The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLWGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-19 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1URV A; 1A00 B; 1MOA A; 2W6W A; 1F63 A; 1LFL A; 1J41 B; 1MYT A; 1DXV A; 1OUU A; 4N8T B; 1S0H B; 2HBD A; 3UHC A; 3UH5 A; 1FSX A; 111M A; 3LB2 A; 1MLL A; 1QPW B; 1DXV B; 1J7W A; 1AJ9 A; 3KUO A; 5EYJ A; 5C6Y A; 1A4F A; 1FN3 A; 5E6E B; 1Y09 B; 1F65 A; 1W92 A; 1J40 B; 1A6K A; 1NQP A; 1O16 A; 2R50 A; 2AUR A; 1OFJ A; 1Y0D A; 1PMB A; 3NG6 A; 3D1K B; 5C6E A; 1F5P A; 2ZS1 D; 3ZJN A; 1NQP B; 2LH7 A; 2SPL A; 1CH2 A; 2O5Q X; 5CNG A; 3WCP A; 1SDK B; 3IC2 A; 1KR7 A; 5EUI A; 1Y7G A; 1C7D A; 1Y4V B; 3SDH A; 1UX9 A; 2DHB B; 1Y5J A; 1DXT A; 2R4Z A; 2HHE B; 2GDM A; 2R4X A; 3OO4 A; 4HSW A; 1YEO A; 1MLH A; 3HF4 A; 1MGN A; 3WCW D; 1BZZ A; 5F2A A; 1QXE A; 1THB A; 3GQR B; 1S69 A; 1R1Y A; 1GVH A; 1HGB A; 2ZT2 A; 1IT3 A; 2R4Y A; 6HBW A; 1HGB B; 1YHU B; 3EU1 B; 3P5Q A; 4OF9 A; 1O1J B; 1YEU A; 3AT6 A; 1NIH B; 3BJ2 B; 3QJB B; 1V4U B; 2AA1 B; 1T1N A; 2JHO A; 2SPN A; 1HBS B; 3EDA A; 3P5Q B; 1Y22 B; 1NEJ A; 2G11 A; 3AQ8 A; 3QJE A; 1XZU A; 2D2M A; 3PT8 B; 3VRE A; 1NZ4 A; 5CN9 A; 3VRF A; 3OVU C; 2ZLX A; 3UHI A; 2XYK A; 3G4W A; 1YCA A; 1YCB A; 1KFR A; 2FRK X; 3KUN A; 1CP0 A; 2VLY A; 4O4Z A; 1RQ3 B; 3UGY A; 1NS9 B; 101M A; 1YFF A; 4O35 A; 4AVE A; 1EBT A; 1DLW A; 3LR9 A; 2OHA A; 1Y4Q A; 5CN6 A; 1FAW B; 1MTJ A; 1Y83 B; 3UH7 A; 3V2Z A; 3WHM A; 2R1H B; 3O89 A; 3DHT B; 3NFE B; 3ZJH A; 2BNL A; 4L7Y A; 2IN4 A; 1I3E A; 2D5Z B; 1AZI A; 1NAZ A; 1MBN A; 1Y0A B; 1XZ5 B; 3U3E A; 4KN3 A; 6HBI A; 1SI4 B; 1NXF A; 1EWA A; 3PEL A; 3PI4 A; 3UHE A; 1VHB A; 2HHD B; 4N7O B; 1A6G A; 1MLF A; 2VYW A; 2MYE A; 1CH4 A; 1G9V A; 1Z8U B; 2PGH A; 4QAU A; 1AJG A; 3K8B A; 1VXC A; 3GQG B; 3FH9 B; 1BZR A; 3ODQ A; 2PGH B; 1DWS A; 3AG0 A; 3K8B B; 3OZW A; 1Y0C B; 3DHR A; 4NXC A; 1BVD A; 3MKB B; 1G0A B; 1A0U B; 1N9H A; 3MJP A; 1YGF B; 1CIK A; 4KMW A; 3OK5 A; 4FWY A; 2YRS A; 3G52 A; 3WR1 A; 3GLN A; 3HXN A; 1GCV A; 107M A; 1VXA A; 3WFU A; 1MLQ A; 3A9M A; 3BJ3 A; 1LHS A; 5JGG A; 4H2L B; 1NPF A; 1LFT A; 1HHO B; 5ILM A; 1GLI A; 1YMA