1OVBA

The mechanism of iron uptake by transferrins: the structure of an 18kd nii-domain fragment at 2.3 angstroms resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
SYYAVAVVKKGTDFMIKDLRGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHREDIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDAKTKCLRNAPYSGYSGAFQCLKDGKGDVAFVKHTTVQENAPEEKDEYELLCLDGSRQPVDSYKTCNWARVAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The mechanism of iron uptake by transferrins: the structure of an 18 kDa NII-domain fragment from duck ovotransferrin at 2.3 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
source organism Anas sp.
molecule tags Iron transport protein
total genus 39
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-10-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovbA00
1H45A 1XS5A 4XIGQ 2ABHA 4RJZA 1NNTA 3PPPA 4MH5A 4BLAA 5KZTA 2QPQA 4P11A 3EF7A 1LAGE 3LUYA 1FQCA 5I57A 4GXSB 5KDTB 1LBBA 4FORA 1MPDA 3IORA 2GFEA 3LSLA 5TPAA 3BBRA 3K2DA 1IXGA 4NF4A 3QK6A 2Q2CA 1B3LA 3K6XA 4OYVA 4Z0IA 1A99A 1DMBA 2NUVA 2DWJA 4R9GA 2I58A 1M5BA 3EPEA 1A40A 3K4UA 1ZIUA 2THIA 2Y7WA 3S9EA 3KGCA 3VDFA 3USDA 4RXLA 1QJMA 5TP9B 2Y7KA 4NTLA 2X7QA 1SW1A 4U2RA 4POXA 3PMVA 1MDQA 1Y4CA 2UVJA 4AB5A 1TWYA 1YTVA 2A5TA 4ZEBA 1SQYA 3TEPA 3CG3A 2VGQA 3IOUA 5DVIA 3T9XB 3T9VA 1LFHA 3KN8A 3U1OA 2FA7A 1AL3A 4R73A 4FAJA 2Q8JA 2D3IA 3PD9A 1LAXA 1YCJA 1GVCA 1MQJA 3TFLA 4F3GA 4HW8A 3Q27A 1Y1MA 5CC2A 1BKAA 3LR1A 4XXUA 1MG1A 4YICA 4PE5B 3T96B 4KYSA 1QUKA 1IXHA 3UIFA 3IJXB 2H25A 3RN8A 4F19A 1B46A 1BLFA 3PU5A 1I6AA 3W15C 1XVXA 2ANJA 1MXZA 4LZ7A 3S2VA 3N5LA 1TFAA 2ZMBA 1SD3A 3C36A 1NNPA 4H5FA 2CMOA 3CFZA 4N6PA 2RKMA 3IL1B 3SEXA 3RT6B 2OJTA 2F78A 3PMWA 4G68A 4MLQA 3T22A 5FTIA 1AOVA 5KDTA 1WODA 4LZ8A 1FQEA 4YB5A 1MS7A 3GBAA 