The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
57
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| total genus |
57
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1XCH A; 3LB2 A; 3PIA A; 3R5I A; 2R4Y A; 4OOD A; 1CG8 A; 2MGI A; 1VXC A; 2MGM A; 2IG3 A; 3A0G A; 3VRE A; 5AZR A; 1HAC A; 2ZSQ A; 1LFQ B; 2XYK A; 3HF4 B; 4ZVA A; 1ABY B; 4ILZ A; 2D2M B; 5ILE A; 1O16 A; 3QM8 A; 1GZX A; 2HBF A; 2MGL A; 3UHC A; 2MGA A; 4MXL A; 1MWC A; 5KDQ A; 1GBV A; 1YE0 A; 2H8F A; 2RAO A; 1Y5J A; 2BNL A; 3H58 A; 3ZJP A; 2DN2 A; 3PIA B; 1YHU A; 4WCH D; 1CG8 B; 1XY0 A; 3D7O A; 4HRR A; 1V07 A; 1MNO A; 5HU6 B; 1ITH A; 1F5O A; 2V1I A; 1RTX A; 1HBG A; 4MQI B; 1G09 A; 1NZ3 A; 1JL6 A; 1GZX B; 3WCW D; 1YHE A; 5SW7 A; 1HBB B; 2GTL A; 2AA1 B; 1YOG A; 3K8B A; 1J40 B; 1SPG A; 5KDQ B; 1O1I A; 3IC0 B; 1URY A; 2O5L X; 3EOK B; 1U7S A; 3MBA A; 2DN2 B; 1YHU B; 1B86 B; 4F68 A; 1DKE B; 2D60 B; 1LFV A; 3D17 B; 3WCV C; 1T1N B; 1CH7 A; 1Y4Q B; 1UFP A; 4ROM B; 1O1I B; 1YEQ A; 1FHJ B; 4MAX A; 102M A; 2ZS1 A; 1OBM A; 4NS2 A; 1S5Y B; 3LHB A; 1JWN A; 2VHB A; 2GLN A; 3DHR A; 1Y0W A; 3BJ1 B; 2OH9 A; 1YHR A; 4AVE A; 3WI8 A; 3EU1 B; 4HHB A; 3QQQ A; 4HRT A; 2H35 A; 5CN7 A; 1BAB B; 2GNW A; 3UHG A; 1N9I A; 3PT8 A; 1CH3 A; 1CO8 A; 1JP6 A; 1J3Z A; 1ECA A; 2GTL D; 2R50 A; 5CNF A; 3VRG B; 1XZU B; 1YZI A; 1Y0W B; 1CH2 A; 2LH5 A; 3AQ5 A; 3WCU A; 2EKU A; 1A9W E; 3MOU A; 3FS4 B; 2G0R A; 3VAU A; 3OO4 B; 2OHA A; 2QSP A; 1LH6 A; 3NMM A; 1YEU A; 2MGG A; 2G3H A; 1YEV B; 2H35 B; 1HAB B; 2O5M X; 1RQ3 B; 3ECZ A; 1J7W A; 1BBB A; 3G4U A; 1S5X B; 2R4X A; 2YRS A; 3PT8 B; 2OIF A; 3UH7 A; 1SDK B; 1D8U A; 3G4Y A; 1XZ4 B; 5E6E A; 2R4Z A; 4L7Y A; 1BZR A; 2LHB A; 5KER A; 4N7P B; 2ZLV B; 5EET A; 2ZS1 D; 3WCU B; 1UC3 A; 3G4Q A; 1GDJ A; 5E83 B; 1Y4V A; 3QZZ A; 3ONZ A; 1JF3 A; 1Y4B A; 1J52 A; 3CY5 A; 2QSP B; 1IWH A; 2ZT0 A; 3AG0 A; 5AZQ A; 3GQR A; 4NI1 B; 3QM6 A; 5HLX A; 4ROL B; 1QXD A; 3GOU B; 2YRS B; 4M4A B; 1Y4R B; 2DC3 A; 4G1V A; 2RI4 A; 1VXH A; 3WCT D; 1HBS B; 1HBH A; 3WCP A; 5JDO D; 2ZSR A; 3QJE A; 3A5A A; 4U8U D; 2QSS B; 1NWI A; 1Y4V B; 2ZLT A; 1HDB A; 2HHB A; 4O4T A; 2D2M C; 2OLP A; 