1OWZA

T4 lysozyme cavity mutant l99a/m102q bound with 4-fluorophenethyl alcohol
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCAAINQVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme
publication title Testing a Flexible-receptor Docking Algorithm in a Model Binding Site
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2003-03-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1owzA00
1L44A 3OE0A 1QUGA 3G3XA 1PQIA 4ARJA 3PBLA 2IGCA 185LA 1L86A 1KY1A 3FA0A 1LYEA 211LA 2RBOA 1OV5A 1D2WA 1L69A 2OTZX 1L51A 1CV5A 2RBRA 4ARLA 176LA 244LA 3DN8A 187LA 1C6NA 249LA 2F47A 162LA 1G0GA 1PQKA 227LA 3UONA 166LA 1D3NA 164LA 1KNIA 4W59A 1C6GA 120LA 1LWGA 2Q9EA 188LA 127LA 1XJTA 4PK0A 167LA 1T8FA 2QB0B 3HU8A 2RAYX 1L03A 4I7SA 209LA 1LLHA 1P46A 1L67A 4YXAC 1QTZA 1CUQA 1P6YA 3HH5A 3DMZA 3HH4A 1L21A 4E97A 1L81A 177LA 118LA 3HT7A 2LCBA 1CV0A 1L23A 1L50A 1C67A 1QTDA 1L58A 1L20A 1SSWA 1G0LA 4LDOA 239LA 2OE7X 230LA 114LA 3EMLA 1LGWA 1QT8A 170LA 4K5YA 1G0QA 1L17A 252LA 2RBNA 1C6IA 1L85A 189LA 1C6AA 238LA 1C6JA 4W57A 1OVHA 3C82A 1L0KA 1G06A 2RB0X 1L52A 1L55A 3SBBC 3LZMA 1P2RA 1CUPA 112LA 1L27A 3D4SA 1L26A 119LA 2RBQA 184LA 1L18A 1L65A 1CTWA 1SX2A 3C7ZA 1CU0A 1CV4A 4AQNA 4I7MA 3SB8A 2B73A 1CX6A 4YX7C 1CX7A 110LA 1LI3A 2F32A 1LYIA 1P36A 3GUNA 1L01A 4ARQB 1L02A 3DN0A 2RAZX 4LZMA 1QS9A 129LA 1L96A 256LA 3DNAA 1L32A 180LA 3SB5A 1QUHA 7LZMA 240LA 3C8QA 1L91A 217LA 1D2YA 150LA 1L28A 1QTVA 1QTCA 1L10A 3HH6A 1L06A 1KS3A 1OWYA 2HUKA 1L34A 4I7JA 1QT5A 1CU6A 3C8RA 4DKLA 130LA 4I7TA 1L72A 3C7WA 1C60A 3DN2A 223LA 143LA 215LA 1C6CA 1CU5A 1CVKA 173LA 4W55A 4EKPA 3DN1A 3GUPA 228LA 4I7KA 2LC9A 1DYGA 1C6PA 139LA 4W56A 2OU8A 4ZPUA 1T97A 104LA 1L25A 1SWYA 159LA 1C6DA 231LA 1L53A 3DMXA 1C63A 3CDVA 198LA 1L16A 1L04A 1L82A 222LA 4GRVA 258LA 5I14A 172LA 3HTFA 1L54A 2CUUA 3GUJA 1DYEA 1QSBA 257LA 1KY0A 102LA 224LA 1L97A 4EKRA 248LA 4LDEA 1CV1A 3C8SA 1CU2A 178LA 1P64A 220LA 