1OV7A

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-allyl-6-methyl-phenol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ov7A00
3CDOA 2Q9DA 1L44A 1LI6A 234LA 2B6WA 3HH3A 1QTZA 2RAZX 2B72A 1OWZA 195LA 1L29A 243LA 252LA 3DN8A 242LA 146LA 3F9LA 1QUGA 2Q9EA 212LA 2RBPA 4YXCA 1C6EA 211LA 1L41A 3G3WA 215LA 110LA 1L91A 1SSYA 1C6CA 1LYDA 1L45A 1C67A 169LA 224LA 131LA 1DYFA 3CDQA 3HUKA 1L99A 2OE7X 4I7KA 109LA 1QTVA 253LA 173LA 1OWYA 1C62A 1G1VA 180LA 4LZMA 1LLHA 4LDOA 4W53A 1L52A 3OE6A 199LA 1G0QA 1L26A 1SWYA 185LA 1L16A 4I7TA 151LA 3HDFA 3OE0A 239LA 220LA 1C6PA 3SB8A 1CUQA 1QS9A 4LDLA 214LA 113LA 4PJZA 1L65A 1L85A 1C66A 3GULA 1OVHA 3HT6A 1TLAA 1QSBA 1L51A 4K5YA 1LWKA 3SB7A 142LA 1L04A 1L40A 1P2LA 1QTCA 4EKPA 182LA 1L28A 104LA 1L12A 186LA 1CU0A 4W58A 160LA 1WTHA 1G0JA 1L42A 129LA 1L86A 1L13A 1OVKA 1L61A 1C61A 1L23A 209LA 115LA 1L74A 112LA 177LA 255LA 1DYGA 1C6NA 4W59A 3V2YA 4I7LA 1LI2A 1JTNA 174LA 118LA 1JQUA 2RBOA 3SB5A 4EPIA 155LA 2OTZX 192LA 4I7JA 1D2YA 4ZPUA 163LA 1PQDA 1XJUA 168LA 244LA 3CDVA 1L43A 4I7NA 1L33A 4PK0A 1C64A 1CV5A 159LA 4DAJA 2LCBA 1L34A 1DYEA 3RZEA 2B6ZA 3FA0A 3GUMA 1PQJA 3CDTA 4W51A 3HUQA 1C6BA 1L66A 2RAYX 1LYGA 1L15A 1DYAA 3L2XA 1L80A 206LA 1SX7A 1L37A 262LA 200LA 248LA 3GUNA 1JTMA 3C7ZA 3SBAA 1LYIA 1G1WA 1PQIA 120LA 254LA 1SWZA 2B6XA 227LA 1LYHA 2L78A 231LA 1L07A 1OVJA 1D3FA 1L09A 1C60A 3ODUA 1SSWA 1K28A 1SX2A 1I6SA 126LA 1L48A 3F8VA 123LA 3DN6A 4ARMB 145LA 1L50A 3SBBC 3DN0A 119LA 167LA 1LPYA 1P3NA 1L59A 1LGUA 3C7WA 4W57A 3NY8A 1CV3A 1L24A 241LA 3DN3A 218LA 1L10A 3SB6A 3C8QA 3EMLA 1L46A 152LA 4ARMA 107LA 1L98A 1G07A 1L36A 1L95A 1C6MA 1L76A 1P6YA 2LC9A 3NYAA 219LA 2NTGA 3DMVA 1C6FA 1CVKA 170LA 3QAKA 137LA 1CU3A 3HUAA 1QTBA 1T97A 3K2RA 226LA 1L30A 1L05A 1DYBA 1QUHA 2O7AA 2OU0X 2RB1X 1L27A 229LA 3SB9A 5LZMA 1P64A 2RBQA 141LA 1C68A 3HH5A 1G0MA 3C81A 1QT4A 2B6TA 3GUIA 1L21A 181LA 1QSQA 1G0KA 196LA 1LGXA 1L89A 2HUKA 1EPYA 1L67A 4YX7C 2QB0B 1LWGA 4W54A 1QT8A 1P37A 1ZWNA 3C7YA 3C8SA 1L35A 1PQOA 4ARJA 1LGWA 1L22A 1L68A 3C8RA 3V2WA 1CV6A 236LA 1QT6A 1QT3A 1L94A 