1P1UA

Crystal structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) l650t mutant in complex with ampa (ammonium sulfate crystal form)
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTTDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tuning activation of the AMPA-sensitive GluR2 ion channel by genetic adjustment of agonist-induced conformational changes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 258
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-04-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1uA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p1uA01
2UVGA 1B4HA 1N0TA 1PBPA 5FHMA 4OMBA 3K01A 4X9TA 3FD3A 4Z0IA 3OXNA 5H8NA 1B32A 2DSFA 1NFTA 4H5FA 4F1VA 3MBPA 5B70A 3P7IA 5AA4A 2F7AA 4ESWA 3KN3A 3FVOA 1MH3A 1FTKA 4G2ZA 4YB5A 4QSEA 4EQBA 4PFTA 1SYIA 4KFQA 3T93B 3H6WA 3HO7A 2QMWA 4GF8A 3SEWA 4LZ8A 3C31A 3U93A 5KZTA 5AE4A 4AQ4A 1WODA 3FJMA 4H8JA 3O6IA 2F7BA 2XX9A 3CRBA 4LQ2A 3MP1A 3PPQA 4GRKA 2WKYA 2FYIA 5JK4A 3MWBA 2RC9A 4QFPA 3VDFA 3V8XB 3HV1A 4H0WA 4GWOA 2QS4A 1WVJA 3MVXA 1B3LA 2ZYNA 3G3FA 2D21A 3VLVA 2Q9TA 3H3GA 3CR9A 3MVYA 4KYSA 3A3UA 1QW0A 2OBGA 1B0LA 1BLFA 2XXXA 4OFOA 1VFDA 3CFZA 2OWSA 1LSTA 2XD2A 4NWDA 3FVGA 2R71A 2Y84A 5JTYB 3IO6A 5I56A 1AMFA 4NWCA 4R9FA 3DELB 2HEUA 4U1ZA 4DCYA 1Y3QA 3PMXA 2IA4A 1D9VA 5I2NB 2XHDA 4IGTA 3KEIA 3I5OA 3V83A 2DVZA 4OETA 4Q8RA 4GLIA 3EQ1A 4F29A 5KCJA 1MY1A 4RXLA 4NF4B 5FHNA 1A8FA 3TPAA 3VLWA 1A54A 4GIZA 3SESA 2X7PA 3SEYA 5I59B 4DZ1A 1N7XA 4RJZA 4QFOA 1UTHB 1USYH 3O28A 4MBPA 3A09A 1SVXB 2HAUA 3QSLA 2P1SA 3W15C 1MQHA 3LSLA 1ELJA 2O1MA 1TWYA 3M3FA 4QF9A 1IXCA 1MDQA 3PMVA 2XXUA 1GV8A 4R75A 1GTKA 4F3GA 2A5TA 3VVFA 3H03A 3C36A 1QKBA 1EH3A 1DTZA 3QIMA 1A8EA 3I6VA 4R6KA 4F39A 4YB6A 