1OKNA

Carbonic anhydrase ii complex with the 1okn inhibitor 4-sulfonamide-[1-(4-n-(5-fluorescein thiourea)butane)]
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structure-based design of a sulfonamide probe for fluorescence anisotropy detection of zinc with a carbonic anhydrase-based biosensor.
pubmed rcsb
total genus 76
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1996-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1oknA00
4COQA 5LMDA 1TEUX 2FW4A 5FNIA 3Q31A 1G52A 5G0BA 3SAXA 4CNWA 3SAPA 4KAPA 5DSNA 4ZWZA 1G1DA 3T84A 4WR7A 4JSWA 1G48A 4Q8YA 1I91A 1YDCA 1I90A 3DCSA 1CAYA 1HECA 3FW3A 1CVEA 5BRVA 3M98A 1HCBA 9CA2A 3MHLA 1CAZA 4PYXA 3OY0A 3UYNA 1YO2A 5BNLA 1BNVA 5EHEA 3NJ9A 1I9NA 1I9PA 3DVBA 1BNTA 3CAJA 4QIZA 3KNEA 1BNWA 1YO0A 2X7SA 4KNIA 4Q07A 4Q99A 3KONA 4XZ5A 3S9TA 3K7KA 4GL1X 1CCSA 2Q1QA 4WUQA 3RLDA 4YVYA 3IBNA 5DSKA 5EKJA 1RZBA 4FL7A 5CACA 4PQ7A 3MNKA 3M04A 4QJXA 1CNWA 4LHIA 3NI5A 1CAOA 1HUGA 3OYSA 4KP5A 1FQMA 3DVCA 5E2SA 5J8ZA 3DCCA 3F4XA 4Q8ZA 3BETA 3SBHA 3P5LA 8CA2A 1FSNA 3N0NA 5DSOA 5JQTA 4M2VA 2WD3A 2FNMA 4ZWYA 3HKUA 3OYQA 2NXRA 4KUYA 4L5UA 4Z0QA 3T85A 4Z1NA 4ETQC 5E2RA 2WEOA 1KEQA 4QJMA 4YGLA 3MYQA 4MO8A 2WEHA 2EZ7A 3IBUA 6CA2A 5BRWA 4Z1EA 4R5BA 4QY3A 4R5AA 4C3TA 1I9MA 1DCBA 3HLJA 4YGKA 5EHVA 4E4AA 3DC3A 1G0EA 3MZCA 1XEVA 4IDRX 5JG3B 3MWOA 3DBUA 4Q7PA 5FL5A 4PXXA 1TG9A 3M2NA 1G45A 5DSPA 1YDDA 2CBBA 1HEAA 5BRUA 4YYTA 1CCTA 4QSIA 3T5UA 5FNHA 1KOPA 1A42A 3M3XA 4BF6A 3VBDA 2ILIA 5FNMA 3V5GA 1KWRA 5FLRA 4MDMA 4YGFA 3HKTA 5SZ0A 1ZGEA 4Q6DA 1AM6A 4DZ7A 5FNKA 3MMFA 4ZWXA 1CNJA 4ZAOA 3S77B 3V7XA 3KOIA 5FL4A 3MNIA 1CRAA 3RYYA 4K0ZA 1BN3A 1CNIA 4CACA 4FU5A 4RH2A 5BYIA 4YGJA 1ZGFA 1TE3X 2FOYA 2HNCA 2FMGA 3B4FA 4E9OX 3ML5A 4K0TA 1BNMA 4L5WA 3U45X 4E5QA 3B1BA 3C7PA 4HF3A 1UGCA 1ZSAA 3SBIA 4M2UA 3M2ZA 3MHMA 4Q8XA 3S72B 3S74B 4JS6A 4R59A 3M1KA 4YXOA 2NNOA 1RZEA 3CYUA 5JEHB 4Q08A 1LGDA 3EFTA 1ZFQA 1EOUA 4Q06A 4E3DA 2HL4A 4M2WA 3PJJA 5SZ3A 3JXFA 3T83A 4G0CA 3M40A 3IGPA 4ZX0A 7CA2A 2IT4A 3MHIA 1T9NA 3M1WA 4Q90A 4TWMA 3DD8A 5AMDA 1OKMA 1CAJA 4Q7VA 2NXTA 1BICA 1TEQX 4RUYA 3M2XA 