1NGCA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFSVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 126
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngcA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngcA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngcA04
3BP8A 2YHYA 1K8KB 2F9WA 3FZKA 4BRMA 2E1ZA 4BG9A 1MA9B 3G25A 3M3ZA 4BC2A 5AQKA 2ASMA 3D7EO 4BR0A 2NZTA 3VEYA 5E26A 2Q2RA 4BGBA 3CHWA 4BR7A 3FLCO 4CI6A 4BR5A 2QWQA 5B8HA 5AQIA 3CJBA 3H6EA 5KPTA 3VOVA 2OANA 3DJCA 3IUCA 1SAZA 4BR9A 2FSKA 2IVPA 2YI1A 5JICA 2HF4A 3MMVA 1GLJO 3LL3A 5AQRA 2YJEA 2HMPA 1KAYA 3IDHA 4BVPA 3VETA 1LCUA 3CETA 4EIAA 3HBTA 1GLBG 2P9LB 3WEEA 5FPMA 1NGJA 1NLVA 4BRPA 4WQ4A 4EAHD 3UKUB 3UB5A 4LC9B 3ULEB 3DXKA 3EKUA 4BR4A 3W3DA 4FWOA 1H1VA 3WXJA 4MO4A 3MN5A 3O80A 3GBTA 2YHWA 3L6QA 2J4RA 4XH4A 2UYTA 3LM2A 3C7NB 3CJ7A 3O6WA 1XC3A 5TKYA 3ZX3A 1DGKN 4H5WA 3H1QA 4F9OA 3U8XA 2D4WA 2GELA 4BC3A 5EX5A 3EL2A 3J8AA 1RFQA 1ATNA 4IJNA 4YDUA 3VGMA 2AP1A 2ZGZA 3GG4A 1IJJA 3MN9A 1GLAG 4H0PA 1QZ5A 3EZWA 2E1YA 3EN9A 2GWJA 2P9LA 1NGFA 5EXWA 4XH1A 2QWMA 3H1VX 1ESVA 5AQJA 5AQFA 3M1FA 2QWRA 5AQPA 5AQUA 2P9NA 3UKUA 4CJ7A 3ULEA 3GDQA 2BUPA 4PKIA 1R59O 4FWSA 3H3NO 3QB0A 2ASPA 3VESA 5AQVA 1OKJA 4B1WB 3D2FB 1QQMA 1T6CA 2Q31A 3VF6A 3MDQA 1BOTO 2QWPA 1V4SA 3C7NA 3ZX0A 3B8AX 2NRHA 2D1KA 4C23A 1BO5O 4FWRA 4AM7A 5BRHA 1BWFO 3ENOA 3KHYA 4FOEA 3A5OC 5LJWA 4FL9A 3SK3A 3H45C 3LDOA 5F1XA 1E4FT 4JNEA 2FF6A 3FFKB 4FWMA 4IJAA 1HKCA 3H46O 4O5FA 2CGLA 5FPNA 2P9PB 3A5LC 3MN6A 5AQQA 2P9SB 2IVOA 3CJ9A 4MLHA 2V52B 2I7PA 3ATUA 4FPAA 1QHAA 1C0FA 3ATVA 4XH5A 3S41A 3R9PA 3JXUA 1V4TA 2GEMA 4CZKA 5AQHA 2A40A 1MWKA 1S3XA 3O4WA 3R8EA 3F9MA 1HPMA 4B1XB 1XUPO 1NGCA 1KAXA 3D2FA 1ATRA 1NGIA 5AFUA 3LDLA 4DB3A 5AQWA 3FE1A 2KHOA 1MDUB 