1NNKA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-atpa at 1.85 a resolution. crystallization with zinc ions.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Core of GluR2 in Complex with the Agonist (S)-ATPA: Implications for Receptor Subunit Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA01
2R9JA 3E4RA 1MPCA 1AH5A 2THIA 4RJZA 4JBZA 3FV2A 3PPNA 5DVFA 1QJMA 5H8SA 3S9MC 2QS2A 5L9SA 3IB0A 5BWJA 3B6WA 2QS4A 4FJPA 5TPAA 2AL5A 3OD7A 1D3KA 1NL5A 2HEUA 5CBSA 1FCKA 5CMCA 1NNKA 4Z7EA 3TTMA 2A5TB 1II5A 3K1PA 1QVSA 4GL0A 4EQ9A 3CSBA 3SERA 4OERA 3QSLA 2VGQA 3O29A 4LP2B 4U22A 2QS3A 5L8DA 1LAHE 3UIFA 4BDMA 3VVFA 4GXSB 2ZYNA 3JV9A 3PMWA 3E9XA 4RK2A 5ISUA 1SQYA 4Q8RA 2Q8JA 4G77A 4IO2A 3Q27A 1TFAA 2RF1A 1N04A 3KJ7A 4X1DA 2OJTA 1MDQA 1NNPA 4JDFA 1LBBA 3H03A 4DCXA 4KHZE 4YAHX 3VDFA 3HO7A 2Q88A 2ZYOA 5B70A 3QUFA 3KOTA 1VR5A 4FAJA 4R2BA 2Y84A 1HSEA 1JW1A 2PT1A 3FXUA 3O9PA 4BDQA 3Q25A 4YZZA 4KYDA 2Z22A 2BJJX 3S2VA 4R6HA 3OXNA 4OWDA 1I6QA 4G4PA 4GFRA 3C9HA 4JSDA 1WODA 3VFJA 2XX9A 3LSWA 3MQ9A 4O3AA 3CG1A 3R26A 2XXIA 1Y3NA 3MPKA 3BKIB 4BLAA 2Q2CA 3F11A 4IO7A 3RPWA 4OMBA 3C35A 4I62A 2DS9A 4KI0E 2HFBA 4O3CA 1SDXA 3FXRA 2DE4A 3TQWA 3KBRA 1MXUA 4H0WA 4Q5TA 3VLUA 3LSLA 1MXWA 2UVGA 1N3XA 1LAGE 1RYOA 4EQBA 4DDDA 1BKAA 5TU0A 2QRYA 2XXWA 4JSOA 2XXPA 4RPNA 1MPDA 1M5CA 3U72A 4QFNA 4XKNA 5EHMA 1URDA 2QMXA 1MRPA 1UTBA 2ESNA 2AYSA 3PPRA 4R73A 4NF6A 1QUIA 5A5XA 2F6GA 4EDPA 4EXKA 3EHSA 5H8QB 2A5SA 3N94A 1M5FA 3FV1A 2DQVA 4H1XA 3IO4A 2ZMBA 3R7XA 1B05A 3QYTA 4WXJA 3V8XB 4KD5A 4F2QA 4P0IA 1LAXA 3I5OA 3TFLA 3C33A 3FJGA 1F9BA 2F97A 4F1UA 2Y7WA 1IXGA 1D4NA 4YICA 1B3GA 2Y7IA 1A54A 1ZBMA 2XD3A 1VFDA 5M2VA 5DEXB 4Q0CA 2XHDA 