1P1OA

Crystal structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) mutant l650t in complex with quisqualate
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 260
sequence length 260
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1oA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1oA01
1WODA 2DOJA 1NKXA 2DP8A 4IGRA 4KYDA 2F6PA 4KYEA 2F6GA 3PUXE 5FHNA 2I48A 3VLUA 4JSDA 1PBQA 3QUJA 4DCXA 2HCAA 1B4HA 1MDP1 4N6PA 1FQEA 1MXZA 3FATA 3ILTB 4F22A 3TUSA 3ECRA 2OBGA 1ANFA 2H25A 1Z7NE 4F3BA 4EXKA 1QUIA 3N6TA 3HO7A 3V5AA 2VOZA 2V93A 2AIXA 2F78A 5I57B 3MVWA 1A40A 4KFQA 1BLFA 3LC8A 4YKJA 3G3FA 3EPEA 2HZKA 3UK4A 1JQFA 1MRPA 4OESA 3MC2A 4MLVA 4QFLA 5TP9A 1SQYA 2LAOA 3I5OA 3R7XA 4ZDMA 3AXFA 1OQHA 1DTGA 3CR9A 4R9GA 4Z7EA 2O84X 1YCJA 2X7QA 1IZ1A 1ZU0A 3CG3A 3O2AA 2UYFA 1OVTA 3KFMA 3TTMA 1PEBA 3HPIA 1MXUA 5AA3A 2GHBA 3U93A 2Q89A 5KDTB 4U21A 3PD8A 3TPAA 2OWSA 1PBPA 4HW8A 3K0VA 2QRYA 1CE2A 2ZMBA 4JBZA 3O6GA 2Y7WA 2PVUA 1POY1 1H76A 1MPBA 2O6AA 4AB6A 4M1VA 3PV0E 4GWOA 3QIMA 1ZMGA 3FD3A 1EH3A 1IIWA 1M5DA 3DELB 1IXCA 2Z8FA 3R6UA 2PMSA 4JWOA 3U94A 4RY1A 4LZ5A 4NF5B 3HV1A 4YB5A 1WDNA 1PB8A 2B3FA 1ZLQA 4MBPA 4OENA 3OO9A 1MM6A 4F31B 5TPAA 2RCBA 4G8NA 2A5TA 4LATA 1H45A 2QS3A 3VE1B 2UVHA 3C9HA 3TTKA 5KZTA 1B51A 3GBAA 2Y84A 1NNTA 1UIVA 1EU8A 1XVXA 4YB6A 5JTYB 4FATA 1B58A 1R1NA 2QS2A 3RLFE 4R6HA 3S9LC 4KYSA 3TELA 1F9BA 2DWAA 5I2KA 3VVDA 3Q27A 1URGA 2ZYNA 5KDTA 2Y7KA 1JVXA 2Q9TA 1O7TA 5TU0A 4F2QA 1I6BA 2O7IA 4HCWA 2VGQA 4NEDA 4F3PA 3MZBA 1URDA 3PPOA 4G68A 5EYFA 4GXAA 3OXNA 4F3SA 2OWTA 4EXLA 3PPRA 2DWIA 4FAJA 2WKYA 1UTHA 1UIUA 2O7UA 1Y4TA 4ZZEA 3EHUA 3IOWA 3OELA 1XOCA 1NMUA 1FTLA 1FQBA 1N3XA 3Q28A 1LFHA 4KHZE 4PP0A 1TXFA 4P11A 1XS5A 4GFRA 1M5EA 3V89B 4GIZA 3KN7A 4JWYA 4QSCA 3IL1B 3PMVA 4EQ9A 2OJTA 1JETA 3T9HB 4DLDA 1S9TA 4F1YA 3SESA 1TFAA 3LUYA 1H44A 3N5LA 1USYE 1A55A 4XKQA 4BDNA 1TWYA 4MLQA 1FQAA 3IORA 2DE2A 