1OVYA

Solution structure of ribosomal protein l18 from bacillus stearothermophilus
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
97
structure length
97
Chain Sequence
b'GTTERPRLSVFRSNKHIYAQIIDDTKSATIVSASTLDKEFGLDSTNNIEAAKKVGELVAKRALEKGIKQVVFDRGGYLYHGRVKALADAAREAGLEF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Bacillus stearothermophilus
pubmed doi rcsb
molecule keywords 50S Ribosomal Protein L18
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule tags Ribosome
total genus 13
structure length 97
sequence length 97
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00861 Ribosomal_L18p Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ovyA00
4WCEL 3G6EN 1N8RO 1VQ8N 2OTLN 3CMEN 4WFAL 1VQ6N 1M90O 3CC4N 5GAGP 1VQ5N 1Q7YO 1KC8O 1K8AO 3CD6N 3OW2M 2OTJN 1VQ9N 1YHQN 3CF5L 1YJWN 5GADP 1NJIO 3PIPL 1K9MO 3CMAN 5H1SQ 2ZJPL 3CXCM 1YI2N 1M1KO 1VQ7N 5JVHL 3I56N 3PIOL 3G71N 3CC2N 1W2BM 4WFBL 2QA4N 3CCMN 5GAHP 3CCQN 1VQPN 1ILYA 1QVFM 1VQLN 3CPWM 1VQON 1K73O 4UY8O 3J7ZO 1QVGM 1S72N 4IO9L 1KD1O 2ZJRL 1Q86O 3CCRN 1VQ4N 4U67L 1Q82O 2QEXN 3CCVN 5DM6L 3CCUN 1VQNN 1VQMN 4IOAL 1JJ2M 1OVYA 5HL7L 3CCEN 5DM7L 1Q81O 3CCLN 1YITN 3G4SN 3DLLL 4WFNL 1YJ9N 1KQSM 5JVGL 5GAEP 4WF9L 3I55N 2ZJQL 5MLCQ 1VQKN 1YIJN 3CCSN 1YJNN 4IOCL 3CC7N 3CCJN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ENOA 3KLFA 4O5FA 3R8EA 3C6HA 4A2AA 3SQ0A 3O3GA 1BHLA 4KTZA 3NF8A 2OTJN 4C1NI 4CHZA 1Z6RA 5GADP 4BVOA 4KKOA 1VSFA 1OVQA 3OVNA 3O3HA 4FJGA 3MEDA 5M1FA 4JS5A 1YI2N 3CJAA 3QEXA 3BEXA 5AQOA 2NRWA 3SAGA 1VSKA 4M3XA 1DT9A 4BY9C 4RCHA 4JKFA 3N4PA 4EHTA 2IVNA 2D1KA 2D0OA 1RBUA 2NUBA 4DF8A 2ZQBA 2DPNA 4B9VA 4I9QA 4ZTFA 3M8PA 3OS2A 1X9SA 2QWNA 3VGLA 2B5JA 3HP9A 4JI8K 4BRFA 4O0JA 