1OQMA

A 1:1 complex between alpha-lactalbumin and beta1,4-galactosyltransferase in the presence of udp-n-acetyl-galactosamine
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
TELTKCKVSHAIKDIDGYQGISLLEWACVLFHTSGYDTQAVVNDNGSTEYGLFQISDRFWCKSSEFPESENICGISCDKLLDDELDDDIACAKKILAIKGIDYWKAYKPMCSEKLEQWRCEKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase, biosynthetic protein
source organism Mus musculus
publication title Structure-based design of beta 1,4-galactosyltransferase I (beta 4Gal-T1) with equally efficient N-acetylgalactosaminyltransferase activity: point mutation broadens beta 4Gal-T1 donor specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Alpha-lactalbumin
total genus 40
structure length 123
sequence length 123
chains with identical sequence C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-03-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1oqmA00
1NDGC 1T6VL 2CWIA 1UACY 1EQEA 5KXNA 3A93A 1HEQA 3IWRA 4H94A 3M18B 5KY1A 1LZNA 1IP7A 5DN4A 2C8OA 4Z3MA 4M6DA 1MLCE 2MEGA 4QGZA 3TMWA 3FE0A 4GN3A 1UIFA 5I53A 3AZ6A 3A90A 4OW1A 1B5UA 4PRQA 2F2NA 2D4KA 2XBSA 5IDDA 1LHKA 1NQIA 1BB3A 1YKYX 5DM9A 4FDYA 4WLDA 5LXWA 1LJGA 5FELA 1GB0A 1OQMA 4LT3A 1GBWA 1F10A 1C08C 1YIKA 4LYZA 2W1MA 4PPOA 2C8PA 4Z98A 4DDAA 4HTNA 1IP3A 1LZYA 3WUMA 2RSCA 2DQCY 2BQJA 1VFBC 1LZCA 1CJ7A 1QTKA 4DDBA 1AM7A 4TUNA 2YBMA 1GFKA 2BLYA 4TSCA 3TXJA 2NWDX 1G7HC 4OOTA 3WUNA 1IWUA 1CKHA 3AJNA 3TXGA 5LINA 1O23A 5C6JA 4KT3A 5HNCA 1B9OA 5I4WA 1GBXA 2YBLA 3E3DA 2Z39A 1DI5A 2MEAA 1QIOA 4ETDA 5KXYA 2Y8PA 1PZYA 3P65A 5HMVA 4II8A 5IHGA 1YANA 4OWEA 5I4XA 4YF2A 5IELA 3EO5A 1JKCA 1LMNA 4ML7A 3WMKA 4N1CC 4WL7A 5EBHA 1UUZC 5KKIA 1BHZA 1V7TA 1IP5A 1CKDA 3RW8A 4B4IA 4OOOA 5KXTA 1OUDA 2I6ZA 1TDYA 1BWIA 4TX7A 1IOQA 5E4PA 1LMQA 4NGYA 4XJBA 4BAFA 2G4PA 1BVXA 1OUCA 3LN2A 4H9FA 1CKFA 1LKSA 4XYYA 5LVGA 1IC4Y 2ZQ4A 5ILFA 3LZ2A 1REXA 1HMLA 1GBZA 1LZSA 4HJVA 2H5ZA 1IR8A 1YAQA 1IEEA 5LVJA 1LZAA 1UBZA 1HSXA 2HEBA 3TMVA 1UIGA 3B0KA 1ZV5L 1B0DA 1BB5A 1WVVA 2W1XA 5B1FA 1B7QA 2LYMA 1LSFA 3W6CA 1FLQA 1XGQC 2ZYCA 1GFTA 1LAAA 3AZ5A 4GCFA 5D5FA 3W6FA 1IWYA 3ATOA 4ETBA 4H92A 5KXKA 4HJYA 1JEFA 1YKXX 3SP3A 