The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHADKLHVDPENFRLLGKVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Genetically Crosslinked Hemoglobin: A Structural Study
doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
Hemoglobin Alpha chain
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| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2002-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3BJ1 B; 1Y7C B; 1DM1 A; 1X9F D; 4HRT A; 2R4X A; 3WCV B; 3DUT B; 1G0B B; 1Y8K A; 1A3O B; 3MVC A; 4UZV A; 3VRF A; 1UIW B; 2C0K A; 1PBX A; 5B85 A; 1Y5J A; 1HGA A; 4UUR A; 1HDB B; 1QSI A; 2MHB B; 2HBE B; 1NEJ B; 1IBE A; 3PI1 A; 2HBD A; 4M4A B; 1XZ5 A; 1NZ4 A; 2OLP A; 3D1A A; 1Y85 B; 2NSS A; 3SZK A; 1LFQ A; 1LHS A; 3ARJ A; 1RQA A; 2MYB A; 3MJU A; 1G9V B; 3IXF A; 5CNF A; 4HRR B; 1H1X A; 2Z6S A; 5CHQ A; 3UHS A; 1UFJ A; 1OUT A; 3M3B A; 1UX9 A; 1MLM A; 1N9H A; 2GKM A; 1MYT A; 1IT3 A; 2CMM A; 4HSX A; 3U3E A; 3GDJ A; 1QPW A; 1HBG A; 2G0R A; 1MBN A; 105M A; 3GQR B; 3QZZ A; 3PI8 A; 3GOU B; 3NFE B; 1VWT A; 1WMU A; 1GDL A; 2OHA A; 1SPG A; 1S0H B; 1RPS B; 2R80 B; 2GTL B; 1MKO B; 3OVU C; 3MN0 A; 2HHD B; 1M6M A; 1CG8 B; 4AVE A; 1Y4G A; 1C7D B; 3NML A; 3HYU A; 3QZX A; 4G1B A; 1JY7 A; 1J41 A; 3ZJS A; 1AJ9 A; 3KUN A; 2AUR A; 3GQP A; 1N9I A; 2ZSX A; 5C6Y A; 1MLL A; 3BCQ B; 4MQH B; 4BJA A; 1CH9 A; 4MQK B; 4JYQ A; 3AQ8 A; 2AUP A; 7HBI A; 1Y4Q A; 4MQC B; 2DHB B; 2MGF A; 2IN4 A; 3ECZ A; 1J3Y A; 1RVW B; 2FRF A; 2DN1 B; 5F2A A; 1RQ4 B; 2R4Z A; 1YH9 B; 2V1I A; 4FH6 A; 3WFX A; 5AZQ A; 4F6D A; 4LPI A; 4N7N B; 1X3K A; 1YG5 B; 5F0B A; 5CN5 A; 2ZT0 A; 2Z6T A; 1DTM A; 3KMF A; 3VAU A; 3MBA A; 2B7H B; 1MZ0 A; 3WR1 B; 2ZT1 A; 2OH8 A; 2XKI A; 1QSH B; 2MGM A; 2RAO A; 1HCO B; 1OUU B; 1Y0D A; 2H8D A; 2DN2 B; 1MNJ A; 1A4F A; 3UHV A; 1LJW B; 2LH5 A; 1HBB A; 1IWH A; 5EV5 A; 1LFT B; 1MBI A; 2GNV A; 2XKH A; 2HBS A; 1G0A A; 3E4N A; 1YHR B; 1LHT A; 1IOP A; 4HSW A; 1YEV B; 4ZVB A; 2W31 A; 2ZS0 D; 1A0Z A; 3ASE A; 1XZV A; 1Y7D B; 3O7N A; 1DWS A; 1LH5 A; 2ZS0 C; 2ZSN A; 3M38 A; 4N7P B; 2EVP A; 3VRF B; 1MLR A; 1QXE A; 1A9W E; 1SPE A; 1HGA B; 2LH2 A; 1Z8U B; 1J52 A; 1HRM A; 1IT2 A; 4ROL A; 1BZ0 A; 1HGC B; 1QSI B; 3BJ3 