1NNPA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-atpa at 1.9 a resolution. crystallization without zinc ions.
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Three-Dimensional Structure of the Ligand-Binding Core of GluR2 in Complex with the Agonist (S)-ATPA: Implications for Receptor Subunit Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 84
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnpA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nnpA02
4E0XA 3LSLA 4GL8A 5H8HB 3QSLA 1LB9A 3I6VA 3K00A 4WKMA 3K6XA 1O7TA 3IB2A 4ZE8A 3OELA 4GD5A 4QRZA 4LUBA 3IB0A 1IXCA 1CE2A 2YPNA 4QSDA 4GF8A 4NE4A 4ZEBA 3IOTA 3FJGA 3L6HA 4F1UA 1TXFA 3TMGA 1CB6A 1MDP1 1MS7A 3S4UA 5AA2D 3U94A 3KZGA 1UTHA 2REGA 5ISUA 1ZKBA 2G93A 3G3KA 2I49A 1B5JA 2RF1A 1PBQA 4ESWA 3KOTA 1FCKA 1B40A 2Y7KA 3E3KA 2HFBA 1SW4A 3FGSA 4M4GA 5IKBA 2HQ0A 3PUXE 1XVYA 1UTHB 2NOOA 3K4UA 4AB5A 3TTNA 3TQWA 5L8DA 4OEVA 4OXVA 4GRKA 4GLIA 3O66A 4K3FA 1NMUA 2Q2CA 3FIRA 3FVNA 2Z8EA 1SDXA 2DQVA 2CZLA 1DTZA 4UACA 2XX7A 3L6GA 5TPAA 3THIA 3FJ7A 1URSA 3C36A 4BDRA 5AA2A 3JV9A 2DXYA 3HPIA 1PEBA 1ZTYA 3EHTA 2B3BA 3EF7A 3K6WA 1UTBA 2VGQA 3PV0E 3TTRA 1MPDA 2UVGA 3USDA 3VXCA 2ANJA 5TPAB 2RC9A 1ELJA 5AA2B 2ZMBA 3HO7A 3N94A 4OTEA 2GHBA 3QUFA 1B05A 3ODBA 3KGCA 1Y1ZA 1UTBB 2I48A 3KN3A 4JWYA 4DXBA 2F97A 5F7VA 3PUYE 1LCTA 3QUJA 1MXZA 2F34A 5DVFA 2XXYA 4F3GA 3T9XB 2XD3A 4IO3A 2QS4A 1B7ZA 4F39A 3H6WA 4JWOA 3SKPA 5ITOA 3TELA 2NVUB 3MWBA 1IZ1A 2V3UA 5HBCA 2E0SA 4OESA 3JYRA 3FVGA 1LCFA 2B3FA 4ELQA 3ZS6A 4YMBA 1ATGA 5JEIA 4EF1A 3IAZA 2ZYMA 3SEWA 3LUYA 3O6IA 5B70A 1A40A 1PB7A 4OZ9A 4QSCA 5DVIA 1D4NA 4IB2A 4R9FA 4PFWA 1SI1A 3TTLA 4IO6A 3CG3A 1T0KA 4X1BA 2I4CA 4MFIA 4U1OA 5J1DA 4BDMA 1EZ9A 