1NGC | Genus

Total Genus 126

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	126
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFSVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus	126
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngcA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngcA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngcA04

3VEZA 4LC9B 2E2QA 5EXWA 2E20A 1X9JA 2ZGYA 2CH6A 4CZMA 5BN8A 5AQXA 2ASMA 4BVOA 2DPNA 3RSEB 1MA9B 1TUYA 3A5MC 3D7EO 3BUZB 4H03B 4B1UB 4BRGA 4BRNA 3FZMA 3MCPA 4BR0A 4BRHA 4A2BA 1U6ZA 4H0PA 4EIAA 3H6EA 4HTLA 2NLXA 3FZLA 1NGJA 1MWKA 1Z6RA 4A2AA 4FPAA 3H45C 3GE1A 3EL2A 4K42A 4PKGA 5BREA 3LDNA 3IDHA 3W3DA 4BRAA 4QS7A 1BOTO 4CZEA 5TKYA 4CZKA 3ZETB 5AQWA 5KPRA 3GDQA 2I7PA 3UB5A 5AQPA 4BR4A 3LDOA 3VPZA 5KPZA 2FF3B 1QZ6A 2FSJA 2Q2RA 3ZX2A 3O6WA 3P4IA 2GELA 4BRDA 3HZ6A 4BRQA 2QWRA 4FO0A 4BR5A 2YHYA 4FPBA 3SLCA 5AZJA 5BR9A 3LL3A 4BRIA 4CJ7A 1NGIA 3UKUB 3EKSA 3EZWA 1V4SA 1JCGA 4H5WA 4FWMA 3O4WA 4DB3A 5BPLA 3FFKB 3DWLA 2V52B 2YHWA 2E1ZA 2IVPA 4BGBA 3QICA 3I8BA 2QWNA 4JN4A 2NZTA 4BRMA 5JLFA 3C7NA 4M63C 1V4TA 4JD2A 5AQIA 1NGBA 1JCEA 3TPQA 2P9KA 5AQHA 1NGHA 3U8XA 2PAVA 4BRPA 4B1YB 4BRFA 5LJWA 1T44A 4CBWA 4BVPA 4HWIA 1BG3A 4M7XA 3VF4A 4BC4A 4CZIA 4DHYA 3M6GA 2YJFA 3UE5A 5AQJA 1C0FA 1QZ5A 1QQOA 3WEEA 5AZJB 4FWNA 4IJNA 2GWJA 2D1KA 2E1YA 1DGKN 3OHRA 1HPMA 3SK3A 1HKCA 4EFHA 1TUUA 2CGJA 2QWPA 3I33A 2A41A 4BC5A 3QFPA 3L6QA 4CBUA 1BA0A 1E4FT 2HF3A 5KQ8A 1Y64A 2V7YA 5BPMA 4BQLA 3C7NB 1Q18A 3L0QA 1HKBA 1YAGA 4B9QA 5BRFA 1GLAG 3FZFA 1IG8A 3VGLA 3FE1A 2P9NA 4CZHA 2D4WA 3ZX0A 2QXLA 3C0BA 2Q36A 2Q97A 5BRHA 3VENA 1SQKA 5AQFA 3WEEB 2Q0UA 1BUPA 2Q31A 5ADXH 1K8KA 1ESVA 2Q1NA 3GL1A 2AA4A 4CD1A 3VOVA 2OANA 2YI1A 3HTVA 4FWLA 4H5RA 1RFQA 5AQGA 4L3QA 1LCUA 4XH1A 4RWTA 3FZHA 1DEJA 4WQ5C 