1PRXA

Horf6 a novel human peroxidase enzyme
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
220
structure length
219
Chain Sequence
LLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNSEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a novel human peroxidase enzyme at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HORF6
source organism Homo sapiens
molecule tags Antioxidant
total genus 64
structure length 219
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 1998-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 1prxA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1prxA01
1W89A 3KP8A 2GQKA 4JRRA 1R26A 5DCHA 2CVDA 1M99A 4FYUA 1HNCA 2B5YA 5J41A 2N5BA 5DALA 2IMDA 4ZL8A 2PUKC 2LJAA 3F4SA 3MNGA 1X5CA 1J0FA 1E6BA 2VCZA 2TRCP 1FHEA 2H66A 2JZRA 4JEDA 1KEBA 2ZUPA 4ZBDA 2WULA 1ERVA 4L0UA 4AJ6A 3L9VA 1TU7A 4AGSA 1T1VA 5IMAA 1V57A 4GRFA 4PX1A 1QXHA 4MF6A 1DUGA 2RUFA 3TJBA 3DIEA 4EC0A 2H71A 1SD8A 1UN2A 5FWGA 3IAM2 4GQCA 4NPBA 2IMFA 4MF5A 11GSA 1ZYEA 1FAAA 4ULXA 4DVCA 6GSXA 13GSA 5HR2A 2PBJA 4G10A 3IBHA 4RI6A 4TR3A 5ECRB 3F63A 1PL2A 2NDOA 4WEYA 5IMCA 3HJOA 2OKAA 10GSA 1WJKA 3UL3A 2CA8A 2VLUA 3ZREA 4K1FA 4OWYA 20GSA 1AC1A 4NV5A 2ES7A 2I81A 4DSSA 1IYIA 1Y6EA 2DIZA 1M9BA 2R6KA 1GWCA 2DLXA 2CAQA 3ZMKA 1XW6A 5ID2A 3TRXA 5GAND 2MBSA 4I97A 4WF5A 2WRTA 5DQYA 1ABAA 1ML6A 3DWVA 5GSTA 3QR6A 2C0FA 2LS5A 4ECIA 1THOA 1PKWA 2X99A 3UARA 3RPPA 5C00A 3J7Yb 2RIIA 4MK3A 3A5WA 2FCHA 2FWEA 3I6AA 3KD0A 4XS6A 2FNOA 2P31A 3CTGA 1MTCA 4WXTA 6GSTA 1Z6MA 3DVWA 3HY2A 5AIVA 2LNTA 2HFDA 1SKRB 3WGEA 1F2EA 2OE3A 3GL3A 3TB2A 1G7EA 1WWJA 2HZEA 4IP1A 4GTUA 4XS4A 3H8QA 4GF0A 2FWHA 5JWRB 2ON7A 4O32A 5D9TA 2PWJA 2K9FA 1UC7A 2GSRA 3LFLA 2HRFA 4PNGA 4JR4A 1TI3A 2WDUA 2KUCA 1BQ7A 2V6KA 4LL1B 2YZHA 2DSAA 5H5RA 1B8XA 1OAZA 3BCIA 4PQIA 3VFIA 4BA7A 5COHA 4N0ZA 1TRVA 2FA4A 3ERFA 2VM2A 6GSUA 3KGKA 3FZAA 1U88A 4TR4A 4AJ8A 2JU5A 1IYHA 5A4UA 1QK8A 2L57A 2YWOA 5GZZB 2LUSA 2IIYA 3W8JA 5HR0A 1WPIA 3QFBC 1YF0A 2DC5A 1EEMA 2X64A 4ILFA 2MZCA 2N5AA 