1B7HA 3CIJA 1RYXA 4XKQA 3U94A 4HTGA 3FVNA 4ZZAA 1B52A 4YB5A 2DXYA 4H5GA 3TTNA 1ELJA 1KWHA 2B65A 3IX1A 2NXOA 4PFTA 4R6YA 4YB6A 4MF3A 3C4MA 1GGGA 4U21A 2R71A 1P99A 3T22A 2CZLA 1Y20A 5L9OA 3CR9A 1NNFA 3MP6A 4U23A 3C34A 3G3GA 3OSRA 1Y3QA 4I8CA 1JETA 1D9YA 1QUKA 3MW0A 1B2HA 5ELVA 2HAVA 4TOZA 1XVXA 3VV5A 1A99A 3HCQA 3H6WA 2I4CA 1PBPA 1MQHA 1Y4TA 3M8UA 3MZ1A 4LQ2A 1B5IA 2I3WA 4F1YA 3V83A 2HXWA 3DP6A 3N6UA 1Y4CA 2I58A 3K6WA 1PB8A 3FIRA 3IORA 4M4GA 4POXA 2UVIA 1FQFA 1SYIA 1MS7A 1CE2A 1SBPA 3TYHA 1Q1KA 5FTIA 3OSQA 2FYIA 4F3GA 3KZGA 1VSOA 4YB7A 1ANFA 4OYVA 4O3BA 3W9WA 4G8MA 3VE1B 4XKPA 3ZS6A 1PC3A 2X26A 3O6IA 4FECA 3KN7A 3HSTA 2F5XA 4ESXA 3KSJA 2FNCA 1ATGA 1QW0A 3H6TA 4RK9A 1MH4A 3CVGA 3ZKLA 2DYXA 1NFTA 4IO6A 1QULA 4C1TA 1H3DA 3MVXA 1MY2A 3MVZA 5I57A 5I56B 2I49A 4F19A 4PE5B 5K2YA 2WKYA 2Y7PA 1SVXB 4X1BA 3HPIA 2XXUA 1VE4A 4I9DA 4IO5A 4MH5A 2B3BA 3PUWE 2O7UA 3PUXE 4HCYA 3SEUA 3TTLA 1B0HA 3GLBA 1ZJLA 5LOMA 3TZAA 5JTYA 1JVYA 5I59A 5KCJA 1N7XA 1B3HA 3MAMA 4GF8A 3A3CA 3KN8A 2GHBA 3CFLA 4FORA 4RXLA 4ECFA 1M5DA 2ZNSA 2V3TA 3H6UA 4GVOA 1FQBA 1Z7NE 1OQGA 3UGWA 1BLFA 3KEIA 3RNNA 2F78A 5J1DA 3K6UA 3W15C 4RA1A 2NOOA 3FASA 4EF1A 4UA8A 4LVQA 3LR1A 4GQOA 5TPAB 4GRKA 5HPQA 2QL3A 1A8FA 3K6XA 4YKJA 3VXBA 1OLAA 5FHOA 3FATA 3H6VA 4PP0A 5CRYA 4ZEFA 3L6HA 3S9EA 3WAEA 1B40A 1I69A 3IOVA 1IXIA 3IJOB 3QAXA 1US5A 2G93A 5CMKA 3B6TA 1O7TA 3U1OA 1B32A 1AL3A 1WVJA 3H7MA 3KSXA 3SEVA 3TUSA 5AA1A 4MFIA 4FATA 4IB2A 3PUZE 1H43A 5H8HA 4LONB 1ZMGA 4R9GA 4F3SA 2P1SA 4HCWA 3HHGA 3BFTA 4PFWA 2RCAA 2NWJA 3UK4A 4TLLB 1B5HA 2OWTA 4X48A 4NWCA 2Y7RA 2O84X 3KOSA 4GIZA 2YPNA 3RTFB 1IEJA 4WEPA 3EHUA 1M5EA 3ECRA 1MXXA 3LC8A 3IB2A 4PQJA 2RINA 2UVHA 2QSXA 1NMUA 