1MXYA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 um brw)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxyA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxyA01
2A5TA 2OK2A 1GVCA 4BDNA 3VLWA 4JSDA 3CVGA 2UYEA 1LFIA 1SI0A 4JDFA 4G4PA 3QK6A 1EZOA 1Q1KA 2PYYA 1I69A 4F3SA 1MPCA 4YB6A 3VV5A 3IR1A 5IKBA 4DCXA 1QVSA 1MQIA 1P1QA 5DVJA 4TLLB 1RYXA 2GHAA 5CMCA 1H76A 1MS7A 1USYH 1OLCA 2XXVA 5L8DA 3EQ1A 1ATGA 4FEDA 1IQ7A 3JV9A 2IA4A 4H1XA 1MM6A 1MXZA 3KJ7A 2ZYMA 5ITPA 1SVXB 4C0RA 4RNSA 4ONYA 5I59B 2Q8JA 1LAGE 4JSOA 1B6HA 2OWTA 4DLDA 4PQJA 3KOTA 1ZMGA 1I6BA 4U1ZA 1Z7NE 4XKRA 2DE4A 1JQFA 2H98A 3TTMA 3SERA 3W15C 2F35A 5L9OA 3KOSA 3TTRA 5L9MA 2H4IA 1A40A 5FTIA 3I6VA 3IL1B 3MPLA 4QFLA 4R9GA 4TOZA 4G8HA 3G3GA 4YAHX 3KN7A 3R6UA 4IO7A 5TU0A 3ECRA 3H6WA 4RPOA 1LLSA 2XHDA 4Q30B 2DVCA 1JNFA 4F22A 3IX1A 3QXMA 1PBQA 1JW4A 4Z7EA 5H8HB 5BUUA 4UACA 1MG1A 1TFDA 3MVXA 5FHOA 3PPRA 2A5SA 3E9XA 1B5IA 3OXNA 4ZZEA 3QYTA 5CBRA 1UIVA 3O6IA 3H4ZA 3PPOA 4IB2A 4U21A 4F29A 2XD3A 2QMWA 3OO6A 1FQCA 4NF5B 3H6TA 4OERA 2NWJA 4F3PA 4MF3A 1MDP1 3HHFA 1QKBA 5I59A 1LAXA 4THIA 4ELOA 4DCYA 1J1NA 1UQWA 4U23A 3A3UA 4YB7A 1D9YA 1IITA 3ODBA 2XXHA 1B7ZA 3N6TA 3KFMA 1LB9A 1LBBA 1QUIA 5LOMA 4HCWA 2QMXA 1M5FA 3ILTB 3UP9A 4NF6B 4I1DA 5CC2A 5DYHA 2H99A 3H6VA 4FAJA 3K6VA 2QS4A 3D4GA 4EQ9A 1FCKA 1FW0A 1B3GA 1ZU0A 2QS3A 4O3AA 2AIXA 1Y20A 4GXAA 4QFKA 2OZZA 1Y3PA 4DDDA 1XC1A 3FJ7A 3H06B 5H8HA 3U8QA 2ZNSA 3SEWA 4G8NA 3T96B 1OIBA 5ICTA 2UVIA 3HSTA 4H8JA 1YTVA 4LUBA 1D9VA 1O7TA 3RGYA 4EF1A 1QKAA 4NF5A 5B70A 1R9QA 3FUZA 3G3JA 3AXFA 2Q88A 1ZTYA 3IOVA 3A09A 1OMPA 1VFEA 1B52A 4GD5A 5ISUA 3G3FA 2THIA 4KYDA 1XS5A 4O3CA 3TTNA 4BDMA 1A54A 3HHGA 2G93A 3S9NC 1D3KA 4F31B 1QULA 2RCBA 3K00A 3LC8A 4QSDA 4F2OA 5CI5A 3PMVA 4M4GA 1LFHA 1M5BA 3KBRA 4MFIA 5AA2D 4NWDA 3B6WA 4LZ7A 4KI0E 4X1BA 4WEDA 1NNTA 3TCFA 5IAIA 2UVHA 4ND9A 3C35A 1B4ZA 1SW1A 4LATA 3PPQA 4GQOA 1DPEA 4DXBA 1ANFA 1VE4A 2Z8DA 1A8EA 3UGWA 1Z7ME 4YB5A 1B0HA 2DWHA 3RPWA 1FTOA 3WAEA 1I6QA 2QJEA 1I6AA 2AYSA 2VHAA 4FE8A 4ELRA 1Y3NA 3IOUA 1MQHA 3VVFA 4EQ7A 3LSWA 4YKJA 