1MY1A

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 nm brw)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my1A01
3TCHA 3LSXA 1B9JA 2B3BA 3T66A 1ANFA 1XHYA 3G3FA 1JVYA 2HAVA 4FECA 4POXA 1MXVA 1FQDA 3B6QA 4XKQA 2Q8JA 4MLVA 1KWHA 3OMBA 1JW4A 3H7MA 3TQLA 4GL0A 2E1SA 4U1OA 1NMUA 5KZTA 3QUJA 3USDA 5I2KB 3RPWA 2UYEA 1FQFA 3U94A 1LAGE 3IL1B 4I8CA 1XS5A 4GF8A 4Q8RA 3WAEA 2XXTA 2PBWA 5ELVA 1LCTA 3SEUA 3K00A 3DELB 1MQHA 1AOVA 4OEVA 2HFBA 3M3KA 1OQHA 2F97A 4FORA 5F1QA 2PVUA 1MY4A 4OTEA 4EQ7A 1A99A 1P1QA 5JK4A 3H6VA 3U92A 4GXAA 3PPPA 5ICTA 3C35A 2P2AA 3KJ7A 4OQOA 3PMWA 3O29A 1MXXA 1M5EA 3PUYE 2UVGA 2Q2AA 1FCKA 4DZ1A 1FQAA 3PMXA 1O63A 4Q30B 1Y4TA 4POWA 3UA8A 4R6YA 5ICQA 2OWSA 1DOTA 4EF2A 4FATA 4F31B 5AA1A 4TLLB 2F7AA 1WVJA 1IZ1A 3FXUA 4H8JA 1MDQA 4LQ2A 4YKPA 3FJMA 2X7PA 4HS7A 2I0BA 1MXUA 1O7TA 4E0WA 1IXGA 2V25A 2XX9A 2FYIA 4KQPA 2VOZA 4PP0A 1R1NA 2RCBA 3DM0A 4PFUA 4BDQA 3TMGA 1A40A 4BDNA 2GHAA 2A5SA 4KFQA 4R74A 2ESNA 4FE8A 1OLCA 4DXUA 3N5LA 1SW5A 2OZZA 4XXUA 3MP1A 3S9NC 2XXWA 4F3SA 3SEVA 4Z7EA 3WAFA 4YKIA 4LQ5A 4EQ9A 3LSLA 3OEMA 1JW1A 4F39A 1OVBA 5A5XB 3LSWA 4WKMA 2OJTA 3OSQA 2H5YA 3W15C 4DXBA 3A3UA 2D3IA 3FXRA 4YAHX 2YLNA 4YICA 4ZE9A 1MQDA 1MPDA 1P99A 1YTVA 3HSTA 3P7IA 1PB8A 3TDJA 1MRPA 2O69A 2XXUA 5M2VA 2P0SA 4QSDA 4F1YA 3R26A 5EHMA 3B6WA 3F11A 5AA2D 2Z8FA 1B3GA 4H5FA 3O6GA 1LAFE 1QJMA 1US4A 2DWAA 3LSFB 3PV0E 4ONYA 4ELPA 1CE2A 4ELRA 1XT8A 4WEPA 2ONSA 1Z7NE 2I58A 1N3WA 5H8SA 2XXYA 4HTGA 2IEEA 1MPBA 3KG2A 1JVXA 2RKMA 3MP6A 2F6PA 3Q28A 5L9SA 4G68C 5AA4B 3S4UA 4TOZA 3V83A 3OO7A 3MZBA 1UTHA 2ALUA 3T9XB 5CC2A 1URDA 1BIYA 4IO2A 2V3TA 3VVFA 5JEIA 4I9DA 1QKAA 4F2QA 2PT1A 5DYHA 3IORA 5L9MA 4F3PA 1B05A 4O3AA 5CM6A 3E9XA 3UGWA 4G2ZA 5I2NB 4ESXA 1B1HA 1II5A 3RT6B 1RYOA 3O28A 1JETA 3TODA 3RTWB 1H76A 1SW4A 2O7UA 4OFJA 2O84X 4U4SA 3OO6A 3K1MA 1S7YA 4TLMB 3RTFB 4KYEA 4AB6A 2BJJX 3MC2A 4H5GA 4C1TA 3CSBA 1YPNA 3VLVA 2H4IA 3MZ1A 4R72A 1N04A 3TQWA 2ONRA 2AL4A 4QSCA 5ISUA 1SQYA 4DE8A 4U2RA 4X48A 4JDFA 3IB2A 1N3XA 4NF5B 4XIGQ 2XXIA 3G3IA 2DP8A 3O6IA 5AA4A 2VHAA 2THIA 