1P1QA

Crystal structure of the glur2 ligand binding core (s1s2j) l650t mutant in complex with ampa
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 81
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1qA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1qA01
4H8IA 3IB0A 1POY1 2XXYA 3L6HA 3M8UA 1B7ZA 5K2XA 1FQFA 3H6VA 5L9MA 3FVOA 1LLSA 3UIFA 3IO6A 2ZYOA 3Q28A 1ZLQA 2O1MA 3OD7A 2DOJA 3JZJA 1SVXB 3O6GA 4R9GA 4JSDA 4H5FA 3MPLA 3RGYA 4KCCA 3W15C 2PT1A 3W9WA 2QSXA 3FVGA 3R6UA 3LBSA 3S2VA 3D4CA 3PUZE 1B4HA 5FHNA 3T9XB 1ZIUA 3M3KA 2H25A 3HPIA 5H8QB 1N0TA 2CZLA 2GFEA 3SEXA 1XT8A 2UVJA 4H1XA 2OWSA 4UA8A 5HPQA 1TT1A 3MZ1A 3BBRA 4JWYA 4POXA 1UIVA 3F11A 1PB7A 4C1UA 1IXHA 2OBGA 1N3XA 1ZKBA 1IUDA 4KYDA 3VDFA 4X1DA 2QMWA 2F7CA 5CM6A 3MUQA 4R6HA 5H8QA 1RYXA 4C0RA 2X7PA 4DDDA 3PUWE 4TLMB 3G7WA 1M5CA 3N6TA 3RY3A 4THIA 1PBQA 1FW0A 1BIYA 4FEBA 2YPNA 2DS9A 3G3KA 4NWDA 1PC3A 3R7XA 4YMAA 3RTWB 1B7UA 3HO7A 1LAXA 4RA1A 5FTIA 2P1SA 4QRZA 4ZEKA 3KN8A 3MW0A 1BKAA 1JW1A 1B46A 3H6TA 3QSLA 4OMBA 1AIVA 3OENA 4TOZA 3MZ9A 4LUBA 4QF9A 3PMXA 1SBPA 4OYVA 4M4GA 4X1BA 1JEUA 3G3FA 3K02A 2H4IA 3KSJA 4NF8A 1Z7ME 3MAMA 4ZEBA 2HFBA 2REGA 1DSNA 1D9YA 1OLCA 2Q88A 2H99A 4F22A 4U4XA 1SQYA 1D4NA 1F9BA 3HHFA 1MXXA 2V3UA 1XVYA 3FUZA 4F19A 2HQ0A 2ZNSA 2XHDA 4LONB 1MM7A 1MXZA 2H5YA 1MXYA 2IA4A 1ANFA 3ILUB 5AE4A 4YKJA 2XXXA 3CFXA 1FQAA 1Y1MA 3KBRA 1H3DA 3UORA 1B05A 3TPAA 4OVJA 3PPQA 1Q1KA 4RYAA 3G3IA 5CMKA 2DWAA 3RT8A 1I6BA 2PT2A 1VE4A 2RKMA 2REJA 3K6XA 4KYSA 2XX7A 5H8HB 3KZGA 1RKMA 3CG1A 2B3FA 4MH5A 5AA2B 1VFEA 4EF2A 2VGQA 5H8SA 2G29A 2V3QA 1DMBA 3KOSA 3S4UA 2XXPA 3IK6B 3FJ7A 4H6DA 4IO2A 3MVZA 3E9XA 3H03A 1DOTA 2I48A 3QUJA 3SEWA 