A; 4M4B B; 1Y35 B; 2H35 B; 1S56 A; 1OBM A; 1Y31 B; 1ECN A; 4F6J A; 3MOU A; 2ZLT B; 3ECZ A; 1HBB B; 1VWT A; 3E5I A; 5MBA A; 2V1J A; 3ARJ A; 1YEQ A; 2W31 A; 109M A; 3WCU C; 3DUT A; 1IWH B; 1DTI A; 3ARL A; 3B75 A; 1Y45 A; 1LFV B; 3QM9 A; 3ZOM A; 2DN3 A; 1LTW A; 1OFK A; 1BZP A; 1PBX B; 1CO9 A; 3WFT A; 2XKG A; 1MOB A; 1MYM A; 2DN3 B; 2FRI X; 4U8U C; 4DC8 A; 1X46 A; 102M A; 2G0R A; 1K0Y B; 1MNH A; 1XQ5 B; 5KKK A; 1C7B B; 2ZLW B; 4MQK A; 2H8F B; 2ZLV B; 2GTL C; 2H8D B; 1CQ2 A; 4C0N A; 2ZFO C; 1HRM A; 1IDR A; 2VYY A; 5ILP A; 2G0X A; 5CNC A; 1WVP A; 1HGA A; 1CBM A; 2HZ1 A; 1X9F C; 2AV0 A; 2ZSS A; 3ZHW A; 2QSS A; 1UVX A; 3AQ5 A; 3IXF A; 1GBU B; 4F6F A; 1G09 B; 3MJU B; 3V2V A; 5KER A; 1MYJ A; 3G4Q A; 4VHB A; 1O1P B; 3ARK A; 4HHB B; 5EV5 A; 3VHB A; 4L2M A; 5EYS A; 2E2Y A; 1HDB A; 1NZ3 A; 2LH5 A; 2D2N C; 5SW7 A; 1JEB B; 1SPE A; 1S5X A; 1SDL B; 1JY7 A; 3TLD A; 3BOM B; 3QM8 A; 2MGM A; 4G1V A; 2QLS A; 1Y46 A; 1QSI A; 1LH2 A; 2PEG B; 3AQ6 A; 1GDL A; 5E29 A; 1DWR A; 3GDJ A; 1O1M A; 1JZK A; 1Y4G A; 1XZ7 B; 1ABY A; 4X0L B; 4NZI A; 4XS0 A; 1S5Y A; 2ZSX A; 7HBI A; 1Y4G B; 4TWU A; 1VXF A; 1MLR A; 1V75 A; 4ODC A; 1EBC A; 1BIN A; 2Z6N B; 3QQR A; 1YHR B; 3FS4 A; 2QU0 A; 3PI8 A; 2D6C A; 1LFQ B; 1R1X A; 1NWI A; 4IT8 A; 3SZK B; 2ZS0 C; 2XKI A; 2DXM A; 2EKU A; 3D7O B; 2M6Z B; 3QJC A; 2SPO A; 1Y7D A; 1V4X A; 1XXT A; 3NML A; 1RVW A; 1BZ0 A; 3QJC B; 3W4U B; 1NS6 B; 2KSC A; 1GBV A; 1Y0W A; 1Y4B B; 4FH6 A; 1B0B A; 3IC0 B; 3UHB A; 3CY5 A; 3M3B A; 2W6V A; 3E4N A; 1CLS A; 3UH3 A; 2QMB A; 3PIA A; 1LFZ A; 5KDQ B; 2EB8 A; 1CLS B; 112M A; 1YG5 B; 4M4A A; 1HSY A; 1IBE B; 104M A; 1BBB B; 3ED9 A; 1MLG A; 2D5X B; 3BA2 A; 1A6N A; 3GKV B; 1COH A; 2MBW A; 1YE0 A; 1O1O A; 4M4A B; 2W72 C; 5HU6 B; 2GKM A; 3AQ7 A; 1DO7 A; 1CMY A; 2MGH A; 1RQ4 A; 2ZSZ A; 2GRZ A; 3LQD B; 3E55 A; 4N7P A; 3D1A A; 2FRF A; 5EE4 D; 2ZSR A; 3A59 B; 4KMV A; 3BCQ A; 2HZ3 A; 4FC3 A; 2O5O X; 1FHJ A; 1GDK A; 4TYX A; 3ZJP A; 1M6C A; 1C40 A; 2VEB A; 4ROM B; 1RTE A; 4MQC B; 3QJD B; 1MYZ A; 1A0Z A; 2MGD A; 4H07 A; 4O4T A; 3ZJR A; 1HCO A; 1MLN A; 1Y4P B; 2G14 A; 1HBR A; 1BIJ A; 3A2G A; 3ZJI A; 1SPG B; 2ZLU