1OVYA

Solution structure of ribosomal protein l18 from bacillus stearothermophilus
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
97
structure length
97
Chain Sequence
GTTERPRLSVFRSNKHIYAQIIDDTKSATIVSASTLDKEFGLDSTNNIEAAKKVGELVAKRALEKGIKQVVFDRGGYLYHGRVKALADAAREAGLEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Bacillus stearothermophilus
pubmed doi rcsb
molecule tags Ribosome
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule keywords 50S Ribosomal Protein L18
total genus 13
structure length 97
sequence length 97
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00861 Ribosomal_L18p Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ovyA00
4IOAL 1QVGM 1ILYA 1VQNN 3OW2M 5DM6L 1KD1O 4IOCL 3G71N 3J7ZO 1VQ5N 3DLLL 3CMEN 1VQ6N 3CCRN 4IO9L 2ZJQL 3CC7N 3CPWM 2OTJN 5MLCQ 1K73O 1K9MO 1VQ7N 3CCSN 3CCEN 1VQLN 4U67L 1Q7YO 3CMAN 3CCVN 3CCUN 1YJ9N 1YJWN 1JJ2M 5GAEP 2QA4N 1VQKN 3CD6N 1OVYA 3G6EN 5JVGL 1M90O 3CCLN 2QEXN 5DM7L 4WFAL 1N8RO 5GAHP 5H1SQ 1VQON 1YI2N 3PIPL 3CCJN 1VQ4N 2ZJRL 1NJIO 2ZJPL 3CC4N 1Q86O 1VQMN 3G4SN 1KQSM 1VQ9N 3CCQN 1KC8O 1Q81O 4WCEL 3CCMN 1VQ8N 4UY8O 3CC2N 3CF5L 1QVFM 4WFBL 1YHQN 2OTLN 1S72N 1Q82O 1VQPN 3I56N 5JVHL 5HL7L 1YJNN 3I55N 4WF9L 3CXCM 5GADP 1W2BM 1K8AO 4WFNL 1YIJN 1M1KO 3PIOL 1YITN 5GAGP
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OH7A 3QEVA 4BRCA 5KQDA 4L3QA 3F9MA 3SAGA 1NLVA 5EOYA 4HCCA 4ZTFA 4DFMA 3OYGA 4EFHA 3CPWM 3VTIA 3D6RA 5F0XA 2AJQA 3UE5A 4JS5A 4LD0A 4NXNK 4ILHA 2XO7A 3CJ7A 3DRSA 5CYMA 3FZHA 4CHOA 1QZ6A 4DSIA 3M8QA 1RTJA 3S9HA 4O0JA 3S3OA 2OZMA 4KB1A 4KBOA 3BGRA 4FJGA 5FPMA 4PL7A 1A5VA 3K5MA 3WNFA 4BRKA 4KO0A 3ZSRA 3L8BA 4DTSA 4HTLA 3PSIA 2NRVA 1U49A 3ZSWA 5F1XA 4Q5VA 4M3TA 4GKKK 4E0DA 4DQPA 5GAHP 3CJAA 3E1YA 3SZ2A 4KHYA 4RW7A 1DLOA 5B8HA 