1NGI | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
source organism	Bos taurus
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
total genus	122
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngiA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngiA04

3DWLA 5CE3A 4MLEA 4BQZA 4CZHA 5JLFA 1C0GA 3CJ7A 2VCPA 3L6QA 3O1WA 3GDQA 4XH4A 2QWLA 4HWIA 5LY3A 3MDQA 3U4LA 3WUHA 3O8MA 2YI1A 3U8XA 1GLCG 3BF3A 2I7PA 3QFPA 4FWPA 5BRFA 2HOEA 2IIRA 3VETA 5ADXH 2ZGZA 4H0OA 1K8KB 4BR5A 3VGMA 2P9UA 2P9NB 4BR4A 1RDWX 3VENA 4NB4A 3KVGA 4BRNA 4BR7A 3D2EB 3CIPA 4IZ9A 4H5TA 4K43A 5AQMA 2P9IB 3A0IX 3CHWA 3A8YA 3BP8A 2A3ZA 4IXCA 5BRDA 5LJVA 3IUCA 1RGIA 3FZKA 1KXPA 3H45C 3MN7A 4A61A 2GELA 4HTLA 5E26A 3MN5A 2Q2RA 1BO5O 2NZTA 1V4SA 5EY4A 1TUUA 5FPDA 3SMPA 2QWQA 1RFQA 4J8FA 1S3XA 2PBDA 1U2VA 4B1YB 4CZLA 5FPEA 1LCUA 2A40A 1BUPA 3LM2A 2PAVA 5AQOA 3QBWA 5AFUA 1HKGA 2D4WA 3A5MC 5BRHA 3R8EA 2QWMA 1KAZA 5AQJA 4Y0WA 3WT0A 1NGDA 4IJAA 2E1ZA 2KHOA 3EKUA 4DHYA 4IJNA 3CJ1A 1BA0A 3HZ6A 5BPMA 1GLFO 5AZIA 3VOVA 4XEIA 3BUZB 1ZXOA 3UE5A 4BC5A 3TPQA 3UB5A 3CJ9A 3QDKA 4H0TB 3JS6A 5AQKA 3LDNA 3WQTA 1JCEA 5KQ8A 4XH5A 3HTVA 3LM9A 4EFHA 4CBXA 3TU5A 1G99A 4EAHD 3DXKA 3FGUA 3GBTA 3WEEB 1X3NA 1GLEG 3SLCA 4FOEA 3SK3A 2E88A 4DQ8A 4B1XB 5EVZA 3A5LC 1NWKA 5FPNA 5ELZA 5AQGA 5BPNA 2ZF5O 4BRLA 2BUPA 5EOYA 3VF6A 4BRGA 3H3OB 2CH5A 5BN8A 3ZETB 1BOTO 5AZJA 3M3ZA 3ULEB 4NO7A 3QICA 2QW9A 4JN4A 1NGEA 5LJWA 1HKBA 2P9KA 3CI5A 3ZEUB 5ADXA 4H03B 4BQLA 5AQPA 2GWJA 2P9LA 4FWSA 3MK6A 1NGGA 2D0OA 3LL3A 3FFKB 3D2FB 2Q31A 4CZJA 3CQYA 3FZMA 3WQUA 3ENHA 4B1WB 4H0VB 3VF4A 2V52B 5BN9A 4B1UB 4BG9A 2YJFA 1ATRA 2FSKA 1MWKA 3F9MA 3O1BA 2F9WA 4LC9B 1TUYA 3EZWA 2Q36A 3H1VX 3UKRA 2ITMA 4WQ5C 3C7NB 5KQDA 4AM7A 3DJCA 4FWNA 5AQHA 1NMDA 4FPAA 4BRDA 3U9ZA 1J6ZA 1BDGA 