1NM3A

Crystal structure of heamophilus influenza hybrid-prx5
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
b'SMEGKKVPQVTFRTRQGDKWVDVTTSELFDNKTVIVFSLPGAFTPTCSSSHLPRYNELAPVFKKYGVDDILVVSVNDTFVMNAWKEDEKSENISFIPDGNGEFTEGMGMLVGKEDLGFGKRSWRYSMLVKNGVVEKMFIEPNEPGDPFKVSDADTMLKYLAPQHQVQESISIFTKPGCPFCAKAKQLLHDKGLSFEEIILGHDATIVSVRAVSGRTTVPQVFIGGKHIGGSDDLEKY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Tetrameric Structure of Haemophilus influenza Hybrid Prx5 Reveals Interactions between Electron Donor and Acceptor Proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein HI0572
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Electron transport
total genus 55
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2003-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nm3A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1nm3A02
4MPGA 1F9MA 2C3NA 3CXGA 1M7TA 1B48A 3GKNA 4EUYA 3IA1A 2A2RA 2FCHA 3ZFLA 2C0FA 2OE0A 2L5LA 4MF5A 4HJMA 4ZL9A 1EP8A 2B5YA 2VM2A 2IL3A 5GSTA 5EPFA 1GLPA 3DRNA 1BG5A 2MBSA 2LRCA 3I9V2 3ZLPA 14GSA 2MMOA 2VCWA 1X5CA 2BTOT 4AF2A 2H1BA 3BCIA 2H30A 2LRTA 3LXZA 3HJOA 2CZ2A 3LYPA 3NZNA 1QK8A 2X8GA 1QFNA 1GTBA 5ECPB 4MABA 3M1GA 2E7PA 3HVSA 1KNGA 1S3DA 1XOBA 1O85A 4Q5FA 2P0GA 3WGXA 4N11A 1IYIA 1E2YA 1Z6NA 2M72A 3MAKA 1FVJA 1ST9A 5G5FA 3H4KA 2GZYA 4WBJA 2B1LA 2HZEB 2GSSA 2LKUA 3VWXA 4I2TA 3EURA 2B7KA 3L0HA 1B4QA 2CX4A 5H5QA 3C73A 1A2JA 3GIXA 4D73B 1I5GA 4MF6A 3ZFBA 5LD0A 2VD1A 4FYBA 2C0DA 3HKRA 3LFLA 19GSA 1EEJA 2VCVA 2HNLA 3SBCA 4ML6A 2VLTA 4L5OA 3KIJA 4XS4B 3IOSA 3PH9A 2OE1A 2R5GA 4HUAA 4TXOA 5KN1A 1CQGA 1SK2A 2DJ3A 1UC7A 3MWHA 4L0WA 1GUKA 4TKYA 1CQHA 4XHMA 5FHIA 4PNGA 4N0VA 3E0UA 4HZ2A 4NV5A 1GTUA 