1R9LA 2F36A 4KI0E 3V89B 3TQLA 1FTKA 3FATA 3DM0A 1PBPA 1O64A 1NNKA 1M5DA 1N04A 2PVUA 5K2YA 1M5EA 4Z7EA 1WVJA 3MAMA 4KYEA 1NFTA 3W9WA 4XKNA 2O7UA 3GXAA 3G7WA 3N5LA 2VP1A 1LLSA 3V83A 1GV8A 1VSOA 3EHUA 3EPEA 5CMMA 2DYXA 4G8HA 3GBBA 4TOZA 2H5YA 2XXIA 3VLVA 2KLFA 1PDAA 4OVJA 4GQOA 3HV1A 4F2QA 2F6GA 1A8EA 1FQFA 4LONB 3AXFA 2O1MA 1JW1A 4TLLB 1Q35A 3O9PA 5DT6A 4ZZAA 1POTA 2I4BA 4QF9A 2F7AA 3H6UA 1OVTA 1YTVA 3ECRA 1FQEA 2X26A 2XXHA 4OFLA 3LR1A 2H98A 4RY1A 3FXUA 1D9VA 4XKRA 2I6EA 2RC7A 4C1UA 3D4CA 4ZEDA 4GXSB 5AA1A 1PB9A 2F8DA 2DWAA 1P1OA 3MP8A 1DTGA 3RLFE 2OJTA 3TODA 3HN0A 3B6TA 4U4SA 1GVCA 3M3LA 4PE5B 3S2VA 1EH3A 4GVOA 1IXGA 4PQJA 1A8FA 1H76A 4QFPA 1QUKA 4E0WA 2GH9A 3DELB 5I58A 4WEPA 4MLQA 3MZBA 1KWHA 1I6AA 2QPQA 4N13A 4EQBA 4YKIA 4Q30B 3OSQA 1URGA 3QK6A 4F18A 1IIWA 5CBRA 4DCXA 3IB1A 4POXA 5BWJA 5I58B 2FA7A 3G3FA 3H6TA 2R71A 3VLUA 2D3IA 4MLVA 5LOMA 5I2KA 4PFTA 4C1TA 2DE4A 1ZBMA 3K02A 5ITPA 3KBRA 3E13X 3O6HA 2DVZA 4NWDA 4O3CA 1B3EA 4YKKA 4AB6A 3U92A 1ZMGA 1LFHA 1QKAA 4P0GA 2HZLA 2XX9A 5I2KB 2Q9TA 2ABHA 2HAUA 3MVZA 4HCYA 2ZNUA 1B6HA 4YKPA 4Q8RA 3HSTA 1IQ7A 4PFUA 4F1YA 1YPNA 4DCYA 2QMWA 2V3TA 4KR5A 2X7QA 3KJ7A 4IO2A 3E9XA 5KZTA 3MP6A 3R6UA 1B46A 4YB5A 1XT8A 5H8QA 3SERA 1Y20A 1B4HA 1B32A 3KSJA 4GWOA 2FYIA 4L17A 4X1DA 4G68C 4C0RA 4G2ZA 3O28A 1N76A 1DPEA 2ZYOA 3KOSA 4FJPA 5F1QA 5KDTA 1JEVA 4IY5A 1LGBC 3ILUB 3LSXA 3U72A 3PPOA 4U4XA 1QVSA 3OEMA 5H8QB 4LZ8A 1AL3A 4EXKA 3HHGA 2HZKA 4YB7A 3SEUA 4OQOA 1ZJLA 1SBPA 1DSNA 4F3PA 3V8XB 2R9JA 3IORA 3B6WA 4N07A 5KDTB 1PB8A 1WODA 4F29A 4NMYA 2UXAA 1UIVA 2D5WA 4NEDA 1OIBA 3GBAA 3G3GA 1N7XA 2UYFA 3CVGA 4RPOA 3QXMA 2Q88A 3MBPA 2DE2A 5BUUA 4R9GA 4ND9A 3T9HB 5DYHA 1YAEA 2Y7RA 2X7PA 3D4GA 1LBCA 3S9MC 3O29A 2DXRA 