The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
53
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLWGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
53
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4MQG B; 2HHE A; 2AV0 A; 1MDN A; 3WTG B; 2NSR A; 1C40 A; 3NML A; 1X3K A; 2OIF A; 3GQP B; 2QSS B; 1DWR A; 1A3N B; 5CNF A; 1HBA A; 2D2M B; 1L2K A; 3A0G B; 1V75 A; 3ARK A; 1GCW B; 1Y2Z B; 3PI8 B; 2ZLV A; 1O1P A; 2QRW A; 1HDS B; 1H97 A; 3SZK A; 1J7Y B; 2QFN A; 3D1K A; 5HAV A; 1X9F C; 4UZV A; 1T1N B; 2PGH A; 1YHU A; 3NL7 B; 4YU4 A; 3M38 A; 1GZX A; 1X9F B; 2GRZ A; 3UHI A; 109M A; 1VWT B; 1JY7 B; 5CN8 A; 1JZK A; 3D17 A; 2ZT1 A; 1A3N A; 3PT7 B; 2ZFO D; 1JEB A; 3LR9 A; 2FRJ X; 1LFL B; 1ABY B; 2HBS B; 2R80 B; 3ZJO A; 1URY A; 1CH7 A; 3AQ6 A; 2GKM A; 3WCU D; 1G09 A; 1MTK A; 1O1N A; 5EE4 D; 3UHQ A; 1A3O A; 3K3U A; 2YRS B; 1YEQ A; 1O1J B; 2W6V A; 1URV A; 1YHE A; 1JP8 A; 2H35 A; 3KMF C; 3QJC B; 1A9W E; 1BIJ A; 5HLU A; 5HLQ A; 2MBW A; 1U7R A; 1YZI B; 3UHH A; 4ROM A; 3ZH0 A; 1Y8W A; 2R80 A; 3DHT A; 1O1L B; 2ZSR A; 4YU3 A; 3WCW A; 2XKG A; 1Y5J A; 1LFY A; 1DXU B; 1YEU A; 1KD2 A; 1KR7 A; 5D5R A; 2NRL A; 3TM3 A; 1MLK A; 4MU5 A; 2LH1 A; 2QLS A; 3A59 B; 5CN9 A; 105M A; 2QMB B; 3WCP A; 1MWB A; 3WHM B; 1A01 A; 3ZJP A; 3UH6 A; 3WCT D; 2DN1 B; 1EMY A; 1I3D A; 103M A; 2O5M X; 1ABW A; 3ZJS A; 1S0H A; 3PEL A; 1G0B A; 2NRM A; 2V1E A; 2D5Z B; 1NEJ A; 2BLH A; 3W4U B; 110M A; 2ZS0 A; 3ZJJ A; 3GQG B; 1MLF A; 2R4Z A; 1DXU A; 2D5X B; 5EET A; 1VXG A; 1Y8I A; 3SDN A; 3HXN A; 4F6D A; 1HV4 B; 3BCQ A; 1MYT A; 3UI0 A; 2M6Z B; 3WFX A; 1YGD A; 1Y35 A; 1MNH A; 1DLW A; 1NZ3 A; 3LB2 A; 1BUW A; 1J40 B; 3AT5 A; 1HBH A; 4TYX A; 7HBI A; 1BZR A; 4U8U A; 4AVE A; 1DXV A; 5JDO F; 2HCO B; 4ESA B; 1FN3 B; 1THB B; 1Y7G A; 1Y85 B; 3DR9 A; 1TES A; 5AB8 A; 2H8D B; 1NZ2 A; 3B75 A; 2NX0 A; 1Y46 B; 2EKT A; 1A0Z B; 1CLS A; 4F6J A; 1Y0W B; 3PI9 A; 3E4N A; 1Y22 A; 3CY5 B; 1SHR A; 1J7W B; 1HLM A; 3ZJN A; 1C7D B; 2VLY A; 2MGM A; 1V4X B; 4O4T A; 1R1X B; 1LFT B; 1CQ2 A; 3UHG A; 1PMB A; 1SWM A; 4DC8 A; 3DHR B; 1NGK A; 3BJ3 B; 1J3Y B; 2W72 A; 1VXE A; 2FRK X; 3GOU B; 3IC0 B; 1JL6 A; 3EU1 