1OVYA

Solution structure of ribosomal protein l18 from bacillus stearothermophilus
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
97
structure length
97
Chain Sequence
GTTERPRLSVFRSNKHIYAQIIDDTKSATIVSASTLDKEFGLDSTNNIEAAKKVGELVAKRALEKGIKQVVFDRGGYLYHGRVKALADAAREAGLEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Ribosome
molecule keywords 50S Ribosomal Protein L18
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Bacillus stearothermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus stearothermophilus
total genus 13
structure length 97
sequence length 97
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00861 Ribosomal_L18p Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ovyA00
3DLLL 5JVHL 4UY8O 2OTLN 1YIJN 4WCEL 2ZJQL 5DM7L 2QEXN 3CMAN 4IO9L 2ZJRL 1Q82O 1VQ4N 1VQ7N 3CMEN 5GAEP 3CPWM 1QVFM 2OTJN 3CCSN 1VQPN 1Q81O 1M1KO 3CCMN 1K73O 1S72N 1YHQN 1Q7YO 2QA4N 1N8RO 4WFNL 1OVYA 3G6EN 3PIPL 4WF9L 3I56N 5GAHP 3CXCM 1VQKN 1VQ6N 1W2BM 1KD1O 3CCEN 3CC7N 3I55N 1VQLN 3CCQN 1VQNN 4WFBL 3CC4N 3OW2M 1VQ5N 1YJ9N 1JJ2M 3CCVN 3CCJN 5JVGL 3CC2N 1M90O 1VQ8N 2ZJPL 5MLCQ 3CD6N 1ILYA 1VQ9N 4U67L 1VQMN 3CF5L 5DM6L 1YI2N 3G71N 1K9MO 4WFAL 5H1SQ 1QVGM 5GAGP 5HL7L 4IOAL 1Q86O 5GADP 3CCUN 1YITN 1VQON 3CCLN 3J7ZO 1YJWN 1KC8O 1NJIO 1YJNN 3G4SN 1K8AO 1KQSM 3PIOL 3CCRN 4IOCL
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U8XA 2FBTA 3OBWA 4B3SK 3D2FB 3V9XA 3QBWA 4FJMA 1NJZA 4O8UA 4BRCA 4DFKA 1YIJN 1BISA 1T05A 1RTIA 5CHIA 4F2SA 4CHPA 4JNEA 5DMRA 4EZ9A 3VEWA 1SL0A 5M1KA 3THWB 1VSFA 4DTJA 2QWMA 4YHHK 2GX9A 4E7IA 4KTZA 3MAQA 3GOIA 2E2QA 3QNNA 4IG0A 4CJ7A 2YHWA 4CEDA 1Q8IA 4LF6K 3QEXA 3KLFA 4CZLA 4OJRA 4KHSA 1RDAA 4OKEA 4H0PA 3K2PA 3M8SA 3THXA 2FSNA 4H03B 3FFKB 