1P1OA

Crystal structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) mutant l650t in complex with quisqualate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 87
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1oA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1oA01
2PMSA 3VXCA 1FQAA 5DEXA 4MF3A 4TOZA 4U4SA 3IJXB 4I9DA 1ZLQA 2IEEA 1Y9UA 1GTKA 2F34A 1IXIA 2QS3A 4KCDA 4C1TA 4ESXA 3H6UA 2H4IA 4DXUA 4F2OA 4X9TA 2M8CA 3CSBA 2F7CA 3BFUA 3W9WA 2VD3A 2X7PA 1H76A 1JVYA 4O3CA 4EQ9A 4G2ZA 2Q8JA 3IOVA 2HCAA 4GL8A 3MP8A 4LUBA 4Z7EA 4BDOA 4FATA 3SEXA 4U22A 2DP8A 1A40A 3L6HA 1JEUA 4OYVA 2O7IA 5L9MA 3H06B 4RPOA 1SD3A 1B46A 1MXUA 5I59B 4R9GA 4XKPA 1B52A 4QSEA 2DS9A 4H6DA 2XXQA 3B7DA 2DVCA 4GQOA 2F6PA 4YKKA 2XXIA 4WXJA 1QUIA 4I8CA 3K01A 4QFNA 5H8HB 2ANJA 3ECRA 3LSFB 4GOTA 4IY6A 1EH3A 3DP8A 3EHSA 1B05A 3TFLA 4LQ5A 1AMFA 4FEBA 4BLAA 2E0SA 3CFXA 4HTGA 3TTNA 1IZ1A 2HZKA 1B1HA 3E9XA 4X1BA 4F1UA 1PB8A 2ZYOA 3OO6A 5ITPA 2HFBA 4ZEDA 2V84A 4L17A 4PQJA 1IQ7A 3FASA 1OIBA 3GZGA 1MQHA 5CBRA 4RYAA 3N6UA 4LA9A 1B40A 4TQUQ 1SQYA 3MZ1A 1B6HA 2OWSA 4MLVA 3FATA 2RCBA 3CR9A 4ELQA 5L8DA 3S4UA 1B51A 5I2NA 5I2KB 1JW5A 1IXGA 1IUDA 2RCAA 5BWJA 3RTFB 1R6ZA 4KI0E 3G7WA 5I56B 3U1OA 2GHAA 3R6UA 3HN0A 3UIFA 1VE4A 2DE2A 4DZ1A 1Y20A 4QHQA 3O97A 2VGQA 4NF8A 5KZTA 4LP2B 1NFTA 2QSXA 2Q88A 3T9UA 1DPEA 4H5GA 1A8FA 5JK4A 3EPEA 3P7IA 4NWDA 3VFJA 4GWOA 2F7AA 4EUOA 1H3DA 1N7XA 1DPPA 1UTBA 1B3EA 3OO9A 1PDAA 2OCUA 1OVTA 3HSTA 3E4RA 3K6UA 1DOTA 3LC8A 4E0XA 1MXYA 4ZEFA 3IL1B 3TUSA 2DWIA 1GVCA 5IKBA 1YCJA 3FJMA 2O6AA 4FE8A 1SYHA 3OXNA 1SI0A 3T9VA 1ELJA 2OWTA 2ZYMA 1JQFA 1Y3PA 3TCFA 1MQDA 1RYXA 4QFLA 3RT8A 1DTGA 2D5WA 3GLBA 3C31A 3FJ7A 3KFMA 4FECA 1FTKA 4Q8RA 5CC2A 1I6AA 5KCJA 4POWA 4F22A 3VVEA 5H8FA 4XTCQ 4R6HA 1JVXA 3LR1A 3IJOB 2OLBA 3OMBA 1VR5A 2DWHA 1KWHA 2Y7WA 4OXVA 5JTYB 5H8QA 4ZECA 1Y3QA 2REGA 3PUXE 2I3VA 3U92A 2XX9A 1R1NA 2O68A 3CIJA 5EHMA 1B5IA 1SW4A 2Y84A 3MW0A 2UYEA 2Y7IA 4NF5A 2DE4A 4IO3A 1LAXA 4NF6A 1FTJA 1IIWA 4ZZAA 3VE1B 3KJ7A 4OENA 4JB7A 2PT2A 3ILTB 1WVJA 4RY1A 2F7BA 5AA1A 1POY1 1MXWA 3HPIA 3U94A 2I49A 3JZJA 4R2BA 