1OC9 | Genus

Total Genus 46

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	46
sequence length	150
structure length	150
Chain Sequence	b'HMSGLKKFFPYSTNVLKGAAADIALPSLAGKTVFFYFSASWCPPCRAFTPQLIDFYKAHAESKNFEVMLISWDESAEDFKDYYAKMPWLALPFEDRKGMEFLTTGFDVKSIPTLVGVEADSGNIITTQARTMVVKDPEAKDFPWPNVEAK'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Tryparedoxins from Crithidia Fasciculata and Trypanosoma Brucei: Photoreduction of the Redox Disulfide Using Synchrotron Radiation and Evidence for a Conformational Switch Implicated in Function pubmed doi rcsb
molecule keywords	TRYPAREDOXIN II
source organism	Crithidia fasciculata
molecule tags	Electron transport
total genus	46
structure length	150
sequence length	150
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-02-07

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13905	Thioredoxin_8	Thioredoxin-like

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1oc9A00

5IMVA 2YPMA 4BPYA 4YQUA 1T1VA 3EVIA 4OFTA 5IMAA 1GUMA 3APOA 3HHVA 4V2NA 1J0FA 3ZZXA 4GSNA 17GSA 1F37A 2FGXA 4N0VA 12GSA 2FUG2 4JZQA 3EMPA 5C00A 3IV4A 2C1YA 4ECBA 1K3LA 3RHCA 4MJCA 3GH9A 5G1KA 3EYTA 2LQOA 2H6YA 5E59A 2WDUA 1XVQA 5HFGA 4GSTA 4J2FA 1EOHA 1JHBA 4TR0A 4KE3A 1QK8A 2LV3A 5H5QA 2HNLA 1E6BA 3QFAC 3C73A 1TP9A 2O89A 4ZL7A 5CYYA 2IMFA 1TK5B 1BYEA 1ST9A 1O8XA 4HU9A 1JFUA 3TDGA 4HS1A 2IWTA 1V57A 2CVDA 2D2ZA 1B4PA 3GKKA 2DIZA 5ECMB 5DDLA 1ERVA 2BJXA 2X8GA 4ZB6A 1EGOA 1TU8A 3MNGA 3TKSE 3TUEA 3LWAA 2IMDA 1XPVA 3F4TA 1TTZA 2RUFA 2CX4A 4TR3A 1SL0B 1JZDA 1EEJA 4GSSA 3UMAA 4ZBAA 2H74A 1A2MA 2CVBA 1G6WA 2DIYA 2GVPA 2O87A 5A4UA 5HR1A 1KBNA 1PN9A 1TRUA 3GX0A 1USBA 5FT3A 3QR6A 4ACSA 1OC8A 2YZHA 5ECHB 1X0RA 5DCGA 2DC5A 2LNTA 2GTUA 