1NM3A

Crystal structure of heamophilus influenza hybrid-prx5
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
SMEGKKVPQVTFRTRQGDKWVDVTTSELFDNKTVIVFSLPGAFTPTCSSSHLPRYNELAPVFKKYGVDDILVVSVNDTFVMNAWKEDEKSENISFIPDGNGEFTEGMGMLVGKEDLGFGKRSWRYSMLVKNGVVEKMFIEPNEPGDPFKVSDADTMLKYLAPQHQVQESISIFTKPGCPFCAKAKQLLHDKGLSFEEIILGHDATIVSVRAVSGRTTVPQVFIGGKHIGGSDDLEKY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Tetrameric Structure of Haemophilus influenza Hybrid Prx5 Reveals Interactions between Electron Donor and Acceptor Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Haemophilus influenzae
molecule keywords Protein HI0572
total genus 55
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nm3A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nm3A02
4ZILA 2F8FA 1K0CA 2MMOA 1ZYEA 1VGLA 3ZRDA 5DAKA 2TRCP 4RUVA 4G10A 2PMTA 1X5EA 4HI7A 6GSSA 4ZIJA 2VUPA 2YN1A 5C00A 4H86A 1XPVA 1SENA 1YJ6A 1IYIA 4MF7A 2GVPA 1DBYA 2V1MA 4IN0A 2L4QA 4N11A 4PQHA 3UL3A 1ZL9A 1DE2A 2YWIA 1Z5YE 1U87A 1GTIA 4Q5FA 4F9ZA 3GIXA 1SL1B 3ME7A 4GF0A 4JRRA 1X5CA 1GH2A 3RPPA 1K3LA 4EDYA 2IN3A 4TR0A 2XPEA 4ZL9A 4HDEA 1FG4A 3GUSA 4ZB6A 1GUHA 2REMA 1OE8A 1AQVA 4E8HA 3PR8A 2GQMA 5KN1A 3IV4A 2OBIA 1F6MC 3DD3A 3HJPA 2V41A 5JWRB 5F07A 9GSSA 2CA8A 1XCCA 1O8XA 5EY6A 2H8LA 1EOGA 2JSYA 6GSWA 4V2LA 2DJ3A 5ECKB 4MDCA 3BCKA 5G2ZA 2O8VB 5DBQA 2NDOA 4MJCA 3D5JA 1T7PB 3IRAA 4PUFC 4O32A 2KOKA 4ML6A 3ZVJA 3ZMKA 2EIRA 4IP1A 3PGTA 12GSA 3GKNA 4BWSA 2EC4A 2K18A 3UAPA 4IBPA 2DJJA 2O87A 1X9SB 5HQPA 1X9MB 2EIOA 4I2UA 2RM5A 2C80A 4IQ1A 2A2SA 4HZ4A 4WXTA 3L9SA 2GLRA 2WDUA 1EEJA 1PX6A 1XZOA 2L59A 2WZ9A 3IXRA 1G6YA 1EEMA 2GSSA 1G0TA 3ERWA 3TOUA 4OMVA 3FKFA 2O89A 4TR4A 4QL9A 