1OV7A

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-allyl-6-methyl-phenol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1ov7A00
1L36A 3OE0A 1L13A 4I7LA 1L97A 1CV6A 163LA 243LA 1KY1A 2RB1X 169LA 1G0JA 1QT4A 2OU8A 3GUPA 4ARQA 1PQJA 1PQKA 1L39A 1L69A 1OV5A 4EPIA 189LA 247LA 1C6JA 1ZURA 162LA 1L62A 248LA 2RBQA 1L12A 112LA 1CU0A 1LGWA 113LA 123LA 1L02A 260LA 3NY8A 1C6PA 1XJTA 1C6FA 1LGXA 1OYUA 1L24A 4EKSA 3QAKA 1LPYA 137LA 1C6NA 1LYDA 145LA 1G0GA 4W57A 1L68A 2B7XA 3HUKA 3GUMA 170LA 1L49A 1CUPA 1C67A 3C8QA 1L96A 4ARMA 2HUKA 1L34A 1QS9A 2Q9EA 1L89A 164LA 1G0QA 1SX7A 1TLAA 238LA 1L35A 1L30A 1G07A 229LA 1L92A 4IAPA 1QUDA 1L10A 4OO9A 1L65A 225LA 3DN3A 240LA 1XJUA 3F8VA 3FI5A 4I7JA 1C6AA 2NTGA 2OEAX 3CDRA 3DN0A 1LI2A 1L01A 1ZYTA 171LA 1L94A 1SWYA 3VW7A 4EPFA 1CU2A 1L33A 224LA 218LA 110LA 1EPYA 4K5YA 1L60A 4I7RA 159LA 1DYDA 1L55A 4ARQB 3HDFA 1L19A 188LA 241LA 140LA 1L58A 1L83A 223LA 2O4WA 4AQNA 1CVKA 2OTZX 1QT6A 4W58A 1C6EA 1QUHA 157LA 2O79A 1L23A 2F2QA 118LA 3DMZA 1QT5A 1CV4A 176LA 6LZMA 1CUQA 1L84A 1L71A 3SBBC 1LYHA 4YX7C 1L48A 3G3WA 3C7WA 1L81A 198LA 192LA 1L26A 256LA 1T97A 1G0KA 1P5CA 1L09A 249LA 1P2LA 174LA 209LA 4GRVA 251LA 147LA 172LA 3RUNA 1P7SA 107LA 4YXCA 1CV1A 1P2RA 1L20A 1L85A 4LZMA 1QTHA 2OE7X 3FADA 3OE6A 146LA 4W55A 1SSWA 1L0KA 1CTWA 1JTNA 1QUGA 2O7AA 3L2XA 1L66A 1PQDA 1SWZA 1OWZA 3FA0A 1L70A 1P64A 1QTVA 3HH5A 1L86A 3HTFA 1L0JA 3CDVA 1L42A 1DYCA 4DKLA 173LA 1L79A 250LA 214LA 4W56A 259LA 1L52A 1OV7A 2LCBA 1C6LA 4I7QA 2OU9A 4ARLA 3G3XA 1DYAA 3C8RA 2B6XA 1L64A 3OE8A 4YXAC 1K28A 3C7ZA 1C6GA 1LWKA 4GBRB 3SN6R 1D2YA 3HDEA 2RAYX 1L57A 1L08A 2HULA 1C6QA 219LA 4EKRA 4ARJA 1QT7A 1C63A 239LA 1L56A 1OVKA 1SSYA 2B6WA 1L73A 2ANVA 185LA 1L99A 2B6ZA 3GUNA 3HU9A 3RZEA 103LA 4E97A 4W51A 4ZPUA 1QTZA 1L51A 1L77A 1PQIA 222LA 1L63A 3GUJA 1CU5A 2Q9DA 183LA 4I7OA 3C80A 1L28A 1D2WA 161LA 191LA 1L29A 262LA 1L46A 3CDOA 4I7NA 3DN8A 3SB9A 1D3MA 1P3NA 4I7KA 1KNIA 233LA 1G1VA 3G3VA 2NTHA 1CU3A 2QARC 2OE9X 1C6HA 130LA 235LA 1QSBA 1L82A 1C65A 1L31A 2RH1A 1G1WA 4I7TA 138LA 2RBSA 1L37A 4EKQA 2F47A 