1Q45 | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	380
structure length	365
Chain Sequence	SNETLFSSYKMGRFDLSHRVVLAPMTRCRALNGVPNAALAEYYAQRTTPGGFLISEGTMVSPGSAGFPHVPGIYSDEQVEAWKQVVEAVHAKGGFIFCQLWHVGRASHAVYQPNGGSPISSTNKPISENRWRVLLPDGSHVKYPKPRALEASEIPRVVEDYCLSALNAIRAGFDGIEIHGAHGYLIDQFLKDGINDRTDQYGGSIANRCRFLKQVVEGVVSAIGASKVGVRVSPAIDHLDATDSDPLSLGLAVVGMLNKLQGVNGSKLAYLHVTQPREEEAKLMKSLRMAYNGTFMSSGGFNKELGMQAVQQGDADLVSYGRLFIANPDLVSRFKIDGELNKYNRKTFYTQDPVVGYTDYPFLAP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	X-ray structure of Arabidopsis At2g06050, 12-oxophytodienoate reductase isoform 3 pubmed doi rcsb
molecule keywords	12-oxophytodienoate-10,11-reductase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Arabidopsis thaliana
total genus	132
structure length	365
sequence length	380
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.1.42: 12-oxophytodienoate reductase.
pdb deposition date	2003-08-01

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1q45A00

4WJEA 4UXDA 1A5BA 2ZFAA 5IBXC 4JX6A 3NQEA 2YCEA 2QCEA 4NVTA 4O4WA 3W76A 1ONRA 3P60A 5DXYA 3PULA 3W2NA 2ATSA 2GJLA 1EWDA 3GNNA 1SSGA 4ZQRA 2C13A 2Y70A 3NPVA 4O52A 3A23A 1IF2A 3M41A 4POCA 4EWND 4AHPA 5AYXA 2DZXA 4IXHA 2V5BA 1AW1A 3UQNA 4JEQA 4JYEA 1Z48A 2WSQA 5D33A 4UFJA 3S5YA 1W3TA 3PM6A 1XUZA 3OEXA 3N14A 4NNBA 1DJNA 5AC6A 3G8EA 2E6DA 3C2OA 4QJ1A 4ADUA 8TIMA 5CZSA 3GK0A 3GXPA 4C1KA 2Y63A 4NJGA 2B7NA 3QSTA 2E77A 1AW5A 3UWUA 5E1QA 1M6JA 1RQHA 2ZYFA 5I3FA 3G24A 3GDRA 3MBDA 4FNTA 4KFOA 3TQ0A 1CX9A 3C6CA 1GG1A 2CU0A 1V7YA 4KKXA 1KFBA 5D2TA 1TIMA 4LVBA 2O7SA 3EKLA 3OVPA 3ABRA 3UPWA 3VE7A 3L5AA 3PAJA 4MJMA 4HPXA 4EF9A 4GC4A 1VS1A 3TCEA 4FB7A 4UTKA 3WJXA 3NR0A 2QKFA 4O13A 1FQ0A 1W5MA 3BVJA 2VFHA 2ZZ4A 3QPYA 4EOUA 1MO0A 4NJJA 3EWXA 1S5TA 1HFBA 1RQEA 1HO4A 3M1ZA 