1OVYA

Solution structure of ribosomal protein l18 from bacillus stearothermophilus
Total Genus 13
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
13
sequence length
97
structure length
97
Chain Sequence
b'GTTERPRLSVFRSNKHIYAQIIDDTKSATIVSASTLDKEFGLDSTNNIEAAKKVGELVAKRALEKGIKQVVFDRGGYLYHGRVKALADAAREAGLEF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords 50S Ribosomal Protein L18
publication title The solution structure of ribosomal protein L18 from Bacillus stearothermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Geobacillus stearothermophilus
molecule tags Ribosome
total genus 13
structure length 97
sequence length 97
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00861 Ribosomal_L18p Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.100 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1ovyA00
5JVGL 1YJWN 3I55N 5GAEP 3CCVN 1Q86O 1Q82O 4WFAL 2ZJQL 5DM6L 2QA4N 1VQON 1YHQN 1QVFM 3CCLN 5GAHP 3CC7N 5DM7L 5GADP 3CF5L 4WFNL 2OTJN 1YITN 1VQNN 1N8RO 3CMAN 1ILYA 3G71N 3CCSN 4WF9L 1VQMN 4UY8O 1K9MO 3CCEN 1VQ8N 4WCEL 3OW2M 3J7ZO 1VQ9N 5H1SQ 5HL7L 3I56N 1JJ2M 2OTLN 1KQSM 3CCMN 3CMEN 3CCQN 4IO9L 1S72N 1M90O 3CCJN 1K73O 1K8AO 5JVHL 3CD6N 3PIOL 2ZJPL 2ZJRL 4IOCL 2QEXN 1YI2N 1W2BM 4U67L 5MLCQ 1NJIO 1QVGM 1KD1O 3CCRN 1Q7YO 3DLLL 3G4SN 1VQPN 1VQKN 1M1KO 1Q81O 3CCUN 1VQ4N 3CPWM 5GAGP 3G6EN 3CC2N 3PIPL 1VQLN 1VQ5N 4IOAL 4WFBL 1KC8O 1VQ7N 3CXCM 1YJ9N 1YJNN 1VQ6N 1OVYA 3CC4N 1YIJN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3K9KA 2FXUA 1RDUA 3H6EA 4IBNA 4DV3K 1ZXOA 3LAKA 3QETA 2D4WA 5HRRA 1GLJO 3SZ2A 4CHNA 3VPZA 4BRNA 2PFUA 4DUZK 3L2RA 1T6CA 5KQDA 4BVOA 2E2PA 3MXJA 3H1QA 3MMVA 4A59A 5DM7L 1C0TA 3SAFA 3A0IX 1MWMA 2ZE2A 4BY9C 3ENHA 4YOWA 2I7PA 1D4XA 2A1SA 1K9MO 1IKYA 2FLOA 1IKWA 2PYLA 2IVPA 3VGKA 3UB5A 4IDKA 1QE1A 