1OUHA

Contribution of hydrophobic residues to the stability of human lysozyme: x-ray structure of the v74a mutant
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAANACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
publication title Contribution of the hydrophobic effect to the stability of human lysozyme: calorimetric studies and X-ray structural analyses of the nine valine to alanine mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1996-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ouhA00
4DDBA 5LA8A 1UIFA 4LT0A 1GF3A 4C3WA 2ZNWY 1YQVY 1LZGA 4NEBA 1EQ5A 2BQMA 4NHPA 5IHGA 5LYMA 1CKCA 3WH1A 1GE2A 1UACY 4N1EI 5B07A 1GFAA 5APCA 1HMKA 1LZ9A 3W6EA 2VB1A 3WVXA 4BAFA 1QUSA 132LA 1HELA 4NWEA 3RZ4A 2F30A 1P2CC 2MEHA 3TXFA 1HEPA 1UA6Y 4WLYA 4X3BA 1GE0A 1IEEA 3AGHA 4R0FA 5ILCA 4LYOA 2HECA 2DQCY 1GD6A 1C7PA 1REZA 2MEFA 4LGKA 5KKJA 5HLLA 2I26L 4J0LA 2HTXA 1JPOA 4NSGA 4DD3A 1BB6A 1VAUA 1GF8A 5C6JA 5LVGA 3AW7A 3CSQA 2I6ZA 3K3TA 5B05A 1G7MC 2YSSC 3AGIA 3VWOA 4QDNA 3T36A 154LA 5AMYA 1CKGA 2ZQ3A 1LJKA 3G3BB 1OUJA 4H8XA 3WUMA 4CFOA 4WM6A 3LHMA 4EOFA 1JKDA 1JWRA 5J7CA 3CSZA 1LYZA 3A95A 1LZ4A 1VDTA 1J1OY 1JSFA 1XGQC 3WU9A 2BQKA 4L41A 1RJCB 4YEMA 5F9XA 1QQYA 1A2YC 1OP9B 1UUZC 1HHLA 5LINA 1LPIA 4HJYA 2Q0MX 3A8ZA 1A4VA 1LZ6A 4HTQA 4OOTA 1ALCA 5KXLA 3F6ZA 1I1ZA 3A91A 4DD1A 4G4BA 1LSAA 3T6UA 1GB8A 3N9EA 4N1CC 1GXXA 1B5YA 1LZSA 1LZBA 3CT5A 2FYCA 4WMGA 4NGOA 2LZTA 2BQAA 4NHQA 2BQCA 1GF4A 4QEQA 1GF7A 1UIBA 1JTPL 1GAZA 2ZYCA 2MEDA 2GV0A 4XYYA 153LA 3A34A 4H9IA 5E4PA 1GE4A 4HV1A 4Z98A 5F14A 4OW1A 3IJUA 3FI7A 1QIOA 1GFTA 5I4WA 2MEGA 5A3EA 1JSEA 1VFBC 4LT2A 2C8PA 3WU7A 1LSEA 5IDDA 2XTHA 2MEAA 2W1XA 4WLDA 2FBBA 3WUAA 1TBYA 4CJ2A 4DD9A 4NHTA 1LZEA 4LT1A 4RLNA 4NHSA 1ZV5L 3W6FA 1AZFA 1V7SA 2BQEA 1LZRA 1HFZA 1KXYA 4B49A 5F9UA 1GBYA 1LSMA 4J1BA 3WMKA 3HFMY 2Y8PA 1LSGA 1H87A 1GF9A 1H6MA 1RI8B 1VDSA 1LZ5A 1YKZX 4NGZA 2HUBA 1J1PY 1SQ2L 2EPEA 4IJ4A 4J1AA 5LYZA 1VEDA 9LYZA 4J7VA 1HFXA 4NGJA 2BQNA 5KXNA 4B4JA 2CWIA 2BQIA 3W3EA 2D6BA 2DQIY 3WPJA 5KXXA 1UCOA 4NG8A 3WW6A 2ZQ4A 5I53A 6LYTA 1ZVYB 