1L45A 3NY9A 3CDTA 3K2RA 231LA 128LA 236LA 195LA 1G0MA 2RAZX 1C68A 1DYEA 220LA 1KW7A 1LYJA 1L03A 3EMLA 144LA 1P37A 2B6YA 4EXMA 1P56A 2LC9A 2QB0B 111LA 125LA 1L91A 1L88A 261LA 2Z6BA 3HU8A 1L25A 4EJ4A 1P6YA 1L04A 2RBOA 1KS3A 1C64A 2RBRA 5LZMA 4EKPA 148LE 3ODUA 1T8FA 4I7PA 3HH4A 1LLHA 1T8GA 3DMVA 228LA 1T8AA 1D3FA 3D4SA 2ANXA 3HUQA 4W52A 114LA 1QSQA 3F9LA 1QTCA 1L41A 1LGUA 3C8SA 1KW5A 1XEPA 3DN4A 1QUOA 3HTDA 1L11A 200LA 1L90A 1C61A 4S0WA 1KY0A 2OU0X 129LA 1L50A 4ARPA 1L44A 152LA 1LYGA 122LA 1G06A 1JTMA 1CX7A 3L64A 149LA 186LA 3LZMA 4PK0A 1CV3A 1L40A 210LA 1LI3A 4DJHA 3HT7A 1OVHA 119LA 2RB0X 1DYGA 232LA 143LA 2F32A 1C6DA 1G0LA 3GUIA 3DN1A 1C6MA 3C83A 1L59A 1WTHA 184LA 1C6BA 3HH6A 177LA 1C6KA 3PDSA 2A4TA 156LA 2LZMA 2B74A 4LDEA 3JR6A 1L80A 2HUMA 1L27A 190LA 1PQOA 3DMXA 258LA 3SB6A 201LA 226LA 1C6TA 216LA 180LA 141LA 1L07A 199LA 253LA 1L43A 1DYFA 3HT8A 7LZMA 3V2YA 1LWGA 2B72A 1L67A 160LA 3SB8A 2RB2X 3HT9A 1L05A 1L74A 1L17A 3V2WA 244LA 1QT8A 181LA 165LA 3HUAA 221LA 257LA 155LA 2B75A 3DN2A 178LA 3DN6A 158LA 139LA 1D3JA 3C7YA 1G0PA 217LA 3HH3A 3SB7A 1L14A 1L47A 3HTBA 2OTYX 3GULA 131LA 3CDQA 127LA 2RBNA 187LA 230LA 1L76A 1QT3A 3DKEX 1L06A 2OE4X 2B70A 1L93A 1JQUA 1L75A 4W59A 3PBLA 1B6IA 151LA 245LA 227LA 3DNAA 4W54A 1CV0A 1D3NA 1L38A 168LA 2IGCA 1QS5A 182LA 1LYIA 1L95A 196LA 211LA 1C62A 1C66A 1L21A 1QTBA 4LDOA 1I6SA 126LA 205LA 109LA 2CUUA 3C81A 1OWYA 1L22A 1CV5A 242LA 254LA 150LA 1L72A 1C6CA 1L54A 1ZWNA 1L32A 1P46A 213LA 3UONA 197LA 102LA 1C69A 1L18A 4PJZA 4W53A 166LA 215LA 3C82A 1L98A 2RBPA 4DAJA 3HT6A 255LA 1L53A 206LA 108LA 175LA 4I7MA 3HTGA 3SB5A 1L87A 1L00A 234LA 4LDLA 1QTDA 2L78A 1D9WA 1SX2A 167LA 3SBAA 4ARMB 1P36A 1LW9A 142LA 1LI6A 1L15A 252LA 3NYAA 1C60A 5I14A 2B6TA 3HWLA 1T6HA 4I7SA 1PQMA 237LA 1LYEA 1L61A 3GUOA 1OVJA 212LA 1LYFA 3OE9A 115LA 1L16A 120LA 1DYBA 2B73A 1C6IA 1CU6A 246LA 104LA 1NHBA 1CX6A 3GUKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1JJ0A 4WM4A 4GLAA 1JTTL 1CV6A 163LA 5APFA 3EMSA 169LA 1G0JA 1LJHA 1PQJA 5HNCA 1PQKA 5E9RA 2FBDA 1GF0A 4EPIA 189LA 162LA 248LA 