1OIBA

Phosphate-binding protein mutant t141d
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGDSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Modulation of a salt link does not affect binding of phosphate to its specific active transport receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Phosphate transport
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 105
structure length 321
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oibA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oibA02
2NUVA 1O64A 2XXIA 3O6GA 3PUZE 3RT6B 2V93A 3P7IA 4DXBA 3SERA 1PEBA 4P0GA 2ONKE 2WKYA 3K6XA 1Q1KA 3OENA 1BKAA 1AIVA 1CE2A 3IB0A 3Q28A 1FQEA 1QVSA 3ILTB 4G77A 1MG1A 3WAEA 1LFIA 1JNFA 3A09A 1YCJA 2HEUA 4O3CA 5HBCA 1BIYA 2V3QA 4ZZEA 4IGRA 1ANFA 3V83A 4NF6A 3CRBA 3SEXA 3TQWA 4RPNA 3C33A 4L17A 1P1OA 2Q2AA 5CMBA 2Z8DA 1MY1A 4E0WA 1MQJA 4X9TA 2XXUA 1A7LA 3FJMA 1D3KA 4R6YA 2ESNA 1GR2A 1ZTYA 1EZ9A 1A54A 2E1SA 1JEVA 4GIZA 3H6WA 4IO5A 4LUBA 5FTHA 3L6GA 5I56B 1US4A 1B3EA 2D3IA 3KFMA 3FXUA 2H9BA 3UK4A 3SEUA 1MXXA 1IUDA 2AIXA 2OWSA 2P1SA 2X7PA 2QPQA 3OSQA 4P0IA 2QJEA 4NF6B 4ZEDA 4G68B 4ZE9A 5HPQA 3HSTA 3K02A 1LLSA 1MXVA 3G3JA 3QUJA 3W9WA 4F1YA 1MXUA 4ZE8A 5AA2A 5I2NA 1IXGA 5KDTA 3CG3A 5H8FB 1PC3A 4ELRA 2PT1A 2Q9TA 3K1MA 3CI8A 3TZAA 3SEYA 5L9MA 2HAVA 4NE4A 3G3FA 3SDFA 2NVUB 3HHFA 1I6AA 2YJPA 3GBBA 4DXUA 2O68A 1MM6A 2ZYKA 3IOWA 4YAHX 4QRZA 4MLVA 2OBGA 4HS7A 1MQHA 4F39A 1N04A 2V3TA 3CFLA 3JV9A 1P1UA 1SVXB 1M5FA 1MPDA 4QFNA 2UYEA 3MQ9A 2DWHA 3PGFA 3Q25A 3CVGA 1URDA 5JTYB 4G8NA 1B7ZA 4FEDA 1MPCA 3CR9A 4ELPA 4H67A 4E0XA 3FXRA 3FD3A 3DP8A 3IJXB 1UIUA 1UIVA 2Y7PA 2OJTA 2ALUA 4JWYA 3RPWA 1LCFA 3DLNA 1NKXA 3FVKA 3OXNA 3K2DA 1B4ZA 5IAIA 3OELA 2CMOA 