1P99A

1.7a crystal structure of protein pg110 from staphylococcus aureus
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
KVTIGVASNDTKAWEKVKELAKKDDIDVEIKHFSDYNLPNKALNDGDIDMNAFQHFAFLDQYKKAHKGTKISALSTTVLAPLGIYSDKIKDVKKVKDGAKVVIPNDVSNQARALKLLEAAGLIKLKKDFGLAGTVKDITSNPKHLKITAVDAQQTARALSDVDIAVINNGVATKAGKDPKNDPIFLEKSNSDAVKPYINIVAVNDKDLDNKTYAKIVELYHSKEAQKALQEDVKDGEKPVNLSKDEIKAIETSLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The membrane-associated lipoprotein-9 GmpC from Staphylococcus aureus binds the dipeptide GlyMet via side chain interactions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein PG110
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus mu50
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p99A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p99A02
3FVKA 2RC9A 1SDXA 1S9TA 1RYOA 1Y3QA 4OFOA 3S9LC 3OO6A 3HSTA 2NWJA 5JTYA 3UORA 1LAFE 2XX9A 3MZBA 1JETA 4OENA 1B5HA 2XD2A 4QHQA 3IJOB 4H65A 5KZTA 4RXLA 4BDRA 3QUFA 4EUOA 4KQPA 3QIMA 3MAMA 1JVYA 1MG1A 2HFBA 1UTBA 1URSA 4GLIA 2RCAA 3CFXA 3W15C 4NF4B 3FV1A 4ZE8A 3PU5A 4BDLA 5ITPA 4JBZA 1QVSA 4YZZA 1VR5A 2VD2A 1PB8A 5DEXA 5ICTA 1B4ZA 2I4CA 2X7PA 5FHOA 4PFWA 4EXKA 2DWHA 3V8XB 4ND9A 1LFHA 1XHYA 4IY5A 4PFTA 1MXWA 1B5IA 3TCHA 1PBQA 5I56A 2DS9A 5CMKA 3W9VA 1AH5A 2DP8A 1FW0A 2V3TA 4F1UA 4EDPA 3RGYA 4R9FA 3IR1A 1EZ9A 1DMBA 2Y7IA 3MP6A 3N6UA 5AA3A 5H8NA 3QAXA 3SETA 3HV1A 1MY3A 4G8MA 1GVCA 3K0VA 5EYFA 2P2AA 4C1UA 4R2FA 1TFDA 3MVYA 1J1NA 3MPLA 3MUQA 1OVBA 1MQDA 4JWXA 5ITOA 4X1DA 1P1OA 4ZZAA 1MRPA 3FASA 1WVJA 3UP9A 4KCDA 1GV8A 3KSJA 3MJNA 4P11A 2DE4A 2QS2A 4FECA 1P1NA 3TCGA 4M1VA 3D4GA 3DM0A 3FGSA 4MH5A 3USDA 3G3GA 4LONB 5H8FA 3RT6B 5HPQA 3B6TA 3MQ9A 3EF7A 4FEDA 3VXCA 2O7IA 4FAJA 1B3HA 1F9BA 5HBCA 5JK4A 4NF4A 1B32A 3I3VA 