1OIBA

Phosphate-binding protein mutant t141d
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGDSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Modulation of a salt link does not affect binding of phosphate to its specific active transport receptor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Phosphate transport
source organism Escherichia coli
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 105
structure length 321
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oibA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oibA02
3TAJA 4RA1A 1P99A 4LUBA 1RYXA 2QPQA 3RT8A 1NNFA 1R1NA 2DXYA 3FUZA 1I6BA 4YKPA 5TP9A 2XD3A 4ZS9A 3FXQA 3KFMA 5CC2A 1Z7ME 3FGSA 3SEYA 3VDFA 4THIA 1A8EA 4R6YA 4WXJA 2DWJA 3I3VA 3IOVA 3VLUA 4PETA 4G77A 5H8FA 3LSWA 1UTHB 2AIXA 2F6PA 2F35A 4G8HA 4TLMB 2D5WA 4IO6A 1EZOA 2ABHA 1BTJA 4O3AA 4YKIA 3TDJA 1P1QA 1Y9UA 3E13X 1SYIA 4KI0E 4HCWA 4R73A 3EHUA 3G3KA 3TELA 1XOCA 3PU5A 4BDOA 4GXAA 2F78A 2ZYNA 5CMBA 4Q0CA 4PE5B 4FECA 2F34A 2ZYMA 1PBPA 1IUDA 3OEKA 4OQOA 3WAFA 1VSOA 3SETA 2Y7RA 2IEEA 1SW5A 1PB7A 1MH3A 3S9LC 4H1XA 1NKXA 1JNFA 3OO8A 2PVUA 4OZ9A 3B6WA 3CR9A 5AA2D 4EQ9A 3RLFE 4ELPA 4NF5B 1RKMA 1AOVA 4GOTA 2ONSA 3PPRA 4JWOA 1YCJA 1GTKA 2AL4A 3BBRA 4GQOA 5I58A 3THIA 4IB2A 3PUYE 1TFDA 4KYSA 2NUVA 5HM4B 3LC8A 3PMXA 1B3LA 2HQ0A 4LVQA 1M5BA 4L17A 3RGYA 4ZECA 1LB9A 4BDRA 5KCJB 4ONYA 1ZKBA 1VE4A 4X48A 3GLBA 1POTA 1Y3PA 5I56B 1PC3A 2NVUB 4GRKA 4NF6A 3CG1A 1B58A 5TPAB 3PD9A 4MF3A 1SW4A 3IB1A 1POY1 4FEBA 1AH5A 3U8QA 3OMBA 3EPEA 3K1MA 1H45A 2B3BA 3KBRA 3FVNA 5I59A 3ZKLA 3KSJA 3H6WA 2UYEA 4G68C 3LSFB 3W9VA 4KCDA 4OFLA 3T96B 3ECRA 2B65A 1LAGE 3PMVA 4AB6A 4OMBA 3U92A 1USYH 1LFHA 2H5YA 4F3GA 1URSA 3QYTA 3H6UA 3FV1A 2ONRA 