1OWZA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 4-fluorophenethyl alcohol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owzA00
2B6XA 227LA 1QTHA 1L56A 4W57A 3GULA 1G0PA 2OU9A 223LA 1QUHA 1SX2A 190LA 4K5YA 3DMZA 173LA 1OVKA 3HU8A 1CU5A 2ANVA 1L79A 4ZPUA 1LYDA 4EPIA 1C65A 241LA 3HDEA 1L33A 1L66A 3DNAA 1L46A 1XEPA 4ARPA 2HUKA 160LA 4I7TA 2RB0X 103LA 1P36A 1L35A 1L88A 3ODUA 1SWZA 2QB0B 1L68A 1L31A 1LI2A 229LA 1L65A 1P37A 1C62A 3GUIA 4DJHA 1CUPA 1D3JA 1QTCA 1G06A 1LYIA 3C8QA 3CDOA 1LI6A 2NTGA 1KY0A 1L30A 3CDQA 3HUQA 1CU3A 142LA 1L63A 104LA 1NHBA 1L26A 1JTNA 113LA 1L34A 3FA0A 4ARJA 1L45A 1KY1A 1CU2A 148LE 3NY9A 3HWLA 4W52A 1L38A 2B75A 1QUOA 1L62A 2OU8A 1L47A 253LA 3PDSA 213LA 1C6TA 251LA 4I7JA 1LGXA 4EKPA 196LA 243LA 197LA 2RAYX 1CX6A 1L09A 1PQMA 1L98A 3SB5A 1QT5A 244LA 3UONA 1QT3A 3CDRA 222LA 3C81A 120LA 1T8GA 150LA 189LA 1L08A 255LA 2HUMA 2RBPA 1DYEA 1L59A 210LA 3C7ZA 2F47A 1D3NA 3GUOA 4ARMB 1L28A 4DKLA 127LA 1P6YA 130LA 1LPYA 122LA 3FADA 191LA 1DYGA 1QS5A 3DN6A 169LA 4AQNA 2Z6BA 2RB2X 232LA 4I7PA 2Q9DA 1L55A 256LA 172LA 184LA 5I14A 1DYBA 1PQIA 261LA 4EXMA 3OE0A 1C6KA 1L70A 1D2WA 1CU6A 158LA 112LA 1L99A 1L37A 3SB7A 1PQKA 1KW7A 1LLHA 1L19A 1C60A 1CTWA 1L92A 3DN0A 1L83A 1L54A 2ANXA 1L27A 3GUJA 1L60A 174LA 1L84A 2CUUA 1L72A 4I7LA 3C82A 1L49A 3C7WA 1L90A 195LA 219LA 3C83A 1QUDA 1L21A 3C80A 1L25A 145LA 1KNIA 3DN2A 185LA 1B6IA 2OTZX 1L03A 183LA 1L86A 119LA 1L16A 205LA 257LA 1T6HA 2RB1X 3HH5A 144LA 4W59A 1G0MA 224LA 4E97A 3DMXA 3NY8A 1L05A 157LA 3G3VA 1OWZA 2L78A 2B70A 1OV5A 111LA 1L81A 262LA 2OE7X 1T8FA 2B6ZA 1OWYA 206LA 5LZMA 230LA 170LA 2QARC 2O7AA 240LA 1QTVA 1QT8A 259LA 1DYFA 3HT9A 3HUKA 4W58A 3DMVA 1L51A 1CV4A 3SB8A 3C7YA 1L36A 3SB9A 1C6QA 138LA 3HT8A 235LA 4EJ4A 4I7OA 4LDOA 2O79A 1TLAA 3HTDA 1L01A 3HH3A 1D2YA 258LA 4EKRA 171LA 242LA 4I7MA 225LA 1KS3A 192LA 4I7SA 1L42A 1L24A 107LA 3NYAA 1LYFA 1LWGA 1QSQA 2RBNA 3JR6A 4PK0A 1L74A 4LDEA 1C6BA 177LA 3HT7A 156LA 164LA 236LA 1OYUA 2B6WA 1QT6A 1QT4A 181LA 1LGUA 2B72A 1QSBA 1L29A 2OE9X 1L02A 163LA 4YXAC 3DN1A 2RH1A 3SB6A 