1O23A

Crystal structure of lactose synthase in the presence of udp-glucose
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Alpha-Lactalbumin (La) Stimulates Milk Beta-1,4-Galactosyltransferase I (Beta 4Gal-T1) to Transfer Glucose from Udp-Glucose to N-Acetylglucosamine. Crystal Structure of Beta 4Gal-T1 X La Complex with Udp-Glc.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
molecule tags Transferase activator/transferase
source organism Mus musculus
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1o23A00
1BWJA 1LSEA 4TX7A 3AZ5A 4G4HA 4J0LA 1HEWA 1JIYA 5KY1A 1B7SA 3WULA 3SP3A 1JHLA 1OQMA 3J4GA 1XGRC 2G4QA 5KXKA 5L9JA 5LAGA 1WQPA 1LHIA 1YKZX 4OOTA 1QUSA 3LYZA 4M6DA 1JJ3A 3HBHA 3EXDA 4N1CC 4NG8A 4DDBA 5B06A 4TUNA 4YENA 1GF7A 3LYMA 3D3DA 1XFPL 1B2KA 1AT5A 3AW7A 4II8A 1B9OA 2HUBA 4WLXA 1LZNA 3WL2A 4ZIXA 4NGIA 2CWIA 4YM8A 1SQ2L 3ZEKA 9LYZA 1DI5A 1LSPA 1JJ1A 3G3AB 1REYA 4NWEA 1LHJA 3RNXA 1IWWA 5M1YA 1LMCA 3GXKA 4WG7A 1WTNA 4NSJA 5F9UA 4CFPA 2BQEA 2YDGA 3A90A 4TSBA 1IC7Y 4E3UA 1LSCA 1LZYA 5ILFA 3W6EA 4DDCA 1FKQA 4DC4A 5LVIA 135LA 5KXWA 1B7LA 5J7CA 1I1ZA 5KXXA 4DD1A 1IEEA 1GB3A 1LMAA 2LYOA 2ZYPA 4LYCA 3WH1A 194LA 1Z55A 4BS7A 4FJRA 5C6LA 1WQMA 1T3PA 1NMMA 3MGWA 3TMVA 4BAFA 4WM5A 1BQLY 3HBEX 4BADA 3AGHA 4B0DA 1UIHA 5FELA 3N9EA 4RW1A 1OUJA 3IJUA 3IWRA 1UACY 4QY9A 1TAYA 4H90A 1GFTA 2BQDA 4NHIA 3TXHA 5KXRA 5ILCA 4H9HA 3AGGG 2BQAA 1CKGA 4HJVA 2B5ZA 1BB5A 5LYZA 2NWDX 1GHLA 1GB8A 2YBNA 1YAQA 5B1GA 1GPQC 1JWRA 2HEEA 2XBRA 4CJ2A 4LGKA 4NHPA 1GB9A 3B6LA 3ATOA 1CJ7A 2BQJA 1QSAA 4RW2A 5EBHA 1GBYA 1LMOA 4TWSA 1FLQA 5K7OA 1UBZA 5E9RA 1IP2A 4C3WA 3RT5X 3CB7A 4J1AA 1GBSA 2BQKA 1RJCB 4GCCA 2I6ZA 2DQGY 2Y8PA 5KXZA 5KXMA 3AYQA 1IO5A 1IWZA 1HENA 4X3BA 5C6JA 4GCBA 1NHEA 1BB3A 3P4ZA 4G4CA 2MEAA 4AXTA 4NGLA 4NGZA 1LJFA 4H9IA 5JENB 1D0KA 1GFEA 1NBYC 1FN5A 4N1EI 1BB6A 4HPEA 3ZVQA 2MEIA 