1OVBA

The mechanism of iron uptake by transferrins: the structure of an 18kd nii-domain fragment at 2.3 angstroms resolution
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
159
structure length
159
Chain Sequence
SYYAVAVVKKGTDFMIKDLRGKTSCHTGLGRSAGWNIPIGTLIHREDIEWEGIESGSVEQAVAKFFSASCVPGATIEQKLCRQCKGDAKTKCLRNAPYSGYSGAFQCLKDGKGDVAFVKHTTVQENAPEEKDEYELLCLDGSRQPVDSYKTCNWARVAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The mechanism of iron uptake by transferrins: the structure of an 18 kDa NII-domain fragment from duck ovotransferrin at 2.3 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords OVOTRANSFERRIN
molecule tags Iron transport protein
source organism Anas sp.
total genus 39
structure length 159
sequence length 159
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-10-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ovbA00
2NWJA 3SEXA 4IO2A 2PT1A 4PFUA 4EF1A 5CI5A 1MG1A 4NWCA 2D21A 4NTLA 2V3QA 4TQUQ 5H8HB 1MXWA 1MH4A 4LA9A 2B3BA 2GFEA 1OVBA 3TZAA 3TCHA 5AE4A 1LBCA 4QSEA 5B7DA 1HSEA 1NKXA 1UTHB 4G8NA 1IXCA 3U93A 3PPOA 3GBBA 3T9HB 3V8XB 3TTMA 5I59A 1JVXA 1MRPA 4H8JA 1B5IA 1TFAA 5AA2A 4H1XA 4JXIA 1FTOA 3A3CA 1L5TA 4MLVA 3FVKA 1B7HA 3O28A 1TXFA 3PMWA 1B3FA 3N5LA 1PDAA 4U1OA 3MBPA 1B5JA 2HAVA 3UN6A 4KCCA 3WAEA 3FATA 4NWDA 2QSXA 1Z7NE 5ICTA 5H8NB 1UIUA 5TPAA 3MPKA 1PEBA 3CG3A 4OYVA 4RPNA 4DZ1A 3FJMA 1B6HA 4G68B 1UIVA 4THIA 4Q30B 4U22A 4FIMA 2WKYA 2H4IA 4IGRA 3C4MA 3MP8A 5I2KA 3C9HA 5CRYA 2DE3A 2I3VA 1SQYA 3ZS6A 2XXQA 1RYOA 4X1BA 1ZBMA 4XIGQ 3MAMA 4IO4A 1BIYA 2RCAA 3HSTA 1QUIA 5AA3A 3MUQA 3T96B 2IA4A 2A5SA 5K2XA 1OIBA 3O97A 1YTVA 5K2YA 2FYIA 1B4ZA 3H6TA 2G29A 5CM6A 3HHFA 4C1TA 2UVGA 4XKPA 5CMBA 4GFRA 3JZJA 2V3TA 4R9FA 1MM6A 3OMBA 1Y9UA 2QJEA 5DYHA 4MLQA 5H8HA 2I4CA 2OLBA 4BDQA 3IK6B 