1OIBA

Phosphate-binding protein mutant t141d
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGDSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYAYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Phosphate transport
source organism Escherichia coli
publication title Modulation of a salt link does not affect binding of phosphate to its specific active transport receptor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 105
structure length 321
sequence length 321
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-11-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oibA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1oibA02
2I0BA 1FQFA 2THIA 3IO4A 3CFZA 3B6QA 1VFDA 4JSDA 3FATA 2B65A 2Q8JA 5DEXA 1I6QA 2H98A 1F9BA 2W7YA 3K2DA 4LVQA 3B6WA 1YPNA 3CIJA 4OZ9A 1LFIA 5HM4B 1FQDA 4EQ9A 1QULA 1I6BA 1S50A 3K4UA 1XVXA 2PYYA 3RUMA 5A5XA 1JVYA 1ZU0A 4O3BA 1OLAA 3H6UA 4OMBA 4QSCA 2VD3A 2OWTA 3TKDA 1D4NA 5DVFA 4FEDA 4BDOA 3S9EA 4ELQA 4JXIA 3KSXA 2XXTA 1GV8A 1PBPA 4IO7A 3TODA 3TTLA 4YB6A 4RA1A 2F78A 3KN8A 4M1VA 3TAJA 3QXMA 4OEVA 3CG3A 2X26A 4MF3A 4R72A 1TFAA 1LAGE 4PFUA 5JTYB 1AL3A 5HBCA 3T93B 4TLMB 1MY3A 3K6UA 2DE3A 5JK4A 2H9BA 2V3UA 3LBSA 4RYAA 4FORA 4WXJA 2IA4A 2E1SA 4JWYA 1R1NA 4DXUA 3KG2A 1ATGA 2XXXA 3FZVA 4G68A 3D4GA 3FVGA 2DSFA 1XT8A 3W15C 5H8QA 4AQ4A 3OMBA 1FTKA 3KOTA 2YLNA 1LB9A 1N76A 4FJPA 5H8NB 3T9XB 3I3VA 1AOVA 4ZZEA 5EHMA 4KCCA 2I3VA 1O64A 5HPQA 5B70A 5AE4A 5AA3A 3LSXA 4GRKA 4I1DA 3OENA 5KDTB 2UYFA 3JZJA 3UORA 1WDNA 2V84A 3K6WA 2XXRA 2Q2CA 4QFPA 3L6HA 2HEUA 2Y7PA 1URDA 4F3SA 3U93A 2M8CA 4TLLB 2AL4A 1GR2A 1MXWA 1QVSA 3IO6A 5H8FA 2DVCA 3KSJA 1ZTYA 4DCYA 1MM7A 4OVJA 3ONMA 1H43A 2GH9A 3R7XA 3Q27A 3MUQA 5TPAB 4HCWA 1N04A 4R6HA 4NF4B 3V5AA 1B1HA 3DELB 4DE8A 4Z7EA 4U4SA 2DWJA 4KHZE 1B0LA 1AMFA 3MVWA 1SW2A 3LSWA 3S9LC 2OLBA 3A3UA 3PD9A 4R6KA 3RPWA 3OXNA 2DWIA 4QHQA 2H4IA 3ZS6A 5F7VA 3MWBA 4OENA 4OETA 3W9WA 1UTHB 4MFIA 3PPOA 1NFTA 4QFLA 4NE4A 3TMGA 2VP1A 