1II5A 1B1XA 1NNTA 1QUKA 2H4IA 2REJA 3VLUA 2UVGA 2DXYA 3Q27A 2YJPA 4GL8A 5F1QA 3Q29A 4PFYA 4TLMB 2HZKA 4Q5TA 3VLVA 4U23A 5AA4B 3G3KA 3RPWA 2I3VA 2D5WA 2HZLA 3CG1A 4F18A 3KSXA 1Y3NA 1GR2A 4EF2A 4G68B 1ATGA 1KWHA 4QSEA 3OO8A 3T9VA 4I9DA 3PUWE 3MVWA 1MY1A 2VD3A 1I6BA 1MXXA 3MVXA 2R71A 2AIXA 3PD8A 1LB9A 1EZPA 1ZTYA 2ZYNA 2DWAA 4ONYA 1NMUA 4GQOA 4FATA 3IOUA 1LBBA 4TQUQ 1AOVA 1FQDA 4KR5A 4F19A 2XXQA 3FVOA 2I4BA 2PVUA 1IIWA 4LA9A 2OLBA 1Q1KA 1UIUA 1S50A 1MQGA 2ZXTA 3G7WA 1D9VA 2QS3A 3TAJA 3TTKA 2ALUA 1HSEA 1US4A 2LAOA 5K2YA 4KFQA 4XIGQ 3EN3A 1Y3PA 1Y9UA 2UVHA 5A5XB 5BWJA 1ELJA 1N3WA 3E3KA 3R7XA 2F6GA 2O84X 4IO6A 4GVOA 4YB5A 1FQBA 4HS7A 3TODA 1A8FA 1MXYA 1MDQA 5L9MA 3MVZA 1LFGA 1Y1MA 2Q2CA 5AA4A 1A55A 4LZ5A 4R74A 1LAXA 3KEIA 5L9OA 1QW0A 1XVYA 4DXUA 4G68A 5I57B 3DP8A 3T96B 3TTMA 1LB8A 4QFNA 4IGTA 4F2OA 4LATA 3TQWA 3VLWA 4O3AA 5TU0A 1NH7A 1SI0A 4GIZA 4F1YA 4DCXA 1N84A 4LUBA 4YKKA 3IAZA 3N5LA 3IB0A 4GRKA 3W9WA 3LSXA 3M3LA 1B3LA 2I48A 1MY2A 4F3GA 4JWOA 3F11A 2R9JA 2XXPA 3H03A 1UTBB 4N07A 4DE8A 4P0IA 2PT1A 3IL1B 2DVZA 3O66A 3ILUB 4ZZEA 1O64A 3SEWA 5DEXB 2F36A 1ZIUA 1BTJA 4OZ9A 1DTGA 3HHGA 4F39A 4G2ZA 2VHAA 3CSBA 2RCBA 2XXUA 4RK2A 1LGBC 1BKAA 4ZDMA 3H6WA 3H3GA 4H5FA 4U2RA 4O3BA 1P1UA 2XD3A 4UACA 4QFKA 3VVEA 2Q89A 3G3IA 4GF8A 4NWDA 2G29A 3TEPA 1I6AA 3C34A 3CI8A 2CZLA 4PE5B 2I0CA 1M5EA 1B3FA 3T9HB 2RKMA 3H06B 4U1ZA 4YKIA 2ZYKA 1MQJA 4JSOA 1SW4A 4H5GA 3KJTA 4R72A 3BFUA 4IGRA 4WEDA 1SW1A 3B7DA 2FNCA 1MH4A 1ANFA 3K4UA 3OO9A 4KPTA 4IY6A 4L17A 1JW5A 1HSJA 3GXAA 2HAVA 2GHAA 3TMGA 3DELB 3RLFE 2NXOA 2Z8FA 1MQHA 4C0RA 4N13A 4QF9A 1B9JA 2B3FA 3CG3A 3C31A 2Z23A 3FIRA 5H8FB 4P0GA 4THIA 3K1MA 2V84A 3KGCA 4RY1A 2G93A 3B6WA 4LZ8A 2RC7A 2B3BA 3G3HA 3KN8A 1AL3A 3FVGA 4QFOA 1ZLQA 2DWJA 4OFLA 3KFMA 3EHTA 2OCUA 2A5SA 3O9PA 1MS7A 