1NGI | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	b'GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus	122
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngiA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngiA04

3GE1A 4IJAA 3IDHA 3EKSA 3ENOA 4XEIA 4BRCA 4EHTA 4YDUC 4A2BA 1E4FT 3WEEB 2FXUA 1WUAA 2P9KB 4ISEA 4K41A 5AQGA 4O8KA 5FPMA 1H1VA 2P9UA 1QZ5A 4BQZA 1RGIA 4LC9B 1Z05A 2Q31A 1T44A 2P9LB 2ZGYA 3IMXA 3R6MA 1T6DA 5AQWA 4RTFD 2CGKA 2AA4A 1JCGA 1ZXOA 4J8FA 2A5XA 1KAYA 3CHWA 3ID8A 2H3GX 2D0PA 4BR4A 3WUHA 3VEYA 2A41A 2HMPA 2ASMA 1NLVA 4E1JA 4BRGA 1WOQA 5F1XA 3D2FB 2PAVA 4BC2A 4EIAA 2Q2RA 3H3OB 2J4RA 5AQOA 5AQZA 5EXWA 3MMVA 3VOVA 5AQLA 2E2NA 2A6AA 1BU6O 5TKYA 1NGJA 2P9IB 5AZJA 4FWKA 4CD3A 3ZX2A 3MCPA 3DAWA 4F9OA 2QWRA 4PKHA 1Z6RA 2HF4A 2V51B 1NBWA 3VETA 1BDGA 2QXLA 4PL8A 4A62A 2ASPA 3QICA 1LCUA 3O8MA 2ASOA 4CZLA 4ISGA 3ATUA 2Q0UA 3UKUB 3IUCA 1BA0A 3ULEB 3MDQA 4Y0WA 3OHRA 3QFPA 4BGAA 3VPZA 5AR0A 4BRFA 4H0TB 2FSKA 5AQXA 1BG3A 3QFUA 1TUUA 3CJBA 4B1ZA 3MK6A 3CJAA 4JHDA 4DHYA 3CI5A 2P9PA 3C7NB 4K43A 2BUPA 3R8EA 4FO0A 4BRAA 4BVPA 3SJHA 3D2EB 1RDWX 4CZMA 4MLHA 1HUXA 3VGKA 1U6ZA 4BG9A 4NB4A 5AQVA 2CGJA 4AM6A 3CJ9A 1SQKA 2D0OA 1NGGA 1NGFA 5E26A 2GTDA 1SAZA 5BRHA 3A5OC 3L4IA 1QQMA 4CZKA 1NM1A 3I8BA 5EVZA 1MWMA 3H1VX 1GLAG 5EOYA 4JN4A 5E84A 2YHWA 5I9EB 1HKGA 2BTFA 3AAPA 3A5MC 4H0XB 3HM8A 1IG8A 3WXIA 4MO5A 3A8YA 5KPRA 3VF4A 1SZ2A 2E2OA 3QB0A 1U2VA 3HZ6A 5F0XA 4BGBA 4BR5A 1NMDA 5AZIB 3C0BA 2NZTA 1X3NA 2E2PA 1V4SA 3MN7A 3IFRA 4BR2A 4HWIA 5AQFA 1RFQA 3UKRA 2QWQA 2NLXA 3O1WA 3VEVA 1YXQA 4Z94A 4CBWA 1MDUB 4FPAA 3ZETB 4NO7A 3FZKA 4A2AA 3JXUA 3TU5A 5ADXA 4JD2A 1K8KB 3BF3A 4IXCA 5KQDA 5BREA 4BREA 3A5LC 4YDUA 5KQ8A 2FSNA 2F9WA 3DXKB 3LL3A 4FWPA 1TUYA 5ADXH 1GLDG 1Y64A 3WEEA 3CQXA 2P9KA 1R59O 1TYQB 3H46O 1GLLO 3DXKA 4QS7A 1NGBA 2V52B 2CH5A 4FWOA 3ATVA 5AQYA 1GLBG 3CQYA 4BR0A 3LDPA 4CZHA 3SMSA 4MLEA 2IVNA 3CJ1A 2P9LA 2Q97A 1NGIA 3QMLA 5FPNA 1DEJA 3H6EA 5BPNA 5JLHA 4BRHA 3HSCA 2V7YA 1P8ZA 4H03B 