1MXYA

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 um brw)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the function, conformational plasticity, and dimer-dimer contacts of the GluR2 ligand-binding core: studies of 5-substituted willardiines and GluR2 S1S2 in the crystal.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxyA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1mxyA01
4MLVA 3E13X 2DXYA 3FVKA 3DLNA 3I5OA 1Y1MA 1JNFA 3MJNA 4BDLA 1LAGE 4FIMA 4O3CA 2QPQA 1HSEA 1JVXA 4LATA 4GF8A 1OMPA 1A40A 3JYRA 2DE4A 1JEUA 2O68A 3UIFA 4ZS9A 3ZKLA 1MH4A 4OFJA 4POWA 1KWHA 5DTBA 1B58A 2GRVA 5I58B 4XKRA 2ONSA 3MWBA 3F11A 3G7WA 2ESNA 1LCTA 4JBZA 4GIZA 2PT1A 3S4UA 3RPWA 3D4CA 5AA2B 3T9HB 2VHAA 2NUVA 2REJA 3R7XA 1P1UA 1FQBA 3KG2A 1URDA 2UYEA 3FXQA 3IOUA 4KR5A 3TAJA 2RC9A 1N76A 3PPRA 3S9LC 2F8DA 1FTLA 1D4NA 5AA4B 4NF5B 3FJ7A 4YZZA 3FASA 1DTZA 4H5GA 3K6UA 3H4ZA 4RPNA 3U94A 3CR9A 3W15C 4TLLB 2O6AA 3FGSA 5TPAA 4X48A 3OO6A 4YU0A 3VFJA 3PMXA 2O84X 2WKYA 2UVIA 4R9FA 1P1QA 4Z0IA 2ZNSA 1Y4CA 2HAVA 3PMVA 5DVJA 3S9NC 5EHSA 4OFLA 2Z23A 3O28A 3O6GA 1AH5A 2Q2AA 3TTKA 2I58A 4NWDA 2DYXA 2FYIA 3QK6A 4OMBA 3TCGA 1YAEA 2F5XA 4R2BA 1PB7A 1CB6A 2KLFA 5CMCA 4MH5A 3S2VA 3MC2A 2F6GA 1QW0A 5AA3A 4H67A 4FORA 3MPLA 2RCAA 1A55A 4POXA 3U8QA 1XC1A 3LUYA 2CZLA 3MQ9A 1MXZA 1M5FA 3IB0A 1OQGA 4FATA 2ZYOA 5ICTA 4QFPA 3LR1A 3G3JA 4I1DA 4KQPA 4WEPA 4QF9A 4YMBA 4OXVA 2VGQA 4EXKA 3PD8A 4AB6A 3TFLA 2V3TA 2OWSA 3Q29A 1MQJA 3T22A 4KYSA 5CM6A 1T0KA 4EF2A 3RQTA 2RCBA 4QRZA 3FVNA 3MVYA 2LAOA 4DDDA 4KPTA 1S50A 3O29A 3TCFA 5KDTA 4P0GA 2XXXA 5F7VA 4IB2A 1MPCA 3Q28A 3IAZA 2AIXA 3C32A 2PBWA 3C33A 4F3GA 2E0SA 3T93B 4YB5A 2B3BA 1AMFA 4R73A 3EHTA 3CI8A 1N0TA 