1N4FA

Para-arsanilate derivative of hen egg-white lysozyme
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Phasing power at the K absorption edge of organic arsenic.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 44
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2002-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1n4fA00
1AM7A 1RE2A 3TXBA 1B5WA 4HSFA 5E4PA 6LYTA 1LSZA 1UIGA 5C6IA 4D9ZA 1LSYA 4LYZA 4W94A 4DD2A 1KXWA 4GN5C 4ZIXA 135LA 1JTPL 3CT0A 1D0LA 5A3EA 1IWVA 4NGKA 3WUAA 2MEAA 2WARA 4HJZA 4N0JA 4XENA 2DQFC 2EIZC 2BQDA 1CKFA 3AZ7A 1FKVA 3W6BA 3LYTA 4MR1A 2BQAA 2XBRA 2DQGY 2PC2A 3J6KA 1LTMA 7LYZA 5M1YA 3RZ4A 4GN3A 4H8ZA 3W6EA 1PS5A 1C43A 2BQCA 3N9AA 2YDGA 1DI4A 5I4WA 3MGWA 4NGLA 1XGQC 1GDWA 4Z3MA 1REYA 1LZ5A 3P4ZA 4UWNA 1LSMA 3A3QA 3B72A 1GE0A 2BAAA 3T36A 4HV1A 2AUBA 3WMKA 4H9IA 5FHWA 2BQEA 1DI5A 3B0KA 1JJ1A 1OUJA 2H5ZA 1EQ4A 1AKIA 1JJ0A 1NQIA 2YBJA 3TXIA 4AXTA 3WU7A 4H9FA 4II8A 1LMAA 4GCCA 1G7JC 5LAGA 1B7MA 1T3PA 1LMQA 1UA6Y 3GXRA 3WH1A 1IIZA 3WL2A 3CB7A 2HEFA 1PZYA 1OUHA 3B6LA 4PGJB 2I26L 5B59A 1RFPA 3B0OA 5FEKA 1BB5A 1LOZA 1B7SA 1GXV2 2BQNA 1B0DA 1RCMA 3QNGA 5KKIA 2F4GA 1GFJA 2HEAA 5APEA 1GPQC 1B9OA 5KXPA 1G7HC 1C7PA 3AW7A 1LMOA 5I4XA 3EBAB 1QTEA 3RT5X 1GAZA 2YBLA 5L9JA 1QDRA 4WM5A 1GE4A 4XJHA 1JJ3A 1NDGC 208LA 1IP5A 3WXTA 2CGIA 4NGWA 3ATNA 4NGIA 3FI7A 1C45A 4PRUA 4G4HA 1REMA 3TXHA 4RDSA 1LSPA 5FELA 1GB2A 2I25L 4GLVA 4WG1A 4E3UA 2Z37A 1YKYX 2HUBA 1CKDA 1V7SA 2EKSC 4WM3A 4DDAA 5K7OA 3A95A 6LYZA 1LHIA 1HMLA 4CGEA 1LJIA 4QY9A 2G4QA 1I1ZA 1HEQA 2W1MA 2BQLA 3FE0A 1B2KA 1GF3A 4I0CA 4XJIA 5JENB 4J1BA 3AGGG 1JHLA 1OUDA 4WL7A 3F6ZA 1GFVA 1KIPC 1HEMA 1HFYA 4HTKA 4YENA 4WLXA 5APCA 4RLMA 5F9XA 4TWSA 4C5FA 153LA 1FLQA 5C6JA 5LYTA 2FYDA 3TXDA 3AZ4A 1GFRA 1QSAA 2BQIA 4HPEA 1G7MC 1D0KA 4GCBA 1FLUA 2F2NA 1YQVY 3A3RX 4XN6A 