1NNKA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-atpa at 1.85 a resolution. crystallization with zinc ions.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Core of GluR2 in Complex with the Agonist (S)-ATPA: Implications for Receptor Subunit Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA01
4R75A 5I2NB 2F8DA 3FGSA 5EYFA 1D9YA 2B65A 1I6BA 4LZ8A 5ITPA 1MY2A 1MXYA 4ZEDA 4R2FA 5DVFA 4FJPA 3RNNA 3PPNA 3O66A 4YMBA 1LBCA 4YKJA 2PX1A 4POXA 4PQJA 4H0WA 1URSA 3T96B 1SW1A 5BUUA 3KEIA 1H3DA 5JTYA 1LAGE 3VXBA 2DE3A 3RLFE 3EQ1A 1J1NA 4NF6B 5J1DA 1ZU0A 2ZXTA 4KHZE 1JETA 3CSGA 1B0HA 4KFQA 1PBPA 3VVFA 3MC2A 4U23A 1TFDA 4F39A 2I0BA 3MZBA 4RXLA 3LR1A 3SDFA 4KCCA 5DVIA 3UK4A 1B7UA 1SW4A 1HSLA 1LGBC 3EHTA 4G8MA 4EXKA 4YZZA 3G3HA 4KI0E 3IB0A 5DEXA 1OMPA 2O69A 1MM7A 1FTOA 1R9QA 4OVJA 1MS7A 1M5DA 3FXUA 2I3VA 3TELA 2A5TB 1M5BA 2OLBA 1OQHA 3HHGA 2I4CA 4THIA 4QSCA 1B58A 4G68A 5I59A 4ESWA 3LSXA 1PC3A 1ZJLA 1UTBB 3C35A 2DWJA 1R1NA 1DMBA 2UYFA 1P1QA 3OSQA 1S9TA 4OFJA 1NH7A 2XD2A 3C34A 2ZYKA 4XKPA 4ESXA 3PUZE 1LFHA 3UIFA 1FTMA 3O28A 5ICQA 5DT6A 1JQFA 4YB6A 5KDTA 4PFUA 5AA3A 3W9VA 1MXWA 4YKKA 1US4A 4IGRA 3TKDA 3DP6A 4FEBA 3ECRA 4PETA 4QF9A 4IO4A 1B7ZA 4QSDA 4LUBA 3Q26A 4IO5A 2XXTA 3EF7A 5A5XA 4F1VA 4R6YA 2DYXA 4OEVA 2ZNTA 4H6DA 3PD9A 4DCYA 3Q25A 2O68A 3TQWA 2NOOA 3AXFA 2Q89A 2P1SA 3B7DA 2ONRA 3RGYA 1MXZA 1UQWA 4YICA 2NUVA 4LVQA 3SEXA 5TP9A 4Q8RA 2REGA 2UVIA 2OWSA 1IXIA 1JW1A 3V89B 1IIWA 3B6QA 1MY3A 1YAEA 3KJTA 3ZKLA 3FJ7A 1IITA 2UYEA 5H8SA 5JTYB 1MH4A 4F1YA 3OENA 3FXQA 1OQGA 2R6GE 3KSJA 3IX1A 1B4ZA 3BFTA 3C36A 2H25A 4IY5A 3TUSA 1IXCA 3FZVA 4OMBA 3SERA 4OWDA 2GFEA 4XIGQ 2OJTA 4JWYA 2D21A 3O6IA 1Y3PA 3MVWA 