2FF6A 3GG4A 1BUPA 3RSEB 1XQSC 2QWNA 5AQIA 2IVPA 5AFUA 1OKJA 3D2FA 4I6MB 3HTVA 3VF2A 3W0LA 3BF1A 4B1YB 2YI1A 4GY2B 4H5VA 3AAQA 4M63C 1QHAA 3LM9A 3HI0A 3CETA 1GLCG 3DXMB 3L0QA 2AP1A 4HTLA 2P9IA 4H0VB 4K25A 2QWMA 3DXMA 3MN6A 3M3ZA 3LDQA 2NRHA 3AARA 3WXJA 5FPDA 4BRNA 3LDLA 4B1XB 3F9MA 1HLUA 3A0IX 4FWQA 3GDQA 5JLFA 1J6ZA 3LM2A 1QZ6A 4XH4A 3UKUA 5ELZA 3ULEA 4FSVA 2P9NB 3S41A 4IO8A 3M1FA 3CIPA 3DJCA 2Q1NA 4FOIA 5LJVA 2E1ZA 5AQRA 4H5NA 3VESA 1HKBA 4FPBA 2Q0RA 4BRLA 1ESVA 3C7NA 4BQLA 2D4WA 3SK3A 2W40A 3D2EA 1NGDA 3FZMA 4A61A 1GLFO 3VENA 2E88A 3VEWA 1DGKN 2ITMA 4WYBA 2F9TA 1NWKA 1LOTB 5JMVA 3MN9A 2ZF5O 3QBWA 4L3QA 2HF3A 4PKGA 1ATNA 3ZEUB 5AQJA 1YAGA 3AY9A 1E4GT 1HKCA 4FWMA 4WQ5C 4BC4A 4DCHA 4H5TA 4WQ5A 1XUPO 3VEOA 3LDOA 3CJ7A 4BC5A 3M6GA 2P9SB 3O80A 1X9JA 1DKGD 3FZLA 5AZIA 1HJOA 2QW9A 4BG8A 4BVOA 5AQNA 1S22A 3SLCA 3FZHA 2A40A 3A5NC 3BP8A 3W3DA 4CI6A 4RWTA 3O08A 2KHOA 4XH1A 1NGCA 1GLEG 4M7YA 3ZETA 5BN8A 3D7EO 1NGAA 2I7PA 1T6CA 2ZWHA 1K8KA 2FF3B 3B8AX 2E8AA 3DWLA 4DQ8A 1IJJA 3H1QA 2QWPA 3EO3A 4RCHA 1KAZA 5LJWA 1JCFA 3WXKA 1KXPA 1TYQA 2A3ZA 2QM1A 4CZEA 3R9PA 3U4LA 3CERA 4CBUA 3WXLA 3WQUA 4ISFA 2YCHA 2P9UB 1BA1A 5AQHA 1MWKA 4H0YB 4CJ7A 5EX5A 3BEXA 2OANA 3VERA 1XC3A 4BRDA 1BOTO 1ATRA 2VCPA 2FSJA 2A42A 2HOEA 2I7NA 4WQ4C 1QQOA 4M7XA 2D1KA 4WQ4A 3EL2A 1YVNA 5AQQA 3ENHA 1MA9B 3GOIA 2WUSA 3RSEA 2ZGZA 2GWJA 3WQTA 2E1YA 5BRFA 1BWFO 5AFUH 1HPMA 4I6MA 1ATSA 5KPTA 4FWSA 2YHXA 2VYPA 4BRKA 3JS6A 4EAHD 1D4XA 5BN9A 4K42A 4B1UB 1KAXA 2E2QA 5B8HA 3TPQA 3ZX3A 3MN5A 3UB5A 2GEMA 4XH5A 2W41A 2QWLA 1ZC6A 5BR9A 3FZFA 2E20A 2YJFA 4JNEA 3I33A 1GLJO 3FE1A 5AZJB 4EHUA 5AQUA 5EY4A 4FL9A 1BO5O 4QS9A 5FPEA 3QBXA 4MO4A 3L6QA 1G99A 2IVOA 4DB3A 4IJNA 2EWSA 3O1BA 3FGUA 4GNIA 3UE5A 1QQNA 2P9NA 1X3MA 4O5FA 3U9DA 4BRPA 3G25A 4CZFA 5KPZA 4FOEA 4KBOA 3O5BA 4B1VA 2PBDA 3QDKA 1HX1A 4JHDB 3VEXA 3GBTA 3H3NO 1S3XA 4AM7A 2P9PB 1CZAN 3BUZB 2GELA 4FWLA 2V7ZA 4BRQA 5CE3A 4H0PA 5AQPA 2YHYA 4H5RA 5AQTA 3KVGA 2DPNA 2YJEA 1V4TA 3FR0A 3KHYA 2UYTA 3LDNA 4H0OA 