1HUXA 4FWMA 3B8AX 3J8AA 1H1VA 3VEYA 4CD3A 3IMXA 3UKUA 5I9EB 2HF3A 1NLVA 5JICA 1E4FT 4BRAA 4GY2B 3L0QA 1T44A 4FWQA 1CZAN 4WQ4C 4CBUA 3FE1A 1R59O 3RSEB 1JCGA 4JHDA 1NGJA 1NM1A 2P9SA 5KPZA 4K25A 4JAXA 3AY9A 4BGBA 3O5BA 2V51B 2P9PB 4JD2B 1IJJA 5F0XA 4H5NA 4Z94A 4BGAA 2DPNA 1DEJA 2NLXA 3BF1A 4BR0A 5BPLA 4M63C 4C23A 4BRPA 3HI0A 5AQFA 3ZX0A 4WQ5A 2HF4A 1ESVA 4H5WA 4DB3A 1JCFA 4PL8A 2D1KA 3ATVA 2YCHA 3VEWA 1K8KA 4O5FA 4K41A 3HSCA 2P9NA 3AAQA 1YVNA 3WXKA 4E1JA 5E84A 4CZKA 5AQLA 3D2EA 4CZIA 4I6MB 3VEXA 2P9IA 1OKJA 2QWRA 4RWTA 4MLHA 5JMVA 1D4XA 5KPRA 2V7YA 3FZFA 3VERA 1E4GT 2AP1A 3AARA 2ASOA 1NGBA 3CERA 2QWNA 4A2AA 4K42A 3VF2A 3CJAA 3H6EA 3VEVA 4H0YB 4ISFA 2E1YA 3DXMB 3AAPA 4IWVA 1TYQB 3MN9A 1YXQA 3GE1A 4IO8A 1GLJO 3CETA 1WUAA 5B8HA 4O8KA 2YHXA 5TKYA 3FLCO 5JLHA 1ZBSA 5KPTA 4BC3A 2A5XA 5AR0A 2Q0RA 1XC3A 2AA4A 2ZWHA 3DAWA 2D0PA 3LDQA 2YHYA 2GWKA 4BRCA 1NGFA 5AFUH 4MO4A 4CZGA 1SAZA 3SMSA 3VESA 5BR9A 2OANA 4MO5A 2BTFA 1XUPO 2UYTA 4RTFD 3KZBA 3GOIA 3CQXA 2IVNA 4BG8A 1QZ6A 1HPMA 4H0XB 3IDHA 1QQOA 4A62A 3I8BA 5AQNA 4GNIA 2Q97A 3O6WA 2CGKA 4A2BA 3VGLA 5AQXA 4B1VA 1GLDG 2QWOA 3ZX3A 2FSJA 4L3QA 4BRQA 3CJCA 4BR9A 2IVOA 5AQYA 3C0BA 3VGKA 2GTDA 4BREA 4CJ7A 4ISEA 3W0LA 1Z6RA 3O08A 2A6AA 3WEEA 4RCHA 4BRMA 3SJHA 5F1XA 2P9UB 3ZX2A 4F9OA 1U6ZA 5BREA 3QBXA 2E2NA 3QFUA 5AQUA 3D7EO 3WXIA 2GEMA 3VPZA 2HMPA 1SQKA 1HX1A 4BC2A 4CZEA 3CJBA 3I33A 1ATNA 3ZETA 1BG3A 1V4TA 4WYBA 3ULEA 4QS7A 2A41A 1MA9B 1HLUA 3S41A 1P8ZA 3ZEUA 4BC4A 3EN9A 3VEOA 5AQSA 3D2FA 2E2OA 4YDUC 1KAXA 1X3MA 4QS8A 5EX5A 1GLBG 3W3DA 2FSNA 1U2VB 2Q1NA 1QHAA 1C0FA 3P4IA 5AQIA 2FXUA 4BROA 3G25A 1HKCA 1GLLO 3ENOA 2QWPA 4CD1A 1NBWA 2GUPA 3C7NA 5AQVA 1S22A 1HJOA 1YAGA 1Q18A 2I7NA 2W40A 3O80A 4BRKA 4PKGA 4H5RA 3BEXA 3IFRA 3LDOA 2VYPA 4FOIA 3GL1A 4PKIA 4BVPA 5AZIB 3GG4A 4DCHA 