1NGIA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngiA04
1QHAA 5FPNA 3ZX2A 1U6ZA 3AAQA 3VEXA 3SMPA 5F1XA 3BUZB 1H1VA 1Z6RA 3HBTA 2FSKA 2Q0RA 5BR9A 1NM1A 1SZ2A 2IVNA 3S41A 3QFUA 5BN9A 3CETA 3CJ9A 3KHYA 4EIAA 1LCUA 4Z94A 3O1BA 2OANA 3AARA 4K43A 1QZ6A 4H5VA 3FZFA 2VWBA 2IVPA 5AZIA 4NO7A 3WUHA 3ULEB 3WEEA 1GLDG 3A5LC 3FZHA 3D2EA 1TUYA 2ZWHA 1DKGD 2VYPA 2FLOA 2W41A 2GTDA 1YAGA 3A8YA 2D0OA 3U9DA 1ATNA 2CGLA 3R8EA 4BGBA 4FWQA 4BG8A 3FFKB 1JCFA 1QQNA 3LDOA 3CIPA 4IZ9A 2YCHA 4M7YA 1XC3A 4WYBA 5KQ8A 3H46O 5AQIA 3AAPA 2J4RA 3CJBA 4CZJA 2P9KB 2CGKA 1XUPO 5AQTA 3FE1A 1S22A 5KPTA 3M3ZA 3VEVA 1QQOA 1JCGA 4EFHA 1YUWA 2E2PA 3VF4A 3QDKA 4CBUA 3KVGA 3MN7A 4B1VA 1DEJA 3VEZA 2I7NA 5BRDA 4B1WB 3O08A 1BU6O 3UKRB 2YHWA 5JLHA 4BROA 4A61A 2NLXA 2P9SA 4FWPA 1KAZA 4PKHA 1BDGA 3O5BA 4O8KA 4CZHA 1ESVA 3H3NO 2GWKA 4CI6A 4CZIA 4A2BA 4XEIA 2P9UB 1TUUA 3SLCA 2ZGYA 1SQKA 3HSCA 3QICA 1CZAN 2D1KA 1IJJA 4QS8A 5B8HA 4GNIA 2Q1NA 3EKSA 2AA4A 2FF3B 5EX5A 2P9PB 1BWFO 2V52B 1E4FT 3RSEB 5FPEA 1BG3A 3VETA 1J6ZA 4CZGA 4IWVA 2P9NB 3BP8A 1NGHA 3MN5A 1T6CA 2YI1A 4FWRA 4MO4A 4CBXA 5F2RA 2Q97A 4BC2A 3LDPA 3EN9A 5AQGA 3W0LA 3QMLA 4BRLA 1NWKA 3DAWA 3VGKA 2Q31A 4K41A 4H0TB 1U2VB 4EHUA 3IDHA 3WXLA 4K42A 4NB4A 5JICA 4YDUA 3O6WA 1ZXOA 4FPAA 3ZX3A 3EO3A 3ENHA 4IO8A 3P4IA 1MWMA 3C0BA 3FZMA 5EOYA 3EKUA 1GLLO 4BR2A 4BVPA 3HM8A 3H45C 2Q2RA 3FLCO 4DQ8A 3GDQA 3CHWA 1ATRA 3C7NB 1DGKN 3GG4A 3GBTA 3MDQA 1GLEG 3H3OB 1Z05A 3MMVA 3A5MC 2PAVA 4BR4A 3ATVA 1V4TA 2V7YA 3CJCA 3VEYA 2E2OA 3U4LA 4DB3A 5LJWA 3D7EO 3VPZA 3ZETB 3DWLA 5AQUA 1MDUB 2GEMA 3JS6A 4BRQA 4BQZA 3U8XA 1MA9B 2W40A 2NZTA 1HLUA 2ITMA 2P9LB 4JHDB 4M63C 2HOEA 4IXCA 3TPQA 5BRHA 2QWPA 4CZLA 2FSJA 4H5RA 3AY9A 1NGCA 4BRIA 4EAHD 5AQMA 4BRNA 