4BRCA 4NB4A 5JMVA 4FWNA 3RSEB 3ZEUB 4HWIA 1TUUA 5JLHA 3QFPA 5E84A 3LDNA 4H5TA 2F9TA 1GLEG 2D0PA 2Q97A 2QWNA 4CZMA 5F0XA 1BU6O 3HM8A 2VCPA 1NBWA 3EO3A 1S22A 2Q0UA 4BVOA 3D2EB 2P9PA 4XEIA 3SLCA 2P9SA 3SMPA 4PL8A 3U4LA 3VENA 4WQ5A 5BN9A 2YJFA 3I8BA 4H0TB 3WUHA 2P9KB 1NWKA 4BROA 1BA1A 4BREA 1K8KA 4HTLA 4ISEA 4A2AA 2FXUA 1QQOA 2Q1NA 3MN7A 1BA0A 1Y64A 5KQ8A 1BUPA 3WQUA 4BRKA 3ZX2A 1NGHA 5AQOA 4CZIA 1MWMA 4NO7A 1YUWA 5AQZA 2PAVA 4JD2B 1YXQA 4WQ4C 3VEXA 4FOIA 2FSNA 1D4XA 4QS8A 4B1YB 2ASOA 3GOIA 2QXLA 3FZLA 4H0OA 3ZETB 4WQ5C 3RSEA 2AA4A 2I7NA 1QZ6A 3ZEUA 3FZMA 1YAGA 1KXPA 4BC4A 1GLLO 3BF3A 5EY4A 1HUXA 3CIPA 2FF3B 3VGLA 1TYQB 1GLDG 3WXKA 5ELZA 3UE5A 2QWOA 3QDKA 2GTDA 4K41A 3FZFA 3BEXA 4CZGA 3VF2A 4MLEA 3HTVA 4BRGA 2QW9A 5ADXA 4PKHA 4CZEA 5BR9A 1LOTB 2P9KA 4RTFD 4BRAA 4BR2A 1C0GA 3VEOA 1DKGD 3LDPA 4YDUC 3CERA 3UKRB 4JHDB 4H5VA 3WT0A 3VEVA 2V51B 5AR0A 3FZHA 4FPBA 4I6MB 4M63C 1NGEA 3TPQA 3KZBA 2IIRA 3SMSA 5BREA 1DEJA 4B1VA 5BPMA 1P8ZA 4A62A 3O08A 1T6DA 3A0IX 4BRHA 1KAZA 4JD2A 3CQXA 4H0XB 1Q18A 2A42A 3VF4A 4RWTA 4CD1A 5KPRA 1TUYA 4JAXA 3ZETA 5AQLA 1X3MA 2E8AA 1E4GT 4M7XA 3TU5A 4PKGA 3HZ6A 2QM1A 4DQ8A 4GY2B 4H5RA 2P9IB 3IFRA 1G99A 5EVZA 3QBWA 5BPNA 1TYQA 4FWLA 1NMDA 2CGJA 3MK6A 5EOYA 4QS9A 2FSJA 3CI5A 3L4IA 1GLFO 4MO5A 5BRFA 1ATSA 3I33A 4BQZA 2CH6A 2VWBA 3HI0A 4CBXA 4BGAA 4J8FA 3UKRA 3VGKA 1ZC6A 4B9QA 1XQSC 3C0BA 4JHDA 1BG3A 3AAPA 4ISFA 4L3QA 4IO8A 2E2QA 4I6MA 1HX1A 3VEWA 5AQXA 5AQSA 2E2OA 4FWPA 5AFUH 1WUAA 4EFHA 4KBOA 1U6ZA 4H0VB 4JN4A 1IG8A 3A5MC 3H3OB 1QQNA 4IWVA 4CBUA 4EHTA 1X9JA 3ENHA 2Q0RA 3M6GA 4WYBA 3CQYA 1EQYA 4BRQA 4DHYA 4H03B 2E2NA 2VYPA 4Y0WA 1YVNA 2NLXA 3WQTA 2P9IA 3ID8A 3HSCA 2A6AA 1NM1A 2A41A 2PBDA 4K25A 3JS6A 4CZLA 3AARA 3GE1A 5AQMA 4B1UB 3FR0A 4BRNA 3BUZB 2W41A 1U2VB 2P9NB 3OHRA 