1NGCA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFSVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 126
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngcA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngcA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngcA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngcA04
1QQOA 4H5WA 5AQRA 2ASMA 4BROA 4H03B 1G99A 3DXKA 3GOIA 4CD3A 2CGJA 1BWFO 3MCPA 2QWNA 1SQKA 1JCFA 1X3MA 4FWOA 3CJCA 1XUPO 3CIPA 2FXUA 4BG8A 2YJEA 2E88A 1GLJO 4YDUA 3LDOA 2QXLA 3UKUA 2P9UA 1GLFO 1HKCA 3H1QA 1GLLO 4BRAA 3P4IA 4BRIA 3IUCA 5AQQA 1C0GA 1T6DA 1LCUA 3O1BA 3CERA 3DAWA 1EQYA 2ZWHA 3JXUA 3FR0A 2J4RA 4CI6A 3A5MC 5AZJB 1HLUA 3U4LA 5BR9A 1KXPA 3H3NO 2IVPA 3LL3A 1U2VB 3RSEB 4BR7A 3WT0A 4CBWA 3VF2A 5AQGA 3AAQA 1ATNA 3O5BA 1ATRA 4FPAA 1IG8A 3HI0A 3KHYA 5AQWA 1U2VA 3RSEA 4GY2B 3S41A 4EFHA 1S3XA 1RFQA 2CGKA 3H6EA 4BRKA 5BRDA 3MN9A 1KAXA 1GLDG 4CZLA 3FFKB 3SMSA 4JHDB 3GDQA 3L6QA 2CH6A 1OKJA 3VEZA 5AQSA 1QZ5A 5KQDA 1NGJA 1NM1A 3IDHA 1Q18A 2QWOA 4JHDA 3ZX2A 4H0XB 3UE5A 3L4IA 2FSKA 1IJJA 4M63C 1GLAG 5LY3A 3FGUA 2KHOA 2P9SB 4MLHA 1QQNA 3H3OB 2V7ZA 1BDGA 5KPTA 3VETA 3LDPA 3R9PA 2P9SA 1KAYA 3WXLA 3QB0A 3ENOA 3SK3A 4BRDA 2UYTA 3FZKA 4BR2A 5EOYA 3AARA 2E2QA 5BN8A 4EHTA 3QBXA 1BUPA 4E1JA 3FZMA 1R59O 2ZGZA 1BA1A 4DCHA 4BRLA 3ID8A 2EWSA 4BVPA 3H46O 5AQMA 2FF3B 2P9KB 4WQ4C 3HSCA 3O1WA 2HMPA 2IVNA 1MWMA 4PKIA 3GL1A 2P9KA 5BRFA 4BC2A 1JCEA 2HOEA 1QHAA 2NLXA 4JAXA 3QFPA 3J8AA 5B8HA 1T6CA 2P9IB 3EN9A 4FOIA 5I9EB 3MN6A 2VYPA 3W3DA 3FZFA 1YVNA 1K8KA 2A41A 3HM8A 3WXIA 1YAGA 5JMVA 3A5NC 2P9IA 4H0TB 4K42A 4KBOA 5AR0A 4H0VB 2H3GX 1HKGA 3F9MA 1TUYA 2V52B 5EX5A 3A5LC 5E26A 2P9UB 1TYQB 1WOQA 3UKUB 3VEYA 2Q0RA 5KQ8A 3CJ9A 3C7NA 2FLOA 2P9NB 2E1YA 2QWRA 4CZGA 3B8AX 2AP1A 3ATUA 4I6MB 