The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
11
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sequence length |
76
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structure length |
76
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Chain Sequence |
EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure of the PI3K SH3 domain and analysis of the SH3 family.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE P85-ALPHA SUBUNIT SH3 DOMAIN
|
| molecule tags |
Phosphotransferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
11
|
| structure length |
76
|
| sequence length |
76
|
| ec nomenclature |
ec
2.7.1.137: Phosphatidylinositol 3-kinase. |
| pdb deposition date | 1994-03-07 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DJQ A; 3QWY A; 1X6B A; 2ROL A; 1QWE A; 2RNA A; 2D0N A; 2EGA A; 3JV3 A; 2IIM A; 2ED0 A; 2LX7 A; 3UF4 A; 4JJD A; 1SEM A; 2FG0 A; 4AG1 C; 3CQT A; 2MIO A; 3NPF A; 2FRW A; 2O31 A; 1B3Q A; 4X1V A; 4R0K A; 5GJV B; 2CT4 A; 4J9C A; 4D8D A; 1AVZ C; 1NYF A; 1GBQ A; 4J9I A; 2YUP A; 2K2M A; 2DNU A; 4AFS C; 1CKA A; 2MCN A; 2H8H A; 2DX1 A; 2GBQ A; 4JJB A; 4ORZ A; 2GGR A; 2VVK A; 2G6F X; 1WDX A; 2YSQ A; 4E6R A; 4F16 A; 1K0S A; 1UEC A; 4M4Z A; 3QWX X; 1Y0M A; 2CUD A; 1JO8 A; 2C0O A; 3UA6 A; 2RMO A; 4LNP A; 2FRY A; 1TG0 A; 5FWB A; 3PVL A; 2P4R A; 3SHW A; 5EC7 A; 2KNB B; 1UUE A; 2DL3 A; 2NWM A; 2CSI A; 1XOV A; 2JM8 A; 3VRY A; 1NLO C; 4IIO A; 5IHI A; 4J9G A; 1JXM A; 2KBT A; 5IXB A; 4GLM A; 3I5R A; 1QKW A; 1QCF A; 2KGT A; 2KR3 A; 3VS2 A; 2KE9 A; 3PVQ A; 4HCK A; 1RI9 A; 1ARK A; 3H0F A; 2CH4 A; 4RTT A; 4ZNX A; 2HEQ A; 4JZ3 A; 2CUB A; 5GJW B; 2BZX A; 1NLP C; 1A0N B; 3ZL7 C; 1ABQ A; 2XMF A; 2FPD A; 2ESW A; 2EW3 A; 2O2O A; 1M27 C; 1ZLM A; 1WXU A; 1M8M A; 1JQQ A; 2PZ1 A; 3NHN A; 2DVJ A; 2KRM A; 2SEM A; 1J3T A; 2BZ8 A; 2QDL A; 2DL7 