1P1QA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) l650t mutant in complex with ampa
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1qA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1qA01
4FEBA 4RYAA 2D3IA 3MPKA 4ECFA 5CMMA 2H25A 2NXOA 1FTOA 1NFTA 1YTVA 2AL5A 1B3LA 1EH3A 1I6BA 3RT8A 1US4A 5BUUA 1SW2A 3R6UA 1FQFA 4AB6A 1OQHA 5H8HA 3MP6A 2UVGA 1B0HA 3K2DA 4KYDA 3KJ7A 2F6GA 4HTGA 2HAUA 4IB2A 4JB7A 4LUBA 2HFBA 3IJXB 2O51A 1QUIA 2QS1A 4EQBA 4O3CA 4QFOA 4MFIA 1DSNA 4JXIA 1M5CA 3PMVA 4U4SA 2R6GE 5TPAA 1PBQA 3TTMA 1CE2A 4YMAA 2PYYA 1MQDA 1NMUA 4F19A 3V83A 1N3WA 1UTBA 1SDXA 3MPLA 4NF6B 1XHYA 4G68C 3I6VA 3N26A 3GXAA 1JW4A 2I4CA 4P11A 2PT2A 2H4IA 4ISUA 2I0BA 2G29A 4NF5B 2W7YA 4F22A 5B70A 1II5A 3C34A 5DT6A 4QF9A 5HPQA 3IX1A 4JDFA 3KN3A 3SKPA 2OLBA 1Z7ME 3T93B 4ZS9A 1YPNA 1QVSA 3IB0A 3IJOB 1MM6A 5ITOA 3LSLA 3E13X 5CMBA 3FASA 3B6WA 3G3KA 2V3TA 1MQJA 2F7BA 1Y3QA 3CG1A 1MXWA 1QKBA 4H1XA 1HSLA 1D9YA 4F1YA 3TTLA 2DWJA 2RKMA 4JSOA 1S7YA 1JETA 5L8DA 3G3GA 4H67A 2HZLA 3Q25A 1QULA 1URSA 4GVOA 4WEDA 1MPBA 1POY1 2XHDA 4ESWA 3HO7A 4ZEFA 1P99A 3S2VA 1UTHA 4DCYA 1FCKA 4ZZEA 1B3FA 3N94A 5TP9A 3CFXA 3SESA 1PDAA 5CM6A 3FV1A 5I57A 4OZ9A 2AL4A 5F7VA 3BBRA 3T9XB 2QPQA 1BTJA 4THIA 3RTFB 3GBBA 3DP8A 1BKAA 4DLDA 1S9TA 3USDA 3CG3A 3K1MA 1EU8A 1H45A 3OO9A 3M3KA 4ZE8A 5JEIA 2ZYNA 4BDRA 3O29A 4N07A 1NKXA 1I6AA 4HS7A 4K3FA 3O97A 3QXMA 4I8CA 5AA2A 4PFWA 1JVYA 3S9NC 4MF3A 3OMBA 3DELB 1HSEA 4OFJA 1LB9A 1MXVA 4DZ1A 3TQLA 4F1VA 5F1QA 4H0WA 3MVZA 3B6TA 1RYXA 2I48A 1OVTA 1UQWA 4LATA 3CRBA 1LGBC 4YKPA 1B3GA 5AE4A 3W9WA 3RNNA 1EZ9A 1H43A 4GRKA 5H8NA 1B4HA 3THIA 3EN3A 5ISUA 1XVYA 2B65A 4YKJA 4BDLA 4X48A 4OTEA 3H4ZA 1N3XA 2VD3A 2VGQA 1LBCA 4F3PA 1QJMA 4RK2A 4YB6A 2DQVA 2QS4A 3M8UA 4X1BA 3FJGA 2F97A 1ZJLA 1ZMGA 4PQJA 2REJA 2QL3A 5AA4A 1MXZA 5I2KB 2DYXA 3LSXA 3ODBA 2XXPA 2Y7KA 3U94A 5JTYB 4ELQA 4I1DA 1KWHA 2QJEA 2XXQA 4IO5A 4WKMA 3TEPA 1YAEA 4JWYA 3ILUB 3LUYA 3ZKKA 4Z7EA 3QK6A 2NVUB 3CR9A 2XX8A 3RLFE 3K01A 2V84A 4EUOA 2A5SA 1NNTA 3DP4A 4O3BA 4UACA 2H5YA 3PU5A 1UIVA 3MBPA 3CVGA 3S9MC 1XVXA 2F5XA 5FTIA 