1O23A

Crystal structure of lactose synthase in the presence of udp-glucose
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase activator/transferase
molecule keywords ALPHA-LACTALBUMIN
publication title Alpha-Lactalbumin (La) Stimulates Milk Beta-1,4-Galactosyltransferase I (Beta 4Gal-T1) to Transfer Glucose from Udp-Glucose to N-Acetylglucosamine. Crystal Structure of Beta 4Gal-T1 X La Complex with Udp-Glc.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 38
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-01-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1o23A00
4LT2A 2DKVA 1BGIA 4H9FA 1OUBA 1LJIA 194LA 3BKHA 1LMOA 1RJCB 2AUBA 4J0LA 1GBXA 4XENA 3A3RX 1IVMA 1W08A 133LA 1MELL 4WM1A 1JTOL 4OWAA 4AXTA 2VB1A 1GFAA 1LZDA 3WU7A 1WQQA 4B4EA 4HSFA 1FLQA 4H8XA 3CB7A 4DD1A 2HEDA 3WPLA 1NDGC 3WVYA 4NGKA 1LMQA 1IWWA 1BB3A 2HECA 2FYDA 2HEFA 1INUA 1WTMA 2BQDA 2Z2FA 4TWSA 3P65A 1B5VA 4NHIA 2BAAA 3SP3A 4UWUA 1UIDA 3A92A 2D4JA 3WU9A 4B4JA 5KXLA 1HSWA 2HEBA 5HQ1A 5AMYA 5DM9A 4WM2A 4UWVA 1DI3A 3WVXA 4OWEA 2BQOA 1D6PA 3AYQA 1GB2A 3LZTA 5B07A 1B5UA 2Z19A 4HV1A 4WL6A 1LYOA 3LYOA 5I4YA 1C10A 1GFGA 4FJRA 1C45A 4NSHA 1LZBA 1LSYA 4B49A 1UIBA 4GCEA 1LZ9A 1GF9A 1YL0X 3LZ2A 2EIZC 4CFPA 1ALCA 1D0KA 1REMA 134LA 1AKIA 3A95A 3AJNA 1QSAA 3EBAB 4ETBA 1TEWA 5HMJA 4NGIA 1CJ6A 4DD0A 1XEJA 1HFYA 3WYHA 4LGKA 3WW6A 2DQCY 3CT0A 5KXZA 3HBEX 1GF6A 1XGTC 2BQNA 1HEMA 1A4VA 3F6ZA 4LYMA 1G7JC 3ZVQA 5B59A 3ATOA 4ETEA 5F9XA 1QTEA 4O34A 3AW6A 4DD3A 3WUMA 4N1CC 4GN5C 1JSEA 1LSPA 1GWDA 2BQGA 4R0FA 1GB5A 1LKRA 3N9AA 5KXRA 2MECA 1IC4Y 4C3WA 4ML7A 2BQFA 2C8OA 3A6CY 3LYZA 4A7DA 4DDCA 2I26L 4NGOA 2ZYCA 4H9CA 1F0WA 5F81A 1BWIA 1GE1A 1C7PA 4XADA 1DPWA 1KIPC 1UIFA 2XTHA 4HTNA 1IP3A 2IHLA 4PRQA 5LVIA 2EKSC 2G4NA 1IIZA 3A8ZA 1DXJA 1GF0A 2LYZA 3RT5X 4GLVA 1JUGA 3A93A 1LYSA 1O23A 5KY1A 4ZEEA 3AGIA 1AT6A 1JJ0A 4NWEA 3B0KA 3FE0A 3M3UA 4YM8A 1ZVYB 4NHTA 4I0CA 3CQLA 1IY4A 4NSJA 4DYGA 4LFPA 208LA 1B7MA 3EXDA 3P64A 4LFXA 5C6IA 1UICA 1PZYA 1PS5A 2BLXA 4LT1A 4NG8A 5LINA 153LA 1IORA 4NEBA 3WL2A 5LYMA 5FELA 4CHXA 1AZFA 4HV2A 1BHZA 4KT3A 1V7TA 