4NF4B 1ELJA 1LFHA 4QFPA 1B3EA 4LVQA 4ECFA 1P1NA 1PEBA 4F31B 1USYH 3HSTA 5H8HA 4G8NA 3T9UA 4P0IA 4GRKA 4IGTA 2D5WA 1P1UA 1L5TA 5AA2A 3N6UA 3PV0E 3V8XB 4F39A 1A8EA 2F5XA 5I59B 2PBWA 4DXUA 2E0SA 4NF4A 4U21A 4IGRA 3B7DA 1DTGA 3SEUA 1N04A 2Q8JA 4EDPA 3IR1A 1IIWA 1B3LA 1OQGA 2DYXA 3K1PA 1XC1A 2RINA 5HM4B 2D21A 5JK4A 1R1NA 4EXLA 4F3GA 5DT6A 1Z7NE 3L6GA 5I59A 3KGCA 1USYE 2BJJX 1FQCA 3LSFB 4H65A 1LB9A 3UGWA 4ZEFA 4GL8A 1AMFA 4DIGA 3TKDA 4XKRA 1GV8A 1S9TA 3QAXA 4EQ9A 1P1WA 3MVXA 5KDTB 4EQBA 2A5SA 3GXAA 4F2OA 2FNCA 1EZOA 4O3BA 5EHMA 4BDNA 4DLDA 1OMPA 1LAHE 4OEVA 1B32A 1P99A 2F8DA 3ECRA 1T0KA 4FE8A 2Z8DA 5K2YA 3KJ7A 3SETA 2I0BA 1NNTA 4OXVA 3LSWA 1MDQA 2I49A 3FXQA 1PB8A 4G68B 1M5EA 3OOAA 5KDTA 3EQ1A 4PETA 1QUKA 2XXVA 3MJNA 4GL0A 2YJPA 3OXNA 4OFOA 5I57B 4GLIA 4YKIA 1YPNA 2UVHA 3Q26A 3M3LA 2XXIA 3CFLA 1VFDA 4L17A 4WEDA 4EF1A 1LCTA 1FTLA 3IORA 3R26A 2XXTA 1FCKA 1IITA 1MPDA 4F3SA 4QHQA 1LAFE 4ESXA 3VXCA 4FJPA 3PUYE 4ZEIA 4KCDA 1I6QA 4AB6A 3PU5A 4G68A 1M5BA 4GOTA 1Y20A 1Y4CA 3FATA 2Y7KA 1NFTA 1FQBA 4E0XA 4ZEDA 3S9NC 2Z23A 2V93A 2HEUA 1A54A 1LBBA 1IEJA 3FV2A 3O28A 1AOVA 4F29A 4JXIA 3B6TA 4QFNA 3OO6A 1MY2A 3MP6A 3TUSA 1LB8A 1UTHB 4I9DA 1NNKA 4PFYA 1BP5A 3PUVE 3EF7A 3A09A 2QS1A 4LZ5A 1QUIA 1SW4A 3MPKA 1IXIA 1LBCA 3VLVA 4H67A 3T96B 3ZKLA 2G93A 3G3GA 4POWA 1B52A 4I8CA 1ZTYA 3K4UA 1BTJA 4OETA 4AQ4A 1TXFA 3TFLA 2QMXA 4I1DA 3SESA 4DE8A 3DP6A 4XIGQ 3KG2A 3DP8A 2RC8A 3T9HB 2NUVA 2UXAA 4NWCA 3ODBA 2AL5A 4O3CA 4U1ZA 3RN8A 4QSDA 5AA2D 2ZYKA 4G8MA 3MVYA 4GD5A 2XD2A 3RUMA 3K6WA 2ONRA 3V83A 4HCWA 2DE3A 1B5JA 4KPTA 2E1SA 4ZECA 4NEDA 4YAHX 1XVXA 2V84A 4OQOA 1B3FA 3C32A 2B3BA 4AB5A 1NKXA 3WAFA 4ZZAA 3SDFA 4OFLA 4KQPA 2DWIA 