4WM3A 3QE8A 1GXV2 4LT0A 5C6IA 4ZFPA 4PJ2C 1LJNA 3TXKA 1REXA 3RW8A 2ZIJA 2FYCA 4PGJB 4UWNA 1CKFA 1J1XY 3A3QA 4XJBA 1DXJA 2BQIA 4ETAA 2BAAA 2I26L 4KPMA 1QTEA 1W6ZA 4HP0A 1GBOA 1KIQC 4WLDA 3BKVA 1HERA 1GEVA 4NGJA 1NWGA 1XEJA 3M18B 4MSTA 1LYOA 5KXLA 1CJ9A 4NWHA 1HMKA 3AGIA 1IC5Y 1RI8B 1JPOA 134LA 3CT5A 1LMQA 1LKRA 4XJFA 3LYOA 1UIGA 1ZVHL 193LA 4N0JA 1LKSA 1UIFA 1IR7A 4D9ZA 1HFZA 1GE4A 1JTPL 1GB0A 1GE0A 1UIAA 1GDXA 1KXYA 1JJ0A 1JUGA 2H9JA 3QNGA 1WQRA 1NKHA 4NSHA 1V7TA 1LZSA 1C08C 2DQCY 2BQOA 5B07A 1HFXA 1D0MA 1GBXA 1KXXA 4PHIA 4ETDA 2D4KA 4L41A 4I8SA 4R0FA 3B0IA 3WW5A 1AKIA 2ZIKA 4DD9A 1YIKA 5KKIA 5KXYA 1F10A 2W1XA 1D6PA 3T6UA 1BWIA 4H9CA 4WM1A 2FYDA 1LZ1A 1PZYA 1YAOA 1LYYA 2LZ2A 4XJGA 3A91A 1JKCA 3FE0A 4B4IA 4OWBA 5DM9A 1GXXA 1F6SA 4H9FA 2LZTA 2HECA 3WUMA 2ZNWY 1GFKA 1LPIA 1GWDA 1UIBA 4B4EA 7LYZA 2FBBA 3TXEA 4XJIA 1XEIA 1B5VA 2YVBA 1YKYX 5LYTA 1IR9A 1GF4A 2CGIA 2BQNA 4NGYA 5A3ZA 1LHKA 4NGVA 132LA 5AMYA 1YKXX 4U3XB 1H87A 4XJDA 4YOPA 1YILA 1B7MA 1NDGC 3VWOA 1HF4A 1OUFA 4G4BA 1F0WA 1OUHA 2MEDA 1GFHA 4KT3A 4MCKA 1ALCA 1LJ4A 4LT3A 4GCDA 1J1PY 1DPWA 3W6DA 5KXTA 4G9SA 1JKDA 5KXOA 1B7PA 1LZEA 4NHSA 4WOAA 1OP9B 1BGIA 3TMUA 1LMNA 2Z12A 4YF2A 4H93A 4H8ZA 4CFOA 5LA5A 2H9KA 5LYMA 4LYTA 1UIDA 2DQJY 5F81A 1TBYA 3WPJA 2G4NA 4EOFA 1JKAA 1RE2A 2BQHA 1REZA 2LYMA 1BB7A 1HEMA 5HLLA 2PC2A 4DWXA 4HTQA 3A6CY 1LMTA 5B05A 5KJ9A 1RFPA 2DKVA 208LA 1IIZA 1IY4A 4OWEA 4J7VA 1CKCA 1NQIA 5LIOA 4B49A 3WW6A 2BPUA 4HV2A 4H92A 3WU8A 4H94A 4Z98A 1ZMYL 1UICA 5LAFA 3D9AC 5FDJA 2BQGA 3CSQA 4WM6A 1C45A 1HNLA 3CQLA 2W1YA 1GAZA 1LZCA 1LYSA 1IOTA 1CJ8A 1DKJA 2MEHA 1FLWA 2ZILA 4HTKA 4UWVA 1B7RA 1LCNA 4DD2A 2BLYA 1LZ9A 1LZ8A 207LA 3M3UA 5FHWA 1GF6A 3OK0A 5FSTA 1IOQA 1JEFA 1LYZA 4NSIA 5FEKA 5T3FA 1LZBA 3OJPA 1IWYA 1LZAA 2Q0MX 2Z37A 1B7NA 4ET9A 4NHQA 3K3TA 5L3HA 4DD3A 1SLYA 1GF8A 4H9EA 1BB4A 5APFA 1REMA 1B5YA 1J1OY 2DQAA 