1NNKA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-atpa at 1.85 a resolution. crystallization with zinc ions.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Core of GluR2 in Complex with the Agonist (S)-ATPA: Implications for Receptor Subunit Selectivity.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnkA01
2F35A 1GVCA 3H7MA 1B51A 5ITOA 3VVEA 3MP6A 1MH3A 3UORA 5H8FB 2AL4A 3IL1B 3KN7A 1RYXA 1SI1A 3M3KA 2I3VA 4ZS9A 3PMVA 3G3JA 2NUVA 1NNKA 3OSRA 4JB7A 4ZEBA 4OENA 2X7QA 2Y7IA 3V8XB 3G3IA 4NE4A 3UGWA 2XX8A 3S9LC 3KSJA 4NF4A 3S9NC 3G3GA 1II5A 4NMYA 1B3HA 1JEVA 4G8NA 2PMSA 4R2FA 3GBAA 4N07A 3ZS6A 2O6AA 3TEPA 3QK6A 1TXFA 1MXYA 2F36A 2XXPA 3TUSA 4JDFA 1FCKA 1KWHA 4DCXA 3EF7A 4R6KA 3C32A 5CBRA 3UIFA 4I62A 2XXIA 1VFDA 2GHBA 2PVUA 2NWJA 5FHOA 3IOUA 2ZMBA 1SDXA 1S50A 3W15C 2O7UA 1L5TA 5I84A 3PUWE 1B5JA 4LQ5A 3M8UA 4RA1A 1F9BA 3SERA 5I57B 3PD9A 3LSWA 2ZNUA 3MZBA 2V84A 4FE8A 3GXAA 1JQFA 1B3LA 2I58A 3O97A 2V3UA 3EN3A 1SYIA 2RF1A 2NOOA 1LAHE 2QS4A 4XIGQ 4ZE8A 3S9EA 3S4UA 3IB0A 2FNCA 1US4A 4KYSA 1URSA 4G68B 3Q25A 1IXCA 3S9MC 3QUJA 3KZGA 4ELRA 1MPDA 3K1PA 2ABHA 4U21A 4YB7A 3ILTB 3ONMA 2D3IA 5I58B 3Q28A 3GZGA 3MPKA 1LSTA 4NWCA 4EQ9A 1AIVA 3E9XA 1IITA 2PYYA 4MLVA 3SEUA 3FJGA 4DXUA 1TWYA 1ZMGA 3DP4A 4IGRA 1LB9A 4IO5A 2ALUA 2XXTA 4KYDA 4FAJA 1I69A 4ELOA 3N26A 1USYH 4GL0A 2DYXA 3N6UA 3JV9A 1VSOA 4LZ8A 5FHNA 4I8CA 4RJZA 4KCDA 3FVKA 5DTBA 3B6QA 2XXUA 3O6IA 4YZZA 4OQOA 4MH5A 2DVZA 2P1SA 1Y4TA 3MVWA 3K6XA 4RYAA 2DWJA 4F31B 2QL3A 3BBRA 3HPIA 5HM4B 3P7IA 1MQGA 2B65A 2RC7A 3MW0A 5J1DA 2HAUA 4H5GA 3C31A 4GVOA 1SVXB 4ND9A 4ZEDA 3TCFA 4BLAA 3FVGA 1SW4A 3H6VA 2XXWA 3FVNA 3K6WA 2VD2A 1P1NA 2DE4A 4G68C 1NNTA 2ANJA 