3FVOA 4LQ5A 1MRPA 2ONSA 1CB6A 3HSTA 3O2AA 4R2FA 4MBPA 1NL5A 3DELB 3IK6B 4RNSA 3VLVA 5I2KA 1A55A 1P1NA 1N7WA 2F6PA 5I58B 4HCYA 1FQAA 3JYRA 3OO9A 4KR5A 2G29A 3B7DA 5HM4B 4OTEA 4JWOA 5AA1A 2DXRA 4FEDA 1POTA 2H5YA 2E0SA 2RINA 4DDDA 3OSRA 2O68A 4R75A 2PMSA 1Z7NE 3IB1A 3CIJA 3MPLA 4R2BA 4EXLA 5ITPA 5FHNA 3EHTA 3ILTB 3TQWA 1FTOA 3LC8A 2QL3A 3VE1B 1O63A 1UIVA 1PEBA 3UK4A 4YKPA 3FVKA 2XXXA 4R6KA 3OEKA 5CM6A 3U93A 4OFJA 4ECFA 1LAFE 2QS4A 3DP6A 2F7CA 3B6TA 2P0SA 4YKIA 2ONRA 4F22A 3PUYE 1YAEA 3MVZA 4IO5A 4EQBA 3C33A 4K3FA 3QSLA 4R74A 5EYFA 4IO4A 4BDOA 3V89B 3FZVA 4G77A 1LCFA 2XXVA 2F36A 5DEXA 3CRBA 2P2AA 1B0LA 2W7YA 1Y3PA 3MPKA 2I0CA 2B65A 1B7HA 2M8CA 4H8IA 4KHZE 4EQ9A 1H3DA 2ESNA 3QUJA 1B5IA 4O3CA 3QXMA 5M2VA 4C1UA 1OQHA 4WEPA 1DPPA 2O1LA 3FATA 1MY0A 4LZ5A 4C1TA 4F18A 4RK2A 3SEYA 1IZ1A 3SERA 2V84A 3RY3A 2DOJA 1F9BA 4OESA 2DE2A 1GTKA 4NF8B 1TXFA 4NWDA 5ITOA 3O9PA 4GLIA 5DTBA 1B3GA 1JW1A 4RPOA 2HAVA 4ZEIA 4E0WA 1PDAA 3FUZA 2XXRA 3K0VA 3KOSA 4F2QA 4ONYA 4DXBA 1MY1A 5AA2D 2G93A 2X7PA 3W9WA 1WVJA 1D9YA 1UTHA 1NNKA 3QIMA 1B4ZA 5CMKA 5AA2B 3I5OA 3V5AA 1LB9A 4BDLA 3LSXA 5TU0A 1IUDA 4Q0CA 4U1OA 5ELVA 2XX8A 3FD3A 2RF1A 2I6EA 2UVGA 3IB0A 1O7TA 4OFOA 1N7XA 4TLMB 3EHUA 3DLNA 4ELRA 1RYOA 2Q9TA 4QRZA 5CBSA 4OVJA 1IIWA 5CMMA 5H8QB 4HS7A 2R6GE 3MUQA 2F34A 1CE2A 1AMFA 4RK9A 3S4UA 3ODBA 2X26A 3C34A 3MW0A 4P0IA 1EZPA 3FVNA 1B1XA 2UXAA 4PP0A 2DVCA 3M3KA 3MQ9A 4YMAA 1BTJA 4GRKA 3QUFA 3ECRA 1Y3QA 2F8DA 4ZECA 2Z8EA 3B6QA 3M3LA 3OO8A 3O6IA 3C35A 1ATGA 3P7IA 1QUJA 3MJNA 4M4GA 5BUUA 1IITA 3G3IA 2F6GA 2F7BA 3IOWA 4U4SA 3OEMA 5K2XA 4BDNA 4XTCQ 3RPWA 4IY5A 2Y84A 3TCHA 4JBZA 5ICTA 2DYXA 3OD7A 1JW4A 4AQ4A 4DE8A 4LONB 3FGSA 1D3KA 5H8NA 4OMBA 1MXVA 2QJEA 4GXAA 5EHMA 4IO2A 1ZKBA 4E0XA 4OETA 1LCTA 4OHNA 5CI5A 3PPQA 3UGWA 3UN6A 3TTLA 1IEJA 