3AZ6A 5B1FA 1C10A 1IY3A 4H9CA 4KL7A 2BQFA 1NBYC 2WARA 3WPLA 1JUGA 3A94A 3RW8A 3B0KA 4NGLA 1XFPL 4B4EA 4MSTA 2IFFY 4WM3A 4AXTA 3RU5A 4GCBA 1GFHA 4GN4A 4TTDA 4CHXA 4Z46A 3P68A 5HQ1A 1JKAA 4OWHA 5KXZA 194LA 2ZIJA 5F16A 5LVHA 2G4PA 1I56A 1LYYA 3N9CA 1REMA 2DQJY 3W6CA 4EMNA 2HU1A 4KXIA 1LMTA 1XGTC 4XJDA 1LJ4A 1B5VA 5KJ9A 1HEMA 1B7QA 4OWEA 4HV2A 1WQRA 1B7LA 1IOQA 5ILFA 1VDQA 1TCYA 2F4AA 3CSRA 4G9SA 1JKCA 1JJ0A 4W94A 4XJHA 4N0JA 1XEIA 2BQLA 1BB7A 1GB3A 1B5WA 4H9AA 1YIKA 3B0OA 4N5RA 1LOZA 3WW5A 2XBSA 2Z19A 3TXGA 4HP0A 1B5ZA 3CQLA 1LJGA 1LMCA 1CKDA 5LAFA 2A7FA 3A92A 1B2KA 4WLTA 4R6CA 4H9EA 4NGKA 4I8SA 1BB4A 1HENA 4PHIA 1JEFA 4C5FA 4NGVA 4IATA 1ZVHL 3TXKA 2D91A 1W08A 4YEOA 1GB9A 4HJVA 4LZTA 2W1LA 1WQNA 1GB7A 1JKBA 2D4JA 2BQGA 2H5ZA 2ZYPA 5DN4A 1NQIA 2BPUA 1GB0A 5LA5A 2MEIA 3HBHA 1G7JC 2HU3A 3IWRA 3WUNA 3P64A 4H9BA 1KIRC 1NF5A 4MCKA 3HBDA 5C6IA 4WOAA 1W6ZA 3LYMA 4LYZA 1NWGA 3LZ2A 3W6AA 6LYZA 4WL7A 1GF6A 1QUTA 1HNLA 1B7SA 1LTMA 4H9HA 1Z55A 8LYZA 4OWBA 4PGJB 1IP6A 1INUA 1IP1A 1LSZA 2BQHA 3OK0A 5LXWA 4GN3A 1DXJA 1I20A 4ETDA 4WO6A 1CKHA 1BB3A 1DZBX 1GE1A 1GFJA 2HEBA 4H92A 4HPEA 4NIJA 4WM1A 1FBIX 1XGUC 1UIDA 1IP3A 1D6PA 1F10A 2YBIA 2Z38A 4WM2A 2CGIA 4FJRA 1FLYA 2FBDA 4YM8A 1HEQA 4CFPA 1B7NA 1D6QA 1GXV2 4LYMA 4AGAA 2YBHA 1GDWA 1DPXA 1LSPA 4H93A 1CJ6A 4XJIA 1NHEA 1UBZA 3EO5A 4NGWA 3WPKA 5A3ZA 1IP7A 2EKSC 135LA 1FN5A 1XEJA 5HMVA 1LYOA 4WO9A 5HNLA 3LN2A 5IELA 1MELL 4DDAA 5FHWA 1IP5A 5T3FA 1BQLY 4P2EA 4QGZA 3P66A 4TUNA 1YILA 4XENA 1JJ1A 1CKFA 1LSNA 1JTTL 4G4HA 2DQFC 2MECA 1TAYA 1N4FA 1YANA 1IR9A 1GBWA 3OJPA 5DL9A 1LJEA 3LYZA 4XJFA 3ATNA 3EMSA 3FE0A 4H91A 4ANRA 2LYZA 2DQHY 4FDYA 4ETEA 4NSIA 1LZ1A 1KXWA 1JIYA 1LMPA 3A93A 4TX7A 5HNCA 1IOTA 2AUBA 2DQDY 1KIPC 1RE2A 2B5ZA 5D5CA 2W1MA 3LYOA 1JTOL 2DQGY 1IWXA 1IOCA 1GB5A 4ML7A 4ZEEA 5APFA 1C45A 3MGWA 1LSFA 2YDGA 1JHLA 3TXBA 4WG1A 3P65A 4DD2A 4E3UA 1LSYA 1B7RA 1SLYA 1LJIA 1GBZA 1G7IC 1UIAA 4NY5A 1LAAA 1UC0A 2N5ZA 5B1GA 3CT1A 1EL1A 1HFYA 1YAOA 2Z2FA 2DKVA 3G3AB 3W6BA 1IY4A 1KXXA 5K7OA 4ET8A 1AKIA 2D4IA 1AM7A 5FEKA 1B7OA 3AZ5A 5B59A 4NFVA 4GN5C 2DQEY 4IASA 