180LA 1DYDA 114LA 3HH4A 3L2XA 249LA 1OVJA 3VW7A 168LA 1L69A 1CVKA 1L61A 2B6TA 147LA 1C6AA 123LA 1L06A 3HDFA 3G3XA 3L64A 1G1VA 1L07A 226LA 2B74A 3HH6A 248LA 1L57A 1T97A 1L67A 1L82A 252LA 1C6CA 115LA 233LA 4ARLA 2A4TA 4ARMA 155LA 175LA 1T8AA 199LA 1L13A 2RBOA 1L44A 1LYEA 220LA 188LA 1PQJA 260LA 3C8SA 4EKQA 176LA 2LZMA 126LA 1D3MA 247LA 2IGCA 2Q9EA 3RUNA 1D3FA 214LA 1L73A 1L00A 1P56A 1D9WA 3CDTA 3GUKA 3GUMA 1L87A 1C6NA 4ARQB 149LA 1C6HA 2F2QA 3HTBA 2F32A 1L94A 250LA 1C6LA 1SSYA 2O4WA 1C64A 1L0JA 1WTHA 1P46A 3D4SA 131LA 1CUQA 1CV6A 216LA 1K28A 1QTDA 1L80A 1CV3A 1P2RA 1L77A 1LYGA 118LA 3DN8A 234LA 125LA 3HU9A 4OO9A 1XJUA 1L18A 215LA 238LA 4W53A 4I7KA 3SBBC 2RBQA 1CV0A 186LA 1G0GA 1LGWA 1G0JA 3GUPA 231LA 1L41A 3EMLA 4S0WA 108LA 1L58A 1QT7A 1P7SA 187LA 1L39A 1QS9A 211LA 1OVHA 3PBLA 209LA 166LA 2LCBA 1G0KA 128LA 4EKSA 152LA 3G3WA 139LA 1LWKA 1L89A 3V2YA 1L97A 3LZMA 1ZURA 3QAKA 4LDLA 1C6IA 2HULA 3OE8A 3F8VA 1L17A 3GUNA 1SX7A 1C6GA 2B7XA 1P2LA 221LA 3DKEX 212LA 3V2WA 110LA 254LA 162LA 1ZWNA 1G0QA 1L71A 1PQOA 1G07A 1CV5A 1L43A 1L52A 1L85A 2RBRA 4PJZA 178LA 1PQDA 1ZYTA 3F9LA 109LA 2OE4X 1L14A 1L12A 1JQUA 1L20A 1C61A 182LA 3CDVA 1L91A 1SWYA 1L75A 1L04A 2LC9A 4W51A 3OE6A 1L76A 129LA 1L22A 161LA 1XJTA 141LA 3K2RA 102LA 2RAZX 1C6JA 4I7NA 1C6MA 4I7QA 1P5CA 4EPFA 1L11A 4W55A 143LA 2OEAX 1L53A 1L96A 3RZEA 1DYAA 1LW9A 4I7RA 2OTYX 1L50A 1I6SA 1LYJA 4W56A 1P3NA 1LI3A 1EPYA 1L32A 218LA 1CV1A 1C69A 1L15A 1L64A 2RBSA 1C68A 1C6DA 1G1WA 246LA 4W54A 1DYCA 1L40A 1L93A 1QTZA 4GRVA 3SN6R 4YXCA 4GBRB 7LZMA 1C6PA 1G0LA 140LA 1LYHA 2NTHA 3HTFA 3OE9A 198LA 6LZMA 1C67A 3DN4A 1OV7A 3HTGA 3HUAA 217LA 4IAPA 1P64A 165LA 1CX7A 245LA 146LA 1C6FA 2B6YA 1L0KA 3C8RA 1CU0A 1QTBA 3DN3A 239LA 1L95A 2OU0X 1C6EA 3FI5A 1L23A 4ARQA 159LA 1L10A 4YX7C 2B73A 237LA 1L48A 228LA 3SBAA 1C66A 1QUGA 200LA 167LA 4DAJA 137LA 1SSWA 1JTMA 1C63A 4LZMA 151LA 201LA 3HT6A 1KW5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LSFA 1L56A 3GULA 2H9KA 1QUHA 190LA 5HNLA 3WPKA 2ANVA 1FN5A 1XGTC 193LA 1UIFA 4EPIA 241LA 1GF9A 1MELL 3DNAA 2G4QA 3TXBA 