3UH3 A; 1QXE A; 1IWH B; 1HRM A; 1O1N A; 1Y0D A; 1V4W B; 107M A; 2O58 X; 4VHB A; 1NZ5 A; 3ZJO A; 1NWN A; 4WJG A; 1YEN A; 2GRF A; 1A01 B; 1QXD B; 1Y45 A; 1FSL A; 2ZFB A; 2E2Y A; 1DO1 A; 1JF4 A; 1XQ5 A; 2RI4 B; 1EMY A; 1HBI A; 1MTJ A; 2HHE B; 4G51 A; 105M A; 3WCP B; 1DO3 A; 1Y8H A; 1HSY A; 1YOH A; 1A0Z A; 3SZK B; 2NX0 A; 2ZLT B; 4UIQ A; 3G46 A; 1OFJ A; 1SDL A; 3PEL A; 2ZWJ A; 1HHO A; 3GLN A; 1KR7 A; 1HBR A; 1EBC A; 1Y0D B; 1F65 A; 1S61 A; 1Y46 A; 2VLX A; 1MCY A; 1K1K B; 1J41 B; 1YDZ B; 1LFZ A; 3UHB A; 1A3N A; 4MQC A; 1NAZ A; 3MN0 A; 5MBA A; 2ZLU B; 1RPS A; 1YHU C; 4SDH A; 5JDO E; 3ED9 A; 3TM3 A; 1Y8H B; 5HLU A; 1YEO B; 1X9F B; 3BCQ A; 1FAW B; 5D5R A; 1LA6 A; 1OUU A; 4MPM A; 1HBR B; 4F6J A; 4N8T A; 1LH7 A; 1ASH A; 1Y46 B; 1XZ5 A; 5EUI B; 1LFZ B; 1A3N B; 3EDB A; 5EQM A; 1M9P B; 3HHB A; 4MQG B; 4NI0 B; 1LFY A; 1HCO A; 1TU9 A; 3M38 A; 5CNB A; 1BIJ B; 3MJU B; 3BJ3 A; 5JGG B; 1CH1 A; 3KMF C; 3NL7 B; 5CNE A; 1MLR A; 2G10 A; 1FSX A; 2O5O X; 1JPB A; 3UGZ A; 1LA6 B; 1DXU B; 1OUU B; 1HLB A; 4B4Y A; 2GRH A; 1V4X A; 1A6N A; 3E4N A; 3S65 B; 1FLP A; 4PQC A; 3BOM A; 2HBC A; 3AQ9 A; 3QJB B; 5HBI A; 3D1K B; 1NS6 A; 1C7B A; 3TM9 A; 1GLI A; 2FRF A; 1K0Y A; 5CHQ A; 3A2G A; 3ODQ A; 1MLF A; 2SPO A; 5F2A A; 1LFY B; 4DWU A; 1NS9 B; 1G08 B; 1R1X A; 1AJ9 B; 4MU5 A; 1LHT A; 3H57 A; 3WCV D; 1Y5K A; 2ZSY A; 1L2K A; 1I3D A; 1O1M A; 2R1H A; 1CIK A; 1FSX B; 2QLS A; 2M6Z A; 4DC8 A; 1Y5F A; 4N7N A; 3MYM A; 2DN3 A; 1V4X B; 3G52 A; 1XXT A; 4ESA A; 3SDN A; 3OVU C; 1BVC A; 2HBC B; 2DHB A; 1A4F B; 1DXT B; 4B3W A; 1LFL A; 2VLZ A; 3AT6 B; 1NS6 B; 3AQ6 A; 1YFF A; 4IRO A; 1UIW A; 1K0Y B; 3QZX A; 4TYX A; 1YCB A; 1CG5 A; 1NQP B; 3S1I A; 1IBE A; 3WCU C; 1R1X B; 2EVK A; 1Y0C A; 2LH1 A; 2V1J A; 4MQK B; 1LH2 A; 4HBI A; 2MGH A; 2Z6N B; 4F6B A; 1Y5K B; 4WJG 1; 3GQP B; 1VRF A; 1Y7G A; 1O1M B; 2R1H B; 2HBE B; 2QLS B; 2M6Z B; 3HEP A; 1LFQ A; 4F6D A; 1YE2 B; 1Y5F B; 4N7N B; 1GBU B; 1MBD A; 1ABY A; 2D2M A; 2GNV A; 2HCO B; 1Y8I B; 2DHB B; 1WVP A; 4O35 A; 3HEO A; 2EKT A; 3ASE A; 5CMV A; 1G0A B; 4XS0 A; 1IBE B; 5D1V A; 1Y7G B; 5HU6 A; 1URV A; 4ODC B; 2V1F A; 5F0B A; 3QMA A; 3ZJQ A; 5EE4 