1P99A

1.7a crystal structure of protein pg110 from staphylococcus aureus
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
KVTIGVASNDTKAWEKVKELAKKDDIDVEIKHFSDYNLPNKALNDGDIDMNAFQHFAFLDQYKKAHKGTKISALSTTVLAPLGIYSDKIKDVKKVKDGAKVVIPNDVSNQARALKLLEAAGLIKLKKDFGLAGTVKDITSNPKHLKITAVDAQQTARALSDVDIAVINNGVATKAGKDPKNDPIFLEKSNSDAVKPYINIVAVNDKDLDNKTYAKIVELYHSKEAQKALQEDVKDGEKPVNLSKDEIKAIETSLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The membrane-associated lipoprotein-9 GmpC from Staphylococcus aureus binds the dipeptide GlyMet via side chain interactions.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein PG110
source organism Staphylococcus aureus subsp. aureus mu50
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 82
structure length 255
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03180 Lipoprotein_9 NLPA lipoprotein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p99A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1p99A02
3DLNA 5DEXA 4RK9A 3UA8A 1SW1A 4MFIA 3E13X 4QSDA 1F9BA 2E1SA 2VHAA 2F35A 3UIFA 1MPBA 2QS2A 3OEKA 3Q27A 4ELPA 3RGYA 1SI0A 4YKJA 5LOMA 4MLVA 2ESNA 1ZIUA 3IX1A 4FE8A 1OIBA 3FVGA 4XXUA 2XXPA 2DXYA 1AIVA 4KHZE 3BFUA 1JEVA 3IJXB 1ANFA 3S9MC 4U1ZA 3PMWA 1BIYA 1NH8A 4R6KA 3UP9A 1ZKBA 1NNPA 1M5DA 3C31A 3S2VA 1UTBB 4U2RA 2VD3A 4NWDA 1P1NA 5H8NA 2YJPA 3MWBA 4ND9A 1SVXB 2B3FA 1D9VA 4WEDA 1EU8A 3HCQA 4IO7A 1IUDA 4R6YA 3S9NC 3RLFE 2D3IA 4WEPA 4IO2A 3TYHA 3T22A 3QIMA 4F3SA 1FCKA 4KI0E 4R6HA 1QULA 1LB9A 2F97A 3OD7A 3LUYA 3TFLA 2UVJA 4ELQA 2F6GA 4EDPA 3ILTB 3TEPA 4PE5B 2RCBA 4IGRA 2ZYOA 3IOTA 4H67A 3O6HA 4ZZEA 4C1UA 3ILUB 4NE4A 1NNKA 4XKNA 2A5TA 4E0XA 2RC7A 1A40A 4X1DA 3FJ7A 3U93A 3TODA 3T9UA 1B5HA 2GHAA 5I56B 4RY1A 3FZVA 1MXXA 4RA1A 3K1MA 3FASA 2IEEA 4FJPA 5BWJA 1FTMA 4OFJA 4ZEDA 4JB7A 5AA1A 