1L12A 1E8LA 4XJIA 5KXPA 3AYQA 1CU0A 4DD9A 1LGWA 2D4IA 1L02A 260LA 4NSIA 1WVVA 4EKSA 1C6NA 1GBYA 2BLXA 1YAQA 2B7XA 1OUCA 3RT5X 5KXWA 4ARMA 2Q9EA 1L89A 2G4QA 1SX7A 238LA 1BVXA 5II3A 1L35A 3LYMA 229LA 3KAMA 1L10A 4KT3A 1L65A 225LA 3DN3A 1UIGA 3CDRA 3DN0A 4NFVA 1YANA 3W6BA 1ZYTA 1B5UA 2YBJA 1HSWA 4U3XB 4CFOA 4EPFA 224LA 4K5YA 5F16A 2MECA 2D91A 1XGPC 1FLWA 5F81A 1L55A 1NF5A 2HEBA 140LA 1L83A 2BQFA 1I56A 1CVKA 1NKHA 1C6EA 1QUHA 1L23A 2C8PA 1QT5A 1CV4A 1IOQA 1CUQA 1GE1A 3LYTA 1GFHA 1L26A 1JIYA 5KXRA 1T97A 1G0KA 5KXKA 1JJ3A 1IVMA 251LA 2YBIA 1P2RA 1B0DA 1LSBA 1QTHA 3FADA 5C6LA 3L2XA 1PQDA 1LZYA 4QEQA 3FE0A 3HH5A 1L0JA 1TEWA 1DYCA 250LA 2W1MA 4WO6A 5KXYA 3IJUA 1C6LA 4ARLA 4ETCA 3G3XA 5DL9A 3C8RA 1L64A 3OJPA 3SN6R 1GF9A 1GBXA 1C6QA 4EKRA 4ARJA 4DQ5A 4NY5A 239LA 1MLCE 1L73A 3N9AA 1GE2A 2B6ZA 3RZ4A 1HSXA 3W6AA 1UIBA 1L51A 3ATNA 1HEMA 1VDSA 1PQIA 222LA 2MEEA 1L28A 1RE2A 262LA 1GF6A 233LA 4RW2A 3WH1A 4NGZA 3B6LA 4LT2A 3A8ZA 5IHGA 1JSFA 3A91A 2RH1A 1G1WA 4I7TA 1LSZA 3CDTA 1LZ1A 4NHSA 128LA 1UIHA 1KIPC 2CGIA 4EOFA 1I20A 1OUDA 2XTHA 1EL1A 1G7HC 220LA 4YF2A 1LYJA 4EXMA 5I4YA 2LC9A 4X3BA 1F10A 125LA 2MEGA 3CQLA 1VDTA 1IOCA 1OUEA 2Z6BA 1L25A 5F9UA 4EJ4A 4QY9A 1EQ4A 2Z12A 1REXA 1UBZA 1FDLY 1DI3A 1KS3A 2W1XA 5DM9A 2DQJY 4EKPA 3ODUA 5LYMA 3A92A 2H9KA 2HTXA 1WTMA 1HERA 4GCDA 3CT1A 4XJBA 4NEBA 1XSFA 5LYTA 3WUMA 1XEPA 3AW7A 1QUOA 1BGIA 5DLAA 1L90A 2HEFA 4GN3A 5LVKA 1ZV5L 4H90A 1IOSA 4EMNA 1GE4A 2N5ZA 5I4XA 1UACY 2ZYCA 4H1PA 1CX7A 3TXHA 3LYOA 2BQGA 4ZEEA 1DYGA 1NBYC 3HBHA 3WVXA 1UA6Y 3WW6A 4XJHA 3DN1A 1WTHA 1UIEA 4R6CA 177LA 3HH6A 5A3EA 3PDSA 2FYDA 1QDRA 4M4OA 1L80A 1OUFA 1CJ9A 2HUMA 4GCCA 4H8YA 258LA 1C6TA 2DQDY 3ATOA 199LA 4XJDA 3RU5A 4A7DA 1P2CC 2RB2X 5C6IA 1L74A 1WQMA 3A93A 3V2WA 4OW1A 244LA 3MGWA 1IP5A 165LA 3GXKA 3HUAA 1KXYA 3A6CY 5L3HA 1LSEA 1YILA 158LA 3C7YA 1LKSA 1V7TA 4NGIA 2OTYX 5B05A 4YM8A 1LHMA 2CDSA 4TUNA 1L06A 2EQLA 1WVUA 1IOTA 1GB6A 1L75A 1LZDA 1LYYA 4W54A 1D3NA 1VDPA 3WXTA 1L38A 168LA 4OOTA 2CJLA 1C46A 5LAGA 2RSCA 1I6SA 4NGLA 1LYOA 1BB6A 5AMYA 1ZWNA 5IDDA 1GBSA 1C69A 1NHEA 3C82A 4WG1A 