3I5OA 3C31A 4YB5A 1ZU0A 2ABHA 4KR5A 4GF8A 3H6UA 3LSXA 4XKQA 4WEPA 3N5LA 3PPRA 3TTKA 2QRYA 4NTLA 1QJMA 5I56B 2QJEA 4R2FA 3QUFA 2GHAA 4ISUA 2XXQA 2QS4A 4GIZA 3EHUA 5CC2A 5CBRA 2XX8A 5LOMA 1O64A 4GFRA 2A5TB 2V3TA 3K1MA 1JW4A 4G77A 3UN6A 2THIA 4YKPA 3RQTA 1R9QA 2P0SA 1US4A 3H4ZA 1P1OA 3TODA 5I56A 4IB2A 5FHMA 1EU8A 2R6GE 3UK4A 4FIMA 1JW5A 3VFJA 3OSQA 2HZKA 2I0CA 3TQLA 5DVJA 2O51A 4R73A 1CE2A 5I84A 5TPAB 1M5FA 3Q27A 4KD5A 5HBCA 3VE1B 4F1UA 1MXVA 1NH7A 4LATA 5IAIA 1PB9A 3O6IA 5CBSA 3O29A 3H3GA 4R72A 3ILTB 1MDP1 4X9TA 3CSBA 5JTYB 4LQ2A 1FTJA 1FTMA 3FVKA 2RF1A 2QS3A 3G3JA 5L8DA 3MP8A 4DXCA 1YTVA 4YU0A 4C1TA 1B7HA 4Q0CA 5ITOA 4JBZA 4O3AA 2H98A 4RJZA 3K0VA 3BKIB 3PGFA 4RK9A 3PD9A 3G3HA 2RCBA 3LSLA 1SI1A 3OEMA 2YLNA 1Q35A 2XXUA 2ZYNA 5DVIA 3PMVA 3KN7A 1BLFA 1TWYA 4P0GA 4UACA 5DVFA 4BLAA 5JTYA 3CRBA 2UYEA 1OLAA 4KHZE 3K01A 4QFLA 1MXWA 5B70A 1HSLA 2ZNTA 3JV9A 3T9VA 4PE5B 1EZPA 2NOOA 4HTGA 3ONMA 4NMYA 4OEUA 3B6QA 3CFZA 3QXMA 1QKAA 3B6WA 1SI0A 4JB7A 2KLFA 1TFDA 5CMMA 1B1XA 1MRPA 5I2KB 4OERA 4JDFA 4QFKA 1JEVA 4IO7A 2OCUA 2LAOA 1JVYA 3FJMA 5KCJB 3OO9A 1Y3PA 1LFGA 4MLVA 3TCGA 1MY0A 3C33A 1GVCA 5M2VA 1MG1A 3IOVA 3TCFA 3GBBA 4BDRA 5BWJA 2F35A 4JWOA 1H43A 1UQWA 3OO8A 4F2QA 4R6KA 4MLQA 4EUOA 4R2BA 3T22A 1B51A 3VLWA 4ESWA 4NE4A 2F78A 1D9VA 2VD3A 1JNFA 1SW1A 5I2KA 2Z8FA 3RT6B 4JWXA 2F97A 3FXRA 1US5A 4LP2B 2AL4A 2W7YA 2PYYA 5CRYA 5DYHA 3TCHA 4HCYA 2M8CA 4M1VA 1ATGA 3KFMA 1QULA 3CI8A 5TU0A 3U1OA 2ANJA 1NNFA 4PP0A 5DEXB 1HSJA 5AA3A 2ONKE 2B65A 3TTMA 1DPEA 4MBPA 1FTKA 2Z22A 2P2AA 3LUYA 3M3FA 1SW2A 3IX1A 2GRVA 2R9JA 4IO6A 3MWBA 4EQ7A 2FYIA 1QW0A 1JETA 3ZS6A 5DEXA 1MQHA 1MQDA 4QFOA 4GXSB 4H8JA 1EH3A 1ZMGA 4IY6A 