The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
115
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sequence length |
283
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structure length |
283
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEAWERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGQGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYRGVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEAWERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGQGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
|
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
|
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
115
|
| structure length |
283
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| sequence length |
283
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1CLS B; 1DWT A; 3OVU C; 3WCP A; 3E55 A; 1MCY A; 1AJ9 B; 2BK9 A; 3E5I A; 2ZS1 B; 1DXC A; 1MYI A; 3PT8 B; 1YOG A; 1OUU B; 1JWN A; 3W4U B; 2OIF A; 1A0Z B; 1KD2 B; 1YGF B; 5D5R A; 1QXE B; 3HC9 A; 1J41 A; 1YMA A; 2MGH A; 2HHE B; 1FHJ B; 1HGC B; 1MTK A; 1NZ4 A; 3GQP B; 3WCT C; 2GKN A; 4NXC A; 1C7D A; 5E83 B; 3MJP A; 1X3K A; 1A6G A; 1FAW A; 1QPW B; 3LQD B; 2VLX A; 4MQH B; 1JEB B; 1Y31 A; 1IBE A; 1JY7 B; 2OH9 A; 2O5B X; 2SPN A; 3HYU A; 1MNK A; 1G0A B; 2MGG A; 3WCW B; 3ECL A; 4ODC B; 1O1L A; 2W6V B; 1RVW A; 5F2A A; 3QJD B; 1DTM A; 1GLI B; 3G4V A; 3NFE B; 1N9H A; 3SZK A; 2NRL A; 4N8T A; 1NS9 B; 2EB8 A; 1Y7Z A; 3A0G B; 5E29 B; 1HDS B; 5F0B A; 4PQC A; 1GCV B; 2IN4 A; 3MYM A; 1FDH G; 2HCO B; 3D7O B; 3HHB A; 3QJB A; 4U8U C; 1JF4 A; 5MBN A; 1A4F B; 1NGK A; 1BUW B; 1MYT A; 3B75 B; 3TM9 A; 4MQK B; 1HBB B; 1YMC A; 1HHO A; 1LFY B; 1BZP A; 3GYS B; 5CNB A; 2YRS B; 1JP6 A; 1MLJ A; 4SDH A; 1CH5 A; 1BZ1 B; 4KMW A; 1F5P A; 4F6B A; 4PQ6 A; 1DKE A; 1THB B; 2MGF A; 3DHR B; 1J7W A; 1K1K B; 5CND A; 2GDM A; 3IC0 B; 3UHR A; 2EB9 A; 1MYM A; 3BCQ B; 4FC3 B; 4XDI A; 1BAB A; 3DHT B; 2MYC A; 5AZQ A; 2NSR A; 1MTJ A; 4G51 B; 1MLL A; 1CQX A; 3NL7 B; 1RQA B; 1XCH A; 1MOD A; 3S66 A; 1ASH A; 3FS4 B; 3VRF A; 4NXA A; 3HEP A; 2PGH A; 4HHB B; 1RQ4 B; 1G0B B; 4YU4 B; 6HBW A; 1UIW B; 1YOI A; 3VRE B; 1YOH A; 3NG6 A; 1GDJ A; 3BJ3 A; 1M6C A; 1YH9 A; 1C7B B; 1MKO A; 2AA1 B; 1MWC A; 1QXD B; 1A3O B; 2ZFO A; 1O1O B; 1A6N A; 