1GR2A 4ZEIA 4YKPA 4U2RA 3RQTA 3QIMA 4U1OA 5ICQA 5DYHA 5AA4B 4OESA 4DXCA 1ZBMA 3SEXA 5JK4A 4NWDA 2AIXA 2I4BA 4OFJA 2UYEA 3KJ7A 4PFUA 4GRKA 2OBGA 4TLMB 2DWAA 2HXWA 4NF6A 3IOTA 4F3BA 1T0KA 4KPTA 1QUJA 4KYEA 4F3GA 3K0VA 1DOTA 3O29A 1UTHA 3ZSFA 1D9VA 1JETA 1D4NA 1YTVA 4LUBA 1YPNA 4PFYA 2I0CA 1OLCA 5HBCA 2QS1A 2M8CA 1XVXA 2FYIA 1FQAA 3H6UA 4HS7A 4QSEA 4QSCA 5L9MA 3TKDA 3U1OA 1IUDA 2GRVA 3TDJA 4EXKA 2REGA 4EDPA 1P1WA 3EHTA 4KFQA 2V93A 1ZTYA 1FQDA 1N04A 4YU0A 3K1NA 3DELB 4KI0E 3BFTA 4ZEFA 1LAGE 1SD3A 3RLFE 3CR9A 4IY6A 3PU5A 4EQBA 1H76A 3RGYA 4C0RA 4Z0IA 2O51A 4IO3A 3MVZA 4QHQA 5KZTA 4FIMA 1OIBA 2Z23A 2OWTA 4QF9A 1M5FA 5DEXB 4G4PA 5I59B 2DVCA 2F34A 3E13X 4BDMA 4UACA 3TTLA 3R7XA 2UYFA 1MPCA 3ILUB 4HW8A 5CMMA 4X48A 2UVGA 2O69A 3C9HA 4G68A 4HCYA 3LSXA 2YLNA 4ZDMA 1URDA 2VP1A 1B0HA 1XVYA 1AOVA 3SKPA 1Y4CA 3QAXA 5A5XB 4AB5A 2I0BA 2WKYA 4BDNA 3KBRA 2GH9A 4DZ1A 1SQYA 1MXXA 1PBPA 5DVFA 3H3GA 4M1VA 1EH3A 4IO2A 3MPLA 1N0TA 5I2KA 4P0IA 4H67A 1B32A 2XXQA 4OXVA 2DWIA 2LAOA 3TFLA 5K2YA 2VGQA 3SDFA 3UP9A 1OVTA 1B9JA 1LCTA 4KHZE 2FA7A 1VFEA 2YPNA 4NF5B 4FEBA 3G3HA 1B3FA 4EXLA 4MF3A 4PE5B 1IIWA 2Q2CA 3TTRA 3G7WA 4I9DA 3H6WA 3KOTA 1A54A 4JBZA 1SBPA 3EHUA 4WEPA 1PC3A 1QKAA 4XKQA 3JYRA 4WKMA 4OERA 4R9FA 3PUYE 4OWDA 5EHMA 1FTLA 4FATA 4G8HA 1A55A 4XKRA 3U72A 4NF8A 1Y3PA 4R72A 1JW1A 3BKIB 3VLWA 3T9XB 5EYFA 4ELQA 1BTJA 4XKNA 2UXAA 4HCWA 2CMOA 5DVJA 4JWXA 3MQ9A 1TFDA 2QS3A 5TPAB 5AA2B 1Y3QA 3SEWA 4F29A 4POXA 1MQHA 5I2NA 2HQ0A 3Q29A 4GIZA 1B4ZA 3CSGA 2XXVA 3C36A 5H8HB 1EU8A 3TPAA 2F6PA 3DP8A 1DMBA 2OWSA 1XOCA 4TQUQ 4OVJA 2R6GE 2DE3A 1R1NA 2ZYOA 2W7YA 2XHDA 3U92A 3PUVE 2X7PA 4IO6A 5IAIA 1XC1A 2I48A 1SW1A 1GTKA 3OENA 4DDDA 3IX1A 2O7IA 