3HMJG 4AEOA 1XBZA 2Q8ZA 2YDAA 3Q2DA 1W8SA 2RDUA 4JR5A 1XC4A 3IIVA 4XKYB 2Y85A 3MP5A 4AWUA 3B0PA 2FQIA 4MPQA 3QPZA 3A5VA 5FI8A 1W3IA 1IXPA 1KLYA 5HULA 3PG9A 1PCWA 3HPSA 2BX7A 4KWVA 4JTIA 3ATYA 3W7KA 5G1TA 5D37A 2YR1A 3ABOA 2I14A 4R53A 1N7KA 3M16A 1EP3A 1W0MA 3VNDA 3LTPA 4K39A 2EPHA 3T44A 5D32A 1F74A 4AF0B 4MLJA 5I3GA 1GPWA 3BW4A 2A5HA 3B05A 2PRMA 3BW3A 1M7OA 3CWNA 3EX2A 4TMCA 4LVAA 4UIOA 1O5KA 2Y88A 4RX0A 4IPJA 2J9ZA 2Z0IA 3LCWA 3MJYA 3OIXA 4O11A 1B9BA 1HL2A 2ZTKA 3S5ZA 5C6MA 4NXSA 2QCCA 1R2TA 3R8RA 1QCWA 2WNNA 3N9RA 4RLIA 3TJLA 2GQAA 3RFAA 2PURA 1T99A 5EBUA 2YFOA 1AMKA 4IGHA 4IMEA 2C6QA 2Q3RA 2DZVA 1X1OA 3NQ6A 5EPDA 1SO3A 3UY8A 1SO5A 1WX0A 2X1UA 4RXFA 1GVQA 1I2NA 3HQ1A 3C2VA 5G5IA 1FX6A 3SJ3A 4JICA 4QIUA 3TAKA 1QOPA 3I65A 2R94A 1DKWA 1PIIA 4WD0A 3CEUA 5DN1A 4UTWC 2WSRA 3GNDA 3SY5A 3R2GA 3EXRA 1S3HA 2ABBA 4PFMA 4JY8A 1KTBA 2YFNA 1GWJA 5DBTA 5CSRA 1C29A 1U83A 3CEPA 3NQDA 1O5XA 2RFGA 3GDLA 3KX6A 2Z6JA 5LNWA 3TNOA 3LCXA 1H61A 3SR7A 3BV4A 5H91A 2PRLA 3CIWA 7TIMA 3JRKA 2BTMA 2WJZA 4JNMA 1ICPA 2A85A 4NZJA 2QCDA 4LRTA 2AQWA 3N19B 3STFA 3P84A 4PCFA 1GG0A 2V9DA 4G1KA 3W7HA 5D2XA 3W7EA 1LCOA 5K9XA 4PA8A 3NQAA 4K8HA 4XQ6A 4XBKA 3RU6A 1TREA 2YGYA 1W5PA 1TO3A 2J9XA 2A6LA 1YXYA 2C1HA 5L6UA 5H2ZA 2QUTA 5D09A 2B4GA 1VCGA 3TC7A 1J4EA 4FEZA 1GT8A 1YXDA 1UASA 2Y61A 2Q3OA 1GQNA 1JQVA 5E0KA 1W5OA 1CW2A 5CG7A 4WX2A 2AAMA 1LORA 4K37A 3TK7A 3QQ0A 3RLVA 3V1PA 3AO0A 4LS0A 1H7RA 4UTIA 2XFWA 5K7JA 4TU1A 5KMYA 3W7NA 5KZMA 3O16A 3HGSA 5DXXA 2CZDA 3LX9A 6ALDA 1OX5A 4UTUA 5U4NA 1GYLA 3WJZA 5D38A 4MZ1A 3UZJA 1HUVA 3YPIA 4LY8A 3NZRA 4MYXA 3CIXA 5G1YA 4RXGA 3LHTA 3LOTA 1R47A 2VELA 1H1YA 3WK2A 3W7RA 4U28A 3NQMA 4OU1A 5IBXA 3DFOA 2W0UA 3DFPA 3LRKA 4LRSA 5KITA 3G1VA 3GLCA 1WOBA 2R14A 2YSWA 3NL2A 3W84A 3B04A 3QMSA 5SWUA 1TV5A 1H7WA 1QDSA 3LRLA 1P0NA 3TSMA 