135LA 1HEPA 255LA 1LSCA 2AUBA 175LA 2ZNWY 1INUA 134LA 1L00A 3G3AB 2ZQ4A 1CKGA 1QTDA 1D9WA 4ARMB 2G4NA 5L9JA 1P36A 1LW9A 142LA 4TTDA 1L15A 252LA 3NYAA 2B6TA 3T36A 4CFPA 1T6HA 5B1FA 208LA 4I7SA 3WPLA 3GUOA 1OVJA 212LA 5D5FA 1AT5A 3OE9A 115LA 4C5FA 1L16A 120LA 2B73A 1ZMYL 1GFAA 1LTMA 4BAFA 3HFMY 3GUKA 2BQJA 1L36A 5I4WA 3EXDA 1IR9A 2BQLA 1KY1A 5KXLA 1LMNA 4MSTA 3GUPA 4ARQA 1L39A 1GFJA 5HNLA 1L69A 4Z46A 5JENB 1XGUC 1OV5A 1L62A 2RBQA 5KXZA 1LZRA 112LA 1LHIA 2LHMA 113LA 123LA 4TSCA 4ETAA 3NY8A 1C6PA 1LGXA 4H92A 3TXFA 1GEZA 170LA 2DQGY 2HUKA 1WQNA 164LA 1IC4Y 1L92A 2DQCY 2I26L 2DQIY 1XJUA 1GF4A 3OK0A 2FBBA 4LT1A 4H9BA 171LA 1SWYA 3VW7A 5KXOA 3W6CA 1KXXA 5LA5A 1W6ZA 2NWDX 159LA 4N1EI 3HDFA 5APCA 1JTPL 188LA 241LA 1DI4A 223LA 2ZNXY 1T6VL 1QT6A 4W58A 4WM2A 5B06A 3K3TA 1HNLA 2F2QA 3DMZA 3WUNA 4W94A 3J4GA 4HJVA 176LA 6LZMA 3TMWA 3A96A 1L84A 3P66A 4H9EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1JJ0 A;  4WM4 A;  4GLA A;  1JTT L;  1CV6 A;  163L A;  5APF A;  3EMS A;  169L A;  1G0J A;  1LJH A;  1PQJ A;  5HNC A;  1PQK A;  5E9R A;  2FBD A;  1GF0 A;  4EPI A;  189L A;  162L A;  248L A;  1L12 A;  1E8L A;  4XJI A;  5KXP A;  3AYQ A;  1CU0 A;  4DD9 A;  1LGW A;  2D4I A;  1L02 A;  260L A;  4NSI A;  1WVV A;  4EKS A;  1C6N A;  1GBY A;  2BLX A;  1YAQ A;  2B7X A;  1OUC A;  3RT5 X;  5KXW A;  4ARM A;  2Q9E A;  1L89 A;  2G4Q A;  1SX7 A;  238L A;  1BVX A;  5II3 A;  1L35 A;  3LYM A;  229L A;  3KAM A;  1L10 A;  4KT3 A;  1L65 A;  225L A;  3DN3 A;  1UIG A;  3CDR A;  3DN0 A;  4NFV A;  1YAN A;  3W6B A;  1ZYT A;  1B5U A;  2YBJ A;  1HSW A;  4U3X B;  4CFO A;  4EPF A;  224L A;  4K5Y A;  5F16 A;  2MEC A;  2D91 A;  1XGP C;  1FLW A;  5F81 A;  1L55 A;  1NF5 A;  2HEB A;  140L A;  1L83 A;  2BQF A;  1I56 A;  1CVK A;  1NKH A;  1C6E A;  1QUH A;  1L23 A;  2C8P A;  1QT5 A;  1CV4 A;  1IOQ A;  1CUQ A;  1GE1 A;  3LYT A;  1GFH A;  1L26 A;  1JIY A;  5KXR A;  1T97 A;  1G0K A;  5KXK A;  1JJ3 A;  1IVM A;  251L A;  2YBI A;  1P2R A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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