5ILCA 1ZVYB 4RW1A 4KXIA 1VAUA 2ZWBA 4TUNA 5KXOA 1LZ4A 1BGIA 4LT3A 3AGHA 5B07A 3WW5A 1AZFA 5KJ9A 4OWBA 4A7DA 2DQHY 3TXFA 1W6ZA 4IASA 3P66A 1QUSA 4N5RA 4WM4A 5DLAA 5L3IA 5F14A 1JKAA 1SQ2L 5DN5A 2BQOA 1GF6A 1JTTL 9LYZA 1XEKA 2BQBA 1IP3A 3LZ2A 4J1AA 4HP0A 4WL6A 1LYOA 2BQFA 5FSTA 1BHZA 1FN5A 4NG8A 2EQLA 1OUEA 1WVVA 1IC5Y 4C3WA 5T3FA 2W1XA 1B5XA 3M18B 4PPOA 4NEBA 1DPWA 1N4FA 3W3EA 2YBHA 1JWRA 1F6RA 1LJKA 4Z98A 1GFUA 1IR7A 1UBZA 5J7CA 5KXKA 3TMWA 1LYZA 4CHXA 5LVHA 2XJWA 5B1GA 1ZV5L 4R0FA 4NHQA 3N9EA 1JKDA 1GBWA 1LSDA 1QIOA 1GFKA 3T6UA 4H9AA 1HEWA 1LSNA 5LA8A 2Z2EA 1XGTC 3A6CY 1LZRA 1ZMYL 3HFMY 4B1AA 5ILFA 1GFTA 2D6BA 1OUIA 4IJ4A 4LT0A 3WUMA 4M4OA 1IOQA 134LA 1WQMA 2DQAA 1LHHA 2HEBA 1LMCA 2I6ZA 4H90A 4X3BA 5I5QA 4HV2A 1LSAA 4LYBA 4H9EA 2BQMA 1LHJA 1KIRC 1GFGA 4H9BA 1GAYA 5LYMA 1GF5A 2HU1A 3M3UA 4FDYA 5KXWA 4OOOA 193LA 1LMTA 1J1XY 1JISA 1CJ7A 1TDYA 2FBDA 2LHMA 4G4CA 4N1EI 4YM8A 1IR8A 4ETDA 1B5UA 2Z2FA 1B7RA 4G4BA 4I8SA 3TMXA 1GEVA 2H9JA 1YANA 1HEPA 2ZILA 3RW8A 1JKCA 3A6BY 4KPMA 3W6DA 4NIJA 4DWXA 4NWHA 5EBHA 2ZYPA 1LZYA 4Z41A 207LA 1IX0A 1FLYA 2LZ2A 1LZ1A 1BVXA 1GDXA 1BWHA 1GB0A 1HFXA 1VDSA 133LA 2DQDY 2LYZA 3AZ5A 1OUFA 1HF4A 1IOCA 4DD1A 1LZGA 4OW1A 1TEWA 1Z55A 4LT2A 4TSCA 4DDBA 4DD0A 1LJ3A 154LA 1I20A 1WQNA 3HBDA 4LYTA 3EO5A 5KKJA 2ZYCA 1GB7A 1JTOL 4H8YA 5DN4A 3ZVQA 5HLLA 1VDTA 2ZNXY 4ETAA 1LKRA 1LZSA 4NGOA 4PHIA 2F30A 5LXWA 2VB1A 5KXLA 5LA5A 1GF0A 2DQEY 1MLCE 1LSGA 1CJ6A 5KXZA 4CJ2A 2MEIA 1FLWA 2Y8PA 4NGYA 1P2CC 1WVUA 1I56A 4OWHA 4HTNA 1VDPA 4XJDA 1GF7A 5F9UA 4H94A 2Z39A 3CT5A 4H91A 5LYZA 1F0WA 4GCDA 1WQRA 2A7DA 4WO9A 5D5FA 3IJUA 4ML7A 4L41A 1HFZA 3TMUA 5DL9A 2YSSC 5LVGA 3J4GA 1UUZC 3ATOA 3LYOA 2H9KA 2C8PA 3CT1A 4XYYA 1YAQA 4B4EA 1LJHA 1G7LC 1VFBC 2LYMA 2MEGA 1VATA 4J7VA 2XTHA 1XFPL 4QEQA 5LINA 1OP9B 1LHLA 1QSWA 5FCPA 1GB3A 3IJVA 5KXXA 1B5VA 