3AT5 B; 2MYA A; 1YEV A; 5B84 A; 1BBB A; 1XY0 B; 1DO3 A; 1WMU B; 2AUP A; 4IRO B; 3RGK A; 1J3Z B; 5CNG A; 4H0B A; 1NPF A; 2AV0 A; 5B85 A; 3WCU D; 3CIU B; 1SHR A; 2SPM A; 2SPO A; 1CPW A; 1MNJ A; 1WVP A; 1HAB A; 2V1K A; 1V4U A; 1ITH A; 1Y83 A; 1ABY A; 1O1J A; 4MBN A; 1LJW A; 105M A; 4ESA B; 1Y4B A; 1Y2Z B; 2ZLV A; 1XZU A; 1YVT A; 3UBV A; 3QZX A; 2D5X A; 2ZLW B; 1DXU B; 1JDO A; 1G09 B; 2FRK X; 1JL7 A; 3UHT A; 2VLZ A; 1BZ6 A; 2QU0 B; 1A01 A; 1TU9 A; 5EE4 C; 3UHI A; 2XKG A; 1CIO A; 1HBR B; 1A00 B; 2LHB A; 3DUT B; 3IXF A; 3WR1 A; 1YEN A; 2ZSP A; 4TWU A; 4M4B B; 1J41 B; 1HAC A; 1O1K A; 2ZS0 D; 2OHB A; 1Y46 A; 1XZ7 B; 3A5A A; 1HGA A; 1YEQ B; 3FH9 B; 1C7D B; 3MJP B; 1HBG A; 5CNC A; 3UHZ A; 3EDA A; 3PI8 A; 1IT3 A; 1OR4 A; 3ZJN A; 1FAW B; 2Z6N B; 5JDO F; 1Y31 B; 2D5Z A; 1HLB A; 1Y22 B; 1LFQ A; 1Y4Q A; 2PEG B; 3BJ1 A; 1GZX A; 3MN0 A; 4HSX A; 2HHD B; 4MPM A; 1O1L B; 1RVW B; 1SDK A; 1Y7D A; 4NI1 A; 4DC8 A; 3PI2 A; 1NS6 B; 3GOU A; 1LFT B; 1XXT B; 2ZSN A; 2H8F A; 1CG5 A; 2DXM A; 3WCT D; 2ZT0 A; 1Y8H B; 1XZ4 B; 1IWH B; 2VM0 A; 5D1V A; 4ZVB A; 3R5I A; 1IDR A; 1CQ2 A; 3UHQ A; 3M39 A; 4FWX A; 1N9I A; 1G9V A; 5KER B; 2OHA A; 1A3N A; 2Z6T A; 3ZJQ A; 3QJB B; 4DWT A; 4DWU A; 1Y8I A; 5MBA A; 1X46 A; 4MQC B; 3UHG A; 1XQ5 A; 109M A; 1YEO A; 2VEB A; 3QJE B; 2GRF A; 4UUR A; 3K8B B; 1MOA A; 2FRI X; 1MTI A; 2ZFB A; 1G08 A; 2ZSQ A; 111M A; 3AQ8 A; 1U7R A; 2G11 A; 3GQG B; 1Y4V A; 4MXL A; 1YHU D; 2V1F A; 4NK2 A; 3ZJJ A; 3G4U A; 1YFF B; 3S65 A; 1MLN A; 1DWS A; 2LH1 A; 3EU1 A; 1SPE A; 5CN4 A; 3GQR A; 1Y7C B; 4L7Y A; 3CY5 A; 3SDN A; 1MLS A; 1J7S A; 1MBO A; 1RTX A; 1J3F A; 2HBC A; 1LUE A; 1Y45 A; 4ROM A; 3UHU A; 4PQB A; 4X0L A; 1JP9 A; 2BMM A; 1HJT A; 1Y85 B; 4FH6 A; 4PNJ A; 2ZSS A; 4GZG A; 3NG6 B; 1YH9 B; 1MKO B; 2VYY A; 2ZS1 D; 2ZFO B; 2GTL A; 1K0Y A; 1SI4 A; 3PI9 B; 2HBD A; 1CH2 A; 3NML A; 3OO5 B; 1ECD A; 1A9W E; 1YDZ B; 2QSS A; 1GBV B; 2H35 B; 1BBB B; 2R50 A; 2NSS A; 1S0H A; 1YE0 B; 3PT7 B; 1MLM A; 3BJ2 A; 3VRG A; 1C40 B; 1XYE A; 4UZV A; 1YEU A; 1HBH A; 1LFV B; 102M A; 1Y5F A; 1Y0A A; 3MKB B; 1HAB B; 1HBS A; 2MGJ A; 5C6E B; 3WCW D; 1BZZ A; 1ABY B; 5CN6 A; 1Y35 B; 2HBF B; 1XZU B; 4FWY A; 1HGB A; 3PI1 A; 1GCW A; 2G0V A; 3GLN A; 3AQ5 A; 1H1X A; 4F6G A; 3UHY A; 1XZ2 B; 2EKT A; 5KDQ A; 3HXN A; 1FN3 B; 3WR1 B; 3QQR A; 1YEN