5KN0A 4YQMA 5IMVA 5IPHA 4TXVA 2LQOA 1YEXA 3GN3A 1Y6EA 3M9JA 1I9DA 1Z7RA 2DJKA 1OC9B 4V2NA 3L0HA 1A2LA 2VCZA 3L4NA 2I1UA 1GLPA 2VCTA 2DSAA 1GP1A 2MBSA 1T00A 1SKWB 3TKSE 1GSSA 3FR3A 4XS4B 3SBCA 2H0IA 5J3RA 3TCOA 3HXSA 1MDKA 5J9BA 3GX0A 2R5GA 4GCIA 5IMZA 2WS2A 4L0WA 2P5RA 1ML6A 2YWOA 1RQMA 2DMLA 5D9VA 3EINA 4N30A 1WIKA 1K0MA 3C73A 3F9UA 1WMJA 1Z6NA 2CVDA 1Z3EA 3TJFA 1AAZA 3L78A 1ZGNA 2PGTA 3F4TA 3ISOA 1A8LA 1FAAA 3H8QA 4IVFA 1SKSB 2KHPA 2E7PA 2HRNA 4GRFA 3LWAA 1R4WA 1TDIA 1SYXA 4WKWA 3GNJA 3A2WA 1USBA 3BJ5A 2YV9A 3D21A 4KE3A 3QR6A 1EWXA 3CXGA 2P31A 2L6DA 4POMA 4Q5QA 3P2AA 3PINA 3KH9A 2IMKA 1RK4A 2AUVA 1K3YA 2H1GA 3ED3A 3TRQA 4F0BA 4WF4A 2H6XA 3DVXA 4F03A 1AW9A 4KGIA 1MD4A 5F0GA 2FNOA 2C0GA 5J9CA 1WJKA 3M9KA 3I43A 2JL4A 2M80A 2KUCA 4Q5NA 3J7Yk 4IGJA 4J57E 2FD3A 1PX7A 1T8EB 2RM6A 2V2GA 4LL1B 1RW1A 4KCEA 2DLXA 3G9BA 1A2JA 2ON5A 4XRAA 2YNXA 1LBKA 1MDJA 3P7XA 1O7UA 2HI7A 1XWGA 2LRNA 4EDZA 2GT5A 3TJGA 3O6TA 3VI5A 1XW9A 3IBHA 3LYKA 1EGRA 2FLSA 1B4PA 5JCGA 5ECSA 3RPNA 4V1Ap 1TK5B 5COHA 4G2EA 2MYGA 1GTUA 3HY2A 4XCSA 4ZL8A 5FWGA 3N5OA 3WT1A 1SD8A 1Q4JA 4IJ3A 2PPTA 2H72A 5KN3A 3GRXA 1V40A 2F9SA 4JR6A 3G7IA 1EV9A 2FGXA 2PVQA 5FT3A 2H66A 3KM6A 1TRVA 3F6DA 4D73B 2LRTA 4WF5A 5A5KA 2N5BA 3ERGA 3WGXA 1TTZA 2C3TA 4MZBA 1OC3A 4NV2A 4TR3A 4F82A 4MMMA 3D4TA 4ECJA 3F4SA 5F05A 5J41A 3BOAA 5CRDA 1M9BA 2VCQA 2X99A 4HJ2A 5ID2B 1C72A 2H6ZA 4JBBA 4AF2A 1A8YA 4F0CA 5D96A 5H5RA 2ZUPA 5DVBA 1M0UA 3TKSC 3D4MA 4XIHA 4K2DA 1JZOA 1M7TA 1T1VA 5IO2A 3Q74A 2YWNA 4KUNA 1R5PA 4HU7A 4L5OA 4G9HA 4NPBA 2HRFA 2GT6A 3EURA 4JZQA 4HOJA 5D9TA 1PD21 2VLVA 3GKXA 5D8IA 1O81A 5IMCA 3FRCA 4RI6A 5AIVA 3VWXA 2YP6A 3KCMA 1XWCA 2GSTA 3QMXA 3FZ9A 8GSSA 1ERUA 3HVSA 4FYUA 