1OWYA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 2-propyl-aniline
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owyA00
127LA 152LA 1D3JA 1L81A 190LA 3OE0A 2B6YA 1OWZA 1L71A 1KW7A 149LA 1KY1A 1C6KA 1PQKA 102LA 3EMLA 3LZMA 1L14A 2L78A 1P36A 1JQUA 232LA 161LA 1L24A 227LA 172LA 1L54A 1P6YA 199LA 4EPFA 1L53A 4I7MA 143LA 1T97A 1ZWNA 3SBBC 2F32A 1LPYA 1TLAA 2LZMA 2OU8A 3D4SA 240LA 4W57A 1L16A 1C6CA 1L66A 2F2QA 3SBAA 1C61A 1CU5A 137LA 1P46A 1T8GA 1L68A 3GUPA 1L62A 1C6BA 1JTNA 1L89A 195LA 2A4TA 1QT4A 3FA0A 166LA 1PQIA 1P2LA 1DYGA 1LYGA 192LA 188LA 1G0GA 185LA 1L73A 247LA 120LA 138LA 1L34A 212LA 2ANVA 159LA 1LWKA 1P64A 1L88A 4I7PA 4LZMA 2RBSA 2RH1A 112LA 1L38A 4PK0A 2OEAX 1T6HA 3HT8A 221LA 1L05A 107LA 3CDRA 1L59A 4I7LA 1D9WA 1L98A 253LA 141LA 4IAPA 2ANXA 3HU8A 1L49A 1CU0A 4W51A 1LYFA 262LA 4ARJA 1L61A 1LYHA 1L51A 2RBQA 1QUHA 184LA 1QUDA 2B6ZA 1EPYA 1C6JA 178LA 1LI2A 1T8FA 1L13A 2QB0B 1L21A 3SB5A 4ARQA 4W54A 1L90A 1SSYA 3V2WA 1L63A 125LA 1L23A 1L85A 3CDOA 155LA 1C6EA 3C8RA 1CV6A 1DYCA 3G3XA 157LA 1L99A 1C63A 1L42A 4I7RA 3SB7A 205LA 238LA 3HDEA 1L87A 1CU2A 1G06A 1QUGA 224LA 1C6HA 3F8VA 1LI6A 4ARMA 3FADA 144LA 1LI3A 3G3VA 1L47A 1C6MA 1LLHA 1K28A 160LA 3SB9A 177LA 3GUOA 216LA 2B73A 1OVJA 163LA 3C82A 209LA 1L76A 1QUOA 2CUUA 1C6AA 210LA 3K2RA 1PQOA 1L15A 3UONA 2OE7X 1LYIA 1XEPA 1L77A 3NY9A 3OE9A 1KNIA 122LA 1L0KA 1SX2A 165LA 3HTFA 3HWLA 4I7QA 3HH4A 1L70A 4W55A 1LGWA 1C64A 2QARC 3FI5A 4W59A 3PDSA 4I7OA 119LA 1CX6A 1QSBA 4I7NA 1OVHA 2Q9EA 1SWYA 3L2XA 1P5CA 103LA 104LA 3HTGA 241LA 217LA 3C8QA 234LA 1CVKA 4OO9A 3HH3A 169LA 1D2WA 1C6NA 1L44A 1D2YA 1L45A 1OWYA 201LA 3DN0A 1CV1A 2HUKA 2LCBA 1G0KA 196LA 2RBNA 1L39A 3HT9A 222LA 3HU9A 3RZEA 1QTZA 4EJ4A 164LA 4EKRA 211LA 1CX7A 1OV5A 230LA 3L64A 1QT6A 236LA 1L28A 1L00A 1QT3A 111LA 3C7ZA 1G07A 3CDQA 1OV7A 114LA 1G0JA 3C7YA 1L40A 145LA 1L36A 258LA 1L29A 1QTVA 2Q9DA 3PBLA 1DYBA 1L35A 3HUQA 4EXMA 113LA 110LA 1L75A 1C6LA 3DKEX 257LA 206LA 4ARLA 168LA 2B72A 2OE4X 3DN3A 3DMVA 220LA 259LA 1L69A 162LA 1KY0A 4ARQB 183LA 171LA 3GULA 1G0PA 1L95A 