1NGC | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFSVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism	Bos taurus
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
total genus	126
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngcA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngcA04

2D4WA 2NLXA 1P8ZA 2VWBA 3A5OC 3S41A 2P9IA 1XQSC 4K43A 4FWNA 4CZLA 3IMXA 3VERA 4BRIA 4CI6A 2V51B 3BEXA 4PKIA 2P9LA 3VEXA 4MLEA 3A0IX 3QICA 5FPEA 3W3DA 4JHDB 1NM1A 3D2FB 2P9UB 3R9PA 4H0PA 4C23A 4WQ4A 2P9NB 3ZX0A 4CZIA 4H0YB 5AQKA 2ITMA 3FZFA 4BG9A 4BRPA 4BR2A 5F0XA 3AAPA 4BRLA 1NGFA 3UKRB 3ZX2A 4B1WB 1YVNA 2Q0UA 3VEOA 3LDNA 4QS8A 2YHWA 3ENOA 4FWQA 5AQPA 1NGCA 2BTFA 4FWOA 3LM2A 1Z6RA 4A2AA 3H3OB 4BC3A 3IFRA 2GTDA 2W40A 3CJAA 4EIAA 3CETA 4FOIA 2QWMA 3VESA 5AZJB 4E1JA 2A6AA 5JLHA 3FLCO 3WT0A 1LCUA 4ISFA 4Y0WA 3O1WA 4BRFA 4BG8A 4FSVA 3C7NA 3ZETA 1IG8A 2AA4A 2E1YA 3U8XA 2FXUA 4BC2A 1HKBA 5LJWA 4B1ZA 4IJNA 3O8MA 2FLOA 3BUZB 2J4RA 3FZLA 2AP1A 3CJCA 1E4GT 3A8YA 2Q2RA 4CZGA 5KPZA 3HI0A 2Q1NA 4LC9B 1T44A 5AQNA 3LDPA 3M6GA 3CERA 3O08A 4RTFD 4H5WA 2A40A 5EOYA 1KAXA 2A3ZA 2GWKA 4IXCA 4ISGA 3EO3A 3VEYA 5JMVA 2YHXA 1X3MA 2EWSA 3FR0A 2QW9A 5ADXA 3UKUA 1MDUB 1TUYA 3O4WA 4O8KA 5ADXH 1HKGA 5ELZA 5JICA 4BC4A 4EHTA 1HPMA 2BUPA 3SK3A 2Q36A 1J6ZA 1U2VA 4RWTA 1TYQA 3H3NO 3MK6A 4GY2B 3MN9A 4EFHA 4FL9A 1EQYA 2P9PA 3C0BA 1ATNA 5EVZA 3G25A 4PL8A 5AZIB 3H1VX 5AQOA 3QFUA 4JNEA 2HF3A 2HF4A 3H46O 4ISEA 3EKUA 4JAXA 1GLDG 1D4XA 5AQMA 2NZTA 2IVPA 4JN4A 5AQJA 3WEEB 1BA1A 1S3XA 1GLBG 2FSNA 2QWOA 1NGHA 3M3ZA 5TKYA 5FPMA 4XH4A 4AM6A 2HMPA 2F9TA 1IJJA 2FF6A 1BDGA 1HJOA 3GOIA 1KAYA 1ZBSA 4CBWA 3DWLA 3F9MA 3KZBA 3ULEA 5KQDA 1GLEG 2P9SA 1YXQA 3UKRA 1NGJA 1QQOA 3LDQA 3HSCA 4BRGA 2V7YA 1K8KA 1T6CA 1TUUA 1XUPO 5E84A 3D2EB 1NWKA 2QXLA 4A2BA 3SMPA 1LOTB 5BR9A 1V4TA 4B1VA 3CI5A 3EKSA 2YJEA 5BN9A 5BRFA 1JCEA 2P9KB 3ENHA 5BN8A 1NLVA 1U6ZA 5BPNA 4FWKA 3WXLA 1C0FA 3JXUA 2Q31A 3QBWA 2NRHA 4FOEA 4JD2B 3QBXA 3CIPA 5AQVA 1Z05A 5KPRA 5LY3A 2YHYA 4BR7A 4H0VB 