4EZ6A 4DTSA 1J5EK 2GBZA 3AV9A 4DTNA 3GDQA 4DU1A 2V7YA 2NRWA 5AQTA 3SZ2A 2X74A 3V81A 2W40A 4W5OA 3HP9A 1KAXA 4JKGB 3MK6A 3A5NC 4YOUA 4WFBL 2IS3A 3FZKA 4E7LA 2G8UA 3CCVN 2KLAA 4FJ5A 5AQWA 1VQ8N 1HRHA 4GVEA 2FXUA 5J2MA 1X3NA 3EN9A 1B9DA 3PO4A 3E9LA 4OLAA 5I3UA 2OPSA 2RN2A 1NGDA 2P9IB 4BE2A 1JL1A 3KK2A 4CJEA 2WONA 4WFAL 2XY6A 1X9MA 5TKYA 1YXQA 3PX6A 2HBJA 4PY5A 3CJCA 4BVOA 2YNFA 4DFMA 3BP8A 5C2DA 4BRHA 3WUHA 3LP2A 2P51A 4H4OA 2AA4A 3MN9A 3R3LA 1KQSM 2AP1A 1Z05A 2QXFA 4CEAA 3MN7A 4AHVA 5BR8K 4C8OA 4LY7A 4CE9A 4BREA 1RNHA 2P9NB 2IVPA 3ZSYA 2YKMA 2HHQA 3ENHA 3HVRA 3SUQA 5F1XA 3K5OA 4DFJA 3FE1A 1QS4A 3CMAN 4J2DA 1ATRA 3MX5A 4NB4A 4FPAA 4PQUA 2X78A 4J8FA 2EHGA 1S6PA 3CPWM 4FM0A 1NOZA 3ENBA 4EIAA 3CCSN 3HTVA 3QMLA 4RG8A 4LC9B 3T69A 3UB5A 3C7NB 3C6HA 4FJJA 3QLHA 4J2EA 4BRFA 4CHYA 3TSPA 1S1WA 3AVIA 4QS7A 3HPOA 1WLJA 3RMCA 2IGIA 3O9TA 5KRSA 4CZIA 3WT0A 3KD1E 1VSIA 3MEGA 4KAZA 1BL3A 1X9WA 4NYFA 5BRHA 2ZGYA 3O4QA 4DS5A 4Z4HA 3U6FA 3PSIA 2HF3A 1W97L 1C0UA 3FFIA 4Z4IA 5FLXO 3HP6A 3ITHA 2O8CB 4BC4A 1Q9XA 4L3QA 3MXJA 3DOLA 5KPZA 3OS2A 4KH5A 3CCQN 4Q0BA 1EO1A 4NLCA 4JLHA 4JKFA 3CYMA 4BC3A 5LJWA 3QINA 1BIUA 1CLQA 4E7KA 3MEEA 4ZHRA 4QCLA 5KRTA 2KFZA 1YVUA 3DRPA 3SBTA 1WNSA 3SLCA 3ZSRA 4JS5A 3EKSA 4M3RA 4FM2A 3P31A 4XIUA 2Y1JA 3BZKA 4BWJA 4A5AA 4CECA 1HPZA 1RBVA 3MMVA 4DTXA 2IIRA 4CJFA 1EX4A 2RKIA 1HKCA 5HP1A 4LF5K 2KW4A 4DV1K 1KAZA 3THYA 4LSLA 4B9VA 4CEQA 4CHZA 3RTVA 4FCYA 3W3DA 4CJUA 3KJVA 3SNNA 1TUUA 3AVBA 3QDKA 1OKJA 1IH7A 3K58A 5M1QA 1TL1A 3LP1A 5C12A 3AY9A 5AQKA 2QWOA 3ULEB 2VWKA 2ZWHA 3CPEA 4FOEA 4Z4CA 2NRRA 1X3MA 1HQEA 3P5JA 4QOZB 3ULDA 4DG1A 4JI8K 1TK0A 3RMAA 4TSXA 3QESA 5HRPA 3SI6A 4I6MB 4YDUC 4ZTFA 2G8FA 4LF9K 3OYLA 1IBKK 5EOYA 3N4PA 3DLBA 2YHXA 1D9DA 5BREA 4AM6A 2BANA 