4ID0A 4KDXA 1QGVA 3ISOA 3IR4A 1U3AA 1GSQA 1JLVA 1UVZA 1ZMAA 4IN0A 1MEKA 2WS2A 2GSTA 1OC3A 4QL7A 1PD21 4YAPA 3TOUA 5DCGA 4PNFA 3GL5A 4EDZA 2ALBA 8GSSA 4LMWA 2A4VA 1GUHA 2YZUA 1ON4A 2OJLA 2VUPA 1R7HA 1A8LA 1QFNA 2YANA 1XOBA 3CBUA 4Q5QA 1YKCA 5AISA 4EO3A 2L59A 1O7UA 2RLIA 4HQZA 4G19A 2VOCA 4CDOA 2HNLA 3ZFBA 2CX4A 2GGTA 2LEGA 1Z7RA 2AHEA 5ECKB 5DJMA 3CTFA 3W8SA 4RI7A 2IFQA 2IPAA 1XIYA 3KH7A 3LXTA 3EURA 1RQMA 2LTKA 1T7PB 3M3MA 5D96A 3MWHA 4FH8A 2GZYA 18GSA 2DMLA 4FO5A 4O7HA 1NHOA 4TVEA 1GSYA 3ZMLA 4IS0A 2KLXA 3CSHA 5CREA 3F4TA 2C4JA 2VL2C 2VO4A 3FR9A 2BJXA 2IL3A 2GT6A 2H6XA 4OO5A 5CRHA 4WBRD 5CYYA 1FOVA 5HQPA 5D9VA 5F05A 4TR1B 3EU4A 3V1WA 2OACA 3DXBA 3KM6A 3TRPA 5ECQB 3P8WA 1GULA 1I9DA 3FK8A 2H6ZA 4ZXGA 3MSZA 5EL8A 1T4YA 5F07A 4IQAA 3GKMA 4K7IA 2V41A 1OC9A 2AYTA 2FWGA 1N2AA 2H30A 9GSSA 4GSSA 5GSSA 2H1DA 1NHYA 4RQRA 1PX6A 2C0GA 1PSQA 3ERWA 4JE1A 5G31A 1SJ6A 2F3MA 1EGRA 4F2IA 4PUFC 3F6DA 2X8CA 3WD6A 3EWLA 4N11A 1Z9HA 4ZL9A 1EV9A 5ECNB 1S3AA 2GT5A 2CV4A 4K9ZA 2GSSA 1M0UA 1OE7A 1ZZYA 5ECPB 2VAFA 3IAS2 2HT9A 2YN1A 4ML6A 2F8FA 3GX8A 2VCTA 4NHWA 3ZLPA 4V1Ag 2B1LA 3DMLA 1AW9A 1J08A 3WYWA 5G1KA 3OR5A 1ZYQB 2EIQA 2CX3A 2HZFA 1VF1A 4PUAA 4D73B 12GSA 3KEBA 2QSIA 2WGRA 2I9HA 3C1SA 4TR0A 1SL1B 2DIYA 4LA1A 3TKSA 1OKDA 1BEDA 7GSSA 3PH9A 1E2YA 3UOMA 3GNJA 1TRSA 1YEPA 2R3XA 3N5OA 1ZL9A 1G7OA 1GUMA 2P5RA 3DD3A 4BWSA 16GSA 5G5FA 2V6OA 4J57E 4HOJA 1M2AA 3PGTA 2Z9SA 2GQLA 1F9MA 4MCUA 1YKAA 5DAKB 4Z7XA 3NOFA 1NW2A 3IOSA 4TW5A 4GXZA 3TKQA 1Z7PA 3BBYA 3KH9A 1PN9A 3FRCA 2CT6A 2IWTA 4MF7A 3J7Yk 4WR4A 5G2ZA 4YQVA 2X8GA 3ED3A 5IPGA 3F9UA 4IBPA 2AUVA 1XPVA 3F3QA 4ZBAA 2YP6A 2B3SA 2R2JA 1K3YA 1OKTA 2L4CA 1XZOA 4TOPA 1NM3A 2L5OA 2MMAA 2XBQA 4L0WA 4P3YB 1SJIA 1SL0B 3QFAC 2DJJA 1YY7A 3O6TA 2KP1A 1GTBA 2TRXA 1U6TA 4EL1A 3VWXA 1SYXA 1USBA 3H4KA 2H76A 2RM5A 1MD4A 2KP2A 1ERWA 3CRUA 2IJYA 4IELA 5JWQB 2DJ1A 4PURA 5CAXA 3IK9A 1AQWA 5EPFA 1V9WA 1CQGA 2DJ3A 4IGJA 5IO2A 3EYTA 1G6WA 5ID2B 1K0OA 5HR3A 3JCML 5ECLB 3PR8A 2IN3A 4MH2A 3M0FA 4Q5RA 1YJ6A 2H73A 