1OUAA 1T3PA 5LAFA 1LZ1A 2BQKA 3WU8A 3B0OA 4NIJA 5KXLA 1XEIA 4HSFA 4YENA 5LIOA 4B1AA 2BQCA 4NHPA 1C43A 1GFHA 4MR1A 4PGJB 2BQFA 1LTMA 4PJ2C 3WU7A 3AZ7A 4DD7A 5FSTA 1GF6A 4N0JA 4NGOA 1DI4A 4OWHA 1GB6A 4FJRA 4DD3A 2WARA 4AXTA 4DDCA 1DPXA 1LMCA 2HEDA 4Z41A 3CT0A 1VDQA 4WM3A 1WTNA 4HPIA 5B06A 1JUGA 1IP4A 1YROA 3LYOA 4QEQA 1JITA 5ILCA 1LMPA 1UC0A 4MCKA 1GF0A 4H9IA 3TXHA 1JJ0A 1RI8B 1LZ9A 4HJZA 3WYHA 1RFPA 3WW5A 5B07A 1FDLY 4NSGA 2H9KA 4DC4A 5FHWA 1D0LA 3K3TA 5I4YA 1TBYA 1B5VA 1W08A 1HC0A 1B7RA 4NY5A 4AGAA 2ZQ3A 3A67Y 1BVKC 1HNLA 1CKGA 1B5WA 3QNGA 4NHTA 3B0IA 5C6LA 4NG8A 1IC5Y 2DKVA 2HEFA 1D0MA 5DLAA 5L3HA 4BS7A 2MECA 4D9ZA 5FCPA 1GD6A 1HFYA 2Q0MX 3TXBA 1GB9A 3WPLA 4G9SA 3CSQA 4WM6A 2DQHY 4A7DA 1RCMA 2A7FA 3TMUA 1LHIA 1IWWA 4J1AA 1D0KA 1IX0A 1UA6Y 4MSTA 208LA 1SLYA 5LYMA 4LT0A 1P2CC 2EIZC 4NHQA 1DXJA 4GCBA 4WM2A 193LA 3IJUA 4RW1A 1LKRA 1GFUA 1XSFA 2CDSA 2IFFY 2BQGA 1HELA 1N4FA 1BB4A 1XGUC 1GF7A 1LSAA 4H9CA 4WM5A 4XJIA 3T6UA 3WW6A 3CB7A 2F30A 4GCEA 1H6MA 1LMTA 1LPIA 1ALCA 1YAOA 1XGPC 5APFA 3VWOA 1LSBA 4OWBA 1HFZA 2Z2EA 3F6ZA 1LJJA 1B5ZA 1V7SA 4WO6A 5KXPA 1LSZA 3T36A 4P2EA 1OUGA 1UCOA 3GXRA 4B4JA 4GCDA 8LYZA 1ZVYB 1LZTA 1GAYA 4X3BA 5F16A 4ET8A 1HEPA 1GEZA 2Z12A 4NGZA 1LMAA 3EXDA 1B5YA 4WG7A 4NFVA 4ZIXA 4HV1A 4UWUA 1QSAA 4CFPA 1GDXA 7LYZA 3RT5X 5L3IA 1GE0A 2BQNA 1LYSA 1RE2A 132LA 1IOTA 1G7LC 1LMOA 1LJ4A 1QSWA 1ZVHL 4C5FA 5LYZA 2ZNWY 1B7LA 1A2YC 1BWJA 1TEWA 1CJ6A 3ATNA 4EOFA 1LZ4A 1PS5A 1LJHA 1FN5A 2D4JA 2XJWA 1HMKA 4NG1A 2ZWBA 1DKJA 5M1YA 4R0FA 2YBNA 5LA8A 1LJ3A 3LHMA 3W6BA 1I56A 1GE1A 1QDTA 4H8YA 1IP6A 1C10A 1C45A 3P64A 1JKBA 3HBHA 3OJPA 4LGKA 4QDNA 3WH1A 1LJFA 1F6SA 4QY9A 4LYBA 5KXRA 4U3XB 1HEMA 1WQMA 4XN6A 3P4ZA 1LSEA 1OUEA 5II3A 3CSZA 3GXKA 1FBIX 1I1ZA 2ZNXY 1NKHA 1HERA 2FYCA 4TSBA 3WUAA 1EL1A 2W1YA 4B49A 1IR9A 5D5CA 4OWAA 135LA 2MEBA 1JTPL 4PHIA 3ZEKA 2GV0A 3A92A 3WVYA 2G4NA 154LA 1HF4A 2YDGA 3KAMA 5APCA 1DI3A 1EQ5A 2I26L 4YEOA 1LZ8A 2Z2FA 4N5RA 4N8ZA 1LZEA 4H9HA 4DWXA 4ETEA 4RDSA 1WVUA 4NEBA 1IIZA 1YKZX 3WPJA 4UWNA 2HUBA 1KIRC 2LZ2A 4NHSA 1GB7A 4ANRA 1H87A 3AW6A 2MEDA 4GLVA 4W94A 3ZVQA 1G7MC 1IWXA 1GF3A 1WQNA 2CGIA 2Z18A 3HFMY 1MELL 1CJ8A 3CSRA 4H93A 