3H08A 1IG9A 1D9FA 1UA1A 3QEPA 3PV8A 1JL2A 5BRHA 1BOTO 2W40A 4KO0A 3TU5A 1J53A 5LL6Z 5BR8K 4R5PA 3RMAA 4DTRA 5AQMA 3L0QA 1QZ6A 2P9KA 3GL1A 4KFBA 3SLCA 5AZIB 1BIZA 1BCMA 1SL2A 2E20A 1K8AO 1NGDA 3VQBA 4TSXA 2DY4A 1WUAA 1S1TA 4JV5K 3BGRA 4CJ3A 2ZWHA 4F9OA 3EEQA 2OANA 4WQ4C 4DV0K 5AJ3K 4N47A 2E2QA 4KTWA 1UOCA 4BWMA 4FM2A 4KHNA 4OPAA 2OZSA 4FJNA 2G8HA 3ZSXA 1SL0A 1XC3A 5AQWA 2PBDA 3M8PA 4A2BA 1J6ZA 5C12A 3PLAA 2YKMA 1TUYA 3R3LA 2UYTA 3AAQA 1BI4A 3VTHA 1RT2A 5KGXA 4H0YB 5FPEA 2YKNA 3CFRA 3RWUA 3WUHA 1NOZA 1QHTA 2E8AA 3S3OA 2ASPA 2V51B 3CXCM 3ZX0A 4JKHA 4DU1A 1NGCA 4HHTA 3PO5A 2HNDA 3VGLA 4O8KA 1TYQB 3DRPA 4GKJK 4LSNA 4K42A 1BO5O 4DSLA 3JSMA 5GIPA 2XY5A 2QXLA 4FCYA 1D5AA 3TAFA 5JICA 1XUPO 4ILJA 4KPYA 3ZX3A 1U2VB 4B9UA 2Q31A 4JK7A 2Y1JA 3T7ZA 1LAWA 2ZGZA 3OS0A 2HNYA 4DR4K 4JRPA 1NGFA 1UWBA 1RILA 4A57A 4CJEA 4EP4A 2P9PA 1XNRK 4FVMA 4ISGA 2QWMA 4CZLA 3KLHA 4IJAA 2VG5A 2WOMA 3AVJA 4FLTA 2YCHA 4M63C 3EYZA 4JKBA 1WBDA 3W3DA 2YHYA 1DTQA 4JD2A 4LFBK 1BDGA 1BGXT 3DOLA 3M3ZA 3QICA 3QDKA 2ZGYA 3SCXA 3OYCA 2ASOA 3MXMA 4GNIA 1K73O 5BPMA 2NZTA 1RT1A 3B6OA 1C0FA 1ZBLA 4QS8A 4ID1A 4W5NA 5SZTA 1GLAG 4HWIA 4LF5K 1D9DA 3DLEA 3CHWA 4XH4A 1T8EA 5E84A 3BF1A 4JN4A 4K25A 1BUPA 2ZQBA 3F5TA 3KK1A 2EWSA 3FE1A 2QK9A 3AVNA 2BH1A 2YNGA 3VEOA 1RBUA 3MWPA 4GMJB 4CERA 3R6MA 3WXMB 4DTOA 3OYFA 2O8BA 2GWJA 1EWRA 4W5QA 3ZSVA 2A6AA 4CHOA 3I8DA 3VEVA 4YOUA 1ASWA 3E66A 3PUFA 3VGMA 1WB9A 3ZX2A 1JLQA 4M3YA 3HPHA 3S9HA 3CFPA 3J7YP 3THWB 3CC4N 4DSEA 4N56A 3CJBA 3LPTA 1YIJN 4H0XB 2JLEA 1SUQA 4I9LA 4DTNA 3TANA 4F3OA 1W97L 2HW3A 4FJ8A 1NKBA 1WSIA 3JS6A 5DM6L 2QM1A 1N36K 2VQEK 3U8XA 4BRGA 1VQON 3ZSQA 4OO1J 1S1XA 1U49A 4CF2A 4FWLA 4Z4CA 4JI4K 4CZFA 2JGUA 3V9SA 1NGJA 2VWBA 1NGAA 1RFQA 4DR6K 2KLAA 3CQYA 3O9TA 3WXIA 4GW6A 4DR2K 2QW9A 4DQIA 5FPNA 5AQVA 2KKZA 2Z1GA 5M1OA 1G15A 3KLGA 4DFPA 1LWEA 