2V52B 5AQWA 3HZ6A 5AFUA 5AFUH 1RDWX 3SMSA 4AM7A 4FWSA 3RSEB 4I6MB 1XC3A 4BRQA 3VGMA 4BQZA 2I7NA 1SZ2A 1V4SA 3D7EO 5AQFA 2CGKA 4XH1A 2D0OA 4HWIA 2QM1A 3M1FA 1NGAA 4CZJA 5AQXA 5I9EB 2PBDA 2GWJA 2P9IB 2YJFA 4H5NA 4CBUA 3U9ZA 2WUSA 4B1XB 3HTVA 1NGBA 2P9LB 1QZ5A 5F2RA 1ZC6A 3DXMA 3EN9A 3LM9A 5E26A 3GE1A 5FPDA 3MN7A 4BREA 4XEIA 3QMLA 5AQGA 2D1KA 3VEWA 2E2QA 2V7ZA 3KVGA 5AQSA 3W0LA 3KHYA 1NGDA 4BRMA 2FSKA 2W41A 3ATUA 1GLCG 4BR5A 3GG4A 5JLFA 4BRHA 2PAVA 4MLHA 4H5VA 1GLLO 3I33A 1RGIA 2IVOA 3CQYA 2H3GX 1BUPA 3VF2A 4M63C 5BPMA 4K25A 2E2OA 3ZEUB 2KHOA 3AAQA 3A5MC 1E4FT 1MWMA 4BVOA 3HBTA 4CD1A 3TU5A 3J8AA 1NGGA 3C7NB 4EAHD 4H03B 3EL2A 3WQTA 3DJCA 1OKJA 1HUXA 2Q97A 4B1UB 3SLCA 2E1ZA 3H6EA 4HTLA 4BC5A 2F9WA 4IZ9A 4QS7A 5CE3A 4BR9A 1ESVA 3CJ7A 3DXKA 3SJHA 1RFQA 2D0PA 3MDQA 3L4IA 3U9DA 5KQ8A 4PKHA 4WQ4C 4Z94A 1SAZA 3GDQA 3AY9A 4H0TB 2A42A 2P9KA 4H5RA 3FZHA 4FPBA 4JHDA 3D2FA 1DKGD 2P9UA 4NO7A 1T6DA 1NGEA 2QWRA 1HKCA 3O6WA 2P9NA 5AQUA 2E8AA 3GL1A 2GELA 5AQYA 3O5BA 1QQNA 3WXJA 1ZXOA 1BO5O 2A5XA 3UKUB 2DPNA 1JCGA 5AQRA 2Q0RA 4BROA 4BGAA 4WQ5A 3QFPA 3FFKB 1KAZA 4CZFA 1YUWA 3FE1A 3L6QA 3A5NC 4YDUA 3MN6A 4FWMA 3FGUA 4GNIA 1U2VB 3MCPA 1TYQB 3CJ9A 4CZEA 1BOTO 2ZWHA 1QQMA 4FWPA 4A61A 2P9PB 4CJ7A 4BRCA 3ATVA 1WOQA 2A41A 4H0OA 3CHWA 2FF3B 5AZJA 1MA9B 5AQHA 1NGIA 3VOVA 4O5FA 4DCHA 1HLUA 4EHUA 3BF3A 3BP8A 5BRDA 5BREA 3VENA 3B8AX 3BF1A 2YCHA 4BRDA 1BWFO 3QDKA 3VF6A 3UB5A 3ZX3A 4BRAA 2E88A 3CJ1A 4L3QA 3AARA 3ULEB 3VF4A 1R59O 3LL3A 3VGLA 2P9SB 3VPZA 1WUAA 2E2PA 4BR4A 5AQTA 3EZWA 1K8KB 2ASOA 4WYBA 3U4LA 4H0XB 3CJBA 1HX1A 2GUPA 3WXIA 5AQIA 5AR0A 3P4IA 5AQZA 1GLJO 1CZAN 2E2NA 2QWQA 4QS9A 3R8EA 5B8HA 2QWNA 3CQXA 1BA0A 1BU6O 4CD3A 3L0QA 4NB4A 3DAWA 1ATSA 2QWLA 4DB3A 2QWPA 4MO4A 5EXWA 3ZEUA 2VYPA 2CGLA 4IO8A 1SQKA 4A62A 3MMVA 4FWLA 2IIRA 4F9OA 5EY4A 3H1QA 3VEZA 4B9QA 5AQQA 2CH5A 2ZGZA 2ASPA 4M7XA 5LJVA 5F1XA 3WXKA 1JCFA 5AZIA 3UE5A 4PKGA 4B1YB 1NBWA 1Y64A 4J8FA 1ATRA 4MO5A 4BRNA 4M7YA 3HM8A 3LDOA 2CH6A 1BG3A 3WEEA 4BVPA 4PL7A 3O1BA 1QZ6A 4K42A 1NMDA 