5HLLA 1LJIA 2BQAA 4GCCA 1AKIA 5T3FA 4WM4A 4G49A 5F9XA 2H9JA 3TXDA 5A3ZA 4LFPA 2EKSC 1LOZA 1JKDA 1B7NA 2HEEA 1HEWA 3RNXA 1LZ6A 3QY4A 3A95A 3W3EA 1LCNA 4C3WA 3AB6A 4BADA 4E3UA 1JSEA 1YQVY 4J7VA 1UIAA 4G4BA 2BAAA 2D6BA 3A96A 4KPMA 4H9EA 4H1PA 4OWCA 3AYQA 1WQQA 3W6EA 4B0DA 1J1PY 1IVMA 4GN4A 1GB3A 1IWTA 1LYYA 1UICA 1VDTA 2BPUA 3ULRA 1REZA 1LJEA 2DQIY 1GAZA 1GFEA 4GLAA 2BQEA 1LHHA 1AZFA 4HTKA 1OP9B 1UIHA 2HU1A 9LYZA 3EMSA 5C6IA 4LT2A 5F9UA 5HNLA 1G7JC 3WXTA 1VEDA 3A94A 1GFVA 2YBJA 1TAYA 2BQLA 1DKKA 1GB5A 2BQBA 1DZBX 1JJ1A 2BQOA 1B7PA 1B2KA 2BQHA 3LYMA 1BQLY 3LYZA 4W96A 1YL1X 4J1BA 1IY4A 1YAMA 4DD0A 1B7OA 1NDMC 2LYZA 2N5ZA 1IOSA 1FLUA 2ZIKA 1FLWA 1WQRA 4WM1A 5HMJA 1LZ5A 4H8XA 3FI7A 4B4EA 1YL0X 4CGEA 3AGGG 2W1LA 3CQLA 2DQGY 3P66A 2A7DA 1JPOA 1J1XY 1LZBA 2G4QA 4PRUA 4R6CA 1JTTL 1NF5A 5KKJA 4CFOA 1VDSA 2YSSC 2Z37A 1LSNA 4RLMA 4WLTA 4ZEEA 4NWEA 5L9JA 5AMYA 1BWHA 1GFJA 1BB6A 4NGVA 1OUHA 1GHLA 4LYCA 3TXKA 3W6DA 3AW7A 1LSGA 2ZILA 1HHLA 2YVBA 1B7SA 3RU5A 2XBRA 1CKCA 4RW2A 1GB2A 4I0CA 3WULA 4YM8A 1GFGA 1JSFA 2VB1A 1FKQA 2BQMA 1NHEA 2HECA 1B7MA 1YAPA 1YILA 1REMA 1AT5A 2IHLA 4WOAA 3TXEA 1ZMYL 3A3QA 5LVKA 5KXSA 4DD1A 5LA5A 1F0WA 1KIQC 1GF9A 2AUBA 2XTHA 3N9AA 1GFRA 1VATA 1INUA 4LFXA 3WPKA 2LHMA 4WLYA 4HP0A 2DQAA 3CT5A 3W6AA 2LYOA 2I25L 4DD2A 5KJ9A 1JKAA 5APEA 5B1GA 3ZVQB 4ZFPA 1NBZC 1JWRA 3CT1A 1GE4A 2YBIA 4ET9A 1GEVA 3WXUA 1LYOA 5LVHA 2D91A 4NSJA 1JISA 4HTQA 4WLXA 3OK0A 4EMNA 3TXFA 6LYTA 4H91A 3QE8A 1HENA 4G4CA 2ZYPA 1A4VA 1NMMA 4O34A 1XFPL 1LSMA 1LJNA 1D9UA 1LZDA 1QUTA 4N9RA 1B5XA 1IP2A 1HSWA 1OUJA 3A8ZA 1OUIA 1SQ2L 1GBYA 1KIPC 3LYTA 3WL2A 2BQIA 1NBYC 3J4GA 1KXWA 5APDA 3AZ4A 5B59A 5LAGA 3N9CA 4HPEA 1XGTC 1LSYA 4NGLA 4XENA 3MGWA 153LA 2BLXA 2DBTA 3N9EA 1W6ZA 4NGKA 5FEKA 1GBOA 4CJ2A 1KXXA 1OUFA 3WVXA 4LYTA 1QQYA 2DQFC 4UWVA 3D3DA 2PC2A 5FDJA 3A91A 4Z46A 1AT6A 1XGRC 1CNSA 2F4AA 2HEAA 3AGIA 1J1OY 4TTDA 4ETCA 4H8ZA 4NWHA 1G7IC 207LA 3BKVA 3HBDA 4N1EI 1IOCA 1IWZA 1BGIA 4M4OA 2BQDA 1HFXA 4ETAA 5KXOA 2F4GA 3A6CY 1VAUA 1GXXA 5DL9A 5JENB 2FYDA 4L41A 1GXV2 1LSDA 1JIYA 4H90A 1I20A 2MEEA 4LZTA 4NGJA 2D4IA 4LYMA 1GFAA 3IJVA 3J6KA 5F14A 3A34A 1EQ4A 1QDRA 1UIBA 1GF8A 4YOPA 1GE2A 2MEHA 