1LLSA 3VVEA 5CM6A 1A40A 4F29A 3N6TA 3ONMA 1B1HA 1IQ7A 4FE8A 1LGBC 3ZKKA 1XC1A 3MVWA 1TFDA 3K1NA 1Q35A 2F8DA 2Z23A 1B58A 1MQGA 2D3IA 2NVUB 3VXCA 4IY6A 4ELQA 3B7DA 3UN6A 3TMGA 1MQIA 4UACA 4YMAA 3MP8A 2RC7A 3DP4A 3A3UA 4BDOA 2O69A 1EH3A 1JQFA 2HZKA 4JXIA 5I58A 2E0SA 1N7WA 4OZ9A 1YCJA 4EF2A 4ZECA 4QSEA 2G29A 5DVIA 1L5TA 4NF5B 3RGYA 1I6AA 4QFLA 4BDRA 1Y1ZA 4DE8A 4P0GA 3FVOA 2Q89A 3SEWA 4WEDA 3T9UA 4NF5A 2NUVA 4ZZEA 2O68A 5H8FA 2UXAA 4DXCA 1FTKA 2ONRA 2E1SA 5AE4A 4F18A 4ISUA 1FW0A 3D4CA 3M3FA 1URSA 4R9FA 1UTBB 3RLFE 4NE4A 1MY3A 1NNTA 4NF6B 4R74A 5A5XB 4F2OA 1HSLA 2Z8EA 2PVUA 3JYRA 1S9TA 4ONYA 3SEXA 5KZTA 3KN3A 4LQ5A 2V93A 2XXHA 2ZNUA 2DP8A 3UP9A 2IEEA 4X9TA 3V89B 4RYAA 3K0VA 2R6GE 1P1NA 4KCDA 1OIBA 5DVJA 2DWJA 5DYHA 3OO8A 1QKBA 2ZNTA 4G68A 4JWOA 4NEDA 4HW8A 4PETA 3K1MA 4FIMA 3HHFA 2O7IA 3O97A 3MZ9A 5FTHA 4XIGQ 2ONKE 3FVGA 3LSFB 4OVJA 3E3KA 2YLNA 5F1QA 5HBCA 3PUVE 2P2AA 3CSGA 3ZSFA 5IKBA 3FJMA 1LBCA 4ELOA 3FD3A 1R6ZA 1HSJA 1JEVA 3TODA 5CI5A 3I6VA 3L6GA 1ZU0A 2I6EA 5HM4B 3EF7A 3O6HA 1DMBA 3VLVA 1CB6A 3EPEA 4R72A 1MY4A 4C0RA 4F3PA 1B51A 3S9LC 1TWYA 3IK6B 1A7LA 1OLCA 3VVDA 1LCTA 4KCCA 3EHTA 3VLWA 3MPLA 2OWSA 1N0TA 1JVXA 4H8JA 1GTKA 3IL1B 1PDAA 5AA4A 4ND9A 3O28A 4OETA 4ZS9A 4ELRA 3ILUB 4IO4A 4M1VA 1N3WA 2VOZA 2H5YA 2ALUA 1UIVA 2OCUA 3CG3A 1B3EA 2HZLA 3OOAA 3SESA 3IOTA 2H9BA 4H6DA 2XXTA 1PB7A 3IOWA 2DOJA 5H8NA 2I48A 3UORA 1MXYA 4GL8A 4NF4A 1SYHA 1TT1A 1MXVA 2ONSA 2F7CA 4N6PA 1MDP1 4DLDA 2VP1A 1B6HA 4MLVA 1MY1A 3PPQA 1FTLA 2ANJA 4ZEDA 1R9LA 4RNSA 1N84A 1ZKBA 2I0BA 3TTRA 3C36A 2AL4A 5K2XA 5I2NA 3O66A 1M5BA 3IOUA 4F1VA 4QFKA 4QSDA 4JWXA 1Z7ME 1B1XA 3O6GA 2RCBA 5I57B 2HQ0A 3OEKA 2V84A 3K02A 3MZBA 2X7PA 3DM0A 