A; 3NMZ C; 1SHF A; 2A37 A; 4GBQ A; 2YUQ A; 1U5S A; 2J6K A; 1AZE A; 4OMO A; 4DEX A; 3TSZ A; 2DE0 X; 4J9D A; 1YCS B; 2RN8 A; 2J7I A; 2MOX A; 1AWW A; 1W70 A; 1Y57 A; 4CC3 A; 1Z9Z A; 1WXT A; 2W0Z A; 3R6N A; 1MV0 B; 1OV3 A; 3VS5 A; 5IXF A; 3THK A; 2DL5 A; 1KIK A; 1M3B A; 2LZ6 B; 1N5Z A; 3IQL A; 3LH5 A; 3H0I A; 3FJ5 A; 2M0Y A; 1X2Q A; 2I0N A; 3TVT A; 4Z8A A; 2L3S A; 2LMJ A; 2KT1 A; 1FMK A; 2VWF A; 2F2X A; 1NG2 A; 1WYX A; 2DIL A; 1AZG B; 1UTI A; 5IHN A; 4ESR A; 1WLP B; 1ZUK A; 1MUZ A; 2X3X D; 1K1Z A; 1ABO A; 1ZBJ A; 4CC2 A; 1UJY A; 2V1Q A; 4KRT A; 2GNC A; 4CC7 A; 2JM9 A; 2JW4 A; 1H92 A; 1AWJ A; 2V1R A; 2O9S A; 2RQV A; 1UGV A; 3GBQ A; 3VRZ A; 1AEY A; 3UA7 A; 1GCP A; 1SSH A; 1GFD A; 5I11 A; 4J9B A; 1BU1 A; 4JPB W; 2OAW A; 2AKL A; 2ED1 A; 1WI7 A; 2DF6 A; 3EHQ A; 4A63 B; 3M0P A; 2K9G A; 4K11 A; 3M0R A; 4F14 A; 2E5K A; 2KYM A; 2JS0 A; 2KYB A; 1OEB A; 2EGE A; 4HVW A; 1PWT A; 5I22 A; 1UJ0 A; 1X27 A; 1AD5 A; 1SPK A; 1X6G A; 1GL5 A; 4LUE A; 2A08 A; 1I1J A; 1Z9Q A; 3EG3 A; 5IHK A; 1T3L A; 3TSW A; 2C0T A; 1X69 A; 2L3Q A; 4OMM A; 1OOT A; 2PNI A; 1IO6 A; 2F2W A; 2DRK A; 2RQT A; 1KJW A; 1JEG A; 2AZS A; 3EHR A; 4FSS A; 3ULR B; 3KFV A; 4J9F A; 1SRM A; 1UHF A; 2AKK A; 2L3P A; 2JMA A; 2BZY A; 2KRO A; 2EYX A; 2LJ3 A; 1RUW A; 2JT4 A; 2EPD A; 2DLP A; 2CRE A; 1SHG A; 4HVV A; 1ZSG A; 1K0X A; 2K6D A; 2DMO A; 2VKN A; 4Z88 A; 1NM7 A; 3VS4 A; 4HXJ A; 2D1X A; 2CSQ A; 2EYW A; 3EG2 A; 1KSW A; 1AWX A; 2J6F A; 2NUZ A; 2ENM A; 2AK5 A; 2EQI A; 1OPL A; 1YWO A; 2FPE A; 2EGC A; 1TUC A; 1VA7 A; 2LQN A; 1UFF A; 1WXB A; 2K3B A; 1PKT A; 1YWP A; 2LNH B; 4RTV A; 4DEY A; 1PHT A; 3VS0 A; 3M0Q A; 1NEB A; 1W1F A; 3VS3 A; 1YP5 A; 1E6H A; 1I07 A; 3EG1 A; 1PRL C; 1AOJ A; 3RNJ A; 1LCK A; 1GRI A; 1ZX6 A; 2EBP A; 2EYZ A; 1GCQ C; 4AG2 C; 2FEI A; 3NGP A; 4RTW A; 1MV3 A; 1PRM C; 4J9E A; 1I0C A; 4LN2 A; 1BB9 A; 4IIM A; 1M3C A; 