5H8QA 3IO4A 3PPPA 1VR5A 4G8HA 5HPQA 1B3GA 2XXTA 4GFRA 3GZGA 2REGA 3C4MA 2XXYA 3RY3A 1B58A 3PD8A 4QHQA 1QUIA 2O7UA 3FASA 1EU8A 3EHSA 5DTBA 3PUVE 3O6GA 5AA2A 4R73A 5F1QA 2Q88A 4G8NA 3FIRA 2DXRA 3ZSFA 1SD3A 4OFJA 5ICQA 3I3VA 4XKPA 1R9LA 2X26A 4Q5TA 2F97A 4H67A 2DWHA 2XXHA 4G68C 1T0KA 1Z7NE 3KN8A 1TFAA 3MPLA 4MH5A 3IL1B 4YKKA 1B9JA 5I2KA 4U22A 1LCTA 1QUJA 5EHMA 1MM7A 1ANFA 4ECFA 1YPNA 1XHYA 4G4PA 2Z8FA 3IB2A 3KZGA 5TP9A 4OEVA 1IXGA 2F36A 3U72A 4GOTA 1MQJA 3GXAA 4JWXA 3HHGA 1AIVA 3V89B 3W9VA 4N07A 1I6AA 4YICA 5A5XA 1SI1A 3HCQA 3R6UA 3D4GA 1MPDA 1YCJA 4I9DA 1B3EA 2UVHA 4KYDA 3S9NC 1B7ZA 5ITPA 4WEDA 3JYRA 3UN6A 1AH5A 2D5WA 2R6GE 4LZ5A 3S2VA 3CFXA 4N6PA 4OQOA 4EQ7A 1JQFA 3MQ9A 4OENA 2G93A 2UVIA 5FHOA 3BBRA 4IO2A 2XX8A 3RN8A 3G3IA 4RPOA 1MH4A 5TPAB 2YLNA 3TTRA 1UIVA 4PFUA 2QRYA 4KCDA 1NH7A 2Y7KA 4F19A 5I57A 4AB5A 1JNFA 4X1DA 3GBBA 5H8HB 4QSDA 2F6PA 2BJJX 3MAMA 4ZECA 1MY3A 3FVKA 1RYOA 1N7WA 3OMBA 1DSNA 5DVFA 2RCBA 2H5YA 1LCFA 4THIA 4P11A 3LSWA 4MF3A 3TUSA 4OTEA 4YZZA 5IAIA 3PPNA 2GH9A 4RY1A 3K6XA 3MW0A 2E1SA 2X7QA 3KSXA 2ZYKA 4EF2A 5HM4B 5H8FB 3TCHA 2ZXTA 4KCCA 5F7VA 4R2FA 3CFLA 3MJNA 5J1DA 1S50A 1XS5A 4QSCA 4PFWA 1CB6A 3EPEA 2OJTA 1TXFA 2O6AA 1NL5A 1NH8A 2YPNA 2ZNUA 1AL3A 3TTNA 3IORA 4WEPA 5CBSA 3K6UA 2THIA 2I0CA 4GXAA 3TQLA 4Q30B 2ESNA 3MP8A 4YMBA 3R7XA 1HSJA 3FZVA 3IOVA 2QJEA 3DM0A 3FJ7A 1ZTYA 1MXYA 5FTIA 1SW1A 1US5A 1XC1A 1B6HA 4C1TA 4LONB 3LSXA 4ZEKA 3IK6B 1P1UA 3VVDA 1LAFE 2I58A 1URSA 3G7WA 4I1DA 1EZPA 3MC2A 4JDFA 4KHZE 5EHSA 4OZ9A 3TMGA 3UP9A 3D4CA 3K0VA 1JEVA 2Z8DA 2DP8A 1RKMA 3PUWE 3H6VA 3GLBA 2O68A 1S9TA 5DEXB 4GL0A 3CG1A 1FTMA 1I6QA 2HZKA 3C33A 3SKPA 1Y1ZA 3EF7A 2GFEA 3IB1A 1Q35A 1LLSA 2F6GA 4E0XA 3OOAA 2VD2A 1N84A 2HXWA 4X1BA 1VSOA 1B0HA 5JEIA 1MXZA 