3MBPA 1B7ZA 3KSXA 1VR5A 3V8XB 1B46A 2ZNSA 1LLSA 3P7IA 1URGA 5ITPA 1QJMA 5K2YA 1WODA 4OFOA 2AYSA 4NWDA 2ZXTA 2Z8DA 1EH3A 4OHNA 5A5XB 2O7IA 3MVZA 4XKNA 2XXPA 2V3QA 5AA4B 4F2OA 3I5OA 2E1SA 2F7CA 4N13A 4R9GA 2R6GE 4ZEBA 2PYYA 1QKAA 1A54A 4GFRA 1FCKA 3FATA 5H8HA 2OBGA 3S9MC 3UK4A 1MPBA 2I58A 2OWTA 1B5JA 1PBQA 2CMOA 3V5AA 5IAIA 1Y4TA 3SEWA 1LFGA 5CMMA 2DVCA 1LSTA 5L9MA 1JW4A 1JW1A 1VFEA 3TCFA 3G3FA 3EHSA 1D9VA 4XTCQ 5B7DA 2YJPA 4ELOA 4QHQA 2XXIA 2Z23A 1SI1A 3K1PA 5L9SA 3O6HA 5DVIA 2XXQA 4EQBA 3FJMA 2HZLA 4WEPA 3FXUA 4ZZEA 1SYHA 3IB2A 1R6ZA 3GZGA 4F2QA 1MM6A 2XX7A 4AQ4A 1XVYA 1US4A 4KYEA 3C32A 2I3WA 5L9OA 3MZBA 1WDNA 4LQ5A 3GBBA 3K6VA 2ZYOA 3U94A 4IO7A 3DP4A 3M3FA 1IXIA 5AA3A 4ZEIA 2Q89A 3IJXB 3KGCA 2A5SA 5DVFA 3SEVA 3I6VA 2NOOA 4ESXA 4ISUA 2LAOA 3Q27A 4H67A 5JTYB 1A99A 3TTNA 1B4ZA 4DDDA 3UA8A 1OVBA 1TXFA 3QUJA 3K4UA 2XHDA 1LFIA 2UXAA 3PPPA 3JZJA 4QF9A 3KN8A 4POXA 1MY4A 1B0LA 4C1UA 3IOWA 4QFLA 1NNTA 3E3KA 4EUOA 4XXUA 3IOTA 1AIVA 2XXRA 4PFWA 4IY6A 4LZ5A 1FTJA 3QIMA 4H65A 3G3GA 4I62A 4BDNA 4XKPA 1ZBMA 1FTOA 1B9JA 1FTMA 3HHGA 2RINA 4HCYA 5FTIA 1Y4CA 1CB6A 3A3UA 1IIWA 3TTMA 4RK2A 1NNPA 1MXZA 1IITA 1QUJA 2BJJX 1MXWA 3KEIA 2I0CA 1B5IA 5DEXA 3MPLA 5ITOA 3OO7A 1ZLQA 3KZGA 4NF8B 4HTGA 4JBZA 1UTHA 3CIJA 1LBCA 3MP8A 4GXSB 4IO4A 4R72A 1UIUA 2O68A 1MY0A 5DT6A 1H43A 1B3EA 5H8NB 1LAHE 2I4CA 4OESA 4XKRA 1HSLA 4OFJA 1PDAA 2I4BA 1XHYA 2Q2CA 3MVWA 4G8MA 3RUMA 3VFJA 3T9XB 4U1ZA 3IOUA 4ZE8A 5H8QB 1MXUA 1N7XA 3OSRA 3IO6A 4N07A 1O64A 3N26A 1B5HA 1B3GA 3N94A 1MY3A 1H3DA 3E9XA 4EQ7A 3CFZA 3OD7A 3UP9A 2VOZA 4EXLA 3W15C 3OXNA 2QRYA 1FQBA 3MJNA 3AXFA 4NF5A 4EF2A 2Y7IA 4U21A 3UORA 4GL8A 3VVEA 5HBCA 3K6XA 3T9UA 1N76A 4F1UA 2O84X 3U93A 3HO7A 5F7VA 1FTKA 2W7YA 4QSEA 1A8FA 4OYVA 1R9LA 