1PRXA

Horf6 a novel human peroxidase enzyme
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
220
structure length
219
Chain Sequence
LLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNSEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a novel human peroxidase enzyme at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HORF6
molecule tags Antioxidant
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 219
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 1998-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 1prxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1prxA01
1T1VA 4X1UA 1BX9A 2G0FA 3M9KA 4MDCA 4G10A 2H30A 3U6VA 3KM6A 4AF2A 1VRSD 3L0HA 6GSSA 4IELA 1GNWA 1PA3A 3F3QA 3EVIA 2C0FA 2X64A 3D0ZA 5L71A 2ZNMA 9GSSA 5H5RA 3CSIA 5ECSA 1S3DA 1YEPA 1YKCA 1CQGA 3Q74A 1JHBA 2LNSA 4GXZA 2FD3A 4ACSA 3DGQA 3IV4A 11GSA 2OADA 5DJMA 4TXVA 2L4QA 2XPDA 2OACA 2LSTA 2PWJA 5IMDA 4J2FA 4X0XA 1EZKA 1R7HA 4QQ7A 1U3AA 2CV4A 4TOPA 3CRTA 3RBTA 3M3MA 2HSHA 3M9JA 1LBKA 3H93A 5IOWA 1I9DA 3GKXA 5B8AA 5HR2A 1GRXA 5DCGA 1TU8A 4Z7XA 1A0RP 1HQOA 2IMKA 1SK0A 5B7CA 1XZOA 1OVNA 1TRWA 1EV9A 4FO5A 2NBSA 1JLVA 3KZQA 1ILOA 2JL4A 1GSUA 4EVMA 2FGXA 2FWGA 2H01A 4V1Ap 2LNTA 2WRTA 4OFNA 3M0FA 2H6XA 2A2RA 3GL5A 2BMXA 2DJKA 2I1UA 1THOA 4YQVA 5GAND 2WFCA 1PMTA 4DEJA 2FUG2 4OWYA 2HNLA 4F0BA 1TK8B 1B4QA 3MAKA 5ECNB 2K6VA 2RUEA 4MK3A 1V40A 2XBIA 3QAGA 1AAZA 3IC4A 1SL2B 1B9YC 1XW9A 2KLXA 2C0EA 5IO0A 3FK8A 1V57A 2G2QA 5JWOB 2L59A 4NPBA 13GSA 1A8YA 1OYJA 2I4AA 3MNGA 1T00A 2MMZA 4IVFA 3EYTA 2VCWA 2IFQB 3TUEA 2VIMA 3L78A 4GQCA 4KCEA 1GL8A 7GSSA 4PUAA 4NMUA 2H71A 1XBSA 4RQRA 3ISOA 2V1MA 3IR4A 4QL7A 4NAXA 1JZWA 2ON5A 2AUVA 3FR9A 4TXOA 2C3NA 3Q19A 1SJZA 2GDRA 4JBBA 3TJBA 3LG6A 1A2JA 4XIHA 1KNGA 2YWOA 3TKPA 1Q4JA 4ULXA 2OKAA 4V1Ag 4EKZA 1DSBA 1GP1A 5JWQB 3QOUA 4MMMA 4GF0A 2H1DA 1SK1A 3IK7A 1TRUA 1T8EB 2FWHA 4I2TA 1NM3A 4K1FA 3DD3A 3GH6A 5HFKA 5A4VA 6GSVA 4BVXA 3APQA 2GSQA 3TJGA 1K3LA 1M7TA 3KJYA 4XCSA 5GSTA 1Y6EA 2YV7A 4DSRA 2MMOA 