5AQLA 4AM7A 2IVOA 1K8KA 2GELA 4FOIA 1ATSA 3ENOA 3I33A 2VCPA 3SJHA 2F9WA 3FZLA 2WUSA 2ZF5O 4BRFA 5AFUA 3LM9A 3DXKA 3JXUA 4I6MB 5AQKA 3EZWA 2A6AA 2CGJA 4DCHA 1GLFO 4BC4A 5AZJB 3MN6A 2YJFA 4PL7A 1NLVA 4BC3A 1R59O 4JNEA 4BQLA 5JMVA 3O4WA 1X3MA 4H0OA 4ISFA 3DXMB 3F9MA 3DJCA 3LM2A 4B1ZA 2A40A 4XH4A 2V51B 4FSVA 1TYQA 3WT0A 5EY4A 3TU5A 3D2FA 4FWMA 2QXLA 5AQPA 1XQSC 4QS7A 4BRAA 3R6MA 4WQ5C 1NGEA 4MLHA 4RWTA 2PBDA 3W3DA 3VF2A 2FXUA 5AZIB 4BRDA 3VENA 5AQWA 3WEEB 2ZGZA 3M6GA 2P9IA 1NGFA 3HZ6A 4BR7A 1YXQA 1X9JA 3D2EB 1WUAA 3O80A 4CJ7A 1BO5O 5KPZA 1RDWX 5AQVA 1OKJA 4WQ4C 2QWNA 2D4WA 3ZX0A 3J8AA 4FWKA 5FPDA 3BF1A 4JD2A 2QWQA 5I9EB 2ASPA 4BR9A 1D4XA 4CZFA 3UKUA 5ADXA 4BVOA 5AR0A 4XH5A 4A62A 1NGAA 1KXPA 2BUPA 5AQRA 4FWLA 1QZ5A 2YHYA 2FSNA 4ISGA 4B1YB 3CJ1A 3ATUA 5AQFA 2A3ZA 1E4GT 1HJOA 3LDNA 4MLEA 4L3QA 4CZMA 2V7ZA 2P9SB 3L6QA 2ASMA 2GWJA 3VF6A 3VOVA 2A5XA 3GL1A 3U9ZA 3GE1A 5F0XA 5AFUH 3ZEUB 1T44A 2E2QA 2HF3A 3CQYA 5AQNA 3MN9A 4BR0A 2ASOA 3A0IX 4RTFD 3OHRA 4F9OA 4H0VB 1KAYA 3ULEA 4B1UB 5BREA 4K25A 1T6DA 5AQOA 4XH1A 5AQZA 3HI0A 3FR0A 1LOTB 3CQXA 4BRKA 3A5OC 4BGAA 3WXIA 4DHYA 4H5WA 2H3GX 4ISEA 4Y0WA 3LL3A 2UYTA 2P9KA 1BA1A 4HWIA 1HKGA 2EWSA 4BC5A 3QFPA 3CERA 3L4IA 4J8FA 2QW9A 4EHTA 5AQSA 4M7XA 2QWMA 3QB0A 3FGUA 4H03B 3QBXA 3SK3A 2YHXA 1HKCA 3UKRA 1C0FA 3B8AX 2E1YA 4CD1A 5AQYA 1GLCG 3M1FA 5BRFA 4BRMA 2P9UA 5AQXA 1ZBSA 4CZKA 1C0GA 1MWKA 5FPMA 5KQDA 4O5FA 3VERA 3CI5A 5ADXH 2E88A 5TKYA 1NGDA 3A5NC 5EVZA 3UB5A 1BUPA 2D0PA 3LDQA 3UE5A 1Y64A 4JN4A 4QS9A 2P9PA 3RSEA 2GUPA 3HTVA 1BA0A 1NGGA 5ELZA 1RFQA 1HKBA 2QWLA 2AP1A 4FPBA 4BREA 2P9NA 1NGBA 4YDUC 1SAZA 3VEOA 1BOTO 3ID8A 2YJEA 3WQTA 2QM1A 5LY3A 3KZBA 4AM6A 3BF3A 2QWRA 2DPNA 3WXJA 1NGJA 4FWSA 1K8KB 4H5NA 