3VQEA 3WXIA 4CEZA 4OO1J 3VENA 4KHPK 2ZJPL 2W40A 4FJ7A 3DM2A 4DSLA 3DLKA 3K57A 1TL1A 1WSHA 2EX3A 2GUPA 3I0SA 4CGHA 1W9HA 2ITGA 1J6ZA 3K9JA 1T03A 1MU2A 3R1XA 1Q9XA 3VESA 1YXQA 3OYAA 1E3MA 2B4JA 3VN5A 3CG7A 4FLYA 4DR1K 4NLBA 2DTUA 3OS1A 2F4VK 2QXFA 4JI6K 1NK6A 3FZKA 3O8MA 1RCHA 3O4WA 4GVEA 3NF9A 4DB3A 1NKBA 3MCPA 4FWNA 2NRXA 3SK3A 4BE1A 3P4IA 1Q8IA 3MN5A 2VQFK 3TU5A 1KFDA 5BRHA 1XI1A 3KD5E 1NWKA 2VWBA 4JI3K 1TKXA 4CJWA 4DTNA 3QO9A 2QWNA 5AQHA 4PWDA 1U04A 1RBSA 3CMEN 3KK1A 4FPAA 4BRQA 3CIPA 4I2PA 1TUUA 2FSJA 3ZETA 2G8UA 3BF1A 4GMJB 3L3UA 2ZF5O 3QNNA 3LP3A 1RDAA 4CGDA 1X1PA 3U3GA 4NCAA 1VQLN 3O4NA 1EKEA 4Z94A 4CW7B 4FVUA 2DPNA 1ZBIA 1C0UA 2YJEA 3SJHA 4CE9A 1WAFA 3T7ZA 3ZETB 2WFBA 4FLVA 4M3YA 1MA9B 3FFIA 4U7BA 5I42A 3SMSA 3CHWA 1RTDA 1DT9A 3QERA 3PLAA 4OLAA 5BR8K 2QTDA 3PO4A 3CCLN 1V4TA 4CZFA 1RBVA 1IKWA 2BH1A 4AHRA 1HNXK 1NJWA 4TSXA 1J54A 4CHQA 5BN8A 2YKMA 4A5BA 1YI2N 1D4XA 4JI8K 1KCFA 4JI5K 1K8KB 3AO2A 2FF3B 4PQUA 3T1HK 4CCHA 3G4SN 4WQ5C 1S1XA 2VYPA 3E9LA 3V4IA 3AGRA 1BA0A 4FZZA 5C2DA 4YFUA 1VSHA 4FJXA 3FZMA 3EKSA 4BDYA 3RMDA 4IDHA 3ENOA 3RR7A 3MN6A 4B8AB 4WQ4A 3WXJA 4PKIA 4CFBA 4Y1CA 4X62K 4CIFA 4GKJK 3QESA 4Z4IA 1QSSA 1BIUA 1RT6A 4BR4A 5SZTA 1QSYA 5KRSA 4DU3A 3QBXA 4I6MA 3M8RA 1TK5A 4FJ9A 3MAQA 2ATQA 3G0ZA 3I8BA 3V1QA 5DK5A 1L3SA 3OHRA 1YIJN 2G8WA 4L8RB 2YNGA 1LWCA 4M41A 4CEDA 2IOCA 1GLJO 3SPYA 4XH5A 3H1QA 1VSKA 4B1VA 4JV5K 4RCHA 3B6OA 4I6MB 3SBGA 3AAPA 4DFPA 2A5XA 3CM5A 2I5JA 4CJPA 3G71N 3SQ4A 4B9UA 5D3GA 4NLCA 1ASVA 1JXEA 2D1KA 2IAJA 4CF8A 2Z1IA 3VQ4A 2IVPA 3O3FA 4JLHA 3V1OA 4E89A 3CCEN 3NHGA 4PHTX 1FKOA 5I3UA 2PYJA 4HUGA 4LY7A 1HYVA 3TSUA 1HQEA 1NM1A 1TUYA 4WQ5A 5FLXO 3FR0A 2FF6A 4PY5A 1UOCA 4EHTA 4B3OA 4J2AA 2FC0A 4Z4GA 1M90O 3DLBA 4IEIA 3AVGA 5M1PA 2NUBA 4HTUA 4FWRA 3W3DA 3THWA 1X3NA 2VWJA 