4CHSA 3TRXA 2DIZA 1M9BA 2B7JA 4FH8A 2XBQA 1XOBA 2ES7A 1ERVA 3A2XA 4KDUA 2AV4A 3IRAA 4EL1A 4DSQA 3GKKA 1J08A 3JCML 1MDIA 5DALB 1PL1A 2H1AA 1K0OA 2VL3A 2VCVA 4N10A 1DE1A 4XS4A 3TJKA 4ZB8A 3ZMLA 3ZZXA 2CZ2A 3C73A 2O7KA 3WGDA 1E6BA 2OE1A 4HS1A 3HCZA 3C8EA 5D73A 1SJ6A 3SBCA 3ZIJA 4ECIA 5A4UA 2QKEA 1G7OA 2DC5A 3PR8A 3ERWA 5HFGA 4BWSA 2KP2A 3TKSC 3LQ7A 2C80A 1EEMA 1MDJA 1V58A 2WB9A 5C04A 3GH9A 4IS0A 4Q5QA 1EGRA 2PVOC 3C1SA 1SENA 5JCUA 2N5FA 5ID2A 4N11A 3GRXA 1YKAA 3Q6OA 4GTUA 4K7OA 4I6XA 4J57E 5IIZA 1GSFA 2KUCA 1XCCA 3NOFA 3I43A 4I97A 1URMA 5FWGA 1PX6A 1H75A 3ZLPA 4PX1A 5AN1A 4MH3A 1C72A 5D96A 5ENUA 5B8BA 1SL0B 2AYTA 3CYNA 4N0ZA 3PH9A 1RW1A 4KA0A 2V2GA 2DJ2A 2VM2A 3KMOA 3O3TA 4CDOA 4KAEA 1WOUA 1O8WA 3GL3A 4OCEA 1J9BA 5CREA 1FW1A 1SKSB 2NPBA 4TVEA 3HVXA 2DMLA 4ILFA 1PX7A 5ECKB 4EUYA 4KSMA 4DSSB 3GSTA 3EU3A 3HJOA 3G7JA 5D9VA 4OCFA 3D22A 2HXKA 3L9SA 2MMAA 1X5DA 1VF2A 3TJFA 1I5GA 1XIYA 4KE3A 5JCGA 2C0GA 3LXZA 1SL1B 4F0CA 2VD1A 3TOTA 4IJIA 2GSSA 1QQ2A 2E2GA 2O89A 5IM9A 4FYUA 2VLUA 2GZPA 6GSUA 19GSA 2X99A 4MP4A 14GSA 2B5YA 2H0GA 3FR3A 22GSA 3RDWA 1WP0A 2DIYA 2KHPA 4HZ4A 2CA8A 3EINA 5HR1A 2FA4A 2H1GA 1XWKA 2YPMA 3DXBA 3D4TA 2RIIA 4LL1B 3KD0A 1X5EA 3PGTA 3BCKA 4MLYA 5EPFA 3VWVA 4L0UA 3SWLA 1K0MA 1FVKA 2JZRA 1ZZYA 2YJ7A 4NWYA 4Q5NA 1Z5YE 4ZIJA 5DQSA 4TN8A 2C3TA 5G5FA 4EO3A 2HI7A 4F82A 2H76A 3WYWA 1XWCA 4MZBA 1ERUA 1TK5B 5DALA 3DMLA 4XTSA 4FYCA 4GQFA 3QD9A 2VAFA 1A2MA 3C1RA 4PQIA 2AAWA 5J41A 4ZL8A 2R5GA 5J4UA 2M72A 3RHBA 3TRPA 1GSYA 3VFIA 4KSOA 4IQAA 1F3BA 3UL3A 3IE3A 2K8SA 1IYIA 5FHIA 3WGXA 2IMFA 3D21A 5DAKB 3ME8A 4ECJA 4PQ1A 1YZXA 3ZFLA 5F0GA 3ERGA 2L57A 4YQMA 1X9SB 1DUGA 1WMJA 2RLIA 2IPAA 1QGVA 1J0FA 4K0GA 5AIXA 5F06A 2B5XA 1OC9B 3RPNA 2MBTA 1GTAA 5AISA 4IHUA 5D9XA 4WETA 2ZUPA 3UVHA 5A5KA 4NXIA 6GSYA 1TI3A 5ECLB 5H5QA 1THXA 4I5QA 1FVJA 3HZ8A 1V9WA 3AY8A 1UA5A 4RUVA 1TTZA 2HRFA 2HZFA 3UEMA 4E8EA 2FHEA 2VCZA 5LNKe 2NTOA 4JE1A 4HEA2 1XVWA 1GTBA 5IMZA 4IGJA 2N5AA 1H4OA 3A2VA 4PGTA 3FR6A 4V2MA 3GKNA 2REMA 3QDNA 1U87A 