3C36A 2H98A 1BIYA 1R1NA 1B3EA 1UTHB 2DE2A 3M8UA 1D3KA 1JVYA 1SBPA 2XX7A 1R6ZA 3OSQA 1N7WA 1AIVA 1LBBA 5I2KB 3OO7A 3ILUB 5H8FA 3KJTA 3B7DA 2V3QA 3USDA 3HCQA 2FA7A 4EQBA 4H6DA 1SI1A 3S9EA 4N13A 2HXWA 3PUYE 3Q26A 2YLNA 4QFNA 1URSA 4KI0E 4ZDMA 2B65A 3TEPA 3K0VA 4ZE8A 1NKXA 1OVBA 1TWYA 1IXGA 1WVJA 2F6PA 5F1QA 3HHGA 4Z7EA 3IOWA 1DPEA 4OHNA 2QL3A 3QXMA 4GLIA 2QRYA 4ZEDA 2O1MA 3H6WA 1NL5A 3KOTA 1Y9UA 1VFEA 3CFLA 4M1VA 5H8SA 4F1VA 1GGGA 2XXIA 2Z22A 3VXCA 1JQFA 3KGCA 3U92A 1PBQA 3RTWB 2XXTA 5ICQA 3VXBA 3FIRA 4H8IA 2DQVA 2M8CA 4OENA 2D21A 1ANFA 3KEIA 5TP9A 1DMBA 3OEMA 4MBPA 1I6QA 3OELA 2Q9TA 5ITOA 5AA2D 3V89B 1N04A 2I4BA 5KCJA 4IGRA 1B7ZA 4NF4B 1B3LA 1HSJA 1MDQA 2R9JA 3UGWA 4X9TA 2X26A 4G68C 1QUJA 1QKAA 1MM6A 5IKBA 1SDXA 3FVGA 4PQJA 1MS7A 1ZJLA 3PPOA 3UN6A 4OZ9A 1Z7ME 3O6HA 3U72A 3H6UA 4MF3A 3SESA 3PU5A 2GHAA 1QVSA 3HN0A 1XVXA 2O69A 3VLUA 2ABHA 4OVJA 3R26A 2A5TA 1XVYA 4YICA 1PDAA 1I69A 3B6TA 4OWDA 1XHYA 4U23A 4HW8A 3H03A 3SERA 1B4ZA 4JWYA 5LOMA 2XXQA 3I6VA 3LSLA 2BJJX 4LZ7A 4ISUA 2HEUA 1B0LA 1IXIA 2V25A 4C1TA 5A5XB 2ZYKA 1OVTA 4F22A 1NH8A 5ELVA 4FAJA 5M2VA 1ATGA 1MXWA 1B0HA 2F36A 1ZTYA 5BUUA 1M5DA 2PX1A 1LAFE 5I57A 3VLWA 2G29A 5AA1A 4U1OA 3PPPA 4TOZA 4LQ2A 4R74A 4GXAA 1RYXA 4I9DA 2F7BA 2Y84A 1FQDA 3IL1B 2THIA 4G4PA 1NNPA 4RA1A 4TQUQ 1MPDA 4IY5A 4IO5A 3ODBA 4ESXA 2XD3A 3M3KA 4LUBA 5DVIA 2F7AA 3T66A 3G3IA 4LZ8A 3G3GA 3H7MA 3OEKA 4GRKA 1A7LA 4PFTA 3TZAA 3QUFA 1XT8A 1UQWA 3IB2A 3RUMA 3O66A 3RT8A 3K1MA 1MY3A 3SEUA 1M5EA 3SEYA 1P1NA 3TCHA 4BDRA 2HAUA 1QJMA 1R9LA 4JWOA 4NF8B 3VV5A 4YKIA 2R71A 4OETA 2DXRA 1XOCA 1B5HA 3PPNA 3KJ7A 1DSNA 4FJPA 3TMGA 3EF7A 4HCYA 5HPQA 3OO8A 2I0BA 2I3WA 4I8CA 2OJTA 1B3GA 1SW5A 4GXSB 4H1XA 4NF6A 4R75A 