3TAPA 4FJXA 4CF1A 4ELUA 5C25A 5AQFA 1JLEA 2UXCK 1ZBSA 1C0GA 3EKSA 3KLIA 3JXUA 3MCAB 4BRCA 4CW7B 3CD6N 1CXUA 5EU7A 4M41A 4BVPA 1RTDA 1XQSC 1I39A 3VQEA 2QEXN 1W2BM 4F3TA 1HYZA 1HR0K 3SUOA 4AH9A 1NJIO 3ZETA 3LP0A 3VQ9A 3CYMA 5BPLA 1RDCA 3TTFA 1L5UA 2QWQA 3SK3A 4H5WA 5JS1A 5B8HA 3A5NC 4DR3K 4OJRA 4KI4A 4I9QA 3HOSA 3G6EN 3KK7A 2FSJA 3OS1A 3QFPA 2D0OA 2VCPA 4J2AA 1K8KB 4CHZA 1WSGA 1T7PA 3HVRA 4BR7A 2BUPA 1KXPA 3UKRB 1GLBG 1W7AA 3M8SA 1VSMA 5AR0A 1UAXA 1IKVA 4JI6K 4DF8A 4CZMA 4NCAA 4FZYA 4B1YB 1NK9A 3NCIA 2D0AA 3DLRA 4K43A 1VSKA 2CH6A 4JK8A 5I9EB 3OYJA 4I7FA 1BCOA 2GUIA 3VQPA 1LWFA 3ISNC 3UIQA 3CJ7A 1C1BA 2QKBA 3VF2A 2A5XA 3HSTB 2KHOA 3U3YA 4OGEA 2OPQA 3BP8A 3DYAA 4ISFA 5C10A 3AY9A 5M1FA 3QLHA 3ID8A 2HMPA 4CFBA 2GELA 3LANA 4CJUA 4KB0A 3U9DA 4M3XA 4BC3A 2XO7A 3M6GA 4I2QA 4KHYA 1HJRA 3ZEUB 3WXLA 1FW6A 4FJ5A 3V9UA 3F9KA 4YDUA 4NYNA 2G8UA 4J2EA 3O1BA 1X3NA 4B8CA 3RMCA 5JVHL 4B3MK 1T05A 4LH5A 2P5GA 3TTCA 2IVNA 2W6KA 3IAYA 4W5TA 4Z4IA 4CJWA 4F8RA 4JI8K 3SJHA 1J9AA 3K5OA 1QZ5A 3MN9A 1X9WA 3GG4A 1NJZA 4LY7A 2XY7A 1S6QA 4AILC 1QQNA 4BR9A 5T7BA 3THXA 4MFBA 1KD1O 3ULEB 4NB4A 4E7IA 4ILHA 3CPEA 4KTQA 3GOIA 3EY1A 4B08A 3KLFA 3KJVA 3OA9A 2QKKA 4H4OA 3CCUN 1IG8A 3T19A 2NRXA 3CPWM 4JKCA 4NXMK 4BWJA 5GAGP 3RRHA 1NJYA 2P9SA 4FWPA 4DLEA 1TAUA 2DPNA 3TTDA 3DRSA 4IEIA 2B4JA 4IOAL 3HP6A 1KC8O 3DJCA 3CG7A 4CJ4A 3O4NA 1Q9YA 1EP4A 1TUUA 1WN7A 1JKHA 1Z25A 1LV5A 2Z1IA 1S9EA 3O9UA 1YJWN 3GE1A 3Q7BA 4C8MA 3IMXA 5GAEP 4LF8K 2G8IA 2HF4A 1ASUA 4KHQA 2NRWA 2NRVA 4DR7K 2O4GA 4B1VA 2E4LA 4FK2A 1TAQA 1YHQN 2E5LK 3VETA 4FJGA 3TAEA 3WNEA 2VG7A 1HYVA 3CCSN 4CEBA 1GLFO 4JEPA 3O9SA 1HQUA 5A2QO 4WCEL 3J7ZO 1U48A 4FM0A 3H46O 1J54A 4LH4A 2X6NA 1O1WA 3AVLA 4W5OA 4OX9K 3D2EA 3VMFB 3CCQN 2O8FB 3K5LA 4F2RA 3A5OC 2QWRA 5FDLA 1XHZA 1KVAA 4DLGA 4DSFA 4B9SA 3BF3A 4JKAA 3UKUA 3ZLJA 2A40A 1OH7A 