1MY1A

Crystal titration experiments (ampa co-crystals soaked in 10 nm brw)
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords GLUTAMATE RECEPTOR 2
publication title Probing the Function, Conformational Plasticity, and Dimer-Dimer Contacts of the GluR2 Ligand-Binding Core: Studies of 5-Substituted Willardiines and GluR2 S1S2 in the Crystal
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-10-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my1A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1my1A01
2ONKE 2UYFA 2D3IA 4ESWA 5HM4B 5L9MA 2REGA 4R2FA 5H8HA 4U2RA 3GZGA 1YCJA 3SESA 1AIVA 3LUYA 2DP8A 1OVBA 1UQWA 4LATA 2Z8DA 4O3AA 1LFIA 1WVJA 4QSCA 1PDAA 5LOMA 1BTJA 4F29A 1IXCA 3U92A 4PFUA 3RY3A 2VHAA 1MPBA 2P2AA 5H8QA 4Q5TA 4OFOA 1SQYA 3O97A 1B46A 4OMBA 3Q27A 4YZZA 4MF3A 4POWA 2Y7RA 3K0VA 1XVYA 4U21A 1AOVA 4R73A 3TTRA 4I8CA 4EF1A 3B6QA 2NUVA 1M5FA 1MY3A 2VD3A 3VXCA 2Z23A 1UTBB 3W9WA 4IO5A 2F7CA 4NF6A 3TELA 3HCQA 3OO7A 2IEEA 3H4ZA 1XHYA 1OVTA 2RCBA 1LBCA 3THIA 1WDNA 3KZGA 3K6XA 3FVGA 3KN8A 3FJGA 1A8EA 1NH8A 4XIGQ 1B0HA 1N7XA 1MXXA 1AH5A 3TEPA 4G68C 2CZLA 4XKRA 3Q28A 1B05A 2X7QA 3H6TA 2OJTA 1B7HA 2DWHA 2XXIA 1VFDA 5KDTA 4R6HA 5I58A 4RA1A 2FA7A 1R9QA 5AA3A 2W7YA 3TTKA 4QFPA 3TQWA 1TXFA 4EUOA 1UIUA 3LSWA 3ZS6A 5H8FA 4JWXA 1QW0A 4RK2A 4UACA 3QYTA 1IXGA 4JSDA 1M5CA 4NE4A 1B3HA 1GV8A 5BUUA 3R7XA 1URGA 1N0TA 1DOTA 2H25A 5KZTA 2XXHA 1S9TA 2ONRA 3OOAA 3KSXA 4OERA 4HS7A 2UVJA 1VR5A 1QKAA 2I48A 4H5FA 3TCHA 4EXKA 3MVWA 3IJXB 4Z7EA 1N7WA 5AA4A 5I56A 3KOSA 1ZIUA 1B40A 1OQHA 3TPAA 4NF4B 2GH9A 1N3WA 1IIWA 1NFTA 4DDDA 4L17A 3JZJA 1B7UA 5L9SA 2VP1A 3V89B 2UYEA 1MDQA 1OLCA 4OFLA 4TQUQ 3OO6A 3U8QA 3C4MA 5JTYA 1ZBMA 1SW5A 4BDRA 3KFMA 4OTEA 2IA4A 