3IUCA 2WUSA 3KHYA 3U9ZA 4WQ4A 2VWBA 3CETA 5BRDA 2ASPA 3LDPA 3DXMA 1D4XA 2D0PA 3O1WA 4BR7A 5E84A 4FOIA 4PKHA 4RTFD 3O80A 4EHUA 2A5XA 3DXKA 4IZ9A 3D2EA 5AQYA 4I6MA 2P9PA 3SMSA 3QBWA 3QDKA 1U2VA 2GTDA 1HUXA 5E26A 4GY2B 2HF4A 4BROA 1R59O 5ELZA 1NGAA 1NGCA 1K8KB 2A3ZA 2IVNA 3ENOA 4A61A 4B1WB 5KPTA 3QFUA 1NMDA 2VCPA 3O5BA 5LJVA 3ID8A 1H1VA 4Y0WA 3VGKA 4K25A 2VYPA 1XC3A 4B1VA 3LDQA 1BDGA 4BRKA 1NBWA 4BR9A 1Z05A 1GLEG 3CJAA 1T6CA 2E8AA 3CQYA 3WT0A 3QB0A 4K41A 2P9UA 4QS8A 1NM1A 3EO3A 3QBXA 2QWLA 1CZAN 2W41A 1KAYA 3M3ZA 3CI5A 1NLVA 3O1BA 3A5NC 1BA1A 1X3NA 2UYTA 4IWVA 4NO7A 3S41A 5FPDA 3DXKB 4H0VB 4MO4A 3WQTA 3EKUA 1ZXOA 3D2EB 1QHAA 2P9PB 4I6MB 3CJ7A 4FWQA 2IVOA 3J8AA 4BRLA 1HLUA 4WQ4C 3A5OC 3H1VX 1NGFA 5JICA 2AP1A 2E2OA 4H0YB 1GLJO 5AZIA 4IXCA 4QS9A 1QQNA 3MMVA 4FWKA 4EHTA 3MDQA 3AY9A 4DQ8A 5AQSA 2FSNA 3HBTA 1RGIA 2ZF5O 4H5TA 4XH5A 4BRCA 2F9WA 2QW9A 2W40A 4C23A 4XEIA 1LOTB 3GBTA 4WQ5A 2HMPA 3WXKA 2P9UB 3HSCA 5EX5A 4MLEA 2CGLA 3M1FA 3A8YA 3VF2A 3CERA 2P9IA 4BC3A 4PKIA 2A40A 1BO5O 1X3MA 4JD2B 3VESA 3CIPA 2F9TA 4ISEA 2IIRA 3SMPA 1YUWA 2P9KB 4PL7A 3A0IX 4CI6A 4WYBA 1DKGD 1HX1A 5AZIB 2BUPA 3KZBA 3BP8A 1NGGA 4BQZA 2E2NA 2QWMA 1C0GA 2ITMA 4H5VA 3VEVA 1TYQA 3HI0A 3WQUA 5BPNA 4J8FA 2YHXA 3WXLA 4ISGA 2BTFA 3FR0A 2ASOA 2ZWHA 1GLDG 3CJBA 5AQVA 4H0OA 1QQMA 3ZEUA 3WUHA 4BR2A 5I9EB 4CZGA 4CZFA 1S3XA 3UKRA 2A6AA 2Q0RA 5AQNA 4KBOA 1P8ZA 4JNEA 3VERA 2P9IB 2CH5A 5FPMA 4CZLA 5AQUA 4XH4A 3R8EA 5AQZA 3IFRA 4BG8A 5AQOA 4Z94A 3AAQA 3WXIA 2FF6A 2PBDA 2ZGZA 4FWSA 4BG9A 2D0OA 4BC2A 3H3NO 2P9NB 5FPEA 1EQYA 4CD3A 1XQSC 1YVNA 4M7YA 3CHWA 2FXUA 2H3GX 1ZBSA 1GLFO 1TYQB 3QMLA 3W0LA 1OKJA 5EOYA 3G25A 4NB4A 3MN9A 3ATUA 4O5FA 4H5NA 3UKUA 3ZEUB 3ENHA 3MK6A 5JLHA 3VEYA 5AQRA 5AFUA 3D2FA 3LDLA 5AQQA 3R9PA 2KHOA 5AQMA 3UKRB 4FWOA 5F2RA 3FZKA 4MLHA 2FLOA 3ATVA 5AFUH 