1FTJA 4GOTA 3MP1A 1B5IA 3C4MA 4ELPA 4G77A 3VVDA 3HHFA 4Q30B 4LQ5A 5K2XA 3T96B 4GD5A 4IO4A 3Q25A 3B6WA 4PFWA 4EQ7A 3DP6A 2HZLA 5I84A 1N3XA 3FXUA 3KBRA 5ITPA 5I56B 4I62A 5IAIA 3OXNA 1EZ9A 3MUQA 3GBBA 3ZKKA 5H8HB 5I2NA 1MPBA 1B9JA 1H44A 4RYAA 3Q27A 4NE4A 2ONRA 4PE5B 4DZ1A 3BFUA 4AQ4A 3KN8A 3TDJA 4QFOA 4RNSA 2OZZA 4OERA 4OYVA 3LSWA 5H8NA 1ZBMA 3BKIB 4BDQA 2FNCA 3UK4A 5BWJA 3GBAA 3C35A 4UA8A 3JZJA 4OTEA 3DELB 1LLSA 3O2AA 4K3FA 1B5JA 3MZBA 3E3KA 4FEDA 2DP8A 1SI0A 3GLBA 2XXYA 2PVUA 4F18A 4RK2A 1MG1A 4TLMB 3LC8A 4N6PA 1LFGA 5CC2A 3IX1A 4PFYA 3OOAA 5L9MA 1TFAA 4R9GA 1P1OA 3PUXE 1FTKA 3CFZA 3GXAA 2NWJA 3M3LA 5JTYA 3V8XB 3TUSA 3OENA 1I6BA 3RT6B 4E0XA 2AL4A 2XXHA 2RINA 1H45A 3WAFA 1MY1A 1Y3NA 5DEXB 4ND9A 3OMBA 2Z8DA 5I59A 1A99A 3SETA 3B6QA 3QUJA 4Q0CA 1WODA 1BKAA 1PC3A 3GZGA 4R2FA 2A5SA 4DIGA 4PP0A 2QS1A 1US5A 1B52A 2VOZA 3EHUA 1LFIA 4YKJA 3TTMA 2REGA 4ZZAA 3IOVA 4NWCA 1MQGA 1LAXA 4RXLA 4JWXA 4XTCQ 5K2YA 2I3VA 1ZU0A 5EYFA 2PT2A 4Q8RA 1LB9A 1URGA 4JSDA 1N84A 1RYOA 2H4IA 1L5TA 5DT6A 1FTOA 1ZMGA 3K1PA 2NOOA 3FD3A 1QUKA 3G3KA 1IITA 4G68A 3K6XA 2Y7WA 1Y3QA 4KFQA 1BLFA 4KCCA 5H8QA 2VD2A 3O6IA 4ESWA 1SVXB 3T9UA 3K00A 2O51A 4DCXA 3U1OA 3IO6A 1B40A 3TTNA 1WDNA 2F78A 2DWAA 3CSBA 4KYDA 4BLAA 1HSLA 2ZNUA 2Z8FA 3DP4A 4QFLA 2R6GE 1SYHA 2ZYMA 1QULA 2F97A 4LA9A 5TPAB 3H6TA 3TPAA 1TXFA 3UP9A 1JW4A 1POTA 1BP5A 2QS2A 2HQ0A 4N07A 3QIMA 1XS5A 4DXBA 1B51A 3MZ1A 2Y7RA 5FHMA 5ISUA 4FECA 3A3CA 4Q5TA 1M5CA 2RC7A 1LCFA 2OLBA 1IQ7A 1MXVA 3DM0A 4DXUA 3IK6B 3TQWA 4DCYA 5CMMA 4YAHX 1JEVA 1LB8A 3VVFA 5I58A 3MVZA 4HCWA 4XXUA 2Q89A 2F34A 3TTRA 2XX9A 3FV1A 4O3BA 1DTGA 3TTLA 4C0RA 3RY3A 5AA2A 3VLVA 4F29A 3UA8A 1IXHA 4EDPA 3C31A 1A8EA 2XHDA 2DS9A 4FEBA 4H8JA 