3IJOB 3MC2A 1ZLQA 2DSFA 3TQLA 2D5WA 4RNSA 3TZAA 4IY5A 2DP8A 4G8MA 1SI0A 3WAEA 2A5SA 4PFTA 1PBQA 2OZZA 4PQJA 2AYSA 2F7AA 1Y3NA 3O66A 1NH7A 3OO6A 3LC8A 1J1NA 1ZKBA 3QXMA 4EQ7A 4BDRA 1AH5A 4KD5A 1DTGA 3O6GA 3L6GA 5TU0A 1Y1MA 4OFLA 2NVUB 4ESWA 1Y1ZA 1QW0A 2V3TA 3VLUA 2Q88A 4ZECA 1MG1A 4R6YA 3FXRA 1FTJA 1B5IA 4KCCA 3B7DA 4C1UA 1P99A 5DEXA 3R6UA 2Z8EA 5I59A 1N3XA 3TODA 5JEIA 3T9VA 5KCJB 5FTIA 3MUQA 1NMUA 1OLAA 3N5LA 3RT8A 4AB6A 2F7CA 1NNFA 2F7BA 1BKAA 3C4MA 1LLSA 1B52A 3I6VA 3KSXA 4R73A 2P2AA 1S9TA 1FW0A 1P1QA 4QFLA 3RT6B 4RK9A 2I49A 3A09A 3PPQA 3IK6B 4H8JA 2IEEA 1D9YA 1HSLA 4O3BA 1QKBA 3KJTA 4EUOA 1OMPA 4YKIA 3RUMA 1I6AA 4MLQA 4O3CA 3CIJA 3EPEA 5H8NA 1PB8A 1MRPA 3VVDA 2Z8DA 2DS9A 3QUFA 3IOVA 1B1HA 1MM7A 4DLDA 2O1LA 3T66A 3PUXE 2Y84A 3T93B 3RPWA 4P11A 3BFUA 4NF5A 3TAJA 4OFOA 4TOZA 4GXSB 2UVIA 1WVJA 1UIUA 1M5EA 3MAMA 2D21A 4H8IA 5ITPA 3DP6A 5BUUA 1M5DA 3QYTA 1ANFA 1NL5A 1O64A 1B40A 1NNPA 3K4UA 3D4CA 4OEUA 5H8FA 1Z7NE 3K02A 1MDP1 2O1MA 3FGSA 4NF4B 5I56B 3RTFB 3IB1A 4DCYA 2UVJA 4FECA 1ZU0A 4PETA 4K3FA 3OO8A 2XXXA 1MQJA 3PGFA 3VDFA 3D4GA 2O84X 3PPNA 3Q26A 1NH8A 3LBSA 2QMXA 1SYHA 1XT8A 2RCAA 3HV1A 1XS5A 4N13A 1SW2A 3C35A 1PB7A 2XXHA 4DIGA 5CC2A 4L17A 4F1UA 1YCJA 4RY1A 4E0WA 2V3QA 1CE2A 3TMGA 4P0GA 3CVGA 5H8HA 4QSDA 3JZJA 3HSTA 1PDAA 4JSDA 3QSLA 4G77A 1QVSA 1B46A 3OELA 3FXUA 4TLLB 1H43A 5B7DA 3HO7A 1I6BA 5HPQA 3TELA 3DLNA 3IR1A 3EHSA 3PPPA 3OSQA 1B7HA 3U94A 2RCBA 1OQHA 3K2DA 1QUIA 4YAHX 1DPPA 3PD8A 5CMBA 4PFWA 1MDQA 4Q5TA 1PB9A 2Y7WA 3K6VA 5I57A 4YB6A 3OO9A 1P1UA 3VFJA 1MY0A 1FQFA 4ISUA 3H03A 3MVXA 3ZKKA 4F2OA 1P1OA 3MP8A 4F3PA 3I3VA 1EZPA 2YJPA 1UQWA 3A3CA 1B1XA 2F97A 2E1SA 4WXJA 4XTCQ 1MM6A 3K1MA 4R9GA 3TYHA 