3H06B 1FQFA 3UA8A 3BFTA 4LA9A 2RF1A 1MXXA 4LVQA 1BKAA 2PBWA 1UTBB 1GR2A 2V3TA 1MPCA 1R9QA 4HCWA 3RT6B 1FQDA 4NF4A 1MM6A 1MXUA 3BKIB 1P1OA 2ZYMA 1B51A 3N6TA 1FTJA 4NF8B 5I59A 3O9PA 4FEDA 4LZ7A 4ONYA 1UTHA 2F34A 2QPQA 3OENA 4PE5B 4ZEIA 2V84A 4ZE9A 1O7TA 3PUXE 1LFIA 4POXA 2RC7A 4EXLA 4QRZA 2B65A 3RUMA 2VP1A 2V93A 3PV0E 5CRYA 3K6WA 1POTA 4G68B 1B1XA 4WKMA 2VHAA 4F31B 1JW5A 1Y3PA 3EHUA 5M2VA 2ONKE 1PDAA 3S4UA 3TKDA 3KBRA 1JETA 3AXFA 3Q25A 1QUKA 4XTCQ 4N13A 1D4NA 5KDTA 1IUDA 4XKQA 4IO6A 4H65A 4EF1A 3VE1B 2UYEA 1A99A 1P1WA 4BDRA 2DE4A 3CI8A 1Y4TA 3O29A 4OWDA 5DYHA 2ZNTA 3OEKA 4NEDA 3U94A 3E13X 3T96B 4QFNA 4MLQA 2DS9A 2CZLA 2ZNSA 3G3JA 1B46A 3LUYA 2I6EA 3T66A 3TZAA 1IXIA 1KWHA 3USDA 5EYFA 4RPNA 3B7DA 2GHAA 3K1NA 4KI0E 3R26A 1N76A 3K6VA 1L5TA 2NWJA 1IEJA 1MXVA 1FTOA 3O2AA 3ECRA 4Q0CA 3C32A 1PEBA 3SDFA 2QMXA 4FORA 3CSBA 2PYYA 3RPWA 2O84X 5CMBA 3T9HB 1B2HA 3IB0A 4LATA 3V5AA 4F1YA 1QVSA 4GQOA 1ZJLA 3FV2A 4XKNA 4O3CA 2HZLA 1NMUA 1RYXA 1VFEA 2R9JA 1F9BA 5TU0A 4XKRA 2KLFA 1MQIA 1ZU0A 1MQGA 2NXOA 4RNSA 3B6WA 3ILUB 3C35A 4EUOA 2H98A 2OZZA 2XXVA 3W9WA 2I4CA 3VXCA 3THIA 1H45A 1J1NA 3RGYA 5TPAA 2F78A 4JWYA 4HS7A 1B52A 3GBAA 4U4XA 3S9EA 5K2YA 4C1UA 3DP4A 1JW4A 3TEPA 3K1MA 1H3DA 1DTGA 3FVNA 1YTVA 3WAFA 4K3FA 4IO4A 3Q28A 3TTKA 3U92A 4YKPA 4JBZA 3E9XA 2DOJA 3U1OA 1LGBC 4NF6B 4F1UA 3KOSA 4DLDA 1I6BA 3MUQA 1A55A 5L9SA 3QUFA 2AL5A 1R1NA 3IOTA 3JV9A 4ELOA 4GD5A 4YKIA 3E4RA 4O3BA 3HN0A 2XD3A 3KOTA 4KYEA 1ZKBA 4IO7A 3ZKLA 3OSRA 1DMBA 3VLUA 5H8FA 2F7CA 3PU5A 2AYSA 4U23A 4NMYA 3TCGA 3DP6A 1A7LA 1SBPA 1BIYA 4H6DA 2Y7WA 1H43A 5H8QB 1SW2A 3VFJA 4XXUA 2Z22A 3KJ7A 3JZJA 1B05A 5CI5A 2F5XA 5DVIA 1D9YA 2XXRA 1JVXA 1R6ZA 1QKAA 3DLNA 3FJGA 4P0IA 1M5CA 2XXPA 4TQUQ 2Q89A 1ZMGA 2Y7IA 2D3IA 2ALUA 