1Y3NA 3K1NA 2Q8JA 4YKPA 4ESXA 5DEXB 1LGBC 1S50A 2Y84A 1FTLA 2I4BA 4HW8A 4I9DA 1MM6A 2A5TB 1FTOA 3ONMA 4H1XA 4G8MA 1BLFA 3IJOB 4IO3A 3VLWA 4YICA 1P1UA 5I84A 4KQPA 4F3BA 1NNTA 4QRZA 2BJJX 1O7TA 2P1SA 4QSEA 2E0SA 3TODA 1FTMA 3FUZA 2HXWA 1ZTYA 3KN3A 1MXVA 3PUYE 4R74A 3ZKKA 3USDA 1MQDA 2O7UA 5TP9A 4FJPA 2XXXA 3P7IA 5K2XA 3HV1A 3E9XA 5FHMA 1BKAA 1B58A 2ZXTA 4OEUA 1Y4TA 2UVIA 1ZKBA 1Z7ME 2PMSA 3RQTA 1FQFA 1P1OA 4H0WA 2Z8FA 2V3UA 4F3SA 4E0WA 1CB6A 4M1VA 4OHNA 3T9VA 2O7IA 2QS1A 1ZMGA 2Y7WA 4IB2A 4ISUA 4OESA 4ZE8A 4RPNA 4JSOA 1B3EA 3TDJA 3FIRA 4YAHX 1URSA 1DPPA 2R71A 3Q29A 2DXRA 1UTHA 4K3FA 1RYOA 2I6EA 3T96B 1MXZA 4DE8A 3OMBA 3JYRA 4P0IA 3PMWA 3B7DA 1A8FA 1GVCA 3FJMA 3U1OA 2ZNSA 3H6VA 3U72A 4E0XA 4ZEBA 3SEUA 3MVZA 4AB6A 1Q1KA 3PPRA 3T22A 4QFNA 3SEYA 4XKPA 2QS2A 1TT1A 4HCYA 4RYAA 4RPOA 3K6UA 2XX9A 2RKMA 3FV1A 1QVSA 3C31A 5ICTA 3D4CA 1Y3PA 4GWOA 3L6GA 1LAXA 2HFBA 4DIGA 2O1MA 4G77A 3SERA 4DCYA 4QHQA 1P1WA 3C9HA 3CFLA 4YB7A 4ZS9A 1A7LA 1SW4A 1Y9UA 3SKPA 3CSBA 1ATGA 2Z8EA 4IO6A 3CIJA 3R26A 4IO4A 3TTLA 3GBBA 3RPWA 1B2HA 5H8NA 3VV5A 1SI0A 4AQ4A 3PPQA 4DXBA 4H8JA 4EQBA 5ICQA 2UVHA 4F19A 2RC9A 1QULA 2H5YA 2Y7KA 1SW2A 3PGFA 2Y7PA 1FTJA 1JVYA 3M8UA 3TZAA 2E1SA 4P11A 1WODA 2F35A 2NVUB 1HSJA 5HBCA 1BIYA 2AIXA 4G2ZA 2O1LA 1UTBA 1LAFE 3RT8A 4GXAA 4R2BA 3LSLA 3EN3A 4OWDA 3IL1B 2YJPA 5I2KA 1LFHA 5EYFA 3IR1A 4OEVA 2RCAA 2DS9A 5B7DA 5ISUA 1XT8A 3M3FA 1ZU0A 1P1NA 2F78A 2XHDA 3OELA 3MZ9A 1LB8A 3C33A 3CG1A 3CRBA 3G3KA 4LQ5A 3ZKLA 4JB7A 2PT1A 4PE5B 3VLVA 1HSLA 3QIMA 4KHZE 4LA9A 2HEUA 4EQ9A 1NNPA 3FXQA 2O6AA 3I3VA 1MS7A 5L8DA 2THIA 1MPDA 2HZLA 4RNSA 1NMUA 4I62A 4H6DA 3MPKA 4JDFA 3OSRA 3V8XB 2DSFA 4FIMA 4GVOA 4WKMA 2D21A 2ALUA 4ZZEA 1B5IA 3OO9A 5M2VA 2XXYA 4YMBA 4ZEDA 