1OUAA

Contribution of hydrophobic residues to the stability of human lysozyme: x-ray structure of the i56t mutant
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGTFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title The structure, stability, and folding process of amyloidogenic mutant human lysozyme.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 49
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ouaA00
1FN5A 2W1LA 1XSFA 4Z98A 3ZVQA 2DQEY 5KXNA 1RFPA 4LZTA 4DD7A 4ANRA 4GN5C 4DWXA 4LT0A 4H9IA 1LJFA 1FLYA 4R6CA 5LYTA 4ETDA 4H93A 1LHIA 4UWNA 1IWWA 1G7MC 1F6SA 1GFUA 1HMKA 1B7QA 5KXMA 5I4XA 1FLWA 1LSFA 1DPXA 3TMUA 4GLAA 1F6RA 5LVHA 3LYMA 1IOSA 2AUBA 2MEIA 4TUNA 5LYZA 3TXKA 1NDMC 4DDAA 1QQYA 3A92A 3B72A 4WM5A 1B2KA 1IP3A 1GB6A 4H90A 1GBWA 3E3DA 4WM1A 1IC5Y 5IDDA 1BVKC 1B7OA 4B0DA 4ZIXA 1LYOA 4GLVA 134LA 2BQBA 2ZIJA 4XJFA 3AZ4A 1HHLA 4YOPA 4DDBA 1CJ6A 1LYZA 3KAMA 1FKVA 5I4YA 1PS5A 2EPEA 4NGYA 5D5CA 4NHIA 4DD2A 1IC7Y 1XGQC 1GF0A 1I56A 1HELA 2CWIA 2I25L 4GCEA 3WULA 154LA 4I8SA 1IY4A 5HMJA 4NGKA 2D4KA 5I53A 1REZA 4NSGA 2BQOA 1LHJA 3WYHA 4NGZA 1GFEA 5B07A 3GXKA 4H92A 4DDCA 3AYQA 2G4QA 1XEJA 2LYOA 1AM7A 1REXA 1G7LC 1CKHA 4HJZA 2G4PA 4G49A 1OUDA 1IEEA 4M6DA 3W6DA 2H9JA 4QDNA 1JKCA 1OUBA 3WPKA 2W1YA 4P2EA 1C46A 1GF9A 1LJKA 1NHEA 1DXJA 1GFJA 1TDYA 1HEOA 3WL2A 2HEAA 2MECA 2Z2EA 4NGVA 5AMYA 4NSHA 4N5RA 1NKHA 1VDSA 2XBSA 4H9AA 4NHTA 1QUSA 2BQAA 1YAOA 1A4VA 1GF7A 1UIHA 1YAPA 2BQMA 4J1BA 4NSJA 1LSAA 1JUGA 3TMXA 4GN3A 3F6ZA 4PJ2C 1OP9B 3D9AC 4LYTA 2CDSA 4OWHA 1LSCA 3WMKA 1IOQA 1B5YA 1YIKA 2EKSC 2LZTA 1JKBA 1LMAA 4LFPA 4LYMA 4XADA 4J1AA 3TXBA 3W3EA 3WXTA 2ZNWY 3A95A 2ZYCA 1BQLY 4OWCA 1HC0A 1LSDA 1FKQA 1JSFA 1F10A 1LZ4A 5LIOA 5HMVA 2I26L 1IVMA 3CQLA 5APFA 3RNXA 4Z3MA 2HU1A 5L3HA 4N1CC 5II3A 1LJ3A 1YANA 1YL1X 4GCCA 1LYSA 3N9CA 1AT5A 1WVVA 1IWXA 1J1OY 3EO5A 5EBHA 4NG8A 3RZ4A 1JSEA 3WXUA 4HV2A 5FEKA 1IIZA 3LYTA 3AJNA 5KXWA 194LA 1VATA 3QY4A 1BB3A 1LZNA 1B7MA 3A93A 4MCKA 3B6LA 4OWBA 3IJVA 5DL9A 2X0AA 1XEIA 5C6IA 1RE2A 1D6PA 1REYA 2LYZA 1PZYA 5KY1A 1VDQA 4CHXA 