3CJAA 3WXIA 1X3NA 4A2BA 4QS7A 2W40A 2ITMA 3QICA 1CZAN 2HOEA 3A8YA 1ZBSA 2ZGYA 1RDWX 4BRLA 4FWQA 4GNIA 4CZHA 4FSVA 3O8MA 1RGIA 5LJVA 2ZF5O 2P9UB 3DXMB 2E20A 3LDQA 2BTFA 2WUSA 4BQLA 3VPZA 4DCHA 4RCHA 3LM9A 4A61A 2H3GX 3MCPA 4ISGA 1HKBA 3QBXA 3W0LA 1J6ZA 5AQGA 2QWLA 1JCFA 2FLOA 3DWLA 3QFUA 3O1WA 4CZFA 3KVGA 1SZ2A 4K43A 2Q36A 1Z05A 3L0QA 5AQNA 5LY3A 3GL1A 2HF3A 4BG8A 4AM6A 3AAQA 5AZIB 3D2EA 2A3ZA 4FO0A 3U9DA 4E1JA 5F2RA 1NGBA 3QMLA 1JCEA 4CBWA 5BPLA 2EWSA 5I9EB 1GLCG 3O5BA 2V7YA 1WOQA 5AZJB 5BRDA 5CE3A 4PL7A 3R6MA 3VERA 2YCHA 5KQDA 5ADXH 5AQTA 1U2VA 1ZXOA 5KPZA 3WXLA 3CJ1A 2YHXA 2GWKA 2CGKA 2IVNA 3SJHA 3A5NC 4FWKA 4K42A 2CH5A 1BDGA 4BRDA 4O8KA 3IMXA 1NGAA 1T44A 2P9UA 3DXMA 5FPEA 2E88A 3O1BA 1HJOA 4IZ9A 2E2PA 4EHUA 3P4IA 3FGUA 3CJCA 4H5NA 3BF1A 1HLUA 1HKGA 3VEZA 1Z6RA 4Z94A 3EKSA 4CZJA 4IXCA 4BRFA 4B1ZA 5JLFA 2D0OA 3AY9A 3WEEB 1NGDA 2GUPA 1JCGA 5AZIA 2A5XA 3U9ZA 3DAWA 5AQYA 4H0YB 4M7YA 4CD3A 2DPNA 3DXKB 2ZWHA 4BRIA 1SQKA 5AZJA 4BC5A 2V7ZA 5FPDA 1NGGA 5BN8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F9WA 3SAGA 4DG1A 3G25A 3PV8A 3D7EO 3LP3A 4BR0A 4XJXA 1UA0A 3CHWA 4BR7A 4CI6A 2Z1IA 3T1HK 2QWQA 4FJMA 1J53A 1UAXA 4XIUA 3AA2A 3IUCA 4RW8A 4C8NA 3RWUA 4IFVA 1EWQA 2IVPA 5JICA 4F2SA 1W97L 4KHQA 1N4NA 2YJEA 2HMPA 1KAYA 5K14A 3IDHA 2YNGA 4BVPA 3LZJA 4YOUA 4Q5VA 2HVHA 3SQ2A 4LF8K 1GLBG 1KVCA 3K5OA 3M8QA 1JZBA 5FPMA 4KB1A 1C6VA 2X78A 1U45A 1OH7A 1I6FA 1C56A 3UB5A 4KHWA 5LL6Z 2M8BB 3EKUA 1ZBHA 4CVNE 4NYNA 2VG6A 4OPAA 3QESA 2E3GA 3OS1A 4E7HA 4M3WA 5HLFA 3KP0A 2VQFK 1B7DA 3LM2A 3C7NB 4KHPK 2HHTA 3AVGA 1DGKN 1ICAA 1CZ9A 3NF9A 3N4QA 2MZ0A 4DTOA 3TI0A 3U8XA 2D4WA 4CGGA 1X9WA 4ID1A 5EX5A 4DV7K 4H4OA 1F21A 3EL2A 4FJLA 1C1BA 1ATNA 2KLAA 1L3SA 2ZGZA 4CQKA 3GG4A 4O44A 3U6FA 4JKGB 2O8FA 4O0IA 5HL7L 