1NGI | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
total genus	122
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngiA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngiA04

3EO3A 3VEWA 1ESVA 3BUZB 1GLEG 4CZIA 4HWIA 3VEXA 1NGCA 2V52B 4QS9A 2YCHA 3MMVA 4B1XB 1HKGA 3UB5A 2BUPA 3BP8A 3CQXA 4H5VA 3HM8A 3ATUA 4K42A 4DQ8A 1HPMA 3M6GA 4BRQA 2IIRA 3HI0A 3MDQA 4B1UB 2FXUA 5KQDA 1R59O 4L3QA 4H0VB 1E4GT 2CGKA 3SJHA 1NGEA 1NM1A 4BRNA 3DXMB 3D2EB 5ADXA 3DXMA 1K8KB 2YI1A 2IVPA 4MO4A 5EVZA 1GLJO 1NGJA 4BR2A 3AARA 1ZC6A 5AR0A 2AP1A 3IMXA 3WXLA 3HBTA 4H5NA 3AAPA 1NWKA 5AQHA 4K41A 1MDUB 3QMLA 2HF3A 3VGKA 2GELA 3R6MA 2W41A 3UKRB 2PAVA 1U2VA 2IVNA 4FWNA 3A8YA 2CGLA 3A5MC 2P9IA 3VGLA 1SQKA 3HSCA 5F2RA 3EZWA 2ZWHA 1QHAA 3VEVA 3FGUA 3VF2A 5KPTA 3MCPA 3U9DA 5BRHA 1XUPO 1DKGD 1P8ZA 3GE1A 4M7XA 3WQTA 3WQUA 5LJWA 4EHUA 2QM1A 4BQLA 3DXKB 3H6EA 1ATNA 4PL8A 2P9NB 4YDUA 3DJCA 2P9NA 1KAYA 5CE3A 3FZKA 1KXPA 1GLFO 2GTDA 3QB0A 4XH1A 5AQXA 1GLLO 5BN8A 2P9LB 1H1VA 5AQUA 3GOIA 3WUHA 3CJAA 3IFRA 2PBDA 2HOEA 3S41A 3WEEA 2FF3B 1WOQA 2E1ZA 2QWLA 1X3NA 2CH6A 2YHWA 4CZLA 4XEIA 1QZ5A 2NLXA 3WXJA 5BR9A 4BVOA 5F1XA 4EIAA 3FE1A 1HKCA 1DGKN 3U9ZA 2EWSA 4IJAA 1CZAN 4FPAA 3VESA 3BF3A 5AQSA 3I8BA 2A6AA 3ZX3A 2E8AA 5FPDA 4K43A 3CETA 4BRHA 1NMDA 2E2QA 2W40A 1YAGA 2Q0RA 3EN9A 1BG3A 4EHTA 3CQYA 1ZXOA 3GDQA 4XH4A 4LC9B 1JCFA 4NB4A 5EY4A 3C0BA 3DAWA 1T6CA 2HMPA 1S3XA 4A62A 2ZGYA 2VCPA 2QWOA 4QS7A 4BG9A 3FR0A 4CJ7A 4M63C 4BG8A 1NGDA 4H5TA 5E84A 2GWJA 3LM2A 4CZJA 2Q36A 5AQJA 2P9KA 3TU5A 2CGJA 2P9KB 3ENOA 4H03B 3DXKA 4H0OA 5KPRA 1HLUA 5FPEA 1QQOA 2ASOA 1QZ6A 2I7NA 3QICA 4A2BA 3J8AA 4WYBA 5BRFA 4YDUC 3CIPA 4GNIA 2QW9A 1KAZA 2A40A 3FZMA 4BC4A 1GLAG 3A5LC 3DWLA 4CZMA 1BUPA 4EFHA 4H5RA 2BTFA 4FWPA 4BRFA 1Z6RA 2Q1NA 2F9WA 2ZGZA 2YJEA 3EL2A 4QS8A 3EKUA 5AQMA 5AZIA 5JLHA 5AZJB 5AQIA 3LL3A 4B1WB 4BRMA 3BEXA 1SAZA 2P9PA 3FZLA 2E88A 3QFPA 4BR4A 5AQLA 5AFUH 3VEZA 1QQMA 3VEYA 4BRKA 1IJJA 1IG8A 2Q2RA 2E2NA 3L0QA 3ZEUB 2GWKA 5LJVA 3WEEB 