3G3BB 1LJNA 1OQMA 4LT1A 1D0MA 1WQOA 3P65A 5II3A 2HU3A 1B7PA 3EXDA 1UICA 3ZVQB 1D9UA 1B7QA 1A2YC 1YL0X 4AGAA 1LAAA 4WOAA 5KXYA 1YILA 1FBIX 1CKGA 1HSWA 4ZEEA 1TAYA 2D4IA 3AJNA 4H92A 4YOPA 1D6PA 1GBXA 1GD6A 2BQHA 2HECA 2MECA 2YBNA 3N9CA 4WLYA 5LAFA 5LVJA 1HEOA 2YVBA 2Z38A 5FDJA 1IWZA 2ZNWY 1ALCA 4CFOA 1INUA 1E8LA 3LHMA 4WMGA 5KXNA 4LYMA 2DQJY 1AT6A 1IOTA 1LPIA 3LYZA 4TTDA 1HC0A 4NSIA 4BAPA 4NHSA 1D6QA 4N9RA 1H87A 4H1PA 4WM6A 1DQJC 1GF8A 2IHLA 2Q0MX 1LZNA 1IORA 3LYMA 4J0LA 4UWVA 1LJJA 3KAMA 4YF2A 5KXMA 1LZAA 1QUTA 4XJFA 2GV0A 4NFVA 2MEBA 4GLAA 3VWOA 1GBYA 3LZTA 3HBEX 2A7FA 1IP4A 4H93A 4HPIA 1DPXA 1J1PY 4RLNA 1IEEA 5B05A 2LZTA 1F10A 3WPKA 4WLDA 5KXTA 3RU5A 1WQQA 1GXXA 4NHIA 3WPLA 1KXXA 4P2EA 3WYHA 4B4JA 4WLTA 4ETCA 5AMYA 1OUAA 1BB3A 1IP1A 4LZTA 5F81A 5L3HA 5IHGA 4WM2A 1LHKA 4R6CA 1O23A 1IO5A 2FBBA 1LSEA 4BADA 1JSFA 1UC0A 1REXA 4DT3A 3WW6A 2D91A 3WU8A 1IWYA 1QQYA 1J1OY 1HHLA 1LJEA 1YL1X 2X0AA 2YBIA 1LZ8A 4MSTA 3A8ZA 4NGZA 4UWUA 3D3DA 5LVIA 4ETBA 1LCNA 2CJLA 3WVXA 1EL1A 1C08C 4WG7A 1ZVHL 4H8XA 3A91A 5IDDA 1LMPA 1NMMA 1NF5A 3SP3A 1WQPA 2HEDA 1BWIA 1LMNA 1GWDA 1HNLA 4NHPA 4YEMA 2D4JA 1CJ9A 1IC4Y 1UIBA 1XEJA 4FJRA 4DD9A 2Z19A 4W96A 3WULA 1LJ4A 4LFPA 4TSBA 4H9HA 4OOTA 1GBSA 2MEEA 1A4VA 1C10A 2RSCA 4RW2A 1QDTA 2D4KA 1GFEA 3GXKA 3TMVA 2YBMA 3CSRA 3A92A 2NWDX 5HNCA 5IELA 1GB8A 1GB6A 1YKZX 3TXEA 2W1YA 1DI3A 5A3ZA 1BWJA 4QDNA 4NGVA 3WPJA 2W1LA 1XGPC 1NDMC 1B7LA 1UIHA 4HJYA 1B5ZA 4IATA 3WVYA 1LZCA 1JUGA 4B0DA 4ETEA 4B4IA 4KT3A 5KXSA 2DQCY 4QGZA 3A34A 1HELA 1GBZA 1DZBX 1WTMA 3HBHA 4NSJA 4BAFA 1IP2A 5B06A 4U3XB 1IWXA 4G49A 3WU9A 1YROA 1IR9A 2C8OA 4Z46A 1DKJA 1GF9A 2DQIY 1CJ8A 2LYOA 3A67Y 4LYCA 2ZIJA 2B5ZA 3P68A 4NSGA 1H6MA 4XJBA 3TXJA 3W6AA 5C6LA 5I54A 5HMVA 1IOSA 1B7OA 1IY4A 1LSCA 1CKCA 1LSBA 3P64A 4LGKA 4DD7A 2MEFA 4TX7A 4ET8A 1NBZC 4GN4A 2N5ZA 4DC4A 