1P1OA

Crystal structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) mutant l650t in complex with quisqualate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 87
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1oA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1oA01
3O9PA 3S2VA 2XX7A 1DTGA 3Q29A 4ZECA 4OEUA 3CG1A 5HPQA 1DPEA 2RC9A 1OLAA 4JXIA 2Z8EA 4G8NA 4YZZA 3EHUA 4LONB 3K6VA 5KDTA 3TUSA 4KCCA 1MY4A 1SVXB 4DZ1A 2ZYMA 4XKPA 1UIVA 3CR9A 3PD8A 2GRVA 3G3GA 5FHNA 3FIRA 3RQTA 4RY1A 3IAZA 1TFAA 4MF3A 1PDAA 2QJEA 4KYSA 4FEBA 1MXYA 3CSBA 3TCFA 4BDMA 1O63A 3GBBA 2Q2CA 1LB9A 3I5OA 1JETA 3M8UA 4ZZAA 1S9TA 1TT1A 4YB5A 5H8QA 4EF2A 4GQOA 4ESWA 3ECRA 3N6TA 1I69A 4H1XA 3OO8A 5ITOA 2R6GE 1YTVA 1WODA 1M5CA 3H6TA 1UIUA 4YICA 3M3FA 2RINA 4IY6A 4OMBA 2NUVA 1A99A 1MH3A 1A7LA 4I8CA 2HAUA 3TCHA 4DXCA 2DWHA 4POXA 2O51A 1QW0A 3KOSA 1SW4A 1P1QA 1B0HA 1Z7NE 2XXYA 1ELJA 1MXUA 1POTA 4WXJA 4IO5A 4F3SA 5ICQA 4JWOA 2UVHA 2X7QA 3K1PA 4JB7A 2O1LA 4QSCA 1IIWA 3RY3A 1DMBA 3T9VA 4H0WA 3H6UA 1B52A 3IJXB 1I6AA 2G93A 5I2KB 2UYEA 3IO6A 1B5JA 4ZE9A 1Y4TA 5H8HB 4JSOA 3KJ7A 2DQVA 4GD5A 2XXQA 1ZKBA 3TQWA 3OENA 1LBBA 2YPNA 3H03A 1M5DA 2ALUA 3Q28A 4H8IA 2FNCA 4LZ7A 1N3WA 4RYAA 3PPNA 3PUXE 5IAIA 1OLCA 3RT8A 5BWJA 3C34A 5H8SA 2I0BA 5H8FB 1CE2A 1EU8A 1FQBA 4JWXA 3QYTA 2VOZA 3BFUA 1LFGA 4GF8A 3O6HA 4IO4A 1J1NA 5I59B 3EHTA 2FA7A 4MFIA 4TLLB 3GZGA 4OFOA 3WAFA 4OHNA 1FW0A 4GFRA 2OBGA 2Y7WA 1P1NA 1NMUA 4NF6A 4BDLA 4L17A 2R71A 3ONMA 4U1OA 2XX9A 3W9VA 3IX1A 1ZBMA 3IB1A 3TQLA 2F6PA 5K2XA 4EF1A 4WKMA 5A5XA 3D4GA 3I6VA 1R6ZA 3PPRA 1XHYA 5AA2A 3RLFE 2THIA 4F1VA 3MZ1A 2UYFA 2F7AA 2QSXA 3O97A 2VP1A 1SYIA 5FHOA 4C1UA 3G3FA 3IOWA 4G8MA 1Y3QA 1A55A 3PV0E 2DE3A 3TZAA 5M2VA 4F1YA 1IXGA 3TFLA 1MDQA 4H65A 4KR5A 2DYXA 4LA9A 3LSFB 1US4A 1ANFA 2F78A 1I6BA 1USYH 2CZLA 1IQ7A 1RYOA 2QS3A 4DE8A 2F97A 1B7ZA 2HEUA 2I49A 5KCJA 1O64A 3U72A 2O7IA 4GL0A 1NL5A 2GHAA 2DE4A 4BDOA 3QAXA 1XS5A 1JEUA 2OLBA 1VSOA 1MXZA 4TOZA 3WAEA 3VLVA 2D5WA 4IY5A 1YCJA 2OJTA 1VE4A 2OK2A 5EHSA 5AA3A 1IXIA 4G68C 3RPWA 4DXBA 4PFTA 1BLFA 1LCTA 3ILUB 3LBSA 3KSXA 3OO6A 4YMAA 