B; 1XZ4 A; 2LH3 A; 1HCO B; 1A01 A; 2ZSQ A; 3S1J A; 3WCT B; 1MWC A; 1J52 A; 2VLX A; 1O1L B; 3R0G A; 1YGD B; 2RAO B; 1CG8 B; 4B4Y A; 4C44 A; 3E5O A; 1A01 B; 3RGK A; 3UGZ A; 1MOC A; 1YIH A; 1VRF A; 2HBS A; 1FLP A; 3G4V A; 2HHB A; 5JDO D; 3O7N A; 1LFL B; 2XKH A; 1OUU B; 1A3N A; 2HBD B; 1A3O A; 5HLX A; 1FSX B; 1CP5 A; 3HEP A; 4DWU A; 1YE2 A; 3OZU A; 1J7W B; 1AJ9 B; 1XZV A; 1Y8I A; 1A4F B; 1YE2 B; 1FN3 B; 1Y5F A; 1Y4R A; 1D8U A; 3VRG A; 2B7H A; 1J3Y A; 2AV3 A; 4MQJ A; 1ECO A; 5JDO E; 2MGK A; 1Y0D B; 3NG6 B; 1UIW A; 1BUW A; 2WY4 A; 5C6E B; 2HBC A; 3HEO A; 1YMB A; 2O5S X; 3ZJO A; 2BWH A; 2ZS1 C; 1WLA A; 3WCP B; 1UIW B; 3IC2 B; 5EUI B; 1Y7G B; 5IKS A; 2Z6T A; 2VYZ A; 1Y0T A; 1C7D B; 5CNF A; 1MLM A; 3S65 A; 1MLO A; 2LHB A; 1NPG A; 5HAV A; 3ECX A; 1Y5J B; 1BJE A; 1DXT B; 3D17 A; 3UHR A; 1Y7Z A; 5ILE A; 2AUP A; 3OO4 B; 1MZ0 A; 1YEO B; 4YU3 A; 3HF4 B; 3VAU A; 4ROL A; 1BZZ B; 2BLJ M; 1YOH A; 2MGL A; 3WCW C; 1QXE B; 1THB B; 2MGB A; 1R1Y B; 5AZQ A; 1Y7C A; 4HBI A; 3WCU A; 6HBW B; 1A9W E; 3EOK A; 4HRT A; 2EF2 A; 1YEU B; 5EOH A; 1B86 A; 3AT6 B; 4ILZ A; 3GOU A; 2O5L X; 1BAB A; 2DN1 A; 1T1N B; 1XCH A; 1MKO A; 5MBN A; 1NEJ B; 1MTI A; 3QJE B; 1XZU B; 4U8U A; 2D2M B; 1DKE A; 3DR9 A; 1CH5 A; 4MQG A; 108M A; 2DN1 B; 1DXD A; 1VXG A; 1YIE A; 1CH7 A; 3VRE B; 1O1I A; 3VRF B; 2GTL A; 2ZLX B; 3UHZ A; 3WCV C; 1N9I A; 2ZFO A; 1VXH A; 4G1B A; 1CH9 A; 3WCT D; 2BK9 A; 1X9F A; 1YFF B; 1CG5 A; 2V1E A; 4JYQ A; 5EQM A; 3A0G A; 3HHB A; 4NI0 A; 3LB3 A; 1X3K A; 1JW8 A; 1N9X A; 2BW9 M; 2MHB A; 1Y4Q B; 1K1K A; 1HBA A; 1CG5 B; 2ZSY A; 1CQX A; 3WHM B; 3HHB B; 1J3Z A; 3IA3 B; 1DO1 A; 1IRC A; 4L7Y B; 1Y85 A; 1HBA B; 4OOD A; 1OR6 A; 3QM6 A; 1YH9 A; 3A5G A; 2O5T X; 2D2N A; 1LA6 A; 1MNK A; 3PEL B; 4MQI A; 1DUO A; 2BLH A; 1XYE A; 3HYU A; 1Y5K A; 1G9V B; 2BKM A; 1JPB A; 1I3D A; 3ODQ B; 2HCO A; 3S48 C; 5CN7 A; 2VM0 A; 3G46 A; 1MCY A; 1ASH A; 3DHR B; 3QM7 A; 1NZ2 A; 2EVK A; 3MJP B; 4WCH D; 2GNV A; 2YRS B; 3WR1 B; 3HXN B; 3ZJM A; 2ZS0 A; 1GCV B; 1J7S A; 3UHY A; 2OLP A; 1Y2Z A; 1DXU A; 3BJ3 B; 4NK2 A; 1ABS A; 2ZSO A; 5JGG B; 1OUT A; 3G4U A; 1BVC A; 1LFT B; 1UT0 A; 2QSP A; 2GRF