1JEFA 4EMNA 1DXJA 1EQEA 4MCKA 132LA 1UIAA 1MELL 3A93A 1LZDA 4ZFPA 1GB5A 3ULRA 1JSEA 1YKXX 2G4PA 1IY3A 3CSQA 4H9CA 2CDSA 1HSXA 1IC7Y 1V7TA 1IVMA 1KIQC 1NBYC 1NHEA 1FKQA 3OK0A 1JIYA 5KY1A 1XGRC 4LFXA 5B1FA 1JKBA 1SLYA 1NKHA 3W6FA 1XEIA 1GFHA 1LZBA 2HEEA 1QTKA 1LKSA 3A94A 1TBYA 2CWIA 1GE2A 1LJGA 2ZQ4A 2MEHA 3K3TA 1B7NA 1BB7A 3QE8A 1LZ9A 1UIFA 2MEDA 3QY4A 4NWEA 4HTQA 1HMKA 4XJGA 1RI8B 3CSZA 2EPEA 3BKHA 1B5YA 1FDLY 1YAPA 3WUNA 3RNXA 1IWTA 3G3AB 1G7IC 1GEZA 4OWAA 2DKVA 1OUBA 3BKVA 4PRQA 1YIKA 4XADA 4PJ2C 1REZA 4WM1A 4M6DA 3B0IA 4GCEA 194LA 2BLXA 3OJPA 3LN2A 4GCFA 1AT5A 4O34A 1UIDA 1C46A 1YAOA 2XBSA 2BQKA 1CNSA 2G4NA 4NSHA 1LZEA 1LHMA 4N1CC 1GF4A 1LSFA 5APFA 2ZIKA 4YEOA 1IP6A 1IP7A 1UCOA 2FYCA 5E9RA 1JITA 3A90A 1GBOA 3EMSA 5F16A 5LIOA 4ANRA 1XSFA 4B49A 3IWRA 1BB6A 4NY5A 1W08A 3AB6A 4EOFA 1GFAA 4OWEA 5HQ1A 1JPOA 1LJFA 3AGIA 3E3DA 1UIEA 2Z12A 4G9SA 5APDA 4BS7A 8LYZA 4WO6A 1LYYA 1OUCA 1T6VL 1WTNA 3AW6A 4DYGA 2DBTA 3ZEKA 1YAMA 3CQLA 1XGUC 1CKHA 1GE3A 1DKKA 5D5CA 3TXGA 2BPUA 1VEDA 4OWCA 1OUGA 5LVKA 1GB9A 1LZTA 4ET9A 4N8ZA 3TXKA 5DM9A 5HNLA 1NWGA 4DDCA 4NG1A 1HENA 3WXUA 4CFPA 1VDQA 1IWWA 1RJCB 1KXYA 4NHTA 2Z18A 5I4YA 1BB4A 4LYOA 4HJVA 3W6CA 4DD3A 1GE1A 5KXRA 2BLYA 5HMJA 1UACY 2IFFY 1EQ5A 2BQJA 2ZQ3A 1BQLY 1GHLA 5I53A 3D9AC 1F6SA 4KL7A 3AZ6A 2BQGA 4NGJA 3A96A 1HERA 1LZ6A 2F4AA 1BVKC 1TCYA 3AYQA 1IWUA 1LYSA 2HTXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L64A 3TXBA 4D9ZA 1LSYA 4DD2A 135LA 1ZYTA 3CT0A 1D0LA 4K5YA 4NGKA 3WUAA 2WARA 2IGCA 158LA 2BQDA 2XBRA 2DQGY 2PC2A 3HT7A 4GN3A 1PS5A 2BQCA 5I4WA 3MGWA 1LZ5A 1LSMA 3A3QA 1ZURA 3B72A 1C6TA 3T36A 1DI5A 114LA 168LA 1JJ1A 2H5ZA 1JJ0A 4II8A 5LAGA 1G7JC 4LDLA 3WH1A 1L58A 200LA 4EKPA 1G0PA 4W57A 1L68A 5KXPA 1B9OA 3EBAB 1QTEA 1GAZA 5L9JA 1JQUA 2CGIA 1L53A 4NGIA 6LZMA 1C45A 4PRUA 1L25A 2RBSA 2HULA 