221LA 201LA 2O79A 1L79A 157LA 1D3JA 1G0KA 3SBAA 3GUIA 1L40A 1P56A 1L80A 1LWKA 2ANXA 1LPYA 1P3NA 1L89A 3RZEA 3GUKA 113LA 1OYUA 245LA 4I7LA 1T8GA 4I7NA 3C83A 1LYHA 2NTGA 4EKQA 259LA 1LW9A 141LA 181LA 4PJZA 169LA 3C7YA 2QARC 4ARPA 3HUKA 1ZWNA 4W52A 156LA 1EPYA 1G07A 1NHBA 237LA 152LA 3GUOA 1L31A 3V2WA 190LA 3HT6A 1OVKA 2LZMA 225LA 3NYAA 2RB1X 3HT9A 1PQDA 1L57A 3VW7A 2OU9A 1L60A 1L30A 191LA 213LA 1P5CA 1PQOA 4S0WA 226LA 1QSQA 1CV6A 192LA 3HUQA 128LA 182LA 1ZURA 1SSYA 216LA 174LA 123LA 1DYCA 218LA 3HDEA 1QUOA 1L63A 2B70A 3GUMA 235LA 146LA 1LGXA 1LYJA 3G3WA 160LA 3OE6A 3HTBA 1L07A 212LA 1L64A 199LA 1G1WA 1JQUA 4OO9A 3NY8A 4ARMA 3L64A 2B74A 3GULA 125LA 1SWZA 1KW7A 3HU9A 4ARQA 165LA 1L98A 2Z6BA 1L29A 1L19A 3DN6A 242LA 1QTHA 1P37A 1G1VA 205LA 1L94A 1C64A 1C6MA 4I7QA 1JTMA 1D9WA 1OWZA 1LYGA 1G0PA 1L66A 2RB2X 1C62A 4W51A 161LA 2O4WA 149LA 1L33A 148LE 1L43A 1L62A 243LA 2B6XA 3V2YA 144LA 1L12A 2RH1A 4W54A 260LA 1L48A 3L2XA 232LA 1QTBA 196LA 1L38A 219LA 2OE4X 1QT3A 1L42A 1SX7A 2OTYX 1C6TA 3HTDA 4I7OA 3PDSA 2B6YA 1P7SA 151LA 3CDQA 122LA 241LA 251LA 1KW5A 3QAKA 4DAJA 2B6WA 1L35A 1DYDA 1QS5A 175LA 3SB7A 1LI6A 1I6SA 108LA 210LA 2F2QA 4GBRB 1L49A 4YXCA 4EXMA 1OV7A 1L75A 197LA 234LA 2ANVA 1L46A 4W58A 1DYBA 1C65A 103LA 3SB9A 1C68A 1C66A 1K28A 195LA 1XEPA 261LA 2B6TA 1B6IA 2L78A 1C6HA 1QT4A 2RBSA 3F8VA 1L74A 250LA 3CDTA 3NY9A 1L61A 1TLAA 1PQJA 200LA 1L83A 140LA 2B6ZA 1P2LA 111LA 233LA 137LA 1PQMA 1LYFA 1XJUA 168LA 2Q9DA 2HULA 3ODUA 3DKEX 1L45A 6LZMA 163LA 1L11A 3HTGA 1L24A 3DMVA 1L0JA 1C6FA 1L09A 2B7XA 3HDFA 3F9LA 254LA 2HUMA 126LA 1C69A 4I7RA 145LA 138LA 1JTNA 1L37A 1WTHA 1DYFA 158LA 1L87A 3C80A 1ZYTA 1L41A 1DYAA 171LA 142LA 3HUAA 3HWLA 4EKSA 2B72A 2B75A 2A4TA 155LA 3FI5A 3SN6R 1L73A 2OE9X 255LA 1L70A 2OEAX 3HH3A 1C6EA 1QT6A 214LA 2RBPA 4EPIA 3OE9A 3OE8A 4EJ4A 1L77A 246LA 206LA 4IAPA 1L68A 1L88A 2NTHA 247LA 1T8AA 1C6BA 3SB6A 253LA 3DN4A 5LZMA 109LA 1L92A 4W53A 