3KC6A 2LT8A 4Y1CA 3OS0A 3CPEA 4GVMA 2WBNA 4H0PA 3TAGA 1OH8A 3QEVA 1SKWA 1KTQA 5C2FA 1W9HA 1UOCA 2D0CA 2P9NA 1EWRA 4F3OA 1ILYA 3ULEA 2BUPA 3QB0A 3S9HA 1VQNN 1W7AA 4DR1K 5C42A 1BOTO 5FDLA 2GBZA 1D5AA 3SBTA 4K0KK 2O8CA 1YJNN 4CJTA 5H1SQ 2D1KA 3RMDA 1CZBA 4DR6K 1BO5O 5BRHA 5M1PA 3VQPA 1Y97A 1JZAA 3KHWA 2KZZA 4FOEA 1G15A 4CHNA 3OJUA 3H45C 1IBKK 2WFBA 4JNEA 4IJAA 4DTSA 2O8BA 3CCEN 4DS5A 5HRPA 3ZSRA 4CHYA 4OO1J 1VSMA 1XI1A 3ATUA 5BR8K 4I9QA 2B5JA 3O9TA 1RDDA 1KV0A 3S41A 1VSFA 4X64K 3VQ5A 4CZKA 3LWMA 4QAGA 3ZT3A 1S3XA 4FLUA 5SZTA 5JS2A 3F9MA 5M1FA 3VQBA 1NGIA 4W5OA 2D5RA 1PX9A 2HHIA 2KHOA 4FJNA 4O5BA 1VSIA 1NRBA 4NB4A 4YY3K 1SKSA 2P51A 3N4PA 1NK7A 4HWIA 1T1TA 4M3RA 1I6GA 1ASWA 5E84A 1BMRA 2F9TA 4JI1K 3R3LA 4NXNK 1FW6A 4CZMA 2VCPA 1VNAA 3EO3A 4FZXC 1BGXT 3D2EB 3SMPA 2XY6A 4CEFA 1WBDA 3V9SA 2F7TA 4B9UA 4HUGA 1QQOA 2N66A 1YITN 1BA0A 1Y64A 2NY9X 4ELUA 1DJTA 4BRKA 4E3SA 5AQOA 3MXIA 4AF1A 1EKEA 2JDQD 4KPYA 3ISNC 4JD2B 3VQDA 4WF9L 4JKDA 2A1SA 1ZYQA 2LKBA 3GOIA 4JS5A 2QXLA 4H0OA 3L2RA 3L2QA 4Y1DA 2RN2A 4JI7K 3RSEA 4E1NA 2I7NA 1QZ6A 3NDKA 4J2BA 4KH6A 5GIOA 1GLLO 1LW2A 4FLTA 4M3UA 3O3HA 3J7ZO 4DTPA 1TYQB 1GLDG 3WXKA 3UE5A 2GTDA 4NLCA 4K41A 4CJFA 5HP1A 5I42A 4CZGA 2Y1JA 4E72A 4RW6A 2NRTA 1RT1A 4LF4K 5KGXA 1VQ8N 4BRGA 2QW9A 4PKHA 3ZCMA 1LOTB 3HO1A 3VEOA 1J54A 3T69A 3SUOA 3KD1E 3T3FA 2QTDA 3CFOA 4JHDB 4CK2A 1KC8O 1VQ5N 5AR0A 4I6MB 3ZT0A 3SQ1A 1NJWA 4JKFA 4B1VA 5BPMA 1TK5A 3AVKA 4I9LA 3A0IX 3IRXA 3MEDA 4H0XB 3BZCA 3NHGA 2A42A 2BDPA 3EEQA 1XWLA 4RWTA 4CD1A 2QA4N 1HQEA 1X9SA 1VAZA 5AQLA 1NJZA 4QOZB 2YIOA 2ZD1A 4GY2B 4O4GA 4H5RA 2P9IB 3AO4A 2BANA 3G10A 5EVZA 3KWIA 3QBWA 4C1NI 4E7IA 5BPNA 2Q3SA 1RILA 4CHOA 1BIZA 3LZIA 4CJVA 4JI0K 4DR7K 2FSJA 3L4IA 5DM7L 1IH7A 4CEQA 3I33A 4K8XA 1LWCA 2G8IA 1Q7YO 3VTIA 