2FD3A 2YNXA 3TUEA 1AXDA 4OFMA 3GX0A 1G6YA 1R5AA 1M7TA 1WIKA 2I4AA 3KXOA 1J9BA 4BPYA 5J4UA 3HVXA 1Z5YE 1TTZA 4GQFA 3UEMA 4Q5NA 2VD0A 3HJPA 1GP1A 3LQ7A 2B7JA 2R4VA 5F0GA 4OMVA 3P90A 5IIZA 3APOA 4KW6A 4V1Ap 4POLA 4MPFA 2RUEA 1N8JA 5J3RA 4N0VA 3TJKA 5DBQA 4V2MA 2PGTA 1YQ1A 2C3NA 1JZWA 5C04A 1XWKA 4K7NA 5A5KA 4ACSA 5ECOB 3NZNA 1WRYA 3C73A 1OC8A 2WZ9A 4HU9A 2QKEA 3CSIA 2D2ZA 3WGDA 4FYCA 2REMA 3UBKA 1WE0A 2JADA 17GSA 2I3YA 3VWVA 1U3IA 3I9V2 4MJCA 3UJ1A 2R5GA 3GSSA 4OO4A 5D8IA 1EV4A 3M9JA 1TK0B 3QMXA 1SD9A 2H19A 2H0HA 4MPGA 3UIWA 3LSZA 2GZZA 4GLTA 1TK5B 1SK2A 2CVKA 3F4RA 2O7KA 4ZBBA 4IQ1A 5JWOB 1GH2A 3WT1A 4XS1A 1ST9A 2C80A 5G30A 1Z6NA 2H1AA 2VCXA 1PGTA 2K6VA 1B9YC 2C3TA 5EY6A 5IO0A 2H75A 5D9WA 3FR3A 3TCOA 4LLRA 2JSYA 2MMZA 2YWNA 1GRXA 2OADA 3QPMA 2JSZA 1FB0A 2JZSA 1VF2A 1VRSD 1EEJA 2C0DA 2FHEA 1XVWA 1W4VA 4X0XA 3E0UA 2B6MA 1GTIA 2YV7A 4IP6A 2GQMA 4HJ2A 3F8UA 1XWBA 2OA7A 4O5RA 5IQYA 3L4NA 2E2MA 5H5QA 1GSDA 2MMNA 4XRDA 1K0CA 4L5LA 3CYNA 1EP7A 1B4PA 1FO5A 2XHFA 2O89A 2B5EA 1SENA 5CO3A 4XRAA 4F82A 4OD7A 3ZRDA 1ZOFA 4RQXA 2CQ9A 4POKA 3VPQA 4MJBA 5IM9A 4BWQA 4GSNA 5IMFA 4MABA 1GTAA 4ZILA 1OYJA 4ECBA 3HJMA 2YPMA 5CP1A 2VD1A 1GLPA 2K18A 2IFQB 1GSUA 5CRDA 4IJ3A 3G7YA 2C0EA 3A2WA 1A2LA 1URMA 2A2SA 2L6DA 4EE0A 5L71A 3FZ5A 2PVOC 3IHQA 3QOUA 1GTUA 3P2AA 3LGCA 1X9SB 3H93A 2FA8A 3L9UA 1ERUA 3GSTA 5IOWA 2JACA 4XTSA 3EINA 4IW9A 3C1RA 5KEJA 4PQ1A 1JZOA 1CQHA 3GHAA 1XWGA 4KSMA 3F0IA 1B4QA 6GSSA 1I5GA 2RM6A 2VIMA 1BAYA 4KX4A 3BOAA 2H8LA 2GS3A 1X9MB 1LJRA 3TRQA 1XWAA 2G0FA 5GAPD 1QUWA 3A2VA 3LYPA 1NSWA 1SK1A 3IK7A 1TW9A 1T8EB 2E7PA 2ZNMA 3Q18A 1Z3EA 1XCCA 3UBLA 1BG5A 1WOUA 2P0GA 2FUG2 1THXA 4RUVA 1F3BA 3G7IA 4XIHA 3TJFA 2L6CA 2HI7A 2WCIA 1K0MA 3DKSA 4KB3A 2VCWA 4BVXA 4DEJA 2LRNA 4YAVA 2VLTA 2V2GA 3CRTA 2E0QA 5IMVA 1ERTA 1XWCA 2JL4A 3UVTA 1FB6A 2YWMA 5AIXA 2X8HA 1QQ2A 1M2DA 1DE2A 1SJZA 1EOHA 3GUSA 3VWUA 1O73A 3KIJA 3L78A 3FZ9A 3VI5A 4OCFA 4G9HA 1SYRA 4N10A 1XW5A 1HNBA 4HEA2 2XBIA 4NMUA 3TJGA 3D5JA 2O8VB 1BJXA 2WFCA 1GUKA 1JZDA 5HFKA 4X1UA 