236LA 1G0MA 1L14A 1L56A 1L99A 4EPFA 115LA 4ARMB 1L36A 1L22A 1L95A 1G0JA 1C6LA 3DN3A 3RUNA 1L00A 1L59A 1L08A 4I7PA 1QUDA 262LA 1T6HA 3C81A 107LA 1C6QA 1LYDA 1CV3A 2O7AA 183LA 147LA 3G3VA 1L13A 3CDRA 1L15A 3HT8A 1LI2A 1L84A 1L90A 3FADA 1D3MA 4DJHA 131LA 3JR6A 1L47A 3CDOA 2OU0X 1QT7A 1D3FA 1OVJA 1C61A 1L05A 4LDLA 1L93A 229LA 1LGUA 1L76A 1CU3A 186LA 1L39A 1L71A 1C6KA 3K2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L44A 3OE0A 1QUGA 3PBLA 2EKSC 4WLXA 3FA0A 3WUAA 3CQLA 1HEQA 1OV5A 5LXWA 1JISA 1L69A 2D6BA 4DDAA 153LA 176LA 1V7TA 1UA6Y 2PC2A 2W1LA 120LA 1JKDA 3WPJA 1DI3A 2Z12A 167LA 3HU8A 1CJ9A 6LYZA 1WQMA 5K7OA 1L67A 5L9JA 1QTZA 1GFTA 4GLVA 4G4HA 4H1PA 3HT7A 1CV0A 1L50A 1GAZA 1L20A 2F4AA 1T3PA 230LA 3CSQA 1LGWA 2ZNXY 3TXJA 3WMKA 2IHLA 9LYZA 2RBNA 3A6BY 1ZVYB 1CJ7A 4WL7A 1OUCA 4W57A 4H8YA 4J0LA 4NWHA 2RB0X 4TSCA 1JUGA 1W08A 1P2RA 2ZILA 5IHGA 3C7ZA 1GF3A 2B73A 4G49A 3HFMY 3P68A 2F32A 1LYIA 1P36A 1L01A 1KXXA 2IFFY 3AW6A 1WVUA 4DWXA 3N9AA 3AGIA 5KJ9A 3SB5A 1C45A 240LA 3C8QA 1KIPC 3HH6A 3LHMA 1KS3A 1OWYA 1GE0A 1LJIA 1AZFA 2HUKA 3CT1A 1G7HC 1NDMC 4B0DA 1A2YC 3AZ4A 4H94A 3C8RA 1HFXA 1OUGA 1CKCA 3DN2A 2BPUA 2LYZA 1YAOA 5LVKA 3GUPA 3IJUA 4I7KA 3TXHA 1KIRC 4R6CA 1VFBC 4NSJA 4ZPUA 1LZRA 1T97A 2W1XA 104LA 1EL1A 1TEWA 4PPOA 1C6DA 1L53A 1LZ6A 3AJNA 2D4KA 1GBZA 1W6ZA 1GAYA 1HERA 2FBDA 3G3BB 1L82A 258LA 5I14A 2NWDX 3HTFA 2CUUA 4B4JA 1D0KA 5KXTA 1L97A 5D5CA 4EKRA 3A34A 3EXDA 178LA 221LA 201LA 1L79A 1D3JA 1D6QA 4NSGA 2ANXA 2BLYA 1L89A 3GUKA 5I5QA 4I7LA 245LA 1LOZA 1JJ3A 1UUZC 1LSNA 3CSZA 4LT3A 4DD7A 1BWJA 2NTGA 4QY9A 1LJ4A 1UIFA 169LA 2HEDA 4C5FA 4ARPA 1NF5A 156LA 1AM7A 1EPYA 1G07A 4GCCA 5KXZA 1LJHA 3A95A 1GPQC 3GUOA 2LYMA 1GDWA 2RB1X 1L57A 5KKJA 4XADA 1IX0A 2Z38A 1L30A 191LA 1LZSA 5DL9A 1H87A 3TMWA 3HUQA 216LA 123LA 5LAFA 1IP1A 4UWUA 3HTBA 1L07A 199LA 1SWZA 2LZ2A 1KW7A 4ARQA 1IWTA 1L98A 4LYBA 1QTHA 1I56A 4BS7A 5APDA 1GF7A 4NG1A 154LA 1QIOA 2RB2X 2A7DA 4W51A 