2VGQA 1LSTA 3UK4A 2RINA 3B6TA 3E3KA 2QS4A 3M3KA 3FVOA 1O63A 5AA1A 5FHNA 5TPAB 1N04A 2ZMBA 4OVJA 4XXUA 1OIBA 4X48A 4NF4A 1ANFA 2I3VA 2X26A 4U1OA 3PPNA 1POTA 4NWCA 4F18A 3HSTA 4ZEKA 2UVGA 3K6WA 2F36A 5CI5A 1FQEA 1ELJA 4WEPA 4ZECA 3VFJA 3KSJA 4ND9A 1N3XA 3CFZA 4F1VA 2F6GA 3O6IA 1Y4CA 2RF1A 1IITA 1FQAA 3QUJA 5CRYA 3U93A 2I3WA 3KOTA 2DWIA 4NWDA 1I6AA 1XVXA 5DEXA 1H76A 1SDXA 5I57B 4O3CA 4NF8B 2FNCA 4U4XA 2XX7A 3C34A 2ZNTA 3DM0A 4KCDA 4PFTA 5DVFA 2OBGA 4F39A 1NH7A 4NF6B 3R6UA 4GLIA 3TCGA 1PB8A 4FE8A 3TQLA 2ZYOA 3K1MA 3DELB 4MBPA 4NF5B 3W9VA 5KCJB 5FTIA 3KEIA 1FQCA 2XXVA 5AA2B 1SI1A 3N5LA 1I69A 1B7ZA 5I2NA 4QSDA 5TU0A 1SD3A 1US4A 4ECFA 1LCTA 3O29A 4U23A 3QSLA 3QK6A 3T9HB 2HQ0A 5CMBA 4KYEA 4OFJA 1RKMA 4ELPA 3U94A 1SYIA 4YB5A 2A5SA 1EZPA 3F11A 4BDMA 5A5XB 3FD3A 4U1ZA 3RNNA 1RYXA 1ZJLA 1D9VA 4F2QA 4XTCQ 3UA8A 5H8FB 2H9BA 3KG2A 3MBPA 3OENA 2HZKA 3KJTA 3IOTA 2AL5A 4PQJA 1PEBA 5CC2A 2M8CA 2QMXA 4KD5A 3VDFA 3MJNA 4I1DA 2I0CA 3CVGA 3SEVA 3PPOA 2ESNA 3G3IA 4H65A 3OD7A 5CBSA 4WXJA 3MZ1A 1CE2A 4N6PA 1B1HA 3MQ9A 1IEJA 1NNKA 1DTGA 3L6HA 5AA4B 2H98A 2XD3A 3IAZA 3MP6A 2DVCA 4KPTA 1NNFA 1IUDA 4H67A 1SYHA 2D5WA 4FAJA 2YPNA 3WAEA 4WEDA 4OYVA 3LBSA 3W15C 3O6GA 2ZYNA 1IZ1A 2VOZA 1MY1A 3FJ7A 2YLNA 4YB6A 2QJEA 1LFGA 5JTYB 4OZ9A 1FCKA 3GXAA 2OZZA 3S9LC 4LQ2A 1EZOA 2Q2AA 1NL5A 4GRKA 4F3GA 4OXVA 3RN8A 4F22A 4OENA 2OWTA 2V25A 1YAEA 5ITPA 3S2VA 4NEDA 4G68B 3OEKA 1IXHA 3FZVA 3ZSFA 4R75A 3RTFB 4PETA 2HAUA 2G93A 1A54A 1PB9A 1OLAA 2FYIA 2NOOA 5HPQA 3G7WA 3C35A 1BP5A 4DCXA 5K2YA 3RUMA 4FEDA 1B3GA 3MPLA 3PMVA 1PB7A 1MQHA 1H45A 3O2AA 2DYXA 3FXUA 2PYYA 4X9TA 4C1UA 1B9JA 2HCAA 4GXSB 2B65A 3N94A 2OLBA 1DPEA 4TOZA 1D4NA 2XD2A 2ZYKA 1PBPA 1MM7A 1MDP1 3O28A 2R9JA 1XS5A 2QMWA 1USYH 3PMXA 