1O8WA

Radiation-reduced tryparedoxin-i
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
GLDKYLPGIEKLRRGDGEVEVKSLAGKLVFFYFSASWCPPCRGFTPQLIEFYDKFHESKNFEVVFCTWDEEEDGFAGYFAKMPWLAVPFAQSEAVQKLSKHFNVESIPTLIGVDADSGDVVTTRARATLVKDPEGEQFPWKDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Tryparedoxins from Crithidia Fasciculata and Trypanosoma Brucei: Photoreduction of the Redox Disulfide Using Synchrotron Radiation and Evidence for a Conformational Switch Implicated in Function
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN
source organism Crithidia fasciculata
molecule tags Oxidoreductase
total genus 41
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1o8wA00
6GSYA 2YCDA 1NM3A 4N11A 4KB3A 4WEYA 1R5AA 2DIYA 1G0TA 1SYXA 3DVWA 1MDKA 1PA3A 4D73B 3L9UA 4V1Ag 5IQYA 3BBYA 3F6DA 2FA4A 5DAKA 5EPFA 2CAIA 5D8IA 4BWSA 2NPBA 4ML1A 2VCZA 5ENUA 4GF0A 1TP9A 6GSWA 2RLIA 3TKRA 1EGOA 1IYIA 2PERA 3S9FA 3EMXA 1AIUA 2CZ2A 3ZIVA 1WRYA 1MD3A 2XBQA 2GZPA 1VF3A 1XCCA 2XPDA 2PPTA 2XBIA 2ON5A 3HY2A 4TVEA 1TKDB 2HLSA 4K6XA 3O6TA 2WULA 2HT9A 5ABRA 1AQVA 4OMVA 2HZFA 2DIZA 1KTEA 4DSSB 1XWBA 2K18A 5GZZB 2FCHA 2H70A 1QGVA 4K9ZA 4IVFA 4OFTA 5CP1A 1M0UA 3ZRDA 2HI7A 3CSHA 3TCOA 5EL8A 4FIWA 1GSDA 2I81A 2LNSA 2CQ9A 1ERWA 2PVOC 1N2AA 4WXTA 3GH6A 2VCQA 3LJRA 4N10A 5LD0A 4EF0A 5GSSA 2C0FA 5AIVA 3IOSA 4I2UA 3KP8A 3UL3A 5DVBA 3VFIA 2P31A 3LQ7A 7GSSA 1HNCA 2DSAA 1GUMA 3CRTA 5DALB 1WPIA 3GMFA 3SBCA 2E0QA 2GSQA 3QAWA 2MMZA 4YQUA 1JZDA 1UA5A 3F63A 3IA1A 3UARA 1U3IA 5COHA 1TW9A 3N5OA 4ZL9A 4POMA 2MYGA 2F3MA 1F37A 4JR4A 1X5CA 4GCIA 1XWKA 5IMFA 5B6MA 3SWLA 1GTAA 3HXSA 5AGYA 2MMAA 4Q5QA 3UBKA 4OFNA 2FUG2 4TXOB 4F9ZA 1J08A 3QDNA 1SK2A 2H0GA 4PQ1A 2IWTA 2LEGA 3UJ1A 1AUCA 3F3QA 4KX4A 2KP1A 4F82A 4HU7A 3TOTA 4GQFA 4CDOA 2YWOA 4MP4A 2NTOA 1TU8A 3VWUA 3TRQA 4HQZA 16GSA 1Z7PA 4IP1A 4WBRD 4POLA 1K0CA 3KMNA 4DSRA 4K1FA 1LU4A 2JZSA 1TJDA 1SJ6A 3UVHA 3DVXA 2F51A 3TB2A 5G5EA 2AJQB 2PMTA 2WS2A 4MJAA 5FWGA 2VL3A 3FK8A 5A5KA 4V2NA 2JL4A 5F05A 1SL1B 1JLWA 1FB0A 1EV4A 