2ZIKA 1OUCA 1B0DA 3A6BY 4LYBA 1DI3A 4XADA 1OQMA 1HC0A 1DPWA 3SP3A 3AYQA 3P4ZA 4YENA 4QY9A 1RFPA 1GAYA 1HERA 1QDTA 1BB5A 1LZNA 3AZ7A 1BWIA 2BAAA 1LZ8A 3AGGG 4UWVA 3WULA 3WXTA 5L9JA 5KXMA 4ET9A 1LHHA 1LMOA 2I25L 4NSHA 4U3XB 1KIQC 4B1AA 4DC4A 3CT0A 4HPIA 1IO5A 4WL6A 4Z3MA 4H90A 1OUEA 3W6DA 1YKYX 1B5UA 1B7PA 4LYTA 2G4QA 3A90A 4I0CA 4NWHA 4UWUA 1B5XA 4ETBA 1LJHA 1GFUA 1LZCA 1OUIA 1F0WA 2CDSA 4YOPA 4DWXA 1NKHA 133LA 3A6CY 4WM4A 1HEOA 2Z18A 5B06A 1LJNA 1AT5A 1FLUA 4D9ZA 1XEKA 2G4NA 1XGRC 1DQJC 1OUDA 1PS5A 1YKXX 3ULRA 1LMQA 4G4CA 1HEWA 1BGIA 4M4OA 1YL1X 1GPQC 1G7HC 5APEA 3WL2A 7LYZA 4ZFPA 1LJ3A 1J1XY 2Z37A 3J6KA 4H94A 1VDPA 1BHZA 1MLCE 1WVUA 1OUGA 1YAMA 2BLYA 1IIZA 2YVBA 5KXOA 4ETCA 4H9FA 5L3IA 4N9RA 1XGPC 1IWWA 4WG7A 1LHJA 4BS7A 5LVJA 3TMUA 1UICA 4B0DA 3M3UA 1IWTA 1BWHA 2XJWA 4ZIXA 1GB6A 1QTEA 5KXTA 1GEVA 4HTNA 1DKKA 1FKVA 1GWDA 1IC7Y 1NBZC 1NMMA 3IJVA 4II8A 5KXRA 1C46A 1LCNA 4RDSA 4H8YA 3QY4A 1HMLA 4GLVA 2BLXA 1LHLA 4UWNA 1OUHA 1DI5A 1FLWA 1LJJA 1HSWA 4MR1A 2BQOA 4KPMA 2CJLA 4RW2A 5KXKA 2DBTA 4NGYA 5LVIA 5F81A 2F4GA 1F6SA 1BVXA 2LYOA 4M6DA 1GE3A 1JITA 1LHMA 1RCMA 1IP2A 1UIHA 2F2NA 3AB6A 3CB7A 4PRQA 2YBMA 1GBSA 1DI4A 2EQLA 1OUBA 1LKSA 1D9UA 1PZYA 1REYA 5KKIA 1IC5Y 2ZNXY 1GB2A 3TMVA 1B7MA 1LSCA 3WXUA 2BQBA 4ETAA 4GCCA 4OWAA 4XJGA 4LFPA 3RT5X 5I4XA 1GBOA 1YROA 3D3DA 1IX0A 4W96A 5FCPA 1T3PA 1WTNA 3WYHA 1D0LA 5DM9A 1GBXA 1IR8A 1BWJA 1CNSA 2YBLA 1LZTA 1YAQA 1WTMA 1LZYA 2H9KA 3B72A 1LZDA 2DQAA 4RLMA 3QNGA 5I5QA 3D9AC 3J4GA 4CGEA 1EQEA 1UIGA 3TXEA 2Z39A 1DKJA 1T6VL 4NSJA 1CJ9A 1D0MA 1GF5A 5LAGA 1UIEA 5EBHA 1JISA 5M1YA 1JJ3A 4PJ2C 4A7DA 4PRUA 1HSXA 2LHMA 1IORA 3N9AA 2ZWBA 4RW1A 5E9RA 1LZAA 1IC4Y 3E3DA 1IWZA 1IR7A 1YL0X 3EBAB 3GXRA 3TMXA 1CJ8A 4N8ZA 1FKQA 2YBJA 3GXKA 5I54A 1FLQA 1GHLA 3A96A 4GLAA 1LJFA 1QDRA 1GEZA 1QSAA 1IOSA 3ZVQB 5I4YA 4B4IA 4G49A 1HF4A 5JENB 5APDA 1EQ4A 1GFVA 1XSFA 3ATOA 5DLAA 3A3RX 4LT3A 4H8ZA 3M18B 3QE8A 2W1YA 1QTKA 1O23A 3TXDA 3WVYA 1TEWA 1OUFA 1GF0A 208LA 2D4KA 4NHIA 3B6LA 5LIOA 3TXJA 5FDJA 4DD7A 2X0AA 2A7DA 4BADA 4OOOA 4NGIA 4LYCA 3TXIA 1IWVA 3KAMA 3RNXA 2MEEA 5FSTA 