3K2DA 3OO6A 5L9MA 1HSLA 3UP9A 3FUZA 1JW1A 3K6WA 5I56A 3RY3A 4R73A 3U92A 2AL4A 4ND9A 3S9LC 1UTHA 4F2QA 4JBZA 2XXYA 1N3WA 4PETA 3ILTB 4GL0A 3THIA 1FQEA 3ONMA 5DTBA 2Q9TA 2AIXA 4EF2A 2HEUA 2DYXA 1B51A 5KZTA 2CMOA 5FTHA 2NVUB 2F7AA 1A40A 2XX9A 1MQJA 2A5TB 3G3IA 3PUXE 2F7BA 1OLAA 3E3KA 3FXQA 4R75A 3TKDA 2NOOA 4UACA 3T93B 2HZLA 4GQOA 2DP8A 1H44A 5FHOA 4ZDMA 3KN3A 2F7CA 4X1DA 5H8NA 2QS3A 5BUUA 4DXUA 4QHQA 1Y4CA 1AL3A 4OTEA 1FQBA 1M5EA 1N7XA 4G68A 1A55A 4O3BA 1R9LA 3CR9A 3IB0A 1P1OA 4IB2A 4RXLA 4QFOA 2YLNA 3SKPA 3PUVE 2H98A 3G3GA 2V3UA 3ODBA 1DPEA 3M3FA 1URGA 4ZEKA 4RYAA 4OWDA 4OEVA 4OEUA 3TCGA 3S9EA 2F6GA 1MY0A 4Z7EA 3K00A 1GR2A 4YZZA 2HXWA 2D5WA 3PUYE 3SERA 3FASA 2YJPA 4RK2A 1QJMA 1LFHA 3DP8A 2OWTA 3G3HA 1MY4A 5CC2A 3UIFA 1ATGA 3TTNA 1WODA 2R9JA 4POWA 4M1VA 4DDDA 3OD7A 5BWJA 2DWIA 3CFXA 3VXCA 3QUFA 1TT1A 4YMAA 1AIVA 5JK4A 5L9OA 3VLVA 3MQ9A 2ZYOA 4TOZA 3MPLA 1PC3A 4FEDA 4HTGA 3VFJA 5TP9B 4KYDA 3WAFA 2Y7WA 3LUYA 1FTKA 1S9TA 2B65A 1B3HA 3PPPA 1MXYA 2P0SA 3KBRA 1ZLQA 3KEIA 2ZYKA 3S2VA 2OBGA 4KPTA 3MJNA 5H8SA 3T9XB 4GLIA 3M8UA 4R9GA 1LFIA 5H8FB 3TPAA 2DE2A 1Q35A 2XXWA 3N26A 2P2AA 2REGA 1MS7A 2DXRA 1KWHA 3PPRA 3CIJA 4F29A 3FVGA 4F3SA 5FHMA 1IITA 3T9UA 4EQ7A 1H76A 5AA2D 3SETA 3BFUA 3PMXA 4H0WA 4QFNA 5M2VA 2RC9A 3V83A 1PB7A 1M5BA 3IB2A 3PU5A 5A5XB 4P0IA 3VLWA 3Q27A 3OO9A 2THIA 4DIGA 4BDLA 4OETA 2I0CA 4GOTA 2PYYA 1MQHA 4JWOA 3K0VA 2F35A 5EHMA 1B9JA 1R6ZA 1SW5A 4EXLA 3OO8A 3B6TA 3TELA 4C0RA 1D9YA 3KGCA 3DELB 1B46A 1IZ1A 2V93A 4LZ8A 1B40A 1LSTA 3TTRA 2DWHA 3SEVA 3FV1A 3P7IA 1MQGA 2DS9A 4E0WA 1UTBB 1MPDA 2Y84A 3EHUA 2XXRA 1Q1KA 1JW4A 4NF8B 3H7MA 1VR5A 1QUJA 5HPQA 1YPNA 3M3KA 4N13A 1SD3A 1VSOA 4JSOA 1A7LA 3N94A 3VVFA 3VV5A 1M5DA 3C32A 5I57B 3H6UA 3UORA 4JB7A 4IO7A 1DTGA 4L17A 3RLFE 2HCAA 2I4BA 4N6PA 1MXVA 3EQ1A 5H8FA 