2X26A 4U4SA 2UVGA 4PP0A 4BDLA 3S9LC 4GXSB 3PUVE 1A55A 1PBQA 1M5BA 3HO7A 3EF7A 3MAMA 5CMMA 2Q2CA 4KYEA 2FA7A 2XX9A 1B5JA 3BFUA 4LA9A 4MLQA 4I62A 4XTCQ 2PYYA 4ZEKA 4RK2A 2QS3A 2YLNA 2O84X 1EH3A 3G3IA 1DPPA 3Q29A 4GF8A 4OFOA 1B32A 3MWBA 3KZGA 1Y20A 2DXRA 3D4CA 3PMVA 3TQLA 3CIJA 3KSXA 4G4PA 2UVIA 2R9JA 3FUZA 4KCCA 4LONB 5EYFA 3H03A 5I2KB 4ELOA 1M5DA 5K2YA 1LAHE 3Q26A 4KQPA 5AA1A 3UP9A 2DWJA 2ZNUA 3MJNA 1B58A 1MDQA 4NMYA 1Y3NA 2I0BA 2UVJA 3MPLA 4YKPA 4GL0A 3EN3A 3OO6A 3ODBA 3IO4A 2REJA 4Q30B 1MRPA 4JXIA 1JEUA 1ZMGA 1USYE 2XXVA 1RKMA 4DCYA 5AA4B 2F36A 5CI5A 1H45A 1NNTA 4OYVA 4Z0IA 1NH8A 2P0SA 3K1PA 4NWCA 4R9GA 1DSNA 4TOZA 3UN6A 1OLCA 2I58A 3KN8A 5CMCA 3OEMA 3V8XB 4ECFA 5AA2D 1J1NA 2ANJA 1B52A 1B1XA 3KSJA 4QHQA 1P1QA 4YU0A 3CFZA 4P11A 4ND9A 2D5WA 2O6AA 4RK9A 3FZVA 3OO9A 4ZS9A 5DVFA 5I57A 3FV2A 1RYOA 2I3VA 2W7YA 3FVGA 3KBRA 4IO3A 4JSDA 2DVCA 4FJPA 4UACA 3VLWA 2DYXA 2F7AA 2R6GE 2ONSA 1DPEA 2OWTA 1B9JA 4HCYA 4JWXA 1I6BA 3UA8A 1EU8A 2DP8A 4M4GA 2DWAA 2E0SA 3LC8A 4H8IA 2G29A 3TYHA 4EXLA 2QMWA 3FVOA 1B5HA 1NFTA 3VLUA 2F8DA 4KCDA 2QS2A 2XX7A 3T9VA 2HFBA 4YICA 3ZKLA 2RKMA 3IL1B 1B5IA 3B6TA 2ZYNA 3OMBA 2GH9A 1B7UA 2Q89A 1I69A 2ABHA 1AMFA 3N5LA 4F19A 3HHGA 4AQ4A 1SDXA 1XS5A 3FJGA 4FATA 3OSRA 5JK4A 3K6WA 4ZEFA 3UGWA 1TT1A 3H4ZA 4C1TA 1UTBA 3C36A 2D21A 3O28A 3G3KA 5H8NA 2BJJX 4DLDA 3IR1A 5CRYA 3A3CA 1WVJA 2O1LA 1NNPA 2Q88A 3M3LA 3PV0E 3KEIA 5AA4A 2XX8A 3MUQA 3H6VA 3DELB 5FHOA 2I48A 4KD5A 1PBPA 3MPKA 2DE4A 3S4UA 4PFWA 4U1ZA 3V89B 1BP5A 1Y4TA 4ISUA 4NF4A 1B51A 2RCAA 1AH5A 1NH7A 5I59B 1AOVA 4OENA 4F3BA 2VHAA 1PDAA 4PQJA 1S9TA 3C34A 3FIRA 1DOTA 1B0LA 2QL3A 4GL8A 1OVTA 2THIA 3T66A 4DE8A 2QS1A 1VR5A 3HPIA 3H6TA 3RTFB 3MVZA 3QUFA 3A3UA 2I4CA 4QSCA 5CM6A 4O3AA 