4CZHA 4F9OA 3EKSA 4IXCA 1TYQA 1YXQA 5BREA 1NGCA 2A5XA 3WEEA 2P9NA 1C0FA 3VESA 4FWMA 1MDUB 1KAZA 3VGLA 4I6MA 1YUWA 4O5FA 4IWVA 4DB3A 3H1VX 3ZETA 4IZ9A 2QWLA 2D1KA 3D2FA 1S22A 3LDQA 3IFRA 2E8AA 1NGBA 4B1ZA 3ZX0A 4PKHA 1ESVA 2F9WA 1BG3A 1Z6RA 5AQOA 4WQ4A 4FWRA 4BRHA 3O6WA 2QWQA 3C0BA 5AFUA 4CZFA 4WYBA 5ELZA 2WUSA 1E4GT 2ASOA 4QS7A 5AFUH 3ULEA 4NB4A 2W41A 2GELA 3U8XA 4RWTA 2QM1A 4BGBA 4O8KA 4HTLA 5EVZA 5BN9A 4XH5A 1P8ZA 3CJBA 3WXKA 4FL9A 1NGIA 2A40A 3GE1A 1V4TA 1TUUA 2D4WA 3CETA 4M7XA 4Y0WA 2E20A 3W0LA 2GWJA 2E2NA 5CE3A 1D4XA 2DPNA 1ATSA 1HJOA 4M7YA 5FPDA 3LM9A 3D2EA 4XEIA 3OHRA 1BO5O 4BR4A 1BOTO 3JS6A 5BPLA 2VCPA 3VGKA 2FSNA 4B1WB 4WQ5C 4BRMA 2GTDA 5AQNA 1U6ZA 3M6GA 4JN4A 3GBTA 5KPZA 3UB5A 1H1VA 4BC5A 5AQPA 3QICA 3DWLA 1XC3A 3U9ZA 1NGHA 4CZMA 1SZ2A 2AA4A 2FF6A 3O4WA 2E2OA 3DJCA 1ZBSA 2FSJA 4FWLA 5AQHA 4CZKA 5AQIA 4DQ8A 2V7YA 4BREA 2D0PA 2Q36A 4FPBA 3QFUA 4HWIA 3VOVA 4FWKA 4H0PA 4DHYA 3A5OC 5TKYA 4K25A 1XQSC 4JD2B 3L0QA 3QDKA 3TPQA 4BRFA 1QZ6A 3AY9A 2PAVA 5KPRA 4RTFD 4K43A 1K8KB 1CZAN 2W40A 2PBDA 1RDWX 4JD2A 4K41A 4L3QA 4ISFA 1SAZA 3HBTA 3WQTA 4CD1A 3AAPA 3LDLA 4H0OA 5BRHA 4A62A 3ZEUB 4PL7A 2ASPA 4AM6A 3HZ6A 3C7NB 1MWKA 2IVOA 3G25A 5F1XA 4FWQA 4BVOA 2HF4A 1GLEG 3VGMA 4MO4A 3CHWA 3ZEUA 5F0XA 4LC9B 3VEVA 4WQ5A 4RCHA 3VEWA 3VF4A 3WEEB 5EXWA 2GWKA 3D7EO 1X3NA 4QS9A 2CGLA 4BR5A 4EHUA 5LJWA 4B1XB 4IO8A 3DXMB 3ATVA 4BRGA 5FPNA 1HUXA 2ZGYA 3FLCO 3ZETB 4BRQA 4MO5A 3LM2A 5JLFA 5AZIA 4A2BA 3D2FB 4FWSA 3DXMA 4FO0A 5JICA 3ZX3A 1Z05A 5AQLA 1NMDA 3ENHA 3IMXA 3I33A 4B1VA 4BGAA 4H5RA 5ADXA 3CJ1A 3ULEB 2YJFA 4BR0A 4CZIA 5ADXH 4XH1A 1QQMA 4BQZA 2YCHA 3SJHA 2ZF5O 5BPNA 2I7PA 2BUPA 4BG9A 2Q31A 3R6MA 4BQLA 4BRNA 4FSVA 3UKRB 3VEOA 2GUPA 3KVGA 4B1UB 3A8YA 2ITMA 3U9DA 2A6AA 3BEXA 4CBXA 3CQYA 1LOTB 4PKGA 3UKRA 1GLCG 2I7NA 2QWPA 