5AA1A 2I6EA 3GLBA 5JEIA 4Q8RA 3ZSFA 4H5GA 2F34A 2PX1A 1Y4TA 4TQUQ 5KZTA 2VHAA 4YICA 2I58A 2UVIA 2I3VA 3USDA 1B3GA 3IL1B 3IJOB 1URSA 3IJXB 2UYFA 5I57A 3GZGA 2O7UA 3BFUA 2XXHA 3SERA 3Q25A 1N76A 4LZ8A 2DXRA 4OZ9A 5F7VA 5L9SA 1AH5A 1MQJA 2X26A 2O84X 4GXAA 1B5IA 5ICTA 2Q89A 3V89B 3MC2A 4R75A 4BDQA 3A3UA 4KI0E 4ZDMA 2DSFA 1IXGA 1MS7A 3RTFB 4ZS9A 1WODA 2WKYA 1MH3A 1Y3QA 4PFTA 2F7AA 1II5A 4H0WA 1XOCA 3VXBA 4GWOA 4F1YA 2ZMBA 2OLBA 4MFIA 4U4SA 3IO4A 3OO7A 2Y7WA 5CI5A 5ITPA 1GR2A 1N84A 5EHSA 1B0HA 2Y7IA 2QPQA 1FQDA 3BFTA 1ZJLA 1LAGE 1GGGA 2DVZA 4ONYA 1NNPA 2DWHA 1UTHA 4N13A 2QL3A 1SYHA 3S9MC 4K3FA 3PPPA 2XD3A 2DP8A 2V25A 4ELQA 5I2NB 2RC9A 1DTZA 1MH4A 3FJGA 1YAEA 3MVWA 4YKKA 3VVDA 3CSGA 3KOTA 4R74A 5I58B 3O2AA 3TQWA 1OQHA 4JSOA 1MPBA 3FXUA 2RCAA 4RNSA 3LR1A 3H06B 5ICQA 2I4CA 4ELRA 3KJTA 4GVOA 1WVJA 1FQEA 3K00A 3K1NA 3TMGA 3OMBA 5H8FB 4U2RA 4BDOA 2VD2A 5I2NA 4LQ5A 1MY3A 3CR9A 4YZZA 3PUXE 3THIA 3PMWA 1AL3A 3FZVA 5BUUA 3P7IA 5I58A 1EZ9A 4OTEA 4OENA 2DQVA 2CMOA 1H45A 4NF6B 1PDAA 1MXUA 2UVGA 1NL5A 4ELPA 4WKMA 3C36A 3JYRA 3CG3A 1GTKA 3HCQA 5H8FA 2F6PA 3D4GA 1P1QA 1VSOA 4F18A 2OK2A 4HW8A 4NF8B 1N7XA 3H7MA 3QK6A 2ALUA 1JQFA 1B3HA 3TEPA 4Z7EA 3E3KA 2HCAA 1XS5A 2FA7A 3TYHA 2I4BA 2ZNUA 5ELVA 1B9JA 4NF6A 4XKPA 2NWJA 1A55A 4Z0IA 3IB2A 3W9VA 3RLFE 4DXBA 4XTCQ 2GH9A 3O9PA 2Y7RA 4YB6A 1OVTA 3A3CA 3KN3A 5L9OA 4RPNA 3EHTA 4U1OA 2DVCA 2HAVA 1O7TA 4ZE9A 3VV5A 3SEVA 3EHSA 5CMCA 3FIRA 3TTLA 5F1QA 3OELA 2O6AA 3LC8A 2A5TA 1IQ7A 3K6VA 3HHGA 1LFIA 3C34A 1NH8A 1B0LA 1D3KA 2DWJA 3S9EA 1JVXA 2HAUA 3K6UA 1A40A 3TAJA 1Y3NA 4BDMA 1SW5A 2H9BA 1VR5A 4LZ7A 2HZLA 4XXUA 5B7DA 3SEYA 4OFJA 2F7BA 1B5HA 3IOTA 2DE4A 2PMSA 3VVEA 2O69A 2I3WA 