1NNTA

Structural evidence for a ph-sensitive di-lysine trigger in the hen ovotransferrin n-lobe: implications for transferrin iron release
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural evidence for a pH-sensitive dilysine trigger in the hen ovotransferrin N-lobe: implications for transferrin iron release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
source organism Gallus gallus
molecule tags Iron transport protein
total genus 97
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-09-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nntA02
2UVGA 2ALUA 5CMKA 3PUVE 1MH3A 3K01A 4EF2A 3UK4A 1POY1 2YLNA 3K1PA 4HCYA 3C33A 1MY1A 4OFJA 5CRYA 1R6ZA 1XVXA 3PV0E 5DEXB 3RUMA 1HSEA 4H67A 3H7MA 1JNFA 2ZYKA 4G77A 2VD2A 1N04A 3H6UA 3L6GA 1SYHA 3KOTA 4GLIA 4K3FA 1M5FA 3MBPA 1M5BA 1GTKA 4IGRA 1JEVA 2XXQA 3TTKA 4KD5A 3WAFA 3BBRA 3FIRA 2Z8DA 4HS7A 2FNCA 2V93A 2PMSA 5H8SA 2F35A 3N6TA 4G68B 3D4GA 4R6HA 2OWTA 3H3GA 2M8CA 1OIBA 5H8FB 4R9FA 2H5YA 4Z7EA 4F1VA 1MH4A 3K2DA 3OD7A 4BDNA 1YPNA 2X7QA 4GXAA 2PYYA 1H43A 4OQOA 2RINA 1YAEA 3T22A 4DXBA 3U72A 1B4HA 3U92A 3O29A 2G93A 2P1SA 4EUOA 2I6EA 1QKAA 3IORA 1A99A 1LAXA 1RKMA 1N7XA 5I56B 3VFJA 3VLWA 5CBRA 1I6AA 3TCGA 1EH3A 3QSLA 1SD3A 4YMBA 2OLBA 2DE2A 1DTZA 3ZKLA 4TOZA 1B6HA 4MBPA 1LAFE 4JDFA 3UIFA 1FTMA 5AA4A 2ZYNA 3W9WA 4LZ8A 4MLQA 3MZBA 1SW2A 4EDPA 4H8IA 4RJZA 5FHOA 3SERA 1D9YA 4IO3A 1SW1A 3A3CA 4YKPA 1B0HA 4X1DA 3OSQA 3M3FA 4F3GA 1S50A 3FXUA 2ZXTA 4ONYA 4PQJA 3H6VA 2DWJA 4F1YA 5AA1A 1IXGA 2V84A 2PVUA 4IB2A 1GV8A 4YB7A 2F6GA 2F7BA 1RYXA 3PPRA 3EN3A 3K1MA 3FXQA 5L9OA 5LOMA 3C35A 2ABHA 2DP8A 4U2RA 4NTLA 4RYAA 2RC8A 3N5LA 1A7LA 4WEPA 3C36A 2VP1A 3B6QA 4YB5A 3LR1A 4AQ4A 3GBBA 1DTGA 3TODA 1JW1A 3CFLA 4O3CA 