A; 3A5G A; 1FAW B; 2OLP A; 1MWC A; 4ODC B; 3QJB A; 5E29 A; 3MBA A; 3H57 A; 1KFR A; 1BBB A; 107M A; 3GDJ B; 1IWH B; 3MKB B; 3HF4 A; 4XDI A; 1IOP A; 1LTW A; 2FRF A; 3UH7 A; 2ZFB B; 3VHB A; 4TWU A; 3S1J A; 1EWA A; 4G51 A; 3WCW D; 1YIE B; 1CH9 A; 1F63 A; 1C7B A; 1Y31 A; 2HBG A; 3A2G A; 1MOC A; 1MBO A; 5JDO C; 1O1I A; 1QSI B; 3K8B A; 3NMM B; 3OO5 B; 5KER A; 1Y4R A; 3LB3 A; 4MQJ B; 1BJE A; 3ECL A; 1V4U A; 1XQ5 B; 111M A; 2BMM A; 1A4F A; 2RAO B; 4F4O B; 3ZJL A; 4PNJ A; 2ZWJ A; 1O1M B; 1QXE A; 1BZP A; 1CIO A; 3UHV A; 1BZ1 B; 1Y4Q B; 1O1K B; 4H2L B; 4N7O B; 2ZS0 D; 1IBE A; 2JHO A; 1AJ9 A; 3QM5 A; 2HHB B; 3UHZ A; 1QXD B; 3D4X B; 4N7N B; 1OUU B; 1U7S A; 1LFZ A; 5EOH A; 3UHS A; 1MGN A; 3D7O A; 1NIH B; 1J7S B; 1S5X B; 1NPF A; 3VRG A; 5ILR A; 1YG5 A; 1XZ5 A; 2ZSZ A; 1JW8 A; 3HRW A; 4L2M A; 3FS4 A; 2AUP A; 3MJP A; 3WFU A; 2DXM B; 3OGB A; 1Y4G B; 3LB1 A; 1W92 A; 1YOH A; 3GYS B; 4U8U D; 1S56 A; 1Y45 B; 1M9P B; 3ORD A; 1YEN A; 5E6E A; 3UGZ A; 2FAM A; 5B84 A; 4NK1 A; 1K0Y B; 1Y0T B; 1HHO B; 1YGF B; 2ZSX A; 3ODQ B; 1GCV B; 1LH2 A; 2QSP B; 4MAX A; 1MTJ A; 5EE4 C; 2VYY A; 1HGA B; 3WFT A; 1QPW B; 1YIH B; 3IA3 B; 3E5O A; 2MGE A; 1RQ3 A; 3M3B A; 4ROL B; 2G0V A; 2ZLT A; 2BW9 M; 1RTE A; 1OFJ A; 2BWH A; 2ZLU B; 2BLJ M; 1HLB A; 1MKO B; 1LH3 A; 2ZT2 A; 3EDB A; 2MGH A; 4FWY A; 2AUO A; 1F5P A; 3WR1 B; 2ZFO A; 3GQR A; 4NI1 B; 5CNB A; 2QU0 A; 3CIU B; 3VRE A; 3AT6 B; 1CPW A; 2VM0 A; 4KJT A; 1VHB A; 1HCO B; 3WCU A; 1R1Y A; 1G0A B; 1O1O A; 3ECZ A; 4X0L B; 5EUI A; 3M3A A; 1N9H A; 1XZ7 B; 2D60 A; 2VYW A; 3IC2 B; 1SI4 B; 2D2N A; 4O4Z A; 4HRR A; 1YDZ B; 1RQ4 B; 3MJU B; 4VHB A; 1MBD A; 1OFK A; 2Z6N A; 3VAU A; 1DTM A; 3UGY A; 3DUT A; 2HBC B; 1S5Y B; 3WCT C; 4HRT A; 2OHA A; 1HGC B; 1Q1F A; 5JDO E; 1MBC A; 3WCT B; 1OBM A; 3V2Z A; 3NG6 A; 1F5O A; 2HHE B; 1C40 B; 1DXD A; 2MB5 A; 1DWS A; 1NS9 A; 1HBA B; 1CBM A; 5AZQ A; 1UC3 A; 1V75 B; 5E83 A; 2ZLV B; 1O1P B; 3GKV A; 1Y8K A; 3QQR A; 3SZK B; 3D1K B; 2PGH B; 3G52 A; 4M4B A; 1VXA A; 5CHR A; 4WCH D; 4YU4 B; 1GZX B; 5EYJ A; 1MLS A; 1A00 A; 4B4Y A; 1LHS A; 1MOH A; 2MGD A; 3D17 B; 3ARJ A; 1JEB B; 4MQK A; 2DN3 A; 3HHB A; 1BAB A; 6HBW A; 