3H6WA 4ELOA 4FECA 4RXLA 4WXJA 1S50A 5ISUA 1Y1ZA 5TPAA 4N07A 4RPOA 3VLUA 3FD3A 3TDJA 3FVNA 1N3WA 3UP9A 2RC7A 3O97A 4X48A 2XX9A 2O1LA 1LGBC 4TLLB 1IZ1A 3DM0A 3U72A 3RPWA 1MY1A 1A7LA 4GQOA 1I69A 4DCYA 5J1DA 1KWHA 3T93B 2OJTA 3SKPA 3EN3A 1O63A 1NMUA 2IEEA 4E0WA 3IOWA 2Q2CA 4IO5A 2F6GA 4LA9A 2ZYMA 4G8HA 5A5XB 1MPCA 3CIJA 1I6AA 2DE2A 1DPPA 1SYIA 3KSXA 1S7YA 3KEIA 2HXWA 1QKBA 3WAEA 1LCFA 1TFAA 2O7IA 1URDA 3TZAA 2NXOA 1B58A 1Y9UA 5DTBA 5FTHA 4QSCA 2ZXTA 1B4ZA 4R6YA 1SD3A 1UIUA 2O68A 3PPOA 3QIMA 4MF3A 1N7WA 3DP4A 2OZZA 2AIXA 2XXWA 4N6PA 3UA8A 5A5XA 3IAZA 1WDNA 1H44A 3U92A 3ZKKA 2XXRA 2VOZA 2ESNA 3PD8A 4F3PA 5IKBA 4OHNA 3DELB 2QS2A 1MM6A 1IXCA 1B6HA 3FGSA 5H8NB 2Z8EA 3IB1A 4FORA 4DZ1A 2NVUB 5KCJA 1B1HA 1ZBMA 3I6VA 1MQIA 4PQJA 2ONSA 3MBPA 3K2DA 3FASA 1M5DA 4U22A 3PPNA 3T66A 4IO4A 4F1VA 3TTNA 3O6HA 1SDXA 4G68C 4Q5TA 2Y84A 2OWTA 3EPEA 3VVFA 4RY1A 3U93A 3TTRA 4OESA 3QYTA 1QVSA 1YCJA 5AA4B 4FEDA 2DXYA 2Q9TA 5H8NA 1H76A 4PFWA 1R9LA 3IOUA 3O66A 1A99A 1UTBB 3RNNA 1FTOA 4PFUA 1URGA 3CVGA 4XKNA 5EYFA 1LSTA 5TP9B 3U94A 1HSEA 3V5AA 3AXFA 4P11A 4BDLA 3E4RA 3N94A 2R71A 4QSEA 5CMBA 2X7QA 4ZZEA 3HN0A 4RK2A 1A8FA 5AA4A 1J1NA 3U8QA 1R6ZA 4KYEA 1OIBA 2GHBA 4YB7A 4DCXA 4NF5B 4Q30B 3OEKA 3MZBA 2VP1A 1POTA 1UTBA 3I3VA 1OVBA 3C9HA 4R9FA 5TP9A 1RYOA 1PBPA 4G4PA 3TELA 3C4MA 4FAJA 1XHYA 1QUJA 3FV1A 4IO3A 1B2HA 1MQGA 3OSRA 4F3BA 2Q2AA 4ND9A 4YMBA 4I62A 3DLNA 4FATA 2AYSA 2PVUA 4EXKA 3C35A 3E13X 4NF5A 4OWDA 2D3IA 4HS7A 2F36A 4IY5A 1CB6A 4U23A 3S9LC 3HV1A 4G2ZA 1B40A 3MQ9A 3N26A 4ZE8A 4KFQA 5FHOA 2Y7PA 3GBAA 3Q29A 3MP1A 1MY4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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