161LA 1LMTA 4R0FA 2DBTA 1BB5A 1L12A 1OQMA 5LINA 196LA 219LA 2N5ZA 1SX7A 4DQ5A 5HQ1A 1Z55A 3EO5A 3QAKA 2B6WA 175LA 1LI6A 2BQMA 1HMLA 4H9CA 1IP3A 1LSGA 1C65A 1WTMA 1XGQC 1C68A 3F8VA 3NY9A 250LA 4LYZA 1IWZA 2YBMA 140LA 5KXMA 2B6ZA 1GEZA 2H5ZA 111LA 3CT5A 1JSEA 1PQMA 1B5UA 4DYGA 1SLYA 1L45A 1NDGC 6LZMA 1L11A 3TMUA 3AGGG 4W94A 1HEMA 2HUMA 5FSTA 1BHZA 1C69A 1CKHA 1G7LC 1JTNA 1WTHA 4HJYA 158LA 1HEWA 1L41A 142LA 5LYTA 2C8PA 155LA 1L73A 1UIDA 2BQFA 2WARA 3HH3A 2XBSA 1LZGA 1ZMYL 1C6EA 1QT6A 4EPIA 3OE9A 5I4XA 1L77A 5KY1A 3CB7A 4IAPA 1HHLA 4HPEA 1L88A 1LJFA 247LA 3SB6A 2EPEA 1IWWA 3LZTA 253LA 5LZMA 109LA 1L92A 4QEQA 1GBOA 4BAPA 1L22A 1LSBA 3DN3A 1L59A 4MR1A 3C81A 4ZIXA 2HEAA 1C6QA 1GE3A 1L13A 3CDRA 2G4PA 1L84A 1L90A 3FADA 1OUBA 1HNLA 3CDOA 5AMYA 4H9BA 1LGUA 1KXYA 5F9UA 4NGIA 4E3UA 1LTMA 186LA 5FDJA 3K2RA 1C10A 3G3XA 3BKHA 4UWNA 4YM8A 1TDYA 211LA 2RBOA 4EMNA 5IELA 1D2WA 2OTZX 1CV5A 2RBRA 5HNCA 3M18B 1JWRA 3DN8A 4XENA 1LSZA 2F47A 162LA 1TBYA 1G0GA 1VDSA 6LYTA 1D3NA 2F2NA 1KNIA 4W59A 4MSTA 1C6GA 1GBXA 1GE2A 1LWGA 1XGUC 2Q9EA 1T8FA 2QB0B 5APCA 2LHMA 3RZ4A 1LLHA 4YXAC 1P6YA 5HLLA 1YANA 2HEEA 3DMZA 3HH4A 1L21A 2BQBA 3RNXA 1WQQA 4ANRA 4LT2A 1OUHA 1L58A 3WUNA 1SSWA 4WLDA 4G4CA 2CDSA 1BB4A 5KKIA 1WQOA 4CFOA 133LA 1GFUA 3FE0A 4NGVA 1L17A 252LA 1IY4A 238LA 1C6JA 2ZQ3A 5KXOA 5LVIA 2XBRA 1VAUA 3LZMA 4WLYA 3D4SA 1L26A 4DD2A 3J6KA 2RBQA 1SX2A 3ZVQB 1CU0A 3SB8A 1CX6A 4YX7C 1CKDA 1CX7A 4XJHA 3GUNA 1L02A 2RAZX 4LZMA 4ETAA 4LYCA 2EIZC 2FYDA 5L3IA 1VDPA 4KL7A 4L41A 180LA 1AKIA 1YKXX 207LA 217LA 1JKAA 1D2YA 150LA 5KXNA 1L10A 2MEAA 5I4WA 1G7MC 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2OE4X 1QT3A 1L42A 2OTYX 3PDSA 2B6YA 1IY3A 1P7SA 2Q0MX 151LA 2YDGA 4PRUA 251LA 4P2EA 4DAJA 1LSPA 8LYZA 1OUDA 1QS5A 2HECA 1I6SA 2F2QA 4TUNA 4GBRB 5I53A 1IC5Y 197LA 1BB3A 1LKSA 1DYBA 103LA 1I20A 2D91A 1K28A 1XEPA 2RBSA 261LA 2Z37A 1B5WA 5F16A 1C6HA 4I7OA 1L74A 4B1AA 1L61A 1TLAA 3A3QA 