2F8DA 2Q89A 3OEMA 4IO4A 1BP5A 3LSFB 3OD7A 4GD5A 3W9WA 4OEVA 5I58A 3OO7A 4GXAA 1I6QA 1N76A 1N7WA 4QFKA 1B5HA 4YKKA 3FV2A 3ECRA 2QPQA 4YMBA 1N3WA 2ZNSA 2DE2A 4RPOA 1A7LA 3VV5A 2A5TB 4POWA 5ISUA 1IEJA 3SEVA 1FTMA 3CSBA 3V83A 5KCJA 3U8QA 1IQ7A 3MP1A 1EZOA 1MH4A 1MY1A 3UK4A 3MZ1A 2F78A 4U1ZA 1VE4A 1JVYA 5CRYA 4GL8A 1A99A 3T9HB 4FJPA 3FJ7A 4OYVA 2PBWA 4FEDA 3TCGA 2AL5A 1US5A 1IXIA 2DOJA 1PEBA 1LCFA 3PV0E 2XX7A 3VE1B 3LR1A 4MFIA 4Z7EA 4Q8RA 1MPBA 4IO7A 3O9PA 3VLVA 5H8QB 1QJMA 1H44A 2QS2A 4QFPA 1R9QA 2RINA 3SEYA 1SW5A 3IOWA 3O2AA 3H6TA 1H45A 1VR5A 4MBPA 2DXYA 4C1TA 1WDNA 1EZ9A 3LSLA 1YAEA 1BLFA 4F18A 3UN6A 1LFGA 5FTHA 1USYE 4Q30B 3ZKLA 3FIRA 4JSOA 4LA9A 4OMBA 5F1QA 2HAVA 2DQVA 3G3FA 2RKMA 4NF6B 4R2BA 2OLBA 2GHAA 4X9TA 1MY3A 2I4CA 5L8DA 3G3KA 1Z7ME 2QRYA 3OEKA 1R9LA 4KQPA 3HCQA 2IA4A 2VOZA 1JNFA 2Z22A 2XXYA 1UTHB 5FHMA 2HZLA 2ZYKA 1MXUA 3KFMA 3TTKA 4H0WA 5I56A 2I6EA 2Y7RA 4YMAA 5AA4A 2XD2A 5CM6A 1B6HA 3CRBA 3B6WA 1JVXA 4H6DA 2CZLA 1UIVA 4M4GA 1LFHA 1TFAA 3F11A 3V5AA 3IB2A 1RKMA 2PT1A 1ZJLA 2UVHA 2Z8FA 2BJJX 1MS7A 5AA1A 4R75A 1IXHA 3C34A 4GQOA 1UTBB 1BIYA 1MQIA 4IGTA 1MY2A 4OHNA 3L6HA 3GBBA 5K2XA 3SESA 5JTYB 1WODA 4F3SA 4AQ4A 2VHAA 4JWOA 4R74A 4LATA 4OTEA 4E0XA 2DWHA 5M2VA 3MBPA 1MXZA 1IZ1A 1TT1A 1B3EA 5DT6A 2RC9A 3TQWA 3FJMA 1MXVA 2PX1A 2X26A 4LQ2A 5ELVA 4HTGA 4JWYA 2H99A 1Q1KA 4NEDA 1FTOA 3N94A 4XKPA 3PMWA 5CMKA 3B6TA 1A40A 2ZNTA 3IORA 3IAZA 4KR5A 3MWBA 3N6TA 3T22A 1LBBA 1Y9UA 3WAFA 4ONYA 3K6UA 1AL3A 1M5CA 2QJEA 1LAXA 3KEIA 2THIA 3FVOA 2QSXA 4U4XA 3FZVA 4PP0A 4H5FA 1MXWA 5I2KB 4JXIA 1A8FA 5TP9B 2PT2A 1MQDA 2HCAA 3S2VA 3RN8A 1M5BA 4WEDA 3TTMA 3FV1A 4ZZAA 4F1YA 2VD3A 4BDLA 2Q8JA 3AXFA 3RY3A 2G29A 5AA3A 