1YDKA 1ML6A 2M46A 1TK0B 1WIKA 3VWUA 1NSWA 2DSAA 4GSSA 3HDCA 3KP8A 1FO5A 3IA1A 2P5QA 1VF3A 5F05A 2GTUA 1N2AA 3WT1A 3FKFA 1SYRA 2IL3A 5ELGA 1QFNA 2B1LA 1G7EA 3UBKA 3M8NA 2O85A 2WCIA 4YQUA 2B1KA 2E2MA 2WZ9A 1XFLA 3TKQA 5IO2A 2VOCA 2WULA 3IPZA 1RK4A 3FW2A 4PURA 3LORA 4TR1A 1KEBA 2PERA 2H6YA 5ECPB 1EOHA 2HYXA 5CRGA 3UJ1A 2I81A 4ZILA 1NHYA 4IKHA 3RHCA 3U5RE 2WDUA 1PRXA 2YZUA 3UARA 2V6KA 1W4VA 3S9FA 2CQ9A 2QGVA 1SJIA 2IMDA 4ZL9A 3DIEA 1F9MA 2B3SA 2LKUA 4POKA 5HFIA 1ZL9A 5CO3A 1TJDA 4K2DA 3E3EA 2E0QA 3IHQA 4HU9A 3UBLA 3LWAA 3UAPA 2VL2A 3EURA 1Q98A 5IPGA 1A24A 5J3RA 2B7KA 1E2YA 4NV2A 4ZBBA 3BCIA 4POBA 4KCAA 1F37A 1F2EA 2GQLA 3F9UA 4KDYA 3VI5A 1G6YA 1GLPA 1XPVA 5DDLA 2AHEA 2CVDA 1XXUA 4RI7A 2XC2A 4ID0A 2LTKA 2EC4A 4N30A 2F3MA 4IP6A 1XWGA 4GRFA 3TKRA 1ZGNA 1TDIA 4F03A 1OKDA 2FNOA 3ZMKA 1SKRB 1VGLA 1ON4A 1XOAA 1A23A 3BOAA 2J9HA 1U88A 2JACA 3HA9A 5IMCA 3H79A 2H0HA 3G9BA 4IQ1A 1F3AA 1GUHA 1S3AA 4NHWA 4G2EA 2VO4A 4JRRA 2HT9A 4AJ6A 3QPMA 3I9V2 5ECOB 3H1NA 3KP9A 1TOFA 3ZITA 3EMPA 4KGIA 5A4WA 5IMFA 2GVPA 2BTOT 1GSQA 4YH2A 3CSHA 4RQXA 5D9WA 3US3A 3TGZA 3ERFA 1PSQA 1TP9A 4ZBDA 3J7Yb 3UOMA 5G1LA 1EOGA 4EF0A 3C71A 4F9ZA 1Z6NA 2JZSA 2QSIA 3C7MA 2XPEA 2YV9A 2LQOA 2F8AA 2V6OA 3F8UA 4PQHA 1CQHA 5EVOA 4LLRA 17GSA 4EDZA 1YF1A 2N5BA 3VLNA 4JR6A 2HZEB 2A2SA 2RM6A 4OMVA 3EE2A 2MBSA 1ERTA 1HD2A 4Q5FA 5DQYA 3IOSA 3H8QA 2P5RA 4K0NA 1Y25A 4O32A 5ECQB 2H75A 2B5EA 2JU5A 2F51A 2F9SA 2B6MA 3GN3A 3K8NA 4ZB9A 2X8HA 4HDEA 1YJ6A 3GTUB 1TRSA 3RAZA 2GZYA 3TOUA 2YOIA 4HJ2A 3ZVJA 1X9WB 2KOKA 1K0DA 2GGTA 1EV4A 2Z9SA 3D6IA 2X8GA 4GCIA 3TDGA 5IPHA 1O73A 2CVBA 2H8LA 1TU7A 4J56E 3BBYA 5CNWA 3P2AA 3HJPA 2CT6A 1KBNA 3F4SA 1AC1A 2IMIA 4IBPA 5C00A 3G7IA 4ZBAA 3HJMA 3DEXA 2BJXA 5F8BA 3FYGA 3E9JB 2V41A 5IMAA 5D93A 2JSYA 4G19A 3F0IA 1HYUA 1YF0A 5COHA 2OE0A 3F3RA 3WT2A 1T4ZA 1PKWA 4BA7A 2GT5A 3FZ4A 2VL2C 4D73B 3KMNA 2IFQA 2C1YA 1SU9A 1YQ1A 3Q18A 1PD21 5CYYA 2PPTA 2YCDA 3F4TA 2VLTA 3RPPA 3F6DA 5GAPD 2H73A 2A4VA 3CMIA 5G1KA 3ZRDA 3PINA 2ALBA 4EDYA 2GQKA 3P8WA 