1Y4F A; 101M A; 3RJN B; 1UFJ A; 3ZHW A; 2G10 A; 4G1B A; 2EB9 A; 1V07 A; 2ZLX A; 1G09 B; 3OO4 A; 1O1N B; 1A3O B; 3UH5 A; 1YEQ B; 2MYE A; 1MYJ A; 3EDA A; 2W6V B; 5HBI A; 1YHE B; 3O7N A; 4O1T A; 2H35 B; 4MQI A; 1FHJ A; 1Y0A A; 1BIJ B; 4KMW A; 3LQD A; 1GBU A; 3LHB A; 1YH9 A; 1DTI A; 2V1J A; 2VRY A; 4F6F A; 4ROM B; 1Y8W B; 4NS2 A; 3DHT B; 2MGB A; 2GRH A; 2R50 A; 3WCW C; 3PIA A; 5M3S A; 4YU3 B; 3WCW B; 4JAC A; 1Y5J B; 2D2N D; 4FC3 A; 1LFY B; 1YEU B; 5CN7 A; 2ZS1 D; 1KD2 B; 4PQC A; 4UUR A; 1YVQ A; 1EBC A; 4FH7 A; 2MGF A; 1DO7 A; 2QLS B; 3NFE A; 1XZU A; 4LPI A; 1OUT A; 3WCP B; 2B7H A; 1DWT A; 4BJA A; 1JZL A; 2G0X A; 1A01 B; 3ZOL A; 1DO4 A; 1M6M A; 3MN0 A; 3UBV A; 2ZS0 C; 1ABW B; 1A6K A; 1SPG A; 1S0H B; 4HSX A; 3PEL B; 1AZI A; 1G0B B; 1JPB A; 1DXT A; 1NEJ B; 1DO1 A; 1CH2 A; 2ZS0 B; 5EV5 A; 2MYC A; 1K1K A; 104M A; 5CNG A; 5CN6 A; 2OH9 A; 1UX8 A; 1Y8I B; 1Y7D A; 3HXN B; 3BCQ B; 3D1A A; 2MHB A; 3G4U A; 5CN5 A; 2VEE A; 2HZ2 A; 3OVU C; 2ZT4 A; 1CG8 A; 1YGD B; 1Y35 B; 2VYZ A; 4U8U C; 3AQ5 A; 3QJD A; 1BUW B; 3AT5 B; 1HBH B; 3G53 A; 1Y7C A; 4U8U B; 3A5A A; 1DXV B; 1CBL A; 5JGG A; 3A5B A; 1RTX A; 1Y7Z A; 1Y7G B; 3ASE A; 3B75 B; 3WCV D; 4GZG A; 1CO8 A; 3G4Y A; 1NAZ A; 1DXC A; 5HLX A; 1CLS B; 2MGK A; 3QM7 A; 4H0B A; 3UHX A; 3PI9 B; 3VRF A; 1Y22 B; 1SHR B; 1BZ0 A; 4MQH A; 1UFP A; 1XY0 A; 1RPS A; 4N7P A; 2ZSS A; 3UHT A; 1HBS A; 3QQQ A; 2W72 C; 1YE2 A; 1XZ2 A; 1IT2 A; 3QMA A; 1DKE A; 1MLH A; 4DC7 A; 1CMY A; 2W72 B; 2WTG A; 1HBI A; 1ABS A; 3EU1 B; 2RI4 A; 4H07 A; 1A6G A; 3QJB B; 5E29 B; 1UVX A; 1BBB B; 3HEP A; 2EVP A; 3UBC A; 4N8T A; 3HF4 B; 3QJE A; 2QFK A; 4G51 B; 2FAL A; 2GKN A; 1LH7 A; 1Y31 B; 1C7B B; 2D2M D; 2AA1 A; 1Y4V A; 1LH1 A; 1O1I B; 1NQP A; 3K8B B; 2HHD A; 2MGL A; 1GJN A; 5KER B; 1Y4R B; 3UH3 A; 4WJG 1; 1V4U B; 1YVT A; 4IRO A; 1YOG A; 2ZSQ A; 5HY8 A; 2LH2 A; 1A4F B; 2HBF A; 1QXE B; 5D1V A; 4KN3 A; 1CH5 A; 2LH3 A; 4FWZ A; 1IBE B; 2V1I A; 1HDB A; 1AJ9 B; 1YOI A; 5CNC A; 5HU6 A; 1COH A; 2DC3 A; 1DLY A; 3MOU A; 1LFZ B; 1A0U A; 1N9I A; 1Y4P A; 4MPM A; 4KMV A; 3D7O B; 1LFV A; 5F0B A; 1VXB A; 3VRG B; 5C6E A; 1FSX A; 1YG5 B; 1XZ5 B; 1MLO A; 3HRW B; 2V1H