B; 1RPS B; 1JW8 A; 1WLA A; 3OO4 A; 1M6M A; 1O1K B; 1Y4P A; 2LH7 A; 3QMA A; 1T1N A; 1Y46 B; 1IRC A; 1DXV B; 1HGA B; 3HF4 B; 1CG8 A; 1JL6 A; 1Y8W B; 3WCU C; 3VAU A; 1MOH A; 103M A; 1Y0C B; 1A6M A; 1EBC A; 4O1T A; 2D5Z B; 1Y4R B; 1LFQ B; 1HDA B; 2ZFO C; 4F6D A; 3UHB A; 1NWN A; 2W72 A; 2W6W A; 2BWH A; 4NI0 A; 1S5X B; 1SPG A; 1YIE A; 1LHS A; 1JPB A; 2ZST A; 3AQ9 A; 1SDK B; 4NI1 B; 1LHT A; 1O1M B; 3LB4 A; 1COH B; 3GOU B; 1LFZ A; 4WJG 1; 1JZK A; 3WTG A; 2H8F B; 3D1K A; 4YU3 A; 1CG5 B; 2V1I A; 1MLK A; 3QZZ A; 1MBS A; 1VRF A; 3R5I B; 3M38 A; 3WHM A; 1G9V B; 2MYE A; 3A5G A; 1V4X A; 4TYX A; 3KMF A; 1R1Y A; 1MYZ A; 1XZV B; 3H57 A; 3UHX A; 1A6K A; 2MHB A; 1YE2 A; 3LR7 A; 4F69 A; 2O5Q X; 2DN1 A; 3RJ6 A; 3GKV B; 1MYH A; 1EMY A; 1J40 B; 1LH2 A; 1OUT B; 3G4W A; 1G08 B; 1IT2 A; 1J52 A; 1MNH A; 1Y4F A; 1UVX A; 2MGC A; 2VLY A; 1CMY B; 4H07 A; 1VWT A; 2V1H A; 2BNL A; 3OZU A; 1OFK A; 3GQR B; 1VXG A; 1X9F D; 5HU6 A; 2HBC B; 2VYZ A; 1Y45 B; 3D1A B; 2W31 A; 2C0K A; 1QSI A; 3IC2 A; 3PI3 A; 1YG5 B; 3UHC A; 1JP8 A; 1QI8 A; 3UHV A; 1O1I B; 5EET A; 1NQP B; 1V4W A; 1W92 A; 2HBD B; 3UH5 A; 1UVY A; 1HCO A; 1VRE A; 1Y7G A; 2QSS B; 1LH5 A; 5CNF A; 1MGN A; 2KSC A; 1RQ3 B; 2HZ2 A; 1HDB B; 3ZOL A; 1XYE B; 1U7S A; 4NZI A; 1DLY A; 3WCV A; 1YHU C; 1DUO A; 1Y5F B; 1IOP A; 1BJE A; 1S5Y A; 2D2M A; 1OR6 A; 2D2N A; 1HBS B; 3BOM A; 1BZZ B; 2HBE A; 4O2G A; 4IT8 A; 3O89 A; 3MYN A; 2AV3 A; 2HHB A; 1HGB B; 2R1H A; 3PIA B; 5SW7 B; 3AT6 A; 2XKH A; 2GRH A; 1MZ0 A; 1AJG A; 3QM9 A; 1YGD B; 1Y0D A; 5KDQ B; 2ZS1 C; 1J7Y B; 2QSP B; 1RTE A; 4WCH D; 3WI8 A; 1DXD A; 3UGZ A; 3D17 B; 3WFW A; 4DC7 A; 2G0X A; 1MYG A; 1NEJ A; 1YIH A; 4MQI A; 1LFL B; 1CG8 B; 3G4Y A; 2DHB B; 1ABW B; 2WTH A; 3QJC B; 1MYJ A; 4MQG A; 1MBN A; 1Y09 B; 4NK1 A; 4F6I A; 3LB1 A; 1F5O A; 2DN3 A; 2FRF A; 2B7H B; 3WCW C; 4NI0 B; 1SPG B; 1YVQ A; 5HAV A; 2EF2 A; 3GDJ B; 1LFZ B; 1Y0W A; 3WTG B; 3D1K B; 4YU3 B; 1Y4G B; 3ZJM A; 3D4X A; 2Z6S A; 2DC3 A; 3A59 B; 1HSY A; 1IRD A; 1B86 A; 2V1E A; 1GBU B; 1Y5K B; 2GRZ A; 2W6X A; 4MU5 A; 4O35 A; 1HBI A; 1MOC A; 1LTW A; 3WHM B; 3AG0 A; 3ZJH A; 1V4X B; 5KKK A; 1QSH A; 2LH3 A; 3NMM B; 1LA6 B; 2ZFO D; 1GVH A; 2MHB B; 2QLS A; 5HLX A; 1D8U A; 1YE2 B; 1YHE B; 1PBX B; 3ZOM A; 1X9F B; 2MGD A; 1O1N B; 1YZI A; 1FSX A; 3O7N A; 2RI4 B; 4N7O A; 4F4O A; 