1VFDA 3JYRA 4PFYA 4GOTA 4KYEA 1B6HA 1BP5A 4IGTA 3IK6B 3VFJA 4AB5A 3HN0A 4BDMA 1IUDA 2QSXA 1QUKA 3VE1B 4NF4B 3M3LA 2HEUA 4QSCA 4I62A 2FNCA 5CMCA 3U92A 5DEXB 5J1DA 1LAGE 3MVYA 4ZZAA 2RC8A 4IGRA 1M5EA 3TMGA 3OELA 4KPTA 3FXUA 1JW5A 3N5LA 4JWOA 2OBGA 3TCGA 1SW5A 4RY1A 1RYOA 1TFAA 1I69A 3MQ9A 1LLSA 3MUQA 4H5FA 3S4UA 3OEMA 1P1UA 3C4MA 3FVGA 1ZTYA 3I3VA 3OSRA 1R9QA 5I2NA 3D4GA 1XS5A 3PPPA 3TCHA 1Q35A 3U93A 2F7CA 3HHFA 3VVDA 4G8NA 4FJPA 1MDP1 3FVOA 3PV0E 4ZDMA 2Z8DA 2XX9A 4IY6A 3IL1B 1H3DA 3TUSA 4IO4A 4TLMB 3L6GA 4FEDA 3K6VA 1OIBA 2O1MA 5L9MA 3UN6A 3DLNA 3IB1A 2OWSA 3G3IA 1B1XA 1OLAA 4LZ5A 4QSEA 4JSDA 3G3JA 4EF1A 3OO8A 2XX7A 5TPAB 3WAEA 3VV5A 4FECA 4GWOA 3H03A 3MC2A 2I0CA 3OXNA 4RNSA 1TT1A 1OLCA 2VOZA 3N6TA 2YJPA 3KG2A 2I58A 3O28A 2PBWA 1R6ZA 2QS3A 3HPIA 3K0VA 3EHUA 3K1PA 2PX1A 2YLNA 1A54A 1A99A 4QFKA 5KCJA 1H44A 3SEXA 1L5TA 3FZVA 4EQ9A 4YB7A 1P1WA 1DPPA 4DDDA 1N04A 1XT8A 4F2QA 2I4BA 2OCUA 5H8QA 1DMBA 1B32A 5I56A 4XKNA 3SEWA 3ZKLA 4BDNA 3OEKA 1NNKA 1MH3A 2A5TA 4PFUA 1AIVA 3FGSA 3PMWA 1POTA 5KDTB 1S50A 1B1HA 4ZEDA 3T9UA 2B3BA 3FATA 2G93A 2RC7A 4PFTA 3JZJA 1B2HA 1ELJA 3Q28A 5ITPA 3ONMA 2R9JA 4G2ZA 1MXUA 4NE4A 1PB8A 1PB9A 2XXVA 5FTHA 4GFRA 4JWXA 4R2FA 3UGWA 4C0RA 4NTLA 3VLUA 1B40A 2ZYOA 1ZU0A 3WAFA 1Y9UA 3R26A 4ZEBA 3IOUA 3TELA 2DVZA 4TQUQ 1EZPA 1US5A 1FQAA 1B7UA 1OVBA 2Z8FA 2D21A 4L17A 4OENA 5TP9B 1GTKA 1WVJA 1N0TA 1B3HA 1IXGA 3UK4A 4YU0A 2ZMBA 2REGA 5I57B 3G3FA 3KN7A 4IO2A 3U72A 4HW8A 1DPEA 3C35A 5DVFA 4NWCA 2Q2CA 4ELRA 3Q26A 3FJMA 3C36A 3TCFA 4NWDA 3CSBA 2OWTA 4LP2B 5H8SA 2Q88A 2XXYA 3RTWB 2O68A 3TYHA 4F29A 4DXCA 3K6WA 3O6HA 1LFHA 2OJTA 4HCYA 4KI0E 4Q5TA 4XTCQ 1GV8A 3KZGA 4N6PA 1MY4A 2Q8JA 1MXYA 1HSJA 5DVJA 5AA2B 2QS2A 4E0WA 3G3HA 4NF6A 4Q30B 3SDFA 5I58A 2Z8EA 5A5XB 3KOSA 1LCFA 4C1TA 3MP1A 3IO6A 2FYIA 3KN8A 3OENA 1O7TA 4NF5A 1P1NA 4I9DA 3H7MA 2Y7IA 4M4GA 3Q29A 3P7IA 1IZ1A 4ELOA 1CB6A 4TLLB 1JW1A 3IOVA 4FORA 2HAVA 3RUMA 4WEPA 4DCXA 5TU0A 2I6EA 1PB7A 2QMWA 5AA1A 1N7WA 2ONSA 1Y3PA 3HCQA 2UXAA 4XIGQ 1B05A 2Y7PA 2UYFA 1ZIUA 3Q27A 3E4RA 3MZ1A 1FQEA 1B58A 1GGGA 4H65A 2NUVA 2HQ0A 