3VV5A 3FJGA 3SDFA 1FQCA 4PFYA 1AH5A 4BDRA 1JVYA 2QPQA 2DOJA 3CFXA 2H98A 3RT8A 1J1NA 1VSOA 4FE8A 2XXRA 4X9TA 5ITOA 1FTOA 2UVHA 4DCYA 3JV9A 3V8XB 4O3AA 5I58A 3E3KA 5KZTA 2DVZA 1MQJA 3IR1A 3ODBA 3PUZE 1O7TA 3B7DA 3SEXA 5I57B 4OTEA 4GL0A 5AA2A 3K6WA 4DXCA 2OBGA 1WDNA 1NH8A 2RCBA 4OETA 4HTGA 2G29A 1B3EA 4ELRA 4GD5A 1IUDA 1ZKBA 1P1WA 3MPKA 4N07A 3FVNA 1URGA 4NE4A 1IZ1A 4LA9A 4LONB 1UIUA 3G3IA 4NF6A 3SKPA 3TPAA 1QKBA 2VHAA 5B70A 1AIVA 5CM6A 4BLAA 1PEBA 3M3LA 1TFAA 3T9UA 1MXZA 4C0RA 2A5SA 4OEUA 2A5TB 4F1UA 1DPEA 3U1OA 2GRVA 2IEEA 4FATA 2I0BA 5EYFA 1N7WA 2XX9A 3C32A 1I6QA 1FQDA 1XHYA 3ILTB 2Z23A 3FVGA 3KSXA 1HSJA 2QS4A 2F8DA 4YKKA 3JYRA 4FORA 1DSNA 1ELJA 1B2HA 1SW5A 3PUXE 1OQHA 2UYFA 3QK6A 4ECFA 3KJ7A 1FTLA 3F11A 2PX1A 4YKJA 2CZLA 1VFEA 4ZE9A 2RC9A 4G4PA 3AXFA 4RK2A 1LAGE 5CI5A 4GF8A 4FAJA 2O51A 1RYOA 3PPNA 1JQFA 4ND9A 2B3BA 4FEBA 3MQ9A 3HO7A 5H8HA 3FUZA 5DVJA 4EF1A 4OXVA 3MP1A 1FQFA 2YJPA 4FIMA 1QW0A 5TP9A 3CSGA 2ZYOA 1CE2A 1GVCA 2F7AA 2O7UA 2XXHA 1SBPA 3S4UA 4H0WA 2PT2A 3VVDA 1H76A 2QRYA 2Y7IA 5AE4A 4QSEA 3MP6A 2ONKE 3DM0A 1LBCA 3CI8A 1M5EA 3KBRA 3RTFB 3DP8A 1Z7NE 4XKPA 2I49A 3O6HA 3RGYA 5JK4A 4QF9A 2F7CA 3CFZA 1MY2A 3R6UA 4PFWA 2HAUA 4I8CA 1VE4A 1Y1ZA 3B6TA 3MZ9A 1YCJA 3G3GA 4AB6A 3EHSA 3PUWE 4NWCA 4ZEKA 4R72A 3VDFA 5M2VA 4OFOA 2Q2CA 4ESWA 3O28A 5AA4B 4EXLA 2I4CA 5ISUA 2B65A 4ELOA 4AB5A 1XT8A 2ZNSA 2Y7PA 5ICTA 4P11A 2VGQA 1B3FA 1EZ9A 4N6PA 2XXTA 4GL8A 4POWA 4RPOA 4U21A 3U93A 3IK6B 4RY1A 1PB8A 2E1SA 1GR2A 3SEYA 3S9EA 1B1HA 3C34A 2LAOA 5DT6A 3C9HA 5FTHA 3G7WA 2DWAA 2V25A 2XX7A 3HV1A 3T66A 4RA1A 1LSTA 2RC7A 3TTNA 1S9TA 3OSRA 1JW4A 5A5XA 4KQPA 3HCQA 1URDA 3BFTA 3V83A 3UN6A 2Y84A 3FASA 4GXSB 3MP8A 3TFLA 1LLSA 1JEUA 3S9LC 4FJPA 1PBPA 4I1DA 1TFDA 1Q35A 4IO7A 