4MO5A 2F9TA 2Q0UA 4BR5A 3VESA 1U2VA 1G99A 3CJ7A 3BEXA 3G25A 1NGIA 1WOQA 3IMXA 4FL9A 3DXKB 3SMSA 4H0YB 4B1XB 3L0QA 5AQJA 3CJAA 4RCHA 3QBWA 4CZEA 4HTLA 1V4SA 3FZKA 5EXWA 2NRHA 4IJNA 1NBWA 5BN8A 4PL8A 3ZEUA 4H0PA 4FWNA 3VGMA 2E1ZA 4LC9B 4JAXA 3C7NA 1GLJO 5AQHA 3IFRA 3LDLA 4BRHA 1YVNA 5BPNA 2CH5A 1TYQB 1RGIA 3H1VX 2CH6A 3WXKA 1HPMA 5JLFA 5BPLA 5AQQA 4GY2B 5KPRA 3I8BA 3ZETA 3D2FB 1S3XA 1EQYA 1X3NA 2P9LA 2Q36A 4JHDA 1NMDA 2BTFA 2E2NA 2HMPA 2HF4A 1GLAG 2IIRA 4B9QA 1HUXA 4PKIA 2P9IB 4CBWA 1JCEA 4C23A 1Q18A 1HX1A 2QWOA 1P8ZA 3VEWA 4FO0A 4BRGA 5LJVA 4BRPA 5CE3A 4BRCA 2A42A 4WQ5A 3H1QA 4JD2B 3GOIA 4H5TA 4IJAA 2FF6A 1ZC6A 2I7PA 4PKGA 5E84A 3UKUB 5E26A 3VGLA 3WQUA 3EL2A 1QQMA 1IG8A 3MCPA 4BG9A 4I6MA 2E8AA 4H0XB 4WQ4A 2KHOA 4KBOA 2E20A 1GLBG 3R9PA 5AZJA 3H6EA 3O8MA 2A41A 3MK6A 3O1WA 4CD3A 4A2AA 1KAXA 4FOEA 4FWOA 3DXMA 5BPMA 4E1JA 3IUCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QHAA 3CC7N 4HE7A 1MU2A 4DUYK 1TVRA 2G8KA 1IH7A 3N4QA 5BR9A 2IVNA 5BN9A 1C1CA 4CHPA 3OY9A 1OVQA 4FK0A 1RT7A 3AARA 4CJ5A 4LF8K 1BISA 1IKXA 2O4GA 1ILYA 1ZUTA 1BCGA 1FW6A 3ULEB 5FDLA 4CJPA 1ZBFA 3D2EA 1DKGD 2VYPA 3M8RA 2RPIA 1VQ4N 3CYMA 3L3UA 3SQ1A 3QERA 4ELVA 4CFCA 4BG8A 5CYQA 4E72A 1W2BM 1JCFA 1QQNA 1MR4A 3AA5X 4IZ9A 4YHHK 2OCEA 4CJLA 4WYBA 1OH8A 4CQKA 3H46O 3QEXA 2LY5A 1VSIA 3CPEA 4CHYA 4MFBA 2Y1IA 1S22A 4N47A 4PA1A 4R5PA 4O0IA 5J2MA 3K5MA 5C24A 4B1VA 2NY8X 3SCXA 2GMOA 4A5AA 4DWIA 4KI4A 4BROA 4PY5A 4JKGA 2HSTA 2M8BB 4NXNK 2HNZA 4O8KA 4CZHA 3PY8A 5KGXA 3U3YA 1VSDA 1U4BA 3HSCA 3EZ5A 1BK8A 2NRVA 3RRHA 3PSFA 1SKWA 2WC9A 1WSIA 3ZSVA 5BR8K 2LN8A 3EKSA 3LPTA 4CGGA 4DQQA 1QSLA 1BRZA 3KJVA 4E7JA 2P9PB 1QVFM 4NCBA 1N34K 5FPEA 1BG3A 1SN1A 4IWVA 2DTUA 4ZTFA 2YI1A 3D45A 3NH0A 4CW7B 