3UK4A 1MRPA 3G7WA 2A5SA 4POXA 2ALUA 4YMAA 5AA2A 2DWIA 2VP1A 4KR5A 2QRYA 3G3HA 4BDOA 2I3WA 4KQPA 5FTIA 4JWXA 1NH7A 4HW8A 4P0IA 5L8DA 3F11A 1QKAA 3K6WA 4ZDMA 4MF3A 2F8DA 2ONRA 2REJA 1YCJA 3JYRA 2XXXA 3GZGA 1MY0A 4P0GA 3PUWE 3N6TA 4ZZAA 1XC1A 4EF2A 1H43A 3TCFA 1AL3A 1N84A 4IO5A 1PC3A 5H8HB 4FAJA 4H8JA 2QPQA 5DT6A 1UTHB 2Q89A 5DVFA 2O7IA 5TU0A 3OXNA 3K02A 5IAIA 2I4BA 1WDNA 2X7QA 4OMBA 2R71A 4F2OA 2UVGA 4N13A 3OMBA 5HBCA 2XXRA 1O7TA 4MBPA 2Z8FA 2GFEA 2QL3A 1D4NA 2V3TA 4MH5A 3QK6A 4F18A 4KYEA 3K6XA 1JNFA 1SD3A 4OENA 3JV9A 4G8HA 4AB5A 3EPEA 3K4UA 1IXHA 1VSOA 4N07A 4Q8RA 4C1TA 3SKPA 2XX8A 4TLMB 3Q28A 5TP9B 3RUMA 1DPEA 2Z8DA 3IR1A 3SEUA 3R6UA 3TTKA 4IO6A 1QW0A 3DELB 3TELA 3K1NA 3PUZE 3A3UA 1PB8A 3M3LA 5TPAB 4GL8A 5I2KB 4OQOA 4YB7A 3UORA 4AB6A 5L9SA 5JTYB 3IOUA 2P1SA 5AE4A 3KOSA 3VVDA 5ICQA 4YZZA 1XT8A 1NNFA 2RF1A 3USDA 1DSNA 4LZ7A 2I48A 3L6GA 4LA9A 4G8MA 5CC2A 4RYAA 4XKQA 1RYOA 5EHMA 4O3AA 2I4CA 4F31B 4U21A 4JDFA 3THIA 1T0KA 2ZNSA 1FTJA 3PUYE 4F1YA 2I49A 3QYTA 1LB8A 2DE2A 1A54A 1UIUA 2O84X 2OLBA 1BLFA 5JK4A 2AYSA 1IEJA 5I2NB 1Y1MA 2VOZA 3O97A 2QS4A 1Y9UA 1B0LA 3O6IA 3Q26A 4Q5TA 3LSXA 1IQ7A 4ECFA 3O9PA 4HTGA 1GVCA 2H25A 2P2AA 4KPTA 2HEUA 3KEIA 3H03A 4R74A 3K2DA 4QFKA 1B5JA 4POWA 3N94A 4GWOA 1XS5A 4DE8A 5BUUA 1OLCA 2Q2AA 1B5IA 3FD3A 1A8FA 1MY4A 3V5AA 3LC8A 5I58B 4IY6A 3MAMA 4IB2A 4NF6A 1LCTA 4GLIA 2P0SA 3VLUA 3PD8A 1O64A 2R9JA 3W15C 3FUZA 3E9XA 3PPQA 4DXCA 1MQDA 4KCCA 1GGGA 3EHSA 3OSQA 1RKMA 3IOWA 1PB9A 4JSOA 4I9DA 3KOTA 2HFBA 2O1LA 3ONMA 3O66A 1OLAA 3TQLA 1SW5A 4LQ5A 1O63A 3EQ1A 5B7DA 1R9LA 3CFXA 1MXZA 2UVHA 4R75A 1LAXA 3MJNA 4G68A 3MZBA 3TQWA 1B7UA 1SW2A 3HO7A 4ZEFA 1TFDA 2YLNA 1CE2A 2F36A 4UACA 3B7DA 1MH3A 4RK2A 1GV8A 4G4PA 4X9TA 4HCYA 5CBRA 1B7ZA 5H8FA 3TTNA 3QUJA 2QS1A 5DEXB 3U72A 4DLDA 1S9TA 1N76A 3PPPA 4ZEBA 3HN0A 2W7YA 4LVQA 