4WEDA 3QUJA 1MRPA 1QULA 1MPDA 4GVOA 3ECRA 3H4ZA 4ZEFA 1WODA 3KFMA 3E13X 4NF8A 4TLMB 3HHFA 3EQ1A 4R2FA 1LBBA 1SI0A 3M8UA 2DWHA 5I58B 5L8DA 3V5AA 3Q25A 4FECA 4NF5A 4UACA 5AA2B 3MUQA 1MXUA 2H4IA 2QMXA 2DE4A 1NL5A 2DXRA 3KGCA 2FA7A 1ATGA 2KLFA 2NUVA 1O64A 1MY3A 1Z7ME 4WXJA 4NEDA 3Q26A 4PFUA 3OEMA 1ZIUA 2VOZA 3VLVA 3IX1A 4Q30B 3H06B 3K6UA 2DSFA 2ONRA 1MQHA 1MQDA 1Y4CA 2BJJX 3ZKKA 3SEUA 4DLDA 1D3KA 3WAEA 2IA4A 4NF6B 2NOOA 4H5FA 4DXUA 4F22A 3FV2A 3A09A 3KZGA 5AA2D 3HSTA 4MFIA 2I3WA 5H8QA 3GLBA 1B7ZA 1EZOA 1UTHA 5ELVA 3W15C 3K00A 2I4BA 3O6GA 2XHDA 3IJOB 4OFLA 3OO9A 2HZKA 1IIWA 1Y3QA 1KWHA 3VXBA 5KDTA 4TLLB 1MDP1 4PP0A 3IOUA 5HBCA 3RLFE 1O63A 5J1DA 1LGBC 4LVQA 4F39A 3FJMA 2PT1A 5HPQA 2X7PA 3MZ1A 3RQTA 3PD8A 4U4XA 1A40A 4JWYA 2E0SA 3M3KA 1TT1A 1USYE 4XTCQ 3H03A 5TU0A 1B4ZA 1OVBA 3N94A 4OENA 3MAMA 2V3UA 1MXXA 3GXAA 2REGA 1MS7A 4DIGA 1B0LA 5H8HB 3T93B 4IY5A 3KEIA 1ZLQA 3QIMA 5F7VA 4O3BA 1NNFA 1ZMGA 2Q88A 1A8EA 2F36A 3P7IA 2F97A 2D21A 4KYSA 1N3WA 4PETA 2O1LA 5TP9B 3TEPA 3PMVA 4GWOA 3H6WA 1Y9UA 1N3XA 3FD3A 4R75A 3IOWA 1MDQA 4IO6A 3Q28A 1AOVA 4OMBA 3FVOA 3N6UA 1IEJA 2QL3A 3KOSA 3RTWB 1QJMA 5IKBA 5I2NA 3G3FA 4Q0CA 4NF4A 3IOVA 4U4SA 3K1NA 4TQUQ 4ZEIA 5IAIA 5BWJA 2DVCA 2QS1A 3OOAA 3KSJA 3PUYE 3THIA 1PBQA 5I2KA 1D9VA 3QUFA 2Q2AA 3RN8A 2NWJA 2O84X 2HEUA 4KYDA 5F1QA 4I62A 2R9JA 4L17A 3FVKA 3OO8A 3HN0A 1QUJA 4IO4A 4ELPA 3PPOA 3UGWA 1B7UA 2RF1A 4P0IA 2GHAA 2GHBA 4HCWA 4POXA 3I5OA 5KCJA 1FQEA 4LQ2A 4YU0A 1P1NA 3SETA 4QFPA 3O2AA 3VE1B 2WKYA 1B46A 2O69A 2NVUB 3LC8A 5B7DA 3SESA 4C1UA 3DELB 3A3UA 1DOTA 1I69A 2OCUA 3KJTA 3VVFA 1B52A 4JXIA 4EQ7A 2ZNTA 1FW0A 1Y3PA 3DLNA 5A5XB 1P99A 3VVEA 4YMAA 1I6BA 1M5DA 3K6VA 4F31B 1B7HA 4ZZEA 4BDMA 3TTLA 3S2VA 1H3DA 5DYHA 4LZ7A 3TTRA 3V89B 