3QYTA 3U1OA 3VDFA 1B46A 4X1BA 1GTKA 4H65A 3ZS6A 2F78A 4F3GA 2GHAA 1DTGA 2FYIA 3AXFA 5HM4B 3CFXA 3JZJA 1FTKA 1P1WA 4MH5A 4QFKA 3PUYE 3TELA 4ESXA 4F1UA 1D9VA 1JETA 2PT2A 3IB2A 3KG2A 4G2ZA 4QSDA 5DEXA 1IXHA 1SW2A 3I5OA 1R9LA 3OO8A 4JDFA 3B6QA 4IY5A 4R6KA 1B3HA 1UTBB 4FIMA 3MP8A 1B6HA 2O1MA 2F6PA 2Y84A 2PVUA 3HV1A 4GOTA 3T9HB 1MQDA 1F9BA 1UTHB 1TWYA 2AL5A 5H8HB 4ZEBA 1FTLA 4KYDA 3K1NA 5I58B 1FCKA 2HAUA 4YZZA 3KN7A 3O9PA 1OLAA 3RTWB 4H5FA 3UIFA 2ZYMA 5J1DA 3S9NC 3IO6A 3B6WA 3IORA 2ONRA 3O29A 3LSFB 5JTYA 1YAEA 4OVJA 3PD8A 2XXRA 3MZBA 4R75A 5L8DA 4U22A 4KFQA 1URGA 5F1QA 1XVYA 2F5XA 2RCBA 4XIGQ 1IZ1A 1LB9A 4HTGA 3VVEA 3TCFA 4QF9A 3SETA 1S7YA 2H4IA 1YPNA 3C4MA 4KPTA 5FHMA 4EQBA 4KI0E 5I59A 1MY2A 1JW1A 2DOJA 3VVDA 5A5XB 3C31A 2M8CA 3KOSA 5DYHA 5TP9B 1B40A 3RN8A 1QULA 4XKRA 1A8EA 4H6DA 4TLMB 4JB7A 4ONYA 2HZLA 5ELVA 1LSTA 1POTA 2F7BA 5EHMA 4F3PA 3RLFE 4ELQA 4X48A 3TTNA 1MY0A 4R74A 4FECA 5DEXB 1NNFA 4QFPA 1HSLA 1QUJA 1R6ZA 3QK6A 4G8HA 4AB5A 3S9MC 5TPAB 3G3GA 4LQ2A 3U92A 4ZECA 3T96B 4FAJA 2CZLA 1MQIA 4FE8A 3GZGA 1DTZA 1MM7A 3BBRA 1SW5A 2F97A 3ECRA 4PFUA 4R73A 4RA1A 4XKNA 3SEWA 4BDNA 4XKQA 4GXAA 4RYAA 1N3XA 2VP1A 3RUMA 4F22A 1FTJA 1M5EA 4RNSA 4WKMA 1N3WA 4Q8RA 2HCAA 3KJTA 2XXWA 4H1XA 3F11A 2QRYA 4YB5A 4NF8A 2I3WA 2REGA 2RC8A 5DTBA 2NXOA 4DCXA 2GFEA 1ELJA 3ONMA 3O6IA 1LBBA 2I6EA 5CBSA 4JSOA 1WODA 4PETA 4OFLA 2DE2A 1D9YA 3PPRA 2XXHA 5CBRA 3M3KA 1IXIA 1B3LA 4K3FA 4NTLA 2XD2A 1USYH 3Q27A 3TTLA 4DDDA 2ZXTA 4OQOA 4UA8A 4F3SA 2VD3A 5LOMA 3U8QA 1HSEA 3C35A 4NF8B 4DXCA 2FNCA 2R71A 1B3GA 5A5XA 3TAJA 1PB8A 5H8FA 3G7WA 1JW4A 5JEIA 4YB6A 2RINA 3IAZA 3MVYA 1I6QA 2XD3A 2AYSA 4NF5B 2F34A 4H0WA 1EZOA 4Q5TA 4BDMA 3W9VA 4KR5A 1SI1A 3TTMA 1VFDA 2Y7KA 5FHNA 4TLLB 3SESA 3QAXA 