3U9ZA 4PKIA 2GUPA 4CBXA 3WT0A 1YUWA 3CJCA 5BPLA 1Q18A 3ZEUA 4BRMA 4CD1A 3EKUA 2FLOA 4CZGA 3U8XA 4IWVA 3O6WA 5LY3A 4IZ9A 4JAXA 2P9SA 5AQMA 3GL1A 4FWRA 4BR7A 1U2VB 1EQYA 4BROA 3O4WA 2Q36A 2IIRA 4C23A 4EFHA 3EN9A 3FLCO 3P4IA 3EZWA 1NGEA 1ZBSA 4FWNA 3KZBA 3SMPA 3ZX0A 4BC3A 2CGLA 4PL7A 4CZJA 2CH6A 5JICA 3HBTA 3UKRB 4BRIA 3J8AA 3VEZA 2QWOA 5AQKA 2VWBA 5BRDA 5BPMA 3VGMA 4QS8A 2GWKA 4CZIA 5AQSA 4B9QA 5F2RA 1JCEA 3VF6A 3H45C 4B1WB 4H5WA 3VGLA 1NGHA 1C0GA 4JD2B 3FFKB 1C0FA 4BR9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

2LY5A 2N2QA 1KLMA 3GE1A 4J2EA 4GV6A 3ENOA 1RBVA 4BRCA 3ZSZA 3WEEB 4AF1A 1U4BA 3T1AA 1H1VA 1LQIA 1W9HA 2P9UA 4DR3K 4H4MA 3SQ2A 4CGFA 4HE7A 4RTFD 2CGKA 2NRZA 3OYJA 2G8KA 4J8FA 3JYTA 3RMAA 3HXMA 4JI1K 3ID8A 1CXUA 1T0ZA 4BR4A 4MDBA 2E6LA 1WOQA 2J4RA 4I7FA 2R7YA 3QLHA 3SYZA 3TARA 3VOVA 5AQLA 2E2NA 1BU6O 4LD0A 5C0YA 5KI6A 3LPTA 2HF4A 3TABA 1TL3A 5CR4A 1NBWA 4C1NK 4KI4A 4A62A 5GIPA 5A2QO 1LCUA 4CZLA 3V9XA 1LQHA 3NFAA 4NLCA 3UKUB 3ULEB 4Y0WA 4YHHK 2VWJA 4FLYA 4CIEA 1IKYA 4NCGA 3VPZA 3SQ1A 4JKCA 3PX4A 2O8CA 1TUUA 3SPZA 1XC9A 3CJAA 3NVKA 4IFYA 2HNYA 4GV3A 3CI5A 4K43A 3AGRA 4HVJA 1J54A 1KCFA 3G71N 5J1EA 3VGKA 1Q9YA 1U6ZA 4BG9A 1SKRA 3PV8A 5J2QA 1C56A 2EX3A 1T1TA 4DWIA 1NGFA 5BRHA 1ZVEA 1GPTA 1QQMA 4CZKA 1A5VA 1NM1A 2YX6A 3KLIA 2G8WA 2RE2A 1BRZA 1HKGA 1XHXA 2ATQA 3HPGA 4EZ9A 1IG8A 3WXIA 1U49A 1QSSA 4V1DC 4MO5A 5KPRA 3VF4A 1GOBA 3QEXA 1U2VA 3U6FA 3HZ6A 2NY8X 3ZSXA 3V81A 3E9LA 2NZTA 1DJTA 2E2PA 3MN7A 4ICLA 3UKRA 2QWQA 2E3GA 3E66A 3O1WA 3VEVA 1YXQA 2BRZA 4YOTA 4CEOA 4Z94A 1VSEA 1MDUB 4FPAA 4DS4A 3ITHA 4DR5K 3FZKA 4FZZA 4JLHA 4A2AA 4E72A 4E19A 3JXUA 5ADXA 1LAVA 4JD2A 3OJSA 1VQ4N 4BREA 4ID5A 2FSNA 4FJGA 3LL3A 3MEDA 4FWPA 5ADXH 1GLDG 1SV5A 1R59O 2N69A 3AGKA 1A5WA 1NGBA 1T03A 2CH5A 2X74A 5AQYA 3CQYA 1VSFA 2VG7A 4JKHA 4A57A 2IVNA 3CJ1A 2Q97A 4FLTA 3SPYA 2PYLA 4JRQA 2I5JA 1I2VA 1I39A 4OKEA 3T69A 4HUFA 2OPRA 1KTQA 3L2WA 3KD5E 4JKBA 2OA8A 1EXQA 2HHVA 3KD1E 3CFOA 1IKXA 3CFPA 1OKJA 1T05A 4I6MB 3VF2A 3BF1A 