4OHNA 4IGTA 4ELPA 4YMAA 2XXRA 2O1LA 4MLQA 1FTLA 2AL5A 1EZPA 3KGCA 1TT1A 2Y7PA 3QIMA 1XVYA 3MAMA 5F1QA 2HXWA 5HBCA 5K2XA 4EF2A 2O1MA 1A8FA 3S9LC 4NTLA 3ZKKA 2I49A 3TPAA 3A3CA 1GR2A 3DP8A 3H3GA 4OMBA 4GOTA 3K6WA 4ZEDA 1NMUA 5FHNA 4K3FA 3TZAA 4GXSB 1FTMA 5BWJA 1LGBC 1B0LA 4OYVA 3V8XB 4I8CA 2V3QA 4FECA 4H67A 2RC7A 2UXAA 4F18A 5DTBA 4JWOA 5KCJB 1S7YA 4EXLA 4KHZE 3ZS6A 1N84A 3OD7A 4JWYA 2DWJA 3L6GA 1A99A 2XXIA 5M2VA 3MZ9A 2QRYA 2F7AA 5JK4A 2Z8FA 3VVDA 3SDFA 3IJOB 1P1UA 4R72A 3OO7A 4GWOA 1DTZA 2I0BA 1N0TA 4QHQA 4G68C 1LSTA 2UYFA 2RC9A 4QRZA 3TQLA 4ZE9A 3R26A 3CR9A 1DPPA 4OTEA 4JB7A 3MP6A 1NNKA 2E0SA 4YICA 4OVJA 2VOZA 4H0WA 4U1OA 2ZNUA 2DQVA 5CBSA 1IXCA 4JXIA 1UTBB 2PMSA 2OJTA 1LCTA 4IO5A 4HS7A 3PUWE 3ONMA 2V25A 5H8FB 1URGA 2YPNA 3RTWB 2O68A 1DMBA 2DE2A 2XXTA 3S9EA 3FV1A 3O2AA 4KYEA 3FASA 5AA1A 1N3WA 1GTKA 2O7UA 5JTYB 3L6HA 3SKPA 2QSXA 3EHTA 3KEIA 4GL0A 4XKNA 4QF9A 1L5TA 5EYFA 3FXUA 4OESA 4IY6A 4XXUA 5AA2B 2ONRA 4KQPA 3QSLA 3LSXA 1HSEA 3T9XB 5KCJA 1ZBMA 4R9FA 3VLUA 5DEXA 4BLAA 2RC8A 3D4CA 4ZZAA 3G3IA 1LFGA 1ELJA 4POWA 2NOOA 1H43A 2PT2A 2KLFA 1BLFA 1Y4TA 3QUJA 3KN8A 5TP9B 1P1OA 2I3WA 2OLBA 3U93A 3OOAA 1MY2A 1GV8A 2B65A 1BKAA 2GRVA 1Y3QA 1UTHB 2FYIA 2UVJA 3KSJA 4OQOA 2VD2A 4KR5A 3TAJA 4F1YA 2F6PA 1XHYA 2BJJX 1B51A 4G8MA 4AB6A 5K2YA 5JEIA 1IXGA 3U72A 4MH5A 2F7BA 2O7IA 3PV0E 2VD3A 1B58A 1H3DA 4I9DA 1UTBA 3UA8A 1IIWA 1TWYA 4XIGQ 3C36A 3P7IA 2UVGA 2ALUA 1BP5A 4X1DA 4ZEKA 3Q26A 3M8UA 1B46A 1R6ZA 5H8FA 2H9BA 4U4XA 3F11A 2HZKA 3UORA 1MPDA 1XT8A 4R6HA 1SQYA 1UIUA 2Z8EA 1MDQA 4PFWA 1MY4A 3RT8A 1FTJA 4I62A 3O6GA 3USDA 5HM4B 3M3LA 2GFEA 4R2FA 2ZYKA 3GBBA 3V5AA 1PEBA 4RK2A 3M3KA 2O6AA 4G2ZA 4EXKA 5CMKA 1JVYA 5JTYA 3H03A 4IO6A 3FVNA 3MVZA 3HV1A 4YKPA 3IAZA 4Z0IA 2LAOA 2I4BA 1B1HA 3FVKA 2ONSA 1II5A 1B4HA 5AA2A 5FTHA 4Q0CA 2Q2CA 3LSLA 3FVOA 4F1UA 2REGA 4P0IA 3EN3A 4YU0A 1SBPA 2ESNA 4OWDA 3I5OA 3FJGA 4DZ1A 2P2AA 3IB1A 3MZBA 5TP9A 4F1VA 2Z23A 5DVIA 2XD2A 1QW0A 3VDFA 3MP8A 4KCDA 3PMXA 3CG1A 1UTHA 1XOCA 4IO4A 3K1PA 3TTKA 3TODA 1B32A 2DOJA 4F2QA 4NWCA 2RCAA 1FQBA 3RTFB 1OLAA 5I2NB 2QL3A 3KSXA 