1GOAA 3NH0A 2YHYA 1TV6A 2QXLA 3ZSZA 2E5LK 3QNNA 2OPQA 4H0YB 2VQEK 4CZFA 1CZAN 5KRTA 3SPYA 4KHSA 1QSLA 4QS8A 4RW4A 4ISFA 1TVRA 3AAQA 4Y0WA 4YOTA 4AHUA 1U2VB 5C2DA 3PO5A 4XEIA 2F8TA 1C6VA 1C0FA 4DU1A 5JICA 1NJZA 3I0RA 1J5EK 3WQUA 1NK9A 1BA0A 3C6AA 1NGBA 3IKMA 5FPNA 3VEYA 5AQRA 3GDQA 3OYDA 3RWUA 4B8CA 3ULDA 1ZYQA 1RBSA 4V19S 1X9MA 3GG4A 3P5JA 4KH4A 4CEFA 3LALA 4JEPA 2FSKA 2FXUA 3HPHA 3CMEN 3H3OB 4YOYA 1VSDA 3KK2A 2Y1IA 1M90O 1HNXK 2GWJA 3DRRA 3TABA 2QTDA 3B6OA 4CBUA 4C8NA 4CZEA 3MCPA 3O4QA 1JLAA 1U2VA 5JS2A 1YHQN 4JN4A 4BRHA 3CHWA 4CBWA 4Z4HA 2Z1GA 4FJKA 3H1VX 2P9UB 4HUEA 2VCPA 2Z1JA 4DU3A 3AVMA 2E2QA 4FM2A 5LJVA 4ILGB 4AHSA 1D9DA 3J7YP 3JAMO 3AVBA 1W97L 3S3MA 4JS4A 1ILYA 4IZ9A 5BR9A 1K6YA 1YUWA 2G8VA 1CZBA 4YORA 3C6TA 4N47A 3DLHA 1KXPA 1BISA 4OGCA 1N5YA 3ZEUA 4UQGA 1S72N 2G8FA 2P9UA 1BUPA 1BGXT 3KVGA 4Y1DA 3VEWA 3IFRA 5BN8A 1T44A 1YAGA 4CFCA 1W0HA 4FVUA 4JI0K 4L8RB 4M3ZA 3VEOA 3VPZA 1NK0A 5F2RA 3LPUA 1ZBSA 5DM7L 1SZ2A 2E1ZA 3B6PA 1RDUA 4FWPA 4B1ZA 3CFOA 3QB0A 3MWTA 1V4SA 4EAHD 4DHYA 2WONA 5GAEP 1T7PA 5ADXA 4E7LA 2HHUA 1G15A 4FK4A 3CCSN 2VWBA 4IFEA 1BWFO 1EWQA 2VQFK 1NLVA 1U49A 4CGFA 2E88A 4NCGA 3HXMA 3OYCA 3DLEA 1JLEA 5C2FA 1VQ8N 2VWJA 4CJ3A 1YT3A 4FK0A 1ZBIA 4BDPA 5FPEA 3A5NC 3VQPA 2NRXA 1NKBA 2ETJA 4H5VA 5BR8K 2DTUA 1RT6A 3P83D 4FVMA 3QBWA 3EEQA 3F2KA 3B8AX 4ID5A 4WQ4C 1FK9A 2P9LB 1WLJA 4PA1A 2A41A 3AGRA 4GY2B 3G71N 1NWKA 1EKEA 4DMNA 2OANA 1L3TA 1QZ6A 4MO5A 3E9LA 4FJ7A 1DEJA 1EETA 3CCMN 3NH1A 4X65K 4R79A 4Z4FA 1MWMA 1T6DA 4FLZA 1HNIA 2PYLA 1NKEA 3KLIA 3LPTA 2E1YA 1TYQB 5DK5A 2XY6A 4X64K 1DLOA 4DTUA 2ZJRL 1KLNA 1Q86O 1VQ4N 4W5OA 2P51A 5J2QA 1EX4A 2P9LA 3G0ZA 2F9TA 5AQYA 5DM6L 3NVMA 1TK8A 4LFCK 3W0LA 3WXMB 3V1OA 1HLUA 4IEEA 4IJAA 3M1FA 1RBTA 2WC9A 4BE0A 