4CZKA 3TPQA 1DEJA 2ZF5O 1H1VA 4IJAA 3I8BA 4WQ5C 3O80A 3FZKA 3ZETB 2ASMA 4FO0A 3MN5A 3DXMB 4DHYA 1GLFO 2HOEA 4KBOA 4FPAA 4YDUC 3JS6A 3WUHA 3R6MA 4CZMA 3ID8A 4CZHA 4DQ8A 1G99A 3VETA 1KXPA 4IWVA 1QHAA 2ZGYA 3IDHA 1DGKN 2I7PA 3D2EA 3VGKA 1C0GA 3GBTA 1Q18A 4K41A 4BR0A 3A5LC 1MWKA 1S22A 2UYTA 2CGJA 2FSJA 4RCHA 4JD2A 4XH5A 5EX5A 2E20A 5BRHA 3IUCA 2GEMA 3FZMA 2VCPA 3VEVA 1GLAG 5BPLA 2YI1A 4CBXA 4BRKA 1YAGA 4H5TA 5AQLA 3RSEA 4BGBA 4I6MA 3WQUA 3H45C 5KPTA 5FPNA 3LDLA 4BQLA 1X9JA 3OHRA 2IVNA 1X3NA 4FWRA 3DXKB 3QB0A 2OANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1BK8A 2VWBA 4CZLA 3VERA 1J9AA 2HNYA 2OPQA 2QI2A 4JRQA 2P9LA 4DLGA 4BDZA 3D2FB 1VHXA 5M1OA 1HPZA 4C23A 1UA1A 2QA4N 4B3SK 3V1OA 2WOMA 4BG9A 3CCRN 4A5BA 1KQSM 1VSIA 3TABA 3UKRB 4YOYA 4PWDA 3IKMA 1JXEA 2XRIA 2Q0UA 4KAZA 2RE2A 1TVRA 2YNFA 4IOAL 3CC4N 1VSLA 1IKVA 4BC3A 3BZCA 2NY9X 1VRTA 4AF1A 4E89A 2GTDA 2W40A 2YKNA 3ALYA 3CETA 3CJAA 4FOIA 4EIAA 3TAQA 1HNIA 3ULDA 2IOCA 4FCYA 2RF2A 4DR1K 1BRZA 3O9QA 4ISFA 4ICLA 4Y0WA 3P39A 1T7BA 1RBSA 2AJQA 4WF9L 3J81O 2E6MA 1FKPA 1T7EA 3ZETA 4L8RB 3MXMA 4N56A 1LQHA 5HRPA 1TK8A 2FXUA 3DM2A 1OH8A 4JI3K 3SQ1A 1XHXA 4J2BA 5LJWA 2PZSA 1SNBA 3BUZB 1D9FA 4KH5A 3FZLA 1BL3A 3MWTA 1VSDA 3CJCA 2LT8A 4DV3K 5AQNA 4RTFD 1ZU3A 4YY3K 4H5WA 2A3ZA 5HL7L 4ISGA 1N6QA 4KPYA 1NK6A 3S5TA 5JMVA 2YHXA 1X3MA 2EWSA 4CJ3A 4DU3A 1SV5A 2G8KA 1TUYA 3AO5A 4EHTA 2BUPA 1HNZK 1L3VA 2YHAA 1BIUA 3SNNA 3THWA 1U2VA 3I0RA 1X9WA 4DMNA 4C1NI 4YFUA 3CMAN 1ZBFA 1TK5A 3MN9A 2HMIA 3OYIA 2P9PA 3H1VX 4FVUA 3QFUA 4JNEA 2HF3A 2HF4A 3MX5A 3EKUA 1CZ9A 1GLDG 2NZTA 5AQMA 3LAMA 3OYKA 3CQ8A 1PTXA 1B3CA 1GLBG 3ASMA 1A5XA 5TKYA 3VQ8A 3OS0A 4RW6A 4AM6A 4NYFA 2ZJQL 3AA3A 2MN5A 2F9TA 1IJJA 1BQNA 3MEGA 3I56N 1JLCA 1HJOA 3HRGA 3GOIA 2KKZA 2Z1HA 3F9MA 2VG5A 2P9SA 3SUOA 3SBGA 1NGJA 3UKRA 3LDQA 2D0CA 2V7YA 4I2QA 4TSXA 1T6CA 4KHQA 1NWKA 1IKXA 3SMPA 3OYLA 3CI5A 3O4NA 3I8DA 1XNQK 1CXQA 1JCEA 2P9KB 4AILC 3SUQA 1Z25A 5BN8A 1NLVA 1FW6A 3THYA 4FWKA 5BPNA 4IFYA 5HRRA 3JXUA 2Q31A 1WSJA 4GV9A 4FOEA 