The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
115
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sequence length |
283
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structure length |
283
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEAWERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGQGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYRGVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEAWERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGQGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
|
| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
115
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| structure length |
283
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| sequence length |
283
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3AQ7 A; 4ODC A; 3UHC A; 1BZ1 A; 3QJC A; 1MYT A; 1NIH A; 2DN1 B; 4IRO A; 1M9P A; 2LH2 A; 2QSP B; 5EE4 C; 3WCW A; 3ZJL A; 2XKI A; 5SW7 A; 4XS0 A; 1HRM A; 1MLS A; 2LH7 A; 3ZJI A; 3VHB A; 4N7O A; 3DHT A; 1J3Y B; 1XY0 A; 1GDK A; 2DN3 A; 1YMC A; 2QSS A; 2HCO B; 4G51 A; 2O5T X; 3CY5 B; 4H07 A; 1Y4R A; 3E5O A; 5JDO F; 3K8B A; 1A9W A; 1Y4V A; 3VRF A; 2ZSY A; 1O1J B; 3RGK A; 3WR1 A; 1BJE A; 2WTG A; 1R1X B; 1LFZ A; 3WFT A; 1A0U B; 1C40 B; 1OR4 A; 1SDL A; 3G4U A; 4YU4 B; 5CNB A; 5HY8 B; 1AJH A; 5EV5 A; 1Y8W A; 1C7C B; 2MYC A; 2H8D B; 4N7P A; 2OHA A; 1IWH B; 4FWY A; 2BLI A; 1Y4F A; 1G08 A; 3UHW A; 1N9H A; 4ESA A; 3WFU A; 3PI8 B; 1Y7Z A; 1HGB B; 1Y01 B; 1YFF A; 3ZJQ A; 1DTM A; 1F5O A; 3UHE A; 4NI0 A; 4H2L A; 1EBC A; 1Y8W B; 3M39 A; 3AQ5 A; 3RJ6 A; 3G4Y A; 3P5Q A; 2D2N B; 3ORD A; 2ZSZ A; 3HXN A; 1GDJ A; 2V1I A; 1N9X A; 1NEJ A; 1YCA A; 2LHB A; 1Y7Z B; 3GQR B; 4HHB A; 2HHD A; 1S0H B; 3VRG A; 1YEN B; 1J3Z A; 102M A; 1AJ9 A; 1DO3 A; 2R4Z A; 4NI0 B; 1CIO A; 1JZL A; 1YH9 B; 3HEN A; 3S48 C; 1MLJ A; 1O1K A; 1MOC A; 5ILP A; 2EVK A; 2ZS0 A; 1YG5 A; 4NZI A; 1HV4 B; 1HSY A; 2ZLX B; 1S5X A; 4M4A B; 2W6V A; 3QZX A; 4C0N A; 1MNJ A; 5EYS A; 4MXK A; 1BZR A; 1NS9 B; 1QXD A; 3PT8 B; 3PEL B; 3ONZ B; 1GBU A; 4NI1 A; 2MGM A; 5JDO C; 1Y0C B; 2ZLV B; 1Y5F A; 1V5H A; 1UFJ A; 3ZJM A; 1LH3 A; 1QSH A; 2PGH A; 3GOU A; 1O1I A; 4SDH A; 3OO4 A; 2ZS0 D; 1DXT A; 2FAL A; 1YZI A; 1PBX A; 1HBH A; 3ZJS A; 2SPO A; 1HDS B; 3EU1 