4O3BA 3OD7A 1J1NA 4H8JA 3VDFA 2CMOA 1JEUA 4RXLA 2XXWA 2V25A 2VD3A 4QHQA 2Z8FA 3JZJA 3H6VA 5FHMA 2QL3A 1MY2A 3T93B 2ESNA 4GXAA 4G8NA 1RYOA 2V93A 2ZXTA 4UA8A 1LFGA 3QIMA 4I1DA 5IAIA 3MVYA 2QJEA 4LA9A 4YICA 3SEXA 2ONRA 2AL5A 5JTYA 3UIFA 1FQBA 2D21A 4DIGA 4ESXA 4RYAA 5EHSA 1LSTA 2O6AA 5AA3A 1VFEA 4F3SA 4ZEFA 1SW2A 3LSWA 2UVIA 2P1SA 5JTYB 5B7DA 5CC2A 1MQIA 4RK9A 1XOCA 3ZKLA 3UN6A 1MY4A 3RNNA 5L9OA 1BP5A 1LAGE 1N7WA 1BKAA 1Z7ME 3MW0A 1B1XA 4MBPA 3W15C 3CFLA 1PC3A 2Z8DA 3RN8A 2NXOA 2ONSA 1QUIA 2VOZA 4YMAA 2THIA 2REJA 2AIXA 3RTWB 3VLWA 1POY1 3CIJA 3ILTB 3RT6B 3VVFA 4NWCA 1Y4TA 4KCCA 3K1NA 2OK2A 3VV5A 1MY3A 3Q29A 4XKQA 1P1UA 3TCHA 3ZSFA 4GOTA 4P11A 3MQ9A 4G68A 1OLAA 5FTIA 3G3JA 2Z23A 1LAHE 3FZVA 3T66A 4LVQA 4DDDA 3CR9A 4X48A 3IX1A 3SDFA 1GR2A 2H25A 3CG1A 4G68B 1S50A 1SD3A 3RGYA 3VXBA 2IEEA 4H5FA 1AOVA 4TQUQ 5AE4A 2Q8JA 3IJOB 4POWA 3OXNA 4ZE9A 3TCFA 4ONYA 4KYDA 5CI5A 3KEIA 1TT1A 4DZ1A 4I8CA 1B3LA 1MXYA 3PMWA 4ZDMA 4LP2B 4ELPA 2XXUA 2A5TA 4XIGQ 1XVXA 1NNFA 4IY6A 3IO4A 3H4ZA 3PU5A 1USYE 1SYIA 4M1VA 3OMBA 1P99A 3MPKA 1MY1A 3U1OA 3OO6A 1N3WA 4ZZEA 4FEBA 1MQJA 5ICQA 1Q1KA 3PPQA 2B65A 2HAVA 3A09A 1OVBA 1MQDA 3PPPA 2VD2A 1XHYA 4P0IA 5TP9A 1B52A 4LZ7A 2A5TB 1M5CA 4R2FA 2Q89A 1GTKA 3IOVA 1XC1A 3O2AA 4IO5A 4DXUA 3FVKA 1FTOA 4XTCQ 3TDJA 5I56A 2M8CA 2QMXA 1Y3PA 2RKMA 4R72A 1FW0A 5CRYA 5I59A 5TP9B 5H8NB 1SVXB 1FQCA 4QFKA 4H1XA 3H03A 1QJMA 3LSFB 4XKPA 4ELRA 1MXVA 2O84X 2PYYA 1AIVA 3FV1A 3VFJA 4H67A 1IEJA 2PBWA 2BJJX 2Q2AA 5I56B 1NNTA 1B51A 3CI8A 1F9BA 4LZ5A 5TU0A 1B0HA 1M5FA 1MQGA 5I59B 4EUOA 4JB7A 2XD2A 1XS5A 3MVXA 3SEYA 3UP9A 4RA1A 4U21A 4ISUA 3FXQA 3FVOA 4PP0A 2XXTA 1B0LA 4U2RA 1SYHA 3MP1A 1Z7NE 1L5TA 1FTMA 4NF8A 4ELOA 3RY3A 3RTFB 3Q27A 1VR5A 4U23A 