1WA3A 1TQXA 5D2YA 3C0JA 4QM1A 3TC6A 2QUUA 1HTIA 2CW6A 4DBDA 1XDMA 4N6EA 5EA9A 5LNRA 3ATZA 2QDHA 1P5BA 4S2CA 4R7JA 3DFQA 3OVQA 3NQ2A 3W1LA 4KFNA 1FDZA 3QQ1A 1JQXA 2CLHA 2B7PA 5IM51 3G1FA 1UUMA 2TSYA 3LBMA 1Q3NA 1DVJA 3MUXA 1MSSA 1OFPA 2O7QA 2FPYA 3DAQA 2EAWA 3CM4A 3E9AA 2YW4A 3QYQA 4P2VA 1YTDA 4LUIA 1EP2A 4TMBA 2X30A 2H8ZA 5FF4A 3GIYA 4W9TA 5HR6A 2HSAA 3H53A 3VFLA 4MUZA 1GTEA 1UB3A 2V82A 1KV5A 2CLFA 3GXNA 5J5RA 5BMWA 4OE7A 3O6DA 2E6YA 1YPIA 4Z1CA 1QAPA 4JS3A 2E5DA 4JTJA 4YLWA 1ZAHA 3HGRA 2RHGA 4JTSA 3B03A 3E0IA 3TKFA 1SW7A 3W7OA 5AHEA 2NV1A 3MBFA 3P62A 3U2OA 2VFDA 5AC8A 4JGDA 2CWNA 2A7RA 3PBVA 2ALDA 1GZGA 1THFD 3PY2A 2I1OA 4AF0A 1F7BA 1MXSA 3DI1A 2VFGA 3BGGA 3M6YA 1RQBA 2BXVA 2RDTA 4Z0SA 2E1DA 2H90A 3MI6A 4JDYA 4RZ5A 4AAJA 1VYPX 2X1SA 1PHWA 5HINA 3TXVA 1G6CA 2QUVA 1ML1A 4MY1A 4UNKA 2AGKA 3W9ZA 5K4XA 3M5YA 2OJPA 1BWLA 1I2OA 5D30A 3EX4A 4HKPA 3M7WA 3LHWA 1QPRA 1ZAJA 4E2BA 5K9DA 1RZMA 4JTLA 2CZEA 5KZDA 2ZZ5A 3DZ1A 3M5XA 4JDBA 3DFNA 4HNVA 3GZ3A 1TPEA 1W3NA 3ZWSA 3IIOA 1B57A 3LB0A 3W22A 1IXQA 2NWSA 4GRSA 4BFAA 3HOJA 2ZZ2A 3LERA 3B4UA 4ALDA 1LTDA 4JTEA 1KA9F 5F1UA 4DF0A 1YPFA 5K4ZA 2NXIA 4WY0F 2JKPA 1W54A 4LTSA 2QCMA 3B0VC 4FO4A 2ABAA 3A5FA 2Q8LA 1SZGA 2FPTA 4N9EA 5CZJA 3HG3A 1F6PA 3SGZA 3MHGA 1VYSX 4LVFA 3W2MA 5F4XA 3BGJA 4QNWA 1U5JA 1D3GA 2HMCA 4OV4A 3FFSA 2X16A 4LOCA 4HIBA 1NF0A 1TPC1 3ZWTA 4YXGA 3MW7A 4ZL1A 5F2GA 4XBSA 2ZZ7A 3TQVA 3KRUA 3LDVA 2ZRXA 4GJ1A 2OT0A 2VENA 1KM4A 1VRDA 4HHPA 3T55A 1NEYA 3Q37A 1JCXA 2E5CA 3E02A 1FCQA 3W3OA 4N2YA 4JTTA 4S1FA 5HQEA 1AG1O 3L66A 3L0NA 4MLRA 4MVAA 2TPSA 2A6NA 3VI2A 1KTNA 5HUPA 1KFCA 1YDOA 4DF2A 2OX1A 4B5NA 4DO6A 3PUOA 2B7QA 4WY0B 3G3DA 2RH9A 2GPTA 3FLUA 4UFHA 1B3OA 4NU7A 1K7EA 1OFEA 2GQ8A 2EF9A 5TIMA 4O8RA 3ZR4A 3F1QA 4CQAA 4N02A 1DORA 1WOAA 3HBLA 5FEXA 3G1DA 1F73A 3N2XA 1OK4A 3DBPA 4PH6A 