4TR0A 2CZ3A 1X5EA 6GSUA 2FLSA 1GNEA 1TU7A 3NOFA 2GGTA 3ZRDA 1DBYA 1YKAA 3GFKA 5JWQB 3HJMA 5B8AA 2OE3A 1TXXA 3QMXA 3IDVA 5D9VA 3EU3A 3DMLA 3EMXA 4HDEA 4KSOA 11GSA 1AAZA 4K0GA 4XTSA 3GL5A 4PURA 3QFBC 3TOTA 4WBRD 2GT5A 5DJMA 2X8CA 1JLWA 1XVWA 2VLVA 1TTZA 5IO2A 1XOAA 4XS1A 3HZ8A 1EWXA 3WT1A 1G6WA 4ZB6A 2C1YA 3M9JA 3ZTLA 5HR0A 2ZNMA 5IM9A 3FRCA 2V1MA 3PINA 4ZBBA 2YWMA 2WCIA 1J9BA 1ZYQB 3TJGA 16GSA 4YQMA 5E59A 3IC4A 1HNCA 4ECCA 1H4OA 2L4CA 3CTFA 5CRDA 2H1AA 3RPNA 3KD0A 1Y25A 4K0NA 2OJLA 3BOAA 4N0ZA 5ID2B 3TDGA 2PUKC 3BBYA 1SL1B 4WEYA 4ULXA 2MZCA 1WRYA 1ZYEA 2F3MA 4IS0A 2V32A 4XS4A 5DQYA 1VF4A 3TKPA 2V6KA 2VAFA 4RQRA 1DE2A 2PU9C 2AHEA 2IFQB 4K2DA 2FY6A 2DJ2A 2B1KA 2ES7A 3CRUA 1OKTA 5ECNB 2NBSA 2FA8A 1OAZA 3GMFA 1F37A 4FYCA 3M0FA 2MMAA 3KMNA 4KE3A 2RLIA 1YY7A 3UBLA 4MCUA 2H72A 3F4SA 1O81A 9GSSA 2YJHA 3LJRA 1DSBA 3GRXA 3RAZA 2YNXA 5IOXA 1F2EA 3F0IA 1TP9A 4NXIA 1PN9A 5F0GA 1LU4A 3FHKA 4POBA 3D21A 3LXTA 4DSSB 3MNGA 4Q5NA 4GSNA 3K8NA 1PL2A 2QKEA 1SYXA 4DVCA 5D8IA 1A8YA 1OC3A 3TJFA 1PKWA 1O7UA 5HR2A 4GQFA 2CAQA 2K9FA 1M99A 1ML6A 5IMFA 2L4QA 1MTCA 5COHA 1VF3A 2BMXA 2O87A 1JFUA 3VWVA 3F3QA 3FZAA 3DYRA 4X0XA 3EWLA 5ECHB 1K0AA 3GTUB 5ID2A 4ZBDA 1FVKA 3D6IA 4PQ1A 2DMLA 3TCOA 17GSA 4GLTA 5ECKB 1HD2A 2XHFA 4IN0A 4TR3A 4Z7XA 1EOHA 4PQHA 3FW2A 2LJRA 3IAS2 2PMTA 1M2DA 3ZITA 2YPMA 4K6XA 4OO4A 3FZ9A 4MJEA 1AIUA 4KAEA 2YCDA 4EO3A 1YEPA 4K7OA 1WPIA 3DWVA 3ZIJA 4K7NA 2WB9A 2VIMA 4JU5A 5J41A 2O8VB 3L9SA 6GSYA 3Q6OA 5JWRB 4MZCA 2FWHA 3WGDA 2CVKA 2GS3A 1R7HA 2MMNA 2IWTA 4AJ7A 1K3YA 1OC8A 2E0QA 1GUHA 5IPGA 4MH2A 4TOPA 2PN8A 13GSA 2Z9SA 3A2VA 1SKRB 4DSSA 3CSJA 3G9BA 5ECOB 4V2LA 2RM6A 2EC4A 2FWEA 4KCAA 4O5RA 2N5BA 1URMA 1TRVA 2GQLA 1F3AA 2MBTA 3ISOA 1U87A 1YEXA 