2K79 A; 1YNZ A; 3UAT A; 3I35 A; 1WIE A; 4AFQ C; 2KRS A; 1WFW A; 3A98 A; 2L2P A; 4LUD A; 2JS2 A; 2LP5 A; 2DBM A; 3EGU A; 1K76 A; 2YT6 A; 4JZ4 A; 4RTX A; 2ABL A; 4WCI A; 5FWC A; 1BK2 A; 1T3S A; 2KXC A; 2OJ2 A; 2CDT A; 1KFZ A; 2A36 A; 4RUG A; 1CSK A; 3M0U A; 2DBK A; 1T0J A; 2ECZ A; 1X2K A; 4OMN A; 2EYY A; 1WX6 A; 1SRL A; 1UHC A; 1G2B A; 1HJD A; 2D8J A; 3REA B; 4Z89 A; 1S1N A; 2B86 A; 2PTK A; 1BBZ A; 2DL4 A; 2RQR A; 1U3O A; 4HVU A; 2EVR A; 2HBW A; 2RQW A; 3REB B; 1QWF A; 1ZUY A; 3U23 A; 2HSP A; 3H0H A; 1WA7 A; 1NEG A; 1G83 A; 3C0C A; 2LJ0 A; 2W10 A; 3M0S A; 2KT8 A; 4D8K A; 1HSQ A; 1B07 A; 2AZV A; 3RBB B; 1H8K A; 4OML A; 1VYV A; 2KXD A; 1CKB A; 1NYG A; 4RTU A; 1HD3 A; 5HCK A; 2J05 A; 5L23 A; 2JXB A; 2EKH A; 2LCS A; 1GBR A; 2RPN A; 1GFC A; 2SRC A; 1OPK A; 3M0T A; 2KEA A; 2GQI A; 1PKS A; 2BTT A; 1TUD A; 2LJ1 A; 2YUO A; 4JJC A; 1K4U S; 2CH4 W; 1UG1 A; 3VS7 A; 1T0H A; 3H41 A; 1GCQ A; 2GTJ A; 3I9Q A; 5ECA A; 2J06 A; 4RTZ A; 1RLQ C; 2JMC A; 3O5Z A; 1V1C A; 4LE9 A; 4OMP A; 1H3H A; 2KRN A; 1E7O A; 1X43 A; 1UDL A; 3I5S A; 2J6O A; 3EG0 A; 2F2V A; 2A28 A; 1ZUU A; 2D8H A; 2HCK A; 4OMQ A; 1VYU A; 2DYB A; 4RTY A; 2YUN A; 2DRM A; 5IH2 A; 1M3A A; 2DA9 A; 1E6G A; 1YN8 A; 4QT7 A; 4CC4 B; 1JXO A; 1FYN A; 2RF0 A; 3SEM A; 1M30 A; 4Y92 A; 2K7A A; 2LQW A; 2ROT A; 2L0A A; 2GTO A; 1EFN A; 1K9A A; 2OI3 A; 1AWO A; 1RLP C; 2HDA A; 3PE0 A; 4J9H A; 2O88 A; 2FPF A; 2DL8 A; 1VYT A; 1UE9 A; 2O9V A; 2X3W D; 5FW9 A; 2CT3 A; 2DM1 A; 3VS6 A; 1QKX A; 2YDL A; 4F17 A; 2RQU A; 4EIK A; 2M51 A; 4AFU C; 1QLY A; 1U06 A; 2FO0 A; 1PNJ A; 3VS1 A; 2C0I A; 1JU5 C; 4AFZ C; 1W6X A; 2JTE A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1D3B A; 1NZ9 A; 3MEA A; 1TOV A; 3M58 A; 2RNA A; 3DB3 A; 1MMN A; 2D0N A; 1I8F A; 2EGA A; 1U1S A; 3URG A; 5DLQ E; 4IKF A; 2QA4 A; 2QG9 B; 1SEM A; 1O75 A; 3L2Q A; 2EJG A; 3NPF A; 4BDY A; 