4ARPA 2DKVA 1QDRA 1OUFA 1L88A 1L31A 1JTPL 3GUIA 4OWAA 4MCKA 1IY4A 5KXRA 3ATOA 2I6ZA 5I4YA 1L26A 1JTNA 3SP3A 5J7CA 3B0KA 3TXFA 3FA0A 3AZ6A 148LE 1L38A 5E4PA 1JSEA 1HFYA 1ZMYL 1HSWA 2OU8A 1CKCA 1C6TA 1IY3A 1AKIA 1YKYX 5F14A 4HJVA 197LA 5F9UA 1QT5A 1IP4A 2XJWA 3C81A 189LA 4YF2A 1L08A 255LA 2HUMA 4J7VA 1BB6A 2HU1A 3P65A 1CNSA 5HLLA 2Z37A 1H6MA 5HMJA 4WLXA 3FADA 2MEBA 1QS5A 169LA 4AQNA 2Z6BA 4WM4A 4N8ZA 1IC4Y 1UA6Y 3QY4A 1YANA 2CJLA 4DD0A 184LA 1LJ4A 1CU6A 158LA 1Z55A 1IOSA 3SB7A 1PQKA 1CTWA 1L92A 3DN0A 3LN2A 1L83A 1GDXA 4NSIA 4HTNA 2D91A 1UIHA 5APEA 4I7LA 3C82A 1KXXA 4L41A 1L21A 5KXKA 1JISA 3WU9A 3C80A 3WULA 145LA 1KNIA 2XTHA 185LA 2FBBA 1HEPA 2DQDY 1SQ2L 1JJ1A 4E97A 1CJ7A 157LA 1OWZA 2Z39A 111LA 1T8FA 1OWYA 5LZMA 170LA 1INUA 2MEDA 2G4NA 1LJHA 1GB7A 1QT8A 1B7QA 4NG1A 3SB8A 3C7YA 1C6QA 3EMSA 3HT8A 4EJ4A 4LDOA 194LA 2O79A 4LYOA 4EKRA 5I4WA 242LA 4QDNA 3WMKA 192LA 4I7SA 4CJ2A 2Q0MX 1DQJC 1LHHA 2HEAA 1LWGA 1QSQA 2RBNA 1CKGA 2G4PA 1N4FA 3TXJA 2BQKA 1C6BA 1QDTA 1V7SA 4P2EA 156LA 3W6BA 1OYUA 3WPLA 4DD2A 2Z38A 1LGUA 1OUJA 3WUNA 4TX7A 2OE9X 3N9AA 1L02A 5L9JA 3DN1A 4YM8A 4GCFA 1C10A 3SB6A 180LA 5KXWA 114LA 3L2XA 4NGJA 3MGWA 1CVKA 4XADA 4DC4A 3IJUA 2B6TA 5LYZA 1BWIA 123LA 3HDFA 1KIPC 4OWCA 1C43A 1G1VA 5AMYA 4H9HA 1MLCE 1L82A 4ARLA 1RFPA 4I8SA 175LA 2RBOA 1L44A 220LA 1PQJA 5B1FA 1LMOA 1WVUA 2Q9EA 2IGCA 4XN6A 3G3BB 1HMLA 1L73A 1DZBX 3KAMA 4NFVA 4TSCA 1CJ8A 4MSTA 3N9CA 1CKFA 1KIQC 3HTBA 4FJRA 2F32A 5T3FA 1SSYA 5LIOA 2YVBA 1CV6A 5LVHA 1FKVA 1QTDA 1GE4A 1L80A 1EQ4A 3B6LA 1GFJA 234LA 3FI7A 3W6FA 3SBBC 1IWTA 2RBQA 1CV0A 1GF3A 1G0GA 4ML7A 4NSHA 2ZWBA 4S0WA 108LA 1P7SA 1L39A 3IJVA 1GE3A 1TCYA 1OVHA 2LCBA 1LYOA 3G3WA 3V2YA 2ZYCA 1C6IA 2WARA 4H8YA 4WO9A 2ZNXY 4LT1A 3CSQA 1C6GA 1JKDA 212LA 4KPMA 1ZWNA 2W1YA 4J0LA 3WW5A 4DD7A 4OWBA 3RT5X 1L52A 2YBIA 5ILFA 4PJZA 4ANRA 1WQPA 109LA 2OE4X 1JQUA 3CDVA 1L75A 1L04A 4WM5A 1HC0A 2LC9A 2N5ZA 3OE6A 1L76A 129LA 4NHSA 2F2NA 161LA 1LZDA 1XJTA 141LA 4EOFA 2EKSC 1T6VL 4I7NA 4BS7A 4ET8A 3W6CA 3CT5A 4W55A 143LA 4ETEA 3BKVA 1I6SA 1B2KA 5FHWA 1YAQA 1XEJA 218LA 1NKHA 1CV1A 2F4GA 