3RN8A 1A7LA 3G7WA 3H3GA 4LONB 2V3QA 3TFLA 1MM7A 2RCAA 4GLIA 4R75A 2H9BA 5AA4B 1D3KA 2Z23A 3F11A 3UORA 1IXIA 2VD2A 3MW0A 4G4PA 3UIFA 4LZ7A 1MY0A 3TQWA 3BFUA 1QUJA 1B4ZA 3ECRA 1PBPA 4AQ4A 1BLFA 3V8XB 1FTLA 2DWAA 1URDA 3OO7A 3KGCA 1SQYA 1XOCA 5KZTA 3DP6A 3ZSFA 3A09A 2AIXA 4OFLA 4ESXA 2YPNA 4NMYA 3VLVA 2IA4A 5ELVA 2X7PA 4YKIA 4X1DA 1VFEA 4MLQA 3PMXA 3EQ1A 1MPDA 3UA8A 3RQTA 5ICQA 4ND9A 3FXQA 1QW0A 2I3VA 1ZLQA 3V89B 5I59B 4YICA 3MJNA 1D9VA 2P1SA 1I6QA 3FVNA 1LAFE 3MZBA 4OEUA 3KBRA 1IIWA 2VHAA 2UVIA 4IO7A 3PUXE 1AMFA 4GXSB 3VVEA 4OWDA 5LOMA 4LA9A 3KOTA 1SI1A 4F31B 4FIMA 3A3UA 4E0XA 2RINA 1MQGA 4YB5A 4R2BA 4TOZA 3H6TA 5IKBA 3O66A 3MVXA 3C32A 3CIJA 3KEIA 4FATA 1B7ZA 4OXVA 4PE5B 1SBPA 3RY3A 2GHAA 1PEBA 4GL0A 4RXLA 4POWA 2DE2A 3K02A 4G68B 3V5AA 1B9JA 5CBSA 1MQHA 5K2YA 5CRYA 4PETA 2DS9A 2RCBA 1PC3A 4Q8RA 4NF8B 5JTYA 4ZECA 5H8FA 4H8JA 2UVJA 2M8CA 5EHSA 1B5JA 3PUVE 4NEDA 4KCCA 1VSOA 2F34A 1TWYA 3FV2A 3MWBA 4BDOA 1Y4TA 1N84A 1MY2A 3A3CA 2X7QA 3FIRA 4OQOA 2CZLA 4G77A 1EZOA 5H8HB 5EHMA 3S9LC 3E9XA 4M1VA 3VXBA 3PD8A 4X9TA 2CMOA 1B51A 3PD9A 3VLWA 3SEYA 4OETA 5H8QB 1M5BA 4ELPA 3TAJA 3QIMA 5I56B 1DOTA 2XXIA 3QSLA 1NL5A 4GL8A 1H76A 3LBSA 1B3EA 4FE8A 5CBRA 3SETA 2QRYA 4JBZA 3TDJA 2Z22A 3O2AA 3K1NA 2X26A 3TTKA 3H6WA 1URGA 4IY5A 3E3KA 3IOTA 4GQOA 1TXFA 1UTBB 3IB2A 3C31A 1SYHA 4QFNA 2Y84A 1J1NA 1B0LA 5B7DA 2QMXA 1MH4A 1YCJA 2P2AA 4POXA 1LAHE 2B3FA 3I5OA 4YMBA 2HXWA 4GF8A 4KYSA 2HZKA 3EPEA 5M2VA 4YZZA 3T66A 4P0IA 1P1OA 4OYVA 4EXKA 1N76A 2F8DA 1IXHA 3MVWA 4R6HA 1LAXA 4EDPA 3EHSA 1JQFA 5FHOA 2P0SA 3IORA 1IXCA 1MG1A 2O7IA 4Z0IA 4OFOA 2Q9TA 2HCAA 2Q89A 2DOJA 3C33A 3S9EA 3KFMA 1Y20A 4U4XA 4DIGA 3SERA 5JK4A 5FHNA 1FQDA 2D5WA 4R6YA 2DWIA 2ZXTA 1SW1A 2ZYKA 1JNFA 2R71A 4EXLA 4ZE9A 3T9HB 4H6DA 2NWJA 4R72A 2V93A 4C1UA 2ONRA 2DVCA 3PGFA 2F78A 4LQ2A 1MS7A 3U8QA 2WKYA 2AYSA 1T0KA 2E1SA 1SD3A 1XC1A 1VR5A 3FD3A 4F1UA 4DXUA 2NOOA 3QYTA 1MRPA 3C9HA 5I58B 2F35A 3ILTB 4XKQA 1USYE 4WXJA 2O69A 3KSJA 3RGYA 3MP8A 2O6AA 4LZ8A 1UTHB 2XD3A 3FVKA 4R9GA 4XKPA 4QHQA 1A40A 3RT6B 2I3WA 4F3SA 2RC9A 4IO3A 2ONKE 1R1NA 3LR1A 2DXRA 