1NGIA

Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein atp hydrolytic activity, ii. structure of the active site with adp or atp bound to wild type and mutant atpase fragment
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
b'GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment.
pubmed rcsb
molecule keywords HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date 1994-05-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1ngiA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngiA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ngiA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1ngiA04
1E4GT 4CD1A 3H45C 5AQKA 4NO7A 2W40A 3D2FA 5BPLA 3MN7A 3ATVA 4BVPA 2Q0UA 1U2VB 1LOTB 2A6AA 4A2BA 4BRFA 4EHTA 2NRHA 1DGKN 4CBWA 4BRIA 4MLHA 1H1VA 3CJAA 3JS6A 2E2PA 1NGFA 5EX5A 1TYQA 2HF3A 2P9SA 4H5WA 3F9MA 4CJ7A 3WEEA 3ZETB 5BRHA 1U6ZA 5EY4A 3O1BA 4JHDA 4CZKA 3UKUA 4IXCA 1QZ5A 4H5TA 2H3GX 4MLEA 4FWKA 4H0VB 3SK3A 3KZBA 4PKHA 2PBDA 4EFHA 5AQWA 2UYTA 2FXUA 4CZFA 5CE3A 4CBUA 3MN9A 1KXPA 4DCHA 3ENOA 2ASMA 2FSJA 3MCPA 4O5FA 4WQ4C 1KAYA 4BR5A 3GE1A 5KQ8A 5LY3A 3I33A 1ESVA 1DEJA 4QS8A 1NGIA 1NLVA 2YHYA 4HWIA 4H03B 4PKGA 2QWRA 4WQ5A 3WEEB 3LDLA 2P9KA 3BF3A 5AQLA 2GUPA 3EL2A 2IIRA 2YI1A 5I9EB 2E8AA 4CZEA 5ADXH 3AARA 3DJCA 2YJEA 4K43A 4BR2A 4JD2B 3M1FA 5ADXA 3O4WA 3VEYA 4AM6A 1V4SA 4Z94A 2KHOA 1NGBA 4EIAA 4H5NA 4XH1A 5B8HA 5BREA 3G25A 2V7ZA 3WXLA 4WQ5C 4EHUA 4QS9A 3AY9A 3UE5A 2A3ZA 1QHAA 5BN8A 5JLFA 5AQSA 1HUXA 4BC3A 1NMDA 3SMSA 4J8FA 4CI6A 4RTFD 1NM1A 4IWVA 4AM7A 5BPMA 3FZLA 3CERA 3WT0A 1ATNA 2HOEA 4E1JA 1ATRA 1RGIA 3HI0A 2ZGYA 4NB4A 3WXIA 1BWFO 3WQTA 3CIPA 2P9UB 5ELZA 4BC5A 3GDQA 1BG3A 1MA9B 4BQLA 5JICA 1U2VA 5AQXA 3EKUA 2Q31A 2QWPA 2GTDA 1GLCG 2E1YA 1X3MA 4RWTA 1QQOA 1Q18A 5F2RA 4CZMA 1MDUB 3A8YA 3ZETA 3IUCA 2YHWA 4BRLA 5AQQA 4RCHA 3HZ6A 5AFUH 3H6EA 1Y64A 2QWOA 3RSEB 2ASPA 4BGAA 5LJVA 3FZKA 4FWQA 3SMPA 3TU5A 2QWQA 4B1WB 3VGLA 1E4FT 2YHXA 1SQKA 1OKJA 3ZEUB 5EVZA 3CHWA 1ATSA 3H46O 3WXJA 3O1WA 4BG9A 3OHRA 3C7NB 1GLLO 2A41A 4MO5A 2BUPA 4YDUC 1DKGD 3MN5A 5BR9A 2A42A 2GEMA 1IG8A 4H0XB 4BRQA 1BA1A 1YUWA 5KPRA 4K41A 3VF6A 3O8MA 2P9PB 2I7PA 3L4IA 3FZMA 2D0PA 2GELA 3ZX3A 4BREA 4BRCA 5AZIB 2V7YA 5FPDA 4IJAA 3WQUA 3VENA 1K8KB 5FPEA 5AQIA 4JD2A 4K25A 1T6CA 3CJ9A 3UKRB 3CJ7A 1HPMA 2QXLA 2Q2RA 4B9QA 1BDGA 5AQNA 2J4RA 4FPBA 2YCHA 3CQYA 2Q1NA 4ISEA 4FOEA 5AZJB 3VERA 2E2NA 1GLEG 3O5BA 2FSKA 3A5OC 2HF4A 5EXWA 1GLDG 2I7NA 3FR0A 3H1VX 3U8XA 3C0BA 4BR7A 3VGMA 4GNIA 3L6QA 3ZX2A 1HKBA 4H0OA 4BRPA 3IDHA 2Q97A 3M3ZA 1P8ZA 1ZXOA 5KQDA 1S22A 2P9UA 3VEVA 5JMVA 2QWNA 1HX1A 3J8AA 4B1XB 3ATUA 1YVNA 2FF3B 4FWRA 4FWNA 2AP1A 4XH4A 4FL9A 4FO0A 1JCFA 4BR4A 4PL7A 1NBWA 4I6MB 3QBXA 4BRDA 3EKSA 4A61A 4BRNA 2F9WA 2Q36A 4BVOA 3RSEA 2E2OA 2E2QA 3QICA 3AAPA 5AQFA 2Q0RA 2NLXA 1R59O 3ZEUA 3FZFA 2A40A 4L3QA 1QQMA 3DAWA 4BR9A 5JLHA 3QFUA 2ITMA 3DXMB 1QQNA 3C7NA 3VETA 2W41A 5BPNA 3R8EA 1SAZA 2P9LB 1GLFO 3DXKB 3VEZA 3TPQA 3H3OB 5LJWA 3P4IA 1Z05A 3A5NC 2QWLA 2CGJA 2V52B 3VF2A 4IJNA 5AQVA 2P9PA 3QDKA 3GBTA 2A5XA 3IFRA 4B1YB 3CJCA 1ZBSA 1T44A 5AZIA 1RFQA 3FE1A 5AFUA 1K8KA 3BF1A 5F1XA 3QMLA 1SZ2A 2CGLA 3HM8A 5AQMA 3U9DA 4FSVA 4H0YB 3VF4A 3SJHA 4A2AA 1WOQA 2V51B 3SLCA 3CETA 3MDQA 3UKRA 2FSNA 2DPNA 4BRGA 3ULEB 2ZF5O 1BO5O 2FLOA 3CQXA 2P9NB 4FWPA 3S41A 2QW9A 3LM9A 1NGHA 5BN9A 1HLUA 4IZ9A 2CH5A 2VCPA 3H1QA 4BRMA 4DB3A 2WUSA 3VEWA 5AZJA 1GLAG 3CJBA 1KAXA 3M6GA 4K42A 4BQZA 3JXUA 4H0TB 2HMPA 3UB5A 3L0QA 3MK6A 1BA0A 3GL1A 3A5LC 4XH5A 1NGJA 2QM1A 4CZIA 5E84A 1WUAA 5BRFA 4H5VA 1JCEA 4CZHA 3A5MC 3I8BA 5AQUA 3EO3A 2E20A 2VYPA 5TKYA 5AQRA 4F9OA 4EAHD 2BTFA 2IVPA 3O08A 3W0LA 3ZX0A 1NGDA 3R6MA 3H3NO 4XEIA 1GLBG 3D2EB 3R9PA 3LDPA 3LDNA 2P9IB 3A0IX 4M7XA 4B1VA 2CGKA 4WQ4A 3HSCA 4JN4A 4JAXA 4I6MA 4CZLA 4CZGA 2E1ZA 4CBXA 1T6DA 1NGEA 1QZ6A 2QWMA 1YXQA 3GOIA 4PKIA 3O6WA 5KPZA 1EQYA 4H0PA 5E26A 1RDWX 3B8AX 1HKGA 2OANA 5AR0A 3HBTA 4GY2B 3WXKA 2NZTA 1MWKA 3EZWA 1NGAA 2YJFA 3GG4A 2CH6A 4ISGA 1BUPA 3DXMA 3FGUA 1ZC6A 3VEOA 4BGBA 3D2FB 3BUZB 4H5RA 1LCUA 2P9LA 2ASOA 4FOIA 1S3XA 3DXKA 3D7EO 1NWKA 4LC9B 5AQPA 4FWMA 4FPAA 5AQZA 2GWJA 3EN9A 1TYQB 3FLCO 4BC2A 2P9SB 4CD3A 3U9ZA 4DHYA 3KVGA 4JHDB 1J6ZA 3UKUB 1NGGA 4C23A 1IJJA 1BOTO 1BU6O 2D0OA 3CJ1A 3MMVA 3FFKB 4ISFA 5KPTA 3KHYA 2IVNA 4M7YA 2D4WA 4B1ZA 2E88A 1GLJO 3ULEA 2GWKA 4FWOA 2P9NA 5BRDA 3VPZA 4BRKA 1HKCA 3ENHA 3VEXA 1HJOA 3AAQA 2PAVA 1XC3A 3IMXA 1KAZA 3QFPA 1C0GA 2D1KA 3O80A 1CZAN 4DQ8A 4O8KA 4B1UB 4CZJA 4BG8A 3LDOA 3LDQA 2P9KB 5AQGA 3BEXA 4PL8A 3DWLA 3VGKA 4BRHA 3WUHA 4BRAA 1YAGA 1JCGA 1X3NA 3QBWA 4FWSA 3U4LA 4Y0WA 5F0XA 3ID8A 4IO8A 5AQTA 2IVOA 1TUYA 3LM2A 4FWLA 4WYBA 3VESA 1D4XA 2FF6A 4QS7A 1MWMA 5AQHA 4MO4A 3QB0A 3HTVA 2AA4A 3D2EA 4BROA 5AQYA 3W3DA 2P9IA 1G99A 2ZGZA 1C0FA 2VWBA 3VOVA 4M63C 4BC4A 5AQOA 5FPMA 4JNEA 4HTLA 1NGCA 5AQJA 4YDUA 2ZWHA 1TUUA 4BR0A 3FZHA 1XQSC 4KBOA 3CI5A 1V4TA 4A62A 1X9JA 3LL3A 3MN6A 5EOYA 1Z6RA 3BP8A 2EWSA 1XUPO 2F9TA 5FPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1RDCA 1C1AA 3VQPA 4Z4EA 4CD1A 4FLTA 2OCEA 2KPYA 4FVMA 1BK8A 5GAHP 3H45C 5AQKA 3KJVA 4NO7A 4E7JA 4Z4IA 3D2FA 1RTIA 3WNHA 3DI6A 1X9MA 2LR3A 5I42A 2Q0UA 1VNAA 3KD5E 2A6AA 4RW7A 1H1VA 4DUZK 4B3RK 3JS6A 2YNFA 2E2PA 3CFOA 1ZBHA 2HHWA 2HF3A 4CJ7A 3ZT1A 5EY4A 3I0SA 4KTQA 3V1RA 4M3XA 1Y97A 2B4JA 4ILJA 3AO1A 1TI5A 3EE9A 3E9PA 3QEIA 2FXUA 4GV6A 2N2QA 4CBUA 5FRMA 3SQ2A 3LP2A 5M1NA 5H1SQ 3KK3A 2XO7A 4CJRA 3KOYA 1K73O 1TVRA 4BR5A 5DM6L 3SPZA 3S3NA 1WN7A 1L5UA 3CCJN 3O9TA 1QVGM 1I6GA 3PY8A 1ZFUA 1KVBA 4KB1A 2KJAA 4HWIA 2IGIA 3J81O 4CF0A 2QWRA 4CJWA 4WQ5A 1ZYQA 3AA4A 2WC9A 3I8DA 3BF3A 3K59A 1S6QA 2GUPA 2IIRA 3PV8A 2MN5A 2E8AA 1C6VA 1FXXA 3S3MA 3TSPA 4K43A 4BR2A 3ZT0A 5ADXA 3OYIA 2F96A 3ITHA 2VWJA 1CZBA 1JKHA 4AM6A 1V4SA 1A5VA 3VA0A 3O3GA 2D0BA 2KHOA 4DTRA 4YOVA 4Z0UA 3M5RA 1RILA 2PY5A 2V7ZA 4EHUA 3AVGA 3T1AA 3OYFA 4AB0A 4QS9A 3UE5A 4DS5A 2XY6A 4FJ7A 1QHAA 1U04A 5JLFA 1TK8A 1Q7YO 3AO4A 3SUOA 3J7AP 3E9LA 4JK9A 4IWVA 4DQRA 3M8RA 2HNYA 3HYFA 3WT0A 1T7AA 4FK4A 1QE1A 1PTXA 3NGYA 3WXMB 1VSDA 4NB4A 3CIPA 4CJQA 1RT1A 5AQXA 3C6UA 1WAJA 1NPIA 3ULDA 4DTJA 2E3FA 2HBJA 1Q18A 4C8LA 4CZMA 1SN1A 2QXFA 3ZETA 4JLHA 4HE7A 4RCHA 1BHLA 1WSEA 5AFUH 1YJNN 3P83D 3AA5X 4FWQA 3TU5A 3SV4A 4CQKA 3D6RA 1E4FT 2ITGA 2BANA 4V1DC 1OKJA 4B9UA 3HJFA 2X6SA 3WXJA 4FVUA 2E0HA 3KWGA 4DR4K 3WNGA 3HP6A 3OYGA 1GLLO 4CGJA 2ZJPL 4HCBA 1DLOA 4C8OA 2BUPA 1DKGD 4JYAK 5BR9A 1YITN 4LF8K 3HOTA 4H0XB 1VSFA 1XHZA 4K41A 4FJ9A 3L2QA 2ZJRL 4JKCA 3HVTA 1NMNA 4OPKA 2V7YA 4OLAA 2HNDA 3R2VA 3OYBA 3UKRB 2QXLA 4M3ZA 1VSKA 1VHXA 2J4RA 2C1GA 3CQYA 4DR2K 5AZJB 3E9OA 3VERA 4QCLA 4DTSA 1GLEG 3HVRA 1BGXT 3A5OC 2I7NA 3O4QA 3WNFA 1ASUA 1RDAA 1TL1A 5GIOA 4CJUA 2VGMA 3VGMA 3THXA 4FW2A 4J2BA 4KHSA 3VQ6A 1CN2A 3ZX2A 1SL0A 2AJQA 2JGUA 4DLGA 4Y1CA 4BRPA 5SZTA 4BE7B 1P8ZA 2P9UA 4JI0K 2GMOA 3VEVA 1B7DA 1VQPN 1HX1A 3QETA 3J8AA 3CYMA 3ATUA 1HNXK 2AP1A 4N47A 1HQEA 3ZT3A 4FL9A 1NH5A 1NBWA 4CCHA 4W5OA 4BRDA 2HVHA 3ZLJA 1JZBA 4CEEA 4PY5A 1S5JA 4H4OA 3RSEA 3SZ2A 2KQ2A 3S3OA 2UUAK 1C0MA 4DV2K 3ZEUA 1TL3A 3FZFA 4CF2A 3OS0A 1QQMA 4XIUA 3TARA 2KTQA 3QFUA 3R1XA 3DXMB 3KIOA 5IT9O 3VETA 1LWEA 4WE1A 2O8FB 1SAZA 1I2VA 2VGNA 3EZ5A 1GLFO 1CZ9A 4FJJA 3VEZA 4CK1A 3TPQA 1SKSA 1WSGA 3T19A 5LJWA 3A5NC 2PYLA 4RW8A 2CGJA 3VF2A 4IJNA 2P9PA 3GBTA 3VQAA 4GW6A 3RMDA 1S9GA 5AFUA 3LWLA 3QMLA 3HM8A 3U9DA 5JS1A 5KTQA 1WOQA 5CHIA 3SLCA 2FSNA 1KLNA 1KQSM 4LF6K 1Z26A 1NJWA 1C1CA 3VQ7A 1EETA 3IAYA 1HLUA 4BRMA 1X9WA 