4GWOA 1LLSA 2HAUA 1ELJA 1ZJLA 2F97A 4E0WA 2QS2A 3QSLA 2Q9TA 2UVIA 3PGFA 3UP9A 1A7LA 4R75A 3TCHA 2HCAA 3SEXA 3LSFB 1M5DA 1M5FA 5L8DA 5H8HA 4ZS9A 4U22A 3C4MA 3HSTA 5ICTA 1HSLA 3U72A 3VVEA 5I2NB 2F36A 3EN3A 4RPNA 3K1MA 4KYSA 1ZKBA 2VD2A 3DP4A 2NWJA 3DLNA 2A5TB 4KFQA 1GVCA 5F1QA 1EZ9A 1XHYA 4EF2A 4Q30B 1MQGA 3PUYE 4WEDA 1QKBA 1LAHE 4MLVA 4O3AA 3FV1A 3TCFA 3VVDA 3VXCA 3SEYA 1TWYA 3MBPA 1POY1 1XC1A 3PD8A 4GD5A 1MS7A 1B5JA 1UIVA 3IOTA 4F2OA 4RXLA 3K00A 1VR5A 1LAXA 4PFYA 4ELOA 4EQBA 4NEDA 2XX8A 1LCTA 3JV9A 3SEVA 1MPDA 3KJTA 3IOWA 3QAXA 1ZMGA 1MDP1 4TQUQ 1FQAA 2HXWA 4MH5A 1SBPA 4QRZA 2Y7IA 3CVGA 3FJMA 1QJMA 3VLWA 3PPQA 3ILTB 4OXVA 2QSXA 3ECRA 2DXRA 5ITOA 4LA9A 5EHSA 3S9NC 3I5OA 3LC8A 1EU8A 3GZGA 1D3KA 3CFLA 5H8NA 4H1XA 3B7DA 3THIA 5CM6A 3CFXA 3MZ1A 2F7BA 3DP6A 3TZAA 5TU0A 2O84X 1JW4A 3O9PA 1ANFA 3HN0A 1UTBA 2DYXA 4OESA 4YB5A 3H6WA 1CE2A 5KDTA 4OTEA 2ZMBA 3TELA 4LZ8A 3LSLA 2Y7RA 3TFLA 3O6HA 3UIFA 3TDJA 3PUWE 2ZYMA 3G3GA 4QF9A 1Y3NA 1FQCA 4FEBA 3IORA 5TP9A 5I2KB 2Q89A 3PMVA 4TOZA 1JETA 3QIMA 3V83A 1O7TA 1O63A 1I69A 3MJNA 3UN6A 3E3KA 1A40A 3U8QA 3PPNA 2XXYA 4BDQA 2D21A 3H6TA 4NF4A 3B6TA 2B3BA 3N6TA 1A8FA 1Y20A 4P11A 2RCBA 4DIGA 2D5WA 4U4XA 3CRBA 4ZEDA 3CSBA 5DVIA 4H5FA 1IEJA 1TXFA 3MAMA 4XXUA 3IJOB 1B1XA 1MXVA 4FECA 4NWDA 4G8HA 1QW0A 3RNNA 3S2VA 4G68C 3ZSFA 2B3FA 3VXBA 3IB1A 2PMSA 1SI1A 1UTHA 5KZTA 3N6UA 3RLFE 1A8EA 4X1DA 1SI0A 4THIA 2X7PA 1DMBA 3VVFA 3IX1A 4YICA 3SKPA 3HHGA 3OSQA 1P1NA 4OWDA 2CMOA 1B52A 5I59B 4XIGQ 3VLUA 3EHSA 3VFJA 1UQWA 1EH3A 4RK9A 4F39A 1MRPA 1MQJA 1LB8A 3MC2A 1MM6A 1ZIUA 2WKYA 3W9VA 2A5TA 1MQDA 1L5TA 5JEIA 4DXBA 4BDLA 2RC8A 2XXUA 4IO5A 1FQEA 1MQIA 1XVYA 1EZOA 1B7UA 3GBBA 4GXSB 1NH8A 1S7YA 3IOUA 1Y3PA 2XD3A 1A55A 3SETA 1IXCA 2XXWA 2VOZA 1FTJA 2VGQA 5CMBA 2R9JA 4R2BA 3RT6B 1FTOA 3UA8A 3MVXA 4L17A 3FGSA 1TFDA 1HSJA 2Z8DA 2ZYNA 3DM0A 1LFGA 4ECFA 2ZNUA 5I57B 3O6IA 4QSDA 2GFEA 3C31A 5L9MA 3N5LA 4X9TA 1MXYA 1ZBMA 4EDPA 3ZKLA 3VV5A 3VE1B 4PETA 2I6EA 2I4BA 4U21A 3K1PA 