1NNTA

Structural evidence for a ph-sensitive di-lysine trigger in the hen ovotransferrin n-lobe: implications for transferrin iron release
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
SVIRWCTISSPEEKKCNNLRDLTQQERISLTCVQKATYLDCIKAIANNEADAISLDGGQAFEAGLAPYKLKPIAAEVYEHTEGSTTSYYAVAVVKKGTEFTVNDLQGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLLHRGAIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDPKTKCARNAPYSGYSGAFHCLKDGKGDVAFVKHTTVNENAPDQKDEYELLCLDGSRQPVDNYKTCNWARVAAHAVVARDDNKVEDIWSFLSKAQSDFGVDTKSDFHLFGPPGKKDPVLKDLLFKDSAIMLKRVPSLMDSQLYLGFEYYSAIQSMR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural evidence for a pH-sensitive dilysine trigger in the hen ovotransferrin N-lobe: implications for transferrin iron release.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport protein
source organism Gallus gallus
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
total genus 97
structure length 328
sequence length 328
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-09-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nntA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1nntA02
1MY4A 3I6VA 3QUJA 3C36A 1PDAA 3LSFB 3V89B 2CMOA 1A8FA 5KCJA 1IIWA 3FV1A 4U1ZA 3G3FA 4JWYA 4ZEBA 3H03A 2NUVA 3MZ1A 2PBWA 3PGFA 3LSLA 5I84A 3TEPA 2P0SA 2XXUA 2I4BA 2PT2A 2QS4A 5HPQA 1O63A 2QS3A 4BDOA 1QW0A 1NH7A 4R73A 3FXQA 4P0IA 4H6DA 4PE5B 1IEJA 4HCYA 2GHBA 3TCGA 4IY6A 4GL0A 1MQGA 1SW5A 1H43A 4DLDA 5KZTA 3H6WA 1Y3PA 5B7DA 3E3KA 4NF4B 3A09A 1OLCA 3C9HA 3N5LA 4GF8A 4ZEIA 3DP6A 2O6AA 2O7UA 4F18A 4FATA 3JZJA 2M8CA 3OEKA 1B40A 4G2ZA 4OETA 1S50A 2I0CA 2XX9A 3GZGA 4EXLA 4FORA 5L9SA 5L8DA 5CMMA 3IO4A 1PB8A 1GR2A 4DIGA 4OFOA 2NWJA 3BBRA 4F1VA 3QSLA 3IB1A 2QMWA 1S9TA 1SYIA 3C34A 1IUDA 1A7LA 1B3GA 1PEBA 4JWXA 3MVYA 1IXGA 3UGWA 2VD3A 1FQAA 4I9DA 5A5XB 2HQ0A 