5JMVA 3CQ8A 3OY9A 1NGHA 1WLJA 4CK3A 4IG0A 1WBBA 5CE3A 3O6WA 1NK6A 1YVUA 4H0TB 4RTFD 3LAMA 3MN5A 1RDWX 4AM7A 1NOYA 4QOZB 1O13A 3CC2N 5EX5A 2QWPA 3K58A 3VQ6A 1B9DA 2NRHA 4CHYA 1VQLN 1S22A 5TKWA 1HRHA 3D7EO 2IIRA 4H0VB 1NM1A 2QXFA 1SL1A 4BRLA 4YDUC 4H5TA 4DQ8A 4CIFA 1HPMA 4ISEA 4BC2A 4DU3A 1U6ZA 3NGIA 2RE2A 3TARA 2V7ZA 3ZSOA 1Q86O 4KHUA 1GLCG 2A41A 2LSNA 3P4IA 4EHUA 4RW6A 1HNXK 1RTJA 3AO4A 5AZIA 3ZSWA 4F4KA 5DMRA 1NGIA 1QVFM 1W0HA 1N32K 3ZSRA 4FJ7A 1VSDA 5JLFA 3OJUA 3O9RA 4DR1K 2YJFA 4JI1K 4BR2A 2R7YA 5C0YA 4WF9L 3MECA 5BPNA 4B1ZA 5FRNA 3ENBA 4DTJA 1BQMA 1FKOA 4CEZA 4BRDA 2FF3B 4DB3A 4FOEA 4K8ZA 2BTFA 5BN8A 4QS9A 4J2BA 3ASMA 3SNNA 3FFKB 1QSLA 1JJ2M 1FJGK 3FZKA 2CGLA 4CJ7A 5CY4A 5AQUA 3QEXA 4X62K 2QWNA 3CCJN 4CIGA 1S9GA 1QHAA 2Z1HA 1IBLK 2EHGA 2HHQA 1CZ9A 3NVKA 2ZD1A 1DEJA 2O8EB 1ATNA 4MDAA 4OPHA 3L4QA 3TSPA 1VSEA 4BGAA 2E6MA 4I6MB 1TYQA 2G8KA 3HO1A 4FJIA 2ASMA 4O0IA 3DLLL 4B3RK 2HF3A 2AJQA 2P9IB 3QBXA 2FSKA 3K2PA 5AQQA 2NRTA 3FGUA 2NLXA 1U2VA 2HHUA 4AHVA 4DF4A 3FZHA 4BACA 2VG6A 2YNIA 2E6LA 4FJKA 2YV0X 5AQIA 4DV2K 5F0XA 4DTXA 2D0PA 4CZJA 3P31A 4C8NA 1KCFA 5FPMA 4KHWA 4B9LA 3TABA 1MA9B 5C2FA 1VQ6N 1KSPA 4O44A 3L2VA 3NF6A 3NF9A 4BE2A 1B92A 4LD0A 5ADXH 4RWTA 4FWOA 3VQDA 2HNZA 2J4RA 4DSKA 3J80O 3JYTA 4A5AA 4A62A 5HRSA 4O8UA 3D2FB 3BUZB 1BG3A 1WSHA 3NGZA 1WAFA 2WONA 4YHHK 4JI2K 3QEWA 2KQ2A 2IGIA 1U04A 2ITMA 4GY2B 5GADP 3SAGA 3NH1A 4FZZA 4QAGA 5KPRA 3CI5A 1MWKA 1ZC6A 4FW2A 1NK0A 1ILYA 1JCGA 3DXKA 4CGJA 3RSEA 4KV8A 2G8FA 3P83D 2W6LA 2PYJA 3HXMA 4KH6A 4O5FA 4Z4GA 4C8LA 4M45A 4FK4A 3KD1E 1KQSM 4OLAA 3SAHA 5BR9A 4DV5K 4CJKA 1NMNA 4IOXA 2P9LB 4DQQA 2UXBK 4PA1A 3HM8A 3I0RA 4UQGA 2HHHK 3CM6A 4FWMA 1EO1A 4IOCL 2HHVA 4ELTA 4DCHA 4FK0A 3NGYA 4C1NI 3SUNA 3QO9A 3ZSYA 1CXQA 4ICLA 1P8ZA 4M42A 3THWA 4LFAK 2O8DB 3CCRN 5J2MA 1A5WA 3HVTA 1XHXA 2F9WA 1M1KO 