1CALA 2CBEA 3P44A 3TVNX 4E3HA 5FNLA 1RAZA 1V9IC 5JGSB 4CNXA 3F7BA 5FLOA 3S73B 1CA2A 3V3JA 4HEWA 4FIKA 3IBLA 5G01A 1G0FA 4QK2A 3S75B 1XEGA 4HEYA 2CABA 2FOQA 5DVXA 3RYZA 1BN4A 5JESB 1I8ZA 2NWYA 4M2RA 5DRSA 3RYVB 5EH5A 3DAZA 5DSMA 1XQ0A 4QJ0A 2QP6A 3D8WA 3N3JA 2EU3A 1CVHA 3HKNA 2NMXA 2H15A 3W6HA 1Z9YA 4XIWA 5FLQA 4Q7WA 1ZE8A 5EH8A 2GD8A 4KUVA 3P4VA 2CBCA 4G7AA 5A25A 4RIUA 4CNVA 1CILA 2OSFA 5SZ5A 2ABEA 4FRCA 4ILXA 3HFPA 3W6IA 5DSJA 5G0CA 3U7CA 1CVBA 4YXUA 4Q81A 1G4OA 4HU1A 1G46A 4K1QA 3P3HA 3RG3A 3D9ZA 3MNJA 1CVAA 4YXIA 4WUPA 1V9EA 1FLJA 3TVOX 1TH9A 2X7UA 1FR4A 2AW1A 1HVAA 5EZTX 3M5TA 5EHWA 5SZ1A 2FMZA 2VVAX 3T82A 3RZ1B 3KKXA 5AMLA 4ITOA 4RN4A 3MNAA 4ZWIA 3M5EA 2FOVA 3OILA 3DCWA 1LZVA 1ZNCA 3R17B 4QSJA 1ZSCA 2WEJA 4RUXA 3PO6A 1CANA 4BF1A 5FDIA 1CAHA 4Z1JA 4PZHA 1BNUA 1DCAA 2FOSA 4KNNA 2VVBX 2Q38A 4YHAA 5DOHA 1H4NA 5CJFA 3T5ZA 1FQNA 2H4NA 4KUWA 3MDZA 1JCZA 1I9OA 3LXEA 4Q09A 5A6HA 3OIMA 4YWPA 1KWQA 5FLPA 1BNQA 4Q0LA 3KS3A 4JSAA 3V3GB 1I9LA 1TB0X 5FNGA 4Q9YA 3S76A 1RZDA 1YO1A 3M96A 1CNYA 1DMXA 3OKUA 4UOVA 5DSRA 4IWZA 1RJ5A 3DD0A 2WD2A 1IF5A 3P5AA 3S8XA 3RYXB 1THKA 5SZ7A 3IBIA 3MHOA 4E3FA 1G3ZA 3S78B 4ITPA 3D93A 3M67A 1CZMA 1AVNA 3M2YA 3S71B 2NNVA 4Z1KA 4MTYA 1Z97A 3V3IB 2NNGA 4HT2A 4QSAA 1CNCA 3EFIA 3F7UA 1HUHA 1FSRA 1HEBA 5FNJA 2NN1A 5C8IA 1FSQA 1CNBA 2HFWA 1CVDA 3D92A 1KOQA 2HD6A 1UGAA 4RUZA 2CA2A 2EU2A 3P55A 1HCAA 1FQRA 1IF6A 3N2PA 4HT0A 4YGNA 5AMGA 4E49A 1H9NA 3ZNCA 2ZNCA 4QK1A 4QK3A 4CA2A 1FQLA 3FFPX 1UGDA 5E2MA 5E5UA 3CZVA 4Q83A 1CINA 4RIVA 2NWOA 4K0SA 2HKKA 3IAIA 3V2JA 1I9QA 3DA2A 5JDVB 3MNUA 4JSSA 3RZ8A 5E2NA 4CNRA 1YDAA 1CRMA 1CAMA 1UGGA 2X7TA 2FNNA 3KLDB 5JEGB 2POVA 1CIMA 3GZ0A 3M14A 1OKLA 2POWA 4PYYA 5JG5B 5CLUA 5CA2A 2QOAA 3RJ7A 4Q7SA 1DMYA 3IEOA 3JXHC 3FE4A 5FDCA 4YX4A 1UGEA 5DSIA 4N0XB 4Y0JA 3M1QA 5EKMA 1BN1A 1RAYA 4Q78A 1UGBA 1CNKA 1RJ6A 3ML2A 3HS4A 4HEZA 4L5VA 4RFDA 5DSLA 2POUA 3UYQA 5JEPB 5SZ6A 3RGEA 1G4JA 1MOOA 5SZ2A 4QJOA 1CCUA 1JV0A 1JD0A 4QJWA 2F14A 1CVFA 2WEGA 5JQ0A 2NNSA 2AX2A 3DV7A 3BL0A 3V3HB 2QO8A 3P3JA 5G03A 2NN7A 3D0NA 4Q6EA 3RZ5A 1IF8A 1BNNA 5FLTA 1H9QA 4TWLA 3DC9A 