1NGCA 1X9JA 1WOQA 2ZGYA 3FZHA 4WQ4A 4FWLA 4BVOA 4YDUA 1YUWA 1Y64A 2NRHA 3RSEA 3QB0A 2WUSA 2FF6A 3HBTA 3M1FA 1DGKN 2E8AA 1QZ5A 3H3NO 1BWFO 4JNEA 3QMLA 4M7YA 3U9DA 2ASPA 1LOTB 1T6CA 3LDPA 4M7XA 2P9PA 4CI6A 4JD2A 3MN6A 4EIAA 1SZ2A 3DXKB 4FPBA 2J4RA 2W41A 4B1ZA 3O4WA 1Z05A 4CBWA 4CZMA 4H5VA 3FR0A 1ATSA 4PKHA 3KHYA 3EO3A 2A42A 4CZFA 3EL2A 1IG8A 3R6MA 5AQRA 3ATUA 1QQMA 1BU6O 4EHUA 4BRFA 1NGAA 3A5OC 5EXWA 1QQNA 2H3GX 3L4IA 5AZJB 4FO0A 1MDUB 2YJEA 3A5NC 2IVPA 3R9PA 5AQZA 2P9KB 4I6MA 3ID8A 4FSVA 3M6GA 2P9LB 4XH1A 1NGHA 2FLOA 4EHTA 2CGLA 2EWSA 2QXLA 3LDLA 4BR2A 4QS9A 2CGJA 2Q0UA 2FF3B 3WXJA 4FWRA 4BRIA 3DXMA 2E20A 1TYQA 2E2PA 3UKRB 4PL7A 1KAYA 3HM8A 5AQTA 3MMVA 1BA1A 5AQWA 1T6DA 4H0PA 2CH6A 2YHWA 5F2RA 2VWBA 3OHRA 3H46O 3JXUA 5AQQA 4ISGA 4AM6A 3H1QA 1DKGD 1ZC6A 3UKUB 3MCPA 4BRHA 2E2QA 1NGIA 1EQYA 5FPMA 1XQSC 1MWMA 2QM1A 4FWOA 2V7ZA 3EKSA 3WXLA 1GLAG 4B9QA 3FZLA 2ASMA 4JHDB 2P9SB 4FWKA 3VEZA 2F9TA 4FL9A 4KBOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1C0GA 2A1RA 3LDSA 1U4BA 3GDQA 5LY3A 3O8MA 1OH8A 3PX4A 3I55N 2YI1A 1GPSA 3U8XA 3OYGA 1GLCG 1S1UA 3BF3A 2VGNA 3QFPA 3VQ9A 5H1SQ 3HVTA 4B3MK 2LJMA 3CC7N 4FM1A 4H0OA 4FXDA 4JLHA 1TKTA 2W00A 1RDUA 3VGMA 2O8EA 4BR4A 2AJQA 3NF7A 3D2EB 4E72A 4IZ9A 3SV3A 1ZYQA 4K43A 5AQMA 4RW9A 2ZD1A 4B08A 3ZT2A 4CEBA 1JZBA 5BRDA 3SAHA 4DS5A 4DR2K 3C6UA 1ASWA 3E01A 5E26A 3MXIA 2DFEA 1YJNN 1BO5O 1HPZA 4WFBL 3AO3A 4LF9K 5FPDA 2YILA 3L3VA 3SCXA 2VGMA 2QWQA 1RFQA 3T1AA 3JAMO 3MAQA 4B1YB 3CM6A 1RILA 4CHNA 1TV6A 3HP9A 5JENA 3LM2A 2PAVA 3QBWA 5AFUA 1NK6A 3A5MC 2FBXA 1B7DA 1KAZA 4EP5A 1NGDA 5CZ1A 4JKHA 2E2FA 3CJ1A 2RF2A 3DYAA 3HZ6A 1LV5A 5BPMA 1GLFO 5AZIA 1T7EA 3PY8A 3VOVA 5HOOA 1JKHA 2YHAA 3QDKA 4H0TB 4FJKA 3LDNA 1ASUA 4R5PA 3WQTA 3EEQA 3QNOA 3TSPA 4XH5A 3V1QA 3PIOL 3LM9A 3E66A 3V9XA 