4JBZA 4BDNA 1D9YA 4JSDA 2RINA 3BFTA 3F11A 4EXLA 3IL1B 2F6PA 1MY0A 4EQ7A 1JW5A 4NF8B 3DLNA 4NF5A 3KSXA 5KCJA 1B7HA 1LFIA 1ZIUA 1R6ZA 4THIA 4R2BA 3RUMA 1LAXA 4KD5A 2XHDA 4ZECA 3FUZA 2O7IA 2GFEA 4NF5B 3V5AA 3RPWA 5KCJB 1JW4A 1IUDA 1DMBA 4O3AA 2RC8A 3MZ1A 1B3FA 2Y7PA 2HXWA 3PD9A 3A3CA 2DVCA 2GHAA 1IXHA 2DE3A 3CSBA 5EYFA 3DP4A 4FIMA 4IGRA 2W7YA 4U22A 2PMSA 4H8IA 3T22A 4QFNA 1USYH 2F5XA 4U1ZA 1QULA 2F7BA 4H6DA 1SI0A 2DWHA 3GLBA 1Y4CA 4NF4B 1B5HA 4F22A 2ALUA 4RJZA 2I0CA 2Z22A 3K1PA 1AH5A 3FASA 4KFQA 4OERA 5I2NA 2NWJA 1TFAA 1OMPA 3K6UA 1MG1A 4BDLA 3K01A 3B6QA 3TTMA 3Q25A 2P0SA 1LBBA 2I58A 1NL5A 2QS1A 4PETA 2XXQA 3T9VA 3VE1B 4N6PA 2XXRA 4F3BA 2AYSA 1TWYA 4RPNA 2DWIA 5I2NB 3OO8A 1ANFA 3TYHA 2PT1A 3K2DA 3SESA 4YAHX 3PUVE 4NTLA 1FQDA 2LAOA 4JXIA 5JK4A 5DVJA 3R7XA 3K1MA 3HCQA 4Z0IA 2UYEA 4OEUA 2ZNTA 1ZLQA 2OCUA 4KHZE 5HM4B 2XXXA 3H7MA 3P7IA 4FATA 4IO4A 3C34A 1B1HA 1B9JA 2H9BA 4F19A 1US4A 2ZNSA 3R26A 3OENA 2OZZA 5FHNA 3G3IA 3PMVA 4OHNA 4YZZA 4FORA 4Q5TA 3UA8A 4FE8A 1S9TA 1FTLA 2XXVA 3T96B 3EQ1A 1MQHA 1LB8A 3IK6B 3C4MA 3BKIB 2H99A 1B5IA 3T9UA 1GGGA 1DPPA 5CBSA 5HPQA 1IITA 5K2XA 4I9DA 3TPAA 4MH5A 1I69A 4R75A 4G8MA 2AL4A 1VFDA 2F35A 4R6HA 3KN8A 1B2HA 2YLNA 4LQ5A 1HSLA 3U93A 1JVYA 3U8QA 3Q26A 1II5A 4R73A 2FNCA 2WKYA 1DOTA 4GL0A 2ONKE 4FECA 1JETA 1AMFA 4DE8A 2QRYA 3N6UA 3S9NC 5I84A 3MJNA 3Q28A 4OFJA 3CFZA 3IR1A 1B7UA 4OWDA 4Q0CA 5CMCA 1SQYA 3SETA 2O68A 4H65A 1JVXA 1JNFA 2PT2A 3FXRA 3N6TA 3OOAA 2QS3A 3DP8A 1A54A 4HW8A 1I6BA 5M2VA 1FTJA 4DXCA 3MC2A 4RNSA 3I3VA 3TFLA 2G29A 5EHMA 2YJPA 3O6GA 3OO7A 1LAFE 5H8FA 1HSEA 4YU0A 3UGWA 4OENA 1HSJA 1RKMA 4NF6A 3UORA 3FJMA 1MDQA 5A5XA 3MVWA 3LC8A 5ICTA 1N3XA 1H43A 4R6YA 1MH3A 4I62A 5FTHA 5H8FB 3ONMA 1TFDA 