4ZEEA 5HMVA 1DPXA 4CHXA 1VDTA 1GBWA 2LYZA 4XJHA 3TXIA 3P68A 4ETEA 2Z18A 3AW6A 3WYHA 4ETCA 4QEQA 5LVHA 1GE3A 3WUAA 1GFJA 4TTDA 5KXPA 3B0OA 1AZFA 3WU9A 2DQHY 5D5FA 4XN6A 3LN2A 2ZQ3A 133LA 2A7DA 1DZBX 4HV1A 3WMKA 1EQEA 1IVMA 4ANRA 1VDPA 1GEZA 1LSDA 1WTMA 2YBJA 4GCEA 4H1PA 3P66A 2W1MA 1IORA 2N5ZA 4OWAA 2HEBA 1GE1A 1WQOA 3B72A 4NG1A 1B5XA 1NBZC 3LHMA 3ULRA 4BAPA 4ET8A 3CSZA 3W6BA 5APDA 2BQBA 2EIZC 2ZWBA 1LZRA 3A6BY 3ATNA 1ZVYB 2BQLA 2DQDY 4NIJA 4H9AA 3W6CA 1LOZA 1LSNA 3WU7A 3TXGA 1OUAA 1W08A 1XGUC 1OUCA 2Z19A 2DQFC 4LFPA 4OOOA 4DD0A 1C43A 2BQMA 2ZYCA 2F2NA 2IFFY 3IJVA 2BQFA 4WO6A 1XSFA 3A3RX 1B0DA 3A93A 5DLAA 1IP4A 1UIEA 5APCA 1QIOA 5E4PA 5B1FA 3TMWA 2VB1A 3TXDA 5F16A 1P2CC 1LSBA 1GF3A 4O34A 1FLYA 5F14A 1TEWA 3LZ2A 4GCFA 4IASA 4TSCA 2MEBA 1LSZA 3A8ZA 4NEBA 1HSXA 4NSGA 2XTHA 1GF9A 3P64A 3F6ZA 2A7FA 1LJHA 1YANA 2Z2FA 2YSSC 4HJYA 1GFVA 5APEA 5I53A 1GDWA 4GN4A 1CNSA 3RZ4A 3N9AA 4W94A 2EQLA 1VATA 4QDNA 1IP3A 4HTNA 1OUIA 5DL9A 1IWTA 4XADA 3TMXA 1DI3A 4DYGA 5A3EA 2FBDA 3HFMY 1DQJC 1F6RA 1WQQA 2ZNXY 2I25L 1GFAA 4GLVA 1DI4A 1D9UA 4LFXA 1EQ4A 4I0CA 1HHLA 4J1BA 4P2EA 4B1AA 5LVJA 1YL0X 4WL7A 4C5FA 2MEGA 1IP7A 2YBMA 4NGOA 5HNLA 1B5WA 1JISA 2YBLA 4OW1A 2F30A 1XGTC 2DBTA 2X0AA 5B59A 1G7LC 8LYZA 1AM7A 1VDSA 3A34A 4QGZA 3W3EA 2WARA 1VDQA 4FDYA 1GFUA 3WPLA 4IJ4A 4YEOA 2D4JA 3A94A 5LXWA 3KAMA 1ZV5L 1UCOA 1LZGA 4HSFA 5IELA 2Z2EA 1I56A 3TXBA 1C46A 1YQVY 5IDDA 1HEQA 1D0LA 4CGEA 1IX0A 1YROA 3GXRA 3A92A 4LYZA 4NFVA 3WPKA 1GF0A 154LA 1QDTA 1HC0A 4NGWA 1LJKA 2IHLA 1LAAA 1YAMA 1G7IC 2D91A 4IATA 4LT2A 4RLNA 1GD6A 4WM2A 1LHLA 1IWXA 1LSYA 5LA8A 4DDAA 3RU5A 4LYMA 1E8LA 1VAUA 3HBDA 4N9RA 1XGQC 1C7PA 1JITA 1EQ5A 4R6CA 1LZ6A 1IWVA 1UUZC 2C8OA 3P65A 1A2YC 4H8YA 1TCYA 1TDYA 2XJWA 2EPEA 1LMPA 1G7HC 1UC0A 1YL1X 1FBIX 2GV0A 5HNCA 3AZ4A 5I4XA 1B5UA 1CKHA 1LHHA 1CKDA 1GB6A 1G7MC 1KIRC 4WMGA 4RDSA 2YBIA 2MECA 1HEPA 