2HBMA 3CIPA 5AQVA 2OYQA 2YHYA 4CGHA 4YOXA 3U3GA 5AFUA 4DF8A 4DV0K 1TL1A 4KH4A 1RDWX 4H4OA 2PY5A 4JKDA 2WC9A 2VGNA 2ITGA 3O3GA 1C55A 4BRQA 3AA4A 4E1NA 3NHGA 2GV9A 2I7NA 2Q3SA 4DKWA 4XH1A 1S6PA 4AHCA 4HCBA 1TAUA 2BH1A 1T7PA 4NCAA 2QM1A 3B6PA 2E3GA 1JXBA 4CBUA 1OVQA 2WUSA 4B1XB 2XY6A 1KTQA 3ISNC 2A1RA 4PY5A 4B9UA 4O0JA 1ZC6A 1NK8A 3DXMA 3SV3A 3EN9A 4BE7B 1SL1A 1SUQA 4NLBA 1K73O 4M3TA 2LY5A 3F5TA 3M8PA 2BDPA 5CYQA 4O55A 3VEWA 3IS9A 3AVFA 3ENBA 4BRMA 1AHOA 4IDKA 5GIPA 4E19A 2QK9A 4CEOA 4G1QA 3KP1A 2O8CA 1NMNA 4B9NA 4BRHA 3CG7A 4MLHA 4IEIA 4H5VA 4HVJA 3E66A 4JKFA 3VF2A 4K25A 3AV9A 1X9MA 2N69A 4I7FA 2Z1GA 1TKZA 4OPHA 2HNDA 3OYNA 2KSKA 3KOWA 5HRNA 3HBTA 1I6GA 4R79A 2X6SA 4B8CA 3NF7A 4LF6K 3C7NB 1VSJA 2ETJA 4M3ZA 3DJCA 1GOAA 2Z1IA 3SCXA 3SLCA 1GOCA 3P31A 3CJ7A 3VA3A 4PKHA 4JEPA 4A5AA 4JI4K 2B6AA 4DS5A 2A42A 3T1YK 2P9KA 4N41A 1NGEA 4E7HA 2P9NA 3GL1A 3O5BA 1QQNA 1WMTA 1ZXOA 3UKUB 2QKBA 2Q0RA 1IKWA 3C6AA 3TR8A 4DWIA 3THXA 3C65A 4YDUA 1WT7A 5C25A 4GNIA 4DTMA 1TYQB 4F2RA 2G8FA 3CJ9A 2KW4A 1BOTO 1NH5A 3G4SN 1VQ4N 4H0OA 3CHWA 2W6LA 4N47A 2LR3A 3O3HA 1XHZA 1NGIA 3DRPA 1W0HA 3BP8A 1OH6A 4MDBA 4UY8O 5BREA 3HP6A 1S1UA 3B8AX 3BF1A 4Y1DA 4JI2K 1KV0A 3QDKA 3LPTA 4CF0A 3VF6A 4DQRA 4NCBA 3CJ1A 4CJWA 1Q81O 1VQ8N 1BGXT 4DV7K 3VF4A 4KTQA 4KHNA 4CGFA 4CEQA 3TAEA 3EZWA 3NF8A 2ASOA 1OH7A 3AGRA 4KB1A 4FJGA 2GUPA 3WXIA 2VQFK 3P4IA 1GLJO 4UJ0A 2E2NA 4QS9A 1BI4B 3E01A 4B3RK 1SKSA 3CQXA 1BA0A 1A5WA 1B9DA 1SS6A 1JKZA 4NB4A 2E6LA 3DAWA 4A57A 2QWLA 1SL0A 2QWPA 3T1HK 3TSQA 2HHWA 1SQKA 4CEBA 1I6FA 4A62A 4FWLA 3AO1A 3H1QA 4FLUA 3AVHA 2ZJRL 1C6VA 5AQQA 3OYHA 1IO2A 2ASPA 4CEDA 2DY4A 3WXKA 1JCFA 3ZSQA 4B1YB 1Y64A 4B3TK 1M1KO 2PYLA 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2NRZA 4BRFA 4DSFA 4FSVA 3HL8A 4KH6A 1ZBIA 3CM6A 1P90A 3HOSA 1VSEA 1IG8A 3U8XA 1JLFA 4W5RA 3QEXA 3PSMA 2KFZA 4B1ZA 3O8MA 2FLOA 2J4RA 4CJKA 1S6QA 4RG8A 1XWLA 5K14A 1FXXA 4E7KA 3TI0A 5KPZA 3HI0A 4LC9B 3M6GA 4DV4K 2DFHA 3LP3A 2A40A 1KAXA 2GWKA 3VEYA 2I5JA 5AJ3K 4DR6K 4K8XA 5ADXA 