2QA4 Q; 5GJV B; 4HT8 A; 1VQ6 Q; 4ZGD B; 1XNI A; 1SF9 A; 4J9C A; 4D8D A; 3BDU A; 1AVZ C; 1BIB A; 2XDB A; 2DNU A; 2FYK A; 2DX1 A; 2GBQ A; 2PVD B; 2KAF A; 4DBQ A; 2HSE B; 5GAM h; 1YBY A; 2MPX C; 3QKJ A; 1NPR A; 1SSF A; 2CUD A; 2ZGW A; 4C0G A; 3CCS T; 3CD6 Q; 2C0O A; 2DKG A; 3QII A; 3PIO A; 5FWB A; 4QVC A; 3V8J A; 3SWN C; 4PJJ A; 2JJ9 A; 1U8R A; 1YIT Q; 2V8I A; 3EGD B; 1V29 B; 1KC8 U; 1VQ5 A; 5IHI A; 4BE2 A; 5IXB A; 5LJ5 d; 1D1B A; 4PLL A; 3KXT A; 3AT1 B; 5CKB A; 3H8Z A; 4Q5W A; 3PVQ A; 4M7D A; 1VQ5 Q; 1OX9 A; 4Y28 E; 4E7L A; 4FYV B; 3ER0 A; 2Y4X A; 4F04 B; 1QVF P; 1VQP A; 2LRQ A; 4ZNX A; 3KUF A; 4JZ3 A; 2EIF A; 5GJW B; 2JVV A; 3ZL7 C; 4BY6 B; 3BW1 A; 4ZN1 A; 2XMF A; 1VQP Q; 2ESW A; 2EW3 A; 3VUZ A; 1TTH B; 2QQS A; 4A53 A; 3NFC A; 3S6W A; 1JQQ A; 4C0D B; 4NL3 A; 2DXB A; 1YJW A; 2BZ8 A; 2R58 A; 1ZSZ A; 1U5S A; 2QDY B; 4KGX B; 3M9Q A; 5I2S A; 3WXM B; 2RN8 A; 4WF2 A; 2J7I A; 1W70 A; 2EKO A; 1VIE A; 1WHJ A; 1Z9Z A; 3SWN B; 1WXT A; 5LL6 S; 1OZ2 A; 4IUV A; 1M3B A; 1NPP A; 2KMT A; 4OGC A; 2XKO C; 1VQO T; 4M7D D; 3FJ5 A; 1VQN Q; 2I0N A; 1OU9 A; 2K5F A; 2DPP B; 1H3Z A; 3M57 A; 2JZ2 A; 2FL7 A; 2H3E B; 2F2X A; 1D0Z A; 1M4Z A; 2KDS A; 5IHN A; 1JJ2 P; 2RHY A; 3G71 A; 4J8O A; 2E41 A; 2X3X D; 1K1Z A; 4M7A G; 1ABO A; 1ZBJ A; 4PJO C; 1UJY A; 2K4Y A; 4FCY A; 1M1G A; 2LX9 A; 2JW4 A; 3PNW C; 1BI1 A; 1QP2 A; 3M5A A; 1VQM Q; 3CCQ A; 1VQL Q; 2D6F A; 4HCB A; 4M7A F; 4JPB W; 5J26 A; 2AKL A; 5GAM g; 4FW1 A; 3G4S A; 2K9G A; 4JRK A; 4K11 A; 3V7C A; 3M0R A; 4F14 A; 2QQB A; 2CP2 A; 2JS0 A; 1PD0 A; 4E7Z A; 3I56 A; 1PWT A; 2GFA A; 4X9D A; 1IGU A; 2EQK A; 3H6Z A; 2XID A; 1SPK A; 4BDZ A; 2CYZ B; 3OSS C; 1GL5 A; 1D1A A; 1I1J A; 3EG3 A; 1YJN T; 2C0T A; 4J7F A; 4PJO E; 2DRK A; 4EPC A; 1JEG A; 4FSS A; 1LOJ A; 3KFV A; 3RIR A; 1ACM B; 2K3X A; 2KRO A; 5LJ3 h; 4XTZ A; 2WSC E; 4B6M A; 2HL3 A; 2RHI A; 3RDV A; 3JB9 