3HH4A 1C6GA 3OE8A 1L82A 7LZMA 1KW5A 1L72A 3HT9A 4LDEA 1L54A 260LA 213LA 2ANXA 144LA 221LA 3OE9A 1L69A 150LA 2HULA 3DN1A 3JR6A 1T8AA 1LYFA 1P56A 3RUNA 143LA 1L49A 1L55A 240LA 1L75A 130LA 232LA 1CV4A 237LA 1L57A 189LA 1CUPA 1C69A 259LA 1NHBA 2A4TA 139LA 3DNAA 3FADA 3HT7A 1L20A 4W55A 1C6IA 161LA 3CDRA 1G06A 230LA 4I7SA 1L00A 1L06A 1L63A 122LA 1QUDA 3GUJA 183LA 1L92A 3GUPA 3DKEX 3HU9A 1D9WA 251LA 3HWLA 1CV0A 3UONA 3HTGA 184LA 2NTHA 4S0WA 1C6KA 2OE4X 3GUOA 111LA 1KW7A 1L08A 2ANVA 178LA 3L64A 1C6LA 1LYEA 1L64A 172LA 2O4WA 3HT8A 4GBRB 5I14A 2B7XA 4I7QA 2O79A 1C6QA 1P5CA 3G3XA 1ZYTA 2B74A 1P36A 198LA 1G0PA 1L96A 3C83A 1D3NA 1L02A 261LA 157LA 1L79A 1CV1A 1CX7A 4EKSA 1KS3A 197LA 4IAPA 1LYJA 2B70A 3C80A 2OEAX 4I7OA 201LA 217LA 2OU9A 1OV7A 257LA 3VW7A 228LA 176LA 3PDSA 225LA 1XJTA 1CTWA 1DYCA 3HU8A 1L18A 4ARPA 4ARLA 1L62A 233LA 1D3MA 4EKQA 2B75A 1L47A 1L88A 3DMXA 1CU6A 3NY9A 1L97A 3DMZA 166LA 148LE 165LA 1B6IA 3SN6R 2OU8A 1L0KA 1L83A 1L19A 4EKRA 1L77A 1L32A 3HTFA 2RB2X 188LA 3HTBA 2OE9X 3G3VA 1QUOA 2B6YA 2F32A 1KY1A 1L17A 4GRVA 125LA 222LA 2Z6BA 6LZMA 1D3JA 4AQNA 147LA 2OTYX 187LA 238LA 1LI3A 2RB0X 1T6HA 246LA 1L84A 1T8GA 4EJ4A 164LA 3LZMA 1G0GA 4DKLA 1OYUA 256LA 1L11A 1DYDA 2QARC 127LA 1PQMA 191LA 1QT5A 138LA 4EXMA 190LA 1P7SA 250LA 1PQKA 1C6TA 1C6AA 1L53A 1QT7A 1KY0A 158LA 1LW9A 235LA 3C82A 3GUKA 162LA 247LA 108LA 1L01A 2RH1A 4I7RA 1T8FA 114LA 175LA 4E97A 1L58A 245LA 3HTDA 4EPFA 1C65A 2IGCA 2F2QA 3FI5A 2RBRA 1ZURA 4I7MA 1L81A 1OV5A 1L70A 140LA 2B73A 1L39A 205LA 1D2WA 1L73A 1L38A 3DN4A 1QTHA 2RBSA 1QS5A 1CX6A 1KNIA 149LA 1XEPA 1L31A 1QTDA 2F47A 4YXAC 128LA 1L87A 258LA 4ARQB 1L03A 1C6DA 171LA 4DJHA 1CU5A 1L60A 2HUMA 1C6HA 103LA 2RBNA 1L93A 1L71A 1G0LA 210LA 4OO9A 1L14A 2LZMA 1CU2A 3PBLA 4W52A 3HDEA 4W56A 1P46A 3D4SA 2CUUA 4ARQA 4I7PA 1L56A 223LA 249LA 1C6JA 216LA 156LA 3DN2A 1L25A 102LA 3HH6A 1C63A 1L90A 1L0JA 1P2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GN5C 3LYZA 1QTZA 1C43A 4BS7A 1LCNA 4NIJA 4YOPA 3J4GA 195LA 1L29A 252LA 1GXV2 3TXIA 242LA 4N0JA 3F9LA 1LZTA 4XYYA 2YSSC 3G3WA 