A; 3FS4 B; 1Y8K B; 2ZFO D; 1SWM A; 3QQQ A; 1XZV B; 2GKM A; 3WCT A; 1V07 A; 1SPE A; 3A5B A; 3R0G A; 2EVP A; 1MLG A; 2FRF A; 1R1Y A; 1Y2Z B; 1THB B; 3GDJ A; 1V75 A; 1AZI A; 3QM8 A; 4KJT A; 3ZOM A; 1A01 B; 2D60 A; 1OUU B; 1WMU A; 7HBI A; 1BAB A; 4WJG 1; 2XYK A; 4PQC A; 1Y0A A; 1DLW A; 2GTL A; 3HHB A; 4N7N B; 1HGA A; 1YEQ A; 1Y0W B; 3BJ2 A; 3NML A; 1BZ0 A; 1FAW A; 2ZSX A; 2MB5 A; 3WCT D; 3MKB B; 1DLY A; 4VHB A; 1SPG B; 1YVT A; 4U8U B; 3MVC A; 1Y4P B; 1MNI A; 1QXE B; 3OVU C; 3WCP B; 2ZWJ A; 5CNF A; 1CMY A; 3WCU D; 2Z8A A; 2V1K A; 1LA6 A; 1Y31 A; 1Y5K A; 4O4T A; 1G09 A; 5AZR A; 1UVX A; 1IT3 A; 3KUN A; 1MNK A; 2RI4 B; 2EB9 A; 4L2M A; 1HBB A; 3UH5 A; 3GYS A; 2ZT2 A; 1Z8U B; 5EQM A; 3WFW A; 4DC8 A; 1HLB A; 1ABS A; 1IT2 A; 1SI4 A; 2OH9 A; 1A4F A; 4M4B A; 4X0L B; 1VXA A; 2HHE A; 1G9V B; 3BCQ B; 1F5P A; 1JWN A; 3D1A A; 4DWT A; 1YVQ A; 1M6C A; 4MXL A; 2JHO A; 1ITH A; 2QMB A; 1JZK A; 2HBE A; 1OJ6 A; 4ROL A; 1COH B; 3VAU A; 1MYG A; 3AQ9 A; 3FH9 A; 2MYB A; 1HBS B; 1XZU A; 3NFE A; 1BZZ A; 3PT7 B; 3BJ1 A; 3EDA A; 1XQ5 B; 3HRW B; 3WTG B; 3GQG A; 3A59 A; 3S66 B; 1RQ3 B; 1VXD A; 1J7Y A; 2AA1 B; 1X9F D; 2V1E A; 3GKV A; 5EUI A; 3D7O B; 1G0A A; 2HHB B; 1GDL A; 4YU3 B; 3ZOL A; 1HDA B; 1T1N A; 2MYA A; 5MBN A; 2MGG A; 5AZQ A; 4U8U C; 1IDR A; 1FDH A; 4ROM B; 1G0A B; 3V2Z A; 3UHD A; 1N9F A; 3ZH0 A; 4FC3 B; 1K1K A; 2VEE A; 1NAZ A; 3D4X A; 2G0X A; 3B75 A; 1FLP A; 3M38 A; 3PIA B; 2R1H B; 2VLZ A; 1MCY A; 3NMM B; 3SDH A; 1NWN A; 3E5I A; 1MLU A; 5C6Y A; 4HSX A; 1J41 B; 1SDK A; 3KMF C; 3IC2 B; 2VEB A; 1VXG A; 2ZFB B; 1UX8 A; 1LFY B; 1YEO B; 1MYM A; 1LFL A; 1RQ4 B; 1HDB A; 2BWH A; 4MQI B; 1XYE A; 2MGE A; 1Y8I A; 1YE2 B; 1CO9 A; 2V1F A; 1WLA A; 4MQK B; 3QMA A; 3PI4 A; 4PQ6 A; 1BIJ B; 1J7S B; 5JGG B; 1EWA A; 3QQR A; 1EBT A; 1ABY B; 1LFQ A; 1JDO A; 1NQP A; 2BW9 M; 1WVP A; 2W72 C; 1SHR A; 3OJ1 A; 1YGD B; 1KD2 A; 5JDO E; 1G0B B; 1MBI A; 3WI8 A; 2Z6S A; 1VRE A; 1J40 B; 3S1I A; 3ECL A; 3UHH A; 1VWT B; 1DO7 A; 2HBG A; 1MTI A; 2ZS1 B; 3ODQ A; 4C44 A; 1ASH A; 3MJP B; 1JY7 A; 1YOG A; 1HBR A; 1Y45 B; 1NGK A; 2H8F A; 1MKO A; 2ZLT B; 1C7B A; 2D2M B; 112M A; 3OK5 A; 3UH6 A; 1RPS B; 5EE4 D; 5EOH A; 1JEB B; 4DWU A; 3NL7 A; 1YHR B; 2MHB A; 3CIU A; 3TM9 A; 1Y0T A; 3V2V A; 1HHO B; 2ZT3 A; 1YE0 A; 1MBD A; 2GRH A; 3BOM A; 1OUT A; 2HBF A; 