4FEBA 1OVTA 1PB9A 3O2AA 3USDA 4RY1A 2Z8FA 3PGFA 3S9MC 1SYHA 3RTFB 5DEXB 3B6QA 1BLFA 5I2NB 4MF3A 4K3FA 1MXXA 4PFWA 1EH3A 4LQ2A 5KDTB 1MM7A 3MZBA 1YAEA 3C35A 1P1UA 4AB5A 1J1NA 3MP1A 4H6DA 4QFKA 4LUBA 4KYEA 4IO5A 3U8QA 5IAIA 2UYEA 4ZS9A 5HM4B 3UA8A 1SW1A 2IEEA 3BKIB 4KD5A 3TEPA 2O1LA 2ESNA 4YB7A 2O7IA 3RPWA 1MY3A 4AB6A 1USYH 1RYXA 1LCFA 2RC8A 2LAOA 4F22A 1POTA 3HCQA 1QULA 3K01A 1NL5A 4U23A 1FQFA 1H43A 3DM0A 5CMCA 1I6AA 3TDJA 2ONSA 4QSCA 1SDXA 4BDNA 2QS4A 2H99A 3PPQA 5DVJA 1II5A 4C1UA 1F9BA 3K4UA 1SW2A 1ZU0A 4QF9A 3VDFA 3L6GA 2F78A 3DLNA 4O3AA 4YKIA 3KFMA 2ONKE 2Y7KA 2RINA 4G8HA 3OEKA 4H5FA 2XXVA 1UTBA 3LR1A 1LBBA 2XXHA 5FTIA 3RNNA 2GHAA 1LAGE 2DWAA 4JDFA 5EYFA 3N6TA 3ECRA 1B0LA 3QIMA 4XTCQ 2O68A 4O3CA 3EN3A 3HN0A 4LZ7A 2XXTA 4H8IA 4AQ4A 4HCWA 5I57A 3OO7A 1DPPA 1CE2A 1GTKA 3FXUA 1B52A 2OWSA 4XKNA 4KFQA 1ZJLA 4F18A 3DP6A 4R6KA 4NF6B 4YKJA 1OMPA 2UXAA 1QKBA 5ICQA 1IUDA 1SYIA 2BJJX 1OQHA 2QMWA 3MWBA 3ZSFA 4R2FA 4BDMA 2OCUA 5DEXA 5I2NA 4Q0CA 4FORA 5KDTA 1SVXB 2QS2A 2O7UA 3KN7A 1LCTA 5H8QB 1B7ZA 3C36A 3QXMA 5JTYB 3QK6A 4FECA 2OJTA 4BLAA 4U4SA 2Q89A 1FQAA 3W9VA 3Q25A 3IOTA 4F19A 5B70A 4QRZA 3K02A 1B58A 4G77A 2G93A 1LB9A 1Y20A 2F8DA 5CMMA 4EQBA 1PBPA 3EHTA 3W15C 1DSNA 2F97A 1B5HA 1JEVA 2F6PA 3F11A 3GZGA 3KG2A 3MVYA 1H45A 1GGGA 2XXPA 4KR5A 4ZEFA 3ZKKA 3K6XA 3FZVA 2Z22A 4R72A 3S9NC 3TQWA 3TQLA 4U21A 3ILUB 2PX1A 5L9SA 1BTJA 4XKRA 3PD8A 3SESA 2AYSA 3Q29A 1LGBC 3PPNA 4FE8A 4OXVA 4PQJA 2P1SA 4YAHX 4NE4A 1LAHE 3IX1A 2VD3A 3A3UA 2I3WA 3TAJA 4RJZA 1NH8A 3FJ7A 3IORA 4F1UA 3FJGA 4G8MA 2VOZA 2HFBA 1MY2A 1ZIUA 4POXA 1P1WA 2REJA 5L8DA 4NF6A 1NNFA 3K1NA 3CG1A 3TFLA 4KQPA 3HO7A 4YB6A 1N3XA 2NUVA 3OENA 1NMUA 2X7QA 3VVEA 1BKAA 3AXFA 4X9TA 4LVQA 3T9VA 3FIRA 2M8CA 1XS5A 4ZEIA 3I5OA 1NH7A 2F34A 5H8QA 3O6HA 5ITOA 3G3FA 4PE5B 5JTYA 1YCJA 