5HBCA 2OWTA 4RY1A 3ECRA 1MQIA 4QSCA 1MDP1 1R9QA 2ANJA 4G2ZA 2VD3A 2P2AA 4F31B 2UXAA 3MPKA 4KD5A 3SKPA 4EXLA 3K01A 2E1SA 4R72A 1SW1A 5AA4A 3D4GA 4JXIA 4NF5A 3SEVA 3RN8A 1N7XA 5CI5A 1JETA 3TYHA 3MVWA 4LONB 5KDTB 3LBSA 2UVJA 3CSGA 5L9OA 4IO6A 1H3DA 2OK2A 4R6HA 1MM7A 1TT1A 3K4UA 3LSXA 5L8DA 4YMAA 2H9BA 3O97A 1A8FA 3EHSA 2ZXTA 5FTIA 1B7HA 3PPQA 1YTVA 4OESA 4ZECA 1JW1A 4MFIA 2X7PA 3O9PA 1A54A 4DE8A 2XD2A 2DWHA 3CIJA 1LAHE 1NH7A 4U21A 5H8FB 3MP6A 2H25A 2DOJA 4GVOA 4LVQA 1M5BA 1EZPA 2HZKA 1YPNA 1N3WA 3TQLA 3KN3A 1MXXA 5B7DA 1MH3A 3N94A 3MP8A 2V84A 1SQYA 1UIUA 2PMSA 5JK4A 3LSFB 4JDFA 4KHZE 4IO7A 3ZSFA 4EF1A 5KZTA 4XKPA 2QMXA 1PEBA 5FHNA 2I0CA 4QFKA 3IOTA 3MZ9A 4G8MA 1IUDA 2IEEA 2DVCA 3K02A 2AL5A 4KYEA 5DVFA 1LGBC 2ZMBA 4ELQA 4P0IA 1BTJA 3KFMA 3PD9A 2XXUA 1IEJA 3HPIA 1DPPA 3MW0A 3WAEA 1GTKA 1NNTA 2HFBA 3FVOA 3MVXA 3OD7A 4C1UA 5TP9B 4H5FA 3HO7A 5DYHA 3PUWE 2I48A 1Y1ZA 5KCJB 3ONMA 4F1UA 1D9YA 4WKMA 4ZE9A 2UYFA 4GL0A 2QJEA 4WXJA 1ZKBA 3M3FA 4XKNA 1UTHA 2I49A 2NXOA 4U2RA 4BDNA 3PUZE 2XXWA 4ELRA 3RGYA 1FQFA 5I2KA 4U4SA 2O7IA 3DP8A 4F3BA 4IO2A 4BDOA 1Y20A 2A5TB 3RLFE 4YKPA 3PGFA 2I4CA 1OLCA 3IJXB 3EN3A 2DSFA 4YB6A 2HCAA 4LP2B 3THIA 1ZIUA 2F35A 1H76A 3FZVA 4P11A 1F9BA 3E4RA 4ZEBA 1CE2A 1Q35A 3SDFA 1UTBB 2QS4A 4AB5A 1O63A 1B6HA 4QSDA 4OFOA 3V5AA 3R6UA 4OEUA 4OEVA 4HS7A 2ZNTA 5I57B 4UACA 4L17A 3IB1A 3N6UA 3AXFA 1USYH 1B32A 1OLAA 3N6TA 4M4GA 3U93A 3CG1A 1FQCA 2I6EA 3A09A 2Z8EA 4IY6A 5EHMA 4ZEFA 4ZEIA 4IGTA 2YPNA 2D3IA 4RK9A 5AE4A 1NMUA 1B46A 3N5LA 1GVCA 2RC8A 4G8HA 1OIBA 4QHQA 4NTLA 1MXYA 1VSOA 2ZYNA 4NF4A 1D9VA 4NEDA 5B70A 5HM4B 4IO3A 2F7CA 1H43A 5J1DA 3IORA 2GHBA 4XIGQ 1MQDA 1ELJA 1GR2A 4F2QA 3C34A 1O64A 1EU8A 1MY0A 5JEIA 4MLQA 3T9XB 