2YHWA 3BUZB 4BC4A 4CZJA 4FWPA 2A3ZA 2IIRA 1BA0A 4ISEA 3BF1A 5FPEA 3BF3A 1DEJA 3VERA 3D2EB 2GEMA 2P9PB 1HKBA 5EY4A 5AZJA 1NBWA 1ZC6A 3VEXA 1NGAA 4Z94A 3CJ7A 3VF6A 4ISGA 4H5NA 3BP8A 4BRCA 5AQYA 1NWKA 3VPZA 2P9PA 4PL8A 4CBUA 2VWBA 4H5TA 5JLHA 1NGDA 1ZXOA 5F2RA 2NZTA 4JNEA 3CJAA 4NO7A 4XH4A 1Y64A 3MK6A 1BU6O 2QWMA 4FOEA 1T44A 2E2PA 2F9TA 3MMVA 4CJ7A 3HTVA 5AQVA 3EKUA 3GG4A 3O80A 3O08A 1GLBG 3WXJA 5AQXA 5AQFA 4EIAA 3EL2A 4BRPA 2Q1NA 4IJNA 3SLCA 3VENA 4B1YB 5AQJA 5LJVA 1HPMA 3A0IX 4QS8A 1MA9B 4H0YB 2Q97A 4IJAA 5E84A 5AQKA 1E4FT 4H5VA 4AM7A 2YI1A 4J8FA 2P9LB 2D0OA 4YDUC 3FE1A 2CH5A 3MN7A 4CZEA 1V4SA 2BTFA 2OANA 2A42A 3WUHA 1HX1A 5BPMA 2Q0UA 5AQUA 2NRHA 2P9LA 3FZHA 4A2AA 1J6ZA 1DKGD 2HF3A 4BR9A 4A61A 4FWNA 3M1FA 3FZLA 1NGGA 3R8EA 5AQTA 2E1ZA 2YHYA 3MN5A 3CI5A 1RGIA 3MDQA 3CQXA 3SMPA 3M3ZA 2Q2RA 3EO3A 2QW9A 3WQUA 1NGEA 3QBWA 4MLEA 1WUAA 3EZWA 4EAHD 3I8BA 4BC3A 4GNIA 1JCGA 4B9QA 5AZIB 3LDNA 5FPMA 2V51B 1DGKN 1X9JA 1NGFA 1NLVA 3O8MA 3H45C 5AQZA 3DXKB 2YHXA 4C23A 3TU5A 3QMLA 3KZBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RTHA 5GAGP 3KK7A 2HVHA 3DXKA 3N4PA 1SQKA 4YOUA 4DLEA 1XUPO 3CIPA 3V1RA 1FKPA 3OJUA 1GLJO 3LDOA 2QXLA 3KKSA 2P9UA 4JKGA 1EWRA 3PIOL 3G71N 1NKBA 1JLBA 4C8NA 3SV4A 4UJ0A 5CHIA 4E7HA 2D56A 3HPGA 5KRTA 1T6DA 3MEDA 3TI0A 4J2BA 1JKHA 3SQ1A 4W5NA 2PZSA 3CERA 1EQYA 2UUAK 1IO2A 3HVRA 1WSGA 3SCXA 1RDAA 1WSHA 4KB0A 1NNEA 2VWKA 1C1AA 1U2VB 3RSEB 3CFOA 1YITN 2HNDA 1VQPN 1N34K 4BEBA 3F5TA 2JDQD 4F8RA 1S1TA 4IFVA 2JWKA 4YORA 4OKKA 4BRKA 3THYA 3HPHA 1TK0A 3MN9A 1Q9XA 1GLDG 2PYJA 3FFKB 4HHTA 3GDQA 4DV7K 3L6QA 3JAMO 4DR3K 3PO4A 4W5OA 5KQDA 3LZJA 5K14A 1Q18A 4RW4A 2P5GA 1ZYQA 3L4IA 2FSKA 5LY3A 4X62K 1BGXT 4CJLA 4AHRA 3LP0A 4KRFA 2V7ZA 5KPTA 3AVJA 1KVBA 1N33K 3VA3A 4CHZA 1T7EA 3IG1A 3T69A 2UYTA 3FZKA 4NYNA 