1DXV A; 2SPL A; 1HBI A; 1RTX A; 2QRW A; 1IBE B; 2YRS A; 1F65 A; 1QPW A; 4MQG A; 1W92 A; 1O1M B; 1B86 A; 106M A; 104M A; 1MBC A; 1LFV B; 2G0V A; 3DHR A; 1CG5 B; 1O1N B; 3A2G A; 1XXT A; 4FH7 A; 2RAO B; 4MQH B; 2VYZ A; 2HBC B; 2GKN A; 3OO5 A; 3UGY A; 1S5Y B; 1Y5J B; 3D1K A; 5ILR A; 3A0G A; 2BLJ M; 1GBV A; 1LFT B; 3UH3 A; 2D5X B; 2MGK A; 2MGF A; 1N9I A; 1A3O A; 4NXA A; 1S56 A; 1GLI A; 3W4U B; 1GCW B; 1DWR A; 2HZ1 A; 4ODC B; 1BZ1 B; 3QJC B; 108M A; 1DXU A; 1JP8 A; 3O89 A; 1I3E A; 3BA2 A; 1NIH B; 4IRO B; 1M9P B; 2HZ3 A; 3WCW B; 4JAC A; 1EMY A; 5E83 A; 1CP0 A; 5SW7 B; 1JW8 A; 4B3W A; 1NPG A; 4XS0 B; 3UHR A; 4AVD A; 2ZSO A; 4N7O B; 3DHT B; 1MYI A; 2D5Z A; 3G4R A; 1XY0 B; 2DN3 B; 2QSS B; 4G51 B; 5F0B A; 1CPW A; 3GLN A; 1YHU C; 1Y4R B; 5JDO D; 3K8B B; 1Y4V B; 3VRF B; 1IOP A; 3WCV C; 3WR1 B; 1MDN A; 3IA3 B; 1LFZ B; 5E29 A; 1RQA A; 1YEV A; 2MGD A; 2ZLW A; 3LQD A; 1SDL B; 1LTW A; 3HF4 A; 1DUK A; 3OGB A; 3QM9 A; 4TYX A; 1CIK A; 2SPN A; 4N7P B; 1BVC A; 1UT0 A; 1Y4F B; 1MOH A; 5JOM A; 1G08 B; 1YIH A; 1YHE A; 4ESA B; 3ASE A; 1Y4B A; 1CH1 A; 1YFF B; 1ECN A; 1S69 A; 3SDN A; 4NK2 A; 1A0Z A; 1LHT A; 2G12 A; 4NK1 A; 4MQC A; 2ZSN A; 4H2L B; 5EET A; 3P5Q B; 1DXD A; 2H35 A; 4O35 A; 3HXN B; 1YIH B; 1NEJ B; 1RTE A; 2ZFO A; 4HHB B; 3HC9 A; 3LR7 A; 2HHD B; 3LB1 A; 3VRG B; 1VXF A; 1J3Z B; 1AJ9 B; 1VXE A; 3WHM A; 1O1K B; 3D17 A; 3QJB A; 1EW6 A; 2GRF A; 1Y46 A; 2ZS0 B; 4F6G A; 3UHN A; 2PEG A; 1MWB A; 1YG5 B; 1CH5 A; 2EF2 A; 2OH8 A; 5CMV A; 1MWD A; 1S5X B; 2W6V B; 1V4W A; 2O58 X; 2G0S A; 2BKM A; 2GNV A; 3WCW C; 1QXD B; 1A3N A; 1GBU B; 1XZ2 A; 4NI1 B; 5CN8 A; 5EU2 A; 5HU6 A; 2PEG B; 3AT5 A; 1O1P A; 1Y5F B; 5ILE A; 1Y0D A; 2QU0 A; 1V4W B; 1QSH B; 1MLR A; 1XCH A; 2PGH B; 3GOU B; 1O1I B; 1A3N B; 2DN2 A; 3WCU A; 4ILZ A; 3OO4 B; 4TWU A; 1DXT B; 1JL6 A; 1YZI B; 1PBX B; 1HBH B; 1O1O A; 2O5L X; 3EU1 B; 3HYU A; 2W6X A; 1O1P B; 1U7R A; 2G0R A; 3WCT B; 2QU0 B; 2M6Z A; 1S6A A; 5D5R A; 2D2N C; 1V9Q A; 1OFJ A; 1NS6 A; 1R1Y B; 2ZLU A; 3PI2 A; 3WCU B; 1MYJ A; 1HLM A; 3ED9 A; 1V75 B; 3GDJ B; 3UHB A; 1BZ6 A; 2R50 A; 1XZ4 A; 1VHB A; 1YDZ A; 3LR9 A; 2HBD A; 2D60 B; 4FH6 A; 1WMU B; 1FN3 A; 3ARJ A; 4MU5 A; 1BAB B; 1MLO A; 4F68 A; 3MJU A; 1MZ0 A; 1CH2 A; 3AQ6 A; 4O4Z A; 1PMB A; 2XKG A; 1Y0A B; 2ZLU B; 2GTL B; 3HHB B; 1Y35 A; 1NZ4 A; 