1G7HC 1OUGA 4GRVA 1JJ3A 4WM3A 140LA 1LYSA 1LYHA 3FE0A 1YQVY 3OE9A 4YOPA 5KKJA 2BQHA 4H8ZA 4IAPA 1P64A 1CX7A 4PPOA 1QTKA 1GBSA 1L0KA 1QTBA 4TSBA 1REMA 1C6EA 2F30A 1LSMA 4XJHA 1L23A 4NY5A 4ARQA 4XJBA 2DBTA 1LSDA 2B73A 3T36A 1L48A 1REXA 2MEHA 1DI5A 1JTMA 151LA 1KW5A 2B6XA 4W57A 132LA 3AB6A 2OU9A 223LA 2RSCA 1C08C 1VFBC 4DD1A 3DMZA 1LJJA 1GB5A 2I26L 1CU5A 3TMVA 3A34A 4LT3A 1YL0X 3HDEA 1LZSA 1L33A 4M4OA 4CHXA 4Z46A 1L46A 160LA 2IHLA 1F10A 1V7TA 1L68A 4E3UA 229LA 1L65A 1C62A 1CUPA 1QTCA 4KXIA 1LI6A 3TXKA 1B5WA 133LA 1YL1X 3ULRA 4CFPA 1L63A 3D3DA 104LA 1LZ1A 1NHBA 4C5FA 113LA 1BB7A 1FDLY 1IR7A 4W52A 1QUSA 3ZEKA 2ZNWY 4H9IA 1LYZA 2MEGA 2LZTA 4WG1A 1LGXA 2FYCA 3M18B 196LA 1L09A 3SB5A 222LA 1LSNA 5IELA 150LA 1D0LA 1KIRC 1DYEA 2A7DA 1L59A 210LA 3C7ZA 4PJ2C 2F47A 4DD9A 1D3NA 3GUOA 4ETDA 1OP9B 1GFGA 2YBMA 130LA 122LA 3CSRA 4HJZA 1YKXX 1UIEA 3T6UA 2Q9DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1LSF A;  1L56 A;  3GUL A;  2H9K A;  1QUH A;  190L A;  5HNL A;  3WPK A;  2ANV A;  1FN5 A;  1XGT C;  193L A;  1UIF A;  4EPI A;  241L A;  1GF9 A;  1MEL L;  3DNA A;  2G4Q A;  3TXB A;  4ARP A;  2DKV A;  1QDR A;  1OUF A;  1L88 A;  1L31 A;  1JTP L;  3GUI A;  4OWA A;  4MCK A;  1IY4 A;  5KXR A;  3ATO A;  2I6Z A;  5I4Y A;  1L26 A;  1JTN A;  3SP3 A;  5J7C A;  3B0K A;  3TXF A;  3FA0 A;  3AZ6 A;  148L E;  1L38 A;  5E4P A;  1JSE A;  1HFY A;  1ZMY L;  1HSW A;  2OU8 A;  1CKC A;  1C6T A;  1IY3 A;  1AKI A;  1YKY X;  5F14 A;  4HJV A;  197L A;  5F9U A;  1QT5 A;  1IP4 A;  2XJW A;  3C81 A;  189L A;  4YF2 A;  1L08 A;  255L A;  2HUM A;  4J7V A;  1BB6 A;  2HU1 A;  3P65 A;  1CNS A;  5HLL A;  2Z37 A;  1H6M A;  5HMJ A;  4WLX A;  3FAD A;  2MEB A;  1QS5 A;  169L A;  4AQN A;  2Z6B A;  4WM4 A;  4N8Z A;  1IC4 Y;  1UA6 Y;  3QY4 A;  1YAN A;  2CJL A;  4DD0 A;  184L A;  1LJ4 A;  1CU6 A;  158L A;  1Z55 A;  1IOS A;  3SB7 A;  1PQK A;  1CTW A;  1L92 A;  3DN0 A;  3LN2 A;  1L83 A;  1GDX A;  4NSI A;  4HTN A;  2D91 A;  1UIH A;  5APE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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