2H01A 4FO5A 2AYTA 3DWVA 2GSTA 4WBJA 5A4VA 5L71A 2PVQA 2VD0A 1J08A 5JCGA 2OJLA 3H4KA 3KP8A 2B6MA 1Z9HA 2JZTA 5HR3A 2Z9SA 4F0BA 14GSA 1SK2A 5LCZA 4IJIA 1ILOA 1PA3A 4K7NA 1B4QA 4O7HA 4WF4A 3Q18A 3DD3A 1Y25A 2E2GA 1DE1A 2PGTA 3CBUA 2WS2A 3GMFA 3L78A 4NWYA 5KN0A 3GL5A 3ZFBA 4G9HA 2V6OA 4Q5QA 2LRCA 3FRCA 2WGRA 2F9SA 1FB0A 1PX6A 1Y6EA 2QKEA 1AIUA 2H71A 5AGYA 1YJ6A 4NV2A 4ZB9A 4RI6A 3CYNA 3HKRA 3MDKA 2GZZA 3DYRA 2I1UA 1YF0A 1M2DA 2JACA 4GF0A 5DJMA 1WIKA 5JWRB 2R37A 2OACA 4HU7A 4OO4A 4EL1A 3KM6A 4JE1A 1OKTA 5IMZA 5IMFA 5CRGA 4GCIA 1VF3A 2H70A 2IPAA 2H19A 2VL9A 1YKCA 1F6MC 4GWRA 2LJRA 2V6KA 2I4AA 2N5FA 5ECOB 3F3RA 5FWGA 3TKSA 1O73A 4TXOA 1TRWA 1I9DA 2PBJA 2WCIA 3F4RA 2ON5A 3KTLA 4K0NA 5HFKA 3ZFLA 5JWQB 2R4VA 4MDCA 3ME7A 2H73A 2PUKC 1TI3A 4YQVA 4KNDA 2E7PA 1TK8B 2K18A 4PUAA 2H30A 3FR9A 3K8NA 1FHEA 2FWGA 3KMNA 3TJBA 3LG6A 3BJ5A 3F3QA 5ECRB 2G2QA 4NXIA 3APSA 2B3SA 2L5OA 2MZCA 3GH6A 1M2BA 3C1SA 2C3NA 1JLWA 2VCTA 3G7JA 4MABA 4MJAA 2YN1A 3ZTLA 4TR1B 4POMA 18GSA 3HVSA 2YJ7A 1K0NA 2XBQA 2C0DA 3IXRA 3N9JA 2C0GA 3CSIA 2B1KA 4ULXA 1OC9B 5J41A 2DJ2A 11GSA 2DSAA 5IQYA 3S9FA 4KH7A 2C80A 3GA4A 4DSRA 4HI7A 4NV5A 1MDIA 3VWXA 4I2TA 2C0FA 5B7CA 5CREA 2NVLA 1XWKA 2YZUA 2PERA 5GSSA 1YKAA 4KW6A 2I9HA 4E8EA 3N5OA 3FY7A 1PRXA 4IW9A 3OR5A 2EIRA 1R5AA 3KGKA 2MBTA 1AW9A 1V2AA 3JCML 1FG4A 4Q5FA 3GKMA 3KTBA 5GAPD 3LXTA 2FA4A 1FB6A 1A2JA 2H66A 1UC7A 2P5QA 5ECIB 1EP7A 3I6AA 4GRFA 5A5KA 1SU9A 2VCZA 3F63A 4PXOA 4L5LA 3H79A 3TKSC 4FYUA 3KCMA 1SYXA 1SJIA 3WD6A 2CX3A 4CHSA 1N8JA 3IR4A 4WEYA 1DUGA 2JU5A 5DQYA 3FZ9A 2A2RA 2GQLA 4F2IA 3TGZA 4TXVA 4TVEA 4FH8A 4KDXA 1OE8A 3DIEA 3ZL5A 3TKQA 2C8UA 4XS4A 1RQMA 2VLVA 3TJFA 4BVYA 3TKPA 4L0WA 2V2GA 2DJ1A 2AAWA 4JR6A 3A2WA 4IELA 5ENUA 3L4NA 4K1FA 