3DI6A 3D0PA 4FJ8A 2ASOA 4JD2A 5C25A 4BC2A 1RBTA 1WSFA 3OYKA 3O5BA 1LCUA 1NGIA 4IO8A 3OJSA 3IUCA 3VPZA 3R8EA 4LD0A 1GLFO 1WSGA 2BH1A 3DRSA 4XH1A 3TANA 3L2UA 3LDQA 5MLCQ 2A42A 2HF4A 4A2BA 1IKYA 3O4WA 3PLAA 1J53A 3ISNC 4B08A 1IBLK 3D2EA 3AVGA 2YNIA 2V51B 3G71N 3LZIA 4PUOA 3VQ8A 4B1ZA 2NZTA 1XC9A 1W7AA 3HM9A 3F9MA 4IBNA 1NLVA 5LY3A 3SQ2A 1RCHA 4JN4A 3V9WA 3A5MC 4B8AB 2A5XA 3DRRA 1OH7A 4DU3A 4A59A 1BOTO 3OYBA 3VF2A 4C23A 2Q0UA 4C8NA 1OVQA 4DSIA 5FPMA 3VQPA 3F5TA 4DV3K 4FK0A 4IOCL 5KTQA 3CFPA 3ZLJA 2ZF5O 3ZSWA 3MDQA 4IKFA 4UY8O 3BZCA 3O4NA 1FJGK 3K5MA 1UAXA 3L4IA 3V9ZA 3V9SA 1WSHA 2P9UA 1MU2A 4FWQA 1YVNA 3H1QA 2BUPA 4IO9L 3AVLA 3SUNA 4RCHA 4DU4A 3DOKA 1UWBA 1NGHA 3H45C 4W5RA 2P9SB 1W0HA 3GE1A 3DXMA 4DQ8A 2V52B 4FLVA 3CJ9A 2CGKA 1XUPO 3ZEUA 1CZ9A 5AZIB 3NDKA 2GUIA 2HBLA 4H5VA 2E2NA 4GKKK 3DYAA 3O9UA 4CVNE 3LANA 2P9LA 3T7ZA 3BF1A 3NH2A 4A5BA 3V9UA 3SK3A 1EWRA 1FW6A 1C0GA 1RT5A 4EHUA 4AF1A 4JS4A 5T7BA 3KTQA 4CW7B 3VEXA 1GOAA 4NCBA 1J9AA 5A2QO 1S1TA 3HRGA 3IAYA 1J54A 2XHBA 4JI5K 3O8MA 1ZBHA 3LDLA 2E1ZA 4Y1DA 1DLOA 3SYZA 3HL8A 2ZJPL 1C1CA 2QKBA 1SUQA 1J6ZA 3SBGA 3THWA 5CR4A 2WUSA 3O08A 3FR0A 4M3WA 4ISEA 4JV5K 4E89A 3HOSA 4XH5A 3TABA 2KHOA 5BPMA 4JI1K 4LH5A 3CCLN 2Z1JA 1UA0A 5AQJA 4FYDA 1GOCA 4E7HA 2O8BA 1DT9A 4EP5A 3CJAA 2HBKA 4E1NA 4FJNA 1K8AO 1EWQA 1WBBA 1NBWA 4HHTA 3OTOK 1IKVA 3SUPA 5BN8A 4R79A 4Q5VA 2GUPA 4DSJA 3WNHA 1S9GA 4W5NA 2YNHA 5DK5A 4JKGA 3HPHA 2FC0A 3HVTA 5AQYA 4PL7A 4BR5A 2KZMA 5DM7L 4KV8A 3QIOA 3WXIA 3P4IA 1YUWA 2IOCA 4FK4A 2HNZA 3EY1A 4JK8A 4DTOA 4JI7K 3S9HA 1JLFA 4YY3K 4N41A 4M3ZA 1XMQK 3U9DA 2P9IA 4B1VA 1L3SA 1IV0A 5HBMA 3KK1A 1LW0A 3EZ5A 4CJRA 4NXNK 4F8RA 3ID8A 3ZETA 4IJAA 1CXQA 2E8AA 1TV6A 1HYZA 4BE1A 4OGEA 4AQYK 4YOVA 2ZGZA 2QA4N 4M3UA 3B6OA 