5EOYA 3AARA 2E2QA 1NPIA 5BN8A 3QBXA 4Z4IA 1NG9A 3BK3C 2G2KA 2ZGZA 1BA1A 4KHNA 4I9LA 4QOZB 4B3OA 3NHGA 1QTMA 4JKBA 5AQMA 2IVNA 4PKIA 4FLUA 4C8OA 1ZFUA 2D0AA 2P9KA 4FK2A 4KHWA 3SNNA 2HHQA 3T7ZA 5M1KA 4FOIA 3EN9A 2VYPA 2A41A 3WXIA 1K8KA 4XIUA 2O8DA 4OVLA 5D3GA 2P9IA 3NGZA 4H0TB 4KBOA 4NCBA 5AR0A 1SUQA 5HRPA 3F9MA 5J2NA 2P9UB 4A59A 3VEYA 2Q0RA 4CW7B 3EEQA 2P9NB 2N69A 2E1YA 3B8AX 4CZHA 4B3SK 1EX4A 1L3VA 4C1NK 2ATBA 1NGCA 2A5XA 3WEEA 1WSFA 3V1OA 1TKZA 1TL1A 4FWMA 3VESA 4I6MA 1YUWA 4IG3A 1T05A 3AA2A 1VQ9N 4IWVA 4DB3A 3H1VX 3ZETA 5FLXO 4CHYA 2HW3A 2HNYA 3LDQA 2HB5A 4B1ZA 3ZX0A 2VGNA 1C6VA 1ESVA 3HSTB 3K2PA 1ZVGA 4BWMA 2KBHA 1D5AA 3V9WA 2HMIA 4BY9C 3OYGA 4GVEA 1JLAA 2G8FA 3NMUA 4CZFA 4WYBA 2HHIA 1WMTA 1KLNA 1Q81O 2QM1A 4BGBA 2XHBA 3S3NA 4WFAL 1YJWN 1S72N 1P8ZA 4JRPA 4CEEA 5M1PA 1JZBA 3WXKA 5I3UA 2X78A 4FL9A 1IKWA 2Y1JA 3ZSRA 4Y0WA 3TABA 5CE3A 4GV9A 1IG9A 3QEIA 1R0AA 1ATSA 1HJOA 4M7YA 4XEIA 3CFRA 3OYAA 2VQEK 4FJJA 1D9DA 1NOYA 1N4NA 4BR4A 1I39A 1JXEA 1HYSA 4J2AA 3U3GA 4CGGA 4C8LA 3OBYA 4DR2K 3CYGA 1C55A 5KPZA 1H1VA 5AQPA 1Q86O 2JWLA 3AV9A 5LMUK 4IOAL 3J7YP 2VG5A 4BE0A 2MBKA 3SQ2A 4N76A 5JS1A 4NCAA 4GV6A 4FWLA 5C2DA 2DTUA 2W6KA 3HYFA 4FLTA 1VRUA 3RMCA 2Q36A 3NDKA 3ZYYX 1NE5A 4FPBA 1S9GA 5CZ2A 4MDAA 3DRPA 1X1PA 4FWKA 3OTOK 4H0PA 1G15A 4DHYA 1A5WA 3NAEA 4FJIA 4LF4K 1JL2A 3CCJN 2QKBA 1XQSC 3LDSA 3L0QA 4IDHA 3TPQA 4UADE 4BRFA 1BCOA 3AY9A 3I8DA 1ASUA 5KPRA 3DRSA 1K8KB 1M90O 4U67L 4CJEA 4CK2A 1U49A 2BRZA 1OH8A 4FJMA 4M3RA 3HBTA 3WQTA 4CD1A 5C12A 5SWMA 2KGQA 2B68A 3ZEUB 4OJRA 1NJYA 3CCUN 1RT6A 4AHSA 1MWKA 3KOZA 1BCGA 4GV3A 1HR0K 3PX4A 5J2PA 5F0XA 1RTJA 4IFYA 3TWHA 3VF4A 3HK2A 2KJAA 2OPPA 3WEEB 3M8SA 2C1IA 3D7EO 4OPJA 4FZXC 1JXCA 3TSUA 5LJWA 4B1XB 2N2RA 5FPNA 3ZETB 1XHZA 4NLCA 5AZIA 4JI2K 2FBVA 4CF0A 2X74A 4B08A 