4MK3A 4JBBA 1SK0A 4RUVA 4E8EA 2GQLA 5GAPD 1GSUA 2ZCTA 3LYKA 3F4RA 1URMA 3GTUB 4ZBDA 2GDRA 1EP8A 4O92A 1U87A 4OD7A 3DEXA 1GSQA 4GSSA 1G7EA 3WGDA 1B8XA 1MD4A 3LYPA 3ME7A 2JZTA 20GSA 3IC4A 3A2WA 2FGXA 2GZYA 4N0VA 2B5XA 3LFLA 2B7JA 3DYRA 5CREA 1B4QA 2YPMA 2B7KA 2P5RA 1A2MA 2H30A 2H73A 2AV4A 3TDGA 1WMJA 1PX7A 3FZ9A 1EGRA 4ZL8A 2HZEB 2GS3A 2R3XA 2IFQB 3GV1A 13GSA 1PQNA 1XWGA 3D6IA 4EKZA 5IOWA 3GN3A 4JE1A 3IDVA 1OC9B 2VOCA 1V9WA 3L9VA 4OCFA 1EEMA 1PD21 1V2AA 3KP9A 1QXHA 3L4NA 4ILFA 4HS1A 1QQ2A 4KE3A 3QCPA 4HEA2 4JR6A 2IMEA 4AJ7A 2IN3A 2L57A 1XBSA 1E2YA 3HZ8A 3FYGA 5KN1A 2TRXA 2C3TA 2K8SA 2VL2A 5JWRB 3LORA 4ECCA 3Q6OA 1LJRA 5J9BA 2OA7A 1T00A 3C73A 4MH3A 5ECRB 4HDEA 4MZBA 2OACA 2H75A 5IOXA 3GL5A 4X43A 2VCTA 5CO3A 3GSTA 4JEDA 3IHQA 4LLRA 1WWJA 3ZTLA 1QK8A 10GSA 1T3BA 6GSSA 3Q19A 3N9JA 2YNXA 4K7OA 3TKSE 4PNFA 3F6FA 5H5QA 4WR5A 1T4YA 3E3EA 1YEPA 2J23A 2LV3A 3IR4A 5G2ZA 4LL1B 5DJLA 3C71A 2HFDA 2I3YA 3D4MA 1O85A 4EC0A 3IAM2 1OC8A 4N30A 1DBYA 3RPNA 3EURA 3ZL5A 1AC1A 3ZREA 3ZVJD 4K0NA 1BEDA 4L5OA 4H86A 4PGTA 1JHBA 1OE8A 3FZ4A 2CVBA 5J3RA 3TJGA 1O73A 1GP1A 2ON7A 3FHKA 5FT3A 5HR1A 4LA1A 3ISOA 1G6WA 5DAKB 4KNDA 4FYUA 3F4TA 4LL4B 3ZMLA 1YJ6A 1GTIA 3EYTA 4JRRA 1HD2A 4WF5A 1Z5YE 1K0DA 4KW6A 3CXGA 5H5SA 5C00A 4XCSA 3MSZA 1PGTA 1OC3A 5A4VA 6GSXA 3H93A 4RI6A 1TRUA 1J9BA 2H71A 3M9JA 4ML6A 4Q5NA 4I8BA 4MJCA 1BX9A 1Y6EA 2H6YA 4J56E 4K7NA 2WRTA 3TUEA 4PUFC 1HNAA 2JSYA 2O85A 4BA7A 5FHIA 3KH9A 5G30A 2CV4A 3NOFA 3H79A 2H72A 2V6OA 2OJLA 3BCKA 1H4OA 3KD0A 4IBPA 5HR0A 2AYTA 2HRNA 4X1UA 4F0CA 4GXZA 3ME8A 3U5RE 1BQ7A 2G2QA 2R5GA 2BMXA 4MMMA 3FZ5A 1PRXA 4ISDA 2A2RA 1PSQA 3HD5A 4XHMA 1GWCA 1EWXA 4MF6A 1SJIA 4EXJA 4E8HA 2MMOA 2DJKA 1J0FA 4K8MA 3QAVA 5KN2A 1F6MC 2HSYA 3U6VA 4J57E 2B1LA 1GNEA 3VWXA 5ECQB 3WGXA 2VCWA 2E2GA 4EDYA 1K0MA 1X5DA 3FZAA 4ZBAA 3C7MA 1G7OA 3G9BA 2H6ZA 2GQKA 3QMXA 2H74A 1SYRA 1G6YA 3GH9A 5ELAA 5IM9A 2XPEA 1R4WA 2K6VA 2AHEA 1JFUA 1K0AA 3RHBA 1ERTA 4FYCA 2L5OA 2DJ2A 3RPPA 4WBJA 3US3A 2M46A 2VCVA 1K3YA 2AB6A 4EL1A 1UC7A 1WJKA 2I4AA 4QL7A 