1RZCA 4XE1A 4MLXA 1IF4A 1ZFKA 1G53A 4WL4A 3DVDA 2NWZA 1J9WA 1HEDA 3U47A 2NWPA 3BL1A 4KNMA 3MNHA 3QYKA 3K34A 1CNXA 1G54A 4QJPA 5JGTB 1CVCA 1ZSBA 2HOCA 4QSBA 1OKNA 5DSQA 5FLSA 1Z93A 3OIKA 2W2JA 1G6VA 1BV3A 2O4ZA 1TBTX 3RG4A 3V3FA 1TG3A 4CQ0A 3TMJA 12CAA 3RZ0B 4JSZA 4WW6A 3L14A 1OQ5A 3ZP9A 1CA3A 2FNKA 3KIGA 3JXGA 4QIYA 4K13A 5EOIA 4Q49A 3RZ7A 1CAKA 1RZAA 4XFWA 4RFCA 4DZ9A 4E3GA 1ZH9A 2NXSA 2Q1BA 3K2FA 4WW8A 5E2KA 5EH7A 1CNGA 3F8EA 4MDGA 1Y7WA 3KWAA 4KP8A 2FOUA 5DOGA 2OSMA 3M1JA 3R16A 1CAIA 4ZX1A 3V2MA 4LU3A 5L3OA 5SZ4A 3KOKA 5EIJA 1LG6A 3NB5A 4N16A 4QEFA 4LP6A 1CNHA 1MUAA 4BCWA 2GEHA 4KNJA 1UGFA 5IPZA 4X5SA 1TTMA 3N4BA 3MHCA 1AZMA 4Q87A 1IF7A 3M5SA 3P58A 2CBDA 4KV0A 2CBAA 3PYKA 4QTLA 5EKHA 1URTA 3S97A 5E28A 3HKQA 5FL6A 1LUGA 1IF9A 4HBAA 3OKVA 3U3AX 4FVNA 4MDLA 1FR7A 5L6KA 1F2WA 1BCDA 1BZMA 1LG5A 1YDBA 4XIXA 1XPZA 5E5RA 4MLTA 3RYJB 5HPJA 4FPTA 3CA2A 4FVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4COQ A;  5LMD A;  1TEU X;  2FW4 A;  5FNI A;  3Q31 A;  1G52 A;  5G0B A;  3SAX A;  4CNW A;  3SAP A;  4KAP A;  5DSN A;  4ZWZ A;  1G1D A;  3T84 A;  4WR7 A;  4JSW A;  1G48 A;  4Q8Y A;  1I91 A;  1YDC A;  1I90 A;  3DCS A;  1CAY A;  1HEC A;  3FW3 A;  1CVE A;  5BRV A;  3M98 A;  1HCB A;  9CA2 A;  3MHL A;  1CAZ A;  4PYX A;  3OY0 A;  3UYN A;  1YO2 A;  5BNL A;  1BNV A;  5EHE A;  3NJ9 A;  1I9N A;  1I9P A;  3DVB A;  1BNT A;  3CAJ A;  4QIZ A;  3KNE A;  1BNW A;  1YO0 A;  2X7S A;  4KNI A;  4Q07 A;  4Q99 A;  3KON A;  4XZ5 A;  3S9T A;  3K7K A;  4GL1 X;  1CCS A;  2Q1Q A;  4WUQ A;  3RLD A;  4YVY A;  3IBN A;  5DSK A;  5EKJ A;  1RZB A;  4FL7 A;  5CAC A;  4PQ7 A;  3MNK A;  3M04 A;  4QJX A;  1CNW A;  4LHI A;  3NI5 A;  1CAO A;  1HUG A;  3OYS A;  4KP5 A;  1FQM A;  3DVC A;  5E2S A;  5J8Z A;  3DCC A;  3F4X A;  4Q8Z A;  3BET A;  3SBH A;  3P5L A;  8CA2 A;  1FSN A;  3N0N A;  5DSO A;  5JQT A;  4M2V A;  2WD3 A;  2FNM A;  4ZWY A;  3HKU A;  3OYQ A;  2NXR A;  4KUY A;  4L5U A;  4Z0Q A;  3T85 A;  4Z1N A;  4ETQ C;  5E2R A;  2WEO A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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