4OYVA 3PUXE 4NF8B 3UK4A 1RYOA 2I48A 2ALUA 3K0VA 2PT1A 3K6XA 1SW5A 3OO9A 1SQYA 5M2VA 1N7WA 3EHUA 1LFHA 2OZZA 3FASA 1Y1ZA 1D9VA 3HPIA 1LCFA 4YMAA 3SERA 2I58A 3E13X 3HO7A 1MQHA 1URGA 2DE4A 3T9UA 1PBQA 1USYE 1Y3QA 2DWHA 1NNKA 2O1MA 1LBCA 3MVYA 1PC3A 3H7MA 4C1TA 3WAFA 4BDRA 1J1NA 1MPBA 3HV1A 4X1BA 1FTLA 2BJJX 2ONKE 1IXHA 2DOJA 3V89B 5ELVA 1PB8A 4YKIA 4EXKA 2UYEA 4LZ5A 1BP5A 3ILUB 2DE2A 4H8JA 1VFEA 4U2RA 3VLVA 5I2KA 1PEBA 1URSA 1I6AA 1SW1A 1H3DA 4DLDA 1P1OA 3O6GA 3H3GA 1QUJA 2XXVA 3C32A 3G3KA 3MP8A 2Z8FA 3PMXA 4GVOA 1B46A 2V3QA 5I56B 3IJXB 2AYSA 5IKBA 1B3LA 4PFWA 2I49A 3RT8A 4RY1A 4G8MA 4EUOA 1XS5A 4ZE8A 1B3EA 2XXQA 2I0CA 4ZEBA 3LR1A 4F3GA 2O51A 4OFLA 3FJGA 2IEEA 2RC9A 1QUKA 4EXLA 5K2YA 4JSOA 3T96B 4R9FA 4LZ7A 4KCDA 1GGGA 2QPQA 2DS9A 4U23A 1MDQA 3A3CA 3QK6A 2Z8EA 4DZ1A 3RN8A 4ESXA 4ZEIA 5DTBA 3CI8A 3G3HA 4F1UA 4YAHX 4F29A 1N84A 3BFUA 1Z7NE 5CRYA 2PX1A 2E0SA 1SW4A 3G3IA 5FTHA 2H5YA 3C35A 2O6AA 4GXAA 3MP6A 4OQOA 1MH3A 4H6DA 2YPNA 3K01A 4LP2B 4OEUA 4XKPA 4RPOA 2F7AA 2RC7A 1LGBC 2GHAA 4F3PA 1JVXA 3RGYA 4MBPA 2QMXA 1IUDA 3HHFA 4JWXA 1PB7A 4GFRA 4GF8A 4NWCA 3KBRA 5AA4B 4KD5A 3FVOA 4F1VA 2DXYA 1VE4A 4DDDA 1H76A 3M3LA 2R71A 3OEKA 3FXUA 4YU0A 2PVUA 4N6PA 3G3JA 1RYXA 5JTYA 2QMWA 3BBRA 1DPPA 3QUFA 1NH7A 3U94A 3H03A 2Y84A 3MP1A 4R9GA 5J1DA 2DP8A 1OLCA 2D3IA 1OMPA 1A99A 1BIYA 1DSNA 3FXQA 1DPEA 4QFNA 4HCYA 2ESNA 1B3FA 5I57A 3FJ7A 2ONSA 3TTKA 3IAZA 4FE8A 1MG1A 3FXRA 2OWSA 3PU5A 1M5BA 3PUVE 2AL5A 4OHNA 4XKQA 4YKJA 4GQOA 4NF6B 2A5SA 4NF8A 3UGWA 4KPTA 3FVKA 1M5CA 2HQ0A 4HS7A 1PDAA 3T9VA 1D9YA 1MY0A 3MPKA 3MPLA 2YJPA 2NVUB 5AA2B 4OFOA 2REJA 1EZPA 1NMUA 1VSOA 1GTKA 4Q0CA 4PFTA 3O97A 5BUUA 2I3WA 2Q88A 3OSRA 4R74A 4IY6A 1Y4CA 4O3CA 1B40A 4G8NA 3K1NA 5TPAA 2P0SA 1JEUA 2NUVA 4POWA 3HCQA 4JB7A 3KEIA 2UVHA 3JYRA 2HZKA 4GOTA 1MY4A 2QS3A 3GLBA 3I6VA 2PBWA 3SESA 5AA2D 3EF7A 2RCAA 4RJZA 4ISUA 1B5HA 1ZLQA 2OCUA 3M3KA 4FIMA 4P0GA 4H5GA 4M4GA 2XXHA 3KJ7A 4G4PA 2UXAA 3H6VA 5I56A 4XTCQ 2XHDA 4IY5A 1Y9UA 