110LA 1KIQC 4WM1A 2FBBA 1GBSA 1C67A 224LA 1D9UA 4HTKA 4TSBA 4LGKA 1QTVA 4HTQA 1LHMA 2HEEA 4LDOA 1GEZA 1AT5A 1JWRA 185LA 4N1CC 1D0LA 3A95A 1C6PA 4LDLA 1WQOA 3A96A 1FDLY 4PJZA 1FLYA 1OVHA 2ZYPA 1TLAA 2DQEY 4NGZA 1GWDA 1LWKA 5E9RA 4DD0A 1L40A 1LZ8A 1P2LA 4EKPA 5F9XA 3MGWA 4HV2A 160LA 4YEMA 2Z2FA 1G0JA 1JTPL 129LA 2NWDX 1OVKA 2DBTA 1CNSA 1XSFA 1BGIA 1TBYA 1JKDA 4W59A 3AJNA 174LA 1JTNA 4EPIA 3A6BY 1LZ1A 192LA 4WM4A 1D2YA 3CDVA 4LFPA 4LYMA 1HMLA 2HTXA 1RE2A 2G4QA 4G4CA 5KXMA 2LCBA 1L34A 3LYMA 3RZEA 3FA0A 1LHHA 1PQJA 3AW7A 4QY9A 1L66A 2RAYX 1L15A 1XFPL 4PJ2C 4B0DA 200LA 2CGIA 1MLCE 5KXLA 4GCEA 2CJLA 1G1WA 2MEDA 254LA 227LA 4RDSA 1JSFA 2HUBA 1GB5A 231LA 4WMGA 2ZNXY 3ATOA 1SSWA 4WM2A 1GB8A 1C08C 1HEOA 3RT5X 1GB2A 126LA 2BQGA 3F8VA 2MEBA 3DN6A 4ZFPA 2YDGA 1P3NA 1EL1A 1L59A 1IWTA 1I20A 1CV3A 4XJHA 1L24A 2N5ZA 3DN3A 1F0WA 1BWIA 3SB6A 2W1YA 3C8QA 3P64A 1IR8A 152LA 4ARMA 4J7VA 4H8ZA 2BQJA 3QE8A 1C6MA 1UCOA 1LMNA 1LZNA 2NTGA 1C6FA 1IC7Y 3QAKA 1LZYA 1LOZA 1L30A 4H9BA 1DYBA 1BB4A 3A67Y 1IWXA 5LZMA 5DM9A 5AMYA 2RBQA 141LA 1JJ3A 5C6IA 1G0MA 1OQMA 1UIAA 2B6TA 3GUIA 4NSHA 4W94A 1L21A 2D4KA 1G0KA 3TXDA 196LA 5ILFA 1LGXA 3WULA 2LZ2A 1GFGA 1IP7A 1GDWA 4OWCA 4MCKA 2QB0B 1LWGA 5B1GA 1LJJA 4LYOA 1GFRA 3GXKA 1HSXA 4EMNA 5F81A 4KL7A 3TXEA 3HH4A 4NHSA 3OE8A 4J0LA 1TDYA 3HT9A 3WPLA 3ZEKA 2ANXA 1DI4A 4ETCA 1LYFA 4PRQA 240LA 1LZBA 1CUPA 1C69A 139LA 3HT7A 4BADA 1LSCA 1XEJA 3A91A 1L06A 1BVXA 1QUDA 4HP0A 3GUJA 4AGAA 4XJBA 3A3RX 4H9IA 3HTGA 4S0WA 1AM7A 1LMAA 2C8PA 4NHTA 2BQOA 1GFHA 3L64A 1JITA 1IP4A 1L64A 1YKYX 2GV0A 4IASA 2B7XA 4XJGA 4I7QA 2MEEA 1P5CA 1NBYC 4ETDA 1G0PA 1D3NA 1IWVA 4N9RA 1GBYA 3P65A 4EKSA 1CV1A 1CX7A 1LSBA 1LMCA 1UIGA 201LA 3ULRA 4EOFA 176LA 5KXRA 3LHMA 1GEVA 1BQLY 3HU8A 3N9CA 4NHPA 1NDMC 1YL0X 3M18B 1W08A 4EKQA 3DMXA 4WL6A 2MEFA 2FYCA 1B6IA 4EKRA 1L32A 2RB2X 2OE9X 3G3VA 2B6YA 4FDYA 1B5ZA 125LA 222LA 5LINA 5M1YA 1CKFA 6LZMA 147LA 187LA 6LYZA 1LJIA 1LMQA 2I25L 5KJ9A 246LA 4DD2A 1GF3A 5K7OA 1L84A 4DT3A 4EJ4A 5KXOA 164LA 1G0GA 1FBIX 191LA 1CJ6A 4PPOA 1B9OA 190LA 1J1XY 250LA 1LJHA 1GBWA 1PQKA 4ET9A 