J; 2EJF A; 4HVV A; 2K6D A; 4Z88 A; 4M75 D; 3FC3 A; 4HXJ A; 1RAD B; 2CSQ A; 2EQJ A; 2XHC A; 3X28 B; 3CCS Q; 1AWX A; 2NUZ A; 4QQD A; 6AT1 B; 3P8H A; 1LVK A; 1TUC A; 4C8Q A; 2GF7 A; 3FB9 A; 3V7S A; 3QYG B; 1XQH A; 5KH6 A; 5FRO A; 3OYK A; 4R56 A; 4EMK A; 1S72 A; 4OVA A; 3VS0 A; 3QJ6 A; 3M0Q A; 2DXT A; 1NEB A; 1YP5 A; 4IUR A; 1LCK A; 2YRD A; 5LJ5 g; 1GCQ C; 2R5A A; 1PRM C; 1I0C A; 1TXQ A; 1BB9 A; 1KQS A; 4J7I A; 1B7T A; 5KYY A; 3INZ A; 3CC4 T; 1G5V A; 1X6O A; 1X75 C; 3QZ9 B; 2DD5 A; 2DTI A; 4AFQ C; 3BFM A; 2E70 A; 2MF2 A; 4KH1 B; 4ELY C; 4LUD A; 3X20 B; 3HTR A; 2QGF B; 3RKX A; 1ZSZ C; 3SDZ A; 3EGU A; 3CCE A; 2COW A; 2YT6 A; 1VQ7 T; 5J39 A; 2B8A A; 2E5Q A; 1M5Q 1; 2OJ2 A; 3ZBD A; 3CPW A; 3M0U A; 3CCM A; 2VV5 A; 5CK9 A; 1X2K A; 2AT1 B; 2EYY A; 2P0Q A; 4M7A A; 2QXF A; 3JCM h; 4IUU A; 1RL2 A; 3REA B; 4JRP A; 4ZGJ B; 4M7D E; 2VXF A; 3A8G B; 3RMS A; 2ZPE B; 3QZ5 B; 2DAQ A; 2DL4 A; 2PTK A; 2RQR A; 3REB B; 2MYS A; 1VQO Q; 4HT9 A; 4M7D B; 3H0H A; 4WTO B; 2BE9 B; 2MI6 A; 2RO0 A; 3M0S A; 1JB0 E; 2KT8 A; 4FT4 A; 3OYY A; 4PL6 A; 1VYV A; 1ZA1 B; 1FMV A; 2KXD A; 3PGG A; 2OX7 A; 3CXC A; 1EIF A; 1PD1 A; 2RPN A; 2BKD N; 1BI0 A; 3M0T A; 3OYD A; 1Q7Y C; 1Q7Y R; 1QP3 A; 2BTT A; 2CH4 W; 1ZSZ B; 5GMK j; 4M78 C; 2KK4 A; 3OW2 P; 3I9Q A; 5ECA A; 4BI4 A; 2J06 A; 4XQ3 A; 3QPH A; 2YRC A; 3PMT A; 3I5S A; 3TQ7 P; 1WHL A; 2E65 A; 4IUQ A; 2D8H A; 5GAM j; 2HCK A; 4OMQ A; 4JDS A; 2LT4 A; 2DA9 A; 3J81 E; 1M1K U; 3MP1 A; 4L59 A; 4Y92 A; 2I2L A; 1YJN A; 4BUG A; 4RCB A; 5D6X A; 1EFN A; 2OI3 A; 1RLP C; 4J9H A; 1JRI A; 2DL8 A; 3R6O A; 1UE9 A; 2O9V A; 3RKY A; 1W2B P; 1YIT T; 1UGQ B; 4JJN K; 2V8K A; 3M53 A; 3CCJ A; 3A5Z B; 4C5I A; 3SD4 A; 5GAO r; 1K8A R; 1VQ8 Q; 2RHZ A; 2C0I A; 2DTO A; 3QWY A; 2X4Y A; 2XG8 D; 2EWN A; 2X9H A; 1V76 A; 5GAO m; 2ED0 A; 4JJD A; 4AG1 C; 2ZZD A; 1QVP A; 4C8Q C; 4X1V A; 5DM7 R; 3QUI A; 