5CMMA 2QMWA 1B0HA 2Z23A 3PUXE 3PMVA 4KYSA 5I57A 4NMYA 4EXKA 2M8CA 2CZLA 4RA1A 1B3HA 1M5BA 4QFKA 4QHQA 4PQJA 4EQBA 4AQ4A 1ZIUA 2XXHA 2ABHA 2NUVA 4LZ5A 2O51A 1MQIA 1US5A 1JNFA 3TTKA 2ZNTA 5L8DA 4O3BA 1MM6A 4NF8B 4Z0IA 3FVGA 1JEVA 1A54A 3KN3A 1AMFA 4U21A 1MG1A 2VP1A 4R9FA 1DPPA 5IAIA 1N0TA 4FEBA 1RKMA 4ELOA 2I4BA 3GBBA 3M3LA 1Y3PA 1A7LA 1EU8A 2O68A 2XXVA 1QULA 3VLUA 1B5IA 3MQ9A 4G8NA 4DCYA 4OWDA 3E4RA 5CBRA 1EZ9A 2H98A 1LSTA 4WEDA 4U4XA 1B3FA 4ZS9A 1N84A 5CI5A 2ZNUA 4XKRA 4F3BA 4OESA 3PPRA 1FQBA 2R9JA 2ZXTA 3FGSA 3RQTA 3VXBA 3H3GA 3DLNA 1B5JA 4I62A 4NE4A 1Q1KA 2DSFA 2UVHA 3EHUA 1NNTA 2I6EA 2CMOA 2F6GA 1QUKA 2G93A 1LB9A 4ZEIA 3QAXA 2WKYA 4DXCA 3BBRA 4YZZA 3H03A 4F29A 2VD2A 2V93A 4NF8A 5FHMA 3K01A 4ZEDA 1Y3NA 1LFHA 4GIZA 2B65A 4KCCA 3CVGA 1B7ZA 2ONKE 3FJGA 3VDFA 2RC8A 4R2BA 4R6HA 5CBSA 1B7UA 2V3QA 3MWBA 3OSRA 5I59A 4FJPA 1OLAA 3K1PA 3THIA 3IK6B 3SETA 3C4MA 4QSEA 1URSA 5H8FA 4L17A 5EYFA 4NWDA 2OLBA 3DP8A 4RPNA 1D4NA 4MFIA 4DIGA 2PT2A 5I56B 1N7XA 2HZKA 3MAMA 3K6UA 1QUIA 4LVQA 3CFXA 1FQEA 4F19A 3A09A 1LAHE 1M5FA 3ECRA 3IOWA 1ZMGA 3EHSA 3ILUB 2QS2A 3KGCA 1J1NA 2REJA 2Y7RA 3N6UA 3CR9A 1MH3A 3QK6A 1YAEA 3EQ1A 3MVZA 3OO9A 3IJOB 3I6VA 1SBPA 4F1VA 3T93B 1IXIA 4JXIA 3LR1A 4YB5A 1VFDA 3CG3A 4PFWA 2QS4A 3FJ7A 4OZ9A 5K2YA 1B6HA 2ZYNA 5I2KA 1ZJLA 3N94A 3LUYA 1N7WA 1H3DA 1LCFA 4OYVA 3KN8A 3V89B 2Y7IA 3MZ9A 2RINA 3IR1A 4R73A 2PYYA 5DVFA 2Q2CA 1B1XA 1NL5A 3A3CA 2HEUA 2PX1A 4JSOA 1AIVA 3E3KA 3OXNA 1FW0A 3G7WA 3RY3A 4THIA 5I56A 4YMAA 2V3UA 4JB7A 4E0XA 3SEYA 3KSJA 3PU5A 4BDRA 1OIBA 4G68B 3ILTB 1VE4A 1Y3QA 5DTBA 3UK4A 1B5HA 4MLQA 3TFLA 1LFIA 1A8EA 4M4GA 4P0IA 3O9PA 1LAXA 4H67A 2OCUA 1IXCA 1SD3A 2NOOA 2Q9TA 2RF1A 2Y7PA 3HCQA 3S2VA 1TT1A 3W9WA 2DXYA 2X7QA 3TZAA 1VFEA 1LLSA 4GVOA 4NF4B 3QUFA 3PUVE 4DLDA 1MQGA 1B4ZA 1I6AA 3VXCA 5HPQA 3O2AA 4QF9A 4RJZA 4RYAA 4IO3A 1M5CA 2DVCA 1GVCA 5I58B 1ZLQA 2OK2A 3N6TA 4WXJA 4OMBA 3ZS6A 3FD3A 1QUJA 3B6TA 5AE4A 1EZOA 1MH4A 1HSLA 2DWIA 4UA8A 4ELQA 4HW8A 3UN6A 3FXQA 2O1LA 3OD7A 3T9HB 1UQWA 1POY1 1ATGA 4LUBA 2O6AA 1XVXA 1IUDA 3ZSFA 4FAJA 4IGRA 