5CRGA 2K8SA 3HVXA 3W6GA 5EL8A 3ZL5A 5A4UA 2VAFA 3FR9A 1GSDA 11GSA 1A23A 1QQ2A 3GMFA 2NBSA 5DCGA 4BL7A 4MPGA 2DC5A 3G7YA 1ACVA 3FW2A 5A4VA 2VL9A 2ZNMA 1R7HA 2FWEA 2FUG2 3APOA 3EE2A 3LORA 4N0VA 4POLA 4P3YB 3MNGA 5G5EA 4GQFA 4EF0A 3TKPA 4MA9A 4YQVA 5ENUA 2VCVA 2XC2A 3GYKA 5JCWA 1SJ6A 1XIYA 4JU5A 5INYA 4E8EA 2RLIA 4YH2A 1K0BA 1XXUA 2VLUA 1PKWA 3VLNA 1B9XC 2LNSA 1Y25A 4FIWA 3LFLA 4JR4A 3F8UA 4CW9A 1EV4A 1PGTA 5DJLA 4XTSA 2L4CA 4OD7A 2YPMA 4FYCA 4RQRA 4WR4A 3FR6A 1GRXA 2AHEA 1NHOA 2QKEA 4TXOB 3D0ZA 1V98A 1OVNA 2YZHA 3UBKA 1XFLA 2OA7A 3DRNA 2IFQB 2LSTA 3Q18A 1QXHA 3O76A 5ECPB 2HSYA 4DVCA 4G19A 2HZEA 1F3AA 2V6OA 5ECNB 2NVLA 4O92A 4PX1A 2GQLA 2VM1A 4BVXA 3VWUA 1YY7A 5IO0A 3IPZA 2VCXA 6GSYA 2LJAA 2ALBA 2B1KA 2JZSA 2H0GA 4OFMA 3HHVA 1ZCPA 1S3DA 1T4YA 1H75A 2Z9SA 3KXOA 5GZZB 4NWYA 4OCFA 5GSSA 3MAKA 3GKKA 5B7CA 1OKTA 3KP9A 4TN8A 1Z6MA 2H74A 5H5QA 2L6CA 3LQ7A 1SJZA 4I5QA 1A24A 2OBKA 3U6VA 4BPYA 4PXOA 3H4KA 2C4JA 4EC0A 3GX8A 4DSSB 3IK9A 3DXBA 1YDKA 1QK8A 1JFUA 3KJYA 4L0UA 4IKHA 3UMAA 3WGDA 2O85A 4BA7A 1A0FA 2RUEA 5HR2A 3HJOA 5F8BA 2LV3A 2H30A 3LEFA 3S9FA 1N8JA 2HLSA 2P0GA 1UN2A 2YWMA 4GSTA 2LKUA 2M46A 2I3YA 3IR4A 5GAPD 1OKDA 2ZCTA 3TGZA 3HVVA 3QD9A 5DDLA 4NHZA 1AQXA 3QDNA 1TRUA 5D93A 2LNTA 4EE0A 1Q98A 1DE1A 2LRCA 1K0OA 1LU4A 1A2MA 1M9AA 1F9MA 2CX3A 3KMOA 5G31A 4L5LA 1XVWA 4ILFA 1T3BA 1SD9A 1TRSA 3QAVA 5HR0A 2WGRA 3UEMA 4YAPA 4IP6A 1N2AA 3CRUA 4TR1A 2J23A 3C1RA 1T4ZA 1SK0A 1PA3A 3DVWA 1VF1A 1QGVA 4LMVA 3F63A 3GHAA 3WGEA 2E2GA 2K8VA 4AJ6A 3QFBC 4K7IA 3SWLA 2TRXA 4NV5A 3C7MA 4TVEA 4PUAA 3KP8A 3QCPA 5ECMB 4YAVA 3CYNA 5KEJA 1XOBA 1PQNA 1NSWA 5GAND 3VI7A 3LG6A 4WETA 3DGQA 2PBJA 3NOFA 2WB9A 1MD3A 1OYJA 3GL3A 3DWVA 1SL2B 1UC7A 2B7KA 