1EEJA 4PUFC 3KTBA 1SD9A 2O8VB 5J9CA 2NDOA 2YANA 3L9UA 3TKSE 4POMA 2K18A 4LA1A 2DBCA 4OO5A 4MJBA 2GS3A 3KGKA 2FCHA 3I6AA 1JFUA 1GUKA 4IP1A 1AXDA 3MSZA 5EY6A 3QCPA 16GSA 2O87A 3CTGA 3J7Yk 2DMMA 2VUPA 3ME7A 4PXOA 2PN8A 1M2AA 2R3XA 2H0IA 2LEGA 3KXOA 3KH7A 4ZXGA 3HY2A 4KW6A 1S3CA 2HE3A 2YWIA 1F6MC 1YY7A 5DVBA 1BYEA 1U6TA 2FWEA 3HKRA 3MWHA 4XRAA 1GNEA 2WS2A 4MF5A 3N9JA 5INYA 12GSA 4ZB6A 5H5SA 1GTUA 3KEBA 3TB2A 1AQVA 4MA9A 4X43A 1M0UA 1Z7RA 1JZOA 3IDVA 1VF1A 3HHVA 4H86A 2ON7A 4JEDA 4HOJA 4OO4A 2L6DA 1JZDA 5HQPA 3HXSA 3HD5A 3HVVA 4L8EA 4TXOB 1BJXA 1WWJA 4MH2A 1ERWA 3OR5A 3GNJA 1B48A 5KEJA 2P31A 5ECMB 10GSA 3UIWA 4MABA 2F8FA 2CX4A 4MZWA 1GWCA 5G5EA 2PVQA 2GT6A 1XWBA 3EC3A 1GTIA 4MPGA 3DWVA 1FB0A 1AIUA 2H74A 1TW9A 3EWLA 1XWAA 3ZTLA 2LS5A 5GSSA 1QK8A 4MF6A 4TR0A 3GX0A 2VCQA 4XS6A 4TW5A 5LD0A 4HU7A 1R5PA 2L5OA 1M2BA 1R5AA 5B6NA 1GLQA 3GSSA 5KN2A 4G9HA 18GSA 1X5CA 1R4WA 4HQSA 3W8SA 2LRNA 5E59A 4WR5A 5G2ZA 3GV1A 2LRCA 4K9ZA 5IQYA 1IYHA 1WE0A 4DSSA 1HNAA 3I69A 4CW9A 2YWMA 1OC8A 4XS4B 3GKMA 2IMEA 4O7HA 4WEYA 1TKDB 3WD6A 2YWNA 4TR4A 2GLRA 1NW2A 2YP6A 4D73A 3IXRA 1TRVA 4MJAA 1PQNA 2PU9C 3APSA 4F2IA 2C4JA 2TRCP 3FZAA 2OE3A 1MDKA 3LFLA 3WGEA 1QMVA 3NZNA 2DLXA 3DRNA 4OFMA 3TKSA 4OFTA 1ZYEA 4QL9A 1VF4A 2IIYA 5KN1A 4TR3A 3GURA 4HJMA 2OA7A 2WJUA 2FLSA 4IJ3A 2GSRA 4WR4A 3VURA 20GSA 2H6ZA 4MPFA 5ID2B 3VPQA 5B6MA 4KH7A 1K3OA 1GULA 3W6GA 2DJ0A 3CTFA 4EXJA 5KN3A 4K7NA 2EIRA 3D4MA 4GWRA 1BEDA 1OE8A 2KP1A 4N0VA 3KH9A 1B8XA 4MCUA 1EWXA 3A3TA 1Z6MA 1DBYA 1EP7A 4WBJA 4BPYA 1K0CA 2OBIA 5JWRB 4LL4B 2LUSA 3VI7A 3NIVA 4POLA 2I3YA 5J5NA 2PMTA 3DYRA 3LGCA 4IN0A 4WXTA 2R37A 3GFKA 3LYPA 4I2UA 2ZCTA 2R4VA 2AB6A 1G6WA 3R2QA 4LMWA 3FEUA 3DVXA 4WKWA 4MF7A 5CP1A 4NHZA 1JLWA 3FRCA 1K3YA 3GHAA 3VK9A 1AQWA 3F6FA 1ZMAA 1FB6A 4TRXA 4V2NA 2MYGA 4HZ2A 2L6CA 1WPIA 1X0RA 1M99A 2X8CA 2C3QA 2RUFA 5FT3A 5HR0A 2OJLA 1MD4A 4WF5A 1AQXA 3MDKA 4L5LA 3L4NA 4E8HA 2C8UA 2D2ZA 1ZYQB 1AUCA 1EGOA 4HI7A 4NV5A 4KX4A 2DJ3A 3GUSA 3FHKA 2WGRA 2EIQA 2VLVA 4KUNA 4OD7A 5DAKA 1Z7PA 