5I14A 1C65A 1PQDA 3GUNA 3ODUA 3JR6A 4GRVA 1OVKA 2B74A 118LA 4K5YA 2OTZX 4AQNA 3NY8A 5LZMA 187LA 1NHBA 2B7XA 2O4WA 254LA 255LA 2HUMA 181LA 1L07A 1CV4A 4EPIA 4YX7C 2B70A 4ARMB 1L22A 4PJZA 1D3NA 4E97A 1L37A 180LA 123LA 228LA 1L67A 245LA 197LA 129LA 244LA 1L94A 1LYJA 1L25A 140LA 3DN4A 1QT5A 1L30A 237LA 248LA 1QT8A 2OU0X 3GUKA 2RAYX 1L18A 1I6SA 219LA 4LDLA 239LA 1L26A 1L82A 4EKPA 1QTCA 2RB1X 4I7KA 3DNAA 2RBPA 182LA 1P7SA 4DJHA 1L10A 1L52A 3HT7A 3RUNA 1CUQA 1LGUA 1C6DA 131LA 158LA 1B6IA 173LA 1P3NA 1PQJA 126LA 1L50A 231LA 174LA 3C8SA 226LA 1P2RA 3HUKA 1L04A 1QTBA 1D3MA 146LA 1D3FA 1C6QA 1JTMA 260LA 3G3WA 3SN6R 2RBRA 1ZYTA 175LA 256LA 1C6FA 142LA 249LA 246LA 4LDOA 2RB2X 1L64A 2B6TA 147LA 1L91A 1G0LA 1WTHA 3SB8A 4I7TA 1DYFA 4ZPUA 1L46A 1QS9A 4W58A 4GBRB 1DYDA 1L20A 1L11A 1P37A 1C6GA 218LA 139LA 130LA 1CV3A 1L57A 2B75A 1L09A 191LA 242LA 2F47A 2RB0X 3V2YA 1DYAA 252LA 1L92A 108LA 2RAZX 1L43A 4I7SA 1L31A 225LA 4LDEA 1QTDA 150LA 4W56A 3C7WA 1T8AA 1LGXA 167LA 1L01A 1G0QA 1L12A 1CV5A 229LA 3GUMA 1LYDA 3GUJA 3HT6A 3HH6A 1L41A 128LA 1L48A 3OE8A 1LWGA 1KS3A 2O7AA 261LA 2HULA 1L27A 3CDVA 189LA 1C62A 214LA 2LC9A 1DYEA 1SX7A 1L56A 1P56A 3QAKA 109LA 251LA 151LA 1C60A 4S0WA 1L0JA 1L17A 1L80A 223LA 4YXAC 1XJTA 1C69A 1C6PA 1L84A 1L58A 1L86A 213LA 3DMXA 4W53A 186LA 3HH5A 4ARPA 1CTWA 4DAJA 1L55A 2IGCA 3C83A 4EKSA 3HTDA 1QT7A 1L79A 4EKQA 1C66A 1L02A 1L19A 198LA 3F9LA 2OU9A 1L03A 1C68A 1L72A 1CU3A 6LZMA 1L32A 1SWZA 3HDFA 2NTHA 1L33A 3DN1A 1G0MA 1L97A 1PQMA 148LE 1QS5A 2B6WA 1C6TA 3DMZA 4I7JA 1CUPA 3DN8A 115LA 1L60A 3C80A 2RBOA 235LA 1L83A 1QSQA 156LA 1G1WA 176LA 1L06A 1XJUA 1C67A 3CDTA 1L65A 233LA 170LA 1OYUA 3OE6A 1SSWA 1LW9A 2Z6BA 3C81A 3GUIA 250LA 1L08A 4DKLA 1KW5A 1L93A 215LA 3HTBA 1L96A 4YXCA 3SB6A 3VW7A 3DN2A 4W52A 1CV0A 200LA 1LYEA 1G1VA 2B6XA 2NTGA 2OTYX 1CU6A 243LA 1L74A 3NYAA 1C6IA 2O79A 2OE9X 1QTHA 7LZMA 3HUAA 3DN6A 1ZURA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L81A 1LSFA 1C7PA 2B6YA 1OWZA 149LA 1C6KA 3LZMA 2MEDA 1GFHA 1P36A 232LA 227LA 172LA 1GF3A 1P6YA 199LA 4EPFA 1DZBX 1GB8A 240LA 