1ERTA 2WDUA 3E3EA 1G7OA 5DVBA 1SK0A 3TJKA 1AW9A 1A0FA 1GSEA 1BJXA 2JU5A 2P5QA 1FOVA 4BVXA 3TJJA 1XVQA 2C0GA 3FR6A 3DD3A 4YQVA 2DMMA 1B9YC 7GSSA 2GT6A 3IRAA 3D4TA 1SK1A 4JZQA 3GURA 1YZXA 4YAVA 1K0BA 1QMVA 2NPBA 5J9CA 4GTUA 1TU8A 1EZKA 1FAAA 2PGTA 2H01A 4MK3A 4J2FA 5B6NA 4HQZA 3M3MA 4NAXA 1PKZA 3F8UA 3GTUA 4NPBA 3VLNA 1O73A 4IBPA 6GSSA 1PGTA 4TR1B 1WIKA 2DC5A 3FY7A 2C80A 1MDJA 4XCSA 2I1UA 4O92A 4KX4A 1XFLA 3CMIA 4GRFA 3I6AA 2X64A 3F4TA 3D0ZA 2DJ1A 2WGRA 5E4WA 2F51A 1ZCPA 4FO5A 1Q4JA 1M0UA 3GX0A 4OFMA 4TXOB 3H79A 1M2BA 3TOUA 2DJ0A 5JCWA 3ZYWA 3ME7A 2JACA 2PPTA 1BYEA 2RUFA 1KTEA 5CRGA 1O6JA 4MDCA 1M9AA 2KHPA 1K0CA 4IQAA 3HYPA 3VURA 2HT9A 1E6BA 4MH3A 20GSA 5ABRA 2LQOA 1GUMA 5ELGA 1YJ6A 2VCXA 3CRTA 3LEFA 4F82A 3F6FA 5IIZA 4TW5A 2K8SA 4GSTA 3GH6A 2YV9A 4TN8A 1T00A 3U6VA 2TRXA 2YJ7A 3Q19A 5EL8A 2LJAA 2PVQA 2CAIA 1SL0B 1XZOA 1V58A 2AUVA 2MYGA 1GWCA 2FWGA 4HOJA 5IMCA 1TRUA 3GN3A 3IBHA 4XRAA 4JE1A 1AXDA 4LLRA 3D5JA 2OBIA 1NM3A 3TRXA 1FW1A 4MLYA 2HI7A 5A4WA 5IMVA 2M80A 2NVLA 5AIXA 4G9HA 3HA9A 4K7IA 4NV2A 4TR1A 2M46A 1WP0A 3WGEA 4POMA 3MDKA 4QQ7A 4DSRA 1A24A 4MJAA 4X43A 1T3BA 1FHEA 1UA5A 1W4VA 4PXOA 5A4VA 5AN1A 1R5AA 1IYHA 2C4JA 1ON4A 1XXUA 3E9JB 1S3CA 3VWUA 3O6TA 4I2UA 3G7IA 1M9BA 4O7HA 4RI6A 4L0UA 3Q18A 3EMPA 5G2ZA 5B7CA 1PQNA 2AB6A 3UVTA 4XRDA 5D93A 4TR4A 1V98A 4MF7A 3BJ5A 2JZSA 3WT2A 1MDIA 3VK9A 5GZZB 2N5AA 3LORA 4MP4A 3ED3A 1MDKA 4L8EA 4KCEA 1JZRA 3N9JA 4N10A 2JZTA 3HZ4A 1BX9A 1F3BA 3ERGA 2K6VA 3IK7A 3O76A 4HEA2 5B6MA 4TRXA 4BWSA 1K3LA 3RHBA 2DJKA 3IAM2 1ILOA 2H19A 1K0DA 2C8UA 3LSZA 5CYYA 4MZWA 1U88A 4IW9A 1GSFA 1PX6A 1XWAA 5H5SA 2R3XA 4ZXGA 2AJQB 1USBA 5IMAA 3L78A 4GWRA 4ECBA 4J56E 1Z3EA 1OKDA 1Z9HA 1EEMA 2H66A 1BQ7A 1O8XA 5FT3A 4MPFA 