4Q8RA 2W7YA 2ABHA 1USYE 1M5CA 2XX9A 1WDNA 1A55A 1MH3A 3GLBA 3Q28A 3BKIB 4PETA 2ZXTA 5HPQA 3DP6A 1MQDA 2O69A 4ZEFA 3VXBA 3S2VA 2GH9A 2ZYOA 3MWBA 1ZJLA 1MY0A 4ZEIA 3TQWA 5KZTA 4R6YA 4OEUA 5EHSA 2Y7IA 1SW2A 4LA9A 4OZ9A 3MW0A 5H8QB 3OEMA 4U4SA 1QUJA 2Y7WA 4DIGA 3PU5A 3K4UA 4U22A 2F6GA 2DXRA 3O6HA 3VFJA 3CFZA 4ISUA 4PP0A 4H5FA 3TEPA 4IY5A 2F8DA 2Q9TA 4OETA 3U94A 1S9TA 4H6DA 3FD3A 3C31A 4EQBA 4BDOA 1B40A 3TCHA 1OQHA 3MPKA 1JVXA 1LAFE 1JETA 4Q5TA 3R7XA 1ZKBA 2DVZA 2XXYA 2DXYA 2NVUB 1NL5A 4GL8A 1FQEA 2QS2A 3C4MA 3RQTA 3THIA 3K6XA 2YLNA 4RA1A 1MXWA 2V93A 1LAHE 5I57B 4G77A 4OEVA 3TFLA 3K6UA 1A7LA 2DWIA 1SW4A 3O28A 2I6EA 4OFJA 3BFTA 2O51A 1S50A 1HSJA 1QUKA 2OWSA 2F7CA 3JZJA 3K1NA 1US4A 4FEBA 3EPEA 5I56B 3PPPA 1HSLA 4YZZA 4P0GA 4F39A 5KDTB 1NNFA 4ESXA 4ESWA 2OBGA 5I2NA 3CSGA 1CE2A 1P1WA 1TXFA 2HAVA 1Y1ZA 4O3BA 3OMBA 3B6QA 1BTJA 5EHMA 1PC3A 4FJPA 2RINA 3Q25A 3WAFA 3RN8A 3V89B 4OFOA 1H45A 4JWXA 4MLVA 4RY1A 4IO2A 3I3VA 4RK9A 1EZ9A 3K0VA 1WVJA 2NUVA 1SD3A 5H8QA 4PFTA 3TCGA 3EF7A 4BDQA 3IOWA 3TELA 1T0KA 1O64A 4ZDMA 1RYOA 3PGFA 2I3VA 1YCJA 3FATA 2I48A 4LONB 2ZMBA 2AL4A 4KCCA 3MBPA 3RLFE 3OSRA 5AA4B 4NF8B 5AE4A 4HW8A 4KPTA 1KWHA 3IB0A 2REJA 2FA7A 3CRBA 1LB8A 5J1DA 3O97A 5A5XB 4WEPA 3SEVA 3K01A 5CM6A 3E4RA 5DEXB 3IOTA 1B1XA 3HN0A 2PT1A 3GZGA 3W9WA 2D3IA 5I57A 3G7WA 3MZ1A 3LR1A 2F97A 3CSBA 1SW5A 3PUXE 3RUMA 5CMBA 3TDJA 2IEEA 1MM7A 1NKXA 2M8CA 4GFRA 3PUYE 5I56A 2R6GE 2Y7RA 3FZVA 3CI8A 4FORA 4IGRA 4NF4B 5KDTA 2H25A 1B3HA 1N7XA 4ELQA 2F36A 2HEUA 3QUFA 4C1TA 1JEUA 1RKMA 5ELVA 4R73A 4E0WA 1B3EA 2H5YA 4QFOA 1VR5A 1AH5A 2F34A 3LBSA 4KFQA 2VP1A 2DYXA 4NE4A 1LCFA 1EU8A 2V84A 3B7DA 2DE3A 3K1MA 3T93B 1B2HA 4KYSA 4NEDA 1DTGA 4U2RA 3K02A 1H44A 3OELA 3H7MA 4QSCA 4LZ8A 3O66A 4QSEA 1IZ1A 1F9BA 1FQFA 4WKMA 1B7HA 3TKDA 3ZSFA 3IO4A 2GHBA 2Q89A 4RYAA 2QS1A 2V3UA 4NMYA 1FQAA 5I58B 3IJXB 1AIVA 2V3TA 3MJNA 5AA4A 4NF8A 3UN6A 1WODA 3MP1A 1MY3A 2PVUA 3JYRA 5DVFA 4ZECA 4GF8A 1M5EA 2Z22A 2P0SA 3FXRA 4H65A 5A5XA 3O29A 2OCUA 5B7DA 3EHUA 1N7WA 1IEJA 4PFUA 3CFXA 3FJMA 5ICQA 2RF1A 3KZGA 1B9JA 1Q35A 4XTCQ 3UK4A 