3AARA 4O8KA 4ISFA 5EVZA 2I7NA 4E1JA 5FPNA 3VEWA 1IJJA 1T6DA 1YXQA 2GWKA 4BGAA 1G99A 4CBXA 5B8HA 1GLCG 3BF3A 3DXMB 3BEXA 3LM2A 2NRHA 2A42A 3LM9A 5KQDA 4FOEA 2GUPA 2V7ZA 4IJAA 1E4GT 4H0XB 4PL8A 5BN9A 2P9LA 5AQKA 4JHDA 3DAWA 3VEXA 1U2VB 2E2PA 1SZ2A 4FWRA 3R6MA 2QWOA 1J6ZA 3H3OB 4YDUA 3GOIA 3MN7A 4IO8A 3D2FB 1MDUB 3U4LA 5CE3A 3MN6A 3ULEA 5AR0A 3VF6A 1HJOA 1MWMA 1HKGA 3CJCA 4H0TB 3VGMA 3FLCO 1JCFA 3A5LC 5AQLA 5EY4A 5F1XA 2FSKA 3L4IA 3AAPA 5LY3A 4FWPA 4F9OA 2YCHA 2CGKA 4JAXA 2J4RA 4AM7A 3HM8A 3IMXA 5JMVA 4CZJA 4DCHA 1ZC6A 2V51B 4B1XB 1KAXA 4FL9A 3CQXA 2EWSA 1KAZA 2QWQA 3U9DA 1GLBG 4AM6A 1S22A 3F9MA 4RCHA 1GLLO 2P9SA 3ZX3A 1BU6O 1KXPA 3JXUA 4GNIA 4JHDB 2P9LB 4FSVA 3MN5A 1NGEA 3TU5A 4B1ZA 3CJ1A 3KVGA 5AQTA 1BWFO 4K43A 2E88A 3DJCA 4A62A 3FGUA 3GG4A 5F0XA 2GEMA 3RSEA 3B8AX 3ULEB 1WUAA 4MO5A 2YJEA 4BREA 3EN9A 3WXJA 2QM1A 3H46O 1WOQA 4YDUC 3SJHA 3BF1A 1XUPO 1NGDA 3O8MA 3JS6A 3VEOA 2HOEA 3H1QA 3VETA 1ATNA 2P9SB 1ATRA 5ADXA 3O08A 1NWKA 1SAZA 3ZETA 4EAHD 3CJ9A 1RDWX 1ATSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

4I9LA 4LC9B 1MU2A 3KOXA 1BMRA 3OYLA 3HM9A 1HQUA 2F7TA 2CH6A 4Q5VA 4OLBA 2PFUA 3L2WA 3THXB 4H03B 4JI4K 4BRGA 1KVBA 3MCPA 4BR0A 4H0PA 3RWUA 3OYIA 2NLXA 1BQNA 1Z6RA 4FPAA 4PKGA 1J54A 3W3DA 1J53A 4CZEA 1BOTO 1RTHA 3THWA 3M8QA 1BCGA 4WF9L 2I7PA 1T1TA 2HNZA 4BR4A 2XO7A 4PY5A 3VPZA 4DV6K 3O9UA 1QZ6A 4OPHA 3O6WA 3CC7N 4IO9L 2GELA 1Q9YA 4LFBK 2HHVA 2ATBA 2QWRA 4FPBA 4OKEA 3LL3A 3PSIA 2YHAA 1UWBA 2O8BB 4AHCA 3UKUB 3OY9A 1JKZA 4JI6K 1I3AA 2IDOA 3K0SA 4IDHA 3C6TA 3P5JA 2UUBK 1EP4A 3O4WA 1NK5A 2KW4A 3DWLA 2V52B 1QSSA 4GVMA 3NH0A 3KOZA 3T1HK 3ZSWA 1RT2A 5JLFA 3CMAN 3NGYA 3QNOA 3EY1A 3QEIA 1JCEA 3U8XA 3MWPA 4WFAL 2YKNA 4B1YB 5LJWA 1T44A 2O8DA 1LWEA 4CZIA 4BC4A 4JS5A 3UE5A 1C0FA 5AZJB 2GWJA 3AA3A 3K5NA 2E1YA 5CYQA 1X9WA 4CFDA 