4B4JA 5LVKA 3WXUA 2LHMA 6LYZA 1JSFA 3WUNA 1I20A 3LZTA 4HJZA 5DN5A 5KKJA 5D5CA 1LJJA 1HMLA 2HU3A 5I54A 2H5ZA 3BKHA 1PS5A 1FLUA 3N9CA 5FCPA 1LZ4A 1QQYA 1WVVA 5HMJA 3J6KA 1GBZA 2AUBA 1QSWA 1NF5A 3WVXA 1IP5A 1QUTA 2CDSA 1EL1A 3E3DA 4LZTA 2D6BA 4OWHA 1V7SA 3A95A 1NDMC 3B0KA 3CT0A 5L3IA 1D6QA 1RCMA 4GN5C 5LVGA 1O23A 2RSCA 2C8PA 1OUDA 4PRUA 1IY3A 4Z3MA 5I4YA 1BWHA 1LJ3A 3LYTA 5DN4A 3WXTA 1H6MA 1CJ6A 3CSRA 4Z46A 1OUBA 1INUA 5HQ1A 1LSMA 1JSEA 1QDRA 1T6VL 1XGPC 1QTKA 4NY5A 4WO9A 5F9XA 3T36A 2F4GA 3EO5A 1LSGA 1WVUA 1BVKC 1XEKA 1N4FA 2XBSA 4N5RA 1B7QA 4XYYA 2ZQ4A 1G7JC 4LYBA 1IOSA 4NGKA 5LINA 4M4OA 2W1LA 6LYTA 1LSFA 4WM4A 3AJNA 4PRQA 1UA6Y 1LSAA 4LYOA 4XENA 1IR8A 4A7DA 5II3A 1B7OA 3TXJA 1FKVA 2Z38A 1AT6A 3A67Y 2HTXA 1HELA 1C10A 2G4PA 1YAPA 1HEOA 5IHGA 2EKSC 4WLYA 1KIPC 4G49A 2DQEY 2HEDA 1IC4Y 4MR1A 3G3BB 1LJIA 1JTOL 1A4VA 4ML7A 1MELL 1DKKA 1BHZA 3W6FA 4WL6A 3AZ7A 4YEMA 1OUEA 2BQCA 4DT3A 1JKBA 2DQIY 4OWCA 4GN3A 1GB5A 2HU1A 4H91A 4W96A 1HFYA 4Z41A 4UWUA 1VEDA 4NHTA 4AGAA 3FI7A 1IP1A 1GF5A 1OUGA 3EMSA 1GE2A 2F4AA 1GB7A 1GB2A 2CJLA 4LT1A 4RLMA 2YBHA 1LJGA 3QY4A 1IP6A 5KXNA 1JTTL 3ZVQB 1HSWA 153LA 4KL7A 1GFRA 3TXFA 1LZTA 4GLAA 1MLCE 2HEAA 4DD7A 5I5QA 1LTMA 1WQNA 1VFBC 2HEFA 1GAYA 1LHMA 3WVYA 3AZ6A 2MEEA 4N8ZA 2D4IA 1LZDA 4WLTA 5I4WA 3EBAB 4H9BA 4H8XA 1GFGA 4KXIA 4PPOA 3CT1A 4WG1A 1B5ZA 1IOCA 1KXWA 2MEFA 1BVXA 2BLXA 1LJEA 1LZ5A 4HPIA 5KXSA 3W6AA 4ETBA 3A96A 1FDLY 2Z39A 3AB6A 1IWUA 4EMNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OVJA 3CDTA 3AZ5A 4J0LA 2G4QA 5LAGA 1QUSA 3LYZA 3C7WA 4N1CC 123LA 1T8AA 2Q9DA 224LA 1XFPL 1B2KA 115LA 4II8A 1B9OA 2HUBA 2OU9A 1WTHA 3L2XA 3WL2A 2B6ZA 3C83A 4YM8A 3ZEKA 1JJ1A 1L70A 1LHJA 3RNXA 4W54A 1C61A 2BQEA 2YDGA 3A90A 260LA 1CV6A 3HU9A 211LA 5LVIA 140LA 135LA 1QTZA 210LA 2B6TA 1QTCA 4FJRA 1T3PA 4WM5A 206LA 1L26A 3N9EA 3IJUA 3IWRA 1TAYA 4H90A 2BQDA 