3AY8A 3A2VA 4K7IA 1TOFA 1THOA 3HJOA 3GIXA 5G1LA 1GNWA 4KGIA 5F0GA 1E6BA 1VF2A 4G9HA 2GSTA 5D96A 5CNWA 3VPTA 4HQSA 4HI7A 12GSA 3IK9A 2VM2A 3FW2A 1XW9A 3PR8A 3VURA 1EV9A 3IK7A 3GKNA 3ZIJA 2X8GA 8GSSA 1A8YA 2FLSA 2GT6A 2O89A 3GYKA 4FYBA 2VM1A 4BVYA 2YZHA 1M2DA 4WKWA 5KEJA 2OE1A 1DSBA 1Z9HA 1EOHA 1XW6A 9GSSA 4NMUA 3H1NA 2JADA 4YAPA 3DMLA 2C0EA 3VLNA 2YWIA 17GSA 1U3AA 1XPVA 2F8AA 2G0FA 4ECIA 1TTZA 2IMIA 1GLPA 3V1WA 1XXUA 3GKXA 2V32A 5D9WA 3TJBA 1O8WA 3M0FA 3P7XA 5H5RA 3UBLA 5IPGA 4HU9A 5HFGA 1V57A 1YKCA 3CSJA 1W89A 2R6KA 4PUAA 1O81A 2LQQA 3F8UA 3TJFA 4KSOA 5AISA 3ERWA 4KA0A 4HZ4A 4TOPA 2DMLA 4TR4A 4NHZA 5D9VA 3HJPA 1SD9A 2DLXA 3KXOA 1AQXA 4ZXGA 2VAFA 4TR1A 4IP6A 3HYPA 2XHFA 3KEBA 3IBHA 1PKZA 4XS6A 1V40A 1TRSA 1PN9A 3CTGA 4KCAA 3P8WA 4TR0A 2YWMA 5G31A 5IMAA 14GSA 1FW1A 2DMMA 3UEMA 5ID2A 1T1VA 3M9KA 2AUVA 1CQGA 3H8QA 3G7IA 5DQYA 2C8UA 2H8LA 3G7YA 5CRHA 2VL2C 5DDLA 2R2JA 5JCUA 4ACSA 2L4CA 1ILOA 3C8EA 4TRXA 4IGJA 1U6TA 3DKSA 2FWFA 4GQCA 4X0XA 5E59A 3EC3A 1M7TA 3PGTA 2QC7A 2WZ9A 1Z6NA 2OBIA 1QMVA 2EC4A 4O32A 5AIXA 4RQRA 2CVKA 2LRCA 3HVSA 4OFMA 3WYWA 4V2MA 5IMZA 2FNOA 1FVKA 1X9WB 1YZXA 1R7HA 4POBA 5DCHA 5HR3A 3FY7A 2HNLA 1WE0A 5ECLB 3P2AA 1PMTA 2VD1A 4ZL7A 1M2BA 1O7UA 1ST9A 2FHEA 4BL7A 2YOIA 4CW9A 4HJ2A 1YF1A 3MWHA 1ERVA 2CA8A 3VK9A 5B6NA 2O7KA 5D9XA 1M2AA 1GSEA 1EEJA 4TR3A 2AAWA 1NW2A 1ACVA 3KM6A 3DIEA 4ZILA 2YZUA 2PVQA 1XFLA 3DRNA 1TK5B 1V98A 1THXA 4QQ7A 4XS4A 1XWAA 1N8JA 2GSRA 4KDXA 3K8NA 2H1GA 1O6JA 3F0IA 2LRTA 3QFAC 1K0OA 1KBNA 2HYXA 2LRNA 2M72A 2PWJA 1K3OA 3M1GA 4F03A 2LJRA 4OCEA 5F8BA 5C04A 1TI3A 2WFCA 3DGQA 2KP2A 2I9HA 2RUFA 2JU5A 5ECIB 2P0GA 2PGTA 3LSZA 2KUCA 3KMOA 3VWWA 3QOUA 2C1YA 3FR3A 1SKWB 1GLQA 4MDCA 3KCMA 3UAPA 2J9HA 2GQMA 4Q5FA 3I69A 2LNTA 1U88A 4ZB6A 1XVWA 3HVXA 4LMVA 2VCXA 2L6CA 3CYNA 3GURA 4PURA 2CZ3A 2X8HA 2N5BA 1SK1A 3IPZA 4MF7A 3HDCA 3L9SA 4MF5A 2D2ZA 1SENA 1ZYQB 4MZWA 1OE7A 4I6XA 3CTFA 2ZUPA 4J2FA 1OKDA 1A2LA 3LXZA 2YANA 1FG4A 4HJMA 5IO0A 2RM5A 3W8SA 4IELA 4LMWA 1S3CA 1SKRB 3RAZA 5IIZA 2I1UA 1F9MA 2GGTA 