A; 1BZP A; 2D5Z B; 3WCV C; 1O1N A; 2MYE A; 5CN9 A; 2D2N A; 1Y46 A; 1YIH A; 3WI8 A; 4B3W A; 1Y45 A; 1BVD A; 1S5Y B; 1Y2Z B; 3MJP A; 2VRY A; 4NXC A; 3UHX A; 1MYI A; 1U7R A; 1YHU D; 2JHO A; 3UHG A; 1J7Y B; 3S66 A; 2ZLT A; 5JDO F; 1OUT B; 2GRH A; 4MQJ A; 2W72 A; 5CHR A; 1VXC A; 1MLK A; 1BAB A; 1CG5 A; 2VYZ A; 3PI3 A; 2BNL A; 1LH2 A; 4F68 A; 1DXT A; 3LQD A; 1HGB A; 1FSX A; 3G53 A; 1SPG B; 1ABS A; 1NS9 A; 2ZSP A; 4YU3 A; 2R4W A; 2QMB B; 2AA1 B; 1NQP A; 4DC8 A; 3EU1 A; 1S5X B; 1YVQ A; 1XYE B; 3QQR A; 1Y4G B; 1GJN A; 3UHQ A; 3HYU B; 3UHW A; 2GTL C; 1DO7 A; 2O5T X; 1DO4 A; 1Y22 B; 2ZT4 A; 1OR4 A; 1A6M A; 1B86 A; 1NZ2 A; 1YE2 B; 3BOM B; 1CIO A; 1NGK A; 2MGD A; 1ABY A; 1EWA A; 3OJ1 A; 1C40 B; 1YFF B; 1V5H A; 3K3U A; 1HAC A; 1LA6 A; 1LFY A; 1MBD A; 1TES A; 1YE0 B; 1MNO A; 1NWN A; 3UI0 A; 2AV3 A; 3WTG A; 3D1K A; 2MB5 A; 4WJG A; 2ZSQ A; 2YRS B; 107M A; 1RTX A; 1CBM A; 1LH3 A; 2SPM A; 1HAB A; 3K8B A; 3MYN A; 4F6I A; 2EF2 A; 3CIU B; 1GDI A; 1GCV B; 1EMY A; 5E6E A; 1GVH A; 4MPM A; 1CLS B; 5SW7 A; 5E83 B; 1MWB A; 2O5L X; 2VM0 A; 1A4F B; 4YU4 B; 1MBO A; 1JEB B; 3R0G A; 1BZZ A; 1V4W B; 1Q1F A; 1J7S B; 2HBS B; 5E29 B; 2G0X A; 1MNK A; 1NIH A; 3V2Z A; 4HHB B; 1CO9 A; 106M A; 3DHR A; 5KER A; 1HBA A; 2V1H A; 3HRW A; 1DWR A; 1GZX B; 2ZLX A; 1R1Y A; 4O4Z A; 4AVD A; 3EOK B; 3FS4 A; 1AJH A; 2V1F A; 1RQ3 A; 1HDS B; 1Y4P A; 3UHT A; 2SPN A; 2SPO A; 1BIJ A; 2ZFO B; 4N7O B; 1XY0 A; 1QXE B; 1GBV A; 1Y8I B; 4PQC A; 3S1J A; 3D17 A; 1DXU B; 3OZU A; 1LFZ A; 1YZI B; 2W6X A; 4NI1 A; 4DWU A; 2ZLV A; 5HU6 A; 3MKB B; 1C7C A; 1JZK A; 1BZ1 A; 1O1N B; 2G0V A; 5HY8 B; 1O1M A; 1Y46 B; 1R1X A; 2VEB A; 2D2M B; 6HBW B; 1URV A; 1NZ5 A; 2XKG A; 2DN3 A; 2QU0 A; 1YIE A; 3OZW A; 3QMA A; 5D1V A; 4H07 A; 2BWH A; 3DHT A; 1YDZ A; 3QJD B; 2GL3 A; 1NS6 A; 3AT5 A; 1SHR A; 3S66 B; 4C0N A; 101M A; 1JDO A; 4MXL A; 2MGA A; 4ZVA A; 4ODC B; 1O1P A; 2QSS A; 4FC3 A; 1YVT B; 3A59 A; 1YMA A; 5JGG A; 4U8U A; 3GYS B; 1NS9 B; 4YU3 B; 2Z6N B; 3EDA A; 1SDL B; 1FHJ A; 1Y7G A; 3H57 A; 3FH9 B; 2D5X B; 5KKK A; 3R5I A; 3NG6 B; 1Y8W A; 1MLG A; 2MYD A; 2QSP B; 1ECA A; 3OGB A; 1XZ7 A; 4F6F A; 3ZH0 A; 1JP9 A; 2OIF A; 1B86 B; 1VXB A; 2ZLU A; 2QFN A; 3S48 C; 1TU9 A; 4IRO