3BGRA 1NNEA 3VQ7A 3RMAA 5AQGA 3W0LA 4BRLA 4YOTA 3VGKA 1J5OA 1BHLA 3E66A 4GMJB 4AB0A 3LPUA 3QNOA 2ZE2A 4YORA 3RMBA 3IDHA 4AHRA 4KREA 3Q7BA 1C1BA 4CCHA 3MX5A 1EP4A 1RDCA 3KWGA 2VWJA 4B3RK 4CJUA 1RCHA 5HRPA 2O8FA 3CCUN 3T7ZA 1VRTA 4G1QA 3KC6A 3SUPA 1TV6A 3L8BA 2Q2RA 4DQ8A 2HB5A 3SQ2A 4WCEL 3G6EN 3GBTA 3MDQA 3R3LA 1ZBUA 3OBWA 5HBMA 3QI7A 3ATVA 1V4TA 2V7YA 3AVBA 4DB3A 3U4LA 1YVUA 3CPWM 1WBDA 3DWLA 5AQUA 3NF6A 4X64K 1VQLN 1LW2A 4C1NI 4F8RA 4DV7K 2W40A 3HOSA 1HLUA 3V9XA 2P9LB 4JHDB 2HOEA 3LP2A 3NE6A 3LZJA 5C42A 2FSJA 4H5RA 3M8PA 4DFJA 1MYNA 4ZTJA 4BRIA 4EAHD 3CC4N 3QIOA 2OTLN 1C0TA 4IG0A 1L5UA 3I33A 1X1PA 2F9WA 2KSKA 1NK6A 4BRFA 2GBZA 3QO9A 3HXMA 4FXDA 1LQIA 3OW2M 2Z1JA 2G8UA 3AVLA 2A6AA 1UOCA 4DCHA 5AZJB 3VQ8A 4JNEA 3I56N 5LL6Z 4UADE 2XRIA 1T0ZA 4CEDA 3S5TA 3DJCA 3HT3A 4JLHA 2A40A 2V51B 1C55A 1UA0A 1XMQK 1HNXK 4CGIA 5EY4A 1DJTA 1C6VA 3DMJA 4GW6A 5FRNA 2D0CA 3R6MA 4B9VA 1DLOA 4RWTA 5C2FA 1RDAA 4FJJA 3ZT0A 3VENA 3AVCA 5AQWA 4KAZA 3RTVA 3M6GA 3VQBA 3NH1A 1WUAA 4DTUA 2YNHA 3LZIA 2BH1A 3PLAA 1WWNA 4FZYA 4NXMK 3VQ9A 1LWCA 2NRRA 1B92A 4DTOA 4B9LA 2P1JA 4WQ4C 1NK0A 2QWNA 2D4WA 2YHAA 3ZSQA 4FWKA 4JD2A 4GKKK 4RW9A 1Z25A 4BR9A 5IWAK 4WF9L 3PO5A 3T19A 5ADXA 3HP6A 3G4SN 1K73O 3KD5E 1JXCA 4JKAA 3DYAA 1NK8A 4FJ5A 1SEGA 3AA3A 3LDSA 4AAZA 2YHYA 1YJ9N 4ISGA 3CJ1A 3E1YA 4JK8A 5TKWA 1I6GA 4MLEA 1JLBA 4DTJA 2HMIA 1XNRK 4M3UA 3J7AP 3VQQA 2P9SB 1L3SA 2F8SA 2ASMA 4AHTA 3F73A 2E5LK 1TK0A 2KFNA 4CHQA 4OVLA 3U9ZA 4DV5K 3GE1A 4W5NA 1T44A 3AO3A 3DI6A 4YOWA 4BE0A 2O8CA 3L3VA 3A0IX 4RTFD 1QQCA 4DU4A 1SV5A 1KAYA 4B1UB 5BREA 1WAJA 3C6UA 3KP1A 4KRFA 3O4QA 4NYNA 1NJIO 1T6DA 1T7EA 1WAFA 3VA3A 3L2QA 3ZYYX 4DV6K 3V4IA 3MEEA 4AHVA 1S5JA 4DHYA 3NCIA 3T1YK 5DM6L 2H3GX 4ISEA 