4Q8RA 2Q89A 2GFEA 5HM4B 1P1QA 1Y1MA 2H9BA 1M5CA 1JW5A 1MPCA 4F3BA 2OWSA 1UTBA 4NF8B 1N76A 5ITPA 4R9GA 4JWXA 3LSFB 4R73A 2REJA 1TXFA 3MVZA 4X48A 4NF5B 5BUUA 2X26A 3EPEA 4RNSA 1P1OA 4KYEA 4BDLA 1DMBA 2XXVA 4ZZAA 3G3KA 3O97A 3BKIB 5AA3A 2O7IA 3FGSA 5EHMA 3HPIA 1XS5A 2VD3A 2XXIA 3U8QA 4IY6A 1OVTA 4OEVA 4Z0IA 3E4RA 2OK2A 3TQWA 1JETA 3LSWA 2Q9TA 2DS9A 3CIJA 3MW0A 1B58A 2H99A 1MXWA 1L5TA 3C31A 2HQ0A 3W9VA 1B32A 1SDXA 4ZDMA 2DWIA 5H8QB 4MF3A 2Z8FA 1MM6A 1BIYA 1UTHB 4THIA 1IITA 3UP9A 2Z8EA 5KDTB 1BP5A 4QSCA 1ANFA 2O68A 3DP4A 2ZMBA 4XKNA 1R1NA 2W7YA 2F78A 4N13A 3OENA 4GIZA 3UORA 2QS3A 1POTA 3MPLA 3OEKA 1LAHE 1MQGA 3OMBA 4QHQA 3MVXA 4DE8A 4F2QA 1NKXA 4BDOA 1FQAA 4DCXA 4HW8A 1B5IA 3B6WA 4LQ5A 2XD3A 1SI1A 4H8JA 2O6AA 3CG1A 2XXXA 3E9XA 4UA8A 3TYHA 4RK9A 1UIVA 4R6KA 4C1TA 4ISUA 1FTKA 3TELA 3IO6A 4OYVA 2P0SA 4R6YA 1B40A 4IO2A 1JVXA 1ZTYA 3K02A 1B3LA 5I84A 3QAXA 2OJTA 3FXRA 3VXCA 1QVSA 3LSXA 4U22A 5CBSA 5CMBA 5I2NB 1ZJLA 1P1UA 3TCFA 3MWBA 4NF4B 3O6IA 4OWDA 4F19A 3T9XB 3FV1A 2V3TA 4YICA 4YKIA 2Z22A 1WVJA 1ZU0A 1NNKA 1XVYA 2RCAA 1T0KA 3EHUA 4QFOA 5H8NA 3VLUA 3KN3A 1A8FA 4U1ZA 3OO6A 5I2KB 2QS2A 5CMMA 4DZ1A 3GZGA 3T9VA 4OESA 4ESXA 4YZZA 4R2BA 3PPQA 3L6HA 3S9NC 3T96B 4IGTA 3LSLA 1NFTA 3I3VA 1BKAA 5FTIA 1N0TA 1LFIA 2HZLA 1OLCA 1MM7A 1H45A 3IOTA 1PC3A 3IAZA 5ICQA 4QFKA 3OO7A 4MH5A 3R7XA 1MY4A 4OVJA 5KCJB 4RPNA 4KPTA 3IB0A 1H44A 4NMYA 4ZS9A 5EHSA 1A55A 3QXMA 1PB9A 4OERA 4NWDA 2XXPA 1MY0A 3EF7A 4ZE8A 3FATA 2Y7KA 1VR5A 4E0WA 3PD9A 3PMWA 2DXYA 4G2ZA 4FEDA 2XXWA 4XXUA 4OHNA 2DQVA 5L9MA 3TMGA 3D4CA 2UVIA 5JTYA 1USYH 1Y4TA 2AL5A 2NXOA 2B3FA 3O9PA 1XC1A 1B51A 5TPAA 5K2YA 4F3PA 4RXLA 4JSDA 3HHGA 4QRZA 3RT6B 4EQBA 3SEVA 2FYIA 1MXYA 3C4MA 3CR9A 3IL1B 3PMXA 4U1OA 1IQ7A 5I59A 