3FZAA 2X8HA 3IAM2 5FHIA 5IQYA 2I4AA 4MPFA 3E0UA 4AJ7A 5CYYA 3P8WA 2IMFA 2F51A 1M2AA 2GZZA 4XRDA 1M99A 1FVJA 4MH3A 1S3CA 5B8AA 3M0FA 2LUSA 4K0NA 2IWTA 4KAEA 1AUCA 4Q5RA 3A5WA 3BCIA 3LXTA 4EL1A 2PWJA 4LMWA 2IIYA 3GL5A 2H73A 4KB3A 2V6KA 1DUGA 2CAQA 4KA0A 2C3QA 3CSIA 3IAS2 2GQKA 4EO3A 2DMMA 3Q6OA 3L9UA 18GSA 2CZ2A 2F3MA 1UVZA 4MJAA 3C8EA 2H75A 2X8GA 5DALB 1DSBA 2C0DA 2H70A 2EIQA 1BEDA 2JU5A 2YOIA 2VL2C 1ERVA 2IL3A 4MF5A 3RAZA 1XBSA 4HZ2A 1U88A 3LXZA 5JCUA 4XHMA 16GSA 3CRTA 3CTGA 1YEPA 4PQ1A 1W4VA 5B6MA 2DJ0A 1VRSD 4K0GA 4MJEA 1SK2A 5D9XA 4O5RA 2GTUA 4X43A 2QSIA 4J56E 1ST9A 1TW9A 1F3BA 1Z9HA 1ILOA 1ON4A 1ERTA 5D73A 2JZTA 1JHBA 1CQHA 2QGVA 3DEXA 3TOTA 3TB2A 1GLQA 2VIMA 5LNKe 1FB6A 1ZOFA 2I81A 1WOUA 3TKSA 1B9YC 3F3QA 1XW5A 1VF2A 3ZTLA 5JWQB 3A2XA 3C1SA 5ABRA 3APSA 3F4RA 4PNFA 1K0NA 4J2FA 2R3XA 4V1Ag 4GSSA 1FVKA 2IJYA 2L5OA 3ZIVA 2H19A 3H1NA 3WD6A 1AC1A 3V1WA 2H76A 3R2QA 2WCIA 2JZRA 4QL7A 3ZLPA 2VO4A 1XWBA 1KNGA 1V58A 1TU8A 4L8EA 4I6XA 2PVOC 1EGOA 2VLTA 2C3NA 1BQ7A 3GFKA 1A0RP 2V32A 1NHYA 1MEKA 3M1GA 5GSTA 3J7Yb 1XWAA 4WEYA 1X5DA 5H5SA 1E2YA 1URMA 4HQSA 1X9WB 1GUKA 3GSSA 2F8AA 5DQYA 3QAWA 3A3TA 1J08A 3TJKA 1V57A 1ERWA 3KMNA 3VPQA 1XWKA 4EVMA 3VURA 3LGCA 3ZREA 2D2ZA 4HQZA 3FK8A 2HSHA 1ZMAA 3GTUB 2DJ2A 1G7OA 1EP8A 3KIJA 5HFGA 2CV4A 2B6MA 3KH7A 1FB0A 2FA4A 4AJ8A 1PMTA 5ECIB 2CAIA 1JZDA 6GSUA 1GSYA 2OADA 4NMUA 4OO5A 1TU7A 2IMEA 4GTUA 5G1LA 2FWGA 4MJBA 3FZ4A 1AQWA 4LL4B 1J9BA 4MH2A 3HYPA 4ZB8A 1FOVA 1PL2A 4DEJA 1U3IA 4POKA 4ULXA 3G7JA 4IELA 1KTEA 5KN2A 1HQOA 4ZL7A 3H93A 2H1BA 3MSZA 4FH8A 1K0DA 2IPAA 1GSQA 5ECOB 4I8BA 4MK3A 3D22A 1UA5A 5E59A 5HFIA 5CRWA 3TRXA 2MZCA 5F06A 3TJJA 4KDXA 2LJKA 5DQSA 3TDGA 3IDVA 3FZ5A 4I97A 6GSXA 