1D3KA 1B32A 1DOTA 1FQFA 4ZZEA 4NF5A 5AA4A 5I2NB 2QS1A 5JK4A 5FTHA 3MZBA 4I9DA 4NF8A 1N0TA 2G29A 5FTIA 3K01A 2QMWA 3KJTA 1LFHA 1NNTA 3EPEA 3MP8A 4TLMB 3VV5A 2XD3A 3FVGA 3JV9A 3VLUA 3IORA 2ONRA 4Q8RA 4R75A 3FV1A 1MQGA 3IB0A 4U22A 4OESA 3B6TA 3FXUA 5I57A 1GTKA 5CBRA 5K2YA 3LSWA 1OVTA 4YKPA 4TQUQ 4RPNA 4YAHX 4U23A 4LZ8A 4XKNA 4DLDA 5AA1A 4IO2A 4KFQA 2ANJA 5EHMA 3ODBA 3MAMA 4QFOA 3OEMA 1BTJA 1PBQA 4AB5A 2NOOA 2YLNA 3R26A 4ZDMA 3V89B 1S7YA 3SKPA 4G2ZA 1PB8A 3SERA 1SBPA 4F2QA 2F7BA 2Y84A 4NWCA 3BKIB 3Q27A 3CFLA 3T9UA 5H8NA 1QJMA 4U21A 4GXSB 1UTBB 3GBAA 1ZJLA 1EZPA 4AQ4A 2DSFA 4DCYA 1B1XA 2V93A 2Q89A 3VFJA 1MPBA 5B70A 3TTNA 2VD2A 5TP9A 2QS2A 4Q5TA 4DXUA 1SDXA 3PPQA 4YB7A 2I48A 2I3VA 4G8HA 4ESXA 4F39A 1QULA 1Y1MA 3TTRA 3DLNA 2DE2A 3VXBA 4YB6A 1B3LA 3QK6A 2DXYA 3ZKKA 2AL4A 4ZEIA 3SETA 2ZNSA 5KDTB 2WKYA 2AIXA 2GH9A 4GWOA 2I3WA 2CMOA 4KYEA 5CMMA 1N7WA 1OIBA 5F1QA 2O1MA 3N6UA 4IGTA 3IK6B 4LZ5A 1KWHA 1QUKA 2DOJA 4PFYA 3JYRA 1MPDA 4GL8A 1NNFA 2A5TA 2VHAA 1MRPA 3UN6A 3H3GA 4PFWA 2UVJA 1QKBA 4F31B 2QMXA 4Q0CA 4X48A 1H44A 3RUMA 3TELA 2HQ0A 3MPLA 4OYVA 1DTZA 3BFTA 1D9YA 3IB2A 4R9GA 3CG3A 2OWTA 3KN3A 4YU0A 2V25A 4DDDA 3G7WA 3OEKA 2LAOA 5CM6A 4PE5B 4DIGA 2QL3A 1GV8A 3RNNA 5L8DA 1Y1ZA 2NVUB 4GVOA 3CI8A 4PETA 4MLVA 2VD3A 2O68A 1B58A 5DVFA 5CBSA 4THIA 2H25A 4QFPA 3ZKLA 2X7PA 5ICTA 1R9QA 2DVCA 2XXXA 3I3VA 3LC8A 3HHFA 2HXWA 1D9VA 4RXLA 1B6HA 1POY1 3N5LA 3DELB 3TEPA 4XIGQ 2IEEA 4H67A 2PYYA 3W9WA 2XXRA 4JSDA 2Q8JA 3C32A 3KBRA 4RK2A 4GLIA 3FXQA 3S4UA 2NWJA 4OERA 3RTWB 2OZZA 3QUJA 2XHDA 3BBRA 4F29A 4R6YA 1FTMA 4EUOA 1Y9UA 2GFEA 4P0IA 3C31A 1O7TA 4F3GA 4DCXA 3KN8A 3E4RA 3SESA 1B4ZA 1LAHE 2ZYOA 2P2AA 3C35A 2XXTA 2REGA 5CMKA 4WEDA 4HCYA 3RN8A 1B3FA 1SD3A 3O28A 3THIA 1VFDA 2RC8A 3OO7A 4FIMA 4F3BA 1D4NA 2W7YA 1N04A 3L6HA 4IGRA 1R9LA 3GXAA 1MQDA 4ND9A 5TPAA 2A5SA 5DVJA 2Y7IA 1LAXA 1FQDA 4NF6B 1A8EA 1PB9A 1SI1A 2I4CA 3T93B 3FJ7A 4O3BA 2AYSA 4OETA 2XXUA 5AE4A 2Q9TA 3MUQA 4IO7A 1NNKA 3A3CA 4NMYA 5HBCA 3GLBA 4ONYA 2KLFA 5I2KA 3T66A 4BDRA 1MY2A 4F19A 5B7DA 2PT1A 3K6UA 5AA2B 5J1DA 5H8HA 3KGCA 1SI0A 3EHSA 1FTLA 1B2HA 5JTYB 1R1NA 