4I7FA 1DGKN 2OZSA 1Q81O 2VQFK 1EWQA 1NK7A 1TK8A 1TV6A 1LQIA 3I33A 3QFPA 3TSPA 5H1SQ 1NRAA 3C95A 1E4FT 1Y64A 2V7YA 3VQDA 5BPMA 5CZ2A 3EZ5A 2F8TA 3RVCA 3KHWA 3PO5A 1ZU3A 3L0QA 4O8UA 3F9KA 3H08A 4I2QA 1QSLA 2BE2A 2Z1JA 1UGLA 4HHFA 1SQKA 3BY5A 3THYB 5E41A 1ASUA 3SPZA 3SQ2A 3VA3A 3C6AA 3LALA 3NDKA 1HNWK 3KD1E 3L3VA 4DLEA 3JYTA 2VQEK 4E7IA 4JKCA 1ESVA 4PUOA 3SUPA 4DTRA 4CD1A 3VOVA 3HPHA 4FWLA 3OYFA 4CFAA 1VQON 4RWTA 4FJ5A 1OH7A 4HE7A 3HOSA 2Q3SA 3DLLL 5FRNA 3PX6A 1WBDA 2WUSA 2YIPA 3KHYA 4Z4CA 3HO1A 2VWBA 3CETA 5BRDA 4YOYA 3OYNA 5CYMA 3BGRA 1D4XA 3HPGA 3T1AA 3TTCA 3JSMA 1S9GA 2PYLA 1VSMA 1NK8A 1NPIA 1LQHA 4N41A 3TAQA 4PKHA 4LD0A 4RTFD 1D9FA 5GIPA 3DRSA 4FJJA 3D2EA 3AVIA 1C55A 2P9PA 4I6MA 3SMSA 3TR8A 4B8AB 3J7ZO 3QBWA 1U2VA 1QQCA 4JKAA 2GTDA 1C1CA 3NAEA 1T05A 4BE7B 1KVCA 1NGCA 4IOXA 3CM5A 5LJVA 1NMDA 4FZZA 3DLKA 4Y0WA 3V9XA 5HROA 3LDQA 2O4GA 1ZYQA 3CJAA 1L4VA 4BDZA 3CFOA 1O13A 1LW2A 3O3GA 2P9UA 1NM1A 2KKZA 4IEEA 3AVFA 1VQ7N 4FM1A 1KAYA 1FJGK 2UYTA 3S41A 4H0VB 3KWGA 1ZXOA 4X66K 3ZT3A 2N2QA 1MR4A 1D9DA 1RTIA 3AO5A 3N4PA 1KVAA 1N6QA 4YY3K 3F5TA 1QQNA 3MMVA 1ZBIA 2ZF5O 1VSHA 4KH5A 2C1GA 4YOXA 4H5TA 1YF5L 2R7YA 4DFPA 1LOTB 3GBTA 1WAFA 2HMPA 3WXKA 1BI4B 1NG9A 3AV9A 3O9QA 4CF9A 4N5SA 3LWMA 3SNNA 4B3MK 3NE6A 4CJEA 3KK2A 1VQNN 2NY8X 4MLEA 2E6LA 2CGLA 2BRZA 4KH4A 3CFPA 1AYJA 1SNBA 2P9IA 1YIJN 4BC3A 3VQ6A 4B3OA 3QEWA 1BO5O 3I55N 4CGFA 4ISEA 4KHQA 3E7UX 4CI6A 2F8SA 4WYBA 1S6QA 1HX1A 1SKSA 1SL0A 3KZBA 2BUPA 2YEOA 1BQMA 2WOMA 3K9KA 4I9QA 1N33K 2JWLA 1UAXA 2E2NA 4CVNE 1C0GA 4FZYA 3AGRA 2ITGA 3WQUA 4EP4A 2WONA 4J8FA 3TANA 3SI6A 4ISGA 4JYAK 2YNFA 1N4NA 3FR0A 2PYJA 4DQIA 5C12A 2HMIA 2UXBK 2ASOA 1K9MO 1QS4A 1BISA 4A5BA 1QQMA 1PE4A 1P00A 4WCEL 2DY4A 5J1EA 5AQNA 1NKBA 3MXMA 2CH5A 4CZLA 1A5WA 3CCLN 3PV8A 3IFRA 3VQ9A 2A7TA 3ENBA 4DUYK 1WWNA 3WXIA 