4L17A 2I49A 4X1DA 3ZKKA 2NWJA 3HHGA 2ZYNA 2RCBA 3ILUB 4F3SA 2I4CA 4U4XA 4ELQA 5AE4A 1B32A 5H8FA 3VVDA 1LFGA 1MXWA 5I56B 1R9QA 3L6GA 5DVFA 3LSWA 2ZNUA 3D4GA 3SEUA 4KQPA 1IXIA 1Q1KA 2AL5A 3GZGA 1QULA 5AA2A 2WKYA 3CVGA 3TELA 1YPNA 1VR5A 3OO7A 3KBRA 3VXBA 1UTBA 4KPTA 1FQFA 2ALUA 1H43A 3SDFA 5L9MA 1SI0A 5CMCA 2R9JA 2DWHA 5I59B 5ICQA 3LBSA 1XT8A 4M1VA 1N76A 1P1WA 4F3PA 4QHQA 5H8QA 4RPNA 5DT6A 2VHAA 2UYFA 3S9LC 5H8HA 4IGTA 3FASA 3RTFB 2I48A 4KYEA 1MXXA 2I4BA 4PFTA 4IO6A 1A8EA 4TOZA 4H5GA 1URSA 2REGA 1GV8A 4IO3A 1II5A 4YU0A 1SW2A 2I3VA 2HFBA 3K1NA 3GXAA 3PUVE 1B3EA 5K2YA 2O69A 4H67A 3SETA 4JSDA 2PX1A 4KI0E 4OENA 3FIRA 5AA4B 4F1VA 2UYEA 1B0HA 1UIUA 1ZLQA 5KCJB 2OBGA 1MH3A 4TQUQ 1XHYA 4I8CA 3VFJA 2RC8A 3N6UA 2O7IA 4RYAA 3ZKLA 2Q2AA 4FIMA 4JWXA 3KJTA 3DP8A 3IAZA 3GBBA 4Q8RA 4F1YA 3VVEA 1PC3A 4FATA 1MY2A 1QW0A 1VFDA 4THIA 4YB7A 1MM6A 2DE4A 3WAFA 4U23A 4HCWA 3TTKA 2VOZA 2DWAA 3C4MA 4JDFA 1D4NA 1A7LA 4KYDA 1VFEA 4ESWA 1MQIA 3VXCA 1SBPA 5L8DA 3FJ7A 3PPOA 1JVXA 2OWTA 1B9JA 4EUOA 1SI1A 1FCKA 1XC1A 3KN3A 4QF9A 2XX9A 4IY6A 2PT2A 4R6YA 5I59A 3G3HA 4OWDA 4ZE9A 1DTZA 1Q35A 5TP9A 1VSOA 3H7MA 4GOTA 2GHAA 1NH7A 1JETA 4GQOA 4Q30B 4UA8A 2NXOA 1URDA 4EDPA 1USYE 1OMPA 4QFOA 3HCQA 1I6QA 3E13X 3OELA 1GR2A 4O3AA 3FV2A 3UA8A 2PVUA 4ZZEA 4PFUA 3HN0A 4ZEKA 5DVJA 2OLBA 3U72A 3TUSA 4YKJA 3G3FA 4I9DA 4H6DA 4G8NA 1B51A 3O6HA 3PD8A 5FHMA 2BJJX 1ELJA 2O7UA 2PT1A 3T9UA 3VVFA 2XXHA 4FECA 2CZLA 4GIZA 2IEEA 4GL8A 1NNFA 5JEIA 1MY3A 4YMBA 2V3TA 1OQGA 5KCJA 5BWJA 2Z8DA 2KLFA 4GVOA 1SW5A 3VV5A 1XOCA 1EH3A 3T93B 1I6BA 2V93A 3MBPA 2Q89A 2ZYMA 3SESA 1FTMA 5I2NB 3OSQA 3ZSFA 4I1DA 3V8XB 1P1OA 4YZZA 3OOAA 4OEVA 2QS2A 3FJGA 1A54A 4PETA 1RYXA 4XKQA 5AA3A 3TQLA 4MLVA 4X9TA 3SKPA 3TZAA 3G3JA 5I58A 5L9SA 3C9HA 4P0GA 1ANFA 1LGBC 1FTKA 1D9VA 3KSJA 