1TSF A; 2E6Z A; 5IN1 A; 1CKA A; 2H8H A; 8ATC B; 3OS0 A; 2G6F X; 1WDX A; 4F16 A; 1K0S A; 1UEC A; 1N6A A; 5HK0 A; 2CP6 A; 3CBO A; 1JO8 A; 3JCM W; 5GAN 7; 3UA6 A; 5AYF A; 2KY9 A; 4LNP A; 2RK2 A; 4HA8 A; 3JCM f; 3RKW A; 4PK4 A; 4MZT A; 4M77 G; 2P4R A; 2DK3 A; 1R77 A; 3JCM Q; 3CC4 A; 2E3I A; 2NWM A; 1IRX A; 1XOV A; 2QQ9 A; 3VRY A; 3M54 A; 2EQM A; 1NLO C; 1Q7Y U; 1RAE B; 3OS1 A; 3CC4 Q; 4IIO A; 4J9G A; 1JXM A; 2KBT A; 3G6E T; 1WJS A; 1QKW A; 4C92 C; 3S3M A; 2K3Y A; 1QCF A; 2KGT A; 2KR3 A; 1VQ7 A; 4M77 F; 3I55 T; 1WHK A; 1KC8 C; 1IXD A; 1KC8 R; 1FMW A; 3OYL A; 2KVQ G; 1ARK A; 4C8Q E; 2FZC B; 4DQ2 A; 1H64 1; 1MHN A; 3WVD B; 3OYF A; 2QK0 A; 4FT2 A; 3JCM c; 4C8Q B; 2YLC A; 4DOV A; 2O2O A; 5CVI A; 3UT1 A; 1M8M A; 4ZN3 A; 3CMA T; 2JOY A; 4EMK B; 5KYN A; 5GAN 3; 5C0M A; 1WQ7 A; 4A4K A; 2QDL A; 2DL7 A; 3NMZ C; 4GBQ A; 3OW2 S; 1AZE A; 3OMG A; 1I5O B; 1TWB A; 4HCC A; 3PMI A; 3VKI A; 1AWW A; 1Y57 A; 4CC3 A; 3E9F A; 3QJY A; 1K8A U; 2W0Z A; 1MV0 B; 3E19 A; 2M9U A; 4Z02 A; 5KYY B; 1N27 A; 4N4G A; 4C92 E; 1KIK A; 2LZ6 B; 4MZM A; 2LQK A; 3IQL A; 4KUI A; 4MML A; 2E4H A; 4M75 G; 3DLM A; 3A8H B; 3H9N A; 3LH5 A; 2M0Y A; 3TVT A; 1BCO A; 4Z8A A; 4C5E A; 2CP7 A; 3UDC A; 2KT1 A; 4N0A A; 2VWF A; 1NG2 A; 1WYX A; 1RAB B; 1UTI A; 1WLP B; 1VQ6 A; 1W2B S; 1M2V A; 4M7A E; 5IT9 E; 4IUP A; 2HQX A; 4CC2 A; 4BY6 C; 2RM4 A; 2M16 A; 5LJ3 j; 4PFP A; 2AIR B; 3FJP A; 2V1Q A; 4M75 F; 4CC7 A; 4BB7 A; 2JM9 A; 4M7A B; 3OYC A; 2RB6 A; 3OYH A; 4C0D C; 3CCR T; 2RQV A; 4LDX A; 1NE8 A; 3GBQ A; 3CD6 A; 1AEY A; 3UA7 A; 1GCP A; 3VV0 A; 1D09 B; 1SSH A; 1YJ9 T; 5I11 A; 4J9B A; 1BU1 A; 3ZFJ A; 2ED1 A; 3EG9 A; 3NTI A; 3RUX A; 1VQ4 T; 3OMC A; 1EX4 A; 1YIT A; 1WHM A; 4N4I A; 5CAI A; 1AT1 B; 3OBY A; 3LLR A; 4FYW B; 1IHV A; 1R0B G; 1KQ2 A; 4HVW A; 2P4T A; 3GF5 A; 3EFR A; 3V8L A; 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