4GFRA 2THIA 3KN7A 3G3IA 3CG3A 1A8EA 2G29A 3QAXA 3M8UA 4ZS9A 1P1QA 1URDA 4F1UA 1Y1ZA 4UA8A 3RTWB 4LATA 1IITA 4LZ8A 2NOOA 3C4MA 1LSTA 3FJGA 4RXLA 3OO9A 2QS3A 2X26A 3G3GA 1NMUA 3K0VA 1ELJA 2I0CA 5HM4B 4FATA 1ZTYA 1FTKA 2DWHA 1HSLA 1R1NA 5L9MA 3E3KA 5H8NB 1XVYA 1SI1A 2Z23A 4HS7A 4R9GA 1N0TA 3VVFA 2ZMBA 2Z8EA 4U1OA 1D9YA 1QUIA 3KJTA 4ESWA 2NVUB 3FIRA 1AMFA 1OVBA 3OELA 3PPOA 4OERA 3KGCA 3ZSFA 1USYE 3RPWA 1ZU0A 3CSGA 3PU5A 2NWJA 1B7HA 2PT1A 1IXIA 1USYH 2DE3A 4O3CA 1MH4A 1R9QA 4QFPA 1JW4A 3L6HA 4DDDA 2PBWA 4U4XA 4RPNA 3R26A 3RQTA 2Y7PA 4OVJA 2Y84A 3CFZA 4U22A 3DP6A 2A5TB 1DTZA 2PT2A 1PB7A 2D5WA 1LFHA 3FXUA 4QHQA 1JQFA 3LSWA 3IB0A 1LBCA 3FVKA 3IO4A 1II5A 4YB5A 2RINA 4KD5A 3VDFA 2XX7A 4R72A 3G3FA 2XXHA 3M3FA 3P7IA 3OO6A 3VLWA 1RYXA 4O3BA 3B6WA 2XHDA 5AA2B 2ZYMA 3V83A 1I6AA 2O68A 4R73A 1MPCA 4YKIA 3G3KA 3VXCA 2DVCA 5AA2D 4OXVA 1B40A 1FQCA 4H0WA 4NEDA 3LBSA 1B4ZA 4NF5A 3IK6B 4DXBA 3M3KA 4LQ2A 2OBGA 1XOCA 3FXRA 1VR5A 5ELVA 4ZE8A 4I1DA 4ESXA 4FEDA 5L9OA 3Q25A 5KZTA 1B3HA 3G3JA 4OEVA 1Q1KA 2UYFA 1B4HA 1Y3PA 1UIVA 3KZGA 1IXGA 3SESA 3OO7A 1NFTA 4QFOA 2OJTA 4FEBA 4H65A 2Q9TA 2XXYA 4GXSB 1QVSA 5DVIA 2OWSA 2QSXA 3T9XB 2YPNA 2XXIA 5AA4B 2HZKA 1Y20A 2HCAA 5A5XA 1MQJA 2Z22A 1FQBA 1OQGA 1B52A 5H8HA 3T93B 4QFLA 4RPOA 5H8SA 3ZKKA 1M5EA 3CI8A 3H06B 3CVGA 4Z7EA 2F6PA 2F5XA 2DYXA 2ZNUA 2QMWA 3GXAA 1M5FA 4YICA 4F3GA 4QFNA 1MM7A 5I57A 5F7VA 3RNNA 2REGA 2H9BA 3FVOA 4EF1A 3PMXA 3R7XA 2O6AA 1I69A 2GH9A 5CI5A 2X7PA 1B3EA 2M8CA 4BLAA 1SYHA 3EHUA 4MLQA 4KYDA 3C35A 5KDTA 1LAGE 1TFAA 5ITPA 4QF9A 4PFUA 4AQ4A 3RY3A 5J1DA 3K00A 4QRZA 1P1UA 1EZ9A 3PMVA 1B58A 3FXQA 1SBPA 1I6QA 3CRBA 1LBBA 5M2VA 1JW5A 2UYEA 1B1XA 3K6VA 3TUSA 4F1VA 4GOTA 4G8NA 1MQIA 3T9HB 3HSTA 4NF4A 5H8QA 5ICTA 3IAZA 1TT1A 5B70A 2F7CA 5I59A 3FV2A 3MPKA 4F3PA 4XKPA 4E0WA 1S7YA 4PFYA 4GRKA 4FECA 3SDFA 