2ZNTA 4P11A 3IB1A 5EYFA 3EQ1A 5FTHA 3H3GA 1CE2A 2B65A 5KDTB 1OQGA 1VSOA 3RY3A 1H43A 4H5FA 3PPRA 1AOVA 2F5XA 3N6TA 4YB6A 3MWBA 1GV8A 1RYOA 5I58B 4IO6A 3HV1A 2H5YA 1MH4A 4YZZA 1P99A 3G3HA 4XIGQ 3M3LA 4G8NA 3OO7A 3KBRA 4GXSB 2XXXA 4H1XA 1PBPA 1NL5A 2UVJA 1N0TA 3KZGA 5AA2A 1BIYA 2ZYKA 1XVYA 3K4UA 2OJTA 3ZKKA 3Q28A 2HXWA 4F29A 4F1VA 3RQTA 4OZ9A 3B6TA 3S9EA 5DTBA 5A5XA 1URDA 3Q27A 3K6XA 4R73A 3MP1A 1A54A 4KD5A 1NH8A 2R9JA 3VVFA 5F1QA 4R75A 3VXBA 3UGWA 4OERA 4THIA 3VVDA 3V8XB 3OD7A 3W9VA 1QUKA 5ISUA 4G8HA 4F2QA 3FUZA 3AXFA 3MVXA 1XC1A 4KYDA 5AA4A 1JW1A 1I6QA 3CI8A 1MG1A 2Z8EA 4XKRA 4ELRA 2DQVA 3FZVA 3HO7A 4PE5B 1USYH 3BFTA 2GH9A 3PD8A 5FTIA 4EDPA 3L6GA 4YB7A 3QSLA 4EXLA 2ESNA 1LGBC 1FCKA 4IO2A 1B3HA 2AYSA 1Y3NA 4GXAA 5I57A 4OVJA 1MM6A 2I6EA 1LBBA 5CBSA 3USDA 4DCXA 1ZTYA 4EF1A 3S9NC 2VOZA 3KOSA 2Q9TA 4DDDA 2DWJA 2O1MA 3QIMA 1QULA 3PMVA 1M5FA 2ZNSA 5TP9B 1TWYA 5CM6A 4LONB 1MY1A 3MBPA 5HPQA 5ICTA 2RF1A 3EHTA 4R74A 3EHUA 1ZMGA 1LCTA 4U21A 1UTHB 1EZPA 4M1VA 3TPAA 5H8NB 1MDQA 3FIRA 1M5DA 2KLFA 1GR2A 4G68A 4ONYA 2QS1A 3UK4A 3ONMA 4NEDA 1I69A 1FW0A 5DYHA 1JEVA 5L9OA 2P2AA 5ICQA 3RT6B 4YMBA 1LAHE 4DIGA 4FIMA 1CB6A 2V3TA 3LUYA 4RA1A 4KHZE 3TTLA 3QUFA 2PX1A 3FVOA 4MH5A 3TTKA 3PMXA 1FTOA 2PBWA 3OELA 3TCHA 4YKIA 4IB2A 3R26A 3MJNA 4KCCA 1JNFA 3HHGA 2A5SA 4DXCA 2AL5A 2VP1A 1FTMA 2RKMA 2O7UA 4GRKA 1M5EA 5L9SA 2CZLA 4IO5A 1LFGA 4PFTA 4BDMA 1R9LA 3V5AA 4ESWA 3DELB 4M4GA 1N84A 4EQ7A 1PBQA 1XS5A 1WODA 3GBBA 1P1WA 4IO4A 3V89B 2PVUA 1AL3A 3C36A 2X26A 5F7VA 2XXVA 2YLNA 3MQ9A 5H8QB 5CMKA 3CSGA 4BDRA 3TCGA 1N3WA 1SW1A 1LFHA 4NTLA 1FQDA 3N5LA 2GRVA 4FEDA 1MS7A 3QUJA 3WAEA 1SW5A 1M5BA 1OMPA 4NF5B 4ZEBA 1IXHA 4P0IA 3ZSFA 1YPNA 2UXAA 3T93B 3E13X 1B0LA 4DCYA 2H98A 3VLWA 1YAEA 1B9JA 3G3IA 1LAGE 3C35A 1NNFA 4R9FA 1PB9A 4H8IA 4PETA 5DVFA 2FA7A 2WKYA 4OETA 2OK2A 2B3FA 4F1YA 1B3FA 3ZKLA 5LOMA 3HCQA 5TPAB 2XXWA 1MDP1 1B4HA 3OO8A 1PC3A 1T0KA 5CRYA 4ELOA 4G4PA 3SESA 1L5TA 3N94A 4XKNA 3S2VA 1B7ZA 4KPTA 3T66A 5I59A 1SYIA 5HM4B 3DLNA 4F19A 2B3BA 1B5HA 2VD2A 4ELPA 2F97A 4JXIA 4F18A 5AA3A 1OLCA 2YJPA 4JWYA 2FNCA 1A8EA 4JWXA 3T9XB 4G68C 