A; 5SW7 A; 3FS4 B; 1HAC A; 3MJP B; 2AUQ A; 1UMO A; 1HSY A; 3R5I A; 1YFF A; 3FH9 A; 1XZ4 A; 1NS6 A; 5CND A; 1FSL A; 1J52 A; 1YEN B; 5E6E B; 1JZM A; 1HGB A; 4MXK A; 1V4W A; 1CH4 A; 1LA6 A; 3P5Q A; 2EF2 A; 4OOD A; 1GBV A; 1SDK A; 3PT8 A; 1QI8 A; 1HAB A; 2PEG A; 1D8U A; 4HHB A; 4NZI A; 1AJH A; 1F65 A; 2GTL A; 1WLA A; 1GLI A; 1LJW A; 2VEB A; 1MBN A; 3BJ1 A; 2GLN A; 1UVY A; 1RQ3 B; 2W6X A; 1V5H A; 4OF9 A; 1MYH A; 2ZLT B; 2MYA A; 4TWV A; 5MBN A; 1FLP A; 1J3Z A; 1BZZ B; 3H58 A; 1YHR A; 5C6Y A; 3PI4 A; 3RGK A; 1YMA A; 1JWN A; 1G08 A; 1IRC A; 2V1F A; 4MQC A; 2ZFO C; 2ZLW A; 2ZFO B; 2GL3 A; 3GQR B; 3HEN A; 4NXC A; 2QU0 B; 3S1I A; 4NI0 A; 3VRE B; 3WCU C; 1JDO A; 2D2N C; 1XYE A; 1DUK A; 4M4A A; 3WCU B; 2E2Y A; 1R1Y B; 1O1O B; 1G9V A; 5EUI B; 1HBB A; 3UHE A; 2D60 B; 2O5Q X; 1IDR A; 3BJ2 A; 2D2N B; 4HRR B; 2LH6 A; 2MGC A; 1BZZ A; 6HBI A; 1M6C A; 1XCH A; 4L7Y A; 2Z6N B; 1Y0C A; 2Z6T A; 1Y83 A; 1B0B A; 3DUT B; 3R0G A; 1NWN A; 3G4Q A; 4HRT B; 4O2G A; 2O58 X; 2SPN A; 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2D2M C; 2H8F A; 1FCS A; 4FC3 B; 1CH1 A; 3AQ8 A; 2O5T X; 2DHB A; 1MYG A; 4HBI A; 2HZ1 A; 1YVQ B; 1YEO A; 2WY4 A; 3OK5 A; 2R4X A; 3NFE B; 1XZU B; 1OUT B; 1Y4B A; 3UHY A; 2B7H B; 3PI2 A; 1YEV A; 1S6A A; 1Y0D A; 3ONZ A; 1YMC A; 4MQG A; 3OZW A; 1YCB A; 1SPG B; 1MBA A; 3WTG A; 5ILM A; 102M A; 1DXT B; 3GQP A; 2QSS A; 1MBI A; 1MLU A; 4O35 A; 2WTH A; 1K1K B; 1UIW B; 2D6C A; 2D2M A; 4SDH A; 3A0G A; 1ECN A; 1MTI A; 1GCW A; 1Y2Z A; 3PI8 A; 1Y7D B; 4NXA A; 1HDS A; 3D1A B; 2MHB B; 1J7Y A; 1N9X A; 3HC9 A; 1MOD A; 1JF3 A; 1CG8 B; 1T1N A; 2MGJ A; 3NL7 A; 1X9F A; 3QJD B; 108M A; 4MXL A; 2ZT3 A; 1Y7C B; 1VWT A; 5CMV A; 2ZT0 A; 2BNL A; 5JGG B; 1MLN A; 1JY7 A; 1HJT A; 1Y7Z B; 2BK9 A; 3AG0 A; 4ZVA A; 3PT7 A; 1CO9 A; 1LFL A; 1ABY A; 1UIW A; 3PI3 A; 3LB4 A; 2SPL A; 2HBS A; 3VRF B; 2W6W A; 1BZ0 B; 1J3F A; 2VLX A; 3RJ6 A; 4MQH B; 1XY0 B; 1RPS B; 4N7P B; 2YRS A; 1FDH G; 1VXD A; 1HBS B; 1O1J A; 112M A; 1YE2 B; 1XZ2 B; 3U3E A; 3QJC A; 1DKE B; 1CMY B; 3A9M A; 1MWD A; 1CQX A; 2RI4 B; 3KMF A; 2VLZ A; 4NK2 A; 1VRF A; 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