4LQ5A 3LR1A 3VDFA 4IO3A 3S9EA 3U8QA 4UA8A 3W15C 4P11A 2HCAA 4C1TA 1Z7ME 1NFTA 4KQPA 4XXUA 4POWA 2DVZA 1H76A 1B3EA 4ZS9A 1WDNA 3HV1A 1LBCA 1OMPA 5KCJB 2I0CA 2R9JA 4FATA 1UQWA 4ELPA 1WVJA 2O84X 4FAJA 1Y3NA 5I59A 4XKQA 4N13A 3R7XA 1NKXA 3AXFA 3EQ1A 3TMGA 1NNPA 3V5AA 1TWYA 3C33A 3UP9A 5I58A 4G68A 1LAGE 2F34A 3FGSA 2B65A 1B7UA 3S9NC 2E0SA 3MVWA 3DP4A 4K3FA 1JW4A 4ELQA 4ECFA 3FVNA 4EXKA 3KN7A 4EQ9A 2QPQA 2I6EA 4PFUA 4G4PA 4I62A 5I56A 3HSTA 4OTEA 1B9JA 1GR2A 1IEJA 3F11A 4NF5B 5AA4B 2HAVA 4WEPA 4NF4A 4HW8A 2Y7RA 3IOUA 4C0RA 3KOTA 4R73A 1VFEA 1OQGA 1UTHA 5CRYA 3K1MA 3R6UA 4M1VA 4Z0IA 2RCAA 1MXXA 1SW2A 2B3BA 4KD5A 5JEIA 3TPAA 3FVOA 2B3FA 5DTBA 4JWYA 1JNFA 3IO4A 3SDFA 5I57B 3CVGA 3PD9A 3TODA 2RKMA 3S9MC 1QUJA 2I58A 4XKRA 1N3XA 3H4ZA 3O2AA 1LCFA 1JEVA 1LAFE 3FV2A 3ILTB 4AB6A 2V3TA 2Y7PA 4BDQA 3P7IA 4QSEA 4LUBA 4OFLA 1B5IA 2F36A 2PT2A 3KFMA 3PUYE 1XOCA 3MC2A 1URDA 1P1UA 4GXAA 3UGWA 5H8NB 1ZMGA 4RA1A 1XVYA 3HO7A 3FD3A 4R9FA 4KYDA 1FTKA 4Z7EA 3QUFA 1IZ1A 1S50A 4NTLA 2QRYA 2DP8A 2PVUA 4OFJA 5TP9B 1MM6A 4F2OA 3MPKA 2UVIA 3FJMA 1IXCA 2PBWA 4MBPA 3T96B 5ELVA 4QFNA 1ZU0A 5BUUA 2XXWA 1Y4CA 2F35A 4HTGA 2RC7A 4G77A 3K02A 4ELOA 4X9TA 1TXFA 1Y20A 1MH4A 3H6VA 2RCBA 3IL1B 3HN0A 4MLQA 3VVFA 1B5HA 1B0LA 2YJPA 5DEXA 5CMBA 2DWJA 3MBPA 3VE1B 4LQ2A 3USDA 5HM4B 1A8FA 1DPPA 4ZEFA 4YKIA 2P1SA 2A5TB 1AOVA 2Z23A 2O7UA 1LB8A 1B4HA 4F18A 1YAEA 2H5YA 1MPCA 4FORA 4RK9A 4OXVA 3UIFA 3K00A 3DM0A 4KI0E 1RKMA 4ZEKA 4JDFA 5L9MA 1NH8A 3T22A 2GHBA 1B40A 4U1ZA 2HZLA 2F6GA 3SEWA 1MS7A 3C9HA 4FJPA 1OQHA 1MQHA 1LSTA 4U2RA 1PBPA 1JVXA 3OOAA 4QFKA 3SEVA 3PUZE 2E1SA 1LGBC 1RYXA 5H8QB 4RPOA 3VLWA 1SQYA 1IXHA 3IR1A 5EYFA 3G3KA 5ISUA 1Q1KA 3EN3A 3CSGA 1B3GA 1JVYA 3EF7A 1P99A 2XXVA 1B46A 4YMBA 2ABHA 1M5FA 4Q30B 1XVXA 3E3KA 5IKBA 4M4GA 4JBZA 3TTKA 5KZTA 3V83A 3G3HA 3U92A 2PMSA 1EZ9A 3ZSFA 3TAJA 3HHGA 4ELRA 1HSEA 2XX8A 3H7MA 2O6AA 4H6DA 2OCUA 5TU0A 2ZNTA 3U1OA 3O6GA 2XXIA 1YPNA 1FTOA 2IA4A 5LOMA 4P0GA 2H98A 3OELA 5DT6A 2XD2A 3MVYA 3O29A 3FZVA 1N84A 3DP8A 1B1HA 3T9XB 1MXVA 5CC2A 1QVSA 4ZEBA 3FXRA 3K4UA 3CIJA 3C36A 1HSJA 1PB7A 3LSXA 3VXCA 4O3CA 