3EC3A 3I69A 4BVYA 5B6NA 1K0DA 4MZCA 5D93A 2VCQA 4ZB9A 1O8XA 1AQXA 3FY7A 1BX9A 3HHVA 1A8YA 3A2XA 4GSTA 2IMEA 3H1NA 2VM1A 4HS1A 4E8EA 5CRWA 3RDWA 4J56E 3GTUB 1HD2A 2H1GA 1H75A 2JZTA 4ECCA 4TXOA 2FGXA 2HSHA 1VF3A 1VF4A 1AIUA 4MZWA 2NTOA 3QAVA 4PXOA 1A24A 2CZ2A 2MMOA 2H74A 4V2NA 3D4TA 4EDYA 4POBA 4WBJA 4FIWA 2HYXA 4HZ4A 1TDIA 3ZITA 3K8NA 4OFTA 4TXVA 3D22A 3CSJA 1HNAA 3A3TA 2AAWA 1A0FA 5J9CA 4NXIA 1PRXA 4EKZA 4JR6A 2L4QA 4H86A 2F51A 1M2BA 3TJJA 5B6MA 1EP8A 3LYKA 4AF2A 1SKWB 4K8MA 3LORA 2H0GA 2B1KA 1PQNA 2TIRA 2HRNA 3KZQA 3GV1A 3FR6A 5EVOA 4EF0A 2HE3A 5DALB 2CAIA 1X5EA 2ON5A 3CMIA 1T4ZA 1HQOA 3M9KA 4ZIJA 1O81A 4I8BA 3FYGA 4HUAA 5CNWA 3WGXA 3ZVJA 4K7OA 1SL2B 2AJQB 3EMXA 2B5XA 1GSSA 4K2DA 4HJMA 3EE2A 4NV2A 2H1BA 2H01A 3E9JB 2PERA 1C72A 3EVIA 2OE0A 3C7MA 1F3AA 1PL1A 1A2JA 3SWLA 1GL8A 2PPTA 3GIXA 1TKDB 1GLQA 1Q4JA 2HSYA 2PN8A 3TKRA 3ZTLA 3ZZXA 1TOFA 3C71A 1UA5A 3RBTA 1XBSA 3EMPA 3BCKA 4MA9A 5J9BA 4NAXA 4I2TA 3KCMA 4DSSB 3QDNA 4BL7A 5INYA 2LJRA 3APQA 2CVBA 2KHPA 4G2EA 1U87A 4AJ7A 4JZQA 2M46A 4MZBA 1V98A 4HDEA 2VL3A 4IHUA 4LMVA 5DAKA 3ZYWA 3IXRA 3TKSE 3QD9A 3ZL5A 3AY8A 1T3BA 1A0RP 4EUYA 4ZL7A 2C8UA 2V1MA 3RHBA 6GSWA 2MBTA 1SKSB 1YDKA 1A23A 3S9FA 2H72A 3RHCA 5D9XA 3M8NA 3LWAA 2P5QA 4QQ7A 3TKPA 2GLRA 3Q6OA 1SU9A 1F6MC 4IKHA 3TOTA 1GSFA 3FHKA 3TKSC 1YEXA 4CHSA 3LXZA 4IJIA 1K0BA 2H0IA 5A4WA 4F0CA 4LL4B 5KN3A 3L0HA 4WETA 3APSA 1OVNA 3PINA 2HZEB 3RAZA 4XS4B 3KP9A 1PA3A 4WKWA 3MDKA 5E59A 4WF4A 4MJAA 4ZB8A 5ENUA 6GSVA 3KMNA 2OBKA 3E3EA 3HKRA 5J5NA 3VPTA 4L8EA 4IVFA 3Q74A 2H70A 5HFGA 5G1LA 3O76A 5H5SA 4NWYA 4KCEA 4KDYA 4MDCA 3ZIJA 2VCVA 3GH6A 1K0AA 3IC4A 4GCIA 3ZIVA 3DVXA 1HYUA 5FHIA 5G5EA 3IRAA 3FW2A 5LNKe 4TKYA 1SK0A 2ZCTA 4MH3A 1MD3A 1XFLA 4EVMA 2GSQA 5ELGA 4FYBA 4XHMA 4K6XA 5IPHA 3IDVA 2EIRA 1WMJA 4O92A 4KSOA 3FEUA 1MDKA 2LKUA 2OE1A 3M1GA 2YCDA 1M9AA 1O8WA 3QAWA 4E8HA 4TN8A 1AQVA 1QMVA 2H6YA 2LNSA 3CXGA 2IMKA 1ILOA 2DJ0A 19GSA 5HFIA 5CRGA 5ECMB 3GMFA 2YWIA 3DEXA 1PX7A 2VL2A 1TRUA 2LQQA 4I6XA 4TRXA 4PQHA 5KN2A 4YQUA 3ZVJD 2F9SA 