4J2DA 1ZBUA 4YFUA 4NXNK 1VSJA 3MCPA 4BRKA 2F8SA 3CERA 3PSFA 4DFMA 1YXQA 3SMPA 5J1EA 3DM2A 1HNVA 4LF6K 1JL1A 1VSIA 1XNQK 1JLGA 4LC9B 1XC9A 5TKYA 3AVKA 3OYLA 3AA2A 4CF8A 3L2QA 4X64K 3A5MC 3OYHA 3LL3A 2VWKA 4JS4A 1JLFA 4FLUA 1JLAA 2XHBA 4FL9A 4CZGA 1VSHA 2F4VK 3FZFA 3QINA 1NJWA 3L3UA 3HL8A 4E7KA 1OVQA 4E7LA 4EZ9A 1EKEA 5CYMA 1TKZA 3HSCA 4OVLA 3G0ZA 3O5BA 3DI6A 3O08A 3FLCO 2OTJN 2X78A 4DSJA 1JCEA 3EZ5A 3G71N 1WOQA 1NJXA 1GLDG 4KI6A 1RBRA 3OYBA 3HI0A 4BR0A 4CJFA 4B9TA 4H5VA 4L3QA 3OW2M 4C8OA 4JHDA 1JXEA 2DFHA 4LF4K 1VQ9N 4NO7A 3U9ZA 5HL7L 3DXMA 4CHPA 4CHQA 3I56N 3NVMA 3LP1A 3NHGA 3CCMN 2BGGA 3A5LC 3L3VA 4M3TA 3QIOA 3QEVA 3TPQA 1S72N 4XIUA 4CEEA 3M8QA 1RDAA 1TL1A 3MN6A 3KTQA 3ULDA 4BG8A 4DS5A 4Z4HA 1KFDA 2P5OA 4HUGA 1HX1A 3K0SA 4IFYA 3IKMA 2YHWA 4M3WA 3OYIA 4BRPA 1OH6A 4OPKA 4Q5VA 4GVEA 1IH7A 4G9ZA 3BY5A 2YHXA 3S41A 2HHWA 3HOTA 3H45C 3LWMA 3AO2A 3EE8A 3VA0A 1ATSA 3O4WA 4CGGA 1S3XA 3AVAA 4KTZA 3OS2A 3HPGA 3D0PA 1T03A 1QTMA 4FLZA 1LOTB 2BE2A 4E1JA 4RW7A 4PHTX 3LM2A 3PY8A 5AQNA 3MEDA 1RDBA 1HUXA 3V1QA 4G1QA 3B8AX 4FW1A 2RPIA 3U6FA 1TGOA 5EXWA 1XMOK 5BRFA 1RTHA 1RDDA 3K57A 3LZJA 2GUPA 4Y1CA 5CZ1A 1RT4A 4CEOA 2YHAA 3V9WA 1IO2A 3M1FA 4J8FA 4DTSA 4PL8A 1KAZA 5JVGL 3VA3A 4DSIA 3TSQA 3ZEUA 4GVMA 3VOVA 3SYZA 4CJ5A 1LW2A 3T1HK 4DKWA 3ZT1A 1VHXA 2YHBA 1C0MA 3SI6A 1Z26A 3VN5A 3AVBA 4L8RB 1RBVA 3AARA 4OKEA 4WQ5A 4H5NA 5AFUH 5KTQA 1SZ2A 3G25A 3CCEN 4OGCA 3OYNA 2FBXA 4Y1DA 4KBOA 1QQOA 3EZWA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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 5JVG L;  1YJW N;  3I55 N;  5GAE P;  3CCV N;  1Q86 O;  1Q82 O;  4WFA L;  2ZJQ L;  5DM6 L;  2QA4 N;  1VQO N;  1YHQ N;  1QVF M;  3CCL N;  5GAH P;  3CC7 N;  5DM7 L;  5GAD P;  3CF5 L;  4WFN L;  2OTJ N;  1YIT N;  1VQN N;  1N8R O;  3CMA N;  1ILY A;  3G71 N;  3CCS N;  4WF9 