2VL2A 2DLXA 1FB0A 1Z7RA 2H76A 1BAYA 3A5WA 3F6DA 1PL1A 4ZBAA 1NSWA 1XWCA 2GTUA 4N30A 4PUFC 3PGTA 3ZZXA 5AIVA 4KNDA 2YZUA 1WWJA 3KTLA 1U3AA 3QAWA 2AAWA 3Q74A 5F05A 3JCML 1T1VA 2KUCA 3VPTA 3US3A 5ECQB 3CSIA 3EC3A 3HVXA 2YWOA 5ENUA 5IOWA 2VM1A 3P7XA 4HZ4A 2GZPA 4JR6A 3CYNA 2DIZA 2KP1A 4IQ1A 4ZIJA 3GKKA 3ME8A 3W6GA 3G7JA 1SJZA 4EL1A 1OE8A 2HE3A 3KJYA 1WJKA 1ABAA 4LL1B 5D9XA 5IMDA 4OWYA 2GZZA 1K0NA 3GKMA 1A0RP 2B5XA 4IJ3A 2H6XA 3IXRA 1QXHA 3W8JA 5DCGA 2XC2A 3RPPA 3HHVA 3R2QA 5DBQA 3TJBA 5DQSA 4PX1A 4DSQA 3C7MA 1TJDA 3P90A 2DJJA 2WULA 5LCZA 2B5EA 4OCEA 3GYKA 4YQUA 1SKWB 2PWJA 3VFIA 5DDLA 4OFNA 1OVNA 4KDXA 5AGYA 3TKRA 5AISA 2MMZA 1YF0A 1SU9A 3S9FA 2WFCA 2QGVA 3DEXA 2EIOA 4WR5A 3D4MA 5IMZA 1YKCA 3GSTA 1AUCA 3ZIVA 3TKSE 5ECLB 4IKHA 2IMFA 2YWIA 4P3YB 3QAVA 4ML1A 2NTOA 2GSTA 3FZ4A 1GH2A 3IE3A 1GTIA 5KN0A 4JR4A 1YF1A 4EVMA 2GQMA 2A4VA 3VI7A 4ISDA 5C04A 2QSIA 3IPZA 3UL3A 4YAPA 1MEKA 1UN2A 2IMKA 5HFKA 5DAKA 2VD0A 2REMA 1NW2A 2YZHA 2C0EA 3TKQA 5D73A 4WETA 2H71A 1THXA 5INYA 1S3AA 5KN2A 3TKSA 3WYWA 2HSYA 1FG4A 2CA8A 2LEGA 2B6MA 3P2AA 4WKWA 4KA0A 2DIYA 3HCZA 2FNOA 3CBUA 1XPVA 4TVEA 3QAGA 2C3QA 1NHOA 1R5PA 4JEDA 4FIWA 2R6KA 1SKSB 4PNFA 1X9MB 3VPQA 1PX7A 1ZMAA 6GSTA 1HQOA 3IV4A 5JCUA 1HNBA 4XS6A 4HU9A 1TRWA 4ILFA 2JADA 2LUSA 2OA7A 3O3TA 4EXJA 3QFAC 5HQPA 4EDZA 4F0CA 2AV4A 2PVOC 3BD2A 1MD3A 1B9XC 3GA4A 2VL2C 1A23A 1T4YA 1TRSA 1LBKA 4QL7A 2N5FA 3CTGA 1SD9A 1YDKA 2RUEA 4I97A 1H75A 1J0FA 5CREA 2L6DA 5CAXA 1KEBA 5HR1A 3KGKA 3A3TA 3DVWA 2L57A 4OCFA 2V41A 1GTAA 4BVYA 2L59A 2IMEA 2O89A 1O8WA 1T8EB 1FO5A 5HFGA 1GSYA 1J08A 4HU7A 3ZL5A 4J57E 4NHZA 3APOA 1XCCA 3I69A 1XWKA 1NHYA 4RUVA 4F0BA 2ALBA 4KB3A 5H5RA 1Z5YE 1C72A 3RDWA 4ECJA 4GSSA 2A2SA 1JZOA 3KXOA 