3BFUA 3RQTA 3CI8A 4LATA 4F2OA 1LCTA 4X9TA 3OO7A 2HXWA 5I57B 3IR1A 1UQWA 3OO8A 1VSOA 4LVQA 5CMBA 4DXCA 4BDMA 3GXAA 3OSQA 4NMYA 4X1BA 1I6AA 2QJEA 2XX8A 3FUZA 1DMBA 2I3WA 5A5XA 2AL4A 4QFOA 4WKMA 3Q26A 1B1HA 3TAJA 4GXSB 3B6TA 1ZIUA 3LR1A 3TUSA 1FTJA 3B7DA 2GRVA 3QXMA 2FNCA 4U22A 3PUWE 4GFRA 4QSDA 4IO5A 2HEUA 1XHYA 3K6WA 4YB7A 3B6WA 5DYHA 4NEDA 1M5CA 2ZYKA 4NF5B 3CFXA 5TPAB 4ZZAA 2XX7A 1SVXB 3T22A 3OOAA 4FJPA 3S9LC 1LBBA 3DP4A 1D9YA 1JW1A 1AIVA 1XVXA 4RPOA 4C0RA 2F35A 2XXTA 3O29A 1PC3A 3VLVA 2O84X 1WDNA 3SEWA 3PUXE 3O9PA 4NE4A 4WEPA 2I0BA 5TPAA 4F3BA 4THIA 1QJMA 3FXUA 5ICQA 4BDRA 1B52A 1MQIA 5H8QB 2OBGA 2B3BA 2RCBA 4JBZA 3VDFA 2RINA 2G93A 3MP1A 2XXVA 1B4ZA 4RJZA 1ZTYA 3VVDA 5ICTA 4GXAA 3PPNA 4RK2A 5EYFA 3PD9A 3THIA 4XTCQ 4R74A 4LP2B 1MM7A 3QUFA 4ESWA 4FEDA 1FQDA 1H3DA 2RKMA 4YAHX 2ABHA 2D21A 5AA2D 3M3LA 1EZPA 4L17A 5DVFA 4MLQA 1VFEA 5H8QA 1MH4A 3PUVE 3VFJA 2AIXA 4YKJA 3OEMA 1JQFA 1IXIA 4KHZE 3A3UA 4N6PA 2Y7WA 1XT8A 1MXYA 3IOTA 4ZE8A 3SEUA 4N07A 4ELQA 3SERA 1B05A 1JEUA 4F39A 3QK6A 3OD7A 1N04A 4I8CA 5H8FB 3RUMA 2VP1A 3G3HA 5FHMA 1LB8A 4U4XA 5EHMA 4PFWA 3IJXB 3PMXA 3SEYA 3IJOB 3EQ1A 1CE2A 5JK4A 2Y7PA 4YB5A 3LUYA 4YKKA 2FYIA 3T96B 2YPNA 5I2KB 4LQ2A 3IOVA 5L9OA 1NL5A 4ZZEA 4MFIA 4WXJA 3M8UA 2W7YA 1MPBA 3IO6A 4N13A 1MH3A 3TKDA 5AA2A 1RKMA 4XXUA 5H8FA 3VLUA 4FIMA 1B46A 1O7TA 4OMBA 3IL1B 5BUUA 4JXIA 3E9XA 3WAEA 4ND9A 2DWAA 3DM0A 4FE8A 4MLVA 4O3CA 4YB6A 3UA8A 5I56A 1LB9A 3U93A 4OXVA 1H44A 5K2YA 3EN3A 5CM6A 5I2KA 1FQFA 5AA1A 2QRYA 2V25A 3H3GA 2F8DA 4F31B 2F6PA 1MDP1 3O6HA 1Y1ZA 1JVYA 4R72A 2RC9A 4PFUA 3T66A 1LAXA 4R6HA 5JTYB 3FXRA 3I5OA 1NNKA 4JSDA 4RY1A 3RT8A 2H4IA 3H4ZA 3TTNA 1B2HA 1N76A 1LSTA 5FHNA 2P2AA 4LZ7A 2OLBA 1URDA 2NOOA 5FTHA 2D5WA 4QRZA 4H5GA 1IQ7A 1EZOA 3CSBA 2V3QA 4EQ9A 1LAFE 1PBPA 3SESA 4QFNA 5JTYA 3TDJA 3L6GA 1MY3A 4G68C 2ZMBA 2DWJA 4YKIA 3G3KA 4YICA 4IO4A 