5AQVA 1ATSA 3ZEUA 2E2PA 4IXCA 3MN7A 4RWTA 3BF1A 4BC2A 2E1YA 4EAHD 2P9PB 3UKUA 3KHYA 1XC3A 3ULEB 3O8MA 1RGIA 3LDPA 3ID8A 4BC5A 2P9SA 2V7YA 3LDQA 4KBOA 4H0XB 3H46O 4AM6A 5EXWA 4BRGA 4CBUA 5BRDA 3LM9A 1HJOA 5AQNA 2A41A 4RTFD 3G25A 5EOYA 4CZEA 5E26A 1BDGA 4BVPA 1SZ2A 1QQNA 3CJ1A 5AQOA 4A2AA 1J6ZA 3MK6A 3OHRA 3MN9A 3QFUA 3VPZA 5F0XA 4FWQA 4DCHA 3RSEB 1ATRA 4BQZA 3JXUA 2Q97A 4O8KA 4BR0A 2FF6A 4IJNA 5TKYA 1BO5O 1S22A 3KZBA 3U4LA 2V51B 1Z05A 1HUXA 4BR5A 4BGAA 2D1KA 1U6ZA 5ELZA 3CI5A 3H1VX 3O08A 4MLEA 2VWBA 4HTLA 4Z94A 2GEMA 4E1JA 3M1FA 2P9UB 4PKIA 4ISGA 2FSJA 3IUCA 3R8EA 1MWMA 5EX5A 3QBWA 1DEJA 2OANA 1EQYA 3QDKA 3MN5A 1V4TA 2D4WA 3FFKB 4BRLA 2AA4A 1BWFO 2KHOA 3CJCA 1X9JA 4C23A 4CBXA 4BRPA 3UKRA 2P9UA 3P4IA 2DPNA 5B8HA 2P9IB 3JS6A 4IZ9A 3W3DA 3ZETA 3FZFA 1T6DA 3ZETB 1YVNA 4BRCA 3O5BA 5BPNA 2D0OA 2NZTA 3D2FB 1V4SA 3HZ6A 4WQ4C 4H0PA 3VEOA 2QWPA 3VF4A 1E4FT 2E2OA 3H1QA 1NGFA 5BPLA 3O80A 4AM7A 1BU6O 4BC3A 3A5NC 4FWLA 3A0IX 3WXIA 5I9EB 3H3NO 5AQZA 1NGIA 3VGMA 3CJ9A 3WXKA 3ZX2A 3VENA 5ADXH 3CHWA 3AY9A 3GG4A 4RCHA 3AAQA 4JAXA 3O6WA 1X3MA 1TUYA 3KVGA 2P9LA 5AQTA 4I6MA 4BR9A 4WQ5C 4XH5A 3RSEA 2J4RA 3VOVA 5AQYA 4PL7A 5JLFA 1ZBSA 3VETA 3FZHA 3O1BA 1NGGA 4FL9A 3QBXA 3GL1A 4JHDA 1BOTO 2CH5A 2YJFA 3CERA 4PKHA 3U8XA 2FSKA 4BREA 3UKUB 4FOIA 5BN9A 5AQRA 4FWMA 2QWNA 2QWMA 1GLDG 2GUPA 3R9PA 3WT0A 1C0FA 2YHYA 4CI6A 3D2EA 5FPMA 1TYQA 4WQ4A 1K8KA 4NO7A 2Q0UA 3ENHA 4J8FA 1HKBA 4H0TB 5AFUA 5AQKA 3W0LA 5AQPA 5LY3A 4M7YA 1BA0A 4MO5A 3SK3A 1GLCG 3SMSA 3UE5A 4JD2A 5KQ8A 3FLCO 3CJ7A 4JNEA 5AQFA 5KPZA 1OKJA 4H5WA 4FWSA 3SLCA 4IWVA 4F9OA 1TUUA 4WQ5A 1BA1A 4IO8A 1YXQA 3TPQA 4DB3A 1KAXA 3GBTA 1HX1A 3CJBA 3LDNA 2UYTA 2VYPA 4BRAA 4BR7A 1LCUA 1D4XA 1NGBA 1XQSC 4O5FA 1NBWA 2QXLA 2FSNA 2V7ZA 4A61A 4CZHA 1U2VB 4CZGA 1LOTB 2D0PA 1YUWA 3O4WA 3ZX0A 1WUAA 5AZJA 1RDWX 4BROA 4FSVA 2H3GX 2IVOA 3A5OC 4FWOA 3L6QA 5FPNA 3IDHA 3D7EO 2Q31A 4Y0WA 1T44A 3L4IA 2ASMA 3MN6A 5JMVA 2F9TA 5BREA 3F9MA 2YHXA 4FWRA 1NGHA 3H45C 3EKSA 4B1YB 4BRIA 1MA9B 1RFQA 