3OA9A 4CI6A 3ZX0A 4KH6A 3AO5A 4E19A 3VQAA 4B3TK 2DY4A 3EZ5A 1RTJA 5AQQA 3SMSA 4LF8K 5JLHA 4FWRA 1GLEG 2YNHA 3BGRA 1GOCA 5I9EB 3PSIA 4OX9K 4DR2K 3L3VA 4XH1A 3QO9A 3UKUB 4NB4A 3MECA 1LW0A 1ZBLA 2HBKA 1ATRA 3SZ2A 1I94K 4RW7A 5EX5A 3O9QA 4PWDA 2V7YA 3MXIA 3KKSA 1XMOK 4FWQA 3QEIA 4FZZA 5FROA 1T05A 4DR6K 1TKTA 1GLJO 4A5BA 4CE9A 3SQ2A 3BZCA 4E7IA 3PIPL 2HNYA 1BU6O 3VQ5A 2EWSA 2IVPA 3D2FB 3MN5A 1VQ7N 2A5XA 3V9UA 1KVCA 3CPEA 2BUPA 3O6WA 4OPKA 4DV2K 2IDOA 1NKCA 2JWKA 4FLUA 1VK0A 2RKIA 1I3AA 4AM6A 4DSEA 1W2BM 4NO7A 4KPYA 3UE5A 3UKUA 3A0IX 1OKJA 4HHTA 3VGMA 4RG8A 4E1NA 3CJ7A 1XMQK 2F96A 1P8ZA 4YY3K 4M3RA 4PY5A 5HRSA 3J7ZO 4MFBA 1UA0A 1A5XA 1QQNA 3A5MC 3TSUA 2G8UA 4GMJB 4GNIA 1S1WA 1NM1A 4CD1A 4C8KA 1E4FT 3BF1A 3ZSWA 3SCXA 1LW2A 4DV1K 4CF2A 4KBOA 3D2FA 1NGJA 1QS4A 4AF1A 3HSTB 4KB1A 2Z1HA 2RE2A 3L8BA 1KFDA 3HL8A 4GV9A 1RDBA 5LL6Z 4BGAA 3OHRA 1N32K 1OVYA 3J81O 2YHBA 1VSIA 1WAJA 2HHSA 1FKPA 4KV8A 4AH9A 3P31A 3NVKA 3O9TA 1RDWX 3K59A 4DS5A 3OYFA 3PX4A 1VRUA 5BN9A 1CXQA 1RTIA 4KO0A 5CYMA 4IBNA 4B9SA 3NGIA 4KHWA 3OYBA 1TAQA 2IOCA 2FSNA 1TKDA 3WT0A 4K0KK 1HQUA 4H0VB 3WXJA 4I6MB 3L3UA 2NLXA 3WQTA 4E89A 2G8KA 3SJJA 3EL2A 3CC4N 5AQJA 5HOOA 4CJLA 4B9NA 5LMNK 3TSPA 4BC2A 2ZGZA 3CF5L 1YJWN 1NMDA 3IDHA 1S1UA 3ENBA 2YI1A 2RPIA 4PHTX 3M8RA 2P5GA 3CMAN 1CZ9A 2I7PA 4CGHA 2WBNA 4FLVA 4ISEA 4GKKK 2NRHA 3ZSVA 3U3YA 4RTFD 1TK0A 3KTQA 4B9UA 3SUOA 3TAGA 3O9UA 4OPAA 4FJ8A 1C1BA 3HT3A 2QWMA 3QIOA 1MA9B 4YOVA 2I5JA 4I6MA 5IT9O 1NK7A 2OPRA 1S6PA 1QQMA 4BR5A 4IKFA 3E9PA 1U04A 1HMVA 3R9PA 2YHAA 4OKKA 1RT4A 3HRGA 4J2AA 4KHYA 2Q3SA 1DGKN 5J2MA 5AQIA 3KK1A 2QWLA 3RMBA 1DTQA 1B9FA 5BPMA 2YHXA 1JLFA 3LDNA 1VHXA 5C15A 2AP1A 1ZC6A 4PL8A 4YOWA 3RR8A 3MEEA 2QEXN 2V7ZA 1TL3A 3HI0A 4OPHA 1IH7A 4AHRA 