1NHEA 1LW9A 1IVMA 1LZRA 2RH1A 1T8FA 245LA 4DYGA 2YBHA 2RBRA 5KXTA 1OV5A 140LA 2B73A 1L39A 1V7SA 2HECA 3RNXA 5DN4A 1KIRC 1GE2A 2EKSC 3WH1A 1XEPA 5HMJA 5FHWA 2F47A 4GCDA 1DPWA 2LZTA 4ZEEA 1C6DA 5F9UA 171LA 1I1ZA 3RW8A 4R0FA 1LPIA 3J6KA 1LKRA 5B1FA 4W56A 2IHLA 1WQPA 2CUUA 2F4AA 1L56A 1GBZA 1YROA 249LA 2W1MA 1IEEA 1P2RA 3CDOA 1YANA 1B7SA 234LA 3HH3A 2B6WA 4H92A 4YF2A 3WW6A 4FJRA 4ML7A 1HEQA 1OWZA 1JKAA 1AKIA 243LA 4LT1A 1QUGA 4GCCA 3M3UA 4YXCA 1LHJA 1HENA 3WXUA 215LA 2MEGA 2MECA 5HNCA 4E3UA 1LJEA 1L45A 1B5WA 2Z19A 1HFYA 253LA 1GF4A 1SLYA 1F6SA 4LZMA 199LA 2HEFA 3CQLA 4OWHA 5KY1A 5DL9A 1BB3A 1CJ7A 1OUCA 1QS9A 113LA 1L65A 4WG7A 1B7RA 1IC4Y 1T3PA 4K5YA 4NGOA 2DQJY 1B0DA 1WQRA 1HFXA 5LA5A 182LA 4J1BA 3CT0A 1QSWA 1WTHA 4WLXA 1C61A 3HBHA 4H9FA 115LA 1B7MA 2Z37A 112LA 1VATA 4CHXA 1DYGA 5LA8A 3CSRA 1IR9A 3V2YA 1LI2A 118LA 3EXDA 3G3AB 2OTZX 1B7NA 3A8ZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4GN5 C;  3LYZ A;  1QTZ A;  1C43 A;  4BS7 A;  1LCN A;  4NIJ A;  4YOP A;  3J4G A;  195L A;  1L29 A;  252L A;  1GXV 2;  3TXI A;  242L A;  4N0J A;  3F9L A;  1LZT A;  4XYY A;  2YSS C;  3G3W A;  110L A;  1KIQ C;  4WM1 A;  2FBB A;  1GBS A;  1C67 A;  224L A;  1D9U A;  4HTK A;  4TSB A;  4LGK A;  1QTV A;  4HTQ A;  1LHM A;  2HEE A;  4LDO A;  1GEZ A;  1AT5 A;  1JWR A;  185L A;  4N1C C;  1D0L A;  3A95 A;  1C6P A;  4LDL A;  1WQO A;  3A96 A;  1FDL Y;  4PJZ A;  1FLY A;  1OVH A;  2ZYP A;  1TLA A;  2DQE Y;  4NGZ A;  1GWD A;  1LWK A;  5E9R A;  4DD0 A;  1L40 A;  1LZ8 A;  1P2L A;  4EKP A;  5F9X A;  3MGW A;  4HV2 A;  160L A;  4YEM A;  2Z2F A;  1G0J A;  1JTP L;  129L A;  2NWD X;  1OVK A;  2DBT A;  1CNS A;  1XSF A;  1BGI A;  1TBY A;  1JKD A;  4W59 A;  3AJN A;  174L A;  1JTN A;  4EPI A;  3A6B Y;  1LZ1 A;  192L A;  4WM4 A;  1D2Y A;  3CDV A;  4LFP A;  4LYM A;  1HML A;  2HTX A;  1RE2 A;  2G4Q A;  4G4C A;  5KXM A;  2LCB A;  1L34 A;  3LYM A;  3RZE A;  3FA0 A;  1LHH A;  1PQJ A;  3AW7 A;  4QY9 A;  1L66 A;  2RAY X;  1L15 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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