2WUSA 4ISEA 4CD3A 5AQQA 4GY2B 3HTVA 3LDLA 3SMPA 3ATVA 3VF6A 4CD1A 1MWKA 4JN4A 2NRHA 4PKGA 1NLVA 5AQGA 3H3OB 2A5XA 4FOEA 2ITMA 4BRDA 5JICA 4ISFA 3O1WA 2P9SB 4BGBA 2ZF5O 3LDOA 3B8AX 1Q18A 1C0GA 5AZIB 5BPMA 2ASPA 4B1ZA 2A3ZA 2HF4A 4DHYA 1JCGA 3D2FA 4K25A 4FO0A 2QWQA 4JD2B 4MLHA 2FLOA 4I6MB 4B1VA 4CBWA 3ULEA 4H0YB 4CZFA 4FWKA 3VERA 1GLBG 1NGAA 1TYQB 1Y64A 1G99A 4CZKA 3C7NA 2QWRA 2E20A 2A42A 4FPBA 4B9QA 3I33A 3C7NB 1JCEA 5AQWA 2I7PA 3M3ZA 4JHDB
chains in the Genus database with same CATH superfamily

3EO3A 5D3GA 4FYDA 1ESVA 5FDLA 1VSFA 1NGCA 2YCHA 4Z4GA 3DRRA 4DR7K 3HVRA 1X1PA 1PX9A 4AQYK 1BCGA 1YTUA 3HM8A 3ATUA 4K42A 3KLHA 1HPMA 4BRQA 1CXQA 4HUEA 4B3RK 1MR4A 3M8QA 5C2DA 1TK8A 4QCLA 4W5NA 1E4GT 3O4NA 3SJHA 3THXB 4BRNA 3KLEA 4JI8K 3DXMA 2O8BB 4DTPA 5EVZA 1EX4A 1NGJA 3U3YA 2XY8A 2HBKA 2QI2A 1TK0A 3QEWA 5AR0A 3RMDA 2AP1A 3IMXA 1P90A 3HBTA 2KTQA 1NWKA 3DLGA 4B9NA 2NRVA 3SUNA 1WAJA 3KP1A 3O9UA 3QMLA 2HF3A 2O8EA 5J1EA 1JLBA 1QVFM 1U2VA 2RN2A 3A8YA 3AA4A 4FJLA 3V1QA 3AO3A 3NBPA 3EZWA 4FW1A 3VEVA 3FGUA 4KHUA 3HOSA 2LY5A 3J80O 4JI4K 4IKFA 3NAEA 3WQUA 5LJWA 1NE5A 5HBMA 2E3FA 3QNOA 2G8IA 4FJ8A 2P9NB 4YDUA 3O9QA 2LR3A 1Q7YO 4YY3K 4JS4A 4GVMA 4DF8A 2WONA 4CQKA 2F4VK 5BN8A 1ZBIA 3Q7BA 2PBDA 4CGIA 3WEEA 2PY5A 1RT1A 1G15A 4IOXA 5M1PA 1JZBA 1YF5L 3MCAB 4FZYA 3CCRN 1ASUA 4I2QA 3WXJA 4BVOA 5F1XA 4JLHA 4LH5A 5C42A 4MDBA 1SS6A 1I2VA 5GINA 3I8BA 4OPJA 3K2PA 4LF8K 1KD1O 2W40A 4CCHA 1BQMA 3DM2A 3ZT4A 3GDQA 4XH4A 2O8DA 4LC9B 3MXIA 1RNHA 4NB4A 4OX9K 1WSIA 3V4IA 1T6CA 4IEEA 4BG9A 2HHUA 2YNFA 4CJ7A 4Z0UA 1NH5A 5E84A 1UA1A 4DLEA 2CGJA 5KRTA 2WTUA 5KK4A 1C1BA 5CYMA 1VRTA 3DXKA 5FPEA 1WSHA 3MX5A 1IH7A 2IDOA 4Q5VA 3J7AP 2I7NA 2NY9X 4A2BA 3BGRA 3LWMA 4WCEL 3TSQA 2NRTA 3CIPA 1SL1A 4GNIA 2RF2A 1NG9A 4WE1A 4EP5A 4KTWA 5JS1A 1UAXA 3DWLA 3KIOA 2E6MA 4H5RA 2BTFA 4HTUA 3THYA 2XY5A 5HROA 4BRFA 3QNNA 3RMCA 4MDAA 5C10A 4I9QA 3KK7A 3P83D 3LPUA 4W5TA 3BZKA 4FXDA 2XY6A 2YHAA 5AQIA 4K8ZA 4CGJA 1SAZA 4CFAA 3QFPA 4BR4A 1QTMA 4FJIA 1CZBA 