4DQPA 3E9OA 1TUUA 1ASVA 2HHWA 2QKBA 2KZZA 2KLAA 3RRHA 4CJRA 4IXCA 2FSJA 5JLFA 1NK5A 4BRIA 3NBPA 3ZX2A 3J8AA 4LY7A 1SL2A 3BUZB 2ZJQL 4FK2A 1LWFA 3ZT1A 4PKGA 4K25A 1YJNN 5AJ3K 1NJYA 2HSTA 1BIZA 4F2RA 1NGHA 1NGCA 1MU2A 3NAEA 4RWTA 3V6DA 1XHZA 3TR8A 3BF3A 4K8ZA 4BQZA 3O4NA 1JCFA 1YVNA 1IKXA 3TAPA 4B1WB 1HYZA 3IG1A 3AVNA 3OTOK 2HBLA 3E01A 1J54A 4M7YA 1Q9YA 3LANA 5CYQA 3HOSA 4C8LA 3QBXA 2A6AA 2BANA 4KI4A 3SBTA 3I56N 1JL2A 5JS1A 4M3TA 4H5TA 2QI2A 3VN5A 3L2UA 2O8FB 1HRHA 4YNQA 5AQFA 1KAYA 2OA8A 3EKSA 4CIGA 3GOIA 5BPLA 4CHOA 1EP4A 3VESA 2YNIA 2F9WA 4CW7B 4BVPA 4DUZK 3OBYA 2WOMA 3V1QA 3OJUA 1WSHA 1QE1A 4FWSA 1QVGM 1FXXA 4EP5A 3LP0A 1GOBA 1KVAA 4W5TA 4DF4A 2FBVA 3KKRA 4NXMK 1XC9A 2HHHK 1Z26A 5FPDA 2Z1IA 3HZ6A 1G99A 1VQMN 4BRMA 3I8DA 5GIPA 5AR0A 4JNEA 2O8FA 1NK6A 1DTTA 3DRPA 4F2SA 5DMRA 3SK3A 3G4SN 3A2FA 1BA1A 2PFUA 3H08A 2GUIA 3E1YA 4CVNE 1OH6A 2EX3A 3DRSA 4JI3K 1T6CA 5MLCQ 2NNWA 4FZYA 2IIRA 4QCLA 5SZTA 3NGYA 2UXBK 3A5OC 1VSHA 1HJOA 4NCBA 2UXCK 3H1QA 4IG3A 1VSJA 4WQ5A 4B9MA 4CJVA 2BH1A 3ID8A 2VG6A 3ZSOA 2ZF5O 4F9OA 1Z25A 3IUCA 3S9HA 3HO1A 2AJQA 4CJ5A 3KD5E 3AVHA 1X9JA 4H8KA 5GAGP 4ISGA 4GV6A 2KTQA 5FRNA 4B1XB 3NMUA 4CGJA 3CFPA 4FJHA 3SLCA 1RDDA 3VQDA 4B1UB 4CEDA 1IG8A 3KZBA 4CJFA 4B9QA 2A1SA 3QLHA 3FGUA 2NRZA 2J4RA 1QHAA 2KHOA 4AQYK 2E6MA 5E41A 3LM2A 4BRQA 4X62K 4HWIA 3O80A 1IKWA 3ZT0A 4E7HA 1ASUA 4H5NA 1YF5L 1ATNA 2I7NA 2QWQA 4JKCA 4BR7A 3NHGA 1NGAA 2DFFA 3U9ZA 4BE2A 1QQCA 1NG9A 1XI1A 1ZXOA 2JGUA 4JKBA 3EKUA 3O08A 5AQKA 2O4IA 2NRTA 4LD0A 2D0PA 3K5MA 4ID1A 3UKRB 3C0BA 3CERA 3VQ6A 1N6QA 4IO9L 3TSQA 2YX6A 4A61A 3C6UA 4DQIA 4DFPA 1GLAG 3P38A 5BRFA 4R5PA 5CHIA 4RW8A 4DTRA 2BDPA 3KJVA 3T1HK 3BDPA 2YKNA 3TTFA 1LCUA 3QDKA 4KH5A 1QSSA 3U3GA 2CGLA 3AVKA 4CHYA 4IFVA 