C; 4MQI A; 2EF2 A; 1B0B A; 2EB9 A; 1UMO A; 1GDL A; 1XYE A; 5HLQ A; 3U3E A; 1HBB A; 2ZSX A; 2AA1 A; 1S0H B; 1NEJ A; 3ECL A; 1J40 A; 3IC0 A; 1DM1 A; 4FWX A; 3VRF B; 2O5T X; 4N7O B; 1Y8W B; 4XS0 B; 3EOK A; 1J3F A; 1NIH B; 3ZJN A; 4YU4 A; 2VEB A; 3UHX A; 1MBC A; 1B86 A; 1MBA A; 1Y09 B; 1DKE A; 3AT5 A; 2HBD B; 2FAM A; 3FH9 B; 1CH4 A; 2D60 A; 3R0G A; 3QJC B; 1YGF B; 3D17 A; 1XYE B; 3RJ6 A; 1J7S B; 5EU2 A; 1T1N A; 1NEJ B; 2D2M D; 3O89 A; 2LH6 A; 1Y4Q A; 4ROM A; 1FHJ A; 2ZSP A; 1CBL A; 1ECO A; 1VXG A; 2EVP A; 1BZ6 A; 1VHB A; 3ZH0 A; 1S5Y A; 1SWM A; 1X9F C; 4HSW A; 4YU4 B; 5EV5 A; 1RQ4 B; 1DLY A; 1LH1 A; 3BJ1 A; 5EOH A; 1G0B B; 2AUR A; 2HBS A; 106M A; 1BJE A; 1Y7Z B; 3EU1 A; 3BA2 A; 3BJ2 B; 3KMF A; 1UX8 A; 3UHS A; 4L2M A; 1YG5 B; 1EWA A; 3AT5 B; 2MB5 A; 2ZLW A; 3ZJS A; 1BAB A; 2QRW A; 1G9V B; 4MQH B; 3OK5 A; 1MTK A; 1EBT A; 3TLD A; 1QPW B; 1GCW B; 1XZ2 B; 1S6A A; 1IOP A; 4JYQ A; 1DO4 A; 1M6C A; 3GK9 A; 3VRG A; 3ARK A; 1J3Y A; 3WFX A; 1XZU A; 4C0N A; 5CN4 A; 2HBS B; 3FS4 A; 3IA3 B; 3OO4 A; 1YHU D; 4KMW A; 109M A; 1XZ7 B; 2ZLW B; 1YEV A; 1HAB A; 1RQ3 A; 2QMB A; 1S5X A; 1MNK A; 1Y22 B; 3ZHW A; 5CN9 A; 1Y4P B; 1MYI A; 1SDK A; 1BZZ B; 1GVH A; 1XZ4 A; 6HBW A; 5HAV A; 1ABW A; 1DO7 A; 4N7P A; 1CMY B; 1J3Y B; 3LB4 A; 2ZLV A; 3G4R A; 1MOC A; 2G0V A; 1O1O B; 2FRI X; 5E83 A; 2ZFO A; 3K9Z A; 2SPM A; 4MQJ B; 1C40 B; 1CBM A; 2MGB A; 1O1J B; 3GYS B; 5CN6 A; 1YVT B; 2ZS0 A; 4NI1 A; 1YIH B; 3K3U A; 3O7N A; 2QMB B; 4ROL A; 5EYJ A; 3GOU A; 1X46 A; 4M4A A; 2FAL A; 1Y4R A; 6HBW B; 2D5X B; 2G0X A; 4DC7 A; 3PI1 A; 1HBS A; 1ABW B; 1V4U A; 1Y0A B; 2Z85 A; 3OO5 B; 3HEN A; 2QSS A; 3OZU A; 1KD2 A; 2ZFO B; 5CND A; 5JDO F; 5CNC A; 2Z8A A; 3HYU B; 2VLY A; 2MHB B; 1V4W A; 1JEB B; 2ZS0 B; 4G1B A; 3DR9 A; 5ILM A; 2SPL A; 1A01 A; 2AUO A; 1Y35 B; 1VXF A; 1MYM A; 1CP0 A; 3UHN A; 2Z6S A; 1V75 B; 1UVX A; 3OZW A; 1LJW A; 1V4U B; 2HHE A; 1HGB B; 2G12 A; 1Y7D A; 2XKG A; 3LR9 A; 1COH B; 1CH9 A; 1DLW A; 3D4X B; 3EDA A; 1IDR A; 3SZK A; 1KD2 B; 1PBX B; 1QI8 B; 3UH5 A; 2CMM A; 2V1E A; 1NZ2 A; 1YGD B; 3WCU D; 2ZT1 A; 3UBC A; 3ZJL A; 3RGK A; 1H97 A; 3ZJM A; 5HY8 B; 1K1K A; 3VHB A; 