2R6GE 1P1UA 2QRYA 5H8HA 1O63A 4FJPA 3S9LC 1QKAA 2A5TB 3I6VA 2DVZA 3R7XA 3K2DA 1R9QA 1B32A 1UQWA 2O1LA 3MVYA 3IB0A 4ZZEA 4AB5A 1Y4CA 3D4CA 1MPBA 3BKIB 3VLUA 2GHBA 3SDFA 4HW8A 1HSJA 2NOOA 4RK2A 5CI5A 1I6BA 3OENA 4PFYA 2NXOA 3O66A 1LAFE 1EZOA 2Z23A 1LCFA 2HEUA 3TDJA 3TYHA 3OOAA 2DXRA 4RPNA 3B6QA 3V83A 1Z7ME 5FHMA 3O28A 3TEPA 1FQEA 3DP6A 5I2KA 3B6WA 5H8SA 1MY4A 1AH5A 3EN3A 5I57B 3ODBA 4Q5TA 4PFWA 1J1NA 1BLFA 2QS2A 1TT1A 1GGGA 2DE3A 3K6WA 1O7TA 5I56A 1D9VA 1PB7A 1MPCA 3PV0E 5DEXB 1SVXB 2RC9A 3MC2A 4ZDMA 3N26A 1MQJA 3HHFA 4X48A 3IO6A 4YU0A 3KGCA 3F11A 3H6WA 1Z7NE 1B7HA 4LZ5A 4UACA 3KG2A 4ZEKA 4P0GA 1URGA 1DSNA 1B2HA 3C32A 3JYRA 3A3CA 3MVWA 3UORA 3IAZA 4WEDA 1Y1MA 3UA8A 4ZE8A 1DMBA 1QVSA 2PT1A 3GBAA 1Y1ZA 5AA2D 1EU8A 1USYE 4K3FA 3PUVE 4MBPA 2Q89A 2AIXA 3T22A 2ALUA 3PMWA 1QKBA 2X7QA 3KN8A 4H0WA 3O9PA 1S50A 5JEIA 1LFIA 2HAUA 2QS4A 3TKDA 1D9YA 5TU0A 1ZIUA 2G93A 1A7LA 4YAHX 1Q35A 4F3SA 1M5CA 5IAIA 3KSXA 2DYXA 2XD3A 2QJEA 4BDNA 4GVOA 3K02A 2O51A 5EHSA 3O2AA 1XHYA 3K00A 3E3KA 4UA8A 2RC7A 2ONSA 4LZ8A 4C0RA 5JTYA 4QFOA 1MY0A 1NNKA 3K0VA 4HS7A 4IGRA 1O64A 4U1OA 3OEKA 3I3VA 4YMAA 4MLQA 3SKPA 1VFDA 3KSJA 4F39A 2IA4A 4EQBA 4LVQA 3KEIA 2DWAA 1IXCA 4ZEIA 4LZ7A 3H6VA 3MAMA 3RGYA 3PPOA 2FYIA 2I0CA 3U93A 5B7DA 4JSDA 4OFOA 4Q0CA 1B3LA 2DSFA 4I62A 2NUVA 1FQBA 4YKJA 3SEWA 2Y7PA 3T9HB 4X1DA 1ZBMA 3CG1A 1URSA 3TELA 4IO7A 1B0HA 1B4ZA 3QYTA 2RINA 3PPNA 2Y7RA 3LSLA 1H45A 4F3GA 4KQPA 2ONRA 4YICA 1JETA 1UIUA 3SEVA 3PUZE 4OESA 5I2NB 1POTA 4POXA 2Z8FA 5KDTA 2XXPA 4G77A 1XVXA 2I58A 2QL3A 1A55A 2XXYA 5K2XA 3MZBA 5DVJA 2I48A 4RXLA 1UIVA 5I58A 1S7YA 2R71A 2XXHA 4NF8B 2ZXTA 4R6YA 1BP5A 3RUMA 1TXFA 4OFJA 1ANFA 3CFZA 2P1SA 2D3IA 2O84X 1ZU0A 3TMGA 1N7WA 2I3WA 2I4CA 4GFRA 5CMBA 3UN6A 2UVIA 1UTBB 4U2RA 2QMWA 3IR1A 2F35A 3LSWA 2REJA 2ZYNA 2OZZA 5DVIA 5CMCA 3IO4A 3FV1A 1FTLA 3BBRA 4H67A 3Q26A 4KR5A 5ELVA 3U72A 4YKPA 3FVGA 3ILUB 3I5OA 3C33A 4DXBA 3K1NA 1A99A 4JWOA 4OHNA 2AL4A 4GLIA 4ZS9A 4IGTA 3H03A 3IX1A 4RK9A 2BJJX 4F3PA 3C34A 3TTRA 4JDFA 1XOCA 4LQ2A 3VLVA 1SDXA 4NF4A 3SEUA 4FAJA 2ZMBA 5KCJB 1LSTA 3FJGA 4QFPA 3O29A 4JBZA 2V25A 