4DV4K 3NCIA 4CJEA 1SV5A 1BU6O 3HVRA 4FOEA 1UA1A 1YT3A 5JLHA 3AAQA 1U2VA 2KW4A 3HSCA 1UA0A 3OYCA 3ZX0A 1RDDA 1ZBLA 4BDPA 3THWB 4DFJA 4BR5A 2GELA 3NVKA 4UY8O 3SUOA 3RRGA 3AA2A 4FZYA 1B92A 4NXMK 4YOUA 3RSEA 1H1VA 1T6DA 2E2PA 3MEEA 2FXUA 3GDQA 3UKRB 1UAXA 3VERA 5BPNA 3KWIA 1O1WA 2HHVA 4XEIA 1IKXA 5J1EA 4RWTA 2JWLA 1RT1A 4HUEA 4EHUA 1VSLA 5AZJB 3AV9A 1CXQA 1C0GA 4CEFA 3PX4A 1IBKK 2G8VA 4DTRA 3QBWA 2W42A 3WNEA 2X6NA 1TV6A 1GOCA 2UU9K 3SQ2A 2O4IA 1HQUA 3KLIA 3M6GA 2ZGZA 1FKPA 1HYSA 4C1NK 3DLLL 5TKYA 4W5RA 3CCRN 4DF8A 1X9WA 1GLEG 2GTDA 5KGWA 2YCHA 2QXLA 3LANA 4FWQA 3SI6A 3OA9A 3DLRA 3DLGA 2E6LA 2ITMA 4QOZB 4B1ZA 1Q7YO 2QKKA 4CJRA 4CHPA 3NF8A 4IBNA 4QCLA 2NRTA 3AO5A 3L6QA 5I9EB 3MXMA 4FWSA 4B08A 3VOVA 4NB4A 3CD6N 4BRLA 3HO1A 3JS6A 5F2RA 3KLGA 4WYBA 1ATSA 3B8AX 2QEXN 1BIZA 3ZT0A 1YVNA 3O1WA 2G8KA 5EU7A 3NH1A 3KKRA 2VCPA 3V81A 2D0AA 3TWHA 2P5GA 1VQON 1ZXOA 5CZ1A 5CYQA 3CCJN 1KXPA 2V7YA 5AQUA 2E8AA 4ILGB 2KTQA 4BR0A 2HVIA 2UYTA 1WSIA 5AQMA 3K59A 4GNIA 3SUQA 4J2EA 1YUWA 5M1NA 3RRHA 4O44A 4DS4A 1NNEA 4B9NA 4CJ4A 4GV9A 1ESVA 5CZ2A 3NE6A 4E7KA 3SBTA 3NH2A 2OTLN 3V9WA 1EWQA 4YDUA 5KI6A 4BC3A 1VQPN 1NGCA 3O3HA 3BY5A 2V7ZA 3HVTA 4JI2K 1ZBFA 4MO4A 2UUCK 5AQIA 4BG9A 1J53A 4AHUA 1BO5O 5GADP 4AH9A 1KVBA 5ADXH 5AJ3K 3ZT4A 1K8AO 3O80A 2KQ2A 3HPOA 4BRHA 2P9KB 2RKIA 3TAMA 1GLLO 3OW2M 3P38A 3MWPA 1GOBA 3HT3A 3GE1A 3CM6A 2F8SA 1SQKA 3ENHA 3KK2A 3AVCA 1FK9A 4C23A 1N6QA 4IO9L 5KRTA 1NMDA 3VQQA 1VSJA 2O4GA 5HRSA 2OTJN 4KH4A 1NK8A 4DR2K 2P9SA 5T7BA 4OVLA 1YAGA 3L2UA 2YNHA 3L0QA 4CGJA 3JSMA 3KTQA 4AM7A 4HUFA 1SL2A 3ZT1A 3ZYYX 3WNGA 5CR4A 4CD3A 2IVOA 2P9SB 3SQ0A 2IIRA 3M3ZA 1OH8A 3AVJA 4ISFA 2KZMA 4GVMA 4LH4A 4WFAL 5AQXA 3VEOA 1JL2A 3OYKA 3VMFB 3ISNC 2OYQA 1XWLA 4DCHA 5SWMA 2DFFA 3P83D 4FW1A 4JKCA 3WT0A 3CC4N 1Q86O 2A1RA 3VEZA 1NGDA 