A; 1UFJ A; 1GLI B; 1HLM A; 3MYN A; 1BZ1 A; 1LH5 A; 2DN2 A; 1O1N A; 1RQA A; 1YVT A; 1V4W A; 3MBA A; 4F4O A; 1CH1 A; 1YHU C; 2HZ2 A; 1VWT B; 3S1I A; 2D60 A; 1YEQ B; 1V5H A; 1HBH A; 3DUT B; 1JF4 A; 2VRY A; 1FCS A; 2R4W A; 2D2M D; 3B75 B; 1Y45 B; 4MU5 A; 1SWM A; 1M9P A; 2VEE A; 1HLB A; 2EB9 A; 1G0B A; 3HC9 A; 2C0K A; 2W72 A; 2FAM A; 1HDS A; 2GTL D; 4MQK B; 1MWB A; 1MBA A; 3BJ1 A; 3UHU A; 2Z85 A; 3H58 A; 1V9Q A; 1QXD A; 1DUK A; 1X9F D; 1HGA B; 1ITH A; 1QI8 A; 3D4X A; 4F6G A; 3GKT A; 2ZT0 A; 2QSS B; 1LH6 A; 5HY8 A; 1HAB A; 4ESA A; 1MNJ A; 1BZ6 A; 5KER B; 2ZFB A; 2OH9 A; 1XZ2 A; 1CO8 A; 1MNO A; 3M3A A; 2GNW A; 1YHE A; 1YVQ A; 1H1X A; 3GQP A; 1HDB B; 1YDZ A; 3TM9 A; 4MQH A; 5SW7 B; 1O1K A; 1S5X B; 4NXA A; 1JY7 B; 1LJW A; 5D1V A; 3ECL A; 4G51 A; 1Y4F A; 3LB4 A; 1HBG A; 2QLS B; 1Y46 B; 1QSI B; 1WMU A; 2ZT3 A; 4IRO A; 1HV4 A; 1IRD A; 1TES A; 2MYB A; 5E29 B; 1Y8H A; 1KD2 A; 3MYM A; 3GDJ B; 1O1M B; 3LHB A; 5CNE A; 1YOG A; 1ABY B; 2NRM A; 2HBF A; 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1A0Z B; 4H0B A; 2VLZ A; 2AUQ A; 5CN8 A; 3UHT A; 4PNJ A; 1HBR B; 1MOD A; 1BIJ B; 1NWN A; 3UHQ A; 1J7Y B; 1JL6 A; 2GRH A; 1AJH A; 1XZ4 B; 5EU2 A; 2HBE A; 1UFP A; 2LH1 A; 1A00 A; 2G3H A; 1J41 A; 2HBE B; 1MOH A; 4N8T A; 1S0H A; 4PQC A; 1YIH B; 2HBS B; 4NI1 A; 2HHB B; 1QPW A; 1MLK A; 1N9F A; 1A3N B; 3M38 A; 4N7N A; 5JDO C; 1A3O B; 4WJG 1; 1RSE A; 5E6E A; 1Y09 A; 4NI1 B; 5CN4 A; 1J40 A; 1YOI A; 1VXE A; 2SPM A; 1XZV B; 3ZOL A; 1Y8I B; 4N7N B; 3UHS A; 4F6B A; 3D1K A; 1Y5F B; 3UBC A; 4MXK A; 1Y4R B; 2O58 X; 3VRG B; 2B7H B; 4O1T A; 1J3Y B; 1NZ5 A; 2LH2 A; 2ZT4 A; 2BMM A; 4MQJ B; 1SDK A; 1BUW B; 1L2K A; 1MBD A; 3ZJJ A; 5CNB A; 1A6M A; 1CBL A; 2HBC B; 4DC7 A; 1Y4V A; 1DO3 A; 2ZSN A; 103M A; 2DHB A; 2W6X A; 2CMM A; 2OH8 A; 2HHE A; 1Y0T B; 5F0B A; 1JDO A; 3S65 B; 2Z6S A; 3ASE A; 3G4R A; 1IT2 A; 3D17 B; 1Y7Z B; 2LH6 A; 2BLI A; 3GQR A; 4YU3 B; 1VXD A; 4PQ6 A; 3ZJQ A; 4ROL B; 1JZM A; 1YHU A; 3EU1 A; 3M39 A; 1O1J A; 3UHD A; 1Y7C B; 1NIH A; 4ZVB A; 3WCU B; 3BJ2 A; 3QJB A; 1V4U A; 2AA1 A; 3A5A A; 3H57 A; 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