1B7HA 1FQAA 1GVCA 3MZ1A 1FQFA 1PB9A 3S9EA 5AA2B 4M1VA 1MXYA 1UQWA 3TMGA 3MZ9A 3EHUA 1XVXA 2V25A 2B3BA 1LCTA 2DS9A 3M8UA 3FATA 3FGSA 1OVBA 3PUXE 4GQOA 2OK2A 4R2FA 1D4NA 2O69A 4WEPA 1VFEA 1WDNA 1DMBA 1P1NA 4ZEIA 3RNNA 3ZKKA 5ITPA 3PPQA 1M5CA 4XXUA 1LB8A 1MY3A 1IIWA 2UVHA 3OOAA 2XXXA 3T9XB 3TFLA 4IO7A 1FQBA 4OFJA 4YKKA 5TPAA 1OQHA 2RF1A 3BKIB 3MW0A 4EF2A 1POY1 1GV8A 2I49A 1FTMA 5AA3A 1B3FA 1B1HA 2O7UA 1N7XA 1MH3A 2I4BA 2QMXA 4U2RA 3LSWA 3DP6A 1Y3QA 2F35A 5H8SA 2VOZA 2B65A 1VE4A 3FASA 3TTRA 1MXZA 3KGCA 1QUKA 1OIBA 5H8NB 4ZDMA 5I84A 5CMKA 4N07A 4OESA 4IGTA 2KLFA 1PB7A 1LAXA 3LSXA 1B0HA 5EHSA 3TTKA 3OD7A 4RPOA 3U93A 2Y7WA 1MY4A 4KHZE 4WXJA 3SKPA 2ZNTA 2V3UA 1TXFA 2Y7IA 4U1OA 5H8QB 2DQVA 4H5GA 4NF5A 1ZJLA 4OEVA 1SI0A 1Z7ME 3K4UA 3EHSA 2ZNSA 1JW5A 2H98A 1L5TA 1JQFA 5TU0A 3MVWA 4THIA 1T0KA 4EXKA 1H76A 1ZKBA 3PMWA 2UYFA 2XXPA 1HSJA 1XHYA 5H8HA 1A40A 1NL5A 4OETA 3R26A 2NWJA 3VXBA 4LZ8A 1ZU0A 2PMSA 1IQ7A 2PX1A 3O66A 1FW0A 1B05A 1IITA 3L6HA 1URSA 4LP2B 2HQ0A 3E4RA 1Z7NE 3PPOA 1LAGE 3K0VA 3K6UA 4YMAA 4U21A 1H44A 3T22A 4IY6A 4C1UA 3HN0A 5H8QA 4R9FA 2Z8FA 4EQ9A 2F7CA 1NMUA 2X7QA 1LFHA 3GXAA 1QKBA 4FEBA 5BUUA 1Y4CA 2Q8JA 1UTHA 5DVIA 2LAOA 1BLFA 1SYIA 3RY3A 4F29A 2H5YA 2OLBA 1R1NA 2OZZA 3DM0A 1XC1A 3PU5A 3LUYA 4I1DA 1LBCA 3C9HA 1TFDA 3KJ7A 2VGQA 4LQ5A 5DVJA 4GD5A 1H43A 3G3HA 5TP9A 4F18A 5KCJA 3I6VA 4X1DA 4IO4A 4XKPA 3OEKA 4LATA 1GGGA 1O7TA 2F6GA 4DZ1A 4OEUA 3EQ1A 4EQ7A 1JVXA 4OERA 1MS7A 3KN3A 4HW8A 2VD2A 3KOTA 2Z22A 4NEDA 3RGYA 3RQTA 2YPNA 4OWDA 3MVXA 3FV1A 5ITOA 5B7DA 3MC2A 1MXWA 4C0RA 1Y1ZA 4JBZA 1A99A 4O3BA 3PD9A 5IKBA 1OQGA 1N0TA 1SBPA 3IB1A 1Y9UA 4POXA 5L9SA 1AL3A 3MP6A 3VVFA 4OXVA 4ESWA 2DWIA 3CSGA 3N6TA 3R6UA 3TCHA 4MBPA 3IK6B 5ICQA 1QJMA 1S50A 