2F7AA 2OJTA 3P7IA 2QL3A 4TOZA 4KYDA 1DTZA 2Q89A 3HHFA 3ZSFA 2P1SA 4MF3A 4YMAA 2DQVA 4G77A 3RLFE 3OENA 4KQPA 2ZYOA 3IOWA 1M5DA 3TCFA 1B1XA 2X7QA 1ATGA 2Q9TA 3N6UA 3BFTA 3T9VA 5AA3A 4YZZA 2Y7KA 4GRKA 1QUIA 3K0VA 2XXRA 2UXAA 2FA7A 4P11A 1USYH 3FZVA 3ONMA 3KZGA 2CZLA 1B7ZA 4G68A 3T9XB 4KI0E 3KJ7A 4X48A 4ELRA 1UIUA 2H9BA 3K1NA 1SW1A 2F97A 3SKPA 4E0WA 3IB0A 4Q0CA 1DTGA 2I48A 4LZ8A 1MXZA 1B7HA 1LCFA 4LONB 1AL3A 1IZ1A 3C31A 4UACA 3H06B 1VFDA 4YMBA 3TTLA 1XS5A 4Z7EA 1A40A 3QAXA 4G8HA 1P1NA 1XVYA 3VV5A 2GHAA 2KLFA 2DS9A 4DZ1A 4QFLA 2F7BA 3LSWA 4XKNA 3SETA 1F9BA 1B6HA 2F34A 1QUJA 3C4MA 2DYXA 2F7CA 2XHDA 1SW4A 5FTIA 1DSNA 4TLLB 4E0XA 3H7MA 3LBSA 4AB5A 4K3FA 1LFHA 3O2AA 1RYXA 1POY1 4PFTA 3FV2A 1JETA 2OWSA 2DWHA 4U2RA 3MVWA 1Y4TA 3MC2A 4GLIA 3KOTA 3FJMA 5HBCA 4WEDA 4RXLA 3N6TA 4RPNA 3K01A 4OTEA 3U94A 1VE4A 3ZKLA 3OXNA 1I6QA 1LFGA 4H1XA 3K6VA 4DE8A 4FECA 3FVGA 4NF8B 1HSJA 1QVSA 2OCUA 1SI0A 1ELJA 3GBBA 1M5FA 4GL8A 4POWA 4DCXA 1B7UA 2Z23A 2O69A 3O66A 4F3PA 2DE4A 2ZNSA 2V84A 3UORA 3HV1A 1DOTA 3TQWA 4OEUA 3IX1A 2H99A 2ZYNA 2R6GE 4DXUA 3CVGA 2Q88A 1S7YA 4NF8A 1P1OA 2PX1A 4PQJA 4LUBA 1H45A 1OVBA 4HTGA 2RCAA 4MH5A 1Y3NA 4ZDMA 2ZYMA 1M5BA 3K6UA 5LOMA 1HSLA 4MBPA 1USYE 1MXXA 3K4UA 1QKAA 1D4NA 1BIYA 1N84A 2YLNA 4IO6A 4R9GA 1ANFA 2XXQA 1JNFA 5F7VA 3G7WA 1ZU0A 1B5HA 3TFLA 4NWDA 3R7XA 3CRBA 4F22A 2ALUA 4LQ5A 1AMFA 5H8HA 4OZ9A 3RN8A 1M5EA 3SEXA 3MUQA 1D9VA 1B5JA 1OVTA 2ZNTA 2O1LA 5AA4B 1LAGE 1JW4A 1UTHA 4OFJA 3RNNA 3CG3A 1MM6A 1OLAA 1SYHA 3TODA 2XD2A 4HW8A 3UIFA 2XXYA 4RYAA 2DVZA 3KOSA 1CB6A 2WKYA 3MZBA 2LAOA 3T9HB 4X1DA 4ZEDA 5AA4A 1TFDA 5L9MA 3FGSA 1MQDA 2A5TB 3ZS6A 2E0SA 2X26A 3M3FA 3KN7A 4AB6A 1NH8A 1Q1KA 3EF7A 2V3UA 1FTOA 2I4CA 3O28A 2OWTA 1FQBA 2I58A 1NNTA 2VOZA 4GWOA 5IAIA 3L6HA 1N3XA 2Z8DA 5EHSA 1N7XA 3KN3A 1IXCA 3V8XB 1FQCA 2A5TA 2HAUA 1NFTA 4H8IA 5AA2B 2NVUB 1PB9A 1GVCA 