2Z22A 1PDAA 1B46A 2Y7WA 2YJPA 1XHYA 2I49A 3K01A 2D5WA 2F7AA 4JXIA 3KGCA 3I5OA 4EQBA 4OFOA 3VV5A 3IOUA 3CIJA 3TPAA 1FQEA 4F19A 4LA9A 4WEDA 1UIVA 1B3GA 4G8HA 4H67A 1OLCA 1A55A 1H76A 1N7WA 3FV2A 1BP5A 1JEVA 1A99A 3CFZA 4G68B 5I59B 3MVZA 4KQPA 4F31B 3D4CA 1POTA 4KR5A 2UVGA 4FATA 4OESA 4P0IA 2I48A 3USDA 3KSXA 4MLVA 1LFGA 3RPWA 2QS1A 3MPLA 4O3CA 3KJ7A 3VLUA 1SD3A 1ZKBA 1CE2A 1B3HA 5FTIA 1TWYA 4DCXA 1JVXA 4U22A 4JDFA 2O6AA 1OIBA 3E13X 5KDTB 2VGQA 4QFNA 3JYRA 5TU0A 3P7IA 1MDQA 4RJZA 1LSTA 1FTLA 3K2DA 4PFWA 2Q88A 3CG1A 3QIMA 5A5XB 1NNFA 2DSFA 2OK2A 4JBZA 1Q1KA 4YU0A 5TP9B 4H8IA 4IO7A 2ANJA 1USYE 1M5EA 4H1XA 1TXFA 2A5SA 4IGTA 5FTHA 4DXBA 1HSJA 4POWA 1ZBMA 2XXIA 4H8JA 1B9JA 1Z7NE 4ELPA 5I57A 4YB7A 4NF8A 3OO9A 4NF5B 3TDJA 4LZ5A 3VDFA 3L6HA 1Y1MA 4OENA 4F2OA 5HBCA 4QFLA 1XVXA 5K2YA 4PFTA 1MQIA 5H8FB 4PP0A 4EF1A 4F3GA 1LCFA 1NNTA 3IAZA 3DM0A 2DXYA 3RTFB 3KFMA 1B3LA 1US5A 4R72A 2Z23A 3I3VA 3T9VA 2GH9A 3R7XA 3KN7A 2F34A 1B5IA 2DWHA 3FVNA 1P1WA 4DXUA 3MVYA 4N07A 2HEUA 3RUMA 2ONKE 2YPNA 3U72A 4F29A 2ZMBA 5B7DA 5JK4A 4F1UA 3Q29A 1AH5A 2RINA 3KN8A 1QJMA 2QSXA 4MF3A 2B3FA 3FASA 4KYEA 2FYIA 1Y20A 3L6GA 4EDPA 5L9SA 1PB7A 4OQOA 4LZ7A 3RT6B 4Q0CA 2M8CA 3B6TA 2AL5A 1MPCA 1SI0A 4BDLA 2XX9A 4Z7EA 5DYHA 2D3IA 3HSTA 4ONYA 4GVOA 3PMWA 3O29A 4C1UA 4G68C 1B05A 4U1OA 4H5FA 3CVGA 1B7HA 2Q2CA 3LSWA 1T0KA 3MP6A 2AIXA 3OELA 2XXQA 2PT1A 3TCHA 4G4PA 4YKIA 1A54A 3N6UA 4FORA 3CFXA 1B1HA 2RC9A 3T9XB 3IO6A 1MDP1 2DXRA 3N6TA 1NNKA 5IKBA 3QUFA 1WODA 2OBGA 1A8FA 1IUDA 2ZNUA 3TZAA 1DTZA 4KYSA 3VLVA 4X48A 4HS7A 5L9OA 3K6VA 3GLBA 2I0CA 1SW5A 3CSBA 1URDA 3TCGA 4IO2A 1GGGA 4GL0A 1IZ1A 3IORA 2O1MA 2ABHA 4NMYA 4OYVA 1M5CA 1UTHA 1B0LA 5I57B 2UVHA 3CFLA 