1VATA 4TSCA 1REXA 2BQJA 5DN5A 4HTKA 1G7LC 2IHLA 2RSCA 4GCFA 4DYGA 5II3A 1YAPA 1QSWA 2C8OA 1OUAA 4PPOA 5FELA 1LMNA 4WLXA 1GFKA 2HEDA 4KT3A 1GFEA 3EXDA 1GDXA 4HSFA 1B9OA 207LA 5LYTA 193LA 5KXWA 4BAPA 1GFGA 1WQMA 4NG1A 5KXSA 1LYSA 3ZEKA 5KY1A 2Z12A 5KXYA 5LVKA 3TXHA 2HEAA 1WVVA 4XN6A 1V7TA 3A3QA 4YF2A 3AZ4A 1C43A 5D5FA 2LYMA 2Z2EA 1WQPA 1CJ7A 1F6RA 4WM5A 3LZTA 1IVMA 2YBNA 4H1PA 2PC2A 4GCEA 2H9JA 1WQQA 1LHKA 2BQDA 4LFXA 4DT3A 1LMAA 3WU8A 1BVKC 5L3HA 2HEEA 4Z41A 3BKHA 4TSBA 2MEBA 4DDCA 1IP4A 1C08C 4XJBA 2NWDX 4DD0A 1WQOA 2ZILA 4O34A 1LKRA 3AJNA 4GCDA 1GFRA 1NDMC 2XBRA 2LZ2A 3B0IA 1LHIA 5KXPA 2FYDA 1D0KA 4HJZA 1NDGC 3A67Y 1E8LA 1LSDA 1ZMYL 3HBEX 3ZVQA 4OWCA 5C6LA 1AT6A 1LSBA 1IWUA 1TDYA 2EIZC 3TMWA 5HMJA 4TWSA 1FDLY 134LA 1IWYA 3BKVA 3LYTA 3AW6A 2HEFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4LT0A 1GF3A 4NEBA 1EQ5A 1ZURA 2BQMA 240LA 2Q9EA 3RUNA 1L81A 235LA 132LA 3DN0A 1HEPA 4X3BA 1GE0A 1L47A 2HECA 1D2YA 4LGKA 5KKJA 5HLLA 4J0LA 4NSGA 5LVGA 1GF8A 3L64A 1G7MC 1L60A 3VWOA 4QDNA 3C7ZA 1C6DA 3T36A 2ZQ3A 1CU5A 4CFOA 3C7WA 1JWRA 114LA 3GUOA 3CSZA 1J1OY 1JSFA 1CU2A 1XGQC 3WU9A 1L39A 2BQKA 3OE8A 1G0MA 141LA 5F9XA 1L15A 1L24A 1LPYA 1G1WA 195LA 159LA 1LZ6A 1ALCA 5KXLA 3F6ZA 3NY8A 1GXXA 3CT5A 4WMGA 2FYCA 4NHQA 2BQAA 1L75A 1CU3A 1CV6A 1QT8A 2GV0A 153LA 1GE4A 4Z98A 2IGCA 4OW1A 162LA 5I4WA 181LA 1QTBA 4LT2A 1L84A 2XTHA 1TBYA 3HTBA 4DD9A 1CX6A 4LT1A 3W6FA 1LZRA 1P3NA 1SX7A 1GBYA 1L66A 2Y8PA 1LSGA 1L90A 1YKZX 3HH6A 1L52A 2EPEA 169LA 1QS5A 248LA 1B6IA 4LZMA 4B4JA 4I7TA 2BQIA 4GBRB 2D6BA 2DQIY 2ANXA 166LA 3WW6A 3AZ6A 4H9CA 1LWGA 109LA 3DMXA 3SN6R 3RW8A 4NGLA 4B4EA 1LGXA 4GCBA 4GN4A 4TTDA 4CHXA 3GUJA 5HQ1A 3C80A 5F16A 3N9CA 1LYYA 1LMTA 1L35A 1LJ4A 1B5VA 161LA 4OWEA 5ILFA 1IOQA 1VDQA 2F4AA 1JKCA 254LA 4LDOA 4N0JA 3HH3A 205LA 2BQLA 1GB3A 1B5WA 1C6IA 4H9AA 149LA 4HP0A 3CQLA 1LJGA 3HTDA 1CKDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DDB A;  5LA8 A;  1UIF A;  4LT0 A;  1GF3 A;  4C3W A;  2ZNW Y;  1YQV Y;  1LZG A;  4NEB A;  1EQ5 A;  2BQM A;  4NHP A;  5IHG A;  5LYM A;  1CKC A;  3WH1 A;  1GE2 