3RLFE 2RC9A 1YCJA 4RNSA 1S9TA 1BLFA 2UXAA 4R9GA 1PBQA 4U23A 4NWCA 5DVIA 3RT8A 4FEDA 3MUQA 2H25A 5CMBA 4ESWA 3K6XA 4OENA 3CI8A 4RXLA 5A5XA 2Y7WA 4RK9A 5AA3A 3D4GA 3OEKA 2I3VA 4H8IA 1LB8A 4BDOA 2XXXA 2DYXA 3KFMA 4NF4A 4FIMA 1ZKBA 3T9UA 2QJEA 2NWJA 2Y84A 3IO4A 3MVYA 3FVNA 3CFLA 4LZ8A 5I58A 2Z8DA 5JTYB 4ZZEA 3FIRA 4OFOA 5L9OA 1MDP1 3JYRA 4OVJA 4OEUA 1R6ZA 1JW5A 3HHFA 4ISUA 3IB0A 4Q5TA 2QS1A 1ZTYA 4RK2A 5DEXB 5CMKA 2QMXA 4BDLA 4G4PA 3I3VA 4C0RA 4U22A 5FHOA 4H6DA 4BLAA 3HPIA 1H44A 1DTZA 4N07A 1MY0A 3VE1B 4IY5A 4BDMA 3DP6A 1LFGA 3FATA 2F35A 4YU0A 2XD3A 2VD3A 1NFTA 5TP9B 3TAJA 4F1UA 2AYSA 3FUZA 4UACA 3DP4A 3TTMA 3UIFA 1B40A 1Y4CA 2Z8EA 4HCWA 4IY6A 5I2NA 2F5XA 4QFLA 5DVJA 3QSLA 2KLFA 1H45A 2RC7A 5J1DA 4MF3A 3TCGA 1Q35A 3CIJA 4PETA 4QFPA 3ODBA 3OOAA 1FQCA 3VFJA 1Y20A 2I3WA 4DCXA 3FV2A 3VLWA 3MPLA 1XVYA 2I49A 2R6GE 2QRYA 2D21A 4QFNA 2DQVA 3Q27A 2UVIA 2HQ0A 4OXVA 5DEXA 1NNKA 2ZYOA 3ZKLA 4ECFA 5TU0A 1SI0A 1AH5A 3PD8A 2DS9A 2GFEA 4G77A 2DXRA 4NF5A 3MP8A 2ZYMA 2E0SA 4QRZA 2XXPA 4XKPA 5TPAB 1MPCA 1NNPA 3C33A 3FASA 1I6QA 2IA4A 2ZNSA 1IXHA 2XXRA 3EHTA 1ZU0A 2F7CA 3ZKKA 2F7BA 2ZYKA 4DDDA 3RUMA 2QS3A 4TQUQ 1TWYA 1B3EA 3IOUA 4G8HA 3FZVA 4H65A 3C36A 1D3KA 1ELJA 3R7XA 1WODA 4KPTA 3RGYA 3L6HA 2DOJA 2YPNA 3BKIB 3AXFA 4PE5B 3KN7A 1ZBMA 4IGTA 1O64A 4NF6B 3EPEA 4XTCQ 4PFTA 2Q89A 3O97A 1B4HA 2NXOA 4ZDMA 1SI1A 1UTBB 1DSNA 1QW0A 3K6WA 3M8UA 1GTKA 3UORA 1Z7ME 5F7VA 4GL8A 3Q29A 3VVEA 1MY2A 3K0VA 3EN3A 2O1MA 5B7DA 3CRBA 2D5WA 3G3GA 2QSXA 3PD9A 1AL3A 4N13A 4IB2A 3C34A 4JSDA 4PFYA 1B7HA 5TPAA 5AA2B 4NTLA 5H8QB 1P1NA 1MQJA 1H43A 4X1BA 1PB7A 3W9VA 3KJTA 3HHGA 1GV8A 1GR2A 1PBPA 3GZGA 1FTJA 1D9VA 3KOSA 1SYIA 3IO6A 1VSOA 2F78A 1LBBA 2O7IA 3Q25A 1A8FA 4ZECA 5LOMA 1NNFA 4GOTA 1LBCA 1Y9UA 4GFRA 4XKNA 3S9EA 4NF6A 1HSEA 3MVWA 2I48A 3CFZA 4EUOA 3TELA 4MBPA 2PMSA 4IO7A 1UTBA 1FTOA 1P1UA 2YJPA 4QFOA 3PPOA 3S9MC 1JEUA 5ITOA 1SDXA 1EZPA 3SKPA 4JWOA 2QL3A 1OMPA 1PC3A 1PEBA 1SYHA 1B51A 4YKJA 1D9YA 3L6GA 2HAUA 4LONB 3T9VA 2Y7KA 3E13X 3FVOA 5AA2A 5IKBA 1URGA 1MS7A 5H8QA 4EDPA 4OHNA 2I4CA 1XC1A 4R6KA 