4HHTA 4IDKA 1IJJA 2Q2RA 4YHHK 3L0QA 2W6LA 4ILJA 2E2PA 4B8AB 4CJSA 4AAZA 1RT2A 3MN7A 3CPWM 4KH4A 3U3GA 3V9XA 2E1YA 3VQQA 4JKFA 4RW9A 3CYGA 3K59A 2MBKA 1JL1A 3OYJA 1IBKK 2P5OA 3O8MA 1RGIA 3CM5A 3LDPA 3QEIA 2V7YA 3LDQA 4H0XB 3LAKA 4CJTA 1VQ7N 5AQOA 3ISNC 5CZ2A 4BDPA 3RRHA 3MK6A 5M1OA 3ULDA 2KBKA 3SQ1A 4JI7K 1NK5A 1RT6A 1ATRA 1SN4A 4BQZA 3EZ5A 3BDPA 4IJNA 4PUOA 3U4LA 3VTHA 1N36K 4C8KA 4BGAA 4FJ5A 4H4MA 1JXBA 3CI5A 4LFAK 2ZD1A 3O08A 2OTLN 4CECA 1X9SA 2RHKA 3LP2A 3L2UA 4E1JA 3K5LA 3LP1A 5C25A 1YJWN 4H4OA 1W2BM 1MWMA 5I3UA 1KVAA 2DFEA 1DEJA 3OYMA 4FK0A 1PE4A 4JK7A 3MN5A 1C0UA 3PIOL 1KFSA 1QQCA 2AA4A 1BWFO 4EZ6A 1RT4A 3CJCA 3AV9A 2Q3SA 3NGYA 4UAFE 4O0JA 4FJMA 1JL2A 3TTDA 1C0TA 5DM6L 3VA0A 2P9UA 4DTOA 2YKMA 4CJVA 1T7AA 1S6PA 3VQ6A 1ZUTA 4BE1A 3JS6A 1L3TA 4DFPA 2JLEA 4BRCA 3ZCMA 3O5BA 1QS4A 1FK9A 2ZQBA 1V4SA 4DV5K 3HZ6A 4M42A 1RDUA 1S9GA 1RTDA 1KC8O 1NGFA 1BU6O 4E7JA 4FJ7A 2BE2A 1YT3A 1WMTA 3R1XA 4FK2A 3WXKA 5E41A 3ZX2A 1W0HA 1U45A 4KHWA 1OH6A 4RCHA 3AAQA 4ILGB 3GKUA 1X3MA 3V1RA 1SL0A 1TUYA 2P9LA 3F5TA 4CIFA 4I6MA 4XH5A 5C12A 3S3MA 3SI6A 1OZZA 2J4RA 5GIPA 3K0SA 4DTSA 3E01A 3VETA 4YORA 3O1BA 3QEPA 4FL9A 3QBXA 4FVUA 2GV9A 3J7ZO 3CERA 4PKHA 3SQ0A 2FSKA 4BREA 3UKUB 1FH3A 5AQRA 1HNVA 2Y1IA 2D56A 3CCEN 1JJ2M 3PUFA 3WT0A 4CI6A 4AEIA 4KFBA 3KK1A 4WQ4A 1K8KA 4F4KA 4CK2A 1GPSA 2Q0UA 3ENHA 1NJYA 3KP0A 1YVUA 3DRPA 1OMYA 4E1NA 2X6SA 4JD2A 2YNIA 2G8HA 4JNEA 5KPZA 1Q9YA 2LJ7A 2XHBA 4F9OA 4IWVA 4CJFA 4GV3A 1YXQA 3AVIA 2FBTA 1OH8A 3ZSZA 3OYDA 3GBTA 4N41A 4DQIA 5GAEP 3NGIA 1XMQK 3CF5L 4CHYA 3AVCA 3OS1A 4M41A 3H08A 1NGBA 4CFBA 1SV5A 2G8UA 3T69A 2HBJA 1BGXT 3VQBA 2YIOA 4F2SA 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3KLGA 4KHQA 2UUAK 3SNNA 4RW4A 2W41A 4FM0A 4FWNA 3V9ZA 2G8VA 4E3SA 4DQPA 2P9IA 4C8OA 2HBLA 4KHYA 3I0SA 1RBUA 3VF2A 4CW7B 3MECA 3MCPA 2O8EB 5BRHA 1XUPO 1DKGD 1S1XA 2ZJQL 4C8MA 3WQTA 3TR8A 1DTTA 3SCXA 4KAZA 3L2VA 4BQLA 4GVEA 3DXKB 1TKDA 3B6PA 3O9SA 5SZTA 2F8SA 1I39A 3IRXA 4CFCA 2HHXA 1KAYA 3FZKA 