3N94A 5IKBA 3OO7A 2M8CA 4EF1A 4HCYA 4YKPA 2PBWA 3IK6B 4ZE9A 3LSXA 2HXWA 4ZE8A 2B65A 2Q8JA 3DLNA 3FXRA 3MVZA 5HBCA 1SI1A 4FEBA 3F11A 4LZ7A 3RUMA 1MY4A 4YMAA 3IJXB 1AMFA 1B32A 4E0WA 2DVZA 3TCHA 1FTMA 3ZKKA 4NF4B 3S9MC 1CB6A 4GL0A 3S9EA 3MAMA 4ELPA 3HHGA 3K6WA 3WAEA 5H8NA 5K2YA 2UXAA 4NF8B 3HN0A 3TYHA 4R75A 4DZ1A 4RK9A 2HAVA 3EN3A 1B05A 3DM0A 2HQ0A 3G3HA 1HSEA 3K1NA 1LAFE 3FJGA 1POTA 1MQDA 3FV2A 3RNNA 3ZKLA 1FTKA 1DPEA 3E3KA 4IO2A 2XX8A 5AA1A 1B1HA 3WAFA 3JYRA 1EZPA 1Q35A 1NL5A 1MPDA 4OHNA 3M3LA 3Q26A 2NOOA 1M5FA 3RQTA 3TMGA 1LGBC 2I49A 2I6EA 3IO4A 3RY3A 3USDA 3VVEA 3SKPA 2O1MA 3MUQA 4KD5A 4DXBA 3VLVA 2QL3A 1QJMA 2X7PA 4RPNA 1AL3A 4LP2B 1SYIA 2PX1A 2P1SA 1LBBA 2QPQA 4NWDA 1LB8A 4H8IA 3O9PA 2RC9A 3T66A 4THIA 3L6HA 1LBCA 1II5A 2QMXA 1BTJA 1R6ZA 5ICTA 5JK4A 4FORA 3BKIB 5CI5A 4F29A 3C36A 3CG1A 4PFWA 4NF8A 1Y3NA 1B3GA 4YZZA 1LSTA 3FVKA 3VFJA 1LFGA 1USYH 3O6IA 1H43A 2Y7PA 3FUZA 5ITPA 2H9BA 3W9VA 2HAUA 2XXYA 1YTVA 4C1TA 3FIRA 4FEDA 2FNCA 1DPPA 3PUZE 3V83A 1B5IA 4IGTA 1SBPA 1XHYA 2NXOA 1MH3A 5H8FB 1P1QA 1M5BA 1MY2A 1Y3PA 4JB7A 4U4SA 2DWJA 3LBSA 4ZEBA 2XXVA 2GFEA 1ZJLA 4F1UA 1B3HA 4ELQA 5LOMA 3D4CA 3TKDA 4JSOA 3QXMA 4YU0A 1QUJA 5AA4B 5TPAB 4K3FA 1N04A 2A5TB 3T9VA 4EF2A 3K6VA 1TT1A 2YJPA 4LVQA 3FASA 1LB9A 3S2VA 3A3CA 2I4BA 3TQWA 4XIGQ 4JDFA 5CMKA 3ILUB 2VD3A 3FV1A 1AH5A 1VFDA 1R9QA 4NTLA 4N07A 5I84A 3SERA 1B3EA 3PGFA 4GXSB 4POXA 3IX1A 4QSDA 1IEJA 5I2KB 1GVCA 1B3LA 4F39A 4F18A 4PQJA 2V3TA 5CC2A 2DYXA 4G8MA 4ISUA 2XXRA 3LSWA 1Y1ZA 1LAXA 2UVIA 4EDPA 3FVGA 1D9VA 4RPOA 1VR5A 3OMBA 4G68B 3IOUA 4YAHX 1QW0A 2AL4A 2PYYA 3S4UA 2Z8EA 3OSRA 4P0IA 3K4UA 2YPNA 3H06B 3EF7A 3GZGA 1MQGA 1UTHB 1D3KA 4IO6A 5FTHA 4ESXA 3FVOA 3A3UA 1FQCA 3RN8A 1MXXA 4X48A 2G93A 5M2VA 5H8FA 2XXPA 3DP8A 4DDDA 4FJPA 2F7CA 2FYIA 1LAGE 1I69A 2CMOA 3B6WA 2Z23A 3U72A 2O1LA 3FGSA 4KCDA 1GTKA 5KCJB 1MY1A 4GF8A 1PC3A 3T9XB 5AA4A 4I1DA 5H8HB 2E0SA 3MWBA 5I59B 3H4ZA 