1AQVA 3C8EA 1GULA 1U3IA 2LNSA 4V2MA 3CSHA 3ERWA 5ELAA 1R4WA 4LMWA 4OD7A 2X99A 2FWFA 4I5QA 4OMVA 2ZUPA 4EKZA 2E2MA 3IR4A 2QC7A 4WF4A 3OR5A 5KN3A 4IVFA 1TK0B 4RI7A 3W8SA 1QGVA 2VO4A 1XIYA 2WRTA 3A2WA 4G10A 4BPYA 2H0HA 5JCGA 5F06A 1Z7PA 1F6MC 1VF2A 4HI7A 12GSA 2JSZA 4POLA 1I9DA 1HNAA 1EOGA 2FUG2 3QPMA 1V40A 2YANA 1G6YA 3TGZA 5D9WA 4HS1A 5CP1A 2WS2A 4ZL8A 4AJ8A 4ECIA 3FR9A 2OKAA 2YP6A 3QD9A 2P31A 1QUWA 5IO0A 2NDOA 1ACVA 1ERUA 1VF1A 2HRNA 3L9VA 1M2AA 3WD6A 1EV4A 4ZB9A 1B4PA 3TUEA 4MA9A 2XPEA 2WJUA 2R4VA 1UVZA 1PRXA 5IPHA 4E8HA 5CRWA 2CVDA 3V1WA 3ZVJD 3SWLA 1GSSA 1GSUA 3TKSC 2CT6A 1X9WB 2YOIA 3H1NA 4FYUA 4L5LA 1R26A 3UAPA 2R37A 5ECIB 3D22A 1GP1A 4HJ2A 5GAPD 2EIRA 5D9TA 1OE7A 1RW1A 2JZRA 1RK4A 2RIIA 3N5OA 4IJIA 1RQMA 2K18A 3C1RA 5B8BA 3J7Yk 4K1FA 5DCHA 3UEMA 4KDYA 3FKFA 1N2AA 5EVOA 3DXBA 3GX8A 2F9SA 4ZB8A 2I9HA 1Q98A 1GSQA 3GHAA 1A2LA 2XPDA 4QL9A 3UVHA 5DALA 1EGOA 2HRFA 5J9BA 3FYGA 3UIWA 4PQIA 5CNWA 5JWOB 3LG6A 5GSSA 1GNWA 4K9ZA 3C71A 2VOCA 4BA7A 3KP8A 3GUSA 3ZVJA 1TW9A 3U5RE 4O32A 4OFTA 2LS5A 2VCQA 1JZDA 4DEJA 3P8WA 3H8QA 2LRNA 4POKA 1THOA 1JZWA 2AYTA 2H1DA 2EIQA 4EE0A 5G1KA 2ON5A 4E8EA 5CO3A 4PGTA 3QDNA 3HY2A 1LJRA 2FA4A 1K3OA 1XW5A 4MJCA 2OACA 1ERVA 1KBNA 5G5EA 4MMMA 4CHSA 2HSHA 4KUNA 1ERWA 2GVPA 3EVIA 4BL7A 2HLSA 1EP7A 1T4ZA 1FB6A 3A2XA 3RHCA 1AQWA 2OADA 2GDRA 5FWGA 2LNTA 4EC0A 3ZREA 2H75A 4CW9A 3FZ5A 4ID0A 5G31A 3LYKA 1G7EA 3IK9A 3GSSA 4H86A 18GSA 4OO5A 3HD5A 2VLUA 4GXZA 3APQA 3EE2A 5J4UA 1PD21 3F3RA 4I6XA 5A4UA 2KP2A 3IHQA 10GSA 3G7YA 4NHWA 8GSSA 1TOFA 3EYTA 2H70A 1TKDB 3APSA 4EDYA 2E2GA 5A5KA 4LA1A 4LL4B 2L6CA 2H6YA 3QR6A 2WZ9A 3KH9A 4IP6A 4JBBA 2V2GA 1DE1A 2H74A 1X0RA 2HZEA 3UARA 3PR8A 2ON7A 3EU4A 4WR4A 2G0FA 1PA3A 5DAKB 3GL3A 