1XGUC 2IFFY 4UWUA 2DQCY 4MSTA 2YBMA 2GV0A 4WG1A 4WM3A 4H9BA 2Z2FA 1LHLA 1LPIA 3CT5A 1LZ6A 2HUBA 1GWDA 4NIJA 2BQDA 5DLAA 2BQHA 1GF6A 4EMNA 2YBLA 2DKVA 1IP4A 1LJIA 2YBJA 4NG1A 4HSFA 3ZVQB 4ETEA 5E4PA 1OUEA 1JEFA 1LJNA 1UIDA 5KXSA 4PRQA 1HMLA 1LSPA 1OUGA 1VEDA 4YENA 1QUTA 4NGIA 3A90A 1YROA 2ZIKA 1CNSA 1LOZA 207LA 2D91A 1I20A 1IOCA 133LA 1DZBX 1HFZA 4YEMA 1TAYA 1UIAA 5K7OA 1D0LA 1D6QA 3FI7A 5J7CA 5I4WA 4MR1A 1TEWA 4HJYA 4PPOA 4WL6A 3AGGG 1RJCB 1SLYA 1DKJA 1ZVHL 4KXIA 1JTPL 1LZTA 4XJIA 4GCFA 2YSSC 4B49A 4CGEA 4B1AA 2BQCA 3A94A 1GHLA 1LJHA 1UC0A 3AGHA 4LT1A 4DT3A 1GB2A 3HFMY 5KXYA 1JJ1A 1NBYC 2BQGA 1UUZC 1GB8A 3WW6A 1JWRA 1YKZX 4LYBA 1YAMA 4QY9A 4OOOA 1LSNA 2N5ZA 1G7JC 1LKRA 1LSZA 3WU8A 3AZ7A 1JIYA 4HPEA 2EQLA 4NEBA 4WLTA 5DM9A 3ZEKA 1B5ZA 1LMOA 1LMTA 2HEFA 1AT6A 1GBZA 1NWGA 2XTHA 1IWTA 2Z19A 1DPWA 3CSRA 1GFTA 1HFXA 2YBNA 1GB7A 3WU7A 2BAAA 1YQVY 4C5FA 2MEBA 1CKGA 1GF3A 1IORA 1NQIA 2C8PA 2Z38A 4NGOA 4PGJB 4QGZA 3TXEA 4J7VA 1OUHA 3LYZA 4HJVA 2HEEA 1IP6A 1CJ7A 1LJ4A 1KIQC 1LZCA 1EQ5A 2F4GA 1WQNA 1T3PA 3WVYA 1JTTL 5B1FA 5KXOA 1C43A 1JJ3A 1B7NA 3N9AA 5F81A 1KXYA 3AW7A 1C7PA 1LSEA 4NHQA 1WQOA 3WW5A 2Z18A 4UWVA 3BKVA 1FBIX 1XGTC 2Z37A 1BB6A 4TSBA 4WO9A 2DQJY 4NWEA 2B5ZA 1RI8B 4IATA 3W6CA 2MEEA 3M18B 5APEA 1CJ8A 4BAFA 3EMSA 3W6FA 3LHMA 3TXHA 2WARA 1GFVA 5HNLA 1LSBA 1LSGA 4HTQA 5FHWA 3WVXA 4YM8A 4DD0A 1QTEA 2XJWA 1GBYA 4G4HA 3A3QA 5KXRA 4B4EA 3G3AB 1IO5A 4AGAA 4OOTA 3A34A 2FBBA 1B5VA 2BQJA 1INUA 1VAUA 4NHPA 2C8OA 4XENA 4CFOA 3B0OA 4O34A 1NF5A 5APDA 5M1YA 1LMNA 1GAYA 1QDRA 1JISA 3T6UA 3TXGA 4G4BA 3WPLA 1LZ5A 5LXWA 1UIGA 1B5UA 4ML7A 4FDYA 4LGKA 4DC4A 2H9KA 4N1EI 2G4NA 5LA8A 1JKAA 5C6LA 1H87A 2W1MA 4BADA 5LINA 1LZRA 5T3FA 1REMA 4G4CA 2BLXA 3HBDA 1IR9A 4NWHA 5KXZA 1H6MA 1GAZA 1LZ1A 2DQGY 2XBRA 3W6EA 4PHIA 2CJLA 1C08C 1QSWA 4II8A 1DKKA 2ZILA 4M4OA 1MLCE 1OUCA 1D9UA 1W08A 2DQHY 2MEFA 2F4AA 2ZQ4A 3IJUA 1JPOA 208LA 5KXKA 4H9EA 1GEVA 5LVIA 1UACY 2CGIA 2YBHA 1E8LA 4IJ4A 1LZDA 3A96A 153LA 2DQDY 2LHMA 3A8ZA 1J1XY 2Z39A 2Z12A 1A2YC 1QSAA 3EBAB 3TXIA 1QDTA 1YAQA 1GE3A 1XGPC 2D4JA 1UIFA 