3VLWA 3BFTA 1N3WA 2AYSA 3CSBA 3OO8A 4PFYA 2H4IA 1NNPA 3SEUA 2DWHA 3O29A 3IB2A 2OZZA 3KSXA 3TQLA 3UORA 4ELRA 4OEVA 3VV5A 3K1MA 5F7VA 4GQOA 3SEVA 2UYEA 3IR1A 4R74A 3RT6B 3L6GA 4G8HA 2F5XA 4YB7A 3PUWE 1R9LA 1LFIA 3GBBA 4OFOA 3GXAA 1A8EA 4GD5A 2UVJA 3TCGA 3E9XA 1OQGA 3QAXA 3W15C 4QSEA 4OERA 1B7HA 1B4ZA 3M3KA 1AIVA 4BDQA 1SW1A 5H8NB 4MH5A 2ZYKA 1VFEA 4H5GA 4YKIA 4XXUA 4I9DA 5A5XB 4XKNA 4H5FA 4IO3A 4MFIA 1WVJA 3C34A 4QRZA 1RKMA 4XKPA 5ICQA 4ND9A 5CMBA 1PB7A 5I56A 5BUUA 3KSJA 1D4NA 4GVOA 4O3AA 2ANJA 4F3GA 3RT8A 4OXVA 5KCJA 1JEVA 3FJ7A 4JXIA 2RC8A 5I2NA 3KGCA 5H8HA 1TFDA 2F97A 3SEXA 5I59A 2RCAA 4H1XA 3PMWA 3CFLA 3B6TA 2ONSA 3LR1A 1MDQA 4FECA 3T96B 4O3CA 3QK6A 3FXQA 2DS9A 1QVSA 1B1XA 1A99A 3JV9A 2XXTA 2XXUA 3K02A 3K1PA 3G7WA 2ALUA 3O28A 3QYTA 3RGYA 2ZNSA 3THIA 3MP6A 2D5WA 4U4XA 4NF6A 4TOZA 1BIYA 1BP5A 2RC7A 1JVYA 3UIFA 4OEUA 1UTBB 5DVFA 3IO6A 3TTNA 2H5YA 3U8QA 4GOTA 3C32A 3C31A 4KQPA 3TDJA 1MY0A 4E0XA 2O69A 3I6VA 1A8FA 1P1NA 3O97A 1QKAA 2IEEA 2W7YA 3PPQA 5A5XA 1DMBA 1NH7A 5L9MA 2GHAA 1LCTA 4G68C 3PPPA 1IXHA 4KCCA 4R72A 3E13X 2YLNA 2XXXA 2DE3A 5F1QA 4XKRA 4OZ9A 2NUVA 4L17A 2O51A 4TQUQ 3Q25A 4QHQA 2DXYA 2F35A 4U23A 1ZKBA 1SI0A 3C4MA 5H8SA 3U92A 1PB9A 4RYAA 1M5CA 3TTLA 4EUOA 2ZYMA 3DP6A 4P0GA 3PU5A 3E4RA 4GL8A 4RA1A 5L9SA 4ZZAA 1Y4CA 2XXQA 3DP4A 2XXIA 2GRVA 3IJOB 4DXCA 1JW4A 5ISUA 2XXWA 1B0LA 1Y3QA 3CVGA 3IOTA 3G3JA 2THIA 3MW0A 2B3BA 1NNFA 4ONYA 1JW1A 2V84A 1B7UA 3T22A 5ITOA 1SW5A 3ODBA 3KBRA 2ZXTA 3SEYA 3OD7A 3KN3A 3UGWA 2Q88A 1IUDA 5B7DA 3PD9A 3OO6A 1UTBA 2F7AA 3MPKA 3TZAA 4H67A 3LSFB 2I4CA 4GRKA 5CBSA 1I6QA 5DEXA 3EQ1A 2BJJX 1IITA 3T9UA 3OSQA 2VP1A 2PT1A 4IB2A 3ZS6A 1Z7ME 3FXUA 2I0CA 4R2BA 4BDLA 1NNKA 5FTIA 3H6WA 4H0WA 4UA8A 2F36A 1A7LA 4PFUA 4TLMB 1B3FA 3EHSA 3K00A 3ONMA 4IO5A 4WEDA 1MQJA 3KOSA 2V3QA 5DVJA 4Q0CA 2E1SA 4HS7A 4OFJA 3PMXA 3W9WA 1N7WA 3OOAA 4AQ4A 4OQOA 5CMCA 4F2OA 1S7YA 3R26A 5DYHA 4ZEIA 3HSTA 