4ARQA 4GLVA 112LA 4E3UA 1QUOA 1V7SA 3A95A 2W1MA 3FE0A 4I0CA 1GF3A 4WL7A 3AGGG 3JR6A 2B75A 1C69A 153LA 1FLQA 1L99A 3HWLA 5LYTA 220LA 2BQIA 1D0KA 3C7ZA 1YQVY 4TUNA 142LA 5B07A 3AGHA 3WW5A 1AZFA 4OWBA 2DQHY 1W6ZA 4N5RA 5L3IA 257LA 1JKAA 1DYGA 3F8VA 3SBBC 1C6KA 2OTZX 2B6TA 1LYOA 249LA 5FSTA 1BHZA 1FN5A 2EQLA 1WVVA 1IC5Y 199LA 1N4FA 143LA 4Z98A 152LA 2XJWA 5B1GA 4R0FA 1JKDA 1C6GA 1L72A 259LA 1QIOA 7LZMA 5LA8A 2Z2EA 1LZRA 1QS9A 2D6BA 1OUIA 3OE9A 2RAZX 2HEBA 1QUDA 4LYBA 4W52A 1GAYA 1L36A 175LA 2OE4X 3HUKA 3SB9A 1J1XY 2LHMA 4ETDA 2Z2FA 1GEVA 2LCBA 4KPMA 4NIJA 4DWXA 1QTBA 239LA 5EBHA 207LA 1IX0A 3SB8A 1HFXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1AM7 A;  1RE2 A;  3TXB A;  1B5W A;  4HSF A;  5E4P A;  6LYT A;  1LSZ A;  1UIG A;  5C6I A;  4D9Z A;  1LSY A;  4LYZ A;  4W94 A;  4DD2 A;  1KXW A;  4GN5 C;  4ZIX A;  135L A;  1JTP L;  3CT0 A;  1D0L A;  5A3E A;  1IWV A;  4NGK A;  3WUA A;  2MEA A;  2WAR A;  4HJZ A;  4N0J A;  4XEN A;  2DQF C;  2EIZ C;  2BQD A;  1CKF A;  3AZ7 A;  1FKV A;  3W6B A;  3LYT A;  4MR1 A;  2BQA A;  2XBR A;  2DQG Y;  2PC2 A;  3J6K A;  1LTM A;  7LYZ A;  5M1Y A;  3RZ4 A;  4GN3 A;  4H8Z A;  3W6E A;  1PS5 A;  1C43 A;  2BQC A;  3N9A A;  2YDG A;  1DI4 A;  5I4W A;  3MGW A;  4NGL A;  1XGQ C;  1GDW A;  4Z3M A;  1REY A;  1LZ5 A;  3P4Z A;  4UWN A;  1LSM A;  3A3Q A;  3B72 A;  1GE0 A;  2BAA A;  3T36 A;  4HV1 A;  2AUB A;  3WMK A;  4H9I A;  5FHW A;  2BQE A;  1DI5 A;  3B0K A;  1JJ1 A;  1OUJ A;  2H5Z A;  1EQ4 A;  1AKI A;  1JJ0 A;  1NQI A;  2YBJ A;  3TXI A;  4AXT A;  3WU7 A;  4H9F A;  4II8 A;  1LMA A;  4GCC A;  1G7J C;  5LAG A;  1B7M A;  1T3P A;  1LMQ A;  1UA6 Y;  3GXR A;  3WH1 A;  1IIZ A;  3WL2 A;  3CB7 A;  2HEF A;  1PZY A;  1OUH A;  3B6L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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