4P11A 4F1VA 4RNSA 1KWHA 3FVGA 1LB8A 1USYE 3IO4A 2XXVA 1D3KA 4KD5A 3PUXE 2P0SA 1II5A 2QJEA 1IZ1A 3A3CA 2O1MA 4NEDA 1ELJA 4NTLA 4G2ZA 5H8SA 4G68B 1Y3QA 4LZ8A 4F22A 1I6QA 4OXVA 1JVXA 3LSLA 2UVGA 3VXBA 2H98A 1NNKA 1Q35A 2DQVA 3O66A 3IORA 2Y84A 4GLIA 5M2VA 1I6AA 4U4XA 1FQAA 3K01A 4G4PA 4P0GA 2REJA 2V3TA 2F7BA 3SDFA 2I48A 4E0WA 2Z8FA 4TLLB 4RY1A 1DTZA 2Q9TA 1N3WA 3IR1A 3PPOA 3TUSA 5CRYA 3B6QA 4HW8A 1QUIA 4WEDA 4TQUQ 4K3FA 3MUQA 2RF1A 3G3HA 3H6TA 3W9WA 5TU0A 2FYIA 3T93B 4JSOA 5H8FB 3JYRA 3VLVA 4M4GA 3TYHA 1DMBA 4JXIA 3F11A 3U72A 3H03A 4R2FA 4ZEFA 3TODA 2Y7WA 3FJGA 2O6AA 4X1BA 3CI8A 3PGFA 1HSJA 1MPDA 5AA4A 1EU8A 1MRPA 5AE4A 1B6HA 3GBAA 1DPEA 5FHNA 2VD3A 3QK6A 4Z0IA 4Q5TA 1NMUA 1ATGA 4ZEKA 2O69A 3CFXA 3FIRA 3ONMA 1FQDA 1UTBA 4QFPA 3USDA 1B4HA 3N6TA 4BLAA 4NF4B 4QSCA 2R71A 1M5EA 1HSEA 1WVJA 3QSLA 1OIBA 5LOMA 1TWYA 3QAXA 2RCAA 1NH8A 2NWJA 3T66A 4EDPA 3Q28A 1FTLA 4H5FA 3Q29A 2F7AA 3K2DA 3SKPA 2DYXA 1LCTA 3KN3A 1QKBA 4F1YA 1MH4A 1OVTA 5CI5A 4FJPA 1UIVA 2HEUA 1VFDA 5HPQA 2XXUA 2O7UA 1GV8A 3C4MA 1B52A 1QUKA 4OVJA 4R6HA 1XC1A 1F9BA 1Y1ZA 1MXVA 2Z22A 1B40A 3FV2A 3C31A 1S7YA 3V83A 3BFTA 1SW1A 2QS4A 3RN8A 3TPAA 1QULA 4KFQA 2ANJA 3L6GA 3CRBA 1URDA 3R26A 5DVJA 3VE1B 3HV1A 2RCBA 1GR2A 2WKYA 3D4CA 3ILUB 1P1NA 2QMWA 3MVXA 3FASA 4TOZA 1CE2A 4NF6B 1N04A 3K1NA 5FHMA 2VP1A 1FW0A 1N84A 2R9JA 2PBWA 4DXCA 2X7PA 3OENA 5JTYA 1Y20A 2RKMA 2OK2A 3QUFA 3IJOB 4LONB 1SBPA 1MDP1 4GIZA 4PFYA 2V3UA 4DLDA 3VV5A 2DS9A 2XXHA 3ILTB 4C1TA 4RPNA 3TQLA 1PB8A 3T9VA 4RXLA 4O3CA 2FA7A 3CSGA 1B32A 2PMSA 3C33A 2A5TA 2DSFA 2GRVA 4PQJA 3T22A 2XX9A 1XVXA 5F1QA 2YLNA 4H8IA 3TFLA 3HHFA 2H4IA 1MS7A 3IB0A 4MH5A 3KN7A 1RYOA 4I8CA 3LR1A 4LP2B 4ZDMA 4RYAA 1QVSA 1IQ7A 3HSTA 5I2NA 2DOJA 5K2XA 3Q25A 2HZKA 