2YI1A 4GY2B 4H5VA 4DTRA 2G2KA 4KTQA 4M63C 3T3FA 3ID6A 3HI0A 1TK5A 3CXCM 3DXMB 3VMFB 2F8SA 1Q7YO 3P39A 2P9IA 3M8RA 2YHAA 3AA2A 1VQ6N 1RTHA 3THWB 1SS6A 3NF7A 5HOOA 2HHXA 3DRPA 3THYA 1TVRA 4CJSA 3LDLA 4DR1K 2O8FA 4FWQA 1L3TA 2RPIA 2UXCK 1J6ZA 3LM2A 4O0JA 1O1WA 4XH4A 5ELZA 1ZBUA 1ZBIA 4B3OA 1BL3A 5CYQA 1U48A 4IO8A 1NMNA 3CIPA 1SL0A 1I2UA 3DRRA 3NGZA 2VGNA 2M8BB 3HOSA 1MU2A 3O4NA 5I3UA 4OO1J 5GADP 4FPBA 2ZE2A 3VQ9A 4N41A 2KZZA 1JKZA 2D4WA 1VRUA 2W40A 4E1MA 4CHNA 1GLFO 3MEEA 3BGRA 4LFBK 3NF6A 4MFBA 1PE4A 4CJEA 4WYBA 1RDAA 2F9TA 5KGXA 3NE6A 3MN9A 5FDLA 2ZJRL 1UA0A 5JS2A 3CCUN 3HRGA 2VQFK 2KTQA 1ATNA 3LAKA 3O4QA 4QCLA 1RBUA 1KD1O 3CPEA 2ZQBA 2YIOA 1E4GT 3VQ4A 4C8KA 3ALYA 4Q0BA 2NRVA 5J2PA 2WC9A 3VEOA 4CEAA 3LDOA 4I2PA 4BC5A 3SV3A 4JKEA 1T7PA 1X9JA 4Y1CA 4FZYA 4DQSA 1ZBLA 1DKGD 3FZLA 5AZIA 2QW9A 2ZM6K 3R2VA 1B3CA 4FJMA 4I9QA 4M3ZA 3FZHA 3A5NC 4DQRA 1P90A 3KOZA 3KK3A 1GLEG 1NK8A 1CLQA 4IOAL 3CCEN 2GL1A 2OPQA 3OYAA 2E8AA 4DQ8A 1IJJA 2QWPA 1WMTA 4RCHA 3SBGA 3WXKA 4K8ZA 1BCGA 2A3ZA 1C6VA 3R9PA 2UXBK 3CERA 1HYZA 1DTQA 3WXLA 1WSFA 1NE5A 4B3SK 4Z4FA 1WSIA 2P9UB 1BA1A 4CJ7A 1DT9A 5EX5A 4I2QA 3M8SA 1ATRA 2E3FA 1POIA 2FSJA 4KFBA 4B8CA 5GINA 2XY5A 4HUEA 1QQOA 2ZD1A 4M7XA 4CFBA 1SKSA 4HCCA 3QNNA 1J53A 4DV3K 4IG3A 2AJQA 1MA9B 2LSNA 3TAFA 3RWUA 3GOIA 2WUSA 5FLXO 1NKCA 4B9TA 1NK7A 4LH5A 1HPMA 4CEZA 5GAGP 1BGXT 2VG6A 4FWSA 3EZ5A 1UAXA 4B1UB 3TPQA 4JS4A 3ZX3A 1S1UA 3UB5A 4B3TK 2QK9A 3DLHA 1BI4A 2YJFA 4YOVA 4CCHA 1NU0A 4DR2K 4QS9A 1BO5O 4ELTA 3AA5X 5C10A 4FCYA 3THVA 1G99A 4IJNA 4GNIA 3UE5A 1QTMA 3TSQA 1X3MA 3O9TA 3U9DA 1WB9A 3VQCA 1FKPA 1HPZA 3HP9A 5KPZA 4Z4EA 2IGIA 4FOEA 4B1VA 1BISA 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3K2PA 1Z26A 1C0TA 1VSMA 1WNSA 3VETA 3QICA 3LPUA 3O8MA 4FM0A 2ASOA 2O8FB 1SN4A 5HBMA 2Q0UA 3MDQA 3WNEA 3K5MA 3OHRA 3SBTA 4BGAA 4CGGA 2O8DA 1WSHA 3V1RA 3U3YA 4BRFA 1KVBA 5AQXA 4CJ3A 3LANA 3CJBA 4YORA 1RT5A 4DUYK 4JHDA 3MX2A 4FJ9A 4BVPA 2YV0X 1RDWX 3ZT2A 5C42A 3FFIA 1HUXA 2B5JA 3M8QA 4J2BA 