5DT6A 1RKMA 1IXGA 4GLIA 4DXCA 4FAJA 1IXIA 1BKAA 3IR1A 1SDXA 1SYIA 4ONYA 4HW8A 1Z7ME 3D4CA 4Q8RA 1DTZA 1NNTA 2RKMA 3FIRA 4DCXA 1NKXA 2F6GA 3C9HA 4H8IA 3KFMA 1JW5A 2OK2A 2ZXTA 4NMYA 2QL3A 4IO6A 4QFOA 5H8HB 3RTFB 4ZEKA 1Q35A 4UA8A 2O68A 2DQVA 5CMMA 3R6UA 1KWHA 1DTGA 2P2AA 5I2NA 1OQGA 4R73A 2LAOA 1P1WA 2FYIA 4H67A 4IGRA 4N13A 4YKKA 3L6GA 4Z0IA 1JW1A 1H44A 3U1OA 2OJTA 4QSEA 1US5A 3A09A 4AB6A 4NF5B 1N3XA 2XD2A 2O1LA 4YB7A 3Q28A 3KN3A 1LSTA 4UACA 4G2ZA 4KYDA 1SYHA 2REGA 1IQ7A 3KGCA 3T9HB 2GRVA 4XKNA 4Q5TA 5AA4A 1MXXA 5FHMA 4WKMA 1FQBA 2KLFA 4X48A 4F22A 2F6PA 4G77A 3PUZE 5ITPA 4PQJA 1MXUA 3BKIB 2XX9A 3FUZA 5EYFA 1R9QA 3TTNA 3OO7A 1US4A 5FHOA 2ZNTA 4NTLA 1NNPA 1B58A 2V25A 4YMBA 1MH4A 4GIZA 2Y7WA 5B7DA 4GL8A 2UVJA 4H0WA 1JQFA 5FTIA 1WODA 4F2QA 3MW0A 1Y4TA 2NOOA 3SEUA 1PB9A 3H4ZA 2P1SA 4R2FA 3QUJA 3G7WA 3IL1B 3MQ9A 3S9MC 4NF6A 4ESWA 2ANJA 5CMCA 5CBRA 1USYH 1N0TA 1UTBB 4C1UA 1N7XA 3GBAA 3PPPA 2O69A 4EQ7A 3C33A 4F3BA 1MXZA 1B4HA 1B2HA 1B5IA 3ZKKA 2ZYOA 3S4UA 5AA2A 5K2XA 2RINA 2F7CA 3OEMA 5L9OA 2ZYKA 3DP8A 3USDA 4BDMA 1OVBA 3FD3A 2F5XA 4PE5B 2ABHA 5TP9B 4JWOA 4ELPA 2QJEA 5ISUA 5CMKA 3TPAA 2F35A 5KCJB 4LUBA 3OOAA 5DVJA 3RQTA 3O66A 3CR9A 4AB5A 4R6YA 1MPCA 4RNSA 2DVZA 4LONB 1TT1A 1NL5A 2GHBA 3M3FA 4XKRA 5I58B 4IGTA 3MZ9A 5CC2A 1JEVA 4U1OA 1FW0A 2FA7A 4ELRA 4HTGA 4ZE9A 3M8UA 1LAFE 3N26A 4F1YA 3T66A 3TCGA 2CZLA 3Q29A 1M5EA 3OD7A 2DWAA 2ONRA 2Z22A 2I4CA 3FV2A 5DEXB 1MY2A 3EHTA 1II5A 1CB6A 3TTMA 4U1ZA 4WEPA 5H8SA 3Q26A 1LBBA 4I9DA 3CSGA 1SVXB 5ICQA 5CBSA 1B32A 3T22A 1A54A 4IO2A 4E0XA 1SD3A 5A5XB 5I59A 4GL0A 1YAEA 4MLQA 1HSEA 4F19A 1NNFA 3PPRA 1BLFA 2HZLA 3FVNA 4JBZA 2O7UA 1H45A 1B05A 2O7IA 3OELA 3VDFA 1QKAA 3CG1A 3K6VA 3ODBA 3G3FA 1IITA 4QFKA 5I84A 1R9LA 4ZZAA 4K3FA 3TEPA 4KR5A 2FNCA 4F31B 2XXIA 4H65A 2VHAA 3V8XB 1B6HA 1FTMA 1YTVA 3SEWA 3PMWA 4NF5A 4PP0A 4FATA 1JNFA 2H25A 1AIVA 1IIWA 3C34A 4OFJA 1P1QA 4LQ2A 3LUYA 3O29A 1B3GA 3P7IA 1WVJA 2H99A 4ND9A 2QS4A 1P99A 3E4RA 1OVTA 3TUSA 1Q1KA 4ZDMA 