3DLNA 1JETA 4ND9A 2Z8EA 3QXMA 4GD5A 4EXKA 1JQFA 1A40A 2HCAA 2REGA 2ONKE 4DXBA 1MQHA 5KDTB 3S2VA 1AMFA 5BWJA 1P1UA 4DCXA 5H8HB 5L8DA 3UN6A 2KLFA 1LBBA 4QSDA 5AA2A 3C35A 3SERA 3K0VA 3IAZA 2G93A 4E0XA 2YPNA 4KPTA 5H8NA 1PEBA 2ZMBA 3H4ZA 4BDQA 1DPPA 2QS3A 3HPIA 4MLQA 2OWSA 1BP5A 1JEUA 3FVKA 3PD8A 2F36A 1EZ9A 2GH9A 1TT1A 4KCCA 4R2BA 1MM7A 2F5XA 3SEUA 4PP0A 4ELQA 3V89B 3O29A 4IO2A 1NL5A 3S4UA 2F97A 3EN3A 4I1DA 3K6WA 2QMXA 3UIFA 2XD2A 3SESA 3KJTA 4FATA 4GVOA 4H8JA 5FTHA 4ELRA 3RQTA 3ZS6A 3A09A 4F18A 4DIGA 4YB7A 5EYFA 4I9DA 2NXOA 4FE8A 4LZ7A 3H7MA 1TFAA 2M8CA 4OEVA 3N6UA 4BDLA 2QS1A 1A7LA 3KOTA 2V25A 2B3FA 3FD3A 4F19A 3B7DA 4OETA 3K6UA 4F29A 4U22A 3EF7A 1JW5A 1NFTA 2P2AA 3TTLA 4YAHX 2X26A 2Y7PA 1OLAA 2VD2A 2DWIA 2UVHA 3RNNA 1LCFA 4U2RA 2ZNUA 1L5TA 4BDMA 1JEVA 3O28A 3VVDA 4DCYA 3ZSFA 2I6EA 3OO9A 4U23A 2G29A 5I2KB 1B1HA 2DWHA 1UQWA 1O7TA 4JWYA 1DTGA 4JDFA 4LA9A 4OWDA 5I84A 1GVCA 1OMPA 4YICA 4NWCA 3OO6A 1MPCA 3M3KA 2DP8A 2XXTA 4OENA 1EZPA 4KHZE 2E0SA 4FAJA 3LSXA 5I57B 3OELA 5CMCA 4OEUA 5DEXB 2HAUA 4QFKA 3FVOA 1MY2A 3G3IA 1Y3NA 2GFEA 1MQGA 1S50A 1LAFE 1OQGA 5KCJA 3B6TA 1B51A 3IL1B 3PMWA 2ALUA 5I56A 4IGRA 1QW0A 2DVZA 3EHTA 3UGWA 4YB6A 1MY1A 5TPAA 1BIYA 2Q88A 1LAXA 4DXUA 4R6KA 3BKIB 3OOAA 1SW2A 2OCUA 4WKMA 2OLBA 4RK9A 1YAEA 1Y1MA 4KQPA 1IXHA 1US5A 3O2AA 4NF4A 2XXXA 2O1LA 3MW0A 1FQFA 3MQ9A 1MQJA 4KYDA 2F8DA 4ZE9A 3T9HB 2I3VA 5TP9B 4R9FA 2FNCA 2I0BA 4YMBA 2X7QA 3MC2A 4OERA 2Q8JA 1GGGA 3DELB 2DWAA 1H76A 4M1VA 4NE4A 2D21A 1B0HA 1S9TA 4MFIA 3SEXA 1MQDA 1OLCA 1YTVA 4RPOA 1IXCA 4GF8A 5CBSA 4GWOA 3CSBA 2ESNA 4ESWA 2UVJA 1D9YA 1D4NA 3MVYA 1SI0A 1DOTA 1FQEA 5DYHA 3L6HA 2THIA 3TTKA 4JSDA 2H9BA 5ICQA 4YU0A 4X1DA 3S9EA 5A5XA 4RJZA 2QS2A 1SDXA 4ZEDA 3O9PA 4PFTA 1XT8A 3GXAA 