3RT6B 1EZOA 4NF8B 3E4RA 3CR9A 2I0BA 3MZ9A 2H98A 2RC9A 3A3CA 4L17A 1IZ1A 1EH3A 4ISUA 3KBRA 3TMGA 1M5BA 2FNCA 2V3UA 3ECRA 3MBPA 3DM0A 5I84A 4BDLA 3QUFA 1ZMGA 3I5OA 3V89B 4IO3A 3LSLA 2CZLA 1PBPA 1UQWA 3O29A 4H1XA 3HPIA 3C32A 3MZ1A 1B3LA 1QKBA 1FQAA 1BTJA 4JWOA 1DPPA 5ITOA 2NUVA 2IA4A 2ABHA 3KSJA 4YKKA 3CFLA 3IB1A 5FHOA 4RNSA 1OVTA 3OOAA 4G68C 3SEXA 4YAHX 2F7AA 3U8QA 4NWCA 1MDP1 3TTLA 5K2XA 4GL0A 2Y7WA 1H45A 4Z0IA 4BDQA 2PYYA 4ELRA 4OHNA 1OMPA 2ZXTA 2RKMA 4XKRA 4QSEA 3MVWA 2FYIA 5DYHA 3OEMA 5CMMA 4TQUQ 2XXWA 1ZLQA 4G68B 3GBAA 1LFIA 3IO6A 5KCJA 1Q35A 1LGBC 4PQJA 1BKAA 3WAFA 4K3FA 2V84A 3O28A 1D3KA 2ONKE 4DIGA 3RT8A 1VE4A 1PEBA 1SDXA 2DWJA 2Y7RA 3TAJA 1Y4TA 1LLSA 2UXAA 5H8FB 1AOVA 2XXUA 2VD2A 1B1HA 1SQYA 2ZNTA 3VVEA 1JEUA 2HZLA 3V8XB 4R2FA 3KFMA 1URSA 3IB2A 3BFTA 3IL1B 1FQEA 2RCAA 4Q0CA 3MVYA 3S4UA 1JVYA 2AL4A 3W9WA 1FTOA 4IGTA 1MXVA 3ZS6A 2ZYNA 4YB6A 2WKYA 3KN8A 3H4ZA 4BDMA 1CB6A 1JVXA 3TKDA 2OZZA 4OZ9A 1MG1A 3IOVA 4GVOA 4BDNA 1SYIA 2OCUA 1DOTA 3DP4A 1US5A 1KWHA 3T66A 4F29A 5CM6A 2DP8A 4OWDA 2F78A 1B05A 2RC8A 3KSXA 3EN3A 4G2ZA 4TLLB 4IY5A 4DCYA 3FJMA 1M5CA 1MY3A 2NXOA 3BKIB 1HSJA 3VFJA 4GQOA 4FIMA 4JBZA 1P1WA 3AXFA 1LAFE 1VFDA 1UTBA 2D21A 2AIXA 3TDJA 3ODBA 1XHYA 4YKPA 4WXJA 3FGSA 1MQHA 3GLBA 4LP2B 2PVUA 3TPAA 1A7LA 1N3XA 1PBQA 4OESA 1Y4CA 1TWYA 3TTRA 1GR2A 5DVJA 4I8CA 1B32A 4OTEA 2V25A 1LAHE 1JETA 4PP0A 3TTMA 1EZPA 3S9LC 2XD3A 2ZYKA 2H99A 3MVXA 1B0HA 4NTLA 2AL5A 3FVNA 3C34A 3TCGA 3C9HA 4X48A 2F34A 3PGFA 2O1MA 2Q2CA 2GRVA 3MP8A 1JW1A 1A99A 1TXFA 3LR1A 4GF8A 2VGQA 1LCFA 3JZJA 3SEYA 1MPDA 3N6UA 3FV1A 4GIZA 4OEUA 3RTFB 3MC2A 1PDAA 5K2YA 3A09A 3BBRA 3PUVE 2I58A 4PETA 1DTGA 3MUQA 5I56A 1J1NA 3RN8A 4NF5B 1MQGA 2V3QA 1A55A 5AA3A 1ATGA 3UN6A 3PPRA 4KCDA 5HPQA 3TZAA 2XX9A 4HCWA 2B65A 5JEIA 3ZKLA 2F7BA 3U92A 2I3VA 4ZEKA 3MW0A 5EYFA 1P1OA 