2I6EA 2ABHA 2HEUA 3CRBA 3SDFA 2GFEA 4XKNA 1O63A 5H8QA 4NF5A 1MY0A 4X9TA 3LSFB 5CBSA 1LSTA 2ZYOA 1SD3A 3O29A 5J1DA 4H6DA 1POY1 5AA2D 3KJ7A 1DPPA 2HAUA 1PC3A 4KYEA 3Q26A 4XXUA 2RF1A 4AQ4A 2QS1A 1TWYA 2DOJA 1MPDA 2F6PA 2F7BA 3WAFA 3GZGA 3EQ1A 4AB5A 2HCAA 1GTKA 2E0SA 4K3FA 1GGGA 1Y20A 4JDFA 4MF3A 4ZEIA 1MM6A 4N6PA 2D3IA 1JW4A 3H6TA 4F22A 5DVIA 4FJPA 4RPOA 2V25A 4DXBA 2QMWA 5CMMA 4ISUA 3OEMA 5CMBA 3MP8A 1VSOA 3KOTA 1MM7A 3U1OA 2DE3A 4Z0IA 5FTHA 3TKDA 3UGWA 4ESWA 2KLFA 1MY4A 1TXFA 2V3UA 2F7CA 1LLSA 4KCCA 1EU8A 1JVXA 4MLQA 3FXUA 1IUDA 4Q0CA 2H98A 1ZJLA 1N76A 3MZ9A 1Q35A 5IAIA 4YMBA 3HHFA 3V83A 3H6VA 2I0BA 3P7IA 3OO7A 4R6YA 3TCFA 3V89B 1OQHA 4NMYA 1QULA 3PPQA 1FQEA 4QRZA 4I62A 4NF6B 2FYIA 1A99A 3KBRA 1A40A 3A3UA 3GBBA 1JEUA 1URDA 2NVUB 2NUVA 1LFIA 1B2HA 3RTFB 2H5YA 4XKPA 3LBSA 3IOTA 1YTVA 3DP6A 2Q8JA 1CE2A 1ZBMA 4NEDA 4OMBA 3ODBA 1EZOA 5FTIA 1N0TA 3IO6A 4R6HA 3D4CA 3VVDA 4Q8RA 2RC8A 4FE8A 4GD5A 2REGA 2A5TB 1RKMA 3N6TA 2Q2AA 1QUIA 2UXAA 2DQVA 2PBWA 1B0HA 4IO2A 4KYDA 2O51A 3TDJA 1H76A 4OFJA 1B1HA 1PEBA 5CI5A 3PMXA 4U21A 4HCYA 4H8JA 3ZKKA 2O6AA 3R6UA 3MP1A 3O28A 3CVGA 3EHSA 5CRYA 3KN7A 2XXYA 3VDFA 2AL5A 4YKPA 1L5TA 4E0WA 3L6GA 1NNPA 5CC2A 3PV0E 2ZNUA 3MC2A 4G8HA 2GHBA 3UIFA 3SEUA 4RK9A 3VE1B 3FJ7A 4HW8A 1IXIA 5LOMA 4MBPA 3TTNA 3N26A 5B70A 2VGQA 3C9HA 3SERA 3BKIB 4TOZA 4WEPA 2IA4A 4NE4A 2B65A 5KDTB 5CBRA 3OELA 3THIA 3TZAA 3L6HA 4PQJA 5I84A 3VVFA 4YICA 3MPKA 4IO5A 1N7WA 1URGA 4C1TA 1FTJA 3UN6A 4BDOA 1IQ7A 5AE4A 2UVIA 3TFLA 4OYVA 1M5CA 2QS4A 4DXCA 5DT6A 2GH9A 1NNKA 4F29A 4XKRA 1DTZA 4NF6A 4RA1A 1DSNA 2Y7KA 3U72A 3TPAA 1Y4TA 1NNFA 3H4ZA 2UVJA 1A7LA 3T9UA 2VOZA 4OESA 1EH3A 2AYSA 2Z22A 1H3DA 3PD9A 1WODA 4Q30B 3T93B 4G68C 5ISUA 2A5TA 3R26A 3QYTA 1IXCA 1SBPA 4JSDA 1R6ZA 2H25A 5DTBA 1H44A 3A3CA 4U4SA 3RNNA 