2Y7KA 2Q2AA 1NNPA 1YAEA 3Q29A 3C34A 3IK6B 3CFLA 1IXIA 4KD5A 4ZS9A 2F5XA 4PE5B 1FTKA 3TUSA 4TQUQ 2D5WA 1P1NA 1NH8A 3N94A 5TPAB 3UIFA 3IORA 4NF4A 1JW5A 1AL3A 3OENA 3SEXA 4AQ4A 1B3LA 2WKYA 2E1SA 4ECFA 3FXQA 4LP2B 3V83A 3SEYA 4XKPA 3C32A 3VE1B 3HCQA 1VFDA 3IB2A 4N6PA 4GIZA 5CRYA 2O84X 1BIYA 3KN3A 4LQ2A 3FV2A 1B3FA 3DELB 2R9JA 1MY1A 3DM0A 1POTA 3LSFB 3VVEA 4FATA 1TFAA 2XXWA 4QFPA 3OSQA 1D4NA 1B5HA 1LBCA 2X7PA 5I58A 3VLVA 3K2DA 3MC2A 2Y84A 1OVBA 3OEKA 2X26A 5DT6A 3OO8A 1PB7A 1SI1A 2DSFA 1MXVA 2HFBA 4F19A 3U1OA 3E13X 1MQGA 1URDA 3HO7A 4R6KA 2ZNTA 1R1NA 4R75A 3G3HA 4HCYA 1MRPA 5CMMA 1O63A 3N26A 1XVXA 2XX8A 2F78A 3PPNA 3T22A 2XXQA 4F3GA 4C1UA 2YJPA 4G68B 5TPAA 5I84A 5AA3A 4QFNA 3LUYA 3C9HA 1AMFA 4RPNA 1QJMA 2DP8A 1Y4CA 3IO6A 4X48A 2X7QA 1N3XA 1ZLQA 3TYHA 1MH4A 4JBZA 1GGGA 5I2KB 3H6UA 4LQ5A 3N5LA 1JW1A 4RJZA 1MPBA 1JEVA 2I0CA 2ZYNA 4OXVA 2I4CA 4WXJA 3C33A 3KG2A 4P11A 3RY3A 2D21A 1NH7A 2PBWA 1SYHA 4R74A 2HCAA 1SYIA 3MVYA 3PD9A 4N07A 3BBRA 3TMGA 3SEUA 3T9VA 5H8NB 2P1SA 2HAUA 2I58A 2G29A 2QPQA 2NXOA 1N76A 1EH3A 3E3KA 4RXLA 1US5A 4HTGA 3T66A 5F7VA 4DXCA 4YKKA 2VGQA 4EUOA 4BDLA 4YKIA 4YMBA 1IUDA 2B3FA 3QAXA 1PDAA 4FIMA 1MQJA 4NF6A 1AOVA 3T9HB 4H8IA 3PUVE 4MBPA 2XXPA 3MVWA 4L17A 3MUQA 1YPNA 3RNNA 2XXXA 2CMOA 1IXHA 3CG3A 4POXA 4G68A 3RT6B 1NFTA 1PB9A 1Y1MA 2FNCA 4GRKA 4LZ5A 3PD8A 3SETA 3W9VA 2DS9A 4X9TA 3DLNA 2A5TB 1FQDA 5I2KA 3FIRA 1SDXA 4H5GA 2B3BA 4DE8A 4ZEBA 1P99A 2HQ0A 3ILUB 1MXYA 3PUZE 4TLMB 3VXCA 1DOTA 1M5DA 4M1VA 4N13A 3EHSA 1PB8A 2RKMA 2HZLA 3Q27A 1POY1 2PX1A 4R2BA 3FGSA 1OQGA 3OO9A 3S4UA 2XXUA 5H8NA 3N6UA 3PMWA 1B5JA 3BFUA 2DWAA 2R71A 1ZIUA 1OVTA 1R9LA 1CB6A 3T9UA 1Y9UA 3MQ9A 3M3FA 3S9MC 1MXUA 3GBAA 4PFYA 4GVOA 2ANJA 2ONKE 1DSNA 3B6TA 3KJTA 1B7UA 4OENA 4UA8A 5ITOA 3O9PA 1VSOA 2XX7A 5H8SA 3SESA 3FVGA 1N04A 3HPIA 3CIJA 5L9SA 1MXXA 4XKQA 3GXAA 4DXUA 4ZE8A 3G3KA 3TTLA 1URSA 3DP4A 3U92A 4LVQA 2CZLA 4F3BA 3ZKLA 4BDRA 4IO3A 1B05A 4OFLA 5FHMA 1PBPA 4GLIA 4AB5A 4E0XA 4EDPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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