1EQ5A 1IR7A 1B5UA 1LYYA 1C6CA 3SBAA 1C61A 1P46A 3GUPA 1L62A 1IP3A 3FA0A 2Q0MX 2W1YA 1P2LA 1BVXA 1DYGA 3W6BA 1JJ0A 185LA 2BPUA 138LA 1GFEA 1LZ4A 159LA 4H9BA 1L88A 2RH1A 3WVXA 2I26L 5FELA 1A4VA 2OEAX 1LJNA 5F9UA 107LA 3CDRA 1J1XY 5LXWA 1D9WA 1L98A 1LZ1A 3AZ4A 3IWRA 3OJPA 141LA 2F2NA 1UIBA 4PRQA 1CU0A 4W51A 3CT5A 262LA 1OUHA 1L61A 1LYHA 1QDRA 4XJBA 1LI2A 1IP5A 1L13A 1L21A 3SB5A 1HFYA 1HFZA 1L23A 1L85A 3C8RA 4DD9A 4XJHA 4R6CA 3OK0A 1L42A 205LA 238LA 3HDEA 1L87A 1HEQA 1XEJA 1G7JC 1REZA 4ETDA 1UC0A 1B0DA 4DDCA 3FADA 1DI5A 2YBIA 4OWBA 1LLHA 1K28A 3GUOA 4BAFA 1LZ8A 4YEMA 2B73A 3C82A 4LYZA 1UACY 5B05A 1C6AA 1LSBA 4TTDA 5B07A 1WQQA 3AZ7A 4RDSA 4NGIA 5C6IA 5E4PA 1CKDA 1VDQA 1GBXA 165LA 3HWLA 4CHXA 3HH4A 1IOSA 1IVMA 2QARC 1JJ3A 4W59A 4I7OA 1IOQA 1HNLA 3W3EA 1CX6A 2HEAA 1IC4Y 3TXGA 1B5WA 3C8QA 1IWVA 1VDPA 1JSFA 4CFPA 1YKZX 3A92A 1D2WA 1DPXA 4ET8A 2C8OA 3DN0A 3WU7A 4PGJB 2LCBA 2Y8PA 4B0DA 1BHZA 4KPMA 1TEWA 1YILA 222LA 164LA 2BQHA 1QSWA 3LYZA 3A91A 2ZYCA 1QT6A 236LA 2Z38A 1JKAA 1L28A 1L00A 1LMQA 2ZYPA 5F9XA 2BQAA 1OV7A 114LA 1G0JA 4YM8A 2MEFA 4WLTA 1L36A 1GF9A 1DXJA 1GDXA 1C6LA 4NHQA 4LYTA 257LA 1LSYA 1UA6Y 2B72A 3DMVA 220LA 3T6UA 1LHJA 259LA 2Z12A 162LA 171LA 1G0PA 3GUNA 1PQDA 1OVKA 2B74A 4K5YA 1LJ4A 3LHMA 5LZMA 187LA 5IDDA 2WARA 254LA 4B4IA 5D5CA 2GV0A 4WM1A 1N4FA 1GPQC 4ARMB 1D3NA 4E97A 2YBHA 4XJIA 1LAAA 180LA 245LA 4H94A 244LA 1L94A 1LYJA 154LA 140LA 3D3DA 2F4GA 237LA 1ZV5L 1L18A 3P68A 3TMWA 239LA 5APCA 3WYHA 1L82A 4LFXA 1GE3A 4I7KA 1B7LA 3DNAA 2RBPA 1P7SA 1GFKA 3EBAB 1LTMA 1L10A 3HT7A 3RNXA 5FSTA 3AYQA 158LA 3A95A 1QUTA 4DD0A 173LA 1P3NA 3N9CA 1B7SA 2CWIA 5IELA 5DN5A 1LJIA 1LZ6A 4WM2A 1D3MA 4ETAA 3AB6A 146LA 4NGLA 1LSNA 2RBRA 1YKXX 1OUAA 5A3EA 2D4KA 1LJ3A 1L64A 3SB8A 1WTHA 1DYFA 4B49A 1IC7Y 4W58A 4HP0A 5L3IA 1AT5A 1P37A 2MEHA 1LPIA 5F16A 1L57A 1LOZA 191LA 5FEKA 1GHLA 2RB0X 3V2YA 1CNSA 108LA 2YBJA 1EL1A 1UIGA 1LZ9A 1L31A 150LA 2DQAA 3CT1A 4HSFA 4N0JA 3C7WA 1T8AA 3N9AA 3W6AA 167LA 1G0QA 2ZQ4A 229LA 4NHTA 3GUJA 3A34A 1LWGA 261LA 2HULA 1L27A 2LHMA 2LC9A 1DYEA 1SX7A 2Z2FA 1C08C 1VDSA 4LZTA 