A; 4O35 A; 5EU2 A; 1V4X A; 2D60 A; 3NMM A; 1LA6 B; 1DUK A; 1LFY B; 1YEU A; 2ZSY A; 3WHM B; 1MBC A; 5MBN A; 1O1J A; 3W4U B; 4G51 A; 2NRM A; 1BZ6 A; 3WTG B; 3ED9 A; 4L7Y A; 1K0Y A; 5ILR A; 1JW8 A; 3D1K B; 1V4U A; 4F6G A; 1MTK A; 6HBI A; 5C6E B; 3ZOM A; 4F6B A; 1Y0A B; 4H2L A; 1A00 A; 1MOA A; 3HC9 A; 4KMV A; 3UHI A; 3TM9 A; 3MYM A; 1A3N B; 5AB8 A; 5SW7 B; 1FN3 A; 1ASH A; 2ZS1 A; 1Y5F B; 1DKE A; 2DXM A; 4ESA A; 3S1I A; 1THB A; 1I3D A; 1N9F A; 1DO3 A; 3GK9 A; 3WCU D; 1MGN A; 3G46 A; 1WLA A; 2LH3 A; 2FRK X; 1HV4 B; 5JOM A; 2RI4 B; 3CY5 A; 1O1K B; 1M9P B; 2ZT3 A; 3DHR B; 2QFK A; 5KER B; 3WCU C; 1O16 A; 1BBB A; 5EE4 D; 1HDA A; 2OHB A; 1Y0W A; 3FS4 B; 1BVC A; 3VRG B; 5B84 A; 3ODQ A; 1XZ2 B; 1Y4P B; 3WCW A; 1JF3 A; 1YGF B; 1YGD B; 4ROM B; 2Z8A A; 2GKN A; 3WFU A; 1XXT A; 4XS0 B; 2ZFO D; 1BIJ B; 5EE4 C; 3LHB A; 1XY0 B; 1DXV A; 3D17 B; 2ZLW A; 5CNE A; 1LFV A; 1LFZ B; 1HSY A; 1YEO A; 5CNG A; 4NI1 B; 3GKV A; 2HHB B; 2ZFO C; 1A01 A; 1Y31 A; 1DWT A; 4NXA A; 1LFL B; 2ZFB B; 5CNB A; 2D2M D; 108M A; 1Y5K A; 1GDJ A; 3TM3 A; 1Y4F A; 1VXA A; 1YIE B; 1F63 A; 5EOH A; 2V1G A; 3DHT B; 3AT5 B; 1Y35 A; 2D2M C; 1X9F A; 3UHR A; 4X0L B; 2LH1 A; 4L2M A; 3VHB A; 3PIA B; 1KR7 A; 3ZJQ A; 2ZSR A; 1T1N B; 4F4O A; 3LB2 A; 3QJE A; 4NI0 A; 3UHE A; 1L2K A; 5EUI B; 3RGK A; 3A0G A; 1ECN A; 1O1L A; 1CMY A; 1YMC A; 1QI8 A; 5HBI A; 1G08 A; 1SDK B; 2HHE B; 3D4X A; 1COH A; 1CPW A; 3BJ2 B; 3ONZ A; 5JGG B; 4U8U B; 3B75 A; 3HHB B; 3ZJJ A; 1FHJ B; 2HBC A; 2LH7 A; 3WCT B; 2HZ1 A; 2E2Y A; 3R5I B; 1MOH A; 2H35 B; 1Y8W B; 2IG3 A; 3IC0 B; 1YOI A; 3ZJP A; 2M6Z B; 1EBT A; 3S65 B; 1XZ7 B; 1O1O A; 1YEQ A; 3QJB A; 1MYZ A; 1XZ4 A; 4M4B A; 1IDR A; 2ZSS A; 4IRO B; 1Y7Z B; 5ILE A; 1FLP A; 1XQ5 A; 3AQ7 A; 1BIN A; 3PI9 A; 1V4X B; 4HRT B; 1RTE A; 3WCV D; 1Y8K B; 3OO4 A; 3UHC A; 1YEU B; 2ZT2 A; 3OK5 A; 2FRJ X; 1PBX B; 1Y5J B; 1J3Z A; 3UH3 A; 2AV0 A; 1OFJ A; 3PT8 A; 1IBE B; 1BZR A; 2HBD B; 1XZ5 B; 3D1A B; 1Y4B A; 1A00 B; 1A0U A; 3SZK B; 3SDN A; 1LFQ B; 4G1V A; 4PNJ A; 1MNH A; 2MGI A; 1RQA B; 1A9W A; 2G0S A; 1YCB A; 3MJU B; 5M3S A; 4ESA B; 4OOD A; 1THB B; 102M A; 1CQ2 A; 2G14 A; 5D5R A; 1MOB A; 3E55 A; 3GDJ B; 1S56 A; 1QPW B; 1Y4R A; 1CH2 A; 3E5O A; 2HBG