1HGA B; 1YEQ B; 1YEU A; 3BJ2 B; 1BZ0 B; 1FAW B; 4N8T A; 1HAB A; 1CP5 A; 3LB3 A; 5E6E A; 1C7D A; 1YVT B; 3IC0 A; 1BUW A; 1CMY B; 2XKH A; 3A5G A; 2MYD A; 1CH3 A; 2DC3 A; 1LA6 B; 1Y31 B; 3ZJO A; 1Y5K B; 4U8U D; 1G09 B; 5HLX A; 3WFX A; 5CN7 A; 1X9F A; 3LHB A; 1HBB B; 1Y85 A; 1OR6 A; 4F4O A; 3S1J A; 3GYS B; 4ZVA A; 1HBA A; 3R5I A; 1Y22 A; 1MBO A; 1HGC A; 4NXC A; 2W72 A; 2EKT A; 1MGN A; 3UI0 A; 1GZX A; 1ABW A; 1SI4 B; 1A4F B; 4M4B B; 1CQX A; 3MOU A; 1Y85 B; 1Y7C A; 2ZSS A; 2HHE B; 1IRC A; 1UIW A; 3ZJH A; 1MOD A; 1OBM A; 2NRL A; 3D1A B; 1BVD A; 1YVQ B; 2O5B X; 1K0Y A; 1OFK A; 1X3K A; 2QMB B; 3PI9 A; 1RVW A; 3K3U A; 2HBE B; 2R4X A; 1QI8 A; 1IRD A; 4ROL B; 1MYH A; 2V1H A; 3FH9 B; 1Y83 A; 2DXM A; 1MWC A; 3EOK A; 1J7W A; 1XZU B; 3NFE B; 2MGA A; 1BZZ B; 3G46 A; 1CBL A; 3BJ1 B; 110M A; 3GQG B; 1NPF A; 2V1J A; 3A59 B; 2AV0 A; 5CN4 A; 1J7Y B; 2BK9 A; 1LUE A; 5CNG A; 3GKV B; 5EUI B; 1FHJ A; 2GTL C; 2SPM A; 1Y09 A; 3TLD A; 3OZU A; 1CG8 A; 1T1N B; 1BBB A; 3G4W A; 2CMM A; 2MBW A; 111M A; 4MPM A; 2FAM A; 5CNE A; 1S61 A; 2AUO A; 2OLP A; 2Z6N A; 3G53 A; 2MGB A; 1BZP A; 2B7H A; 2EKU A; 2MYE A; 3BJ3 A; 2V1G A; 1K1K B; 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1MNH A; 1DTI A; 1Y4Q B; 1XXT B; 2QSP A; 4HBI A; 3OZW A; 3UHY A; 1VXC A; 3OO5 B; 3UH7 A; 3D1K B; 3UBV A; 3A0G B; 2O5O X; 1J3Y A; 1GBV B; 1LH5 A; 3G4Q A; 4F6J A; 2HCO A; 3ZJJ A; 1MBN A; 2ZS1 C; 3CY5 A; 2ZT4 A; 3QM5 A; 1O1J A; 4NS2 A; 1R1X A; 1A3O B; 105M A; 1GLI B; 1A0U A; 1C40 A; 1H97 A; 4YU4 A; 2ZSR A; 5HY8 A; 2D2M C; 2ZSP A; 1C7C A; 2H8D A; 1DXU B; 3K9Z A; 1IWH A; 1CO8 A; 1KR7 A; 6HBI A; 3PI8 A; 1M6M A; 1HGB A; 5E83 B; 2VHB A; 5CND A; 2WY4 A; 1BIN A; 2R4Y A; 2D5Z B; 3WCW D; 2D2N A; 101M A; 3GQP A; 1DO1 A; 109M A; 2GLN A; 5CN9 A; 2C0K A; 6HBW A; 4MBA A; 2VRY A; 3GQR A; 3HEO A; 5KER A; 1S0H A; 5E29 B; 1RQA B; 1YEN A; 1LHS A; 1YEV B; 3ECZ A; 2QFK A; 4OOD A; 2ZLW B; 1YH9 A; 3LQD B; 4G1B A; 3HF4 B; 3UHG A; 5CHR A; 2W6W A; 3QM7 A; 3GQP B; 2MGI A; 1HV4 A; 2BNL A; 2Z85 A; 2ZLX A; 4M4A A; 6HBW B; 1YHE B; 1VRF A; 5KER B; 1UFP A; 1Y4B B; 1V4U A; 2G0Z A; 3ZJP A; 1NS9 A; 1A0Z B; 3PT8 A; 3PEL A; 4MQC B; 2D2N D; 3ONZ A; 1UMO A; 4UIQ A; 1YOI A; 1Y0C A; 1CH9 A; 2ZLV A; 2H35 B; 1AJG A; 3ECX A; 1H1X A; 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