3VA3A 3KLEA 4CHNA 1ZBUA 5ELZA 5EXWA 3O8MA 3WXIA 1Z05A 4YDUC 2GV9A 4QS9A 2O8EB 4O4GA 3L4QA 5HRRA 3UKRA 4AHTA 1VSMA 3CCJN 4CEBA 2JLEA 3CIPA 3J7AP 2RN2A 3TTCA 4Q0BA 5KGXA 3DLGA 4AHCA 3EYZA 3NFAA 3RMCA 5J2NA 4CEQA 1CLQA 1RFQA 1RT1A 3S41A 4CGGA 3S3OA 1T03A 1J6ZA 4KTQA 1K9MO 5AQSA 4DTOA 4KI6A 3UIQA 1C0GA 4CEEA 3AO1A 3PV8A 2P9NB 3MX2A 2O8EA 2YHWA 4CZLA 3OYAA 4MQ3A 2HMPA 1OH8A 3TI0A 3AVAA 4NCAA 3VGKA 1T8EA 2V52B 3ISNC 4E0DA 1VQPN 3OYGA 1RT5A 3I8BA 3F9KA 4A2BA 3D2EB 3VOVA 4BDYA 2Q36A 3TAQA 1ZBHA 1L3VA 1WSJA 2ASPA 2IS3A 1UAXA 4MLHA 4O55A 3M6GA 3AAPA 4YOUA 1K73O 4FW1A 4CJ7A 4EFHA 4BRCA 4CIFA 1RILA 1YTUA 3LZJA 1BOTO 1BI4B 1RT2A 1RBVA 4CZJA 4FLTA 3EE8A 1JLQA 1R59O 5TKYA 2P9NA 1VSEA 4QAGA 3HP6A 4CJWA 1K8KB 3ENHA 1H1VA 1NGGA 1QHTA 2YKMA 4W5RA 3CJ1A 3CG7A 3CQ8A 3D6RA 5HBMA 1ESVA 3VQCA 1NMNA 5KRSA 3D2EA 3TARA 1S22A 3C94A 4JKHA 1X3NA 5AQPA 2B4JA 2FF6A 3OS1A 1RBRA 3HPOA 3AVJA 4HUGA 4G9ZA 3CM6A 4I9LA 4Q5VA 4U7BA 2W6KA 5CZ2A 3AY9A 4MDAA 3K5OA 1BI4A 1S1XA 4ZHRA 4CHPA 3QEVA 3I33A 3THYB 2GUPA 3ASMA 3P39A 2O8DB 3JS6A 1WUAA 1JXBA 1HQEA 1HKCA 4JI6K 4Z4IA 4M41A 1JCGA 3WNFA 4NLBA 4DR1K 1S1VA 2FLOA 4CZIA 3QMLA 1K8KA 4K42A 2VWKA 4AHVA 4DLEA 1K8AO 4LF9K 1JCEA 3KHYA 3T3FA 4KB0A 3LP1A 3H45C 4MLEA 3SBGA 3DXKB 1TYQA 5H1SQ 4DFJA 3ALYA 1Q18A 3GL1A 3H3NO 3KK3A 4BDZA 4EP4A 3NCIA 2HHQA 1R0AA 4CJQA 4KREA 5AQNA 3DLRA 4DFMA 3M8SA 4ELTA 4B3RK 3THYA 4OVLA 2ZE2A 2O8DA 3QIPA 4WFBL 3SV3A 3MWPA 1RNHA 4FJXA 1EWRA 4LF6K 4M7XA 4E7JA 1XHXA 2JWLA 5EU7A 2DFHA 4DV7K 1WBDA 1QSYA 4O8UA 5HROA 2QW9A 4G1QA 4BR9A 1T3VA 1WSGA 1ZBFA 1L3SA 3CI5A 4JRPA 4KHNA 2F4VK 1C0UA 3DYAA 3ZSQA 1WSFA 3U8XA 3VQBA 2Q0UA 2YNGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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