2C1IA 3O4QA 3SQ0A 3V6DA 4FLWA 4KREA 3L2WA 4B9QA 3E66A 3J7YP 4L3QA 4FLZA 4CJ5A 2F4VK 4NXMK 1HX1A 3KP1A 3IG1A 3VEWA 4NLBA 3HP9A 3J80O 4H0VB 2ITGA 1NOZA 1KLNA 3A5MC 1HQUA 2HHQA 4B9TA 4FJIA 3OBYA 3L3VA 4UQGA 4CFDA 3CQYA 1YTAA 4KYPA 1C1AA 1EQYA 3K9JA 4DHYA 2UUAK 1GPTA 4JKHA 4H03B 1Z25A 4CJEA 3L2VA 1NJYA 2NLXA 2XY7A 1NM1A 2A41A 4CEAA 2RHKA 1HPZA 3HT3A 1KFDA 1BISA 4DTXA 3FR0A 4CGHA 4BRNA 3MX2A 4L8RB 2W40A 1J5EK 4LFBK 3QICA 1ZBSA 2OPQA 1TI5A 4GNIA 4CZHA 1KQSM 2ZJRL 3LDQA 4N76A 1JLCA 5M1NA 4RCHA 2KW4A 1HKBA 1RBSA 3HVTA 1J6ZA 1BL3A 1TGOA 3DWLA 3O1WA 3KVGA 1SZ2A 3NH0A 4K43A 4DV3K 4PWDA 1RDBA 3EY1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F9W A;  3SAG A;  4DG1 A;  3G25 A;  3PV8 A;  3D7E O;  3LP3 A;  4BR0 A;  4XJX A;  1UA0 A;  3CHW A;  4BR7 A;  4CI6 A;  2Z1I A;  3T1H K;  2QWQ A;  4FJM A;  1J53 A;  1UAX A;  4XIU A;  3AA2 A;  3IUC A;  4RW8 A;  4C8N A;  3RWU A;  4IFV A;  1EWQ A;  2IVP A;  5JIC A;  4F2S A;  1W97 L;  4KHQ A;  1N4N A;  2YJE A;  2HMP A;  1KAY A;  5K14 A;  3IDH A;  2YNG A;  4BVP A;  3LZJ A;  4YOU A;  4Q5V A;  2HVH A;  3SQ2 A;  4LF8 K;  1GLB G;  1KVC A;  3K5O A;  3M8Q A;  1JZB A;  5FPM A;  4KB1 A;  1C6V A;  2X78 A;  1U45 A;  1OH7 A;  1I6F A;  1C56 A;  3UB5 A;  4KHW A;  5LL6 Z;  2M8B B;  3EKU A;  1ZBH A;  4CVN E;  4NYN A;  2VG6 A;  4OPA A;  3QES A;  2E3G A;  3OS1 A;  4E7H A;  4M3W A;  5HLF A;  3KP0 A;  2VQF K;  1B7D A;  3LM2 A;  3C7N B;  4KHP K;  2HHT A;  3AVG A;  1DGK N;  1ICA A;  1CZ9 A;  3NF9 A;  3N4Q A;  2MZ0 A;  4DTO A;  3TI0 A;  3U8X A;  2D4W A;  4CGG A;  1X9W A;  4ID1 A;  5EX5 A;  4DV7 K;  4H4O A;  1F21 A;  3EL2 A;  4FJL A;  1C1B A;  1ATN A;  2KLA A;  1L3S A;  2ZGZ A;  4CQK A;  3GG4 A;  4O44 A;  3U6F A;  4JKG B; 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