1K3LA 1IYHA 3GA4A 4KSMA 1MDJA 3WT2A 4KAEA 4V1Ap 2H6XA 2BJXA 4O5RA 1F2EA 3I6AA 3TKPA 3D21A 4I5QA 1M9AA 3W8JA 1T4ZA 2GVPA 3GFKA 4NPBA 5A4WA 2IMDA 4EVMA 1F3AA 2DBCA 5G1KA 3ZFBA 2H0IA 2H0HA 3ERGA 1YKAA 2YJ7A 2F9SA 4ZB9A 4YQMA 1RW1A 3ED3A 3BJ5A 1B9XC 2OADA 4YAVA 2VLUA 2MZCA 2YV9A 5ECNB 1NSWA 3M8NA 3EE2A 3TRXA 2LS5A 5ECKB 3ZLPA 3C1RA 3QFBC 3RDWA 5B8AA 2NVLA 4K0GA 5KN0A 4AJ6A 1I5GA 1GUHA 1XIYA 1S3AA 5DBQA 3ZZXA 2VO4A 4BVXA 1ZCPA 2NBSA 3WT1A 2RUEA 1TI1A 3F9UA 2RIIA 4GWRA 2DJ3A 3QAGA 4YH2A 4WR4A 3P90A 3UMAA 2REMA 5JWOB 3OR5A 3HA9A 3LWAA 4XTSA 1Y25A 1X0RA 3O3TA 1FHEA 4QL9A 4PQIA 4ULXA 3BD2A 3TOUA 1A24A 2H19A 1USBA 5JCGA 5F06A 3R2QA 3VI7A 1DE2A 1B48A 5JCWA 4MJBA 1JLVA 1ZZYA 3ZFLA 5J41A 1HYUA 4F2IA 2MBTA 4ECBA 3DXBA 1ZGNA 2FWGA 1R26A 5G5FA 1PL1A 4IS0A 5ECPB 3QPMA 5AN1A 5ECHB 4POKA 1A8LA 4F0BA 1PL2A 1DE1A 1TK0B 3EU4A 2L4QA 1Q4JA 5J9CA 4JZQA 1TRWA 3EINA 1GL8A 2JZRA 2MMNA 3NIVA 2O8VB 2ES7A 3G7JA 3MAKA 1XZOA 4V2LA 5J4UA 2R4VA 2LTKA 1HNBA 4TR1B 2XC2A 2H1DA 3D22A 2B6MA 18GSA 4XS1A 4EE0A 1ZYEA 1I9DA 1VF1A 3GSSA 3KGKA 5D9TA 5HFIA 4AF2A 4K2DA 4PXOA 3KH7A 5ID2B 3KJYA 3M3MA 2GLRA 3ERFA 3TGZA 1QUWA 1GH2A 1JZOA 4MPGA 3GL3A 5B8BA 4XIHA 4MPFA 5IO2A 1AAZA 3EVIA 3HCZA 3LG6A 4Z7XA 2OKAA 1AQWA 2H66A 3TKSA 2LUSA 1TU7A 3WD6A 3BOAA 4FH8A 2TIRA 1SU9A 2PN8A 3WGEA 1GRXA 2JSZA 1AXDA 4KCEA 2C3NA 1DUGA 3EWLA 2C0GA 5LNKe 4IW9A 1EZKA 4IJIA 4AJ8A 2HRFA 1GULA 2L59A 2LJKA 2VL9A 5IMDA 3NZNA 3KTLA 3CRUA 3RHCA 1CQHA 5CRGA 2C0DA 4P3YB 6GSTA 1X5EA 4KUNA 2EIRA 3F3RA 1NHOA 1UVZA 1GSSA 4AGSA 3JCML 2DJJA 2CVDA 4XS4B 4DVCA 2P5QA 2VD0A 4L5LA 1RK4A 2CX4A 1KEBA 3QD9A 3VPQA 2JACA 2CT6A 3W6GA 2LSTA 5JWQB 3MNGA 4NAXA 1YEXA 4DEJA 4EUYA 2OE0A 1X9MB 4MJEA 1JZRA 2H76A 4ZBBA 3A5WA 2N5FA 1A2JA 3GRXA 3L78A 2OE3A 5F07A 1B9YC 4MA9A 1H75A 2VIMA 1S3DA 3TKQA 1EOGA 4G19A 2C3QA 1SL2B 1BJXA 3RBTA 2B3SA 2IIYA 3D4TA 4MH2A 2NDOA 1ZL9A 3H4KA 1YY7A 1Z6MA 2B1KA 2M80A 4DSQA 2YV7A 1TK8B 2LKUA 11GSA 5HFKA 2OBKA 3IRAA 4HOJA 1WOUA 2YWNA 2YP6A 3UVTA 2FY6A 2ZNMA 4D73A 3IAS2 3ZVJA 1F3BA 3DWVA 3E0UA 3UOMA 