4HV1A 4ET9A 4L41A 3N9EA 1RCMA 1F0WA 3IWRA 1BWHA 1LZBA 4I0CA 1IP1A 1QIOA 3K3TA 1GB0A 2LZ2A 5C6JA 4DD9A 1GE2A 4H94A 1WQMA 1HEPA 3A6BY 3ATNA 4KT3A 1IP7A 1G7IC 1AZFA 3TXFA 1ZMYL 1KIRC 1LKSA 193LA 1GBSA 1UCOA 2ZQ3A 3RW8A 1GB3A 1HEQA 1WTNA 4BAPA 5KXLA 4YEOA 1IWYA 1HEMA 4H91A 1GFAA 1FLUA 4E3UA 5F9XA 3A3RX 1LMQA 3A6CY 2D4IA 5APCA 1LCNA 1LZAA 1B7LA 1JHLA 1VFBC 5LAGA 2LYMA 4J0LA 1GFGA 2HU3A 4HTKA 5HQ1A 5L9JA 4WM6A 1C10A 1OUJA 1UIEA 3B0IA 4XJBA 4LYOA 1DI5A 1XFPL 4HP0A 3WUAA 3AW6A 4WMGA 3CB7A 2Q0MX 4DD1A 2HECA 3WH1A 2BQEA 3WUMA 6LYZA 5DN5A 4H8YA 1IP5A 3W6BA 1YL0X 1IY3A 2FBDA 1DI4A 2ZYPA 4TX7A 9LYZA 1GE0A 1GE1A 1AKIA 4LYCA 4NY5A 4OWEA 5LVJA 3LN2A 5KJ9A 3WUNA 4ETBA 1GE4A 3D3DA 3GXRA 4YF2A 1EL1A 1LZGA 3ULRA 4BS7A 3TMWA 1EQ4A 5FDJA 1GB5A 4IASA 1YKXX 1HENA 1LHKA 1CKFA 1G7HC 1HFYA 2D6BA 3T36A 1GPQC 1OUFA 3A67Y 2W1XA 4D9ZA 3EXDA 5KKJA 3TMVA 1WQQA 3RU5A 8LYZA 135LA 1GF5A 1ALCA 3G3BB 4RLMA 3RT5X 1LZYA 1QTKA 4X3BA 4W94A 4NGJA 4H8XA 2MEGA 1CKCA 3SP3A 4TWSA 5KXXA 1KXXA 4OW1A 4CFPA 4EOFA 1LSYA 4WO6A 3P64A 1IR7A 4NSIA 5F9UA 1BGIA 1HNLA 1GB9A 4WOAA 1JTOL 5FELA 1GEZA 1XEKA 2F2NA 2IHLA 1UA6Y 6LYTA 4RW1A 5B05A 1Z55A 2BQKA 5IHGA 1V7TA 4U3XB 1BWIA 4WG7A 5B59A 1HF4A 1HEWA 3AGIA 3P66A 4RW2A 5DN4A 1OUIA 2DBTA 5LVKA 1IP2A 1GXXA 5HLLA 1LMPA 1B5XA 3CT1A 3OJPA 1FDLY 5LYMA 1B7PA 5A3EA 1GDXA 2NWDX 2FYCA 1FLQA 3W6AA 3TXJA 5I5QA 1GF4A 1MELL 4H9FA 4W96A 4DD3A 1NMMA 2MEDA 2MEAA 2BQNA 4LYZA 5LVGA 5HNCA 1WTMA 1GD6A 2EIZC 1IWVA 2BQIA 5LAFA 2DQFC 3FE0A 1DI3A 1NBZC 1IOTA 4WM2A 5B1GA 3TXDA 3A91A 1NDGC 1D0MA 4DYGA 1GBOA 3P65A 1WVUA 5A3ZA 1EQEA 4NGLA 4ETCA 2I6ZA 4CJ2A 1LHMA 1ZVYB 2F30A 4HTNA 7LYZA 5KKIA 3P4ZA 1BB5A 132LA 3OK0A 4NFVA 1GF8A 5FCPA 3AZ6A 2ZNXY 3LZ2A 3AB6A 1LMCA 2BPUA 1JKDA 1LZEA 1GXV2 3LZTA 1LAAA 1W6ZA 2HEBA 1CKDA 3AZ5A 1HERA 4N9RA 5LA5A 1KIPC 2YVBA 2DQIY 1DQJC 4R0FA 1OUAA 3QE8A 1BWJA 2HTXA 2BQFA 2YBIA 5KXTA 1IC4Y 1WQPA 4ET8A 3HBEX 1JITA 4RDSA 4ZFPA 1V7SA 2BLYA 3HBHA 4Z46A 2BQLA 4XN6A 5ILCA 5I54A 1IWUA 5JENB 1VDTA 4LFXA 3M3UA 1O23A 3MGWA 1TCYA 1LHHA 1UIBA 1B0DA 4WL7A 1TBYA 2HEDA 4C3WA 3J6KA 4B4IA 