5KXRA 1CKGA 1BB5A 1GHLA 1L36A 1GB8A 1JWRA 2HEEA 4NHPA 1CJ7A 3NY8A 1QSAA 5E9RA 1IP2A 5KXMA 3AYQA 1IWZA 1HENA 1L34A 4H9IA 131LA 1FN5A 3CDVA 3ZVQA 4LZMA 4WM3A 1C6LA 4PJ2C 3A3QA 2BAAA 2I26L 1W6ZA 3BKVA 1HERA 1L33A 4NGJA 1L64A 4MSTA 1IC5Y 134LA 3CT5A 4XJFA 1LKRA 193LA 1LKSA 1UIFA 1IR7A 4D9ZA 1L35A 1HFZA 3GUJA 1UIAA 126LA 1GDXA 1JJ0A 2B6XA 1WQRA 4NSHA 1V7TA 1LZSA 1NHBA 1GBXA 1KXXA 174LA 4E97A 1AKIA 2ZIKA 4DD9A 1YIKA 1F10A 3T6UA 142LA 2FYDA 4XJGA 1YAOA 1LYYA 4B4IA 5DM9A 3HH3A 1F6SA 4H9FA 2LZTA 2HECA 3WUMA 1LPIA 1GWDA 4XJIA 1ZYTA 1XEIA 5A3ZA 3V2YA 1OWYA 4PK0A 1H87A 1C6PA 2MEDA 1LLHA 2RB2X 4LT3A 2Q9EA 1B7PA 1OP9B 1L01A 5LYMA 1OV5A 3GUKA 3WPJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BWJ A;  1LSE A;  4TX7 A;  3AZ5 A;  4G4H A;  4J0L A;  1HEW A;  1JIY A;  5KY1 A;  1B7S A;  3WUL A;  3SP3 A;  1JHL A;  1OQM A;  3J4G A;  1XGR C;  2G4Q A;  5KXK A;  5L9J A;  5LAG A;  1WQP A;  1LHI A;  1YKZ X;  4OOT A;  1QUS A;  3LYZ A;  4M6D A;  1JJ3 A;  3HBH A;  3EXD A;  4N1C C;  4NG8 A;  4DDB A;  5B06 A;  4TUN A;  4YEN A;  1GF7 A;  3LYM A;  3D3D A;  1XFP L;  1B2K A;  1AT5 A;  3AW7 A;  4II8 A;  1B9O A;  2HUB A;  4WLX A;  1LZN A;  3WL2 A;  4ZIX A;  4NGI A;  2CWI A;  4YM8 A;  1SQ2 L;  3ZEK A;  9LYZ A;  1DI5 A;  1LSP A;  1JJ1 A;  3G3A B;  1REY A;  4NWE A;  1LHJ A;  3RNX A;  1IWW A;  5M1Y A;  1LMC A;  3GXK A;  4WG7 A;  1WTN A;  4NSJ A;  5F9U A;  4CFP A;  2BQE A;  2YDG A;  3A90 A;  4TSB A;  1IC7 Y;  4E3U A;  1LSC A;  1LZY A;  5ILF A;  3W6E A;  4DDC A;  1FKQ A;  4DC4 A;  5LVI A;  135L A;  5KXW A;  1B7L A;  5J7C A;  1I1Z A;  5KXX A;  4DD1 A;  1IEE A;  1GB3 A;  1LMA A;  2LYO A;  2ZYP A;  4LYC A;  3WH1 A;  194L A;  1Z55 A;  4BS7 A;  4FJR A;  5C6L A;  1WQM A;  1T3P A;  1NMM A;  3MGW A;  3TMV A;  4BAF A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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