4DT3A 1GBSA 4IASA 194LA 4WMGA 1VDPA 1XEKA 133LA 1IWVA 1D6PA 2ZIJA 4XJFA 3B72A 1D6QA 1JTOL 2DQDY 4G4HA 1BB7A 5KXZA 1IO5A 4CHXA 1GPQC 1E8LA 1CJ9A 2HU3A 1NWGA 1GE3A 3HBEX 2MEFA 2Z38A 1LHJA 1LJKA 2X0AA 1QTEA 3G3AB 3WU9A 5LYTA 1IORA 3A3RX 4DD9A 5A3EA 1WQOA 1C46A 2YBHA 4H9BA 1DQJC 3D9AC 4XADA 5KXMA 3G3BB 3RZ4A 4KXIA 3AGHA 1JJ3A 1FKVA 4NSHA 1LHMA 4GN5C 4WL6A 4BAPA 6LYZA 3EBAB 4LT1A 2HTXA 3BKHA 1UIEA 1LYZA 1DPWA 1QUSA 4NSIA 3P68A 5LVIA 3LZTA 1IP1A 5I5QA 134LA 1WTMA 5I54A 2B5ZA 4NGIA 4WO9A 2MEIA 4LYOA 5B05A 1LZRA 5K7OA 4XJGA 4RLNA 2DQEY 4XJDA 4IATA 5E9RA 5HQ1A 1GF5A 2LZTA 3M3UA 4NHIA 4I8SA 1REYA 1Z55A 4TWSA 1F6RA 2Z19A 2CJLA 4HV2A 4J0LA 4YEMA 5J7CA 1LSCA 2FBDA 1TCYA 2DQJY 1RJCB 5DN5A 4NGWA 1C7PA 3TXIA 4H9AA 5KXXA 2EQLA 1IR7A 3B6LA 5KXWA 2FBBA 1GF4A 1UIDA 1GB8A 1KXYA 5F81A 4WG1A 1FLYA 4IJ4A 1IY3A 1LHLA 1GDWA 1IC7Y 1OUBA 1XEJA 1LSPA 4DYGA 1GWDA 1JHLA 1WQPA 1HEOA 1LZGA 3A6BY 4XJHA 2EPEA 4KL7A 3TMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T6VL 1UACY 138LA 3M18B 2OTZX 5DN4A 4Z3MA 3TMWA 3FE0A 3GUIA 1QUGA 1L91A 1YKYX 1OQMA 1L49A 1F10A 4LYZA 1T8AA 4DDAA 1L73A 225LA 4I7JA 3OE6A 1P37A 172LA 3TXJA 1L99A 1IWUA 1O23A 3DN6A 2Z39A 1L59A 4PK0A 5KXYA 1C6GA 3P65A 5HMVA 1L45A 5I4XA 5IELA 3EO5A 3D4SA 1LMNA 4N1CC 4WL7A 5EBHA 1XEPA 1L67A 1LKSA 185LA 4I7QA 1HMLA 1LYJA 1IR8A 1L29A 1L28A 2HEBA 111LA 1L79A 1B0DA 262LA 2W1XA 5B1FA 1XGQC 3AZ5A 1GFTA 5D5FA 1C6CA 1C65A 238LA 1T3PA 2CUUA 5KXLA 4LDEA 2BQCA 3DN0A 4PGJB 261LA 159LA 1DI4A 4FJRA 4WM3A 103LA 123LA 1OWZA 4MCKA 1UC0A 1SWYA 3TXHA 247LA 3WW5A 3HUQA 4NSGA 1D0LA 3K3TA 1TBYA 205LA 2B75A 2ZQ3A 1HNLA 139LA 166LA 4NHTA 5C6LA 165LA 221LA 4NG8A 1C62A 1WTHA 1D0MA 1GD6A 4G9SA 2DQHY 1CU5A 3SBAA 1L83A 1L44A 5LYMA 193LA 1P36A 2A4TA 4RW1A 2CDSA 3HT8A 1N4FA 3WW6A 4XJIA 1GF7A 1LSAA 2RBRA 2F30A 3F8VA 3SB6A 1L84A 1CU3A 3VWOA 1C6LA 145LA 2Z2EA 3F6ZA 1LJJA 1OV5A 3T36A 1LSZA 2B6WA 3DN4A 4GCDA 1CV4A 1ZVYB 1LZTA 4ARMB 1GEZA 3HTFA 4I7OA 3GUJA 217LA 4CFPA 7LYZA 5L3IA 1QT8A 2BQNA 1LYSA 1RE2A 1L60A 2OE9X 1G7LC 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1NDG C;  1T6V L;  2CWI A;  1UAC Y;  1EQE A;  5KXN A;  3A93 A;  1HEQ A;  3IWR A;  4H94 