3G7WA 4QSCA 2YPNA 2QMXA 4DXUA 1EZ9A 2XX7A 1Z7ME 4N07A 4H65A 3MZ9A 4NF6B 1B4HA 1N0TA 1ZBMA 2HZLA 4QSDA 4YKKA 1PBPA 3M8UA 5CRYA 2V3UA 2NOOA 4QFPA 1L5TA 3TODA 3HO7A 3N6TA 4F1UA 4Z7EA 3A3CA 4G8HA 3T66A 5I57B 2O6AA 4KD5A 3EHSA 2P1SA 3KG2A 1ZTYA 1O64A 1URGA 4QFKA 5EHSA 1Y20A 4FEBA 3R7XA 1OVTA 3MC2A 4R9FA 2XD2A 1Y4TA 2AYSA 3IJOB 5B7DA 2QS1A 4YAHX 1JQFA 4KCCA 2H99A 4BDQA 3GLBA 2HAUA 2OZZA 1MH4A 2XXPA 3Q28A 3H3GA 3VLUA 4ZEFA 2XXUA 5CBRA 1S50A 5IKBA 4G4PA 4NWCA 1FQDA 2OK2A 3QYTA 3TKDA 1P99A 4U1ZA 3VLWA 1SYHA 2AL4A 3I6VA 1EZOA 3KFMA 1Y3NA 2DQVA 1R1NA 1T0KA 2QSXA 3M3FA 3O97A 2VD3A 2HCAA 1OIBA 3G3GA 4TLLB 3K6WA 3PUWE 2FNCA 3MAMA 4EXKA 3E4RA 1P1UA 3N94A 1NMUA 1FQBA 3E3KA 4PFWA 4NF8A 4G2ZA 3MVXA 2E1SA 4ND9A 1M5DA 3RNNA 1N3WA 3O66A 3K00A 3TPAA 3RQTA 1PB8A 3IX1A 3THIA 4NF6A 3IB2A 1A8FA 1PB9A 1QUIA 2ONKE 2XXQA 1IXCA 4RY1A 3TAJA 1TT1A 3IO6A 4WXJA 1IQ7A 1OVBA 4G68B 3C32A 1B5JA 3AXFA 2B3BA 1B3HA 4OXVA 3Q26A 1LSTA 3H6UA 5CMBA 3K6UA 3CFLA 2DVZA 3MVWA 2NVUB 2PBWA 4XKRA 2O84X 3KJ7A 2IA4A 2XHDA 5I2KB 3EN3A 2REJA 3BKIB 3O28A 2Q88A 2XXIA 2ZXTA 3K1PA 5JTYB 4DLDA 1AH5A 3B6WA 1US5A 3H06B 1LLSA 4ELOA 2QRYA 4EF2A 5A5XB 4AB6A 3TMGA 3K6VA 3QAXA 2RCAA 4U22A 1N84A 1ZJLA 2Y7PA 5LOMA 3MWBA 4OFLA 3K1MA 1MPBA 1PB7A 3PMXA 1JVYA 4Q5TA 1FTJA 4JWYA 5HBCA 1LB8A 2HQ0A 2DWIA 2DS9A 4OEUA 1POY1 1GGGA 3WAEA 4F2OA 1DPEA 3U94A 3TCGA 4IO7A 2XXWA 1JNFA 2V3QA 2Z22A 1DOTA 3K02A 2DP8A 3RLFE 1MY4A 3G3KA 4JSOA 4GWOA 1N04A 2V25A 3DM0A 2VD2A 3V83A 3FVGA 1MXYA 2D5WA 3HPIA 1UQWA 3SEWA 5DEXB 1LBCA 3H4ZA 4ZS9A 3JV9A 2I0BA 1MQHA 3KSXA 3UP9A 3PUZE 1HSLA 3LSFB 2YLNA 3S9NC 1DTGA 1US4A 1B7ZA 3OMBA 5F1QA 5I56A 5DYHA 1B6HA 4LVQA 2OCUA 3OXNA 4EF1A 2PYYA 3PPRA 5FTHA 1JEUA 1N3XA 1OLCA 2QS3A 1SVXB 5F7VA 1FW0A 2DXYA 2O1MA 4ELPA 1OLAA 3KEIA 4HTGA 2I3WA 3H6TA 3O6GA 2LAOA 