1R5PA 2R6KA 4LMVA 5DVBA 2C3QA 8GSSA 1DE2A 5CRWA 2F8AA 3E3EA 1HNAA 3M9JA 2EIOA 4NMUA 3H1NA 4LL1B 5IMCA 4V2LA 3TOUA 7GSSA 3IDVA 3GRXA 4HQSA 4ZL9A 2DMMA 4MP4A 4I2UA 1Z7PA 2H76A 4MJEA 1JZRA 2H1DA 3D22A 4WF5A 1FOVA 2VCVA 2GS3A 4G19A 5J5NA 4ZILA 5GAND 2L6DA 3P2AA 2DMLA 4HZ2A 3KH9A 3TJJA 1RW1A 5ECLB 3WT2A 2E0QA 4MF6A 3L9VA 3BCKA 3IA1A 16GSA 4EE0A 4LMWA 5H5SA 1THOA 2N5BA 2EC4A 3EE2A 2H1AA 4GTUA 3IC4A 1R4WA 1RK4A 3KH7A 2CZ2A 4G10A 4AJ7A 1GUKA 2P31A 5KN1A 3H8QA 3W6GA 2LUSA 2CZ3A 2FWEA 5ID2B 4POLA 2IFQB 1O8WA 3DMLA 2MMNA 4ZBBA 4L8EA 2VCXA 1BEDA 4MCUA 5IOWA 4HJMA 2H6XA 3HZ8A 1GNWA 4EO3A 5IPHA 3ZVJD 2M46A 3CMIA 3WYWA 3GUSA 2ZNMA 1FAAA 2KP1A 1H4OA 3R2QA 1SK0A 5G2ZA 4Q5NA 1A2LA 3HA9A 1GTAA 3FHKA 5DAKB 1GSDA 2B5YA 3EMXA 4XTSA 1OC3A 2WULA 3I9V2 3WGDA 1XBSA 5G30A 1MEKA 3SBCA 3ZVJA 1EGRA 3DVWA 5IO2A 3TCOA 1BQ7A 4EKZA 2YNXA 5C04A 1Z3EA 2B5XA 4QL9A 3RAZA 3HCZA 2YCDA 3GNJA 4IQAA 4D73A 5H5RA 1W4VA 5E4WA 1IYIA 1G0TA 4JBBA 3WGXA 1ERUA 2QSIA 5IOXA 4F82A 1U88A 1U87A 3M1GA 3QDNA 3ZYWA 4EUYA 1E2YA 1Z6MA 2L4CA 1VF2A 1H75A 2YP6A 4H86A 3QAWA 1X5DA 1J9BA 5ECSA 4OCEA 1ABAA 5CNWA 3BOAA 3CXGA 3M3MA 4MJBA 1EOGA 4O5RA 4RI7A 2K8SA 4GLTA 2HYXA 5DCHA 1BG5A 2OADA 1SD8A 3AY8A 1F3AA 2V32A 3HJMA 2CQ9A 2MBSA 3ED3A 3IHQA 1TRSA 1XVWA 4WETA 1V98A 3A5WA 4YAPA 3KEBA 1B8XA 3IE3A 4EF0A 3FEUA 3L9UA 1GLQA 1Z6NA 1ZYQB 1S3DA 5AISA 1GTBA 5CAXA 4WR5A 1TK0B 2KOKA 5F06A 3ZITA 3GKNA 3LJRA 3GTUB 5IM9A 2IMKA 3PR8A 1M2AA 3NZNA 4J56E 5G5FA 3RPNA 1GP1A 3ZIVA 5JCUA 3IRAA 1ZL9A 2FLSA 1A24A 4ZB8A 3TKRA 1BAYA 4HZ4A 2H1BA 3DGQA 4X43A 1CQGA 4I8BA 3Q74A 2AB6A 4MA9A 3VWWA 3ZMLA 5DALB 3F8UA 2B5EA 3US3A 5J9BA 2XPEA 4ID0A 2F8FA 1SJZA 3TRQA 4XHMA 3DVXA 4QQ7A 2KP2A 2YOIA 3VFIA 1DSBA 4XRAA 1XW5A 1OKDA 2ZCTA 2GSQA 1KNGA 