A;  1UAC Y;  4N1E I;  5B07 A;  1GFA A;  5APC A;  1HMK A;  1LZ9 A;  3W6E A;  2VB1 A;  3WVX A;  4BAF A;  1QUS A;  132L A;  1HEL A;  4NWE A;  3RZ4 A;  2F30 A;  1P2C C;  2MEH A;  3TXF A;  1HEP A;  1UA6 Y;  4WLY A;  4X3B A;  1GE0 A;  1IEE A;  3AGH A;  4R0F A;  5ILC A;  4LYO A;  2HEC A;  2DQC Y;  1GD6 A;  1C7P A;  1REZ A;  2MEF A;  4LGK A;  5KKJ A;  5HLL A;  2I26 L;  4J0L A;  2HTX A;  1JPO A;  4NSG A;  4DD3 A;  1BB6 A;  1VAU A;  1GF8 A;  5C6J A;  5LVG A;  3AW7 A;  3CSQ A;  2I6Z A;  3K3T A;  5B05 A;  1G7M C;  2YSS C;  3AGI A;  3VWO A;  4QDN A;  3T36 A;  154L A;  5AMY A;  1CKG A;  2ZQ3 A;  1LJK A;  3G3B B;  1OUJ A;  4H8X A;  3WUM A;  4CFO A;  4WM6 A;  3LHM A;  4EOF A;  1JKD A;  1JWR A;  5J7C A;  3CSZ A;  1LYZ A;  3A95 A;  1LZ4 A;  1VDT A;  1J1O Y;  1JSF A;  1XGQ C;  3WU9 A;  2BQK A;  4L41 A;  1RJC B;  4YEM A;  5F9X A;  1QQY A;  1A2Y C;  1OP9 B; 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 1OUF A;  1GF0 A;  208L A;  2D4K A;  4NHI A;  3B6L A;  5LIO A;  3TXJ A;  5FDJ A;  4DD7 A;  2X0A A;  2A7D A;  4BAD A;  4OOO A;  4NGI A;  4LYC A;  3TXI A;  1IWV A;  3KAM A;  3RNX A;  2MEE A;  5FST A;  1VAT A;  4TSC A;  1REX A;  2BQJ A;  5DN5 A;  4HTK A;  1G7L C;  2IHL A;  2RSC A;  4GCF A;  4DYG A;  5II3 A;  1YAP A;  1QSW A;  2C8O A;  1OUA A;  4PPO A;  5FEL A;  1LMN A;  4WLX A;  1GFK A;  2HED A;  4KT3 A;  1GFE A;  3EXD A;  1GDX A;  4HSF A;  1B9O A;  207L A;  5LYT A;  193L A;  5KXW A;  4BAP A;  1GFG A;  1WQM A;  4NG1 A;  5KXS A;  1LYS A;  3ZEK A;  5KY1 A;  2Z12 A;  5KXY A;  5LVK A;  3TXH A;  2HEA A;  1WVV A;  4XN6 A;  1V7T A;  3A3Q A;  4YF2 A;  3AZ4 A;  1C43 A;  5D5F A;  2LYM A;  2Z2E A;  1WQP A;  1CJ7 A;  1F6R A;  4WM5 A;  3LZT A;  1IVM A;  2YBN A;  4H1P A;  2PC2 A;  4GCE A;  2H9J A;  1WQQ A;  1LHK A;  2BQD A;  4LFX A;  4DT3 A;  1LMA A;  3WU8 A;  1BVK C;  5L3H A;  2HEE A;  4Z41 A;  3BKH A;  4TSB A;  2MEB A;  4DDC A;  1IP4 A;  1C08 C;  4XJB A;  2NWD X;  4DD0 A;  1WQO A;  2ZIL A;  4O34 A;  1LKR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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