4MLQA 3P7IA 5L9MA 5AA3A 4TLMB 3DELB 3OO9A 2ZYMA 2ZXTA 1YPNA 3TKDA 5TP9A 1SW5A 3CFXA 2GRVA 1XT8A 2PX1A 1UTHA 3MJNA 1OVBA 2QS1A 1LB8A 4NTLA 2Y7KA 1B7UA 1MH3A 1DSNA 3ILTB 3OMBA 3PU5A 1NH7A 5JTYB 2F7AA 5I59B 5KCJB 2Z8DA 3TEPA 1B3LA 3FXQA 5ICTA 1FQEA 5F7VA 1Y9UA 5DT6A 1T0KA 1POTA 1SI1A 4QF9A 2V3QA 4U1ZA 5I2KA 3PMXA 3SDFA 4OQOA 3H4ZA 2XXQA 3GBBA 1IXHA 3PD8A 1P1UA 2XXVA 4QRZA 4BDNA 2VD2A 4F39A 3MP1A 5CBRA 4NF8A 1O63A 4H65A 4MBPA 1SI0A 4R2FA 5AA2A 4QFPA 4ZEIA 1BP5A 2OZZA 4L17A 4ZEKA 3RQTA 1B0LA 4E0WA 1EZOA 2PBWA 1AIVA 2OK2A 3TCGA 3IO6A 2REJA 4RPOA 1USYE 3SETA 4IO3A 4LZ7A 4PFYA 3THIA 5B7DA 2XX8A 1J1NA 1IITA 4YKIA 4N07A 2Q9TA 3FGSA 1ZTYA 4ZE9A 1UQWA 1B5JA 1ZIUA 2DVZA 3PPPA 3RTWB 2H98A 3V5AA 2XD2A 3KG2A 3MC2A 3GZGA 1A55A 3B6QA 3K00A 1NKXA 3O2AA 3CI8A 3EN3A 5FHMA 3G3KA 3MBPA 4GXAA 2GFEA 4OESA 5H8HB 1TXFA 3K6VA 1GVCA 5CC2A 3WAFA 4Q30B 4G8NA 1LB9A 3FZVA 3LBSA 4AQ4A 2DXRA 2UYFA 4THIA 4DIGA 1OMPA 4ZEBA 2A5TA 2PYYA 3K4UA 4QFOA 1B46A 1EU8A 4IGTA 3KGCA 4WKMA 4JB7A 1IXCA 1IUDA 4K3FA 3G3IA 3M3KA 1YTVA 4GLIA 4H67A 3BBRA 1RKMA 1DTZA 2XXRA 3T9XB 3KJTA 2B3FA 3OO7A 4EXLA 4GOTA 2XXXA 1I6BA 1JNFA 2OBGA 3HV1A 2HAUA 5JK4A 3RT8A 4F31B 4LA9A 1A8EA 3S9NC 1QUJA 3Q26A 4LATA 4LZ5A 4OHNA 1MPBA 4FEDA 1URGA 2DE3A 3IJXB 3W9VA 1Y3PA 1WDNA 3K2DA 3PD9A 1D9VA 1DPEA 4DXBA 4YMBA 3IB1A 4IY5A 5I58B 3UA8A 4OEUA 5JEIA 4R6KA 3T96B 4OXVA 3USDA 4H8IA 3TCFA 4NMYA 4AB6A 1S50A 5CMBA 3BFUA 3IR1A 3TAJA 2GH9A 4OFOA 2REGA 1AMFA 3U92A 1DOTA 2QJEA 3G3JA 5H8FB 1XHYA 3OENA 2D5WA 2OLBA 2I0CA 3KFMA 3C32A 3OO6A 1POY1 5IAIA 1Y1MA 1PEBA 5ICQA 3JZJA 1YAEA 2F6PA 3MWBA 1US4A 1EZPA 1H44A 1XVYA 4C1UA 2HCAA 2I3VA 4IGRA 4BDLA 2ZYKA 3T9VA 1SD3A 2W7YA 3M3LA 2DWIA 2GHAA 