4MH3A 5INYA 2WRTA 1GSQA 3M8NA 2WFCA 4EVMA 2LKUA 2VCQA 19GSA 1GWCA 1TW9A 2XHFA 1YQ1A 3UEMA 5CO3A 1THXA 4PQIA 1ZCPA 4HJ2A 1SJ6A 1MDJA 4KCEA 5G31A 1X5CA 4O92A 2H75A 3J7Yk 4MF5A 2HT9A 4PQ1A 1K0CA 1O6JA 4AF2A 3TOTA 2IMEA 1MDKA 2H0GA 3IOSA 2J9HA 2HFDA 4POKA 3O76A 1FVKA 1SL2B 1KEBA 5CRHA 3F4SA 2QC7A 3ISOA 1A23A 4FYCA 3GKXA 3HVXA 4CDOA 3DKSA 2IJYA 2ZUPA 3P7XA 1YDKA 1T4YA 1XOAA 1ZOFA 3VWVA 2L57A 3QOUA 3M9KA 4K0GA 1VGLA 2K8VA 3LFLA 1XWCA 4HOJA 1GH2A 3W8JA 3GV1A 2RIIA 1ACVA 3D5JA 1YZXA 4N30A 1QUWA 3TRPA 1O85A 3QPMA 4JRRA 1TKDB 3VI7A 2DLXA 4NPBA 3FZAA 2YWIA 3E9JB 3KMOA 4DSSB 5FHIA 3IK7A 2YV9A 5GZZB 1BJXA 1GUHA 1YEXA 3GIXA 4I6XA 2HZEB 2YWNA 4MH2A 5J9CA 4ML1A 2VUPA 2H0IA 4Z7XA 2K6VA 1W89A 5KN3A 4KAEA 3MSZA 2YWMA 3GSTA 1NHYA 1QXHA 3HYPA 1EV9A 4XS6A 1SYRA 1TRVA 2MMOA 2O8VB 3EU4A 3EURA 3G9BA 3UJ1A 6GSVA 1AAZA 4XCSA 4YH2A 1G7EA 2OE0A 3HZ4A 1AQVA 4AGSA 1GSSA 4HEA2 2GQMA 5KEJA 4RQXA 4MPFA 1U3AA 2AV4A 3ERWA 1HQOA 4KA0A 4K6XA 2L59A 2H0HA 4IQ1A 3CSJA 3VWUA 4EDYA 5D96A 1YY7A 4E8HA 2FWHA 2HI7A 1A0FA 1Q98A 3RHBA 4WR4A 4HDEA 2I3YA 1UN2A 2CV4A 4N10A 1OE7A 3FZ4A 2E2MA 1SL1B 3EINA 2VM1A 3CTGA 2HLSA 2DJKA 3CRTA 1GTIA 4RUVA 5ELGA 1XWAA 5EL8A 2JL4A 1HNBA 1NSWA 3UBKA 4JU5A 1F2EA 1A8LA 3J7Yb 5D9TA 3IPZA 2VL2A 2DJ3A 4KX4A 5D9WA 22GSA 3SWLA 5ECKB 4IGJA 1HNCA 4PNGA 4XIHA 4ZBDA 4V1Ag 1AXDA 5G5EA 2V1MA 2OBKA 3RBTA 4X1UA 4LA1A 4TR1A 1GRXA 4MMMA 2GQKA 4OFNA 2NDOA 3DXBA 1AC1A 2VLTA 4PUFC 1TOFA 1OC9A 3KD0A 4ZIJA 2AJQB 2EIQA 3QFBC 1M99A 2ES7A 2M80A 3UOMA 1XW6A 1XCCA 4POBA 2CA8A 4J57E 4IBPA 1M0UA 1K0BA 2HRNA 3Q6OA 2KLXA 3GFKA 4KCAA 4PQHA 1LBKA 2H6ZA 1R7HA 3FK8A 4RQRA 5AIVA 3U6VA 2HRFA 1PKWA 5D9XA 1QGVA 2KUCA 2HSYA 2IMIA 2FD3A 1SKRB 5ECQB 4GQCA 3PH9A 3A3TA 1V40A 5F0GA 4I97A 4JR4A 3UARA 