1Y3QA 1B7UA 2A5TA 5JEIA 4DXBA 2FNCA 3IJXB 4ESXA 1P99A 4ECFA 2HAUA 2F36A 2Y7RA 4RPOA 4GXAA 5ELVA 3KOTA 1AMFA 4OZ9A 2E1SA 4OENA 5LOMA 3H6WA 2FA7A 1OQGA 3FD3A 1Y4TA 3D4GA 2O69A 5EHSA 4X48A 1FCKA 1B1HA 4PP0A 1P1QA 3CFLA 2HZKA 4MBPA 3K6UA 2O1MA 3E9XA 1URDA 2VHAA 3Q26A 1JEUA 1FTMA 2ONRA 4OVJA 1JETA 2B3FA 5HBCA 4FJPA 1DMBA 4TLMB 1PBQA 4N07A 3FV2A 4EUOA 1EU8A 3LC8A 3B7DA 5DVFA 2VD2A 1N0TA 1R1NA 3G7WA 1PB8A 1MH3A 4MFIA 4NF5B 1EZ9A 1LLSA 2I58A 2UYFA 3QYTA 1IXGA 2UVHA 4F1YA 3FXRA 2QL3A 2DVCA 4YB5A 1ELJA 2CZLA 1US4A 3BBRA 1Y1MA 4H67A 3M3LA 4G2ZA 4NMYA 1FTJA 3V89B 4Z0IA 1N04A 3L6HA 5DVIA 3EHSA 4QFLA 3CFZA 3D4CA 1BP5A 4GD5A 5AA4B 2VGQA 4HCYA 1GVCA 4RA1A 3PMVA 2Y7PA 5TP9A 1OLCA 3CVGA 2R71A 3IOWA 4KYSA 3CI8A 3OEMA 4GIZA 3BFTA 1N7WA 2VP1A 3TYHA 1EZPA 3QUJA 2DXYA 1O63A 2O51A 3VVDA 2ZMBA 3GBAA 3OSQA 1M5FA 1MPCA 4F2OA 4F3GA 1ZKBA 3HHGA 1A54A 2XHDA 1S50A 1QW0A 2Q2AA 1Y3NA 1EZOA 2H5YA 3RTWB 4GVOA 4BDOA 1N76A 1M5CA 4GWOA 1LAFE 3O9PA 2ZNUA 1RKMA 4OERA 2GRVA 3FVNA 3TCFA 3MP6A 3IO6A 1P1NA 5I56B 4R74A 1B2HA 4QSDA 1AH5A 4GL8A 4XKQA 1IEJA 2OZZA 4NF4B 1WVJA 2QMXA 1B1XA 4OESA 4ELQA 3H4ZA 2ZYMA 3KN8A 4OFLA 2E0SA 1XVXA 2X26A 4ZECA 4YKPA 4U4XA 4ELRA 4NF5A 1VFEA 5A5XA 3CSGA 3IOUA 4YKKA 1O7TA 4JWYA 3JYRA 1GV8A 3S4UA 2DOJA 1IXIA 4KCDA 1T0KA 4ESWA 1SI0A 2RCBA 4WEPA 3SEUA 4P11A 1HSJA 3TMGA 1B3GA 1MDQA 2GH9A 1D3KA 4IY5A 4TLLB 4XXUA 3KJ7A 3UGWA 4EQ9A 3SEWA 3A09A 2OK2A 4M4GA 4GXSB 2Z8DA 4KI0E 5AA4A 4ELOA 4NF8A 3I6VA 3OXNA 3IL1B 4LONB 1US5A 2QPQA 4IO3A 3TTLA 2I0BA 3LSWA 3H3GA 4IO6A 2DSFA 2ANJA 1A99A 3MW0A 3JV9A 2RKMA 3LBSA 4U1ZA 3RN8A 4YU0A 5CBRA 2ABHA 2UVJA 5F1QA 4R6HA 1D4NA 4WEDA 2RC7A 1FW0A 4OHNA 2I6EA 3RQTA 4I62A 3CSBA 5I58B 1A8FA 4JWXA 2X7PA 3RUMA 1QVSA 4OQOA 4F1VA 3IO4A 2DVZA 2XD2A 4Q5TA 3EPEA 4NF4A 1IIWA 1POY1 3VLUA 1IXHA 5IKBA 2I48A 3O29A 