1ZTYA 4NMYA 3HCQA 3IK6B 1ZMGA 1M5FA 3M8UA 2OZZA 4XKQA 3CVGA 2GHAA 3MZ9A 3MAMA 1SQYA 3DM0A 3KG2A 3HN0A 4R74A 5CM6A 3FJ7A 3ODBA 3TZAA 2H99A 1XS5A 1B3FA 1R9QA 2PX1A 4QFOA 1BLFA 3FZVA 5EHSA 2PT1A 2HAVA 2XXWA 3G7WA 4YB5A 3RTFB 4QRZA 5BUUA 4IGTA 5IKBA 3C36A 3O6IA 4U4SA 4C0RA 3LBSA 1SVXB 4F39A 2IA4A 2O51A 2RC7A 5I58B 4IO3A 2VHAA 4P0IA 4JWXA 1JVYA 4H0WA 1PB9A 4YKKA 3TCGA 1MG1A 3CFLA 2HXWA 3RT6B 4EF1A 4G8NA 4X9TA 4F3SA 4JB7A 2OJTA 3KOSA 2QSXA 3O97A 5ICTA 1Z7NE 4H6DA 1B05A 3RPWA 3VVFA 2XX8A 5KDTA 1MXYA 1MQIA 4ZZAA 3PUZE 1MDQA 3MWBA 1MXXA 2DE2A 1UTBB 3TMGA 3OSQA 2HFBA 4MBPA 1BKAA 3KJ7A 2CZLA 4Z7EA 3PPQA 3DP6A 1N7WA 4MLVA 5I59B 4IY5A 5ELVA 1IXGA 3TQWA 4UACA 4F3PA 1O63A 3WAEA 4DZ1A 3MPKA 1M5CA 2Q2AA 3BFUA 3OEMA 3U1OA 1J1NA 2H25A 3IX1A 4FIMA 5ISUA 2VGQA 3VLWA 1P1WA 1ZU0A 3PUVE 4POWA 3K00A 4IO5A 1H44A 2P1SA 2V84A 1FQCA 2DE4A 2RC9A 3H3GA 3PUWE 3C34A 3PPNA 3TEPA 4YZZA 4FORA 4F3BA 3D4GA 1B1XA 5JK4A 2ZNTA 1A55A 4NF8A 3VXCA 4GL0A 5KZTA 2AL5A 4Q30B 3M3LA 4H5GA 2F6GA 5CBRA 2ZYKA 5JEIA 4DE8A 3ZKKA 3MP6A 2UYFA 4KR5A 4FEDA 2D3IA 3K02A 1NH7A 3RY3A 4F31B 1P1OA 4YMAA 1SD3A 2PT2A 2DXRA 2QL3A 3H06B 3TKDA 5CMKA 4R75A 5J1DA 2UVIA 1IEJA 3S9NC 4N6PA 3C9HA 1YPNA 2Y7KA 4UA8A 3R7XA 3R6UA 5H8QA 3TCHA 4AB5A 5I2KA 3LUYA 3MP1A 1B7HA 1B2HA 2A5TB 3N5LA 5DTBA 3CG3A 3G3JA 4XIGQ 5B70A 1LGBC 5EHMA 1AL3A 1I69A 3O6GA 4YKJA 3PV0E 5FHOA 5I2NB 5AA1A 5I57A 1M5DA 2RC8A 1ANFA 1B7UA 3H6VA 1ZJLA 4Q8RA 2DE3A 1OQHA 3RTWB 1Q1KA 3JV9A 3DP8A 3TTRA 1N3XA 3MZ1A 2XXYA 3EQ1A 1DSNA 2I49A 5AA2B 3FXRA 4ECFA 4HS7A 4LQ2A 4LATA 3Q26A 4G68A 3E4RA 4PFUA 1N0TA 1ZIUA 4U1OA 1B3HA 4OTEA 2GHBA 1T0KA 4QFNA 4O3BA 2V93A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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