2KKZA 5J1EA 5JICA 4FO0A 1TKXA 1RDBA 3MECA 3QEVA 1K8AO 1N6QA 1Z05A 1VQKN 4DSEA 4AAZA 4YOWA 1J9AA 3VQ8A 3I33A 4B1VA 4BGAA 1CHZA 3O9RA 4E1MA 1QQMA 4BQZA 3SJHA 2FC0A 5BPNA 4DR7K 4KV8A 4JRQA 5SZTA 1S5JA 4JKCA 4HCBA 4BRNA 1SKRA 4O8UA 4KTQA 3I0SA 3KVGA 4HTUA 1WNSA 3BEXA 3UKRA 1VRTA 4I2QA 1RDCA 2I7NA 3AVIA 3BUZB 2A1RA 4FWPA 2O4IA 3L4QA 4ISEA 4JS5A 3BF3A 2KQ2A 3F9KA 1ZC6A 2NRTA 3P39A 3VEXA 5GAHP 4KH5A 4CJPA 4Z94A 3CJ7A 4AB0A 4ISGA 1EETA 1WB9A 2YKNA 2P9PA 4HE7A 1NGDA 4R79A 5HRSA 4B9TA 3ZLJA 1HNIA 1P90A 4NXNK 1JXBA 4O0JA 3SBTA 1KVAA 3OVNA 3V1QA 3KKRA 3AA5X 3MMVA 4CJ7A 3HTVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RTH A;  5GAG P;  3KK7 A;  2HVH A;  3DXK A;  3N4P A;  1SQK A;  4YOU A;  4DLE A;  1XUP O;  3CIP A;  3V1R A;  1FKP A;  3OJU A;  1GLJ O;  3LDO A;  2QXL A;  3KKS A;  2P9U A;  4JKG A;  1EWR A;  3PIO L;  3G71 N;  1NKB A;  1JLB A;  4C8N A;  3SV4 A;  4UJ0 A;  5CHI A;  4E7H A;  2D56 A;  3HPG A;  5KRT A;  1T6D A;  3MED A;  3TI0 A;  4J2B A;  1JKH A;  3SQ1 A;  4W5N A;  2PZS A;  3CER A;  1EQY A;  2UUA K;  1IO2 A;  3HVR A;  1WSG A;  3SCX A;  1RDA A;  1WSH A;  4KB0 A;  1NNE A;  2VWK A;  1C1A A;  1U2V B;  3RSE B;  3CFO A;  1YIT N;  2HND A;  1VQP N;  1N34 K;  4BEB A;  3F5T A;  2JDQ D;  4F8R A;  1S1T A;  4IFV A;  2JWK A;  4YOR A;  4OKK A;  4BRK A;  3THY A;  3HPH A;  1TK0 A;  3MN9 A;  1Q9X A;  1GLD G;  2PYJ A;  3FFK B;  4HHT A;  3GDQ A;  4DV7 K;  3L6Q A;  3JAM O;  4DR3 K;  3PO4 A;  4W5O A;  5KQD A;  3LZJ A;  5K14 A;  1Q18 A;  4RW4 A;  2P5G A;  1ZYQ A;  3L4I A;  2FSK A;  5LY3 A;  4X62 K;  1BGX T;  4CJL A;  4AHR A;  3LP0 A;  4KRF A;  2V7Z A;  5KPT A;  3AVJ A;  1KVB A;  1N33 K;  3VA3 A;  4CHZ A;  1T7E A;  3IG1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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