4G4HA 4GCBA 1QDTA 1HMLA 1LZCA 2BQMA 3J4GA 193LA 1VFBC 1LJEA 4EMNA 1FN5A 1UIGA 1UIAA 1WQPA 4UWNA 1B7PA 2LHMA 2ZYPA 1T3PA 4L41A 2DQDY 4GCCA 3TXFA 3W3EA 2LZTA 1BB6A 4P2EA 5DLAA 4NG1A 1IWUA 5DN4A 1AM7A 1LHJA 4TUNA 1BB4A 4ET8A 5A3EA 2FBBA 3P4ZA 4WMGA 4XJBA 1GF8A 1RFPA 1VEDA 5II3A 2ZWBA 3HFMY 5J7CA 5L9JA 1GB6A 1NWGA 4GN4A 4WM4A 1IP1A 4DD9A 5KJ9A 2XBRA 4G4CA 4Z98A 1XEIA 4X3BA 1IWXA 4GLAA 3RW8A 1YILA 8LYZA 3HBHA 1HNLA 3TMVA 1B5ZA 1XGQC 1N4FA 4WM5A 3TMWA 4TX7A 3EO5A 1CNSA 1YKXX 4H90A 1SQ2L 4BS7A 4CJ2A 3A94A 5KXWA 2DQJY 4N1EI 1LJ3A 4XJIA 2BQAA 1HELA 3CSZA 1C08C 3CSQA 1ZVHL 1Z55A 6LYTA 1FKQA 5B06A 1XFPL 5LYZA 1GF5A 1QDRA 2CJLA 3TMXA 1FKVA 4GCDA 3WUAA 1GB9A 1GB7A 1OUDA 1NHEA 3TXBA 3P66A 1HENA 4FDYA 4H91A 4Z41A 1TBYA 2MEFA 1GF7A 1LOZA 1B5YA 1DKKA 1YKYX 1BVXA 3RZ4A 1LSZA 1VDSA 1GHLA 1IX0A 2LYMA 3N9EA 4KPMA 4YOPA 4YENA 3W6CA 2DQIY 4H9BA 1GDXA 1JKBA 1GXV2 4WLYA 1HERA 2W1MA 2IFFY 2ZNWY 1I1ZA 4G49A 3A34A 1LZ4A 1GB0A 1HF4A 3LN2A 4DDAA 1LMAA 3WXTA 1GFEA 1A2YC 1GEVA 1QTKA 2DQAA 5B1GA 1B5WA 2HU3A 2WARA 3TXEA 2F4AA 3CT1A 2B5ZA 1TDYA 1W6ZA 2EQLA 4WM6A 3W6FA 3W6BA 5L3HA 4Z46A 1WQRA 4N9RA 4OWCA 4XJDA 2BQHA 3WPJA 1G7IC 2YSSC 1TAYA 1GE2A 1LZ6A 1MLCE 4WOAA 4ETAA 5L3IA 1HC0A 4H9IA 1IEEA 1GFJA 5E9RA 2I6ZA 3HBDA 3WPKA 4NSIA 1GAZA 5APDA 4BAPA 1E8LA 4DT3A 4LZTA 3CSRA 1LSGA 1YKZX 1YAOA 1BWJA 4CGEA 1LJFA 2XBSA 1BB5A 4LYTA 4J1BA 3TXJA 1UACY 1CKFA 1NBZC 2YDGA 1DPXA 1G7LC 4NGWA 3LYMA 4WG7A 2X0AA 3AB6A 4LT3A 1HMKA 1CJ8A 3AZ7A 1VDQA 2YBHA 5F9UA 2LYOA 1J1OY 1JEFA 1OUCA 1LHLA 4WM3A 5KXXA 1ZMYL 2HEEA 4E3UA 3B6LA 1LJ4A 4ET9A 3A6BY 1NQIA 5LAGA 5KKJA 1WQMA 1HEOA 1VATA 4I8SA 4YF2A 1LAAA 5HNLA 2DQFC 1T6VL 3FI7A 3K3TA 5HLLA 1KXWA 1IP7A 1GFRA 1LSEA 4RW2A 1QQYA 1B7QA 4DC4A 3A3QA 3T6UA 3WULA 1B2KA 3W6DA 2BQLA 3B72A 1YANA 2HUBA 3QY4A 4Z3MA 4ETCA 1IP2A 1H87A 1GF4A 2PC2A 4NSGA 1NMMA 1F6RA 2MEBA 4TTDA 2DQGY 3RU5A 4IATA 1JTPL 3W6AA 2D4IA 2W1LA 1IWTA 1GPQC 1GDWA 1BVKC 1KIRC 3QE8A 4QGZA 5FEKA 3AW7A 2MEIA 4QY9A 5M1YA 2ZILA 1FLUA 4H1PA 3WW5A 4B0DA 3EMSA 1YROA 4NGYA 1B7NA 5APCA 4TSCA 1WQOA 4N0JA 4NGLA 1P2CC 1UA6Y 2LZ2A 1LJGA 2A7FA 4OWHA 2Q0MX 1IOTA 