1KFSA 3A8YA 2KKZA 3KK7A 3RMBA 1OVYA 2DY4A 3VQ7A 1HNZK 1BA0A 1T44A 4DV7K 1QQOA 5M1PA 1TKXA 1ZBLA 2UXDK 5HRSA 3IG1A 2JGUA 4JI3K 2HSTA 3S3OA 2QXLA 2P9NA 2JLEA 1VSEA 1NKBA 5AQSA 2NRXA 4QS8A 3W0LA 2KTQA 4MO5A 4O5FA 4DR6K 3HOTA 1XHXA 1QZ6A 1C0FA 1XWLA 2UUCK 4JI6K 4WQ5C 1WUAA 4H0YB 3C7NA 5FROA 4FVUA 1QSYA 2D0BA 2E1YA 5BRDA 4KHWA 4FW2A 1N36K 1U6ZA 4BR4A 2VQFK 2YX6A 4CF2A 3A2FA 3VQEA 4GW6A 1DEJA 3DM2A 4IDHA 5J2QA 4OKKA 2PFUA 4CJSA 5IT9O 4N5SA 3WXKA 3F73A 3O3HA 2P9PB 3I8BA 1TAQA 2G8HA 3DWLA 3E01A 1NNEA 3ZX3A 2YNGA 4ELUA 2O8DA 4OPJA 1SKSA 4B9QA 3RMDA 2VCPA 4WQ5A 3MWTA 3SCXA 3TU5A 4CBUA 4CI6A 4JEPA 4BRQA 3T1YK 3B8AX 5FPDA 4DV2K 3E9PA 4CCHA 1DTTA 2UXBK 2NRVA 1VQPN 2Z1HA 4H5TA 3SV4A 2JWKA 5AQLA 4CF9A 3QB0A 1W9HA 3AA3A 2HBMA 3O9SA 4FJ7A 2A40A 1VSLA 4AHUA 5AQQA 4IJNA 4KHYA 3O3FA 2J4RA 4BR0A 4O0IA 4OPAA 1BA1A 5C42A 3K5NA 1OH6A 3ASMA 5F2RA 4M3TA 3VQAA 3RWUA 1VQKN 4KI4A 3OYMA 4HUFA 3VF6A 1GOBA 2ETJA 2YKNA 1X9SA 1V4SA 3CCEN 1JLEA 3QBXA 4MQ3A 5CYQA 3L3VA 1VRTA 2VGMA 3NGIA 1KVBA 4KI6A 1VQ5N 4FLUA 3QEWA 3OYFA 3IKMA 1YJ9N 2P1JA 3AVAA 3EO3A 5AQUA 3K59A 2ITGA 3AO4A 3ULEA 2HHXA 3H08A 1NK0A 1XQSC 4YNQA 1KLMA 4DHYA 4X62K 2FBYA 5HROA 4IZ9A 4F3OA 3CFRA 3T1HK 3QFUA 4K8XA 2RF2A 3M8QA 1VSKA 5GAGP 4FWRA 3S41A 4CF8A 3J7ZO 3LAKA 3OS1A 1NJYA 5M1FA 1GLDG 4JAXA 4K43A 4CGHA 4CIFA 1NJIO 3FGUA 4BRMA 4MDAA 3ZT2A 1S22A 1QHTA 2XRIA 4BR2A 4FXDA 3MN5A 2X6SA 3D45A 3K9KA 1QQNA 1J5OA 4BDPA 1YTUA 1S5JA 5AQMA 3VERA 3FZHA 4FSVA 5CZ2A 2QEXN 1HX1A 4HUGA 1JKHA 4H8KA 4BGBA 4ZTJA 5EX5A 4YOWA 2QM1A 4UQGA 4PKGA 1KRPA 5AQHA 3DMJA 1GLCG 4CFCA 1TK8A 5CYMA 3EL2A 3TAGA 4KFBA 1HNIA 4DTRA 3ENOA 3U9ZA 4FW1A 4FWPA 3FZMA 3ZX2A 4OLBA 3EE8A 3SAHA 5AQRA 5FRMA 2FF3B 1Q7YO 2YJEA 1DKGD 4MFBA 1GLEG 3LM9A 1IG8A 4HUEA 3J7YP 4IOXA 3G25A 