1YIKA 223LA 1XJTA 3GXKA 5KXOA 213LA 3DMXA 4W53A 4ET9A 1CTWA 3P65A 1OUJA 5KJ9A 2W1XA 2IGCA 1HC0A 1HHLA 3HTDA 1L79A 4NGYA 1XEKA 3F9LA 1LMCA 2OU9A 3QE8A 1CU3A 3HDFA 3A3RX 3M3UA 1LJFA 1MELL 2XJWA 1SQ2L 1C6TA 1PS5A 4I7JA 1LZCA 3A94A 3T36A 1GB0A 2RBOA 1SLYA 1GAYA 3VWOA 156LA 1L06A 1LHKA 2CDSA 3CDTA 5DL9A 1BB5A 3OE6A 1T3PA 1BVKC 3BKHA 1F6SA 3N9EA 3WH1A 4DKLA 1IY4A 4HTKA 4OWAA 1XGTC 2D4JA 4YXCA 3VW7A 3B72A 1LYEA 4J1BA 2OTYX 1BQLY 2OE9X 8LYZA 1WVVA 3HUAA 1CJ8A 4H90A 3TXHA 3LYTA 127LA 1B7NA 1D3JA 190LA 4AXTA 4NWHA 1GBWA 1PQKA 102LA 3A96A 194LA 2HECA 1FDLY 5KXZA 1AKIA 1JQUA 1C43A 4LT3A 1L24A 5KKJA 2H5ZA 4WM6A 1T97A 1ZWNA 2F32A 1TLAA 4C3WA 1IP7A 4W57A 4H1PA 5DN4A 1L68A 4A7DA 1J1OY 1JTNA 1L89A 195LA 2A4TA 3RZ4A 2HUBA 5DLAA 1LSAA 1REMA 1PQIA 1LYGA 4O34A 2W1LA 2I6ZA 1G0GA 1L73A 4TSCA 212LA 2D6BA 2ANVA 1I20A 4GCCA 1GF4A 1BWHA 112LA 1L38A 3A3QA 1L05A 1NQIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L81 A;  1LSF A;  1C7P A;  2B6Y A;  1OWZ A;  149L A;  1C6K A;  3LZM A;  2MED A;  1GFH A;  1P36 A;  232L A;  227L A;  172L A;  1GF3 A;  1P6Y A;  199L A;  4EPF A;  1DZB X;  1GB8 A;  240L A;  1EQ5 A;  1IR7 A;  1B5U A;  1LYY A;  1C6C A;  3SBA A;  1C61 A;  1P46 A;  3GUP A;  1L62 A;  1IP3 A;  3FA0 A;  2Q0M X;  2W1Y A;  1P2L A;  1BVX A;  1DYG A;  3W6B A;  1JJ0 A;  185L A;  2BPU A;  138L A;  1GFE A;  1LZ4 A;  159L A;  4H9B A;  1L88 A;  2RH1 A;  3WVX A;  2I26 L;  5FEL A;  1A4V A;  2OEA X;  1LJN A;  5F9U A;  107L A;  3CDR A;  1J1X Y;  5LXW A;  1D9W A;  1L98 A;  1LZ1 A;  3AZ4 A;  3IWR A;  3OJP A;  141L A;  2F2N A;  1UIB A;  4PRQ A;  1CU0 A;  4W51 A;  3CT5 A;  262L A;  1OUH A;  1L61 A;  1LYH A;  1QDR A;  4XJB A;  1LI2 A;  1IP5 A;  1L13 A;  1L21 A;  3SB5 A;  1HFY A;  1HFZ A;  1L23 A;  1L85 A;  3C8R A;  4DD9 A;  4XJH A;  4R6C A;  3OK0 A;  1L42 A;  205L A;  238L A;  3HDE A;  1L87 A;  1HEQ A;  1XEJ A;  1G7J C;  1REZ A;  4ETD A;  1UC0 A;  1B0D A;  4DDC A;  3FAD A;  1DI5 A;  2YBI A;  4OWB A;  1LLH A;  1K28 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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