4CK1A 3NF8A 4GW6A 4EAHD 5M1KA 1L3SA 1VSEA 3VTIA 1JZAA 4DQ8A 1Q8IA 4B1XB 2P5OA 3L3UA 3A5LC 2VWKA 3VA3A 4FLWA 4ZHRA 5BPNA 2ZF5O 4ZTFA 4OPKA 1B3CA 5EOYA 3VF6A 3VN5A 3H3OB 1KQSM 3HVRA 3ZETB 2PYLA 4Q0BA 4YHHK 3CG7A 5LJWA 2P9KA 1TK0A 3E1YA 3ZEUB 4AHRA 1S6PA 2KBHA 2HHTA 4FWSA 3CPEA 3HT3A 2HHSA 3SJJA 3I0RA 3CQYA 4LFCK 4B3TK 4CW7B 3PSMA 4H0VB 3VF4A 1S1VA 2V52B 3NF6A 3RRHA 4WE1A 1XHZA 3TR8A 4JI2K 1ATRA 5CY0A 3O1BA 1N33K 3F9MA 4LC9B 1CN2A 4LH5A 2KZMA 1OMYA 3AVCA 3P1GA 1HQUA 4K8XA 4M3YA 1IV0A 1HQEA 4FLTA 3C7NB 5KQDA 4IEEA 2SN3A 1KD1O 1RT5A 4AHTA 2KGQA 3U9ZA 4FJJA 1EXQA 3SYZA 3J8AA 4DV1K 3AO2A 2HF3A 1ZBLA 5JICA 4BRAA 4M42A 1TI5A 4FWQA 1R59O 4I2PA 4LF4K 4FM2A 3CC2N 4FLZA 3AGKA 3RVCA 3MWTA 3O5BA 4H5NA 1JL1A 2NLXA 3TAPA 5TKWA 5BPLA 3ALYA 4C23A 3HI0A 2JDQD 3ZX0A 1ZVEA 2LR3A 2ETJA 1LWFA 4XIUA 3J7AP 2YCHA 4E7IA 1KVBA 3VQ8A 1K8KA 1NJXA 4O5FA 4K41A 4DTRA 4DU3A 3LZIA 1PX9A 3HSCA 3L4QA 1YVNA 3WXKA 5DM6L 4H8KA 4G9ZA 1I6FA 4WF9L 5AQLA 1WAJA 2OZMA 1BGXT 4CZIA 2E3GA 1VQ9N 4RWTA 4MLHA 1D4XA 4IFYA 3FZFA 1ZBIA 3VERA 5HRPA 1A5WA 1K8AO 5HRRA 4ILJA 3KOZA 3HPOA 4K42A 3CJAA 2RN2A 1CZBA 1XWLA 1YXQA 4LY7A 3G6EN 3GE1A 4M3ZA 4IO8A 3OYCA 1WUAA 3HP6A 2YHXA 5TKYA 4ELTA 4F4KA 3QI7A 2RPIA 3ZSYA 3NVKA 3MXMA 2AA4A 5DK5A 3PV8A 2G8FA 1I94K 3H08A 4DQSA 1U45A 2GWKA 3KLEA 1NGFA 4CZGA 1GOCA 5M1PA 3VESA 1U49A 3KOYA 3I0SA 2OANA 1SKRA 2FBTA 4LSNA 4MO5A 4YORA 3J80O 4JKBA 2B3CA 1TKXA 4CEAA 3CQXA 2IVNA 3VQBA 1HPMA 1KCFA 3MEDA 4NCGA 3IDHA 1QQOA 4A62A 3I8BA 1SKWA 3LWLA 2CGKA 1I3AA 5CY4A 3QEXA 3QINA 3ZX3A 2IVOA 4JKCA 3ZYYX 4NXMK 4ZTJA 3HOSA 3G71N 2GTDA 4BREA 1SN1A 4CJ7A 1L5UA 1Z6RA 1C55A 1A5VA 1LW0A 5FLXO 1QVFM 4R79A 4M3XA 3SJHA 4CJ5A 1X9SA 1SL0A 3WNFA 4FJIA 2E2NA 1VQLN 3QIPA 2HMPA 4JKGB 5GAHP 3HJFA 2F8TA 4BC2A 1Q9XA 4OPHA 1B9FA 2W42A 4J2AA 3THVA 3ULEA 