1Y4F B; 4FWZ A; 1F63 A; 3WCP B; 2G3H A; 2ZS0 A; 1NWI A; 5EV5 A; 1OBM A; 3ED9 A; 4H2L A; 5CHR A; 3M3A A; 1NXF A; 1MBA A; 3WFU A; 5HU6 B; 2OH8 A; 2LH5 A; 1OFJ A; 3IC2 B; 4JYQ A; 2AUO A; 4N7N A; 1CH1 A; 2XYK A; 2ZT3 A; 3UHE A; 1A0U A; 1IBE B; 1V4W B; 3HYU B; 2HBS A; 1EWA A; 2SPL A; 2LH2 A; 2MGI A; 3ONZ A; 1Y7G B; 1EBT A; 2O5T X; 1NIH A; 1UMO A; 1HRM A; 2GKM A; 2DN2 A; 2R80 A; 3SZK B; 1S6A A; 4N8T B; 1R1X A; 2WTG A; 1Y7Z B; 3MJU A; 3TLD A; 1SDL A; 2W6Y A; 3LHB A; 5ILE A; 1S5Y B; 2D2M B; 2G14 A; 2D2N B; 3BOM B; 3HHB B; 4HRT A; 4XS0 A; 3A9M A; 5EOH A; 2BLJ M; 1DTI A; 1X9F C; 1HHO B; 2QFN A; 1MYF A; 2QMB A; 1S56 A; 2R1H B; 4AVD A; 2ZT2 A; 3LB3 A; 1Y0T A; 1VXE A; 106M A; 1DKE B; 1MLQ A; 1HBA A; 1FSL A; 1Y01 B; 2O5M X; 4U8U A; 1J7W B; 4N7P A; 1GDI A; 1XZ5 A; 1MBD A; 1BAB B; 2VEE A; 3U3E A; 3S48 C; 2ZLU A; 2G0Z A; 4ROL A; 4VHB A; 1BIJ A; 2ZLX A; 3S66 B; 1YIH B; 4MQI B; 3ZJO A; 3ZJR A; 1HV4 A; 3VRF B; 3KUO A; 3GK9 A; 5JDO E; 3ZJP A; 1FDH A; 4MQG B; 2PGH B; 3PT8 A; 1OUU A; 3EDB A; 3W4U A; 1Y8K A; 1A0Z A; 6HBW B; 1KD2 A; 5AB8 A; 3BJ3 B; 4WJG A; 2FRJ X; 1HGC A; 3GQP A; 5ILR A; 2AUR A; 3QM7 A; 3OK5 A; 5E83 A; 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2QMB B; 1YEO B; 2LH6 A; 2ZFB B; 2HZ3 A; 2RAO A; 4G1V A; 1ECN A; 1Y4V B; 3ECX A; 4ESA A; 3S65 B; 3HRW A; 1RSE A; 1Y2Z A; 1JZM A; 4ILZ A; 3G4R A; 4ROL B; 3EU1 B; 1S69 A; 2ZLW A; 1BIJ B; 4L7Y B; 1DXU A; 1YMB A; 3CY5 B; 3ARJ A; 1J7S B; 7HBI A; 1FCS A; 2ZT1 A; 2QU0 A; 2E2Y A; 4ROM B; 1HV4 B; 1Y5J A; 4X0L B; 2R4W A; 4F6J A; 1HBR A; 1A00 A; 3DUT A; 1Y8K B; 2EKU A; 1VXF A; 4M4B A; 5JGG A; 2VRY A; 3G52 A; 1CH4 A; 4ZVA A; 2GTL B; 1XZ7 A; 1K0Y B; 1SI4 B; 1YEQ A; 3FH9 A; 4KMV A; 1CH3 A; 3QM6 A; 1YHR A; 2Z6N A; 1S0H B; 2BW9 M; 2Z8A A; 1Y22 A; 2PEG A; 3BJ2 B; 3VRG B; 3ORD A; 1O1P B; 2HHD A; 3A2G A; 1YEU B; 3HEO A; 1HBH B; 3A5B A; 3OGB A; 1UFJ A; 2MGL A; 1Y0A B; 1NS6 A; 1LFT A; 2FAM A; 1XXT A; 2MYD A; 2H8D A; 3BA2 A; 1ABS A; 3E4N A; 1Y8H A; 1XZ4 A; 2EVP A; 1IWH A; 3UHD A; 1O16 A; 1F65 A; 1DWR A; 5KER A; 1GCW B; 2HBG A; 5ILP A; 4M4A B; 3WCV D; 1B0B A; 1V07 A; 2VYW A; 4O4Z A; 3UHH A; 4MQC A; 104M A; 2D2M D; 1MNO A; 1V75 B; 2D2N D; 3HXN B; 1FLP A; 3QJE A; 1VHB A; 3K8B A; 3WFT A; 5HLU A; 3OO4 B; 112M A; 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