3H45C 3PX6A 4DR7K 2HHSA 4O5BA 1T6CA 1BOTO 2QM1A 3WQUA 1HNIA 4J8FA 5JMVA 2CH5A 4DUZK 1SKWA 2UUBK 3O9SA 3GG4A 2LSNA 3MXJA 1I94K 5M1FA 2GBZA 3DXKA 3EN9A 1HRHA 5IT9O 4F8RA 2F96A 1T3VA 3O3GA 1QQNA 4OX9K 3R3LA 4YY3K 3HOSA 2DFEA 4W5NA 1JLCA 1IJJA 4NYNA 4CJLA 4CZGA 1U47A 3V1RA 3LWLA 4DTPA 3LM9A 2O8DA 3DXKB 4KTZA 4AM6A 1QE1A 2P9LB 3WXMB 3SMPA 4CF2A 4BRFA 4DLEA 3J7ZO 1VQ6N 4G1QA 5LL6Z 1FJGK 3CC7N 3B6PA 1IKYA 4A2AA 3ATUA 1IBMK 4Z4FA 1VQ7N 3A5OC 3CCSN 4O55A 4ZHRA 1O13A 4BRNA 4OPJA 2E1YA 3D2EA 2YV0X 1P90A 1YJWN 4DV1K 4ZTJA 3FFKB 1IKVA 3IAYA 1EXQA 4O4GA 3ZX2A 3NAEA 2F8TA 1ATRA 3P31A 4B9TA 1BCMA 3QFPA 3VQ6A 1C1CA 1UWBA 4BREA 5DM7L 3DI6A 3D2EB 3RMAA 3E01A 5K14A 4CFDA 1ZYQA 1VHXA 1S6PA 1X9SA 4CHYA 3VGKA 5BRDA 4KH6A 1BI4A 5EXWA 4CBXA 4JD2A 3EEQA 1NOYA 4R79A 1LAVA 3LALA 3VTHA 3ID6A 1RDUA 3C6AA 2RF2A 3KVGA 1S3XA 4CEBA 4PA1A 2NNWA 2CGLA 4M3WA 1TK8A 3VGMA 1BI4B 4JD2B 3C95A 4EIAA 2ZE2A 1YHQN 1GLAG 3K58A 4CHNA 3WNHA 3K5NA 3TAEA 3WXKA 2ZM6K 3IG1A 1YJNN 1SL1A 1WB9A 1RFQA 2WOMA 3I55N 4YORA 4E19A 4W5TA 3OJSA 4IWVA 4YOVA 1V4SA 2A3ZA 4WFNL 1JL1A 4GW6A 1JLFA 1RBUA 3TSPA 5FPNA 1A5WA 1J5OA 1EP4A 5AQTA 2Q36A 3SUNA 1KAXA 3QFUA 3O5BA 2H3GX 1JCFA 1KD1O 3TTFA 2V52B 4BVPA 5A2QO 4H4OA 3GBTA 4CEEA 2BDPA 5AQVA 1K73O 1JLEA 4M7YA 1WOQA 3ZT2A 1CLQA 3R6MA 3OYLA 2GEMA 1NGJA 3OS0A 4WQ4C 4E1JA 1L5UA 3SNNA 4CGFA 4B1YB 4FLTA 2X74A 3V6DA 1TYQA 4CJ3A 5JVGL 4BRAA 3TR8A 4DV6K 3THYA 3Q7BA 3D7EO 4FJ5A 3AVLA 4C1NI 1XHXA 3M5RA 5H1SQ 3A2FA 4KHWA 3DRRA 4B1UB 5J2MA 3TARA 3NF7A 4CF1A 3QMLA 4MDBA 3IMXA 1Q18A 1NGGA 2EHGA 1RT3A 2ZQBA 3VQPA 4FM2A 3J8AA 4H0YB 3ZX3A 1HPMA 3QB0A 3U9DA 4XH4A 1RBTA 4CGGA 3CF5L 1VSEA 1TAUA 3O9QA 4Z4HA 4FJMA 3VF4A 3EZ5A 3CQXA 1S72N 1F21A 2Q31A 4BC4A 2QW9A 3NH0A 3EL2A 5C2FA 2VG5A 4BRGA 2XHBA 4I9LA 1W2BM 4KTWA 4M3RA 4BR9A 1S6QA 3VQ8A 