4PFYA 2XXTA 4DXCA 3PUXE 3SEVA 5JTYA 3RT8A 1MQGA 2GHBA 1JEVA 4YB6A 3CSBA 5IAIA 5A5XA 2F7AA 1M5EA 4ZEDA 3K01A 3MP6A 2Y7IA 3HHFA 1JW5A 1EU8A 1ZU0A 3JZJA 3EQ1A 1FTLA 3CSGA 4DCXA 3IR1A 3BFUA 4GFRA 1QKBA 4MFIA 1HSEA 2H98A 4GL0A 1B2HA 4LA9A 3H6VA 2GRVA 4ESXA 4X1BA 2O51A 2VP1A 1B05A 4LATA 4NF5B 1SDXA 1NKXA 4GD5A 2UVHA 1BP5A 2F97A 3U8QA 2ZNSA 2HZKA 3R6UA 1SYIA 3TTMA 1UTHB 1ZMGA 4I62A 5ISUA 1MM7A 1B58A 1R9LA 4NMYA 2OWSA 3A3UA 3F11A 1BIYA 5AA4A 1SW4A 1USYH 3U92A 2ZNTA 3DP4A 2YJPA 1B5HA 3MZBA 2XXYA 2Z23A 2GH9A 1LFIA 1PBQA 4IB2A 4WKMA 4XKPA 1H76A 4O3BA 2H4IA 3TTRA 3FXUA 3D4CA 2ZYOA 4ZE8A 4ISUA 1QVSA 1I69A 1B40A 4IGRA 1DSNA 4DIGA 4OZ9A 1MQDA 4BDMA 3TCFA 4JB7A 3RGYA 2H9BA 2HEUA 1B1HA 3FJMA 3S9MC 3O29A 4N13A 1B7UA 3R26A 4U21A 3CI8A 3CR9A 2B3FA 4LQ2A 3KN7A 1M5FA 4QSEA 2DE3A 4ZDMA 4RA1A 1AIVA 3IO4A 3ZS6A 5FHOA 2QMWA 4KCDA 4BDRA 5H8NB 3E9XA 4F39A 1NH8A 3IOVA 4POWA 4ZZAA 4MF3A 5J1DA 5B70A 2RC9A 1P1QA 2A5SA 4XKNA 4R72A 2UVIA 1HSJA 1R6ZA 1NFTA 4G8MA 5JK4A 1MPCA 4LP2B 4LUBA 2XD3A 1M5CA 5H8SA 4F29A 3L6HA 1B52A 3T9HB 3FXRA 3N26A 3FXQA 5H8FB 4H8JA 3CG1A 4FE8A 5TPAB 4NF5A 4NF4B 4NE4A 3TYHA 2AIXA 4OQOA 3CFXA 3PPNA 3FV1A 3OO6A 4C0RA 2FYIA 1B3FA 3KZGA 1H44A 4DZ1A 4H1XA 1QKAA 1LAHE 1UTBB 3OENA 3RTWB 3UORA 4DCYA 3MVYA 3A09A 2F5XA 3KOTA 4H0WA 3TTNA 4F3BA 4UACA 1RKMA 4PQJA 5I2NA 3H6WA 3MP1A 2HXWA 2A5TB 1VE4A 4R6HA 4EQ7A 5H8HB 4NEDA 1XVYA 1MXUA 1KWHA 2Y7RA 2Z8FA 3BFTA 3H03A 1S9TA 3IOTA 1WDNA 3W9VA 3RUMA 3C31A 2F35A 3PV0E 5I84A 2RC7A 3HV1A 3TDJA 1Y9UA 1Y1ZA 5HPQA 1S7YA 4KFQA 4QFLA 5L9OA 3PGFA 4X48A 4QFNA 4OERA 4WEDA 4JXIA 3Q29A 4G68C 1J1NA 2D21A 3MZ1A 3I3VA 3Q25A 3ONMA 4GF8A 3MP8A 4FJPA 1TFDA 1MDP1 2DSFA 4F31B 2R71A 2ZYKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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