4WM4A 1BVXA 1LSMA 5E9RA 1N4FA 4N8ZA 1WQRA 4AXTA 4KL7A 4NHSA 1B7RA 1LYYA 1P2CC 2A7DA 4Z41A 1GDWA 4RLNA 1BB4A 4GN4A 4WLDA 5F16A 4XJHA 4GCBA 3P68A 1C45A 1YILA 1XGRC 2DQAA 4FJRA 2Y8PA 1VDPA 1OQMA 4QEQA 5IELA 1LTMA 2H5ZA 1KXWA 4LT3A 4TTDA 2A7FA 1D0KA 5F14A 2ZWBA 2VB1A 4H1PA 1GFRA 1BB7A 4LT2A 4NGWA 1LJEA 2PC2A 4XYYA 5FSTA 3VWOA 1I1ZA 4TSCA 4HPIA 1YKYX 1T6VL 1GFKA 5B06A 3BKHA 4PRUA 4A7DA 1B9OA 2MEHA 3LYOA 1IX0A 3J4GA 3CSQA 4GCDA 1GFHA 1SQ2L 1CJ9A 3ATOA 1HSWA 5KXPA 1JJ0A 3CT0A 4H9HA 1IR8A 1ZV5L 1B5WA 1LZSA 5D5FA 1IWZA 1LJJA 1J1PY 1BHZA 1LJGA 4G9SA 4ZEEA 5ILFA 4B4JA 1UBZA 3CSZA 4ETAA 3B0KA 4XJGA 1LZ9A 1UICA 2RSCA 4WLYA 3WU9A 4H9CA 4OWAA 3QNGA 4H8ZA 1HSXA 5L3IA 3WPJA 2FYDA 2YDGA 4N0JA 1LZ8A 4KPMA 4WLXA 4XJDA 1GBXA 1B7SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6LA 3ZVQA 4DQ7A 4EPFA 1ZWNA 4UWNA 1IWWA 1HMKA 109LA 1DPXA 169LA 5LVHA 2AUBA 1CV6A 3LZMA 4TUNA 2OEAX 4DDAA 1L20A 1IP3A 1GB6A 3E3DA 112LA 1IC5Y 1BVKC 1B7OA 4ZIXA 1LGWA 1LYOA 4GLVA 2BQBA 4DDBA 150LA 1CJ6A 258LA 3GUMA 1XGQC 1GF0A 4ARMB 1IY4A 1G0JA 2BQOA 3F8VA 3GXKA 4W54A 3RUNA 2G4QA 3HU8A 1XEJA 3GUKA 2RAZX 3DMZA 4DKLA 1GFJA 1TDYA 146LA 5AMYA 1C6FA 1L68A 1QUOA 2XBSA 1L22A 1L01A 2NTHA 1A4VA 1L87A 1LSAA 1OP9B 1L31A 1B5YA 4EJ4A 4LYMA 1C66A 3TXBA 3WXTA 4OWCA 157LA 1F10A 1LZ4A 5LIOA 2I26L 1IVMA 3CQLA 176LA 143LA 3HUKA 3UONA 3DN8A 3HTDA 4N1CC 1LJ3A 1YANA 1J1OY 5FEKA 1IIZA 5KXWA 1VATA 1PQOA 3A93A 4OWBA 3CDRA 2X0AA 1XEIA 5C6IA 212LA 1RE2A 1C6CA 1PZYA 1L02A 1C6GA 2IFFY 3HUQA 4WM3A 1L76A 3CT5A 1JTMA 2BQHA 255LA 2YBLA 1LJIA 4HSFA 1LJNA 1OUGA 3HDFA 4YENA 4NGIA 3A90A 1YROA 133LA 1CV5A 1HFZA 5J7CA 1LWKA 3HWLA 4PPOA 1RJCB 1SLYA 1ZVHL 4LDEA 4B1AA 3A94A 4LT1A 1UUZC 3WW6A 1JWRA 4ARPA 1YAMA 4QY9A 4OOOA 226LA 1G7JC 213LA 1JIYA 2EQLA 3ZEKA 2HEFA 1AT6A 1NWGA 4W59A 2A4TA 2ANXA 2YBNA 3WU7A 240LA 1L09A 1CKGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1FN5 A;  2W1L A;  1XSF A;  4Z98 A;  3ZVQ A;  2DQE Y;  5KXN A;  1RFP A;  4LZT A;  4DD7 A;  4ANR A;  4GN5 C;  4DWX A;  4LT0 A;  4H9I A;  1LJF A;  1FLY A;  4R6C A;  5LYT A;  4ETD