3TI0A 4FLUA 2Y1JA 1QQOA 5AQWA 2P9NA 5LJWA 1JLQA 1KAZA 2CH6A 3V9ZA 3C0BA 4JKFA 4BE0A 4RW4A 3MXIA 1VQNN 1VSIA 1XC9A 1KSPA 2RHKA 3Q7CA 2YKNA 3A5LC 3T1AA 2DFHA 4C8OA 3T69A 5KQ8A 4CK1A 1DKGD 4RG8A 2P9NB 1NK5A 1HJRA 4DQ8A 3PO5A 5FPEA 1CZ9A 4JN4A 4GV3A 4BDZA 1Y97A 3ENBA 4KRFA 3EE9A 4CJSA 4H5TA 3ZT3A 3SV3A 5LMUK 4FK4A 1T44A 4OJRA 2G8FA 1KLNA 3MWTA 3ULDA 1N36K 1XQSC 1JJ2M 2NRHA 3THVA 3TANA 4E3SA 4ISGA 1NOZA 3NGYA 1TL3A 2HNZA 4FXDA 3CI5A 4BRPA 4OPHA 3HI0A 1ZC6A 5AQLA 5CY4A 2BTFA 5BN9A 1S1WA 4H4MA 4H03B 4M63C 4FVMA 1B9FA 1EX4A 1GOAA 1VK0A 1N32K 3ZSOA 3H3OB 3UKUA 4QS7A 3VEXA 3V9XA 4OPAA 3CQYA 4MFBA 2HBJA 1BL3A 4HWIA 1TGOA 2RPIA 4FWMA 1LW2A 5EVZA 4CEQA 3R9PA 3QEPA 1J5EK 2P9IA 3AVBA 2HHQA 3HJFA 1QVFM 1BDGA 3P39A 4DSFA 4A5AA 4CJVA 3EO3A 2BANA 3KLEA 3ZSXA 1TVRA 4B9QA 1LOTB 3QIPA 4N76A 4DV5K 3OBWA 3KK3A 5ADXA 1NU0A 1EO1A 1RILA 3LP1A 4F9OA 3EKUA 2CGKA 2P9PA 4LC9B 3P1GA 4KKOA 2HSTA 4KTQA 2EWSA 3CFOA 3WEEA 3VF2A 3KLFA 4FWKA 3ITHA 2F9WA 3AO1A 1WLJA 4ICLA 1ATNA 3PSFA 1U2VB 4KB0A 3LPTA 4FJNA 3F5TA 3IDHA 1U4BA 3CJCA 2P9PB 3QDKA 4IG0A 1GLDG 3QETA 4Y0WA 4KHSA 1VSFA 4LF5K 1BUPA 1HUXA 1VAZA 1MWMA 5AFUH 5MLCQ 1EQYA 3O6WA 3RSEB 3HXMA 2XY7A 4NO7A 5AQZA 3K2PA 1Q9YA 2A41A 3DLHA 3BP8A 1Z25A 3F2KA 2KKZA 2Z1JA 3U9ZA 4CZLA 2VQEK 4IJNA 3DOKA 5LMNK 1EWRA 4YDUC 3NFAA 4JK8A 4H8KA 2I7PA 3M8SA 2QKBA 3LWMA 4DR6K 4LF8K 4DV2K 3C65A 3A8YA 5BPMA 3V9SA 3WXLA 4E7IA 3ULEA 2GWKA 3TSQA 1QTMA 4HHTA 2OZSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4IOA L;  1QVG M;  1ILY A;  1VQN N;  3OW2 M;  5DM6 L;  1KD1 O;  4IOC L;  3G71 N;  3J7Z O;  1VQ5 N;  3DLL L;  3CME N;  1VQ6 N;  3CCR N;  4IO9 L;  2ZJQ L;  3CC7 N;  3CPW M;  2OTJ N;  5MLC Q;  1K73 O;  1K9M O;  1VQ7 N;  3CCS N;  3CCE N;  1VQL N;  4U67 L;  1Q7Y O;  3CMA N;  3CCV N;  3CCU N;  1YJ9 N;  