3D6IA 5HR1A 2P5QA 2YANA 1THOA 3CBUA 1GTAA 2GZYA 1OAZA 2O7KA 1OC9A 1O85A 1KBNA 5G5FA 2KLXA 3ZZXA 1GSUA 2E2MA 2VM2A 1Z7PA 3KZQA 4EXJA 1EP7A 2CX4A 2K6VA 3LYPA 4X1UA 1PSQA 3Q19A 4XS4A 3DKSA 3EMXA 2GZPA 2CVKA 2I9HA 2FWHA 1THXA 2ES7A 3GH9A 2R37A 2HYXA 4X0XA 1GUMA 1X0RA 1YF1A 2DJ1A 1M2DA 5CP1A 1JLWA 1FHEA 1BJXA 2N5FA 2QC7A 3F0IA 1GULA 3KTLA 1AXDA 1HD2A 2MBTA 3FEUA 1VF3A 1VF4A 3QFAC 1TJDA 5A4WA 19GSA 2B5EA 4F2IA 2FHEA 5IMDA 1OE7A 3EC3A 1XOAA 1AIUA 1PL1A 5CAXA 2YCDA 4GXZA 4ECCA 3HZ4A 2IMIA 5G30A 3EU4A 2G0FA 5B8BA 2OACA 3DYRA 3OR5A 3UVTA 14GSA 2DIYA 2OE3A 4PQIA 2R6KA 1SYRA 4K9ZA 3HA9A 2HT9A 3F6FA 2H1DA 3UBLA 5D9WA 5ELGA 1SK1A 2A4VA 3RHBA 5AN1A 1BX9A 3IK7A 1SKRB 2JSZA 3RDWA 4IS0A 3ZIJA 3EYTA 2K9FA 1YKAA 4LLRA 1QFNA 4WR5A 5ECLB 3US3A 2GSQA 4TOPA 5ECRB 3PH9A 2VOCA 3CMIA 4KSOA 2ON7A 1M2BA 1V9WA 5DALA 2AAWA 3LSZA 4DSQA 4KW6A 3UIWA 4XS1A 1E6BA 1WPIA 4IHUA 1W89A 2WULA 3UJ1A 3I69A 3A2VA 1WWJA 3VPTA 3GH6A 1PRXA 2H1AA 4ACSA 1SJIA 5ECHB 4POBA 3TRPA 3EWLA 2GGTA 2OE1A 2YJHA 1FW1A 4RQXA 4GWRA 2MMNA 3VWVA 1GNWA 2AV4A 4V2MA 4OO4A 4GLTA 4PNGA 4TRXA 3ZYWA 2HZFA 4MZCA 3MWHA 2FY6A 1HYUA 13GSA 5DAKB 3IE3A 3CTFA 2FCHA 1MDIA 5HR3A 4OFNA 5J4UA 2H6YA 2LQQA 3APQA 3BBYA 3GA4A 4MZWA 5ECQB 4EKZA 1FO5A 3P90A 1K3OA 1XW6A 1S3AA 4Z7XA 4BVYA 4KX4A 2H01A 3E3EA 3VWWA 4FYBA 4NXIA 20GSA 4ML1A 3L9VA 2NPBA 4KDYA 2RIIA 4ZXGA 4KSMA 4D73A 1NM3A 2JACA 2LTKA 5CNWA 1HNAA 4KNDA 5DJMA 2HZEB 5CO3A 4KH7A 2VD1A 2DIZA 22GSA 2C1YA 3IHQA 5ID2A 2C0EA 1I5GA 1BG5A 3DIEA 1F2EA 1U6TA 3N9JA 2B1LA 3C71A 1HNCA 2DBCA 2YZUA 4PGTA 2BMXA 5IOXA 4IQAA 1O8WA 3QAGA 2VL2A 4XS6A 3DMLA 4TW5A 2CT6A 2WRTA 1J0FA 2LS5A 5G1KA 4K6XA 2J9HA 2YV7A 2H0HA 5C04A 4IJIA 4LA1A 3QPMA 4YQUA 2VCWA 2E0QA 2A2RA 