3VI5A 1BYEA 4OO4A 4TXVA 5GSTA 3HJMA 3GNJA 1YDKA 2DJ1A 4IQ1A 1T8EB 1Z3EA 1YF0A 2E2MA 4OO5A 5B7CA 1GUKA 5IMVA 2GZZA 1M9BA 3C1SA 3D0ZA 2FA8A 2H1BA 3TJJA 1SKSB 4BPYA 3VWVA 2Z9SA 4GTUA 3KZQA 4NXIA 5IPHA 5D73A 3E9JB 1B4PA 5ECMB 1A0RP 3Q18A 1QFNA 1UN2A 2YN1A 1FAAA 4MZCA 1TDIA 4CHSA 2O87A 1SJZA 4DSSA 1ML6A 2L6DA 3PINA 1XW5A 1MDIA 1RQMA 4XRDA 2WJUA 2TRCP 3A2XA 5LCZA 3D5JA 3CSIA 1K0NA 2QGVA 2BTOT 5D93A 4IJ3A 2CAQA 3IE3A 4IKHA 2N5AA 2K8VA 2FWEA 3APQA 2HSHA 3GUSA 2CX3A 1WP0A 1SL0B 2R37A 4MCUA 4KDUA 1VF4A 4NHWA 3GKKA 1O8XA 1HQOA 1MTCA 2A4VA 1T7PB 3HVVA 5CRDA 2H1AA 3F4SA 4FO5A 5DALA 4GSNA 1Z7RA 4TW5A 6GSVA 3IXRA 22GSA 3J7Yk 1C72A 1X9SB 1ABAA 4BWQA 2VLTA 4GRFA 3CMIA 1ZOFA 4TKYA 1OYJA 4WF4A 1XWCA 2WB9A 2WCIA 5KN3A 4G2EA 2DJ0A 3MDKA 3PH9A 4TXOA 1OVNA 4IHUA 5E4WA 3EMPA 4Q5RA 1GSFA 2E7PA 4IN0A 3FEUA 2HXKA 3QR6A 4NWYA 2EIOA 1BAYA 1PKWA 3L0HA 4RI7A 2IPAA 1TXXA 1FO5A 3DD3A 4O7HA 3A3TA 2EIQA 2C4JA 2GSSA 2IMKA 2X99A 5A4UA 3TRPA 3ZITA 4EO3A 3BCIA 3EU3A 1BG5A 5J5NA 4OWYA 1NHYA 5GAND 1GTBA 5CYYA 4MLYA 4GLTA 2DC5A 3FRCA 1OKTA 1VGLA 2LJAA 4ID0A 1XOAA 1FVJA 2VLVA 3GTUA 3J7Yb 3TJKA 1A23A 2LQOA 3ZYWA 1W4VA 2GT5A 19GSA 2KLXA 2F8FA 2H01A 1R5PA 4PNGA 2WGRA 2B5EA 1LBKA 1VRSD 3GHAA 2V2GA 4TN8A 5EY6A 5DCGA 1K0BA 4KH7A 1A0FA 3KTBA 3GX0A 5HQPA 2QKEA 5DQSA 2K9FA 1SD8A 1TRVA 1GTUA 3HKRA 4NV2A 4ZIJA 5ELGA 2A2SA 2V1MA 4I97A 5CRWA 4HUAA 1PX6A 2PBJA 2HZEA 2VUPA 2IFQA 1EP7A 3UIWA 1V58A 4MABA 4HZ2A 5HR2A 5DJMA 4YQVA 1OC9A 3GX8A 1OAZA 3KIJA 3TKSC 2ALBA 4KDYA 1ERUA 3Q74A 2KOKA 4ECJA 2FD3A 2QSIA 2C80A 2B5YA 2RM6A 1YQ1A 4GSTA 3ZMKA 2X64A 2IL3A 3GKMA 4PQHA 3APSA 5ECOB 4EDZA 4NV5A 1M99A 4WETA 3IV4A 3LXTA 2FWHA 4L0WA 3I43A 5L71A 2PUKC 1FB6A 1ZMAA 3O76A 5EVOA 1XOBA 2PU9C 2MBSA 2V6KA 2IMFA 3I9V2 3LEFA 4G10A 1KNGA 2V41A 5ECSA 1GSYA 4L8EA 1WIKA 4RQXA 4PX1A 5CAXA 2KHPA 4I2TA 4L0UA 1XVQA 3FR6A 1ON4A 1MEKA 2X8CA 3FR9A 6GSUA 3FKFA 1JZWA 4XRAA 2HE3A 3LGCA 3HZ4A 2WDUA 1AW9A 3APOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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