2HSHA 2OBIA 3I69A 3MAKA 2C0EA 2A2SA 1DBYA 3V1WA 3PGTA 3F9UA 4QL7A 4WKWA 3F6DA 4NHWA 3CRUA 2BMXA 5DQSA 1K3YA 4L0UA 1TXXA 2TRXA 1A0RP 2I81A 3A2VA 2VOCA 4Q5RA 3RDWA 3CSHA 4JEDA 2NPBA 2NTOA 4TRXA 4GXZA 2J23A 4KDUA 2P0GA 3I43A 2ON7A 3C71A 4K2DA 2VL2C 2XBIA 2B7JA 2X8HA 3L9SA 4GQFA 4I5QA 3LORA 1PQNA 1EEMA 3P8WA 1EP8A 3UIWA 1Z7RA 3ZLPA 2M72A 2LRTA 2RM6A 2PPTA 3GHAA 3EWLA 2OE1A 4HUAA 3VLNA 4KSOA 1T4ZA 3GN3A 3EC3A 1EWXA 1V58A 2L4QA 5B8BA 4G2EA 3HXSA 5IMDA 1F3BA 1M9AA 1MTCA 4IVFA 3A2XA 2ALBA 5HQPA 2PN8A 4F9ZA 5ECNB 4BWSA 4K7IA 2JZSA 5LNKe 20GSA 2FA8A 3MWHA 1ERWA 1G7OA 4OCFA 2HXKA 1URMA 2OE3A 1QMVA 1ZGNA 4FIWA 4K8MA 1NM3A 3O3TA 1K0OA 3EU3A 4ILFA 5ID2A 2LTKA 4DEJA 2IFQA 1VF4A 1B9XC 3KP9A 1GSYA 3HY2A 3LXZA 2R2JA 3FYGA 2LRNA 5DBQA 2LS5A 3HJOA 3L0HA 5HFIA 2LJKA 4MZCA 5ELAA 1ZZYA 2LJAA 1PSQA 2KHPA 1TU7A 1GSFA 3IBHA 3G7IA 2GZPA 2LQQA 1GSEA 3PINA 3KJYA 2F3MA 2FHEA 4MLYA 1M9BA 1T8EB 4TXOB 5HR2A 3QAGA 1JZOA 3FZ5A 5DAKA 3APQA 5AIXA 1XIYA 4MZWA 5J3RA 2XPDA 2WZ9A 3QAVA 3UAPA 4K7OA 2WJUA 2LNSA 2OKAA 4KSMA 2PWJA 1VRSD 4PNFA 1XW9A 3BD2A 1YF1A 3ZMKA 4IP1A 3HVVA 1PMTA 1S3AA 2V41A 3BBYA 3Q19A 4DSQA 1XFLA 4IJ3A 2VO4A 2A4VA 4TOPA 2WB9A 3HD5A 2XC2A 4LL4B 4PX1A 4V2MA 2VM2A 1AUCA 2VLUA 3G7YA 1GTUA 1G6YA 4ECIA 1QFNA 1U6TA 5AN1A 2MMAA 3VPQA 4F0CA 6GSTA 1T3BA 2PU9C 4EC0A 1M7TA 5LD0A 2O85A 1LJRA 1XXUA 1EV4A 1TI1A 3UVHA 4F03A 1PL2A 4WBRD 4ZL8A 3VI5A 1BX9A 4OMVA 1WWJA 1T00A 4MK3A 2DBCA 2RUEA 1HYUA 4AJ6A 2R5GA 1TDIA 1B48A 3D4MA 1PGTA 4OD7A 1Q4JA 2FNOA 2H8LA 2F51A 3F0IA 1WPIA 4PGTA 1O81A 3VPTA 1ZYEA 2B1LA 1O7UA 2C4JA 1K0MA 2OA7A 4NAXA 1F9MA 2B7KA 2GT6A 1GL8A 3D0ZA 2G0FA 1QQ2A 1JZWA 4PURA 3CTFA 1SKWB 3TRXA 5J4UA 4N0ZA 1WJKA 3QD9A 1MD3A 4N11A 4K9ZA 6GSSA 2AUVA 5IO0A 2BTOT 3GURA 