4WEPA 4RPOA 4NF8B 5CRYA 3C31A 2F7CA 2VD3A 2XHDA 1OVBA 5HPQA 1BTJA 3K6WA 1FQDA 3CRBA 4ZS9A 1B40A 2PYYA 1GTKA 4EQ9A 5BWJA 3PPPA 1D9VA 4AQ4A 2PBWA 4RNSA 3H4ZA 2Z8EA 1O64A 3S9NC 2ZNSA 4XTCQ 3QSLA 5F1QA 4F3BA 2XXYA 2UXAA 4U4XA 1H45A 5JEIA 3SKPA 1POY1 3LUYA 4ECFA 4UA8A 3U93A 4F18A 3FATA 1BLFA 5AA2A 2XX8A 4U21A 1N3WA 3IB1A 1N84A 3OO6A 5ITOA 4BDMA 4R6HA 3S9EA 2VOZA 3H03A 3HPIA 1VFDA 1N76A 4G8NA 2GHAA 3JV9A 2O7UA 5I84A 2F35A 4OXVA 2RF1A 2IEEA 4JWXA 2F6GA 4PE5B 2H4IA 1P1NA 3H6TA 1IQ7A 1MY1A 4NWCA 1SBPA 1MH3A 3K1NA 1RKMA 1IXGA 1DTGA 1MM6A 4GIZA 4GXSB 4ZZAA 4FIMA 2V84A 2DE2A 3ILTB 4R9FA 2F97A 3O2AA 4XXUA 3QYTA 3OEKA 2CMOA 3T9HB 3O6GA 2F78A 1O7TA 4ZEFA 3MBPA 1JNFA 3MPKA 5EHMA 4F2QA 3A3CA 3RN8A 2GHBA 3SEYA 3PUWE 2QS2A 1M5FA 4C0RA 3N26A 3ODBA 2OZZA 3S9MC 1QUIA 3OO8A 4YAHX 3PPOA 4LONB 1FTJA 5L8DA 3B6WA 4GRKA 2KLFA 1LCTA 1I6AA 4NF5A 2H5YA 3KOSA 3K0VA 5CI5A 1VSOA 1MG1A 4UACA 3MWBA 2QPQA 2QL3A 2DVCA 5H8FA 3H6UA 4U4SA 1SW2A 1DPPA 2GRVA 4NEDA 3IB2A 3QUJA 4ZE9A 2PT2A 3PU5A 1MXVA 5LOMA 3TYHA 3A3UA 1IEJA 5KCJA 3IK6B 4ZZEA 1QVSA 4GL8A 3UN6A 1UTHB 1NH8A 3SEUA 3SEWA 5I56A 2DP8A 4EF2A 2IA4A 3FJMA 2H9BA 3VXCA 2NVUB 2R71A 5AA2D 2HQ0A 5B70A 2Q8JA 5H8HB 4OFLA 4XKQA 4MFIA 3VFJA 3H6WA 5EHSA 3MW0A 2X7QA 4KD5A 1N7XA 3HHFA 2Y7IA 2BJJX 3H06B 1NKXA 3MVXA 3A09A 2FNCA 3I6VA 4JB7A 2YLNA 3FVKA 3TTLA 5AE4A 1NFTA 3H7MA 2UVJA 3RT8A 2DWAA 3VVDA 3Q28A 3U8QA 4L17A 5AA2B 1N04A 4GFRA 1A40A 3N5LA 4X9TA 1OLAA 1FCKA 3F11A 4RK9A 1QKBA 1S7YA 4OZ9A 1DPEA 1FQCA 4M1VA 3S9LC 5FHNA 1P1OA 3C32A 3TFLA 1A7LA 2DVZA 1SYIA 5DVJA 1Y3QA 3IJOB 3U94A 1SVXB 1XVYA 2DOJA 3GXAA 4M4GA 1MQJA 4FAJA 5CMKA 3ILUB 5CM6A 4ELOA 2RCBA 3KG2A 4HW8A 1JEUA 1FQAA 3LSLA 5CMCA 5ICTA 