4OHNA 2VGQA 1NMUA 2V3TA 3TELA 3D4CA 1A8EA 5I56B 3KG2A 1NNPA 1UTBB 2BJJX 3FVOA 1FTMA 4RA1A 2Z8FA 5TU0A 3MAMA 3U92A 2XXHA 3A3CA 5I2NB 1IITA 1MG1A 2O51A 1B32A 2O1MA 1QKBA 3M3KA 2H98A 3OELA 2Q2AA 3ECRA 1P1UA 1ZBMA 3JV9A 3TMGA 3FD3A 1PB7A 4KCCA 1MXUA 1SBPA 1HSEA 3W15C 1GGGA 1UTBA 1B51A 1B3LA 3H6TA 2PYYA 1MXWA 3D4GA 4RNSA 2QMXA 1AH5A 5I2NA 2NXOA 3PV0E 4GQOA 5ITPA 2UYFA 1YTVA 3F11A 2V93A 5TP9B 4OVJA 2GFEA 2REGA 5FHOA 1KWHA 2GH9A 4H65A 4H67A 5B70A 3HN0A 5KDTB 3HPIA 1WVJA 1R6ZA 4KFQA 3PD8A 2AYSA 1B0LA 4KR5A 4O3AA 3S9MC 1MY1A 4R2FA 3OO6A 5DEXB 1B4HA 3MVXA 5DT6A 1DPPA 4JB7A 5TP9A 2XXPA 1BTJA 4YKPA 3PPRA 1VR5A 4H0WA 2QPQA 4OWDA 5DTBA 5CC2A 3W9VA 4G68B 4KYSA 5KDTA 3MJNA 2Q8JA 5CRYA 4GOTA 3E13X 3CSGA 5DEXA 2UVGA 2DWIA 4JWOA 4ZS9A 3EHUA 3O6GA 3OSRA 1FTKA 4YU0A 1B3EA 3U1OA 4Q30B 3TCHA 1MRPA 4R6KA 3MP8A 4GD5A 2DVCA 3HHGA 3U8QA 1LFIA 3G3GA 4F1UA 2THIA 4FEBA 3R6UA 3MW0A 4OQOA 4EF1A 2IA4A 3FIRA 3FJ7A 2F5XA 3KFMA 3VXBA 2QS2A 2PT1A 2OK2A 1LAHE 4AQ4A 3Q27A 4R2BA 4BDNA 4PFYA 5ELVA 1URGA 1EZ9A 3AXFA 1TT1A 3RT6B 1URSA 3DELB 2R71A 2XXWA 2DXRA 3KJTA 4IGTA 4DDDA 5F1QA 3IORA 1B3HA 5AE4A 3CIJA 3R26A 3G3JA 3PUYE 1RYOA 3ILTB 3FASA 4Q8RA 3PMVA 1B3FA 1FCKA 3TQLA 3MBPA 1ZMGA 2PMSA 2PVUA 3RTFB 5I58B 1FTLA 2B3FA 4F19A 5JEIA 1QUKA 3U72A 1Z7NE 3BKIB 4ZE9A 3ILUB 2R9JA 3S2VA 1MPDA 3JYRA 3USDA 4G4PA 4OESA 1N7WA 5M2VA 3RPWA 1BLFA 1NKXA 2F78A 3S4UA 4HCWA 2XD3A 1YCJA 2F6GA 1MQJA 5I58A 3MWBA 3HCQA 4PP0A 3E4RA 2ONRA 5HM4B 4P0GA 4NF4A 1A54A 1JVXA 1JEVA 2HCAA 2Y7IA 4RK9A 4UA8A 1LLSA 2Y84A 4EF2A 3V83A 1T0KA 3KBRA 1POTA 1B9JA 4NF6B 2G29A 3K2DA 4KCDA 3LSXA 4IO3A 3IB2A 3UK4A 4LZ5A 4OEVA 4F1YA 1SD3A 4ESXA 3TTKA 4QSCA 3Q29A 3TTRA 5DVJA 4LA9A 5H8NB 3ODBA 3ZKKA 4U4SA 2HZLA 4BLAA 2O68A 4KPTA 4F2QA 5CBRA 3N26A 3MPKA 4PETA 1WODA 3B6QA 1PBQA 1SW2A 1TXFA 2Z8EA 5I59B 4NF6A 2ZXTA 4ZEKA 1FQEA 2DOJA 4M1VA 4OFLA 4XIGQ 3EHTA 