5H8FB 3PPPA 2XX8A 3KOTA 3G3KA 3JV9A 1P1NA 1MM7A 2V93A 1Y4TA 3O6IA 4GIZA 5J1DA 2YPNA 4Z0IA 2VHAA 4PFUA 1NNPA 1TFAA 3A3UA 2XD2A 3TQWA 3CFLA 4AB6A 2HZLA 4E0WA 1OLAA 2Z22A 3VV5A 3OSRA 1MQGA 4MFIA 1B1XA 4NF6B 4KYEA 1LB8A 4OTEA 4Q30B 1MY3A 1D4NA 1HSLA 3K1PA 3VDFA 3QAXA 3ZS6A 4N6PA 1N3XA 3G3GA 4OMBA 2I0BA 5TP9A 3M8UA 4XXUA 3RNNA 4QRZA 2QMXA 3GXAA 1QUJA 4U23A 2XX7A 3PUYE 1BTJA 4BDQA 3SETA 3RN8A 1JW4A 1UTHA 3TQLA 3CRBA 3G3JA 2CMOA 5H8NA 1NNTA 1NMUA 2DOJA 5FHOA 3CG3A 3K6VA 3U8QA 4R2FA 2UYFA 4RJZA 2F8DA 1F9BA 4F31B 1RKMA 5M2VA 2QPQA 2UVHA 3RTWB 2THIA 3OSQA 1SI1A 3H7MA 2O69A 5CMMA 3TTMA 2E1SA 3IOWA 1H44A 1MRPA 1ZKBA 2XXRA 1EZ9A 2F78A 1MY2A 3FD3A 4ZE9A 5I84A 4YB5A 5AA2B 1OVBA 3A09A 1ZJLA 5BUUA 2PYYA 1WDNA 4NMYA 4QSCA 3SEYA 4HCWA 4JSOA 1P1OA 1QW0A 4ISUA 4ND9A 4KYSA 3G3FA 5A5XB 2Y7KA 3KJTA 3FXQA 1VFEA 2HAVA 2DXYA 4U1ZA 2H9BA 2UVGA 4G8MA 3S9MC 2F36A 4AQ4A 3IK6B 4QSDA 3M3KA 1DTZA 2NVUB 1HSEA 2D21A 1ATGA 3H6TA 5AA4B 3MPKA 4F3BA 4H65A 4TLLB 2P0SA 1MXVA 2Q2AA 4EXKA 3FVNA 4QFKA 4KFQA 3TZAA 4OFLA 4WEPA 3FV2A 3KN7A 4H8JA 1US5A 1NH7A 4R72A 4ECFA 3PD9A 3KN3A 4DE8A 4OWDA 4NE4A 3EF7A 3MVZA 1B58A 3DM0A 3T96B 3FVKA 1N04A 3THIA 3K1MA 3SERA 3RPWA 1QJMA 3DP4A 2Z8DA 3FGSA 1PEBA 4PP0A 4I1DA 3IB2A 5B70A 2GFEA 2ZNUA 2XXUA 3Q29A 1AIVA 4O3AA 1LB9A 3O6HA 1D3KA 1US4A 4BDLA 5TPAA 3MUQA 3PU5A 3FXUA 2V3UA 3TAJA 3PUWE 3W15C 4U4XA 1FQCA 3UP9A 2H25A 1OQHA 4TLMB 2Q2CA 2OBGA 2XXTA 3C4MA 2F6GA 1TFDA 1NKXA 4G68B 3LSXA 2XHDA 1IITA 1XT8A 3QXMA 3PGFA 4R6KA 4IY5A 4O3BA 1LLSA 3QK6A 5HBCA 1IEJA 1Q1KA 1II5A 2HQ0A 4N07A 3H4ZA 3MZ9A 3MPLA 4GF8A 4LATA 5DT6A 2V3QA 4OEUA 1S9TA 3IOTA 1FQFA 2A5TA 2G29A 4DLDA 1B5JA 5K2YA 4HCYA 1B3GA 2H99A 3D4GA 5ITOA 5FHNA 4N13A 2ABHA 4OQOA 1P1QA 4NWCA 4RNSA 2LAOA 3TODA 1BKAA 1MQIA 5AE4A 1SBPA 2W7YA 1N76A 2I4BA 4QF9A 3LBSA 3C9HA 4NF4B 3WAFA 3IOUA 4GL0A 3RLFE 2RC8A 4XKQA 1MXZA 3Q25A 3FXRA 4WKMA 3CVGA 3MP6A 4GD5A 4C1UA 3OEMA 1YTVA 1MXXA 1MPDA 3M3FA 1B7UA 1MH3A 3PPQA 4OEVA 3O6GA 2NWJA 1LBCA 4FORA 3IORA 1SW2A 2ONKE 4EF2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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