2Z22A 1B0HA 1NH8A 1ZBMA 2Q2CA 4F1VA 1Y9UA 1XT8A 2H99A 1MM7A 2XXHA 5EHSA 4C0RA 5AA2D 1S50A 3MVYA 3MQ9A 4DCYA 1JNFA 4H8JA 5AA2A 1MS7A 3FVNA 1Q1KA 3TFLA 3K2DA 1ZTYA 1MXVA 4FE8A 4ESWA 4NE4A 1HSLA 2RKMA 4GLIA 2AL5A 5DVIA 5I58B 4TLLB 4Q5TA 4YICA 2XD3A 3H6TA 1I6AA 3KEIA 5B70A 1N76A 3JZJA 1QULA 1O63A 5H8QA 3G3IA 1YPNA 3H7MA 1IQ7A 3TEPA 4RK2A 3A09A 3QSLA 3T93B 4WEPA 4I62A 5CMMA 3MZ9A 3RTWB 2XHDA 1MXYA 3KN8A 1N0TA 4RNSA 4H6DA 4X1BA 1XVYA 4QFNA 2QMWA 1GGGA 3KG2A 2ZNTA 5BWJA 1B2HA 1DSNA 4RJZA 1A54A 2OLBA 5I56B 2R6GE 4KR5A 2A5SA 2D21A 1BKAA 2H98A 1GV8A 1SDXA 2Q2AA 1UQWA 2R9JA 3TODA 1ZIUA 1OLAA 4Q8RA 4UACA 1RYOA 4O3BA 2REJA 1B7ZA 5I2NB 1ATGA 1VE4A 3U1OA 1MXWA 4OVJA 2OK2A 1FQFA 3OEKA 1SW2A 1LAHE 1FQDA 5I57A 4BDRA 4KI0E 3VXBA 3MVXA 4FIMA 2OCUA 5CRYA 5HPQA 3IB0A 2ZYOA 5I58A 3RPWA 4NF6B 3CSGA 2F8DA 4N13A 3MJNA 3BBRA 3SDFA 5K2XA 4WKMA 2IA4A 3I3VA 1P1WA 1SW4A 4MF3A 3RTFB 3KOTA 2NVUB 3IB1A 1ELJA 4DIGA 3C33A 1NFTA 2ESNA 3O66A 3EHTA 3H3GA 2CZLA 3M3FA 5CM6A 4R73A 1PDAA 4QFOA 2RF1A 2DSFA 4OYVA 3ZSFA 3VXCA 5FHOA 1H3DA 5L9OA 3V8XB 3HHFA 5ELVA 1EZ9A 2NWJA 4R6YA 1B52A 3D4GA 1P1UA 1YAEA 3C35A 3PPNA 2XX7A 1XC1A 1IXIA 4LA9A 3MPLA 1P1OA 3CIJA 3UA8A 3TTRA 4ZEKA 3IAZA 4H65A 1B46A 2D3IA 1EZOA 2ONRA 5AE4A 4BDMA 2I0BA 4NF5A 4R9FA 3SEWA 3CFZA 2V25A 4RXLA 3PUVE 2HZLA 1VSOA 5DTBA 2PT2A 4Q30B 1QKBA 4LQ5A 3H6UA 4JWXA 2QS4A 2QJEA 1JW5A 4AB5A 4KPTA 4ZS9A 3G3GA 1J1NA 1MQIA 4OTEA 1JEUA 1P99A 1KWHA 3B7DA 2Y7RA 4ELOA 3UP9A 5JTYA 1B40A 3N26A 5EHMA 2RINA 2P0SA 3G3KA 2I3WA 1MQHA 4IO7A 4U2RA 4ECFA 3B6QA 3BFUA 1Y1MA 3CRBA 3P7IA 5IAIA 1MPCA 4U1ZA 4I8CA 1N84A 3MZ1A 2DE4A 5DEXB 3FJMA 2P2AA 2I3VA 1IXGA 2KLFA 1US5A 4Z0IA 4BDOA 1QUKA 2ONKE 4QF9A 3FZVA 1LCFA 2V3UA 2G29A 3MP1A 1FTOA 3Q29A 2HFBA 1N7XA 3UN6A 3K01A 2REGA 4XTCQ 1GR2A 1D9YA 3MP8A 1SYHA 2UVGA 4PE5B 2F34A 4POWA 5HM4B 3PUYE 1MG1A 1US4A 1MY3A 1OVBA 4LZ8A 4U22A 2DQVA 3TCFA 4R2FA 3KJ7A 4G4PA 1FTJA 2R71A 