5EHMA 3GBAA 3MP1A 1QUKA 1XOCA 2KLFA 2V3TA 3T9XB 4JWOA 1LCFA 1S7YA 1LLSA 3CI8A 2G29A 2F6PA 4QF9A 4GQOA 4R9FA 4YKKA 2I49A 5CBRA 2DQVA 1P99A 3K2DA 4IY5A 3MVXA 4N07A 3PUXE 3RT6B 4O3BA 4F3PA 3G3JA 5ELVA 3PD8A 4YMAA 1AMFA 4GF8A 3H06B 3ECRA 4QFKA 5CMCA 4RK9A 1OQGA 2WKYA 4R6YA 1JNFA 3UP9A 4IGTA 2V3QA 4ZEFA 1LAGE 4P0GA 1R1NA 2XXWA 1H43A 2Q2CA 1US5A 1R9LA 4THIA 3BBRA 1ZLQA 2H99A 2O69A 3PUWE 4R72A 3EHTA 1JVXA 1JEVA 1MY2A 2DE4A 3C36A 3CFXA 3S9MC 1MG1A 2F97A 4GD5A 3VLUA 5AA2D 2DVZA 4IY6A 1URDA 4DZ1A 3TCFA 4BLAA 3K6VA 2Q9TA 1M5DA 3HHFA 2ONSA 4TLMB 3M3LA 5B70A 1Q35A 3CSGA 3I5OA 3BFUA 1F9BA 3K01A 1MH3A 3E13X 3JV9A 2GHAA 2XXRA 2O84X 3KBRA 2OCUA 5H8NB 3MW0A 4KI0E 4JXIA 4IGRA 1MY0A 3EQ1A 3VVEA 5DYHA 1LAHE 5I57A 2ZNUA 1JW5A 1YTVA 4NF8A 2RC7A 3N26A 3UN6A 1D9YA 3IOVA 2DWJA 3FXRA 3EHSA 4KYSA 4FEBA 1JW1A 3DP4A 3TYHA 4AB5A 1EH3A 1A40A 3RGYA 5I59B 5CMKA 4GL0A 3FVKA 1UIVA 4PP0A 5KCJA 4NF5A 4MH5A 3K1PA 5I2KB 1I6BA 5JEIA 5BWJA 5FHOA 4X1DA 1B4HA 3B6WA 5AA2A 4QFLA 3ILTB 1A99A 3QAXA 3Q26A 2QS3A 1M5BA 4RY1A 4PFWA 2ANJA 5DT6A 1J1NA 1LB9A 3LC8A 4OQOA 5H8HB 4JWYA 4GL8A 3LSFB 1KWHA 2QL3A 1B1XA 3BKIB 3FVNA 3PPPA 3SEXA 4HTGA 3MZBA 3H7MA 2Z22A 1SW1A 4RJZA 5H8QB 1IQ7A 1B3LA 5A5XA 3ILUB 1VE4A 3TMGA 4EF2A 3VVDA 3VXBA 2LAOA 2Y7IA 1MQJA 2A5TA 4LVQA 3TFLA 1DSNA 3N6UA 3T9UA 2Q89A 5J1DA 3IOUA 1SVXB 3VVFA 4QFOA 4KR5A 1MQGA 4G8HA 1MXYA 1QJMA 1M5EA 3KJ7A 3FATA 1IXIA 3A09A 1B32A 4U22A 4Q8RA 5FTHA 1B0LA 2H4IA 4JBZA 4C1TA 3N6TA 4FORA 2GFEA 4ONYA 3VE1B 2ZYMA 3QXMA 1XC1A 2GRVA 3T93B 2XXQA 3KGCA 4NTLA 1VSOA 2AYSA 2QRYA 1MXWA 5H8SA 2DE2A 4U4SA 2F8DA 1MQIA 1TFDA 1USYE 1OMPA 3SDFA 5KDTB 4YKIA 4KFQA 3K4UA 1MXUA 5I58B 4Q30B 1Y3QA 3DLNA 5F1QA 4LONB 1FQBA 4F2OA 3IORA 4Z0IA 4HCWA 3S4UA 5EHSA 1T0KA 