3T36A 4AGAA 1XGUC 1CJ7A 1DI5A 1XEKA 4J7VA 3TXHA 1LSNA 2N5ZA 1EQEA 1LSCA 1J1PY 3WXUA 3A90A 1GE4A 3J6KA 1QIOA 1D0MA 3KAMA 2H9KA 4HJYA 1QSWA 1B7OA 1UC0A 1UCOA 1V7SA 1ZV5L 2FYCA 1OUHA 1LZSA 1XGPC 1GB3A 1JKDA 4LT0A 3OJPA 3TXGA 3P68A 2FBDA 1UBZA 1LJJA 2Z2EA 1OQMA 4ANRA 132LA 4QEQA 1FBIX 4WL7A 5B1FA 3G3AB 1JHLA 2Z18A 4MSTA 1D0LA 4HTQA 1RCMA 2BPUA 1UUZC 5LVHA 4OOOA 6LYZA 1NBYC 5LXWA 1REYA 3B0OA 1VDTA 1HEPA 5DL9A 1KIQC 1LHIA 1JJ1A 4H8ZA 4XJHA 5A3ZA 5KXNA 1LJKA 2HU1A 3W6EA 2H5ZA 1LMPA 4OW1A 5LVJA 1LZNA 2Z37A 1IR7A 4H9HA 1YAMA 1JITA 5LVGA 4WO9A 1HFXA 4MCKA 1GXXA 1VAUA 4NHPA 1GFUA 4WLTA 3WUNA 2CDSA 2D6BA 3ULRA 2YBLA 4KXIA 5FCPA 1FLYA 4YEMA 1GFKA 1IWVA 1LZAA 1OUJA 2ZNXY 5FDJA 5T3FA 1CJ9A 1LMNA 2XJWA 2H9JA 1DZBX 1GFHA 1JSFA 1LSDA 4PPOA 1LZ5A 1F6SA 2ZQ3A 1GB8A 1NF5A 3MGWA 1IP5A 1LHHA 2ZQ4A 5APFA 5KXPA 3AZ4A 154LA 4IJ4A 5DN5A 3AZ6A 2HEAA 2BQKA 4LYOA 5F14A 4XJFA 2A7DA 4NGVA 2HTXA 2W1YA 4CFOA 1YIKA 4HPIA 2BQJA 4H9AA 5I5QA 5I4XA 4N8ZA 2F2NA 2MEGA 1OUEA 5FSTA 1LMCA 1IWYA 5KXYA 1IWZA 3VWOA 1JKAA 1D9UA 3TXDA 1CKCA 1I56A 4HJZA 1GFVA 2CWIA 1LTMA 4RLMA 4HJVA 1IOQA 4OOTA 2YBNA 3AZ5A 3WU8A 1GF3A 2DBTA 2MEEA 1RE2A 4RW1A 2D91A 1QUTA 5I4WA 3IJVA 1YQVY 1IOCA 4QDNA 1OUIA 1IY3A 1HEWA 1LHKA 1OUGA 2EPEA 3OK0A 5APEA 5IDDA 5LIOA 3ZEKA 4D9ZA 3N9CA 3ZVQB 2Y8PA 1LCNA 1C43A 1FDLY 2YBMA 1HFZA 3AGHA 3TMUA 4R6CA 2BQEA 4PRUA 4C5FA 1BB7A 1LSMA 3AGGG 5ILCA 1LSBA 4B1AA 1JKCA 2Z38A 4LYZA 5KXSA 1GBOA 1GAYA 4XJGA 5I53A 1I20A 3TXIA 1B7SA 4NWHA 3E3DA 1JTTL 1OUFA 4HTKA 1LMTA 2ZIJA 1WVVA 1LZGA 4NGJA 1LYYA 1GD6A 3TXKA 3LYTA 5LAFA 1LHMA 2CGIA 1LKSA 2W1XA 3IWRA 4H94A 4LYBA 1EQ4A 1JISA 1JJ3A 2I25L 5K7OA 5HNCA 1GBZA 1GBSA 5IELA 3GXKA 5E4PA 4ZFPA 1G7HC 1JPOA 3WMKA 2Z39A 1LZ8A 4NIJA 1IR9A 5ILFA 2DQHY 3GXRA 2YBJA 2C8PA 1XSFA 4W96A 4G4BA 2MEAA 4N5RA 1GBWA 1WQNA 4NGZA 1RI8B 5I54A 1OP9B 1HEQA 4J1AA 1WTNA 1DKJA 3D9AC 3B0IA 5LVKA 1LZRA 3A91A 2F30A 2ZIKA 4B4IA 1HSXA 1VDPA 4U3XB 3G3BB 1NKHA 5D5FA 4H8YA 3LHMA 1IOSA 1GEZA 1LJHA 4ZIXA 1LZEA 2DQEY 5KXTA 4H92A 1FLWA 4M6DA 1OUAA 5LA5A 9LYZA 1EL1A 2RSCA 4WLDA 5B05A 2BQBA 2BQCA 1IP4A 4XN6A 1DI4A 4DWXA 1REZA 2F4GA 1H6MA 