1MDUB 4FJ5A 3ZSRA 3O4WA 1HKGA 4CJRA 3KJVA 2IAJA 3AVCA 1GOBA 3U6FA 3SK3A 1Z26A 1XMOK 1J5EK 2YBRC 1Y97A 1C56A 4NCGA 5HOOA 5LMNK 4DU1A 3S3NA 4HUEA 3CPEA 5BR8K 4JRPA 4FK2A 3RTVA 4PL8A 5EVZA 4CF1A 5AQOA 1TV6A 4JYAK 1IV0A 1KVBA 3CC7N 1N34K 2M8BB 4JAXA 4JN4A 1D4XA 3ZT2A 5SZTA 2IVPA 1C1AA 3AVGA 5AQJA 3VQPA 3WEEB 1BA1A 4GV3A 1S3XA 3T69A 5CZ2A 3E9OA 5IT9O 1VNBA 4CGGA 1NK4A 1S1TA 5FPMA 1OVYA 4B9TA 3ID6A 1MU2A 3KOXA 1OZZA 2FF6A 2KPYA 1BDGA 4CBWA 1BIZA 1NNEA 1KSPA 3KZBA 3ULEA 2Y1IA 3SUPA 2GBZA 1YXQA 3QINA 1NKCA 1KD1O 4BRGA 3SAFA 1HYVA 1XUPO 5E84A 3NF9A 4EP5A 2BGGA 2QXLA 4W5TA 1JXCA 1NOZA 3CCVN 3KTQA 1JKHA 1V4TA 5BN9A 2VY6A 3ENHA 3PUFA 3OYMA 2UU9K 1C0FA 3V9SA 1RDDA 3N4QA 2NRHA 3F9KA 1WSEA 2KBHA 4BWMA 1Z05A 1W9HA 3J80O 2GL1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BK8 A;  2VWB A;  4CZL A;  3VER A;  1J9A A;  2HNY A;  2OPQ A;  2QI2 A;  4JRQ A;  2P9L A;  4DLG A;  4BDZ A;  3D2F B;  1VHX A;  5M1O A;  1HPZ A;  4C23 A;  1UA1 A;  2QA4 N;  4B3S K;  3V1O A;  2WOM A;  4BG9 A;  3CCR N;  4A5B A;  1KQS M;  1VSI A;  3TAB A;  3UKR B;  4YOY A;  4PWD A;  3IKM A;  1JXE A;  2XRI A;  2Q0U A;  4KAZ A;  2RE2 A;  1TVR A;  2YNF A;  4IOA L;  3CC4 N;  1VSL A;  1IKV A;  4BC3 A;  3BZC A;  2NY9 X;  1VRT A;  4AF1 A;  4E89 A;  2GTD A;  2W40 A;  2YKN A;  3ALY A;  3CET A;  3CJA A;  4FOI A;  4EIA A;  3TAQ A;  1HNI A;  3ULD A;  2IOC A;  4FCY A;  2RF2 A;  4DR1 K;  1BRZ A;  3O9Q A;  4ISF A;  4ICL A;  4Y0W A;  3P39 A;  1T7B A;  1RBS A;  2AJQ A;  4WF9 L;  3J81 O;  2E6M A;  1FKP A;  1T7E A;  3ZET A;  4L8R B;  3MXM A;  4N56 A;  1LQH A;  5HRP A;  1TK8 A;  2FXU A;  3DM2 A;  1OH8 A;  4JI3 K;  3SQ1 A;  1XHX A;  4J2B A;  5LJW A;  2PZS A;  1SNB A;  3BUZ B;  1D9F A;  4KH5 A;  3FZL A;  1BL3 A;  3MWT A;  1VSD A;  3CJC A;  2LT8 A;  4DV3 K;  5AQN A;  4RTF D;  1ZU3 A;  4YY3 K;  4H5W A;  2A3Z A;  5HL7 L; 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1NGCA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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