4JSOA 4I8CA 2PMSA 3TAJA 4YKPA 3M3LA 4LQ2A 1B5HA 4WXJA 4P0GA 4Z0IA 2RCAA 1ZMGA 3PV0E 5CC2A 4NF4A 5K2XA 4QSEA 5CMMA 3RQTA 4DDDA 1B52A 5H8NA 3FV1A 4EXLA 2QRYA 3FD3A 5I2KA 1II5A 1XOCA 3PD8A 2ALUA 3UA8A 3MUQA 5F7VA 1S50A 4MBPA 1LB8A 4I62A 3EHUA 4I9DA 4X1BA 2ESNA 4H5GA 5AA1A 3V83A 1R9LA 5KCJB 4QFOA 5CBSA 4WKMA 4TLMB 4EQ7A 1B4HA 2O7IA 1PB8A 2NXOA 5I56B 3V8XB 2ZYOA 5HM4B 3SETA 3N94A 3EPEA 4LATA 1EZPA 3TQLA 1Y4CA 3O9PA 4FECA 1Y3NA 1B3FA 1GR2A 3FXRA 3SESA 2QMXA 2QS4A 2WKYA 4QRZA 2E0SA 1R6ZA 2X7PA 4N6PA 4NTLA 1Z7ME 4BDQA 1L5TA 4GD5A 1MQHA 4BDOA 1N3XA 4QHQA 3E3KA 4H65A 2QJEA 3H6VA 4MH5A 5FHOA 1RYXA 2R9JA 1B32A 2Y7KA 5H8QA 4E0XA 2H99A 3OOAA 1D4NA 1LB9A 2THIA 4EUOA 5I58A 3BBRA 4ZEBA 3WAEA 3S4UA 3ZS6A 3G3KA 1BKAA 4R9GA 4ELQA 1ELJA 3TCFA 2I6EA 3VVEA 4O3AA 1MY4A 1PBQA 3KBRA 3T66A 2XXHA 2DQVA 3DP4A 4HTGA 1XT8A 5KZTA 1LAFE 4FEDA 3C4MA 3D4GA 1XS5A 1P99A 3KN3A 1B3EA 4RYAA 3LSFB 3W15C 3EN3A 3WAFA 3K6XA 4OTEA 3RTWB 3M3KA 3K6UA 4AB5A 4HCYA 1F9BA 4TQUQ 4PFYA 2AL4A 4KCDA 2E1SA 3PMVA 4RPNA 3BKIB 3TEPA 1MPDA 3TTRA 3DELB 3QXMA 4GWOA 4NF4B 1D3KA 2VP1A 3OEMA 5H8NB 2ZYMA 3DP8A 2V3TA 1SQYA 3G3JA 5I2KB 3R6UA 1H44A 2OWTA 2LAOA 2RKMA 3LBSA 2H98A 4LQ5A 2Q2AA 5AA4A 5H8HA 3G7WA 1MPBA 1B6HA 1LAHE 3K02A 3G3GA 1QULA 3E4RA 3ZKKA 1MXXA 2Z8DA 1AOVA 1YCJA 2O51A 2HZKA 1AL3A 4Q30B 4IB2A 5ISUA 1XC1A 2B3BA 3OO7A 1QUKA 4BLAA 1URGA 4NWDA 3CG3A 2W7YA 4R6KA 2V93A 1SDXA 2F7BA 5DTBA 1FQBA 3S2VA 3TMGA 3M3FA 3RY3A 1AMFA 3R26A 1MQDA 1RYOA 3C33A 5CBRA 3PPRA 1UIUA 1O63A 3FVGA 1YTVA 3UP9A 1EZ9A 4ELRA 3FVOA 2HFBA 3OXNA 2DE4A 4KPTA 2XXUA 3M8UA 3DLNA 2XX7A 2PVUA 1JW4A 5H8QB 3T9UA 4ISUA 3IO4A 2XXPA 4RY1A 4O3BA 3O97A 3OD7A 4G77A 4N13A 3G3FA 1N0TA 4R73A 3UGWA 