1B7HA 3A09A 1FQAA 1ZTYA 4HS7A 3E9XA 3QIMA 3UK4A 1DSNA 4NWDA 3PMXA 2QS4A 2O69A 4F1UA 1P1WA 4R2FA 3OXNA 2D3IA 1M5EA 4FEDA 1FTJA 4ZEDA 4KCDA 5TPAB 4E0XA 1B51A 4NE4A 3MW0A 4QHQA 4U4SA 1JQFA 5F7VA 5DVIA 3FVKA 1BP5A 1B3HA 3G3IA 3HPIA 3V8XB 4R74A 1LFIA 2UVGA 2Z8DA 3O6IA 2UXAA 3PMVA 4R2BA 3ZS6A 3OSQA 3KG2A 1BIYA 2XXHA 1MM7A 4R6HA 2VGQA 4IB2A 4PP0A 3K0VA 2ONKE 4H5FA 3RGYA 3Q25A 1Y3PA 1M5BA 3N26A 4O3AA 3TTMA 2ZXTA 2NXOA 3K6XA 3M3LA 3UORA 3N94A 3Q26A 5A5XB 1MQJA 3B6WA 2V3UA 4IO6A 1ATGA 1JW5A 4YKKA 4BLAA 2F5XA 3IOTA 3CFXA 3TKDA 3H6WA 1A40A 3IJOB 1OVBA 4ZE8A 3CFZA 3PMWA 3MVXA 2HFBA 4H8JA 4HCWA 1QUIA 1XT8A 5I58B 4LP2B 4G68B 1QKAA 3HCQA 4PQJA 4XTCQ 4QFLA 3E13X 3FUZA 2Y7KA 5I84A 2DS9A 3OSRA 1URSA 4N6PA 5H8FA 4ISUA 1FQEA 2FYIA 5I56B 2AL5A 4X1DA 2H99A 4QRZA 1XC1A 2D21A 4NF4B 4FECA 3MJNA 1TFDA 1MXWA 2ZNUA 4NEDA 5JTYA 2PX1A 1BKAA 3MQ9A 3PPPA 3QSLA 3LSLA 1EH3A 1N7XA 1MDP1 3PU5A 1H3DA 1UTHB 2I4BA 4H5GA 3O66A 3K2DA 2F7CA 4GIZA 4RNSA 4QSDA 4E0WA 4QF9A 4RJZA 3T9HB 2RF1A 2ZYKA 1FQCA 3MVZA 1NH7A 1N76A 3G3JA 4GOTA 1GVCA 3L6GA 4LVQA 3UA8A 5CMCA 4NF8B 1SYHA 3M3KA 3K1NA 1I6QA 3PPOA 1F9BA 2ONSA 3B6QA 3K6WA 2H9BA 3MZ9A 5DYHA 1A54A 1B05A 4OWDA 4YKJA 4UACA 3SEXA 2V3QA 2H4IA 1EZOA 2M8CA 1AH5A 1MY0A 2X26A 3OMBA 4R72A 1L5TA 3TYHA 2Q88A 4N07A 1P1OA 2DWIA 4X1BA 1FCKA 1Q35A 4KPTA 2DWAA 4GRKA 2P0SA 2V84A 5AA2D 3PGFA 3KZGA 3KEIA 3TCGA 3FASA 5L9OA 3LUYA 1MQIA 2F8DA 1II5A 3DP6A 4OVJA 5I2NA 1JW1A 3OD7A 2XXPA 1LLSA 3KSJA 3VVDA 5DEXB 2Z8FA 1ZLQA 3OO9A 5CI5A 4I1DA 1USYE 3SEUA 3C4MA 1H43A 3SEYA 1SW1A 3S9LC 2ZMBA 3FATA 4LATA 3H06B 3MP6A 3RTFB 2ZYNA 4OQOA 3PUVE 1MY1A 4EQBA 5L9SA 1VR5A 1MY3A 3B7DA 2REJA 3PUWE 4OZ9A 2BJJX 3U93A 4F3PA 2HZKA 1PEBA 1PC3A 3A3UA 2OWSA 1GGGA 4FE8A 3U94A 3IOVA 1HSLA 2Q2AA 3TTLA 4OEVA 3D4CA 1IITA 1SW5A 4MH5A 3JZJA 3MWBA 1T0KA 2DXRA 3VVEA 3TDJA 1CB6A 3QXMA 4R6KA 1AL3A 1AIVA 1US5A 2Z22A 3FJGA 3RT6B 4U4XA 5FHMA 2ESNA 1URGA 4KHZE 5ITPA 4EDPA 3MP1A 4EQ7A 4EXLA 3CRBA 1IUDA 4OENA 1ZIUA 1UTBA 1MG1A 4BDNA 1H45A 4F22A 1AMFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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