4H8IA 1Y3NA 1MXYA 4R9FA 2HAVA 3MP1A 4ONYA 3H7MA 4ZECA 5FTHA 4I62A 5CMCA 2I6EA 1S50A 3T9VA 4LUBA 5A5XB 3HV1A 1FQDA 1Y3QA 3H6UA 1BP5A 4XIGQ 4DXUA 5FHNA 1FW0A 4YU0A 2Y7IA 1NNTA 1B2HA 4LONB 3UGWA 1IIWA 4G77A 1UTHA 5AA4A 3OENA 4RJZA 4KFQA 1GTKA 5IKBA 3C33A 3N26A 5I57B 1B51A 5CMKA 1MXUA 4F2QA 3Q29A 4EXLA 4P11A 3OO8A 3EF7A 1QUKA 1NL5A 3H6WA 1B9JA 4EXKA 2DSFA 3H3GA 3FATA 3U1OA 1SW4A 2DWAA 5KDTB 4FORA 1YPNA 2PMSA 1IXCA 4TOZA 3D4GA 4JSDA 3PV0E 1NKXA 2XD2A 3IJOB 3KG2A 4R2BA 3VLVA 4M1VA 2HQ0A 2HXWA 3VE1B 3PUXE 2OWTA 5CRYA 2OK2A 5ISUA 2B3BA 2V93A 3QXMA 2KLFA 4IO4A 5TP9A 3I6VA 1B46A 4Q30B 3KN3A 2O69A 1AH5A 4QSCA 4OYVA 1HSEA 5FHMA 2FA7A 1R6ZA 4NF4B 5H8QB 1MY1A 5I59B 3S9EA 3K1PA 5TPAA 2XXTA 5I2KA 2PX1A 1OQHA 3W9VA 3CSBA 1FTLA 1WODA 2DXRA 5JTYA 2Q88A 4KYSA 4PFWA 3TCHA 5CMBA 1N7WA 3SERA 1P99A 3H6VA 3K01A 1H76A 3SEWA 1MY2A 2ONSA 4NF8A 4X1BA 2CMOA 1POY1 3DP8A 4EQ7A 2DE4A 1ZJLA 3H6TA 3CG1A 1L5TA 4XTCQ 1Z7ME 4GXAA 4H5GA 4ELOA 1YAEA 3MVZA 1QJMA 3EHTA 1YTVA 4H5FA 4M4GA 2QMXA 3LSFB 2ANJA 5I2NA 3MP6A 5DTBA 3PD9A 2H5YA 4NMYA 4BDRA 2DQVA 1MS7A 4F19A 4NF6B 4U4SA 2DS9A 1US4A 3SETA 1H44A 3I3VA 2Q8JA 3C36A 4LZ5A 4F3BA 1B3GA 4JXIA 4YMBA 4F22A 1URGA 2XXVA 4N6PA 3U94A 1QUJA 4EQBA 1Z7NE 5EHSA 4ZE9A 1N04A 4WKMA 5I58A 3D4CA 4GD5A 1B3FA 3PPNA 3HHFA 2E0SA 1MXWA 4OFOA 2G93A 3T96B 2O7UA 3CIJA 4C0RA 3QSLA 4DCXA 1FQFA 1DMBA 5CBSA 3O2AA 1MDQA 3WAEA 1ZBMA 5F1QA 1XVXA 2DVZA 4ZEIA 3MPLA 4F39A 5KCJB 2LAOA 2GHBA 2O51A 2UVIA 3N5LA 3OSRA 3MQ9A 1N7XA 2QJEA 4DZ1A 4EUOA 3VV5A 1H3DA 3IORA 3HHGA 1POTA 2DOJA 2XXQA 4PFTA 3SEVA 4H6DA 3GBBA 3KJ7A 1WVJA 3B6QA 3O6GA 4EQ9A 1LFGA 4JWYA 2HAUA 1B6HA 3B6TA 2BJJX 4OFLA 2R6GE 3VXBA 3K6UA 2Y7KA 4OETA 4THIA 4U23A 1MM6A 2H4IA 1VFEA 1I6BA 1N3WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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