1K8BA 3K5NA 3R3LA 3O9UA 1P8ZA 3KHWA 4M3WA 3TWHA 4BC4A 3EN9A 3QO9A 5LMNK 4GMJB 3D2FA 2E2OA 4YDUC 1NKCA 5LL6Z 4QS8A 4X64K 3V9ZA 1KTQA 1XNQK 1IO2A 2Q1NA 1BK8A 3ZSRA 4IKFA 5E41A 1C0FA 4DFMA 3SAFA 4DF8A 2P51A 3ENOA 4B3RK 4CJFA 4RW8A 1N6QA 2GUPA 2O8FB 1BI4B 3K2PA 1S22A 1YAGA 2YX6A 1X9WA 3IFRA 1CXUA 1T03A 3LDOA 1JJ2M 4FOIA 4CGGA 4KPYA 3KIOA 5C24A 4Z4HA 4XJXA 4FWLA 4KB0A 1YUWA 4DSEA 3QB0A 3G0ZA 4I9LA 3KD1E 1VQMN 1RNHA 1DGKN 2E8AA 1QZ5A 3H3NO 3AVKA 4M7YA 5C12A 4M7XA 1LOTB 1T6CA 2P9PA 3DRSA 2KTQA 1QHTA 3RMCA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1C0G A;  2A1R A;  3LDS A;  1U4B A;  3GDQ A;  5LY3 A;  3O8M A;  1OH8 A;  3PX4 A;  3I55 N;  2YI1 A;  1GPS A;  3U8X A;  3OYG A;  1GLC G;  1S1U A;  3BF3 A;  2VGN A;  3QFP A;  3VQ9 A;  5H1S Q;  3HVT A;  4B3M K;  2LJM A;  3CC7 N;  4FM1 A;  4H0O A;  4FXD A;  4JLH A;  1TKT A;  2W00 A;  1RDU A;  3VGM A;  2O8E A;  4BR4 A;  2AJQ A;  3NF7 A;  3D2E B;  4E72 A;  4IZ9 A;  3SV3 A;  1ZYQ A;  4K43 A;  5AQM A;  4RW9 A;  2ZD1 A;  4B08 A;  3ZT2 A;  4CEB A;  1JZB A;  5BRD A;  3SAH A;  4DS5 A;  4DR2 K;  3C6U A;  1ASW A;  3E01 A;  5E26 A;  3MXI A;  2DFE A;  1YJN N;  1BO5 O;  1HPZ A;  4WFB L;  3AO3 A;  4LF9 K;  5FPD A;  2YIL A;  3L3V A;  3SCX A;  2VGM A;  2QWQ A;  1RFQ A;  3T1A A;  3JAM O;  3MAQ A;  4B1Y B;  3CM6 A;  1RIL A;  4CHN A;  1TV6 A;  3HP9 A;  5JEN A;  3LM2 A;  2PAV A;  3QBW A;  5AFU A;  1NK6 A;  3A5M C;  2FBX A;  1B7D A;  1KAZ A;  4EP5 A;  1NGD A;  5CZ1 A;  4JKH A;  2E2F A;  3CJ1 A;  2RF2 A;  3DYA A;  3HZ6 A;  1LV5 A;  5BPM A;  1GLF O;  5AZI A;  1T7E A;  3PY8 A;  3VOV A;  5HOO A;  1JKH A;  2YHA A;  3QDK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1NGIA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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