1WE0A 3ERFA 2IIYA 1XWBA 5F05A 2CVKA 5B6NA 4TKYA 2R3XA 5COHA 2CAQA 4TR4A 2YV7A 2PVOC 3NIVA 3UVTA 2C3TA 5D73A 3LYKA 5ABRA 3LYPA 13GSA 1GULA 1FVJA 1XOBA 4BL7A 5B8AA 3LGCA 4KB3A 1SD9A 3GTUA 2VAFA 3DEXA 2JSYA 4XS4B 1PD21 1TJDA 3H93A 2DJ0A 4OO5A 2GDRA 6GSUA 3ZRDA 2X8CA 3VK9A 1U3IA 1V9WA 2O7KA 3M0FA 1K0DA 1WMJA 4KUNA 2REMA 3D4TA 3WT1A 1UA5A 4NHZA 4EXJA 10GSA 2VCWA 1C72A 2MYGA 1JLVA 4X0XA 4TW5A 2LEGA 3UBLA 1PKZA 5DALA 4HQZA 3U5RE 2VD1A 2TIRA 4BA7A 1ZMAA 3ERGA 3IAM2 1MD4A 4BWQA 2MMZA 2GSRA 2DJJA 1EZKA 2JZRA 5D8IA 3F6FA 3BCIA 2HE3A 1XZOA 2H1GA 2YWOA 2N5AA 4YQMA 1WOUA 5KN2A 1AQXA 2FWFA 3C7MA 3C8EA 3GSSA 1B9YC 2YANA 4IP6A 3O6TA 1XWGA 1GLPA 3UL3A 4ZXGA 4OFMA 5A4WA 4ML6A 1KTEA 1SKSB 3ME8A 3RPPA 2VIMA 3WGEA 3IAS2 5EVOA 2H72A 2L5LA 1I5GA 1Z5YE 1R26A 1NHOA 1X9WB 3NOFA 4YAVA 3DRNA 3HDCA 5B6MA 1PX7A 4OWYA 4O32A 2TRCP 3FR3A 2NBSA 1AQWA 5JWOB 5CRDA 2LSTA 2JSZA 4IHUA 5GSTA 3IK9A 1ON4A 1OVNA 5EPFA 2QGVA 3VURA 3QCPA 3TB2A 1X9MB 3D21A 1K0AA 1N2AA 4TN8A 4BVXA 2PMTA 1WP0A 5IPGA 2GLRA 1ERTA 5HR0A 3KIJA 3P90A 3TJKA 5F8BA 1S3CA 1PL1A 4FYBA 6GSWA 4ECCA 3LQ7A 9GSSA 1CQHA 4MF7A 6GSXA 1A8YA 1X9SB 3GX8A 4DSSA 3FW2A 1LU4A 2HZFA 2X64A 1X5EA 2AHEA 1GNEA 2FY6A 3KZQA 5EY6A 2HZEA 3LSZA 3ZIJA 4WXTA 4D73B 4ECJA 5F07A 4ISDA 2GSSA 1NW2A 4KDYA 2GZYA 5DJLA 5D9VA 1GSUA 4CW9A 3D6IA 1SK1A 5D93A 1WRYA 2VL3A 2GGTA 2RM5A 2YJHA 2RLIA 2GT5A 1T7PB 2JADA 1OYJA 3E0UA 2FCHA 1SENA 3HJPA 1UVZA 3KXOA 3W8SA 2IN3A 4EDZA 2P5RA 3FKFA 3LEFA 1K3OA 5ECPB 5IIZA 1OAZA 2K9FA 1VF1A 6GSYA 5JCWA 4IN0A 4AJ8A 2L6CA 4L5OA 1IYHA 4IS0A 4KGIA 5CP1A 4MPGA 3TJGA 1YEPA 2IL3A 2CAIA 1ML6A 4LLRA 3QMXA 2X99A 4DVCA 3C1RA 2CT6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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