1IXHA 4JWOA 3EHSA 5I58B 2NWJA 3PMXA 3PUVE 2REJA 3KOTA 1GV8A 4C1TA 1ATGA 3IR1A 3VE1B 3MP1A 1HSEA 4U1ZA 1B2HA 1VFEA 3FJGA 3MQ9A 4MLQA 3CI8A 1ZTYA 4E0WA 4OEUA 3K1PA 4DXCA 1TT1A 2V3QA 1KWHA 4KYDA 1NL5A 2AYSA 3HN0A 5L9MA 3E9XA 1ZLQA 4JSDA 3O6HA 2Y7PA 3T22A 4ZEKA 2CZLA 4X1DA 4G2ZA 1AIVA 2O84X 3QK6A 3FUZA 1JW5A 4I1DA 1NNPA 1LFIA 3GBAA 3K1MA 3ZSFA 1DOTA 1TFAA 4GF8A 1Y9UA 4RA1A 3JZJA 2RC7A 5TPAA 4HCWA 1PEBA 3ONMA 2XXVA 5AA4B 2G93A 4BDRA 5M2VA 2XXWA 5CMBA 5DEXB 1MQGA 3C9HA 4DE8A 2V25A 2QMWA 3BFUA 3OSRA 3V5AA 1LBBA 1B5JA 3CR9A 3U1OA 1PB9A 2FA7A 2XXRA 3K4UA 3TODA 4DIGA 2I4BA 3IL1B 1SI1A 4TLLB 3QAXA 1VR5A 2XD3A 4XKNA 2VD2A 3U92A 3VLWA 2F36A 3Q27A 2V3UA 2VHAA 3THIA 1I6QA 1NMUA 4ZDMA 4F3PA 2Y7RA 4F3SA 2X26A 2G29A 1B51A 2Y84A 4ZECA 2HAVA 4P11A 5I2NA 4IO3A 1MRPA 5ELVA 1FQFA 3TTKA 3MJNA 3PUXE 1ZIUA 3GZGA 2ZYNA 1SYHA 1EU8A 3IOTA 1BIYA 4IY6A 4QFPA 3HCQA 2DWIA 4GLIA 1FTKA 4IO6A 3MP8A 4AB6A 4LP2B 5IAIA 4NF6A 3UORA 2P0SA 3GBBA 3HV1A 4ND9A 3SEVA 4DLDA 1EH3A 2F5XA 3KZGA 3MZ1A 1MY0A 4DZ1A 2O1LA 3W9WA 4U2RA 3H3GA 1QKAA 1DSNA 1WVJA 1QUJA 3PPQA 4BDNA 5FHMA 2XXXA 1P1UA 4QFKA 3LC8A 3HO7A 2ONSA 2DS9A 2HCAA 1QW0A 4NE4A 2F6PA 1H43A 1Q35A 1LAXA 4ZE8A 1ANFA 1YPNA 1CB6A 1WDNA 4TOZA 2HAUA 1LLSA 2A5TA 2RC8A 4OHNA 2I3WA 5TPAB 2Z8FA 4R2BA 2HZLA 2Q9TA 3IJXB 1I69A 3IOWA 2HXWA 4YB5A 3FIRA 4RK2A 1UTBA 1USYH 3T93B 3TTNA 1JVYA 3TTMA 1FW0A 4GOTA 3PUYE 2I58A 3OMBA 4OERA 4FE8A 1EZOA 3MAMA 3IOVA 1Y4TA 1B1XA 1Y1ZA 1A8EA 4YMAA 2OCUA 2QS3A 3K00A 4GXAA 4ZEIA 4K3FA 1MXUA 4XKRA 2P2AA 4Q5TA 1OVTA 4OETA 4R74A 1GVCA 3G3IA 3MZ9A 4F22A 4GQOA 3PGFA 1VE4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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