3OEMA 4OMBA 4LUBA 3KJTA 2Y7IA 5JEIA 1FW0A 3IOVA 4ZECA 1B5HA 4LONB 2DXRA 2HEUA 1B5JA 3S9NC 3N6UA 4X1DA 4NWCA 3VVFA 4QFPA 4C1UA 1B9JA 4EQ7A 4ZEFA 5FHMA 2XX9A 4YKKA 3HCQA 4LQ2A 4F19A 2QSXA 3GLBA 4EQBA 3VDFA 2ZNUA 5J1DA 5AA2B 3H6VA 5DT6A 1O64A 4G77A 4YMBA 2XD2A 1LLSA 4NMYA 4R6KA 5L8DA 5TP9B 3KZGA 4BLAA 1OIBA 2I58A 3K6UA 1T0KA 2VD2A 2ABHA 3LSLA 5CBRA 1SVXB 2QS1A 1AOVA 2Z8DA 1DTZA 4WXJA 4U1OA 4PETA 3SETA 4DE8A 3H03A 4IO4A 1B6HA 4DXUA 3CI8A 3M8UA 4NF4A 4HTGA 4M4GA 5H8QB 2F7BA 1L5TA 2DVCA 2O68A 4PFTA 3TAJA 1MH4A 3MBPA 1SD3A 2FA7A 3K6XA 1FCKA 1HSJA 4QFKA 3O6HA 1DOTA 1RYXA 4X9TA 3CFXA 4OWDA 3QUFA 4ZEDA 2GH9A 2VHAA 1Y20A 1OLCA 4IY5A 4OFLA 3OENA 2X26A 4G2ZA 1URSA 1OMPA 4IY6A 4OETA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WODA 2DOJA 1NKXA 2DP8A 4IGRA 4KYDA 2F6PA 4KYEA 2F6GA 3PUXE 5FHNA 2I48A 3VLUA 4JSDA 1PBQA 3QUJA 4DCXA 2HCAA 1B4HA 1MDP1 4N6PA 1FQEA 1MXZA 3FATA 3ILTB 4F22A 3TUSA 3ECRA 2OBGA 1ANFA 2H25A 1Z7NE 2VPNA 4F3BA 4EXKA 1QUIA 3N6TA 3HO7A 3V5AA 2VOZA 2V93A 2AIXA 2HHMA 2F78A 5I57B 3MVWA 1A40A 1YZ0A 4GBWA 4KFQA 1BLFA 3LC8A 4YKJA 3G3FA 3EPEA 2HZKA 3UK4A 1JQFA 1MRPA 4OESA 4GX6A 3MC2A 4MLVA 4QFLA 5TP9A 3MSTA 2WBBA 1SQYA 2LAOA 3I5OA 3R7XA 4ZDMA 3AXFA 1OQHA 2MKZA 1DTGA 3CR9A 3RPLB 5EQAA 1RDXA 4R9GA 4Z7EA 2O84X 2DDKA 1YCJA 4AS5A 2X7QA 1NI9A 1IZ1A 1ZU0A 3CG3A 3O2AA 2UYFA 1OVTA 3KFMA 3TTMA 1NV7A 1PEBA 3HPIA 1MXUA 5AA3A 2GHBA 3U93A 2Q89A 5KDTB 4U21A 4PDDA 3PD8A 3TPAA 2OWSA 1PBPA 4OVSA 1FBCA 4HW8A 3K0VA 2QRYA 1CE2A 2ZMBA 2OWZA 4JBZA 3O6GA 2ZZWA 2Y7WA 2PVUA 1POY1 1H76A 1MPBA 2O6AA 4AB6A 4M1VA 3PV0E 4GWOA 3QIMA 1ZMGA 3FD3A 1FPIA 1EH3A 1IIWA 1M5DA 3DELB 1IXCA 2Z8FA 3R6UA 2PMSA 5ET6A 2JJKA 2L5VA 4JWOA 3U94A 4RY1A 4LZ5A 4NF5B 3HV1A 4YB5A 1WDNA 4QXDA 4FBPA 2BJIA 1PB8A 5IM2A 2B3FA 1ZLQA 4MBPA 4OENA 3OO9A 1MM6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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