4Y0WA 1SL2A 3LL3A 4J2DA 1TAQA 2P9KA 4CEOA 1BA1A 4HWIA 4BC5A 1L3TA 3RR7A 1XNQK 1RDDA 3THYA 2UUAK 4J8FA 4M3XA 1NRAA 2E4LA 3IS9A 3NVKA 1B7DA 3C95A 4I2QA 4ILGB 2QKBA 1KRPA 2NNWA 2YHXA 4I9QA 2O8EA 1C56A 4CFDA 3KLGA 3I55N 5KQDA 1MWKA 2KBJA 4JI3K 3KLEA 3CI5A 4B3OA 4EP5A 3L2VA 1KV0A 3UB5A 1XMOK 4M3RA 3UE5A 1Y64A 3AVFA 4IEIA 2C1GA 1NOYA 1NPIA 3RSEA 3PX4A 1BA0A 1NGGA 2AP1A 1HKBA 2QWLA 2GL1A 2HNDA 2NRZA 1SAZA 3VEOA 4B3MK 1ZBLA 1BOTO 1U49A 4H4MA 3WQTA 4UY8O 4NCGA 1O13A 2X74A 4B9MA 4BWMA 4FJKA 1A5WA 4H5NA 4EZ6A 1ASVA 4DSEA 2Q0UA 1WLJA 1U2VA 3R2VA 2KFZA 3CJ7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QHA A;  3CC7 N;  4HE7 A;  1MU2 A;  4DUY K;  1TVR A;  2G8K A;  1IH7 A;  3N4Q A;  5BR9 A;  2IVN A;  5BN9 A;  1C1C A;  4CHP A;  3OY9 A;  1OVQ A;  4FK0 A;  1RT7 A;  3AAR A;  4CJ5 A;  4LF8 K;  1BIS A;  1IKX A;  2O4G A;  1ILY A;  1ZUT A;  1BCG A;  1FW6 A;  3ULE B;  5FDL A;  4CJP A;  1ZBF A;  3D2E A;  1DKG D;  2VYP A;  3M8R A;  2RPI A;  1VQ4 N;  3CYM A;  3L3U A;  3SQ1 A;  3QER A;  4ELV A;  4CFC A;  4BG8 A;  5CYQ A;  4E72 A;  1W2B M;  1JCF A;  1QQN A;  1MR4 A;  3AA5 X;  4IZ9 A;  4YHH K;  2OCE A;  4CJL A;  4WYB A;  1OH8 A;  4CQK A;  3H46 O;  3QEX A;  2LY5 A;  1VSI A;  3CPE A;  4CHY A;  4MFB A;  2Y1I A;  1S22 A;  4N47 A;  4PA1 A;  4R5P A;  4O0I A;  5J2M A;  3K5M A;  5C24 A;  4B1V A;  2NY8 X;  3SCX A;  2GMO A;  4A5A A;  4DWI A;  4KI4 A;  4BRO A;  4PY5 A;  4JKG A;  2HST A;  2M8B B;  4NXN K;  2HNZ A;  4O8K A;  4CZH A;  3PY8 A;  5KGX A;  3U3Y A;  1VSD A;  1U4B A;  3HSC A;  3EZ5 A;  1BK8 A;  2NRV A;  3RRH A;  3PSF A;  1SKW A;  2WC9 A;  1WSI A;  3ZSV A;  5BR8 K;  2LN8 A;  3EKS A;  3LPT A;  4CGG A;  4DQQ A; 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