1HHLA 4PHIA 1J1XY 1B7LA 1B7RA 1AT5A 2BLYA 3ATNA 2MEDA 1NDMC 1UIEA 3D3DA 4DD7A 1BWHA 1KXXA 1LZTA 4W94A 1CKDA 1F10A 3IJUA 1YAQA 4H93A 5KKIA 1IR8A 1LZ1A 1C46A 1SLYA 5JENB 1B5XA 1UIHA 4WO6A 5LA8A 1DQJC 1CKHA 4GN3A 3QNGA 1LPIA 4HPEA 1G7MC 2G4QA 3RNXA 5IHGA 1XGRC 4WLXA 5KXMA 4II8A 4GCFA 2MEHA 5C6JA 4EOFA 4NHQA 4NY5A 5F16A 7LYZA 1LZYA 1LJNA 1B0DA 4NHSA 1QUSA 1LSFA 1LYZA 4KL7A 4MR1A 5EBHA 2NWDX 3M18B 5C6LA 1JIYA 4ETDA 1WVUA 135LA 1JWRA 1TCYA 1YL1X 4IASA 2Z12A 4YEOA 4NFVA 4OWBA 5LYTA 4LYCA 1LSAA 1GBYA 1BQLY 1REXA 4HP0A 4XYYA 2YVBA 5FHWA 4DD2A 4TSBA 1EQ5A 207LA 3A96A 4H9EA 3A67Y 5D5CA 2GV0A 1IC7Y 4G9SA 2D4KA 2BQIA 4WG1A 4DDBA 1IP6A 1KXYA 3BKVA 3CT5A 4BAFA 4PGJB 4BADA 1IO5A 1B9OA 1YAPA 1D6QA 2G4PA 5KXKA 5HMVA 4M4OA 1CKGA 1GE0A 3WH1A 1GE3A 4PJ2C 5KXOA 1GFTA 1IC5Y 4RLNA 2YBIA 4RDSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2DKVA 1G0MA 1G0QA 139LA 3D4SA 3F9LA 133LA 1L62A 1MELL 3CDVA 1GFAA 1LZDA 4B4EA 4H8XA 3CB7A 2HEDA 3WVYA 2F32A 1P2LA 1DYCA 2IGCA 1OVKA 2BQDA 1B5VA 1L41A 2HUKA 1L42A 3WU9A 5KXLA 174LA 5HQ1A 3C7WA 2BQOA 3AYQA 3GUIA 102LA 5B07A 1B5UA 228LA 1LYOA 3LYOA 1L52A 4FJRA 4NSHA 1QUDA 1LSYA 4B49A 1L94A 3CDQA 239LA 1C69A 3LZ2A 160LA 3AJNA 1SWZA 3OE9A 1TEWA 4NGIA 2OE9X 4W57A 1L46A 5KXZA 3NY8A 1HEMA 1A4VA 1G7JC 1L45A 5B59A 1C6NA 4ETEA 1T6HA 3WUMA 1G1VA 1GWDA 142LA 2BQGA 1PQJA 4ML7A 2BQFA 3LYZA 2I26L 5F81A 4XADA 5LVIA 246LA 1QTDA 1JUGA 1LYSA 1O23A 1JJ0A 1L37A 3FE0A 1L44A 4I0CA 3CQLA 3EXDA 4LFXA 129LA 4LT1A 1IORA 3WL2A 1AZFA 1L77A 4G4HA 1QDTA 3RUNA 1UIAA 1L06A 4LDOA 4L41A 1OV7A 2DQDY 4P2EA 145LA 4TUNA 229LA 1VEDA 5L9JA 1NWGA 4DD9A 249LA 171LA 1YILA 3HBHA 3EO5A 4CJ2A 1YKXX 1SQ2L 3JR6A 5KXWA 1P3NA 3CSQA 3CSZA 1C08C 1Z55A 211LA 3GUPA 1GB7A 1KW7A 2OTYX 3P66A 1HENA 4Z41A 1TBYA 190LA 1DKKA 3RZ4A 1LSZA 1P6YA 1IX0A 2LYMA 4KPMA 1G1WA 2XQOA 2W1MA 182LA 1L24A 3LN2A 4AQNA 4DDAA 1L65A 3K2RA 2HU3A 2WARA 2B72A 1QTHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LT2 A;  2DKV A;  1BGI A;  4H9F A;  1OUB A;  1LJI A;  194L A;  3BKH A;  1LMO A;  1RJC B;  2AUB A;  4J0L A;  1GBX A;  4XEN A;  3A3R X;  1IVM A;  