2M72A 5JCUA 1EWXA 1TXXA 4I2UA 1XW9A 1FVKA 1K3LA 1RK4A 1T00A 2C3QA 4MJEA 3C8EA 2WB9A 2N5FA 2AV4A 4CW9A 3F6FA 3GFKA 1EGOA 4POMA 3DRNA 3N9JA 5HR1A 3ZFLA 4JBBA 3GURA 3KJYA 1Q98A 2M80A 1XXUA 2PVQA 3KTBA 1S3DA 1V2AA 4JU5A 3UAPA 1O85A 3WT2A 1KBNA 5B8AA 2B7KA 2VLVA 4KCAA 3L9SA 2NBSA 5D73A 22GSA 2FLSA 1YF1A 2EC4A 4YQMA 5ECHB 4KA0A 4YH2A 2XPDA 4MP4A 2LRCA 3VLNA 3QCPA 3DGQA 3HCZA 2YJHA 3F3RA 2DJKA 5AN1A 1TJDA 4PGTA 1RW1A 5B8BA 1S3CA 3IPZA 2V32A 5B7CA 1FG4A 3US3A 1LBKA 3LG6A 5JCWA 3U6VA 1KNGA 5KN1A 1XVQA 4HI7A 1XOAA 4F03A 4ZB6A 2CZ3A 3Q19A 1OC9B 3GRXA 1Y25A 4V2LA 3O3TA 1O6JA 2GDRA 2K8VA 4XCSA 2HLSA 4OCEA 4OFNA 5F06A 2VL9A 2C1YA 3I43A 2LJKA 3UVHA 1R5PA 2OBIA 3GN3A 4EXJA 5JCGA 5ABRA 2QGVA 3EU3A 4L5OA 1JLWA 2YOIA 4KH7A 4TXOB 2HXKA 3HZ8A 4KUNA 3HD5A 3D0ZA 3HA9A 2MYGA 2LRTA 4GWRA 1DE1A 1JHBA 3R2QA 4KDUA 1DSBA 3D21A 2PU9C 1X0RA 1FVJA 2EIOA 3HDCA 2LSTA 4KE3A 6GSYA 1AAZA 3QAGA 3BJ5A 5KN0A 2A2RA 5DJLA 2GTUA 3P7XA 1JFUA 1GSEA 3G7JA 5LD0A 1V58A 1TI1A 4X43A 4KNDA 2DBCA 5DDLA 2K8SA 2J23A 2L5LA 4I5QA 2G2QA 2YV9A 5DQSA 3KMOA 2O85A 3VURA 2AB6A 3ME7A 1TRWA 4ML1A 1A2MA 1TP9A 1K0NA 5ECSA 3G9BA 1WP0A 1ACVA 2IMIA 2XPEA 1B9XC 2LQOA 2QC7A 5ECIB 1EOGA 1DBYA 4DSQA 1GNWA 1ZCPA 3TGZA 4NHZA 4HU7A 4KGIA 3GYKA 2J9HA 5A4VA 1TU8A 1MDIA 1BYEA 1OE8A 3BD2A 3IA1A 1EZKA 2BMXA 1X9WB 4KAEA 2NVLA 4TR1A 1PMTA 3TDGA 4F9ZA 1ZGNA 3IE3A 3HVVA 1VGLA 4Q5FA 3UMAA 4ECJA 2YJ7A 3NIVA 1GNEA 4K0NA 2I1UA 3HYPA 3VI7A 3W6GA 2O87A 3HXSA 2GVPA 2R37A 1PKZA 1X5DA 4MMMA 2DJ2A 3LJRA 1AUCA 1R4WA 1F37A 3VK9A 3D6IA 2LV3A 3GKXA 1KTEA 3U5RE 4K0GA 1B48A 1V40A 5F8BA 3GA4A 2BTOT 4ISDA 3GTUA 4F0BA 3GH9A 2NPBA 4HZ2A 14GSA 3H79A 2FWFA 2F8AA 5E4WA 3DYRA 2GZPA 1YZXA 3MAKA 3VWWA 2DMMA 3IV4A 3GKKA 3KTLA 5ELAA 3D4MA 2XC2A 1MDJA 2WJUA 1JZRA 5LCZA 4WR5A 5IMDA 1G0TA 3ME8A 3FZ4A 1LU4A 3GKNA 2E2GA 2KOKA 5FT3A 3HZ4A 3ERGA 5AGYA 4QL9A 2PMTA 4D73A 4J2FA 1FW1A 3FKFA 4N30A 3RPNA 4MLYA 1H4OA 1K3OA 3LEFA 1TK8B 4HQSA 4DSRA 2FY6A 5IOXA 3HVSA 3SBCA 5IMZA 5DVBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite