1NGI | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	378
structure length	378
Chain Sequence	GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule keywords	HEAT-SHOCK COGNATE 70 kD PROTEIN
publication title	Structural basis of the 70-kilodalton heat shock cognate protein ATP hydrolytic activity. II. Structure of the active site with ADP or ATP bound to wild type and mutant ATPase fragment. pubmed rcsb
source organism	Bos taurus
molecule tags	Hydrolase(acting on acid anhydrides)
total genus	122
structure length	378
sequence length	378
ec nomenclature	ec 3.6.1.3: Adenosinetriphosphatase.
pdb deposition date	1994-05-17

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.30.30	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Defensin A-like	Defensin A-like	1ngiA02
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA01
3.30.420.40	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Nucleotidyltransferase; domain 5	Nucleotidyltransferase; domain 5	1ngiA03
3.90.640.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Actin; Chain A, domain 4	Actin; Chain A, domain 4	1ngiA04

3C7NB 3UE5A 2BTFA 4CD1A 2Q0UA 4H0PA 1SAZA 3H3NO 1U2VB 4BVOA 5AQJA 4YDUC 3ULEB 4FSVA 3M6GA 3FZKA 5I9EB 4RWTA 3DXKB 2W40A 4B1YB 2FLOA 2A40A 3R8EA 2CH6A 2I7PA 3IUCA 3LDNA 4FWRA 1HJOA 4PKIA 3MN7A 3M3ZA 5AZJA 3AARA 5KPRA 3MN5A 3GOIA 2GTDA 3FZMA 2D4WA 1Q18A 1ZXOA 1GLBG 1J6ZA 3ZEUB 1MDUB 1BA0A 3G25A 3GE1A 5KQDA 2PBDA 1S22A 5AQRA 1MA9B 3QBXA 3JS6A 1K8KA 4BRDA 1XUPO 2CGJA 3SK3A 3D2FB 4BGBA 1WUAA 4K43A 3VGKA 1GLJO 4FOEA 3C0BA 3WQUA 4FWPA 3A5LC 4IZ9A 1GLCG 4JNEA 4FWQA 4BRPA 4QS9A 4QS8A 3VF2A 3FZLA 2FF6A 5BREA 4FO0A 3WXLA 3FGUA 2P9NB 4PKGA 1HKCA 2YI1A 3I33A 4H0YB 1ATNA 2A42A 2AA4A 4EAHD 1ZBSA 3I8BA 5BPMA 4CBUA 3FZHA 3ATUA 1NMDA 2A3ZA 4DCHA 2IVPA 4CZLA 3TPQA 3MDQA 5F1XA 3L6QA 3ZX2A 1OKJA 3MN6A 3BF1A 3GG4A 1NM1A 4FWOA 1QQOA 1LCUA 2Q0RA 4AM7A 4A61A 4CBXA 5AQIA 3FLCO 4BRAA 2J4RA 2QWOA 2P9LB 4LC9B 1GLAG 3DJCA 4H0OA 4BRGA 2P9IA 2F9WA 4FWNA 2CGKA 3H3OB 3LDLA 2A5XA 3O1BA 5FPNA 2IVOA 5AZIA 2UYTA 5LJWA 3U4LA 4I6MA 4BQZA 3IDHA 5EOYA 5BN9A 4BR5A 3UKUA 3ID8A 2E2OA 4B1UB 2FSNA 3AAQA 3CHWA 5B8HA 3IFRA 1ATSA 1NGBA 2E2PA 5AQZA 5BPLA 5JMVA 3WXKA 1YXQA 2QWMA 5AQTA 4QS7A 5AQHA 3ZETB 4H5VA 4XEIA 2ASOA 5AQMA 2PAVA 4O8KA 3L0QA 4EIAA 3VEVA 3M1FA 2FSKA 1HX1A 3VEZA 4JHDB 2P9SB 2A6AA 3ATVA 5FPDA 3SMPA 3VEXA 4BRIA 4AM6A 5AQSA 3DXMB 1EQYA 4IXCA 4BR2A 4B1ZA 1V4TA 3RSEA 5KPTA 3WEEB 4PL8A 3LDOA 5AQLA 1SQKA 4H5RA 3L4IA 4ISFA 3KVGA 3UKRB 2H3GX 2HF3A 2ZWHA 1P8ZA 2D0PA 1U2VA 4A2BA 2E88A 2NLXA 3BUZB 3FFKB 4EFHA 3O8MA 3DXKA 4CBWA 4CZHA 4IJAA 4FWSA 3D7EO 4IJNA 4FWMA 1BU6O 1HKGA 4O5FA 4BC3A 4BREA 3MCPA 1T6CA 3H6EA 3O5BA 4BG9A 3QMLA 2YCHA 2QWNA 2FF3B 3SMSA 3CJ9A 4BRHA 1RDWX 4DHYA 2Q36A 2GUPA 4F9OA 4Z94A 2HOEA 1GLFO 2D0OA 4H0VB 4BRLA 5KQ8A 3H1VX 3MN9A 4GNIA 1YAGA 3AAPA 2P9KB 4PL7A 5AZJB 2VWBA 1TUYA 3H45C 2NRHA 2QWRA 3CETA 1HUXA 4BC5A 5BRDA 3VF6A 1NGDA 2NZTA 1GLLO 1NGCA 4WYBA 1E4FT 5AQWA 3O1WA 5TKYA 2Q1NA 3SLCA 2P9NA 4MO5A 3EZWA 2E20A 4A62A 4CZMA 3J8AA 3QBWA 5AFUA 3VOVA 4WQ5A 2FSJA 4CZIA 4CI6A 5JICA 3D2EB 5BN8A 4CZJA 5EY4A 4H0XB 3DWLA 3EKSA 4H5NA 3WXJA 1GLDG 1MWMA 3A0IX 5AQOA 5BRFA 3HI0A 5EXWA 3BF3A 2YJEA 3VGMA 4HWIA 1NBWA 1C0GA 2A41A 4JD2B 4CZFA 5EX5A 4BR0A 4WQ4C 3GBTA 4K42A 5AQUA 3MMVA 2P9LA 1NGIA 2ASMA 2V52B 2D1KA 4ISEA 5AFUH 3LM2A 4HTLA 2V7YA 5F0XA 2P9PB 5BRHA 2ZGZA 1IJJA 3KZBA 2P9UA 4BRFA 1BA1A 1TYQA 1CZAN 1DGKN 1BWFO 4XH4A 1QHAA 3GDQA 4XH5A 4FL9A 1GLEG 2ITMA 1Z05A 1QQNA 3VETA 3QB0A 4MLHA 3CJCA 4B1WB 1ZC6A 1KAYA 2QWQA 3A5MC 3A5OC 2P9IB 3QDKA 5CE3A 3TU5A 3WUHA 2Q2RA 1X9JA 4BGAA 3A8YA 1D4XA 1IG8A 1QQMA 4IWVA 5AZIB 4CD3A 1JCFA 4IO8A 4BRQA 2YHXA 5AR0A 1KXPA 1T6DA 5BR9A 4H5TA 4K25A 2AP1A 3AY9A 1NGFA 1KAZA 3CJ1A 4WQ4A 2W41A 3DXMA 1YUWA 1X3NA 1XQSC 3WEEA 3CJ7A 4H0TB 4C23A 5JLHA 1NWKA 4BC4A 2E1ZA 3VESA 3B8AX 3VGLA 3C7NA 3HZ6A 1RFQA 2GWJA 1NGHA 2OANA 1Z6RA 3IMXA 1U6ZA 1NGJA 3ULEA 3VF4A 3RSEB 1E4GT 4B1VA 5AQNA 4WQ5C 4JN4A 2E1YA 4BQLA 5E84A 1QZ6A 3GL1A 2QXLA 2E2NA 3CERA 5E26A 1JCEA 2E2QA 1NGEA 1X3MA 1SZ2A 3HM8A 3EN9A 3VEWA 1BDGA 2GEMA 4NO7A 3O6WA 5EVZA 3ZEUA 4MLEA 3P4IA 4FWLA 2VCPA 5FPEA 4BR7A 5AQGA 2I7NA 4FOIA 2Q31A 3WT0A 1R59O 4J8FA 3R6MA 4CZGA 3O80A 3D2FA 5AQKA 1MWKA 2P9KA 3LM9A 2QM1A 3SJHA 3U8XA 5ADXA 3ZX0A 4EHUA 4BG8A 4XH1A 3LL3A 5ELZA 3U9ZA 2ASPA 1DEJA 2YHYA 4B1XB 3FE1A 3ENHA 2V7ZA 3H46O 3HBTA 3OHRA 3VPZA 2F9TA 2IIRA 3U9DA 3S41A 5LJVA 4BRNA 1H1VA 2ZF5O 2DPNA 2CGLA 1K8KB 2IVNA 1BG3A 3EL2A 3JXUA 3FR0A 4BROA 5F2RA 3O4WA 1KAXA 2QW9A 3D2EA 1HPMA 5ADXH 4BR9A 1NGGA 4RCHA 1YVNA 4CZKA 2Q97A 5FPMA 4YDUA 4JD2A 5AQFA 1BUPA 1HLUA 1JCGA 1BOTO 4BRCA 1DKGD 2GWKA 4FPBA 3WXIA 4A2AA 2KHOA 2HMPA 2ZGYA 5LY3A 4ISGA 3HSCA 5AQYA 2P9PA 4PKHA 4MO4A 1NGAA 3ZX3A 4L3QA 4RTFD 1WOQA 3CJAA 5JLFA 3LDQA 1LOTB 1XC3A 2WUSA 4JAXA 1Y64A 3W0LA 3LDPA 3BEXA 1T44A 4FPAA 3W3DA 4BC2A 3VERA 2QWLA 4BVPA 3QFUA 3HTVA 2E8AA 3CJBA 5BPNA 3ENOA 5AQXA 1NLVA 3R9PA 5AQPA 2EWSA 2P9UB 4Y0WA 2BUPA 4B9QA 1TYQB 4H03B 3ZETA 4I6MB 2QWPA 4BRMA 2FXUA 4CJ7A 3UKUB 2GELA 1BO5O 3CQYA 3F9MA 4BR4A 3O08A 4DQ8A 5AQQA 3EKUA 3VENA 4JHDA 1ESVA 2P9SA 3KHYA 2YHWA 4K41A 4NB4A 3A5NC 2CH5A 1G99A 5AQVA 1RGIA 3H1QA 1ATRA 4E1JA 4M7XA 2YJFA 1S3XA 4M63C 1TUUA 3UKRA 4EHTA 4KBOA 1C0FA 4FWKA 4GY2B 4BRKA 3CI5A 3QICA 1HKBA 5KPZA 3CIPA 4M7YA 3VEYA 3MK6A 3UB5A 4CZEA 3FZFA 2HF4A 4H5WA 3VEOA 1QZ5A 3QFPA 3CQXA 1V4SA 3BP8A 2VYPA 3DAWA 3WQTA 4DB3A 2V51B 3EO3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1HNVA 3L2UA 4DS4A 3BGRA 2ATQA 4J2AA 2HMIA 1IKYA 2PZSA 2O8EA 4JI2K 1WN7A 1JLQA 2OPSA 2W40A 1JKHA 4FJKA 3IUCA 3NVMA 1OVQA 3DLRA 1Z26A 3PSMA 5AZJA 5KPRA 4CJUA 2W6LA 5C24A 2XY5A 1J6ZA 4LH4A 3ZEUB 5MLCQ 4BE1A 1DQ7A 1T05A 5JVHL 4E1NA 5JENA 1K8BA 3E9LA 4KTZA 3QBXA 4RW7A 1XUPO 3SK3A 4IOAL 2P1JA 3C0BA 4DU1A 3KK7A 4OKKA 3OYGA 2FF6A 4FO0A 2O8DA 4PKGA 2P9NB 3SPZA 3RVCA 3I33A 1ATNA 3HSTB 4CJVA 4EAHD 3QIOA 2YNIA 5C12A 3ATUA 2YNFA 2DTUA 4M3ZA 4W5OA 2A3ZA 1KLNA 1WSIA 3AVJA 3TPQA 3ZCMA 3L6QA 1DTQA 3ZX2A 2KYQA 1YIJN 5SWMA 1S9EA 4AM7A 3PSIA 4IG3A 2QWOA 1TK0A 4FJJA 3RWUA 4F3TA 1CLQA 3CYMA 2YHBA 3I0SA 1VSEA 2P5GA 1GPSA 1NG9A 3S3MA 4R5PA 2KFNA 3KKSA 4ID5A 4DSKA 2E6MA 4I6MA 4LY7A 3OYKA 5EOYA 2KBJA 5BN9A 4KHQA 3ID8A 3AVIA 1NJZA 1IBKK 4FYDA 2IAJA 3DI6A 4PA1A 4PUOA 4C8KA 3SI6A 4DR3K 1I6FA 1YXQA 3SJJA 3ZETB 4DV7K 3TTDA 4O8KA 3KK2A 2FSKA 1A5XA 3SBTA 3MXJA 3VEXA 3R1XA 1ITGA 3T7ZA 4AM6A 4BR2A 4NLCA 3NF6A 3RSEA 4KI4A 1JKZA 1L5UA 3TANA 1L3SA 4HHFA 5AQLA 4ISFA 5J2QA 4CJPA 2ZWHA 3HPHA 3HVRA 3CC7N 3V1RA 4NCAA 2D0PA 2E88A 3BY5A 1HYSA 3NAEA 4RW6A 4FJ7A 1HNWK 4EFHA 4F4KA 4CZHA 2VY6A 1T7EA 4FWSA 4IJAA 4FJ8A 3QERA 4BREA 3LZIA 3MCPA 1VSDA 4B9UA 1FJGK 3N4PA 2ZD1A 1ZUTA 4KHNA 3AO3A 4BWMA 1TKDA 3I55N 4Z4CA 3OS2A 4CIEA 3TI0A 1BQMA 1RDWX 4DHYA 4EP5A 2GUPA 5GIOA 4A5AA 4ICLA 2UXDK 5KQ8A 3H1VX 3I0RA 4B9NA 1L3VA 4N56A 4J2BA 1TV6A 2O8BA 1OH7A 2VWBA 4M3YA 3H45C 5C10A 4JRPA 1HUXA 4BC5A 2DY4A 3IAYA 4U67L 2QA4N 1JLEA 1VQLN 3O1WA 4J2DA 3AO4A 5TKYA 4MO5A 2NY8X 2E20A 2DFEA 1SEGA 3TTCA 4CZMA 2EHGA 1LAWA 3HL8A 3C6HA 3D2EB 1T7AA 4H0XB 1WB9A 3DWLA 1A5WA 4H5NA 4JKFA 3CCQN 4DTPA 4NCBA 4I9LA 3HI0A 2YJEA 5J2MA 4BWJA 1S1TA 1NBWA 4BR0A 3TAMA 3GBTA 5AQUA 2YX6A 2P9LA 2ASMA 3I8DA 4ISEA 2JWLA 3NMUA 3L4QA 4HTLA 4I9QA 2ZM6K 2KJAA 5BRHA 4WFAL 1WSEA 1IKWA 4FZYA 2P9UA 4DR6K 4JI5K 1QHAA 1GLEG 1YTAA 3VETA 2GX9A 3VQ7A 2WC9A 1L3UA 1KAYA 1WAFA 2QWQA 4W5TA 3A5OC 2P9IB 1Q8IA 3ZT0A 4CD3A 1JCFA 4BRQA 4CHZA 1YT3A 2NRTA 1OMYA 1HYVA 3AVMA 5BR9A 1LW0A 2AP1A 1NGFA 4IOXA 1KFSA 3CJ1A 3KHWA 1X9WA 3DXMA 2GBZA 4H0TB 4CEEA 4CHQA 4CK1A 5JLHA 1VQ9N 4AHVA 1PTXA 2UUBK 3C7NA 3VQBA 1RFQA 4K8XA 1ZU3A 1UA0A 3D45A 4DU3A 3ULEA 3MEEA 3VF4A 1E4GT 1NKBA 3DLKA 3ZSWA 4YOVA 2E1YA 4UQGA 1BK8A 1FKOA 1X9MA 1HMVA 3CERA 2E2QA 2RN2A 4KV8A 3QEXA 3ENBA 3T3FA 1NOYA 3TSPA 1YI2N 1RT2A 3OW2M 4FWLA 3V4IA 5FPEA 2O8FB 4IFVA 4DTJA 4FOIA 5A2QO 3WT0A 4C8NA 4B9VA 4J8FA 1UA1A 3O80A 2P9KA 5ADXA 1KV0A 3AV9A 1VSMA 1ZVGA 4EHUA 3LL3A 3ISNC 5ELZA 1JLAA 3ZSYA 2YHYA 4KI6A 4FCYA 4MDBA 3VPZA 3ZYYX 2IIRA 3MX5A 3QLHA 2XY7A 2B5JA 4C1NK 4A5BA 2OPQA 3QNOA 4HUEA 4KO0A 4CESA 3V9ZA 3O4WA 2QW9A 1HPMA 1NPIA 3KWIA 1NJXA 4BR9A 3ALYA 3SV4A 3CC4N 1NGGA 1X1PA 3IRXA 3NF7A 4KKOA 4AHSA 4CZKA 2Q97A 4FM0A 4YDUA 4CEAA 4CGDA 4JD2A 1WT7A 4JI1K 1BOTO 3VQ6A 2ETJA 3JAMO 3QEWA 1T7BA 5H1SQ 4CEQA 2XY6A 5LY3A 3SAHA 3CCLN 4ISGA 3HSCA 5FROA 2P9PA 1WLJA 2FBYA 2KBHA 1MU2A 2F7TA 2JDQD 2XO7A 5M1FA 1EXQA 5JLFA 1TGOA 4Z4GA 2WONA 1UAXA 4O4GA 3BEXA 3W3DA 3O9RA 3KOWA 3SQ0A 1RBTA 4DFPA 4PHTX 1NLVA 2IDOA 3R9PA 4OLBA 1Q7YO 1WSHA 3LP2A 3H08A 2VWKA 5KGWA 1F21A 3V1OA 3QNNA 3PV8A 3TWHA 2FXUA 3S3OA 3UKUB 1W9HA 2NY9X 2DFFA 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2HB5A 5HROA 1RDBA 3K2PA 2OPPA 1IBMK 1LCUA 1N8RO 4CBXA 3FLCO 1HQEA 4EP4A 2RHKA 1XC9A 1RDCA 3NHGA 1C56A 4LC9B 1LV5A 2HNYA 3JYTA 3O9QA 4QOZB 2F9WA 2F4VK 2CGKA 2QTDA 3VTHA 2IVOA 3SCXA 2XHBA 5LJWA 4IFEA 1NRBA 3KK1A 1VRUA 4IOCL 4BQZA 3QO9A 4BR5A 3NDKA 3CQ8A 4CGGA 4B9MA 2FSNA 1YTUA 3SAFA 5B8HA 1RBUA 3OYEA 2LSNA 4OPHA 1IKXA 4OPJA 5BPLA 1YF5L 2HBMA 1I3AA 2B68A 2QWMA 4JKGB 1VSLA 5AQHA 1KRPA 4NYFA 4FK2A 4H5VA 2HBLA 3NE6A 5AQMA 5KK4A 4YOWA 4ILJA 3OYFA 3KP1A 3L0QA 4Y1DA 1RTHA 2VG7A 3VEVA 3VEZA 1TKTA 2P9SB 5FPDA 4AHUA 1X9SA 2A7TA 4B9LA 1EQYA 1VAZA 4IXCA 3LZJA 4CFDA 1V4TA 2G8IA 5KPTA 4PL8A 4GV9A 4FLXA 4H5RA 2G8UA 4FJGA 5M1OA 2HF3A 2X6NA 5KRTA 4B3RK 1WAJA 3VQEA 4CJLA 3O3FA 1JL2A 1P8ZA 3F9KA 3D0PA 4A2BA 4CJQA 2NLXA 1ASVA 3KC6A 4YORA 3J81O 1JLGA 3CM6A 4DR1K 2OZMA 3RR8A 4PQUA 4BC3A 1OH6A 4LFAK 5BR8K 1T6CA 3H6EA 3TAPA 3PIOL 1W0HA 3V9UA 1S1VA 2YBRC 2QWNA 4DQPA 1L4VA 3L2RA 1N6QA 4CERA 1O13A 2O8EB 1SKRA 4Z94A 4DG1A 4BE7B 5C42A 1NOZA 1UWBA 3Q7BA 1RTIA 1ZFUA 3J7ZO 1XHXA 4IG0A 4BRLA 1XRSB 5CYMA 1VQ8N 3KD1E 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2V51B 3EO3A
chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HNV A;  3L2U A;  4DS4 A;  3BGR A;  2ATQ A;  4J2A A;  2HMI A;  1IKY A;  2PZS A;  2O8E A;  4JI2 K;  1WN7 A;  1JLQ A;  2OPS A;  2W40 A;  1JKH A;  4FJK A;  3IUC A;  3NVM A;  1OVQ A;  3DLR A;  1Z26 A;  3PSM A;  5AZJ A;  5KPR A;  4CJU A;  2W6L A;  5C24 A;  2XY5 A;  1J6Z A;  4LH4 A;  3ZEU B;  5MLC Q;  4BE1 A;  1DQ7 A;  1T05 A;  5JVH L;  4E1N A;  5JEN A;  1K8B A;  3E9L A;  4KTZ A;  3QBX A;  4RW7 A;  1XUP O;  3SK3 A;  4IOA L;  2P1J A;  3C0B A;  4DU1 A;  3KK7 A;  4OKK A;  3OYG A;  2FF6 A;  4FO0 A;  2O8D A;  4PKG A;  2P9N B;  3SPZ A;  3RVC A;  3I33 A;  1ATN A;  3HST B;  4CJV A;  4EAH D;  3QIO A;  2YNI A;  5C12 A;  3ATU A;  2YNF A;  2DTU A;  4M3Z A;  4W5O A;  2A3Z A;  1KLN A;  1WSI A;  3AVJ A;  3TPQ A;  3ZCM A;  3L6Q A;  1DTQ A;  3ZX2 A;  2KYQ A;  1YIJ N;  5SWM A;  1S9E A;  4AM7 A;  3PSI A;  4IG3 A;  2QWO A;  1TK0 A;  4FJJ A;  3RWU A;  4F3T A;  1CLQ A;  3CYM A;  2YHB A;  3I0S A;  1VSE A;  2P5G A;  1GPS A;  1NG9 A;  3S3M A;  4R5P A;  2KFN A;  3KKS A;  4ID5 A;  4DSK A;  2E6M A;  4I6M A;  4LY7 A;  3OYK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1NGIA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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