1J41 A; 1YDZ A; 1MDN A; 4NK1 A; 3OJ1 A; 4F4O A; 1PMB A; 1MOD A; 1RQA B; 1Y2Z A; 2PEG B; 2ZLU A; 1LJW B; 3HRW A; 3S66 A; 2B7H B; 1Y7D B; 3A5G A; 1YEO A; 3WTG B; 1X9F A; 1NPF A; 1CIO A; 1R1Y A; 3NFE B; 1C7C A; 2ZST A; 1FAW A; 1LHS A; 2G0S A; 2HZ3 A; 5ILR A; 3MVC A; 4C44 A; 3QJD B; 3UI0 A; 3PT7 A; 1Y31 B; 4KJT A; 1UFJ A; 4IT8 A; 1LUE A; 1RVW B; 2NSS A; 5EUI A; 4O2G A; 4H0B A; 1M9P A; 3OZV A; 4F4O B; 4MQG A; 1O1K B; 4NI0 A; 1Y2Z B; 5EE4 D; 3HRW B; 3S66 B; 1BIJ A; 3MJU A; 2NRM A; 2V1K A; 5JGG A; 2BMM A; 3NL7 A; 2DN1 B; 1YIE B; 4FH6 A; 1R1Y B; 1VXE A; 1C7C B; 1GJN A; 1A6K A; 1DXU A; 1FDH G; 2XKI A; 1CP5 A; 3PT7 B; 1Z8U B; 4UUR A; 4PNJ A; 2AV0 A; 3S65 A; 1C7D B; 1MLS A; 3QJB A; 1LH3 A; 7HBI A; 3D1K A; 3E5O A; 1VXA A; 4MXK A; 4KN3 A; 4XDI A; 3GKV B; 2G14 A; 1CH5 A; 1BZ1 A; 1BIN A; 1OR6 A; 1IRD B; 2MGK A; 1NS9 A; 3WHM B; 1G08 A; 3LQD B; 2MGC A; 1AJ9 A; 1O1P A; 2SPN A; 1HDS B; 1YMC A; 1H1X A; 2V1H A; 4M4B B; 3WR1 B; 2GKN A; 3HXN B; 1X9F D; 3UHW A; 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1AJG A; 3FH9 A; 3QJC A; 4PQB A; 4GZG A; 1YGF A; 3KUN A; 1CLS B; 1J7S A; 2BWH A; 5EYS A; 1J7Y B; 2G11 A; 1A3O B; 1GCV B; 4X0L B; 1KFR A; 3WCW B; 1A00 B; 3ZOM A; 1SPE A; 2W6V A; 3MJP B; 3P5Q B; 4MBA A; 4DWT A; 3S48 C; 3MKB B; 2D6C A; 1RQ4 A; 4TWU A; 4ZVB A; 1DXD A; 1G0B A; 1JL7 A; 2D5Z B; 1Q1F A; 1DWR A; 3PI4 A; 5CN5 A; 1Y7Z A; 3IC2 B; 4UZV A; 3BJ2 A; 1Y8K B; 1YG5 A; 3UHQ A; 3UHV A; 2MBW A; 1JZK A; 2WTH A; 1G9V A; 4MQH A; 3R5I B; 1YVQ A; 1MZ0 A; 1A6M A; 1QPW A; 3A0G B; 3VRE B; 4BJA A; 2ZT2 A; 1GCW A; 1HAC B; 1XZ2 A; 1DXC A; 2W6V B; 3G4W A; 2W31 A; 1FDH A; 4H07 A; 1Y4F A; 2HBF B; 2VM0 A; 5E29 A; 1RTE A; 3UHE A; 1MLL A; 1V5H A; 1AJH A; 1GBV B; 3GKT A; 5CHR A; 5AB8 A; 1YE0 B; 2H8F B; 2RAO B; 1VXB A; 1Y5J B; 1XZ7 A; 1MBS A; 1MKO A; 1Y01 B; 1YVQ B; 3GQG A; 1Y22 A; 3ARL A; 1XY0 B; 3D7O B; 1DUK A; 4HRR B; 2QU0 A; 1DUO A; 1Y4P A; 1OUT A; 2KSC A; 1BZZ A; 1MNI A; 1MYF A; 2O5B X; 1MWD A; 1M6M A; 1G09 B; 1BZ0 A; 1CMY A; 4TWV A; 2GDM A; 1Y4F B; 4FWY A; 1YHE B; 4F6G A; 5E29 B; 5SW7 B; 2GTL B; 1O1O A; 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