1VQNN 3OYJA 2WUSA 2KKZA 3T1HK 1KAXA 4KB0A 2OPQA 3UB5A 4GV3A 1VQLN 3TAPA 1NGJA 4G1QA 3TWHA 1OVYA 4CZIA 3O9SA 2VY6A 1WUAA 5BRFA 4H5VA 2WFBA 3A5MC 4IO9L 5JVHL 1TAQA 4YORA 5AQRA 3KKRA 3DRRA 2IVPA 1NJYA 4FM0A 4J2EA 1L3UA 3ZSOA 3H3NO 5FLXO 3QERA 3HO1A 3IRXA 4XEIA 4RW6A 1QVFM 3D2EB 3TAEA 3LDPA 1B9DA 2NUBA 4M7XA 2I5JA 3NF7A 4DFJA 1EWQA 2UXDK 4JAXA 4CZLA 1DTQA 1L4VA 2FBYA 4CBXA 1Q86O 1T6DA 1T7PA 3SAHA 3GOIA 3V6DA 5KPZA 4H0PA 4DQPA 2OYQA 3DMJA 3HBTA 4GY2B 2N69A 4CVNE 2NZTA 2O8DA 2YJFA 1SUQA 1LAVA 2RF2A 3L2VA 3DYAA 4X66K 3O9UA 2P9LA 5C2DA 2N66A 1NWKA 5HRPA 2G8FA 3CF5L 5AQPA 4CHQA 2GWJA 4BC2A 3PX0A 2P9SB 1IBLK 2O8BB 2YNIA 3IS9A 4JHDB 3F2KA 1NGGA 1BOTO 2D0OA 4B08A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1RDC A;  1C1A A;  3VQP A;  4Z4E A;  4CD1 A;  4FLT A;  2OCE A;  2KPY A;  4FVM A;  1BK8 A;  5GAH P;  3H45 C;  5AQK A;  3KJV A;  4NO7 A;  4E7J A;  4Z4I A;  3D2F A;  1RTI A;  3WNH A;  3DI6 A;  1X9M A;  2LR3 A;  5I42 A;  2Q0U A;  1VNA A;  3KD5 E;  2A6A A;  4RW7 A;  1H1V A;  4DUZ K;  4B3R K;  3JS6 A;  2YNF A;  2E2P A;  3CFO A;  1ZBH A;  2HHW A;  2HF3 A;  4CJ7 A;  3ZT1 A;  5EY4 A;  3I0S A;  4KTQ A;  3V1R A;  4M3X A;  1Y97 A;  2B4J A;  4ILJ A;  3AO1 A;  1TI5 A;  3EE9 A;  3E9P A;  3QEI A;  2FXU A;  4GV6 A;  2N2Q A;  4CBU A;  5FRM A;  3SQ2 A;  3LP2 A;  5M1N A;  5H1S Q;  3KK3 A;  2XO7 A;  4CJR A;  3KOY A;  1K73 O;  1TVR A;  4BR5 A;  5DM6 L;  3SPZ A;  3S3N A;  1WN7 A;  1L5U A;  3CCJ N;  3O9T A;  1QVG M;  1I6G A;  3PY8 A;  1ZFU A;  1KVB A;  4KB1 A;  2KJA A;  4HWI A;  2IGI A;  3J81 O;  4CF0 A;  2QWR A;  4CJW A;  4WQ5 A;  1ZYQ A;  3AA4 A;  2WC9 A;  3I8D A;  3BF3 A;  3K59 A;  1S6Q A;  2GUP A;  2IIR A;  3PV8 A;  2MN5 A;  2E8A A;  1C6V A;  1FXX A;  3S3M A;  3TSP A;  4K43 A;  4BR2 A;  3ZT0 A;  5ADX A;  3OYI A; 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