4CEOA 2E5LK 3MXJA 4OVLA 3LP0A 5M1QA 1TKXA 1SKWA 2P9LB 3V1OA 4IG3A 4CF2A 4DSJA 2F7TA 3ID6A 3TABA 3IFRA 2HOEA 4DR2K 3S41A 3DLKA 3HM9A 1WOQA 3VQ4A 2QWLA 4AH9A 4GKJK 3OTOK 4CF1A 2ETJA 4CZLA 1QZ5A 1FXXA 3CYMA 3TTCA 3SJJA 4EIAA 2MN5A 3FE1A 2BDPA 3AA2A 5LL6Z 1DGKN 1U49A 4IJAA 4ELVA 1RT7A 3P5JA 1P0AA 4KV8A 1A5WA 1VSHA 1WWNA 2A6AA 4KTZA 2E8AA 3D6RA 4HCBA 2HSTA 4BRHA 4JKGA 1NMDA 2E2QA 4LFBK 1TKZA 2Q0RA 3EN9A 1BG3A 4YFUA 1ZXOA 1W97L 1N6QA 5KGXA 1JKHA 4A57A 5HP1A 2O8FB 3QETA 1JCFA 3AA3A 3CCMN 5EY4A 4GMJB 2HMPA 1VQ9N 2ZGYA 2VCPA 2QWOA 4QS7A 3EEQA 5IWAK 4RG8A 3VQCA 3OYEA 4CGHA 1I6FA 3TU5A 2P9KA 4FZZA 3M8SA 1MU2A 2Z1HA 1I94K 3NDKA 2WFBA 1AHOA 5SWMA 3VA3A 3NE6A 1QQOA 3JAMO 3QICA 3KK3A 2VWKA 2FC0A 4WYBA 5FRNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EO3 A;  5D3G A;  4FYD A;  1ESV A;  5FDL A;  1VSF A;  1NGC A;  2YCH A;  4Z4G A;  3DRR A;  4DR7 K;  3HVR A;  1X1P A;  1PX9 A;  4AQY K;  1BCG A;  1YTU A;  3HM8 A;  3ATU A;  4K42 A;  3KLH A;  1HPM A;  4BRQ A;  1CXQ A;  4HUE A;  4B3R K;  1MR4 A;  3M8Q A;  5C2D A;  1TK8 A;  4QCL A;  4W5N A;  1E4G T;  3O4N A;  3SJH A;  3THX B;  4BRN A;  3KLE A;  4JI8 K;  3DXM A;  2O8B B;  4DTP A;  5EVZ A;  1EX4 A;  1NGJ A;  3U3Y A;  2XY8 A;  2HBK A;  2QI2 A;  1TK0 A;  3QEW A;  5AR0 A;  3RMD A;  2AP1 A;  3IMX A;  1P90 A;  3HBT A;  2KTQ A;  1NWK A;  3DLG A;  4B9N A;  2NRV A;  3SUN A;  1WAJ A;  3KP1 A;  3O9U A;  3QML A;  2HF3 A;  2O8E A;  5J1E A;  1JLB A;  1QVF M;  1U2V A;  2RN2 A;  3A8Y A;  3AA4 A;  4FJL A;  3V1Q A;  3AO3 A;  3NBP A;  3EZW A;  4FW1 A;  3VEV A;  3FGU A;  4KHU A;  3HOS A;  2LY5 A;  3J80 O;  4JI4 K;  4IKF A;  3NAE A;  3WQU A;  5LJW A;  1NE5 A;  5HBM A;  2E3F A;  3QNO A;  2G8I A;  4FJ8 A;  2P9N B;  4YDU A;  3O9Q A;  2LR3 A;  1Q7Y O;  4YY3 K;  4JS4 A;  4GVM A;  4DF8 A;  2WON A;  4CQK A;  2F4V K;  5BN8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1NGIA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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