4AM6A 4CJRA 2OTLN 2D0OA 4JKFA 3A2FA 3J7ZO 5E26A 4JS5A 4AAZA 2LT8A 4FJKA 3H1VX 1L4VA 1XNRK 2JGUA 3IKMA 3PO4A 4DSKA 3LP1A 4ZTJA 4H0XB 1E3MA 3AVAA 1IKVA 5CHIA 1ASWA 4KHSA 4IOCL 4CEDA 5M1KA 4OGCA 5AZIB 1IBMK 3R1XA 3OS1A 1NJIO 4KHUA 5EU7A 1RFQA 3AO4A 4DF8A 1JXEA 3HYFA 4CBWA 1BQNA 2DFHA 1NPIA 1S72N 1ICAA 4CECA 1B9FA 1ASUA 5BREA 2HVIA 1JXBA 2HHQA 4F3OA 3QEIA 2KKZA 2LY6A 1ZU3A 2F9WA 4RW9A 1EKEA 1Q8IA 2HBKA 2WFBA 4LF6K 4OPAA 1Y64A 1N32K 3CQXA 4KTWA 3TSPA 2HMIA 3DXKA 4IFVA 2YNHA 2V52B 1RBSA 4A59A 3LDPA 2YEOA 4MLEA 2P9LA 4X65K 1NGIA 1TK8A 1C1AA 3H6EA 5BPNA 5JLHA 2E5LK 2HHHK 4BRHA 4FK4A 4GMJB 4ILHA 1JLBA 1VSJA 2HB5A 2O8BA 3E9PA 5J2NA 3C6HA 3KJVA 2FF6A 3R3LA 1XQSC 4FXDA 2QWNA 1WWNA 3Q7BA 5AFUA 3D2FA 3W0LA 1XWLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2LY5 A;  2N2Q A;  1KLM A;  3GE1 A;  4J2E A;  4GV6 A;  3ENO A;  1RBV A;  4BRC A;  3ZSZ A;  3WEE B;  4AF1 A;  1U4B A;  3T1A A;  1H1V A;  1LQI A;  1W9H A;  2P9U A;  4DR3 K;  4H4M A;  3SQ2 A;  4CGF A;  4HE7 A;  4RTF D;  2CGK A;  2NRZ A;  3OYJ A;  2G8K A;  4J8F A;  3JYT A;  3RMA A;  3HXM A;  4JI1 K;  3ID8 A;  1CXU A;  1T0Z A;  4BR4 A;  4MDB A;  2E6L A;  1WOQ A;  2J4R A;  4I7F A;  2R7Y A;  3QLH A;  3SYZ A;  3TAR A;  3VOV A;  5AQL A;  2E2N A;  1BU6 O;  4LD0 A;  5C0Y A;  5KI6 A;  3LPT A;  2HF4 A;  3TAB A;  1TL3 A;  5CR4 A;  1NBW A;  4C1N K;  4KI4 A;  4A62 A;  5GIP A;  5A2Q O;  1LCU A;  4CZL A;  3V9X A;  1LQH A;  3NFA A;  4NLC A;  3UKU B;  3ULE B;  4Y0W A;  4YHH K;  2VWJ A;  4FLY A;  4CIE A;  1IKY A;  4NCG A;  3VPZ A;  3SQ1 A;  4JKC A;  3PX4 A;  2O8C A;  1TUU A;  3SPZ A;  1XC9 A;  3CJA A;  3NVK A;  4IFY A;  2HNY A;  4GV3 A;  3CI5 A;  4K43 A;  3AGR A;  4HVJ A;  1J54 A;  1KCF A;  3G71 N;  5J1E A;  3VGK A;  1Q9Y A;  1U6Z A;  4BG9 A;  1SKR A;  3PV8 A;  5J2Q A;  1C56 A;  2EX3 A;  1T1T A;  4DWI A;  1NGF A; 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1NGIA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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