A; 2PGH A; 2HCO A; 3HF4 A; 3PI8 B; 4SDH A; 4N8T A; 1Y0W B; 1VWT B; 1WMU B; 1A6N A; 3QJC A; 3P5Q A; 3QM5 A; 2GTL D; 1B0B A; 3ORD A; 1Y0T A; 1LFV B; 1XCH A; 1GLI A; 3UHN A; 1GBU A; 1CH7 A; 2G3H A; 1H97 A; 1MBS A; 1JY7 B; 3WCP A; 1HHO A; 1J41 B; 3OO5 A; 1QXD A; 1Y0C A; 1AJ9 B; 2MGL A; 1SI4 A; 3GQP B; 1A01 B; 1Y31 B; 3ZJR A; 3D7O A; 1MNI A; 1ECD A; 1NZ3 A; 2ZS0 A; 4WJG 1; 4KJT A; 1UFP A; 3G4U A; 3AT6 A; 1Y4Q B; 4MQI A; 1Y4F B; 2W6V A; 3A9M A; 1XZU A; 1GCW A; 1VHB A; 1J3Y B; 1YCA A; 5EYS A; 2XYK A; 1V07 A; 1F65 A; 3BJ1 A; 1Y7C A; 4O2G A; 1X9F B; 2R1H A; 2ZSZ A; 103M A; 3DUT A; 1G0B A; 2EB9 A; 5CN4 A; 1UIW A; 3LB3 A; 4NI0 B; 1VXF A; 1ABW A; 1HJT A; 1Y09 A; 1HDB A; 2R4Y A; 5MBA A; 3HEN A; 3D4X B; 1NEJ A; 3M39 A; 2RAO B; 1YOG A; 1Y7Z A; 1Y0D B; 3ONZ B; 2H8D B; 1Y85 A; 5EET A; 1CP0 A; 1MYM A; 3ECX A; 2HBC B; 1HBB B; 1IWH B; 3WCT D; 1G0A B; 1UC3 A; 1MLU A; 1CH3 A; 3QM8 A; 1G9V A; 110M A; 3GKT A; 1YHU A; 1A0Z B; 4HRR A; 1NPG A; 1O1O B; 1URY A; 1YEQ B; 3QM7 A; 3WCT C; 2WTH A; 1XZ4 B; 1Y83 A; 4MBN A; 3VRE A; 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1Y4V A; 2W6V B; 4MAX A; 3MOU A; 5EYJ A; 2MGC A; 3A5B A; 1Y7D A; 5HLX A; 1JP6 A; 2R1H B; 4TWV A; 3UHU A; 1HAB B; 4N7P A; 4NS2 A; 3K8B B; 4VHB A; 3PEL A; 3G52 A; 1DTI A; 2MBW A; 5CN7 A; 5CN8 A; 1ABW B; 5E6E B; 2MYA A; 1VXD A; 1UVY A; 1X9F C; 1Y09 B; 1MTI A; 1HGC A; 3NL7 A; 2D5Z A; 2ZST A; 1OFK A; 5KDQ A; 1BZZ B; 1GDK A; 3KMF C; 1MYH A; 1DXD A; 1S5Y A; 1Y2Z A; 3ZHW A; 3UH6 A; 1NIH B; 1YHU B; 2BLI A; 1HBA B; 2SPL A; 2EB8 A; 3HRW B; 1J7Y A; 2ZLX B; 1Y83 B; 3VRE B; 1R1Y B; 4H0B A; 1FSL A; 3ZJL A; 1C7B B; 1RQ3 B; 4MQG A; 2G0Z A; 3UGY A; 1A6G A; 1LH1 A; 3WFT A; 111M A; 1GBV B; 1X46 A; 1FAW B; 1K1K A; 1YMB A; 3LB1 A; 4TYX A; 2O5M X; 1DO1 A; 2ZLV B; 1YEN B; 5HU6 B; 2QRW A; 2GLN A; 1DLW A; 1C7C B; 2EVK A; 2QMB A; 1BZ1 B; 2AA1 A; 3M3A A; 2D2N D; 3AG0 A; 1O1M B; 2AUO A; 1S5X A; 1R1X B; 1KD2 B; 1XYE A; 1J7W A; 2QLS B; 2BMM A; 4DC7 A; 3HXN A; 2DN3 B; 2QU0 B; 1Y22 A; 2D2N C; 2ZWJ A; 3AQ5 A; 1YE2 A; 3BOM A; 1YDZ B; 2PEG B; 1ITH A; 1NS6 B; 2EKU A; 1SHR B; 1C40 A; 1YFF A; 1SWM A; 4TWU A; 1CH1 A; 3GQG A; 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