F8SA 3VQ8A 3LM9A 5KRSA 4CFBA 1SKRA 3SPZA 1YT3A 1YVNA 3LL3A 2NRZA 1KC8O 4LH4A 2ZGYA 4ELVA 1HRHA 3ZSWA 4EZ6A 1JLGA 4OGCA 2ZQBA 3MWPA 5B8HA 3DXMA 2ASPA 1SUQA 5JLHA 4ZTJA 3L3UA 3N4QA 2VQFK 4IZ9A 3I8DA 1ZBIA 3N4PA 4BVOA 1D9FA 4FJMA 3K5OA 1SL1A 3QINA 4HTUA 3MEEA 4H4MA 1XMQK 4OKEA 1VQ7N 4BRMA 3WNEA 4YDUA 1Z6RA 2GX9A 4FPBA 3AVHA 3AVBA 2UXDK 1WBBA 1T7PA 4H0TB 1LCUA 4B1XB 1K9MO 1RBTA 3VPZA 3BZCA 2W41A 3QEPA 3O3GA 4I2QA 4G1QA 3G6EN 4B3OA 4CF0A 5C25A 3M8RA 3BZKA 4KAZA 4DS5A 3R3LA 4ILHA 4O4GA 1S6PA 2P9SA 4CF2A 4LFBK 4BR4A 2ZF5O 1ESVA 2ASMA 2AJQA 4DFMA 4LF4K 4BDZA 4FJNA 3HYFA 3MWTA 2P9LA 5AQXA 4FM0A 1IG9A 1KVBA 4H0VB 4QAGA 4DR2K 4YOWA 4DQ8A 3VETA 1VSDA 4RG8A 3JAMO 5SWMA 4DSIA 3IDHA 1WSFA 4DU1A 1VQ6N 1C1AA 4U7BA 1HPMA 2EX3A 3RR7A 3JXUA 3SBTA 1GLBG 3MX2A 2OPPA 1WBDA 1TUUA 3VF6A 4JI0K 1KTQA 4Q5VA 1XC3A 1NK0A 1Y97A 4CF8A 4B9NA 1C6VA 5BN9A 4BE1A 3HJFA 3WXIA 3SQ1A 3WXLA 2Q1NA 1TV6A 4FOEA 1L3VA 2F4VK 5AZIB 1IBMK 1NGAA 3LP0A 4BGAA 3P31A 4JAXA 4HHTA 2D0CA 4CHPA 3QFUA 2Z1GA 4M3YA 1T03A 4JS4A 4JKBA 3UIQA 1KVAA 4K42A 4KTZA 1X9WA 2G8FA 4CIGA 1YAGA 3PUFA 1VSIA 3H08A 3ZSYA 4BR9A 2HHQA 1IBLK 2NZTA 4F8RA 4N5SA 1NMDA 1YXQA 1L3UA 2A1SA 1NU0A 3CJAA 3ISNC 2D0PA 5FPMA 4KB0A 4DMNA 4CJSA 1RT1A 4PY5A 2IGIA 3TPQA 4AQYK 3LAMA 2I7PA 4KTWA 3TAGA 3FZHA 3LDQA 2PBDA 2WONA 1U2VB 3ENHA 1YJ9N 2IIRA 4RCHA 1KD1O 3O6WA 4FWSA 5KPTA 5KQDA 2P9KB 4KB1A 4CZJA 3O80A 1J5EK 2OPSA 4JI8K 2GUIA 3S41A 2O8FA 4YY3K 1GLJO 5AFUH 3LP3A 3ULDA 1D4XA 1HKCA 1IG8A 2NLXA 2P9NB 3J7YP 4DR1K 4MDAA 4W5OA 3AO3A 4I2PA 3VF4A 3I56N 4FJ8A 3E9OA 1C0UA 4UY8O 2Q97A 1HR0K 2HF3A 2W6LA 3NDKA 2WUSA 3ENOA 3MMVA 4JN4A 1NJYA 4JHDB 3CJ1A 3E66A 5E26A 2RPIA 3EE9A 1UA0A 4OVLA 4BC4A 1QQMA 2UYTA 4K41A 4DV7K 2BDPA 1LWCA 4M42A 3FLCO 3ZSXA 4X66K 4CHNA 3C6UA 5AQGA 4DV5K 1HPZA 1HMVA 3MDQA 3KTQA 1VQKN 1HJOA 2HHXA 3RMAA 4M41A 4CHYA 4DV1K 4JI3K 3DYAA 4Y1DA 2QW9A 5JS1A 3UKUA 4FJ5A 5LJVA 4FWMA 3BF3A 2OYQA 4NLCA 3HP6A 4ISGA 3QEVA 2X74A 3O1BA 1OH5A 2XY8A 4BRAA 5I3UA 3DXKA 1RBVA 3QBXA 1T3VA 4CI6A 1EP4A 1Q9XA 4F2RA 4YOXA 3TU5A 1ATRA 3OS2A 5CYQA 3LDOA 4RW9A 2IVNA 1QVGM 1YTAA 1W7AA 2NRRA 3HM9A 2QKKA 1CZ9A 2E6MA 4JD2A 5GINA 3JYTA 3CG7A 4K8ZA 4Y0WA 4CECA 4CZIA 4KI6A 3QLHA 1KCFA 4CF1A 1TYQA 3P38A 3CMAN 1RDBA 3HP9A 3DXMB 4JKDA 1ZBFA 2IDOA 2HBJA 4GW6A 3NF7A 4X62K 1BO5O 4ID1A 4BWMA 4AF1A 4W5QA 5HL7L 3PX0A 4F4KA 3NGZA 3IKMA 3CQ8A 2NNWA 5C2DA 4CGDA 3UKRA 5C42A 5AQZA 4CF9A 3THWA 4JI7K 2JWLA 5LY3A 5AQVA 2P5GA 2GEMA 4DTOA 4KI4A 1EQYA 2F8TA 3VQBA 1NGCA 4B3SK 1EKEA 4CJ5A 5HRSA 1HKBA 4GV6A 3R8EA 2RE2A 1OVYA 4DTMA 4M7XA 1LW2A 1BIUA 1ATNA 3QICA 3KLEA 4DU3A 4FJIA 3EE8A 2P9SB 4EZ9A 1J5OA 2DPNA 4WYBA 4DTUA 2E1ZA 3M8PA 2YHWA 4O5FA 3OY9A 3EO3A 5KGWA 4BC5A 4K25A 3SYZA 3ZT2A 1A5WA 3PO5A 2P9LB 1XQSC 1NK5A 2ZWHA 2HW3A 2HBLA 1W0HA 3LP2A 1JLAA 3KK2A 1VQON 3SUPA 3DRPA 4WF9L 2NRVA 3QESA 1BU6O 4CGJA 1BCMA 4KHWA 4B3RK 4CIEA 4JYAK 4CZKA 4H03B 3FFIA 3NCIA 3ZYYX 4FWPA 4Z4GA 3AA3A 4CEOA 4YFUA 3HBTA 5EU7A 5KRTA 5K14A 3CCEN 1IKXA 3I0RA 3VEXA 3V9XA 4DU4A 3FZKA 1BOTO 3MXIA 3FZMA 3AA2A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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