3KGCA 5BWJA 2P2AA 4H1XA 2GRVA 4JXIA 1ZBMA 4M4GA 1IQ7A 4OHNA 1MG1A 4QFKA 3QK6A 3KN7A 1PB7A 4ZE8A 3LC8A 1H76A 1LBCA 1IZ1A 4H8IA 4WXJA 4I62A 2OK2A 5L9MA 3U8QA 1OIBA 4R72A 5ELVA 3B6QA 4RYAA 2Z23A 1IIWA 4U21A 1ZIUA 2HAVA 3ONMA 1UIUA 4G77A 5DEXA 4IO5A 1GGGA 2Q2CA 3TYHA 2E0SA 3VVEA 4YU0A 2QSXA 1Y20A 2RINA 4IGRA 5B7DA 1XVYA 1PB8A 1MY4A 3CSGA 3LBSA 1P99A 1B7HA 4NF5B 3UIFA 4C0RA 1DOTA 1FQEA 4FECA 1QULA 1OLCA 3A3CA 3Q27A 1FTLA 1UTBA 1JEUA 1Q1KA 3IR1A 3ODBA 4KQPA 1OQGA 1NNFA 2HCAA 4NE4A 5I84A 4MFIA 1LB8A 4NF8A 2ABHA 1M5FA 3K4UA 4F2OA 2VOZA 4ZZAA 1TT1A 1B5IA 2M8CA 3FUZA 1M5BA 3T9XB 1Y9UA 4ELRA 4BDNA 1US4A 1EZ9A 2YJPA 3ZS6A 1HSLA 1YAEA 3O66A 4BDLA 4JWOA 4DXUA 4G68A 1O64A 4KD5A 2LAOA 2QS1A 3RNNA 4R6YA 4POWA 3QYTA 1JW1A 2AIXA 5BUUA 5JTYA 5DVJA 4OERA 4JB7A 2NOOA 2H99A 1LFGA 3N26A 5I58B 5I2NA 1MY2A 4ESXA 3L6GA 1FW0A 2DYXA 3G3GA 4ZDMA 1FQAA 4R74A 3O6HA 3VXBA 4OVJA 3WAEA 3UK4A 4L17A 2H25A 3VV5A 3RTWB 4DIGA 4EQ9A 3ILTB 1B5HA 1P1QA 2Z8EA 4OEUA 5CMCA 4F3PA 4ND9A 1WDNA 5H8SA 4IO3A 1LAGE 3TELA 4DXCA 3OD7A 1NNPA 1MPBA 4I8CA 3TCFA 1OMPA 3T9VA 2VD3A 3IOUA 3TODA 2F35A 4ELQA 2DE2A 1LAXA 1LFHA 2F8DA 4HCYA 1IXHA 1B4ZA 1S7YA 3Q26A 3MP6A 1OVTA 4LP2B 4TLMB 2DXYA 3RQTA 3IJOB 4Z7EA 3KG2A 1NKXA 2FA7A 5AA3A 4GVOA 3OO8A 3FATA 4OESA 2O1LA 3M3KA 1TFDA 5L9OA 5H8NB 4TLLB 4P0GA 4IY6A 3H6TA 4YB7A 1MQDA 2ZMBA 5ITOA 1MRPA 4MLVA 5HBCA 2ZYOA 5AA4B 2B3FA 3TAJA 4RA1A 1IITA 1SW5A 2H9BA 1NNKA 1MS7A 1O63A 4OFLA 3MZ9A 4OYVA 1Y4CA 4U2RA 4FJPA 1LAHE 3S9MC 3EHTA 2RC8A 5CBRA 4KR5A 1HSEA 3IX1A 4IY5A 1P1NA 5CMKA 1D3KA 1URGA 2I0BA 1PBQA 2H4IA 4FAJA 5CC2A 4FATA 5L8DA 4YAHX 4RK2A 1GVCA 2DWIA 2XX7A 3PMWA 4NF6A 2G29A 3H7MA 5ISUA 4EXKA 4DXBA 4FEBA 3IOWA 4KPTA 3RTFB 4G8MA 2Y7RA 2NUVA 2PX1A 4ISUA 2O69A 3CVGA 3L6HA 2RKMA 