1FG4A 2M80A 3HVSA 2HSYA 5ECRB 1V2AA 6GSTA 2GZZA 2I9HA 5KN0A 5D8IA 3E0UA 2OBKA 2H19A 1XW5A 4MJEA 5AGYA 5G31A 5ABRA 5LCZA 5EL8A 4AJ8A 2CVKA 1DE2A 4JU5A 1HNBA 1OC9A 3LSZA 1QXHA 4Q5RA 5ECHB 2YZHA 1UC7A 4KNDA 3W8JA 2EIOA 2K9FA 1K0NA 3DKSA 1KTEA 1LU4A 1WRYA 1TXXA 1GSDA 2VM1A 3M1GA 3KIJA 5DCHA 4ECBA 2HLSA 2LJRA 2R6KA 1FOVA 5DBQA 2LRTA 5ELAA 4BWQA 5CAXA 1W89A 4ZL7A 3KTLA 3ZFBA 4BL7A 2C0DA 1U3IA 4PNFA 1GUMA 1XVQA 5GZZB 2L4CA 1O6JA 2FY6A 1OE7A 3D5JA 2YN1A 3CRUA 3GA4A 3P90A 3DVWA 1G0TA 1BG5A 3L9VA 4P3YB 2TIRA 6GSXA 3IAM2 1T7PB 4KDXA 2PUKC 1ZCPA 4PNGA 3O76A 3VWWA 2DJJA 4ML6A 3UVTA 4EE0A 2P0GA 3H4KA 2H66A 1LJRA 1FAAA 1SK2A 1BAYA 3F63A 5CRWA 4MJCA 1UN2A 6GSWA 3GX8A 3QR6A 1M9AA 2JZTA 2IJYA 4V2LA 4DVCA 3ED3A 5E4WA 2JADA 1B9XC 2MMNA 4RI6A 2H70A 3P7XA 3VPTA 1PKZA 2R2JA 2MZCA 4YAVA 1O7UA 4L0WA 2GQMA 1B4PA 3IK9A 2IWTA 4WBRD 3TJJA 5AIVA 1K0BA 3APOA 4GLTA 4K6XA 5J9BA 1T4YA 3HZ4A 1ABAA 1R26A 4HQZA 1OKTA 2GSTA 3QAVA 5HR3A 2NVLA 2E7PA 5G30A 3UMAA 4O5RA 4JR4A 4XS1A 3O6TA 3TCOA 1MTCA 1T3BA 2K8VA 1A8LA 3VWXA 2VCTA 1ACVA 8GSSA 3FZ5A 3IAS2 4ISDA 5CRHA 3LJRA 1QUWA 3EU4A 5F07A 1XW6A 1V98A 2CZ3A 3QFAC 1PGTA 4YAPA 5D9TA 4TKYA 2TRXA 4AGSA 5CRDA 4L5OA 1OC3A 3CXGA 2XHFA 2H1BA 3IBHA 3TRQA 3KCMA 3ZVJD 1JZRA 2CAQA 1ST9A 1K0AA 3F4RA 5IMVA 2FWFA 3BD2A 3QFBC 2FA8A 2J23A 1O8XA 2PBJA 1X9MB 3GYKA 3FZ9A 4TR1B 1A2LA 3N5OA 2H72A 3CBUA 1BQ7A 1NHOA 1A0FA 1FHEA 2CX3A 2RM5A 3QMXA 3LXTA 1USBA 4XRDA 5ECIB 4WF4A 3EMXA 3ZIVA 2LJAA 1UVZA 2VCXA 3ZL5A 1Z9HA 1MD3A 4GSTA 1SYXA 4IW9A 3ZYWA 5JCWA 2VL9A 1OAZA 3A5WA 4HUAA 1EP8A 5DJLA 3GMFA 1PL2A 2L5LA 4LMVA 3A2WA 3GIXA 1SD8A 4JZQA 1MEKA 2HRNA 4ML1A 4XHMA 4KB3A 2LV3A 3BJ5A 1ZOFA 1RQMA 2HZEA 1TI1A 2LJKA 4AJ7A 3V1WA 2QC7A 2JSZA 2VD0A 2LQQA 5IOXA 3FY7A 1O81A 1N8JA 1PN9A 1YEXA 3CSJA 4MZCA 1SKWB 4K8MA 3LYKA 1O85A 1Z3EA 2CAIA 1WJKA 3HYPA 1GH2A 2HFDA 1GSEA 3ZREA 3QAWA 1M2DA 2IN3A 2YJHA 3GTUA 4EC0A 2DJ1A 4K7IA 3LEFA 4ECCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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