5A5XA 1B0LA 2XXRA 5KDTB 1ELJA 3E3KA 1Q35A 4YB5A 4LVQA 3EQ1A 1LBCA 1IXGA 4F1VA 1B05A 2A5TA 3FASA 4F22A 3K00A 3T9UA 2QMWA 1A8EA 1NFTA 4LZ5A 2XX9A 1GGGA 4DXBA 1B7ZA 3ODBA 1XHYA 4NF8B 4G2ZA 1N7XA 3A3UA 2GFEA 3DM0A 3HN0A 2ZYNA 4UA8A 1B2HA 4N6PA 4ZEKA 3MZ9A 3RNNA 3H4ZA 2OCUA 1AMFA 1GV8A 3CG3A 5I2NB 1H3DA 5CI5A 2HFBA 5BWJA 5H8QA 2ONRA 3O28A 2ESNA 3UA8A 1RYOA 3OOAA 4LP2B 1CB6A 4F2QA 1FQEA 4LZ7A 3M3FA 4Q0CA 3SETA 1LGBC 3KN3A 3PPRA 4F19A 5TPAA 4IB2A 5AA2A 1HSJA 1R6ZA 4OZ9A 1B3GA 3CFZA 4THIA 3K01A 3KG2A 3RTWB 4U4SA 5IKBA 4XXUA 1S7YA 4ECFA 2Q9TA 5LOMA 4BDQA 3MJNA 4DE8A 3CG1A 3VXCA 4GLIA 4YICA 5CBSA 3MVYA 1JW5A 3KOSA 4LONB 4QFOA 1ATGA 1OVBA 2G93A 2R9JA 1FQBA 1N84A 4O3AA 4GWOA 1FQCA 3IJXB 4GF8A 5L9OA 3USDA 5F7VA 3Q27A 4RK2A 1LB8A 1UTBA 3U93A 1D3KA 3VXBA 3TCHA 3H06B 1HSEA 4GOTA 4EF1A 3HHGA 2ZXTA 2F6GA 2H9BA 1JEUA 5B70A 4FORA 2XD3A 4NTLA 2H25A 4QRZA 2DXRA 2NXOA 3CI8A 5JTYA 5L9SA 3FATA 4R6HA 3VVFA 3OMBA 3KN8A 3O6HA 1QUKA 4ESXA 5H8SA 2H5YA 1B7UA 3FD3A 3T96B 2Q2AA 3HHFA 3FUZA 3C33A 2F5XA 2H4IA 3CFXA 3I5OA 1OQGA 5CMCA 1DPEA 1FTKA 2Y7KA 3FXQA 2KLFA 5ICTA 2B3BA 3PMXA 3GLBA 2I3WA 3W9VA 1URGA 3PUZE 4H65A 4ZE9A 4U22A 1POTA 4U23A 2V25A 2ONKE 2H98A 2ZYMA 1NKXA 4BDOA 2E0SA 1JW4A 1LFIA 2OK2A 1LAFE 3LUYA 1B58A 2P0SA 4ZZEA 4H1XA 1B4HA 3IO4A 2O68A 3PPOA 2B3FA 4I1DA 2HZKA 3CFLA 5TP9A 4X1DA 3TTNA 4F39A 5H8NB 1DSNA 4RPNA 1O63A 3M3LA 4OETA 5AE4A 3THIA 4EF2A 2OJTA 4GFRA 2R71A 3V89B 3OXNA 4X1BA 1Y20A 5KDTA 4ELPA 3IO6A 2RC8A 4RXLA 3R26A 1QULA 4YKJA 1POY1 1DTZA 5AA2D 1ZIUA 2HEUA 3E4RA 2ONSA 1MY4A 2REJA 4QFNA 5DVIA 1O7TA 2Y7PA 5EHSA 3KGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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