1W08 A;  133L A;  1MEL L;  4WM1 A;  1JTO L;  4OWA A;  4AXT A;  2VB1 A;  1GFA A;  1LZD A;  3WU7 A;  1WQQ A;  4B4E A;  4HSF A;  1FLQ A;  4H8X A;  3CB7 A;  4DD1 A;  2HED A;  3WPL A;  1NDG C;  3WVY A;  4NGK A;  1LMQ A;  1IWW A;  1BB3 A;  2HEC A;  2FYD A;  2HEF A;  1INU A;  1WTM A;  2BQD A;  2Z2F A;  4TWS A;  3P65 A;  1B5V A;  4NHI A;  2BAA A;  3SP3 A;  4UWU A;  1UID A;  3A92 A;  2D4J A;  3WU9 A;  4B4J A;  5KXL A;  1HSW A;  2HEB A;  5HQ1 A;  5AMY A;  5DM9 A;  4WM2 A;  4UWV A;  1DI3 A;  3WVX A;  4OWE A;  2BQO A;  1D6P A;  3AYQ A;  1GB2 A;  3LZT A;  5B07 A;  1B5U A;  2Z19 A;  4HV1 A;  4WL6 A;  1LYO A;  3LYO A;  5I4Y A;  1C10 A;  1GFG A;  4FJR A;  1C45 A;  4NSH A;  1LZB A;  1LSY A;  4B49 A;  1UIB A;  4GCE A;  1LZ9 A;  1GF9 A;  1YL0 X;  3LZ2 A;  2EIZ C;  4CFP A;  1ALC A;  1D0K A;  1REM A;  134L A;  1AKI A;  3A95 A;  3AJN A;  1QSA A;  3EBA B;  4ETB A;  1TEW A; 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 1FLW A;  4M6D A;  1OUA A;  5LA5 A;  9LYZ A;  1EL1 A;  2RSC A;  4WLD A;  5B05 A;  2BQB A;  2BQC A;  1IP4 A;  4XN6 A;  1DI4 A;  4DWX A;  1REZ A;  2F4G A;  1H6M A;  1HHL A;  4PHI A;  1J1X Y;  1B7L A;  1B7R A;  1AT5 A;  2BLY A;  3ATN A;  2MED A;  1NDM C;  1UIE A;  3D3D A;  4DD7 A;  1BWH A;  1KXX A;  1LZT A;  4W94 A;  1CKD A;  1F10 A;  3IJU A;  1YAQ A;  4H93 A;  5KKI A;  1IR8 A;  1LZ1 A;  1C46 A;  1SLY A;  5JEN B;  1B5X A;  1UIH A;  4WO6 A;  5LA8 A;  1DQJ C;  1CKH A;  4GN3 A;  3QNG A;  1LPI A;  4HPE A;  1G7M C;  2G4Q A;  3RNX A;  5IHG A;  1XGR C;  4WLX A;  5KXM A;  4II8 A;  4GCF A;  2MEH A;  5C6J A;  4EOF A;  4NHQ A;  4NY5 A;  5F16 A;  7LYZ A;  1LZY A;  1LJN A;  1B0D A;  4NHS A;  1QUS A;  1LSF A;  1LYZ A;  4KL7 A;  4MR1 A;  5EBH A;  2NWD X;  3M18 B;  5C6L A;  1JIY A;  4ETD A;  1WVU A;  135L A;  1JWR A;  1TCY A;  1YL1 X;  4IAS A;  2Z12 A;  4YEO A;  4NFV A;  4OWB A;  5LYT A;  4LYC A;  1LSA A;  1GBY A;  1BQL Y;  1REX A;  4HP0 A;  4XYY A;  2YVB A;  5FHW A;  4DD2 A;  4TSB A;  1EQ5 A;  207L A;  3A96 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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