3C32A 3M3FA 3QXMA 4F2QA 4YB7A 2O51A 3N26A 4Q0CA 1B2HA 4N6PA 2ZMBA 1MQGA 2AL4A 4RJZA 2DVZA 5CC2A 2UXAA 3MP1A 3E9XA 4I9DA 4TQUQ 5AE4A 3PMXA 2IEEA 2H25A 3SEVA 4KYSA 4MFIA 3T9UA 1P99A 2NOOA 3O2AA 3FVNA 2GHBA 4N13A 3W15C 1ZBMA 3IOTA 3IX1A 3VE1B 1H3DA 2HZKA 2Y7RA 1QW0A 2I0CA 3H3GA 3R7XA 4FORA 3I3VA 2IA4A 2XXQA 3BFTA 2A5TA 3ILUB 3H7MA 4HCWA 3CSBA 4F1VA 5K2XA 3THIA 4OTEA 1CB6A 1LAFE 2PBWA 4GLIA 1II5A 4GVOA 4OMBA 5B70A 3TDJA 5KCJB 4GFRA 3B7DA 5DT6A 1QKAA 3K01A 1FQDA 1SW1A 3H06B 3OO7A 2H99A 1ZIUA 2Z23A 3FJ7A 4NF4B 1B4HA 2DE3A 4G8MA 3PPPA 4IO2A 5KZTA 4LZ7A 5L9OA 4PE5B 4RXLA 3PUWE 3D4GA 3U94A 1NNKA 3EHTA 3E13X 2XXTA 4F31B 5M2VA 4YKIA 3K6VA 4LZ5A 1RYXA 1XT8A 2P2AA 3O97A 4POWA 4R6HA 3TKDA 2ZYOA 4EDPA 3N6UA 1JVYA 4IB2A 3VXCA 4Z7EA 5I58A 2GRVA 1MH4A 2RC7A 1SQYA 1N76A 3VV5A 4F2OA 4IO6A 2RC9A 4LVQA 1IXCA 1A8FA 3VFJA 4RY1A 1TFAA 3GBAA 2Z8EA 3PPNA 4QFOA 1N84A 2XHDA 3IJOB 4WEDA 3CG1A 3DP4A 3LSLA 5I56A 3LR1A 2B3FA 4BDRA 3U72A 1SD3A 2A5SA 3QSLA 1VSOA 3ZSFA 2A5TB 4OHNA 3O6HA 2V84A 4R72A 1MDP1 3TPAA 3WAFA 4BDQA 4YMBA 5I2KA 4G68A 1BTJA 1US5A 3TCGA 3FXQA 3GLBA 4BLAA 2OCUA 2XXYA 4U4XA 3TODA 3S2VA 1R9QA 4YKJA 4EUOA 5I2NB 5KDTB 4U23A 3HCQA 1FQCA 2QS4A 5F7VA 1SW4A 3EPEA 3H6UA 1LFGA 4GWOA 3RT8A 3UORA 3E3KA 3V5AA 4BDOA 2DSFA 4NWDA 1Q35A 4G68C 3TUSA 3MBPA 4DIGA 1QUIA 2G93A 2HXWA 4MF3A 3T93B 3K00A 3QIMA 4PFTA 5ISUA 1IEJA 1OMPA 5I57B 4GRKA 3IOVA 1FTOA 5FTIA 2DXYA 4PFYA 4OZ9A 4QFLA 4EF1A 3USDA 4QSEA 5BWJA 1O63A 1KWHA 3IOUA 3LBSA 3JYRA 1MPBA 4H8JA 1EZPA 1ATGA 1ZLQA 5ICTA 1Y1MA 1LGBC 4R2BA 1SYHA 2O7IA 2QSXA 1Y3PA 1YTVA 3N94A 4JWOA 3VLVA 1N7WA 4AB6A 4ZZAA 1XOCA 3TEPA 4I8CA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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