3C35A 4JSOA 1MPCA 4H0WA 4NF6B 3RQTA 4X9TA 5DTBA 4JDFA 1Y1MA 2XX8A 4KPTA 5A5XB 3PGFA 3K6VA 1MH4A 1OQGA 4PFYA 2DP8A 3C33A 3QAXA 3FV2A 3O97A 4HTGA 4F31B 1P1NA 3CRBA 4ZEKA 3LBSA 4DLDA 1MM7A 4OETA 1FQAA 5L9SA 2Y84A 1MPBA 4WXJA 2NUVA 4LQ2A 3RT8A 1B3HA 4FEDA 3KJTA 4G77A 4EF2A 5AA4A 4QFOA 3HHFA 3GZGA 1SW1A 5I57A 4IO7A 4RK2A 1URDA 1BTJA 2QSXA 3PUWE 4BDQA 2F78A 1QUJA 3IO6A 4AQ4A 3TKDA 5CMKA 1B58A 1OLCA 4OYVA 1SW5A 5H8NA 5AA4B 4ZS9A 3PD8A 1R1NA 3DP6A 1Y9UA 4FAJA 5I57B 2DOJA 4R74A 4GIZA 3A3UA 1YCJA 3S9LC 1JQFA 2F7CA 4TLMB 3QYTA 1MXXA 5L9MA 2DSFA 1WDNA 2O1LA 2A5SA 3KN7A 1NNPA 1BIYA 1I6QA 3M3FA 2QS2A 3E4RA 1ZU0A 3C31A 3M3KA 4KCDA 4QFLA 1Y3NA 3H06B 2Y7IA 1MXUA 3VVEA 3CFXA 4BLAA 3MUQA 4F2OA 1N0TA 2RCAA 5DEXA 4GFRA 5CM6A 2OWTA 3IJXB 1BLFA 3I5OA 3PPRA 3ZKKA 3BFUA 1MXWA 3UK4A 3CSGA 4OMBA 2ZYKA 4IGTA 1UIUA 2V3QA 3VVDA 3W9VA 3C32A 1B3GA 1M5BA 4JWXA 3H3GA 2DWJA 5DEXB 1US5A 1H44A 2HEUA 2OWSA 1A55A 4HS7A 3N26A 1B4ZA 2OBGA 3IOWA 3TUSA 2ZYNA 3B7DA 4QSEA 3IOUA 2I0BA 2O69A 1MRPA 3EN3A 2HCAA 1QW0A 4R6KA 2IA4A 5H8SA 1A99A 3TTKA 1OQHA 2XXPA 1UQWA 3TEPA 1H45A 2V84A 2DS9A 2I3WA 4KYSA 3KG2A 2R6GE 2UVHA 3M8UA 4ZEIA 4G4PA 2GRVA 4EQ9A 1O63A 1A7LA 1H3DA 3BBRA 3EHSA 3TZAA 1NKXA 1Y3QA 2H4IA 4NF4A 3C9HA 4YB6A 2Y7WA 4ECFA 2OLBA 1VE4A 1S7YA 4H5GA 4MF3A 1NH7A 3S9EA 1N84A 2O51A 3PMXA 1EU8A 3PUZE 5CMBA 4KQPA 3PPNA 3TCGA 3KFMA 3OO9A 1MM6A 3WAFA 1P1WA 4LATA 4XXUA 3WAEA 4EDPA 2VHAA 2P2AA 1QKBA 4F1VA 3K0VA 3MZ9A 1RYXA 3TAJA 3FD3A 1IXIA 1R9QA 4BDOA 2UVJA 5H8HA 1EZPA 2E1SA 3G3HA 2RCBA 1D3KA 2I3VA 1NH8A 1P1QA 2PX1A 4HCWA 4OFOA 1EZOA 5FHOA 5ELVA 3MPLA 3OEKA 3OSRA 4WEDA 3SEVA 4YKJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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