1SVXB 4QFNA 3EHTA 2XXUA 1PDAA 2HXWA 4LATA 4Q5TA 3CSBA 3DP6A 4PFTA 4XKRA 1US5A 3ONMA 4MLVA 3CRBA 4GQOA 1UTBB 3TKDA 1TWYA 1AMFA 2ANJA 1A54A 5DTBA 5K2XA 3PU5A 1IXIA 1SQYA 1GGGA 2QSXA 2PBWA 1NMUA 2I58A 1SW4A 4OZ9A 2ZYMA 3G3JA 2AYSA 3LUYA 5DVIA 1LB9A 4IO5A 2ESNA 3T9HB 4LZ5A 4G8NA 1AL3A 4E0XA 3H6TA 2HCAA 3K4UA 5DEXA 4M1VA 4F2OA 3KG2A 1US4A 1Q1KA 4JB7A 1MG1A 1UQWA 1OMPA 1QUKA 3TCHA 4G68C 5L9SA 1XOCA 3IO4A 1R9QA 3IB2A 3Q29A 1LCTA 4WKMA 3IB1A 3ZS6A 4LP2B 3G3HA 2F5XA 1URSA 2P2AA 3KN7A 3U94A 2V3QA 2UYEA 3TTMA 1Y20A 3OXNA 3N26A 4G68A 4YAHX 4H1XA 4XIGQ 4U23A 3GBAA 3LBSA 5H8FA 1B5HA 1FCKA 3ZSFA 2D3IA 4ELQA 2CMOA 2GH9A 5FHMA 3MJNA 3OELA 1S7YA 3KN8A 4PE5B 2OZZA 4ZECA 3I6VA 1LFGA 4F18A 1OLAA 1B05A 2AL4A 5I56A 3PGFA 3JZJA 4I9DA 2XXYA 4JWOA 4KHZE 1F9BA 1LB8A 4X1BA 4ZEBA 1B1XA 1DPPA 1B5JA 2R6GE 1IXCA 4JSOA 2I3VA 4QFLA 4YB6A 1MXVA 4H6DA 1B3HA 3FJ7A 1BLFA 4R74A 2F34A 3TQLA 2D5WA 1B9JA 4EQ9A 2F6PA 2R71A 1VFDA 5JEIA 4H65A 2UVJA 4LUBA 4H5GA 5H8NB 3TZAA 1HSLA 4XKQA 2I48A 3TAJA 1YTVA 2DE3A 4KI0E 3K0VA 3USDA 1EU8A 4JBZA 2Y7RA 1CB6A 2Q8JA 1II5A 4GOTA 3IJXB 3S9MC 1NH7A 1MQIA 4M4GA 2RKMA 3PPPA 4KR5A 3FZVA 2XX8A 5CMCA 3MVYA 3QYTA 2ZNUA 1EZPA 3MVWA 4KCCA 3CVGA 2O1MA 5CC2A 4G8MA 2HAVA 4QSDA 1ZBMA 1NNTA 2AIXA 1FQBA 3BFUA 2DYXA 1LFHA 3O66A 5JTYB 4F3SA 5FHNA 1OQGA 2QJEA 1D4NA 1MPBA 5I57A 1SYIA 5TPAB 4GFRA 3MC2A 4F29A 1QUIA 3UA8A 3R26A 4EXKA 4KCDA 3SEWA 2Y7WA 2UXAA 4ZEDA 2H25A 5I59B 3RY3A 1R9LA 1LCFA 4BDQA 2YPNA 2I0CA 3Q27A 3RPWA 1BTJA 4KFQA 2QMWA 3TDJA 2ONSA 1FTJA 3ILUB 2HFBA 2XD2A 1B3GA 2THIA 5DVFA 4GRKA 1Y3NA 3RNNA 2A5TA 1N84A 1NNPA 3K6XA 3CG3A 1IXHA 3TUSA 4P0GA 4G8HA 4DDDA 1PB7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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