A;  3M18 B;  5KY1 A;  1LZN A;  1IP7 A;  5DN4 A;  2C8O A;  4Z3M A;  4M6D A;  1MLC E;  2MEG A;  4QGZ A;  3TMW A;  3FE0 A;  4GN3 A;  1UIF A;  5I53 A;  3AZ6 A;  3A90 A;  4OW1 A;  1B5U A;  4PRQ A;  2F2N A;  2D4K A;  2XBS A;  5IDD A;  1LHK A;  1NQI A;  1BB3 A;  1YKY X;  5DM9 A;  4FDY A;  4WLD A;  5LXW A;  1LJG A;  5FEL A;  1GB0 A;  1OQM A;  4LT3 A;  1GBW A;  1F10 A;  1C08 C;  1YIK A;  4LYZ A;  2W1M A;  4PPO A;  2C8P A;  4Z98 A;  4DDA A;  4HTN A;  1IP3 A;  1LZY A;  3WUM A;  2RSC A;  2DQC Y;  2BQJ A;  1VFB C;  1LZC A;  1CJ7 A;  1QTK A;  4DDB A;  1AM7 A;  4TUN A;  2YBM A;  1GFK A;  2BLY A;  4TSC A;  3TXJ A;  2NWD X;  1G7H C;  4OOT A;  3WUN A;  1IWU A;  1CKH A;  3AJN A;  3TXG A;  5LIN A;  1O23 A;  5C6J A;  4KT3 A;  5HNC A;  1B9O A;  5I4W A;  1GBX A;  2YBL A;  3E3D A;  2Z39 A;  1DI5 A;  2MEA A;  1QIO A;  4ETD A;  5KXY A;  2Y8P A;  1PZY A;  3P65 A;  5HMV A;  4II8 A;  5IHG A;  1YAN A;  4OWE A;  5I4X A;  4YF2 A;  5IEL A; 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 4IAS A;  194L A;  4WMG A;  1VDP A;  1XEK A;  133L A;  1IWV A;  1D6P A;  2ZIJ A;  4XJF A;  3B72 A;  1D6Q A;  1JTO L;  2DQD Y;  4G4H A;  1BB7 A;  5KXZ A;  1IO5 A;  4CHX A;  1GPQ C;  1E8L A;  1CJ9 A;  2HU3 A;  1NWG A;  1GE3 A;  3HBE X;  2MEF A;  2Z38 A;  1LHJ A;  1LJK A;  2X0A A;  1QTE A;  3G3A B;  3WU9 A;  5LYT A;  1IOR A;  3A3R X;  4DD9 A;  5A3E A;  1WQO A;  1C46 A;  2YBH A;  4H9B A;  1DQJ C;  3D9A C;  4XAD A;  5KXM A;  3G3B B;  3RZ4 A;  4KXI A;  3AGH A;  1JJ3 A;  1FKV A;  4NSH A;  1LHM A;  4GN5 C;  4WL6 A;  4BAP A;  6LYZ A;  3EBA B;  4LT1 A;  2HTX A;  3BKH A;  1UIE A;  1LYZ A;  1DPW A;  1QUS A;  4NSI A;  3P68 A;  5LVI A;  3LZT A;  1IP1 A;  5I5Q A;  134L A;  1WTM A;  5I54 A;  2B5Z A;  4NGI A;  4WO9 A;  2MEI A;  4LYO A;  5B05 A;  1LZR A;  5K7O A;  4XJG A;  4RLN A;  2DQE Y;  4XJD A;  4IAT A;  5E9R A;  5HQ1 A;  1GF5 A;  2LZT A;  3M3U A;  4NHI A;  4I8S A;  1REY A;  1Z55 A;  4TWS A;  1F6R A;  2Z19 A;  2CJL A;  4HV2 A;  4J0L A;  4YEM A;  5J7C A;  1LSC A;  2FBD A;  1TCY A;  2DQJ Y;  1RJC B;  5DN5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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