A;  4H93 A;  1LHI A;  4UWN A;  1IWW A;  1G7M C;  1F6S A;  1GFU A;  1HMK A;  1B7Q A;  5KXM A;  5I4X A;  1FLW A;  1LSF A;  1DPX A;  3TMU A;  4GLA A;  1F6R A;  5LVH A;  3LYM A;  1IOS A;  2AUB A;  2MEI A;  4TUN A;  5LYZ A;  3TXK A;  1NDM C;  4DDA A;  1QQY A;  3A92 A;  3B72 A;  4WM5 A;  1B2K A;  1IP3 A;  1GB6 A;  4H90 A;  1GBW A;  3E3D A;  4WM1 A;  1IC5 Y;  5IDD A;  1BVK C;  1B7O A;  4B0D A;  4ZIX A;  1LYO A;  4GLV A;  134L A;  2BQB A;  2ZIJ A;  4XJF A;  3AZ4 A;  1HHL A;  4YOP A;  4DDB A;  1CJ6 A;  1LYZ A;  3KAM A;  1FKV A;  5I4Y A;  1PS5 A;  2EPE A;  4NGY A;  5D5C A;  4NHI A;  4DD2 A;  1IC7 Y;  1XGQ C;  1GF0 A;  1I56 A;  1HEL A;  2CWI A;  2I25 L;  4GCE A;  3WUL A;  154L A;  4I8S A;  1IY4 A;  5HMJ A;  4NGK A;  2D4K A;  5I53 A;  1REZ A;  4NSG A;  2BQO A;  1LHJ A;  3WYH A;  4NGZ A;  1GFE A;  5B07 A;  3GXK A;  4H92 A;  4DDC A; 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 1JIT A;  4RDS A;  4ZFP A;  1V7S A;  2BLY A;  3HBH A;  4Z46 A;  2BQL A;  4XN6 A;  5ILC A;  5I54 A;  1IWU A;  5JEN B;  1VDT A;  4LFX A;  3M3U A;  1O23 A;  3MGW A;  1TCY A;  1LHH A;  1UIB A;  1B0D A;  4WL7 A;  1TBY A;  2HED A;  4C3W A;  3J6K A;  4B4I A;  4WM4 A;  1BVX A;  1LSM A;  5E9R A;  1N4F A;  4N8Z A;  1WQR A;  4AXT A;  4KL7 A;  4NHS A;  1B7R A;  1LYY A;  1P2C C;  2A7D A;  4Z41 A;  1GDW A;  4RLN A;  1BB4 A;  4GN4 A;  4WLD A;  5F16 A;  4XJH A;  4GCB A;  3P68 A;  1C45 A;  1YIL A;  1XGR C;  2DQA A;  4FJR A;  2Y8P A;  1VDP A;  1OQM A;  4QEQ A;  5IEL A;  1LTM A;  2H5Z A;  1KXW A;  4LT3 A;  4TTD A;  2A7F A;  1D0K A;  5F14 A;  2ZWB A;  2VB1 A;  4H1P A;  1GFR A;  1BB7 A;  4LT2 A;  4NGW A;  1LJE A;  2PC2 A;  4XYY A;  5FST A;  3VWO A;  1I1Z A;  4TSC A;  4HPI A;  1YKY X;  1T6V L;  1GFK A;  5B06 A;  3BKH A;  4PRU A;  4A7D A;  1B9O A;  2MEH A;  3LYO A;  1IX0 A;  3J4G A;  3CSQ A;  4GCD A;  1GFH A;  1SQ2 L;  1CJ9 A;  3ATO A;  1HSW A;  5KXP A;  1JJ0 A;  3CT0 A;  4H9H A;  1IR8 A;  1ZV5 L;  1B5W A;  1LZS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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