3FATA 2GH9A 1IZ1A 1MY2A 3CVGA 3I3VA 1S7YA 3S9MC 3PUVE 1II5A 4R6YA 4BDMA 4DLDA 2Y7IA 3K2DA 1EH3A 4NF6B 3IO4A 4PETA 4U4XA 3ILTB 2O1LA 3H6VA 3FV2A 3JV9A 5CBSA 2IA4A 1JW5A 4GQOA 2QSXA 5CRYA 3PV0E 4HTGA 5A5XA 3CFXA 2DWJA 2Q88A 4OQOA 3FJGA 1UIVA 3KN7A 2YJPA 2G93A 3VDFA 3QSLA 3EPEA 1TFDA 2VP1A 2O7UA 1Y4TA 1QKBA 1IIWA 1P99A 4X1BA 2RF1A 3CRBA 4ZZEA 3RTFB 2PYYA 3V83A 3KZGA 4ZEKA 5I2NB 2P1SA 4U22A 2Y7KA 1MXUA 1VR5A 3SEXA 2DVZA 1FCKA 1ZLQA 1QUIA 1NNFA 4GL8A 1FTMA 1S9TA 1POY1 2P0SA 3TODA 4U1ZA 5H8NB 2ONKE 3A3UA 1I6AA 3IR1A 2QMWA 2NVUB 5FHOA 1IXCA 3FXRA 3FJMA 4G8NA 4DXCA 1FQAA 4PFUA 1Q1KA 3RNNA 1O7TA 4F2OA 3MAMA 4KCDA 1OQHA 3E9XA 5TU0A 1RKMA 3OO9A 3H06B 1GV8A 2W7YA 1YCJA 1B3HA 1B1XA 2V93A 3K6WA 4FE8A 4NF8A 1B1HA 4XKQA 3BFTA 4F39A 3P7IA 3IJOB 1MY4A 4JSOA 5JTYB 2DE3A 4F19A 4YB7A 3ZS6A 3QYTA 3L6GA 3VE1B 3EQ1A 1PBPA 2ALUA 4ECFA 4F1YA 3PMWA 4NMYA 5I59B 1B05A 1FQEA 4O3AA 5CMBA 4LZ5A 2V3UA 1SYIA 1VE4A 1PB8A 2UVGA 1B7UA 2DWIA 3C9HA 2XXVA 1USYE 3MBPA 5I56A 1LSTA 2Y7PA 2Q2CA 2X7QA 1P1WA 3TELA 2GFEA 5CMKA 5H8HA 1NFTA 1Z7NE 4H0WA 4EUOA 4ONYA 2OCUA 4RJZA 4ELOA 1SW2A 1J1NA 3KSXA 3QAXA 3UORA 2OBGA 4YKKA 1B2HA 2D5WA 3OSRA 3KSJA 3L6HA 4GFRA 1B3FA 3BBRA 3HV1A 4X1DA 4RPOA 4F3PA 5FTHA 2H5YA 1Y3PA 1AL3A 4G68B 4H65A 5L9SA 3FUZA 4EQ9A 1PB9A 2Q8JA 5H8QB 1UTBA 1VFDA 3TKDA 4GWOA 4F3SA 2CMOA 2UVHA 2B3FA 1B4HA 3W9VA 1SW4A 1AOVA 1EZOA 2QS3A 2XX8A 3N26A 1SD3A 1LFHA 4JB7A 3W9WA 3CG3A 1MQHA 2RKMA 1US4A 3VVEA 4WEDA 3K6VA 2AYSA 1FW0A 1MRPA 3SEWA 2H99A 3HSTA 3K1NA 4R6KA 3G3FA 3T9VA 1DOTA 1NNKA 4E0WA 3G3HA 3KOSA 3H3GA 4QSEA 5CBRA 1LBCA 4THIA 5DEXA 2XXRA 2XXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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