3J80O 3VOVA 3AVKA 4LSNA 4YORA 4ISGA 3AAQA 4CD3A 3O80A 5GAHP 3I56N 3ATUA 1YAGA 1KTQA 1VAZA 4KPYA 1Z26A 2ZE2A 1VQLN 3KLEA 1VQNN 3S3NA 2E20A 5JVGL 2A6AA 3VQ5A 4QS9A 4B1WB 1XNRK 2I7NA 1Y64A 1NK7A 4I2QA 5EXWA 2P9SA 3LDOA 3MEDA 4CD1A 4W5QA 4BE0A 3FZFA 3A5LC 5AZIA 4H5NA 4DR1K 3KK3A 4M63C 3H46O 4H5WA 2NRHA 3VF4A 4FVMA 2BGGA 3UKRB 2KZZA 3V1QA 1HNWK 2W6KA 5JLHA 3AA5X 1KC8O 4FK2A 3WEEA 3KKSA 1BU6O 3VEVA 1BHLA 4YOYA 4XEIA 2XY7A 1ATNA 2IVNA 4O0JA 2O4IA 1T03A 3HPGA 3LALA 3DLLL 1BGXT 4JI2K 1KCFA 3DXKB 1Q9YA 3U3GA 3AGKA 2HVIA 3AA4A 3JSMA 4CF0A 3KLIA 3J81O 5AQXA 4CZFA 3KWIA 3OY9A 3PV8A 2IC3A 4FJGA 3QEPA 4DR5K 2HMIA 3CCMN 5FPEA 3ZCMA 1VSMA 3OBYA 1IKXA 1JXBA 1C0TA 3TARA 1S72N 1U2VA 2CH5A 2A41A 2E6MA 1I94K 3AO3A 3VEZA 2GELA 3E1YA 3CJ7A 3I33A 2UUBK 1HQUA 3C6UA 1RDWX 3QEVA 3J8AA 1NGEA 4WF9L 3K0SA 2UU9K 2RPIA 3EZWA 1TYQB 1VSHA 2F4VK 4CK1A 5C2FA 1HR0K 1NM1A 4LFCK 4CEBA 4LH4A 1FKOA 2E4LA 3ZYYX 4DF8A 4DV5K 1IJJA 1S9EA 4A57A 5CY4A 4E19A 1C0MA 4CFAA 3WXMB 4M7XA 2GV9A 2VG5A 4CFBA 1RT4A 3SMPA 2E5LK 4KREA 1OH8A 3C95A 4ISFA 5BN9A 2IAJA 3KVGA 1JCGA 3ZT1A 2HMPA 3LP0A 3THVA 1HYVA 3IRXA 1JCEA 4ELTA 3NF6A 3LL3A 2RHKA 4PA1A 1IO2A 3QICA 4FO0A 1LW2A 3HXMA 2XY5A 2UYTA 4RW4A 4YDUA 1D5AA 5AQZA 3IS9A 4CZJA 3VEOA 4QAGA 1N32K 5BPNA 4WCEL 1SS6A 1S6QA 5KQDA 4DQQA 2Q1NA 1VK0A 2ZJRL 2I5JA 2HHSA 4B3TK 1EXQA 3VQ6A 4FWNA 2O8FB 1QVFM 2OTJN 4CBWA 3L2WA 2QK9A 3O6WA 1NKCA 4FOIA 4CEEA 4Z94A 2NRZA 1GLAG 4JKDA 4F2RA 3PSFA 1YT3A 3AGRA 4FJ9A 4EFHA 4CERA 4Z0UA 4ILGB 4AHSA 4LF4K 1BWFO 2QWLA 1EKEA 1JL2A 4HCCA 2YHBA 3IMXA 1KVCA 3L2RA 3IDHA 4M42A 1L5UA 2HNYA 1O1WA 2G8KA 3WQTA 5GIOA 3PX4A 2WC9A 4B3OA 3CC7N 3NGZA 4DLEA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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