4LUBA 2NXOA 4IO2A 4BDOA 1B5HA 3TAJA 2CMOA 4H5GA 1H3DA 1I6QA 1GTKA 3UORA 3E4RA 1O64A 1JETA 2HAVA 4GOTA 3IO6A 3G3GA 1B4ZA 4M4GA 3IB1A 4Q0CA 1II5A 2OWSA 4BDNA 4ELQA 3LSXA 4G68A 1N84A 4MLQA 2NWJA 1D3KA 3H03A 2O51A 2PX1A 4F31B 4ZE9A 3OXNA 5I56B 4G8NA 3TUSA 5ITOA 5L9OA 4MFIA 4ZDMA 4G4PA 1QKBA 2GHBA 4KCCA 3MC2A 3D4GA 3S9EA 4N13A 4EDPA 5I2NB 3G3FA 1PBQA 3MUQA 5CMMA 4FATA 3HPIA 5IAIA 1MY4A 2DWAA 4ZEIA 4MLVA 3PUVE 1Y20A 3EHUA 4KYDA 3V5AA 1B3FA 1L5TA 3K02A 1JW4A 1A55A 1N76A 5F7VA 4F1YA 3AXFA 4GFRA 3A3CA 3G3HA 4DXCA 1POY1 2I0BA 2I4CA 1JEUA 1FW0A 1MRPA 3O6HA 3QUFA 1JQFA 3OSQA 3IK6B 1B51A 2XXPA 2PBWA 2XXUA 1TWYA 3PD9A 5JK4A 4F1UA 5AE4A 4UA8A 2F34A 2REJA 3KN7A 1B52A 2XX8A 3TTNA 3OO8A 4NMYA 1QUIA 4OETA 3HN0A 5CM6A 4RXLA 4X1BA 3SETA 2O68A 4LZ8A 2R6GE 1TFAA 1FTKA 2PT2A 5TP9B 3TKDA 3MWBA 1VFEA 4BDQA 1P1QA 4YKJA 3PV0E 2VD2A 2F7AA 3FGSA 4LZ7A 3RLFE 4GIZA 1MH4A 1DMBA 2B3FA 4ELRA 4XKQA 3S9NC 3H6UA 4DLDA 1SBPA 3CG3A 4YU0A 2B3BA 1EZ9A 5DVJA 1Y1ZA 4C0RA 1GGGA 1DTZA 3MVYA 5IKBA 1HSEA 2DE3A 4ELOA 4EXLA 4BDLA 3DP6A 1PC3A 4LZ5A 1H44A 3GLBA 2V93A 3LR1A 4DXUA 3A3UA 1NKXA 3RTWB 3I6VA 3OEMA 1Y1MA 3FV2A 1MPCA 2QSXA 3PU5A 4IO7A 2V84A 3Q25A 4FECA 3DP8A 3ODBA 3BFTA 1UTHB 1FQDA 2I58A 3MAMA 3IO4A 3IX1A 3HO7A 2DXYA 3IB2A 2RC8A 3IB0A 4PFYA 2DOJA 4R6KA 3K00A 3EPEA 2PVUA 2OK2A 1B5JA 5DTBA 2F5XA 5DVIA 3HHGA 3T66A 2P0SA 1EU8A 2X7PA 4H8IA 3PUZE 4EQ7A 3O66A 5I59A 1YPNA 3O9PA 3IOWA 1R6ZA 3FASA 4R9GA 1LBBA 5TPAA 1B6HA 3UGWA 3V83A 3MP8A 3SEWA 2QPQA 1Z7NE 1GR2A 3TTMA 4ZZAA 3CR9A 3H3GA 2AL4A 3H6WA 3EF7A 4XKNA 3UIFA 2XXTA 4TLLB 1QUJA 2ABHA 2Q88A 2F7BA 1AL3A 3WAFA 4LP2B 4POXA 2UXAA 3C32A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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