2IIYA 2VUPA 1AQXA 2BJXA 1X5DA 1XW9A 4ACSA 2H6ZA 3NIVA 4D73A 3FK8A 5ECSA 3UMAA 5L71A 3M8NA 4TXVA 5F07A 3KCMA 1EGRA 2R2JA 1TI3A 2O7KA 2KOKA 2FHEA 2CV4A 3C1SA 2TIRA 3DKSA 1SJ6A 1WMJA 3HDCA 3L9UA 1SD8A 1BEDA 4RQXA 3TRPA 3F63A 2YN1A 4HQSA 1ZOFA 2ZCTA 2H8LA 1SL2B 4IP1A 4I8BA 3UOMA 4PUAA 1K0OA 1XW6A 2JSYA 2G2QA 2IN3A 4X1UA 2CX3A 1X9SB 2PBJA 1GSDA 2VL9A 3DVXA 4G19A 2X8HA 2C3TA 3KP9A 4YH2A 2VCTA 1PSQA 4LMVA 3UBKA 3HVVA 1XWBA 4AJ6A 4GCIA 2RM5A 1ZZYA 1TK5B 4KSMA 3UJ1A 5LNKe 2I3YA 6GSVA 3LWAA 4NWYA 5EY6A 3QOUA 3QCPA 4V1Ap 4CDOA 1XBSA 2PERA 4WF5A 4IELA 2YV7A 1A2MA 4V1Ag 5GAND 2F8AA 1N8JA 6GSXA 1AC1A 5KEJA 4KH7A 2H73A 3F9UA 2XBQA 3KTBA 4WXTA 1W89A 2YWNA 1EV9A 2V6OA 3GV1A 2H0IA 4NMUA 4JRRA 3H93A 3AY8A 2XBIA 4ZILA 1PMTA 2D2ZA 1VGLA 2IJYA 1DUGA 1TDIA 5HR3A 4EF0A 1YQ1A 2LJKA 1V57A 2GSRA 2H0GA 3KZQA 4ZL7A 3ERFA 1OC9B 1ZGNA 2B7JA 2VCZA 4F2IA 3DGQA 4MJBA 2TRCP 4IHUA 5J3RA 3FR3A 2LSTA 1SJIA 4AGSA 3TB2A 4F9ZA 4XIHA 2IFQA 1A8LA 5D96A 1B8XA 3HJPA 2IMDA 3DIEA 2KLXA 5IQYA 4F03A 3MSZA 3I43A 2GQKA 4FH8A 5CRHA 2J9HA 1Z6MA 5HFIA 2J23A 4KGIA 3GKXA 2IPAA 2CVBA 2DSAA 2B3SA 1QQ2A 4G2EA 4IGJA 2DBCA 1K0MA 4MZBA 1Y6EA 5J5NA 1HYUA 1MD4A 3EINA 4GQCA 2L5OA 3GNJA 2H1GA 5G30A 2LV3A 2LTKA 2HZFA 3ZMLA 2FGXA 5ECMB 5F8BA 1OYJA 2GLRA 3M9KA 1V9WA 1SYRA 2VL3A 2I81A 5G1LA 1T7PB 1GRXA 3KMOA 4KW6A 5DJLA 1V2AA 3TRQA 3FEUA 3HXSA 3LGCA 1JHBA 4Q5RA 2CQ9A 3L4NA 3F4RA 6GSWA 1ZL9A 4BWQA 1WOUA 2GSQA 3GH9A 1GLQA 1GL8A 2HYXA 2IMIA 3KH7A 1U6TA 2P5RA 3J7Yb 22GSA 1JLVA 4GF0A 3BCKA 2F8FA 5C00A 1XWGA 2K8VA 2OBKA 3KM6A 5ECRB 4KDUA 5DALB 1OC9A 2HFDA 2JL4A 1VRSD 1TK8B 2HXKA 3RBTA 2O85A 3KEBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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