4BDNA 2CMOA 3FZVA 1DOTA 2V3QA 1T0KA 2DSFA 3VFJA 3TTLA 5TP9B 5BUUA 5FHMA 1Z7NE 1SVXB 1UTHB 3CR9A 5I59B 1IXHA 4GOTA 3CIJA 2O1MA 1PDAA 3PPOA 1BLFA 3RT8A 2P0SA 1OIBA 4LQ2A 3V5AA 3S4UA 4IO3A 3ECRA 4POXA 2YPNA 1LAGE 5H8SA 3OMBA 1UIVA 3N94A 4OTEA 3IOWA 1NKXA 1NL5A 2HQ0A 1PB9A 4FIMA 3M3KA 1POTA 5KDTA 4EQ9A 1WDNA 2M8CA 1M5FA 2I49A 1FQCA 4HCWA 1P1QA 3SESA 1OVTA 1BIYA 1VE4A 4U22A 1LAHE 3T9XB 4F2QA 2I3WA 1I69A 5H8QB 2DVCA 4OQOA 2PX1A 2E1SA 3RQTA 4NF5B 3B6QA 2ZNTA 4R2BA 1OQGA 3HCQA 4LP2B 3MZ1A 3UA8A 3U8QA 3K1NA 1SYIA 1Z7ME 4F3SA 3RY3A 4LZ7A 2V93A 2X7QA 5ELVA 3SEXA 2DXRA 2F7AA 4YKJA 1YCJA 1N7XA 1FCKA 2Z8EA 5TPAB 3DP4A 5L9SA 1JEVA 4POWA 4ELRA 3C32A 2VP1A 2QRYA 4GWOA 1ZKBA 3C35A 4OEUA 2ZYMA 3K02A 3LSWA 3PUVE 4KHZE 1A54A 1B0LA 1B7ZA 1OLAA 4YB7A 3PPPA 1N04A 2F34A 5B7DA 1MPCA 4G8NA 3E9XA 2ANJA 3DLNA 3PPRA 4QSCA 2D21A 3IORA 4H67A 3M8UA 3FXRA 3OENA 5TP9A 3LUYA 3HO7A 1UTHA 5I59A 3TYHA 2XXXA 2Y84A 3PUXE 1D9YA 1SW2A 4I1DA 1R9LA 2ZMBA 5H8HB 3ZKLA 1LCFA 3U93A 3VXBA 1VFDA 1B40A 4ELPA 1A8EA 3TELA 5I2KA 2UYEA 1UQWA 3S9MC 2F35A 1B51A 4NF8B 4PETA 1B46A 4YMAA 1ZU0A 3EHUA 3I5OA 4OETA 3ONMA 4G77A 3IB2A 3CFLA 2R6GE 2XXVA 3LC8A 3QSLA 3K6UA 3QK6A 3Q28A 2X26A 4GXAA 1JNFA 1XC1A 5I2NA 3IB1A 4R9GA 3JZJA 1P99A 3M3FA 3ILTB 2OWTA 3MBPA 4EQ7A 4YB6A 1TFAA 4OXVA 2F97A 1JW1A 2OZZA 4KD5A 2AL4A 1R9QA 3IOVA 3IJXB 5CMCA 5KCJB 3QUJA 1FTLA 5AA2A 2F5XA 5HM4B 5TPAA 4WXJA 4EXLA 4WKMA 1FQFA 2Y7WA 2PMSA 3JYRA 4R75A 4ECFA 1AMFA 1B7UA 3HPIA 3ZSFA 3T66A 1IEJA 3JV9A 1USYE 3K1PA 4RPNA 3OSQA 2HXWA 4O3CA 4RNSA 3SEYA 4BDMA 3K6WA 2QL3A 4R6KA 4GXSB 3PPNA 1N3XA 1M5BA 4HTGA 1MDP1 4TLLB 5JEIA 1TT1A 4X1BA 2OK2A 3PUZE 2O69A 3PUYE 1SI1A 5H8HA 1FTKA 2H99A 1HSLA 2UYFA 3S9NC 4G4PA 2OJTA 1B58A 1XOCA 4U1OA 4JXIA 2F8DA 2O7UA 3KOSA 3GBAA 1YAEA 1SQYA 4F1VA 1JQFA 2DE2A 4NF8A 