2FF6A 4NCBA 3E66A 5KRSA 5DM6L 3H3NO 5FPEA 1T7AA 1B3CA 1XQSC 1YVNA 4CD3A 4PWDA 3CCEN 4EZ9A 3CHWA 4E19A 1XNQK 3P38A 3PSFA 1GLFO 1S1XA 1TYQB 2FC0A 3QMLA 2LJMA 1PTXA 3LPUA 3G25A 5JS1A 4NB4A 4O0IA 2QKBA 4H5NA 5J2MA 4DQPA 4JI8K 1TKXA 4CIFA 3TAMA 3CCUN 3LDLA 1Q8IA 1XWLA 3SUNA 2KHOA 5AQMA 4FWOA 3FZKA 2FLOA 3AARA 5EVZA 2G8IA 2I7NA 4DSIA 4KFBA 1T6DA 1YXQA 4XJXA 4FLYA 1SKWA 2O8CA 1G99A 4CBXA 5B8HA 3O4NA 1WSJA 4MQ3A 4R79A 1XC9A 3TSUA 2D5RA 3DXMB 2NRHA 1ZVEA 3ISNC 1OZZA 3ZSVA 5JVHL 4GV3A 2G8HA 4PL8A 3VEXA 5AQKA 4JRPA 2X74A 4E1NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4I9L A;  4LC9 B;  1MU2 A;  3KOX A;  1BMR A;  3OYL A;  3HM9 A;  1HQU A;  2F7T A;  2CH6 A;  4Q5V A;  4OLB A;  2PFU A;  3L2W A;  3THX B;  4H03 B;  4JI4 K;  4BRG A;  1KVB A;  3MCP A;  4BR0 A;  4H0P A;  3RWU A;  3OYI A;  2NLX A;  1BQN A;  1Z6R A;  4FPA A;  4PKG A;  1J54 A;  3W3D A;  1J53 A;  4CZE A;  1BOT O;  1RTH A;  3THW A;  3M8Q A;  1BCG A;  4WF9 L;  2I7P A;  1T1T A;  2HNZ A;  4BR4 A;  2XO7 A;  4PY5 A;  3VPZ A;  4DV6 K;  3O9U A;  1QZ6 A;  4OPH A;  3O6W A;  3CC7 N;  4IO9 L;  2GEL A;  1Q9Y A;  4LFB K;  2HHV A;  2ATB A;  2QWR A;  4FPB A;  4OKE A;  3LL3 A;  3PSI A;  2YHA A;  1UWB A;  2O8B B;  4AHC A;  3UKU B;  3OY9 A;  1JKZ A;  4JI6 K;  1I3A A;  2IDO A;  3K0S A;  4IDH A;  3C6T A;  3P5J A;  2UUB K;  1EP4 A;  3O4W A;  1NK5 A;  2KW4 A;  3DWL A;  2V52 B;  1QSS A;  4GVM A;  3NH0 A;  3KOZ A;  3T1H K;  3ZSW A;  1RT2 A;  5JLF A;  3CMA N;  3NGY A;  3QNO A;  3EY1 A;  3QEI A;  1JCE A;  3U8X A;  3MWP A;  4WFA L;  2YKN A;  4B1Y B;  5LJW A;  1T44 A;  2O8D A;  1LWE A;  4CZI A;  4BC4 A;  4JS5 A;  3UE5 A;  1C0F A; 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1NGCA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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