1YJW N;  1JJ2 M;  5GAE P;  2QA4 N;  1VQK N;  3CD6 N;  1OVY A;  3G6E N;  5JVG L;  1M90 O;  3CCL N;  2QEX N;  5DM7 L;  4WFA L;  1N8R O;  5GAH P;  5H1S Q;  1VQO N;  1YI2 N;  3PIP L;  3CCJ N;  1VQ4 N;  2ZJR L;  1NJI O;  2ZJP L;  3CC4 N;  1Q86 O;  1VQM N;  3G4S N;  1KQS M;  1VQ9 N;  3CCQ N;  1KC8 O;  1Q81 O;  4WCE L;  3CCM N;  1VQ8 N;  4UY8 O;  3CC2 N;  3CF5 L;  1QVF M;  4WFB L;  1YHQ N;  2OTL N;  1S72 N;  1Q82 O;  1VQP N;  3I56 N;  5JVH L;  5HL7 L;  1YJN N;  3I55 N;  4WF9 L;  3CXC M;  5GAD P;  1W2B M;  1K8A O;  4WFN L;  1YIJ N;  1M1K O;  3PIO L;  1YIT N;  5GAG P; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OH7 A;  3QEV A;  4BRC A;  5KQD A;  4L3Q A;  3F9M A;  3SAG A;  1NLV A;  5EOY A;  4HCC A;  4ZTF A;  4DFM A;  3OYG A;  4EFH A;  3CPW M;  3VTI A;  3D6R A;  5F0X A;  2AJQ A;  3UE5 A;  4JS5 A;  4LD0 A;  4NXN K;  4ILH A;  2XO7 A;  3CJ7 A;  3DRS A;  5CYM A;  3FZH A;  4CHO A;  1QZ6 A;  4DSI A;  3M8Q A;  1RTJ A;  3S9H A;  4O0J A;  3S3O A;  2OZM A;  4KB1 A;  4KBO A;  3BGR A;  4FJG A;  5FPM A;  4PL7 A;  1A5V A;  3K5M A;  3WNF A;  4BRK A;  4KO0 A;  3ZSR A;  3L8B A;  4DTS A;  4HTL A;  3PSI A;  2NRV A;  1U49 A;  3ZSW A;  5F1X A;  4Q5V A;  4M3T A;  4GKK K;  4E0D A;  4DQP A;  5GAH P;  3CJA A;  3E1Y A;  3SZ2 A;  4KHY A;  4RW7 A;  1DLO A;  5B8H A;  3VQE A;  3WXI A;  4CEZ A;  4OO1 J;  3VEN A;  4KHP K;  2ZJP L;  2W40 A;  4FJ7 A;  3DM2 A;  4DSL A;  3DLK A;  3K57 A;  1TL1 A;  1WSH A;  2EX3 A;  2GUP A;  3I0S A;  4CGH A;  1W9H A;  2ITG A;  1J6Z A;  3K9J A;  1T03 A;  1MU2 A;  3R1X A;  1Q9X A;  3VES A;  1YXQ A;  3OYA A;  1E3M A;  2B4J A;  3VN5 A;  3CG7 A;  4FLY A;  4DR1 K;  4NLB A;  2DTU A;  3OS1 A;  2F4V K;  2QXF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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