2REJA 1PB9A 3CIJA 3O97A 2I3WA 3MVWA 4DCXA 1M5DA 3FXRA 5CMMA 2Y7PA 4X48A 3SETA 1FCKA 3MZBA 4U4SA 3OO7A 3H4ZA 3DP8A 3K00A 4FE8A 4PP0A 5ICTA 3N6UA 5I56B 2VGQA 2HQ0A 3C34A 2Q8JA 1SQYA 1II5A 3K1PA 1B3FA 5KDTB 1BP5A 3OO9A 1Z7ME 4YMAA 2V25A 1XT8A 4U1OA 4PFYA 2V3UA 1OVBA 3PPRA 3HPIA 3C9HA 2ONSA 2GHBA 2W7YA 2OCUA 1SDXA 5KCJB 4F22A 4O3AA 3MVZA 4H5GA 2UYFA 1SYHA 2CMOA 4JSDA 4F18A 3TTLA 5H8HA 4LQ5A 3HHFA 1CE2A 3Q29A 4ZZEA 3K02A 4ZEFA 2Q2AA 3OSQA 3KFMA 5LOMA 1B5JA 1AOVA 1B7UA 3G3HA 1SI0A 4ZEDA 4EDPA 1A40A 4ZEBA 4PETA 3LSFB 2A5SA 3KSJA 4HTGA 3SEVA 1ATGA 4FIMA 3BFUA 1XOCA 2O7IA 4TOZA 2HFBA 2A5TB 2FNCA 2UXAA 4OXVA 4E0WA 3N94A 3OEMA 3OO6A 2DWJA 1B3HA 1LBBA 3EN3A 1H44A 2DQVA 2I49A 4DE8A 3SEXA 4NF5A 4BDQA 2ANJA 3IAZA 2AL4A 3KJTA 4R6HA 3UGWA 3SERA 2I48A 3OELA 2P0SA 3HSTA 5AA2B 3FGSA 3QAXA 3MPKA 4RK9A 1LB9A 3PD9A 4R2BA 2V3QA 3FXUA 2XXQA 1N3XA 1OQHA 3G3KA 4F3SA 4XIGQ 2DE3A 3K2DA 5I2KB 3B6TA 1N3WA 2OLBA 1B40A 1JVYA 4HW8A 3T9UA 2PVUA 5AA1A 1NNTA 1ZLQA 1FQCA 3E3KA 2I4BA 3S9LC 5TP9B 3MZ1A 1SW4A 1POY1 4GXSB 5FTHA 4DDDA 3PGFA 4R9GA 1MY0A 2XXIA 1DPPA 4IB2A 1EZOA 1MDP1 2NVUB 5A5XB 3QXMA 2QS3A 2PT1A 2QL3A 2DWAA 4BDOA 1DPEA 4ELPA 1MXWA 2ONRA 2RCAA 1OLAA 4UACA 2PT2A 2OWTA 3M8UA 5IKBA 3FXQA 3FV1A 5K2XA 2UVJA 3RT8A 2QS2A 5I58A 4ZS9A 3PUYE 1I69A 3F11A 1VE4A 1FQBA 1M5EA 3PUZE 2IEEA 3TDJA 1Y3NA 4M1VA 4GL8A 1PC3A 3LR1A 4AB6A 4F2QA 1N04A 4YKJA 3N5LA 1QJMA 5DT6A 3QUJA 4F3BA 5CM6A 5I57B 3TTMA 1BTJA 3TFLA 1Y1MA 4QFLA 3PPOA 1UQWA 2DVCA 3SEUA 3ZKKA 4BLAA 1USYE 5AA2D 4PQJA 2PMSA 1URDA 4BDMA 3IJXB 2B3BA 3M3LA 4UA8A 3TQWA 4LUBA 3T22A 4NTLA 4JSOA 3H6UA 3UORA 2O51A 3RLFE 2I3VA 3CG3A 1XVXA 2XXWA 1B1HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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