3TCFA 3D4CA 3HN0A 4F3GA 4R75A 4H1XA 3SERA 1NH8A 3GLBA 1IQ7A 3KBRA 4EXLA 5KCJB 1MXZA 1JQFA 1F9BA 3U93A 5FHNA 4GLIA 2DVZA 3G3HA 1EH3A 5I84A 4GRKA 1S50A 3G3KA 2DE4A 3MW0A 4NEDA 2DE2A 3MJNA 3IB1A 2UVJA 2X26A 3HV1A 1UTHB 4F2OA 3C9HA 3QXMA 3LC8A 1P1OA 4KYDA 2XX7A 1NH7A 4HCYA 3TKDA 1IIWA 1TFAA 3U1OA 3MVXA 4IO4A 3H6TA 2GHBA 3SDFA 3BFTA 1MY1A 2GH9A 3K1NA 1UIUA 1NKXA 1B58A 2AIXA 1TXFA 2NVUB 3QIMA 3VV5A 3H4ZA 5FTHA 5BWJA 4R2FA 1MXYA 3GBAA 3K4UA 1XOCA 3OENA 3T96B 1IEJA 5ITPA 4GQOA 3OO8A 2GRVA 3HO7A 3H6UA 2XX8A 1RYXA 1P1WA 1MY3A 1R9QA 2W7YA 1FTKA 4YB7A 4LA9A 4G68A 1B46A 5DT6A 1Y1ZA 5KCJA 4RPOA 4P0GA 4YB6A 5H8HB 3KZGA 5B70A 1BTJA 1B32A 1B2HA 3G3JA 1TFDA 4GWOA 3TYHA 2RCAA 3PUWE 3TTLA 2XD2A 5FTIA 1MM7A 1MXWA 3JZJA 4ND9A 4C1UA 3N26A 4GD5A 4M1VA 5CMCA 3EF7A 3FV1A 2H99A 3IOTA 4OFLA 2G29A 4ZEKA 4IO5A 5I57B 3MBPA 4I1DA 3JV9A 2FA7A 3TPAA 2UYFA 4YKKA 4ZEFA 3PPQA 1WDNA 2XXQA 1BP5A 2V84A 1DTGA 3CG1A 1VR5A 3TTNA 4KR5A 5KDTB 2R71A 4ZE8A 1LGBC 5BUUA 4F18A 5K2XA 2REGA 3U72A 1N76A 1GGGA 3I5OA 4X9TA 3R6UA 2A5TB 3FVKA 4KI0E 3KSXA 4U1ZA 3T22A 1L5TA 1R9LA 3K6VA 1DPEA 3CSGA 1DMBA 3VVDA 1USYH 2B3FA 2ANJA 2ZMBA 3RN8A 1PDAA 5H8NB 3PUZE 2HXWA 3V8XB 3M3FA 1I6BA 3BFUA 5H8HA 1B3LA 3O6HA 3V5AA 4KCDA 1QKBA 3O66A 3SEWA 1OQGA 5HBCA 1A55A 4H0WA 3H6WA 2DWJA 2OWTA 1T0KA 3IX1A 1FTMA 3K2DA 1SW1A 4EF1A 3C31A 3IOVA 2AL5A 2LAOA 3GXAA 4K3FA 1QVSA 2DWHA 2I0CA 3TTRA 3PGFA 2HCAA 1USYE 1PB9A 2QPQA 3KEIA 4RY1A 1FTLA 3IAZA 4G8MA 3ONMA 5JTYA 4KD5A 2P1SA 5KDTA 5EHSA 1CB6A 4JWYA 3U8QA 2DE3A 2Q88A 1Y1MA 3RNNA 3MPKA 4AB5A 4KHZE 3H06B 1SW2A 1B0LA 1SVXB 3K02A 2A5TA 4GXSB 1IITA 3OELA 3UP9A 4LP2B 3IJXB 4Q0CA 3LBSA 1UIVA 4F22A 4YMBA 1I69A 3KOTA 4IO6A 4N6PA 1M5DA 4X1DA 3TEPA 5H8NA 1BKAA 3SEXA 1HSJA 5I59B 2F36A 5TP9A 4P11A 2F34A 2OBGA 5H8FB 4JWXA 4ZZAA 2F8DA 1B52A 3SESA 1POTA 3PPNA 2HZLA 4JBZA 2FNCA 2XHDA 4OERA 3B7DA 4MH5A 3C32A 5CRYA 2Z22A 3TUSA 3S9LC 4O3CA 4LATA 4LZ7A 3Q26A 4ZEBA 2H9BA 5HM4B 1OVTA 2VGQA 4OETA 3QYTA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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