3KD0A 2CVBA 2VD0A 3HCZA 3GURA 3GTUA 3CSHA 2OE0A 5HFKA 2HNLA 2FWFA 4O7HA 3WT2A 3BD2A 2OKAA 3ZFBA 3M3MA 2GDRA 2L5LA 3I6AA 3HD5A 3MDKA 1G6WA 1HNBA 3GV1A 5L71A 2KP1A 3W8SA 4MF6A 3EVIA 4ID0A 2G2QA 3RHCA 3UARA 3UVHA 1EOHA 1R26A 3QOUA 1TK0B 3EU3A 3HJMA 3AY8A 5LD0A 5AGYA 4IW9A 4MLYA 4NAXA 2OJLA 2B7JA 4ZBBA 3HDCA 4K7NA 4ECIA 3ERFA 2LJRA 10GSA 1TKDB 4K1FA 1MTCA 2WJUA 6GSVA 4KDUA 5IIZA 2KP2A 2L57A 1SU9A 1G7EA 2B3SA 4FO5A 1YF0A 1CQGA 3FHKA 6GSTA 5J5NA 2IMDA 1QMVA 4TKYA 4HS1A 4NHWA 5IM9A 4PURA 1H4OA 3F3RA 2H71A 3ME8A 4RI7A 3H79A 4OFTA 2MMZA 1R5AA 4ZB9A 4MP4A 2HXKA 4TR1B 1GSFA 5CRHA 4ISDA 4KCAA 3EMPA 3JCML 2CQ9A 2YJ7A 3HKRA 1QUWA 1GNEA 4MABA 4JEDA 4N0ZA 3ZVJD 1K0AA 17GSA 1ZZYA 3K8NA 1WP0A 3NIVA 1TRWA 4TXOA 5EVOA 3GKMA 1JZWA 2XBIA 4QQ7A 3KEBA 4N10A 5AISA 3KTBA 2IFQA 4I2TA 2RUFA 1WRYA 3IOSA 2GS3A 3GSTA 4GSNA 2AJQB 3KGKA 2CZ3A 2GSRA 3TJBA 2JADA 2PN8A 4ECBA 3M8NA 1SL0B 2AYTA 4JE1A 4HJMA 1GWCA 1TP9A 3IC4A 2TIRA 3TUEA 3U5RE 2BTOT 2VL3A 1IYHA 1OC8A 2FA8A 4GQCA 2PERA 1B4QA 5IMFA 3UOMA 4HUAA 4CDOA 2BJXA 1TK8B 1TI3A 1BAYA 2MMAA 2B5YA 5IOWA 4EUYA 3FY7A 3NZNA 1ABAA 1B48A 1BYEA 1PKZA 4K8MA 2NTOA 3CSJA 3E9JB 1TOFA 3IA1A 3O3TA 2LEGA 4DSRA 1PN9A 2XPDA 1TXXA 4DSSA 1EZKA 3TKQA 4AGSA 1U3AA 3W8JA 1O6JA 1GTBA 3FYGA 2HFDA 1B8XA 3TKRA 3I9V2 3ZFLA 3LJRA 3VFIA 1KEBA 4HEA2 2X8CA 5EPFA 4OWYA 3WYWA 5IMAA 1O73A 5IPGA 7GSSA 4ZBAA 5AIXA 2X64A 2XBQA 1YQ1A 5CREA 3HZ8A 2WFCA 2M72A 2R2JA 3VK9A 1JZRA 5B6NA 2PU9C 1GL8A 5DCHA 2PUKC 2XHFA 1YZXA 2AB6A 5JWOB 1NW2A 4K7OA 1XVQA 5LCZA 4BWQA 2R4VA 2C0FA 4CHSA 4HU9A 2N5AA 3ZMLA 5E4WA 3ZITA 1F37A 4OCEA 1ZYQB 1V2AA 4ZBDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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