2Q2AA 3IK6B 1XOCA 1AH5A 4G68B 3KN7A 1B4ZA 1POTA 3E9XA 5H8QB 4KI0E 4JDFA 2V93A 4N07A 3TQWA 1B7ZA 3U92A 3KZGA 3MVZA 3OO8A 3O28A 4IO4A 5IAIA 3Q25A 1B9JA 1OQHA 3QYTA 2HAVA 3H06B 3RY3A 3F11A 4YZZA 2Z23A 1B3HA 4IO3A 1B7HA 2HFBA 4I8CA 1R6ZA 3SDFA 2Y7KA 3TQLA 1DOTA 3IOVA 1OIBA 2XXPA 5H8FB 2F34A 1N3WA 1T0KA 4ZECA 2G29A 4P0IA 5CI5A 3EPEA 2AIXA 2V3TA 3IB0A 2RF1A 4LQ5A 3IB2A 1YCJA 1B0HA 4IB2A 2R6GE 5L9SA 4ZEFA 3TTRA 4F18A 2ZNSA 3C36A 2XX7A 1Y1MA 2QS1A 2G93A 1P1UA 3GXAA 1FCKA 4EF1A 4RK2A 1IZ1A 3TYHA 3OO6A 3KOSA 2PT2A 2NXOA 5KCJA 2OBGA 1BTJA 3MZBA 1B51A 3EQ1A 4I62A 2F8DA 5AA1A 2UVGA 4YKPA 3AXFA 5LOMA 4C0RA 4KYEA 4BLAA 4OERA 2QRYA 4POXA 3RTWB 1MY1A 4LATA 5BWJA 1QUIA 3N94A 2X7QA 3K02A 5DYHA 1UIUA 5FHNA 5I58A 4BDNA 3PV0E 3R26A 3BFTA 3WAEA 4KQPA 1S9TA 3O2AA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CEXA 2I0BA 1FJ6A 1FQFA 1FJ9A 2THIA 4JVDA 3IO4A 4PC9A 3CFZA 3B6QA 1VFDA 4JSDA 2HXRA 3FATA 1KA0A 2B65A 5FBPA 2Q8JA 5DEXA 1I6QA 2H98A 4NGUA 1F9BA 2W7YA 3K2DA 1G0HA 1LBWA 4LVQA 3B6WA 1YPNA 3LV0A 3CIJA 4OZ9A 1LFIA 4X04A 5HM4B 1FQDA 4EQ9A 2L5VA 1QULA 1I6BA 1S50A 3K4UA 1XVXA 4N81A 2PYYA 3RUMA 5A5XA 1JVYA 1ZU0A 4O3BA 1OLAA 3H6UA 4MIJA 4OMBA 2CZIA 1RDZA 4QSCA 2VD3A 1NV7A 4LN5A 2OWTA 3TKDA 1D4NA 5DVFA 4FEDA 1FBGA 3B50A 4BDOA 3S9EA 4ELQA 4JXIA 4GWWA 5EQ7A 3KSXA 3SZPA 2XXTA 1GV8A 1PBPA 4IO7A 3TODA 3TTLA 4YB6A 1EYJA 4RA1A 2F78A 3KN8A 1LBXA 4M1VA 3TAJA 3IFAA 3QXMA 4OEVA 3CG3A 2X26A 4MF3A 4R72A 1TFAA 1LAGE 4PFUA 5JTYB 1AL3A 2WBDA 5HBCA 3T93B 4TLMB 1MY3A 3K6UA 4OVRA 3BIHA 2DE3A 5JK4A 2H9BA 2V3UA 3LBSA 1K9ZA 4RYAA 4FORA 4WXJA 2IA4A 2E1SA 4JWYA 4NX1A 1R1NA 3KG2A 2XXXA 1ATGA 3FZVA 4G68A 4DXUA 3D4GA 3FVGA 2DSFA 1XT8A 2KQZA 3W15C 5EQAA 5H8QA 4AQ4A 3OMBA 1FTKA 3KOTA 2YLNA 1LB9A 1N76A 4FJPA 1BK4A 5H8NB 3T9XB 3I3VA 1AOVA 4ZZEA 5EHMA 4KCCA 2I3VA 1O64A 5HPQA 5B70A 5AE4A 5AA3A 3LSXA 4GRKA 4I1DA 3OENA 5KDTB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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