L;  1VQM N;  4UY8 O;  1K9M O;  3CCE N;  1VQ8 N;  4WCE L;  3OW2 M;  3J7Z O;  1VQ9 N;  5H1S Q;  5HL7 L;  3I56 N;  1JJ2 M;  2OTL N;  1KQS M;  3CCM N;  3CME N;  3CCQ N;  4IO9 L;  1S72 N;  1M90 O;  3CCJ N;  1K73 O;  1K8A O;  5JVH L;  3CD6 N;  3PIO L;  2ZJP L;  2ZJR L;  4IOC L;  2QEX N;  1YI2 N;  1W2B M;  4U67 L;  5MLC Q;  1NJI O;  1QVG M;  1KD1 O;  3CCR N;  1Q7Y O;  3DLL L;  3G4S N;  1VQP N;  1VQK N;  1M1K O;  1Q81 O;  3CCU N;  1VQ4 N;  3CPW M;  5GAG P;  3G6E N;  3CC2 N;  3PIP L;  1VQL N;  1VQ5 N;  4IOA L;  4WFB L;  1KC8 O;  1VQ7 N;  3CXC M;  1YJ9 N;  1YJN N;  1VQ6 N;  1OVY A;  3CC4 N;  1YIJ N; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3K9K A;  2FXU A;  1RDU A;  3H6E A;  4IBN A;  4DV3 K;  1ZXO A;  3LAK A;  3QET A;  2D4W A;  5HRR A;  1GLJ O;  3SZ2 A;  4CHN A;  3VPZ A;  4BRN A;  2PFU A;  4DUZ K;  3L2R A;  1T6C A;  5KQD A;  4BVO A;  2E2P A;  3MXJ A;  3H1Q A;  3MMV A;  4A59 A;  5DM7 L;  1C0T A;  3SAF A;  3A0I X;  1MWM A;  2ZE2 A;  4BY9 C;  3ENH A;  4YOW A;  2I7P A;  1D4X A;  2A1S A;  1K9M O;  1IKY A;  2FLO A;  1IKW A;  2PYL A;  2IVP A;  3VGK A;  3UB5 A;  4IDK A;  1QE1 A;  3H08 A;  1IG9 A;  1D9F A;  1UA1 A;  3QEP A;  3PV8 A;  1JL2 A;  5BRH A;  1BOT O;  2W40 A;  4KO0 A;  3TU5 A;  1J53 A;  5LL6 Z;  5BR8 K;  4R5P A;  3RMA A;  4DTR A;  5AQM A;  3L0Q A;  1QZ6 A;  2P9K A;  3GL1 A;  4KFB A;  3SLC A;  5AZI B;  1BIZ A;  1BCM A;  1SL2 A;  2E20 A;  1K8A O;  1NGD A;  3VQB A;  4TSX A;  2DY4 A;  1WUA A;  1S1T A;  4JV5 K;  3BGR A;  4CJ3 A;  2ZWH A;  4F9O A;  3EEQ A;  2OAN A;  4WQ4 C;  4DV0 K;  5AJ3 K;  4N47 A;  2E2Q A;  4KTW A;  1UOC A;  4BWM A;  4FM2 A;  4KHN A;  4OPA A;  2OZS A;  4FJN A;  2G8H A;  3ZSX A;  1SL0 A;  1XC3 A;  5AQW A;  2PBD A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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