4LVQA 1LBCA 5FHNA 3TQLA 2Y7PA 1FTMA 4DCYA 1XT8A 3VV5A 4ZECA 2W7YA 3H6UA 3KZGA 2Y7RA 2ZNSA 1B3GA 5M2VA 3TTRA 3AXFA 4GFRA 1B6HA 1OLCA 3O6IA 4IO4A 3E13X 4M4GA 5IKBA 3MW0A 4BLAA 3HN0A 4F3PA 1XS5A 4H1XA 1H45A 3MWBA 4DZ1A 2XXTA 1B3EA 3K01A 4OEVA 3CSGA 5F7VA 1MXUA 5KCJA 1ZMGA 1RYXA 2XX8A 4RYAA 1QJMA 2QPQA 3RUMA 3IX1A 3OEKA 3OD7A 3O6GA 4QFPA 3I6VA 2FA7A 1MXZA 1B4HA 4OVJA 3TUSA 4GL0A 2IEEA 4OHNA 3K2DA 2OBGA 1AIVA 4QFLA 3U94A 4ZS9A 4FORA 1H43A 4ZEDA 5I58B 1CB6A 1NFTA 3LSLA 1IXGA 4IO7A 2PT2A 1D3KA 4DDDA 3G3JA 3T22A 3O2AA 5DVFA 2NOOA 2ONSA 1B7HA 2XX7A 4UA8A 1IITA 4PFUA 4XKQA 4EF1A 1DPEA 4ZEBA 3LR1A 1MH3A 1B05A 5DYHA 4ELQA 4H8IA 4EQBA 3OXNA 3A09A 2XXHA 3E4RA 3K6XA 1R1NA 3PMVA 3PGFA 3CFZA 5L8DA 3UK4A 3GLBA 2H9BA 3FVNA 4DLDA 2XHDA 4NWCA 3Q25A 4RJZA 4YAHX 4X48A 4I8CA 3FUZA 2THIA 2QMXA 4QSDA 3C36A 3EPEA 2XXRA 3C33A 4H0WA 1QKBA 4BDQA 5K2XA 1I6QA 1P1WA 1SW5A 5DVJA 1B52A 4KYSA 4R73A 2P1SA 3O97A 2YLNA 1USYH 4OERA 4MFIA 4DIGA 2QSXA 1M5DA 1MQIA 1O7TA 1Y1ZA 5AA1A 1FQAA 2ONKE 3OSRA 5JTYB 5CM6A 4XTCQ 4KI0E 2Q9TA 2WKYA 1B5JA 3IK6B 1US5A 4LQ5A 2DYXA 1LCTA 2Z8DA 3WAEA 3U92A 1FTOA 3ZS6A 3OOAA 3KN3A 1QKAA 3QXMA 2XXWA 3RTWB 4YU0A 4FEBA 4IB2A 4OWDA 1OMPA 4U4XA 3IO4A 2O68A 5EHSA 5I58A 1Y4CA 5I2KB 4MLVA 4JB7A 2XXIA 3FATA 2RINA 3KG2A 3PMWA 4JWYA 3SKPA 4F3BA 4ESXA 1MPBA 2O1LA 1D4NA 2F78A 3RN8A 1IZ1A 3K00A 4ZE9A 5ICQA 1MXVA 5I2NB 1NH8A 2I58A 2Q88A 2QJEA 3H7MA 2ONRA 3S9EA 2DWIA 2GRVA 1YPNA 3FJMA 4F31B 1PBPA 1BP5A 5I56B 4NTLA 1SYHA 4E0XA 5EHMA 1S7YA 4AB6A 3FD3A 1VFEA 4Z7EA 3S2VA 4ZEFA 5A5XA 3FV2A 3BBRA 3BFTA 2ESNA 2BJJX 3FJGA 1PB7A 5AA2B 2OWSA 5H8NB 1XVXA 3SEVA 3G3FA 2PYYA 3C4MA 3FXQA 4PP0A 4ELOA 3O6HA 3K6VA 4ZEKA 1QUJA 5I57A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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