3CFZA 3T9HB 4G2ZA 3LUYA 1GR2A 3DP8A 3QK6A 4OFLA 1P1QA 5KDTB 3H06B 1BIYA 4GWOA 4OENA 4G68B 1MY0A 3T93B 2H4IA 3PV0E 4H5FA 3QIMA 5KDTA 1SW1A 3GXAA 4XKRA 4R75A 2X7QA 3G3HA 1B9JA 1LSTA 3N5LA 2H25A 3FUZA 1VFEA 3IAZA 5I84A 4N13A 5ITPA 1MM7A 3SEYA 1B3FA 5H8QA 2UVJA 2DVCA 2O1LA 4LZ8A 4I1DA 3G7WA 1LFIA 1XOCA 2P0SA 5EYFA 2F36A 4QSCA 3TCHA 3SKPA 4OFJA 3FVKA 4FEBA 4OEVA 2QPQA 3MUQA 3N26A 3ODBA 1USYH 4LUBA 4KYEA 5DEXA 4DZ1A 1OVTA 4KQPA 4HS7A 1O64A 5AA4B 4G68C 1B4HA 2AIXA 3D4GA 4KYSA 5DTBA 5FHNA 3TQLA 2FA7A 2RC9A 2DWHA 1JW5A 3MVYA 4GD5A 5BUUA 2O6AA 2XXYA 2DSFA 4PFUA 3U93A 3CRBA 3RUMA 3I3VA 5H8NB 5AA2D 4DCYA 4AB5A 4KR5A 5EHSA 2DWAA 2O51A 3PGFA 4NF4B 3TPAA 1MM6A 1OQHA 3U8QA 4YKKA 1BTJA 1FQDA 4RY1A 1S7YA 3H3GA 1LFHA 3RT6B 2O1MA 4NWDA 3TDJA 1IZ1A 4ZE8A 4DXUA 3K01A 2D21A 4EQ7A 1MG1A 2RKMA 1N76A 4YU0A 4U4SA 4G8HA 1AOVA 1H45A 2V25A 2LAOA 1FQAA 5ITOA 1DPPA 4U1OA 1LCFA 2F35A 4YKPA 4TQUQ 1SW4A 3EQ1A 4E0XA 1FTJA 1B4ZA 1JW4A 5I2NB 1LAFE 2PT2A 1JEUA 4F3BA 3DLNA 4ESWA 3GBAA 3QUJA 1P1WA 2ABHA 3E13X 2PMSA 3AXFA 3TTKA 5TP9B 1DTGA 3T66A 4U2RA 3OELA 1SW2A 1FTMA 2VHAA 1UTHB 1IIWA 1GV8A 1MQDA 4ELPA 1H76A 1QKAA 3QXMA 1XS5A 2IA4A 1EZ9A 1UIUA 2F34A 2F7BA 1P1OA 3R6UA 1R9QA 1PBQA 3PPOA 1ZLQA 4OTEA 2KLFA 2XX7A 2DE2A 2I4BA 4P11A 2H99A 2V3UA 4XXUA 4XTCQ 1LFGA 2VD3A 4KPTA 3HN0A 3LSXA 2Z8FA 5CMMA 5I56A 3RY3A 2Q2AA 4KFQA 3OEMA 5I2KB 2YJPA 1MQJA 2QMWA 1R1NA 1PB9A 1NH8A 3RN8A 4NF8B 4POWA 3C31A 5AA2B 4U4XA 3Q28A 2RC8A 4ZDMA 4JWYA 4QHQA 3A09A 1MXZA 2M8CA 3FJ7A 3Q29A 1FTOA 4Z0IA 3PMVA 3TELA 4EUOA 2UYEA 4F22A 3PUYE 1B7ZA 3G3FA 3S4UA 2CMOA 1FQCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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