2XXXA 1AOVA 3FXRA 1B7HA 5FHMA 1SVXB 1DTZA 4OESA 3PPOA 1USYH 3PUYE 3SEVA 1B5IA 5CI5A 4UA8A 3IO4A 3VVFA 5HM4B 1MXXA 2Y7RA 3QUFA 1LSTA 2F7AA 3CSGA 1VE4A 3OO6A 3LSFB 4U21A 5HBCA 5KDTA 2H99A 3U1OA 4OVJA 4U1OA 3GLBA 5L9OA 4ONYA 4F3GA 1A8EA 4O3AA 2H98A 4OMBA 1SYIA 2ESNA 3GBAA 2XXUA 3K00A 2THIA 4QFPA 4GD5A 2DP8A 5EYFA 3IR1A 1P1QA 3T9VA 1Q1KA 2OZZA 3MAMA 2GRVA 2XXWA 1LFIA 2O1LA 1MDQA 2ABHA 2OK2A 4F39A 3H06B 4U2RA 2ALUA 1Y4CA 5H8NB 5L9SA 1FW0A 3T22A 3R7XA 4RK9A 3BFTA 2GFEA 2IEEA 5I84A 1AH5A 3O9PA 5AA2D 4G8MA 4ZEKA 3OSQA 1NH7A 2O84X 3T96B 2DWHA 3W9VA 2Q2AA 1UIUA 4LQ5A 3TZAA 4RPOA 4U1ZA 1Y1MA 1ATGA 4H8IA 2XD2A 4R73A 1WODA 5A5XA 1ZKBA 2XXRA 1NNPA 4YAHX 1JVXA 1GR2A 3GZGA 4N13A 2ANJA 2ZNTA 2UYEA 4FAJA 2DXYA 1OQGA 3CI8A 1JEVA 4QSDA 5IAIA 3QAXA 1FTJA 1NNFA 1B52A 5AA3A 1N7XA 4KFQA 1RKMA 4GIZA 1B46A 3TTRA 3OOAA 1M5FA 1LBBA 1MPCA 3JV9A 3H6UA 4KR5A 1M5DA 1FQBA 1Y3NA 1FTMA 1SI0A 3PUZE 1D4NA 3W15C 1LCTA 2PT1A 3ZS6A 1IITA 4G8HA 2ZNSA 2XXHA 3L6HA 4RPNA 4F3BA 2KLFA 4KCDA 3PPRA 3OD7A 3SEUA 5H8FB 1O64A 2UVHA 3EHTA 4YKKA 4OERA 5CC2A 1IQ7A 2V3UA 1R9LA 5BWJA 2DSFA 5DTBA 3FJ7A 4U23A 4BLAA 5I2NB 4KD5A 1IEJA 3D4CA 4MLVA 2GH9A 3LC8A 3HV1A 2GHBA 4H5GA 4F18A 1A8FA 4MH5A 3H6VA 4RA1A 1NH8A 1BIYA 4QRZA 2PMSA 3MZ9A 2ZNUA 3TODA 4Q0CA 4EF2A 4F2OA 4HCWA 3HSTA 2BJJX 4XKRA 1B5HA 1ANFA 2V25A 3TPAA 4R6KA 4DE8A 5DYHA 4OEVA 4KQPA 2F36A 3UP9A 4U22A 3KJTA 1ZBMA 5K2XA 3PPNA 1LFGA 3BKIB 5I59A 2I49A 5I2KA 4ZEIA 2DE4A 3CFLA 1QKAA 1LB8A 1SW4A 3TTNA 3K4UA 1OMPA 1MQIA 4R74A 2XXTA 2ZYMA 3HHGA 1FQCA 1MY3A 1FTKA 2E0SA 4R9FA 1A55A 3IOWA 1F9BA 2F6PA 5KCJB 3TKDA 3FUZA 2RF1A 4DXBA 1JEUA 3K6XA 4LVQA 5CMKA 3CFZA 3DM0A 3KSXA 3O6IA 3PPQA 3LSWA 3IAZA 4QFLA 4P0GA 4MBPA 5ICTA 1O63A 3K6UA 2FA7A 3O6GA 1WDNA 3PUWE 4NF4A 4KHZE 3N6UA 4PP0A 2DE3A 2LAOA 4IO6A 2A5TB 3M3FA 4RJZA 5DEXA 5DVIA 2O7UA 2PVUA 1AL3A 3VDFA 3VXCA 4G68A 3AXFA 3RPWA 4XXUA 1DTGA 1GVCA 3B6QA 4BDQA 4GXAA 3EF7A 4EQ7A 1TFDA 1MY1A 2Y7WA 3B7DA 4OHNA 2VP1A 4NF8A 1Z7NE 1Y1ZA 3QUJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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