4WL6A 4DT3A 4DD1A 3G3AB 2Y8PA 137LA 4KPMA 4WMGA 1LYFA 1XJUA 4NG8A 3LYTA 3P4ZA 1MELL 2Q9DA 3DKEX 1GB6A 3AZ5A 3HTGA 3DMVA 5KXXA 1L0JA 1C6FA 1HFZA 1L09A 3HDFA 3VWOA 4ZFPA 3ATOA 3QE8A 126LA 4GN4A 1JITA 1FLQA 4DD9A 3B72A 145LA 194LA 138LA 4OWCA 1L37A 1B7NA 3A92A 171LA 1WQNA 3HWLA 4EKSA 2B72A 3SN6R 2AUBA 2OE9X 4H91A 1BB6A 1LSEA 3B0IA 4H9IA 1L70A 3FI7A 3IJVA 4TX7A 2RBPA 214LA 3OE8A 4EJ4A 3WL2A 206LA 5B06A 4NGOA 5KXKA 2MECA 2MEHA 1UICA 1LPIA 1HMKA 1LSFA 236LA 1G0MA 1B5XA 1L14A 1LZ9A 1JJ1A 1NHEA 115LA 1HEPA 3A8ZA 5FELA 1RJCB 1QUDA 3A94A 2BLXA 2O7AA 1L15A 4IATA 1DPWA 4LFXA 1D3MA 2HUBA 5KXYA 3RU5A 2OU0X 4O34A 5LA5A 5D5FA 2DQHY 3LN2A 4ML7A 2DQFC 2GV0A 2H9KA 1G7IC 1L76A 1L39A 3WU9A 1L71A 1C6KA 4BADA 4ARJA 5JENB 185LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L44 A;  3OE0 A;  1QUG A;  3PBL A;  2EKS C;  4WLX A;  3FA0 A;  3WUA A;  3CQL A;  1HEQ A;  1OV5 A;  5LXW A;  1JIS A;  1L69 A;  2D6B A;  4DDA A;  153L A;  176L A;  1V7T A;  1UA6 Y;  2PC2 A;  2W1L A;  120L A;  1JKD A;  3WPJ A;  1DI3 A;  2Z12 A;  167L A;  3HU8 A;  1CJ9 A;  6LYZ A;  1WQM A;  5K7O A;  1L67 A;  5L9J A;  1QTZ A;  1GFT A;  4GLV A;  4G4H A;  4H1P A;  3HT7 A;  1CV0 A;  1L50 A;  1GAZ A;  1L20 A;  2F4A A;  1T3P A;  230L A;  3CSQ A;  1LGW A;  2ZNX Y;  3TXJ A;  3WMK A;  2IHL A;  9LYZ A;  2RBN A;  3A6B Y;  1ZVY B;  1CJ7 A;  4WL7 A;  1OUC A;  4W57 A;  4H8Y A;  4J0L A;  4NWH A;  2RB0 X;  4TSC A;  1JUG A;  1W08 A;  1P2R A;  2ZIL A;  5IHG A;  3C7Z A;  1GF3 A;  2B73 A;  4G49 A;  3HFM Y;  3P68 A;  2F32 A;  1LYI A;  1P36 A;  1L01 A;  1KXX A;  2IFF Y;  3AW6 A;  1WVU A;  4DWX A;  3N9A A;  3AGI A;  5KJ9 A;  3SB5 A;  1C45 A;  240L A;  3C8Q A;  1KIP C;  3HH6 A;  3LHM A;  1KS3 A;  1OWY A;  1GE0 A;  1LJI A;  1AZF A;  2HUK A;  3CT1 A;  1G7H C;  1NDM C;  4B0D A;  1A2Y C;  3AZ4 A;  4H94 A;  3C8R A;  1HFX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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