3H6VA 1MXUA 3R7XA 4I1DA 2QS1A 3R26A 5KCJB 3OOAA 3PD9A 2XX8A 3SDFA 1MPBA 3KSXA 2F5XA 4HS7A 2V84A 3RT8A 4P0GA 5FHNA 2DE4A 2Q2CA 1NNPA 3HV1A 1ZTYA 1I69A 1JVYA 2Q8JA 4FAJA 1MDP1 4F31B 2PVUA 4JSDA 3MVZA 4E0XA 2Z23A 4ISUA 1QUKA 3KSJA 1XOCA 4I9DA 1AOVA 5I84A 4PFTA 4WXJA 2ZXTA 3MC2A 4BDRA 3RT6B 4DXCA 3V5AA 2ALUA 4OFJA 1LFGA 2HQ0A 4ZEBA 4Q8RA 3DP4A 1VE4A 5ISUA 2GHBA 4GRKA 1XVYA 4ZZEA 4DE8A 1LAXA 1XC1A 3U1OA 3H06B 3QAXA 1B0HA 1B32A 3W9WA 2D3IA 5CBSA 1FQDA 3UK4A 3T22A 1N84A 5CMKA 1B3EA 1I6QA 3MZ1A 3IOVA 3GLBA 1DOTA 3N6UA 4UA8A 2XX7A 4ELPA 2R6GE 2UVIA 5ITPA 3K1PA 4YICA 3MZ9A 1MQDA 4ZZAA 3CRBA 2RF1A 3FVOA 3TTKA 4IGTA 4F39A 3VE1B 2DQVA 4DLDA 2O6AA 4HW8A 4PFYA 3FGSA 1JQFA 3C33A 4LZ5A 5I58A 3KJTA 3O66A 1NNTA 3LSLA 2PBWA 3LSFB 1D9VA 1I6BA 1B3LA 4LP2B 4U2RA 4EDPA 1VFDA 3G3JA 3OELA 3K1MA 1TWYA 3MVXA 1SW4A 4OMBA 1Y3PA 1FTLA 1LB8A 2PMSA 3KOSA 4R2BA 4OFOA 3EF7A 1URSA 4FATA 2W7YA 5AA1A 4F3BA 5KCJA 2DWJA 1Y1ZA 1CB6A 4F3PA 4LATA 1UQWA 2NXOA 3U72A 2YPNA 3C31A 1JNFA 1NFTA 4RNSA 3KZGA 3IJOB 1S7YA 3U94A 3VXBA 3PUZE 4R6YA 1MY1A 2XXIA 3SEYA 4MH5A 2QRYA 3E13X 1B4HA 2O84X 3Q28A 2ZNTA 1NNKA 1TFDA 5I59B 1ZMGA 3T66A 4QFPA 4H5GA 5F7VA 5AA2B 2PT2A 1A8EA 2H25A 3GXAA 3OSRA 1B05A 1R9QA 3C34A 2I49A 3TUSA 1H3DA 3ZKLA 2XXXA 1MQIA 3IAZA 4LQ5A 5J1DA 3PV0E 4RK9A 2V25A 4ZE8A 3O6GA 2Z8EA 5TPAB 2Y7IA 1IQ7A 4GF8A 4ONYA 1USYE 4DCYA 3E4RA 4G68C 2ZNSA 3LSXA 4IY6A 3MVWA 1QKAA 1XT8A 1SBPA 1ANFA 3H03A 4EXKA 2XXUA 3IB1A 3IR1A 2ZYNA 4DCXA 5I2KB 3QSLA 3HPIA 3PUWE 2Q88A 3R6UA 1JW5A 3I3VA 4KHZE 2AL5A 3K6VA 4G4PA 2XD3A 1DTZA 1XHYA 1O64A 4YMBA 3G3KA 3O6IA 4WKMA 4NEDA 4I8CA 1Z7ME 3RGYA 1SI1A 5DT6A 3TODA 4ZE9A 3B6WA 5TU0A 1MXZA 1FQCA 1WDNA 2KLFA 4H65A 4ZEDA 2H9BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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