4I1DA 2VD2A 3W9WA 2Y7RA 5H8HB 5H8NA 3CR9A 3O97A 4DCYA 4DXBA 4G8NA 2H25A 4M4GA 3IAZA 2HAVA 3MZ9A 3I3VA 1UTHB 4KYEA 3LC8A 2ANJA 4G8MA 1FW0A 5CMKA 5I59A 1LGBC 1TWYA 3HSTA 3GLBA 5I57A 1DPEA 1XOCA 2Z22A 1BP5A 4C1TA 1QULA 2ZNUA 4EUOA 3TTMA 1SDXA 2RC8A 4H5FA 4I62A 4EQ7A 1J1NA 4HS7A 1YPNA 2DSFA 2HFBA 1OMPA 3TYHA 2QSXA 1P1QA 4IY5A 1SQYA 4NF5A 4O3BA 4GIZA 1EH3A 3SDFA 4ELPA 1MXVA 4JSOA 4ECFA 1SI1A 1B5IA 4C1UA 3PMWA 4EXKA 3UP9A 1Y3QA 3G3IA 1ZKBA 2X7PA 3OMBA 3IOUA 2QS1A 3CFZA 1P99A 1EU8A 1Y20A 4ZEFA 3MP6A 5ISUA 3GBAA 4IGRA 2IEEA 2DE3A 4U21A 3PPPA 3EHSA 2REJA 3Q25A 3K02A 1IXHA 5DVIA 2UVJA 2RC7A 3TPAA 2UYEA 3H6UA 3VE1B 4NWCA 3TZAA 1JW5A 4R6YA 2I3VA 3KGCA 3VVFA 2DXYA 2UVIA 2OZZA 4ZECA 2ONKE 3FVNA 5IKBA 2B65A 2Q2CA 1N3WA 4EDPA 4F3SA 4OYVA 3S9NC 2RF1A 1Y4CA 4QFKA 4IB2A 5CMCA 4U1OA 1US4A 3N94A 1R9QA 3CG1A 4BDLA 1B0HA 1H76A 3PUZE 2I6EA 1XC1A 2ONSA 2E1SA 4EQBA 3FATA 2XXXA 4NTLA 1L5TA 3O6IA 3MPLA 4QF9A 4GVOA 3V5AA 4IO7A 1BKAA 4JDFA 4QHQA 5H8SA 1US5A 4IO2A 3EPEA 3UN6A 1MY2A 4TLMB 4R9FA 3FVKA 1Q35A 4BDQA 1A99A 4XKRA 3T93B 1MY0A 3K6XA 4R75A 5CI5A 4OENA 2AL5A 1GTKA 2A5SA 1NNFA 1I69A 1ZLQA 3HO7A 3T9UA 3QIMA 2H5YA 3K00A 1UIVA 1R1NA 1MS7A 1N0TA 1MPCA 1Y1MA 3DP8A 3MVZA 3OO9A 1AOVA 1OIBA 3SEVA 2D3IA 4QSEA 1II5A 3RGYA 3C33A 4F3GA 1GV8A 3VLWA 4TQUQ 3IK6B 4XKQA 4OERA 2UVHA 1LBCA 5ITOA 2HZKA 3K1MA 1OQHA 3RTWB 1TFAA 1MQHA 1I6BA 3C35A 4ELOA 1YAEA 2DE2A 1P1WA 1MDQA 3MQ9A 2VHAA 1B58A 3QYTA 3KSXA 4POXA 5J1DA 3RY3A 3PPOA 4XKPA 3CFLA 3KEIA 4ONYA 3H6VA 2XXIA 3DLNA 1A55A 3PPQA 4FAJA 1Z7ME 4ISUA 5CBSA 2YJPA 3Q28A 4KD5A 3VVEA 3WAFA 5K2XA 5KCJB 5BWJA 2I49A 1Y9UA 2ESNA 4H8JA 3FJGA 3C32A 3S9EA 3VXCA 2O7IA 3KN8A 2F36A 4QFPA 3KSJA 4Z0IA 1D3KA 4U23A 4F29A 1OQGA 4Q5TA 1O64A 3K1PA 1ZJLA 2DP8A 1R9LA 3PU5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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