2YW3A 4Y8FA 1MZHA 3RLUA 6TIMA 3TSBA 2NX3A 1FY6A 2G5WA 5F2MA 3P61A 4ADTA 1CI1A 4N6FA 1JJKA 2ZRVA 3INPA 1O60A 3P5YA 1TTJA 4IMGA 1M5WA 3LXBA 5ABTA 3NQVA 1UBSA 3R13A 2ZDRA 3QW3A 3T4CA 4U4MA 3FA5A 3R89A 2XN0A 1VHCA 4GUIA 4UFKA 4RK8A 4O16A 4UTLA 4A2RA 3I68A 3T7VA 3LLFA 4UMBA 4O1DA 3KAOA 1HG3A 1TTPA 4DO4A 5AYZA 1QO2A 1NVMA 4FXRA 4IXXA 1XBYA 1QPOA 4LUJA 4ORIA 1VCVA 3LRMA 1T0OA 4IJBA 3G3MA 3TQKA 2W6RA 2A0NA 1KW1A 5BOOA 1E51A 3PC0A 2QF7A 4X2RA 4OGZA 1TRDA 3HIJA 5I3IA 3NO5A 3TJXA 3A9IA 1FDYA 1JRBA 1F76A 4N9BA 5D2VA 3UWYA 1KM6A 1LLWA 5AHFA 2ZRUA 3W2UA 3W1RA 2FB2A 5D02A 3W1UA 3BK0A 4M5PA 4JYFA 2HS6A 2KZHA 4O50A 3L2IA 2ZA3A 1GJPA 2Y6ZA 3IVTA 4O12A 1RPXA 1F5ZA 3DENA 2GUUA 2A2IA 4N4QA 2R8WA 2DP3A 1JCMP 3SIZA 3CHVA 3M44A 1MEHA 2YYTA 5AOUA 5EY5A 5G4EA 2Y7EA 4LU0A 1W1ZA 1DQXA 1XDLA 2CLOA 5MHBA 4GUGA 3A22A 4LC6A 4JXCA 3BPWA 5DLCA 1F6KA 1R46A 3DGRA 3FJ6A 1EIXA 4H4IA 4YL2A 1S5WA 5LSMA 3DFTA 1R30A 2FIQA 5HR7A 3O8AA 1GTHA 4FNRA 2ZZ1A 1SU5A 1G4TA 4M7SA 5G2HA 5LHFA 1VLIA 1P0KA 2NUWA 3C3NA 1H50A 1AL8A 4FX8A 1P1XA 2GVLA 3GR8A 1K03A 4NJIA 1QFEA 3ABSA 3M0ZA 4NZFA 2ZCGA 1VH7A 1YDNA 2WPBA 2H6RA 3G22A 1LRTA 1MEWA 4N4PA 2VFIA 4P61A 1WBJA 4ZQPA 1ZHAA 4O4VA 1K02A 2VEPA 4HN4A 1KFJA 3O6YX 4FX7A 3UWWA 4JIQA 3O07A 3W2KA 3EXTA 4CQ8A 4RCXA 1DOSA 3KVLA 2V0TA 5F1VA 3SECA 3W07A 1TMHA 1JCNA 4GE8A 1VC4A 3CWOX 4MZYA 4JD4A 3W7PA 1FUYA 4DF1A 4UNLA 3HG4A 1SZEA 3EKZA 3WK1A 1TCDA 3W72A 3N2MA 4MOZA 2E68A 1G4PA 4HSOA 5HWJA 3G0XA 3FKRA 3VCRA 1KFKA 3UXAA 3EWZA 4LVGA 3G1XA 3QW4B 1BEUA 3W7IA 1OFBA 4AXKA 1FWSA 1LDCA 2JKAA 1L9WA 1SR9A 4A3UA 3THAA 4OQVA 1I4NA 1ZAIA 5CZ0A 2ZRYA 3KRSA 3QFEA 1NSJA 4AVFA 2QCFA 3GB6A 3W1MA 5AB3A 4QITA 3JR2A 1EB3A 1G67A 2CLMA 4AHOA 2X1TA 3S5NA 3C2FA 4LS2A 4NNCA 1JUEA 4E0CA 4X22A 1WBHA 2E5BA 4QNEA 4IWWA 1LBMA 4HT3A 4XZ9A 1OFAA 2DZTA 1KM0A 4O54A 5I3KA 4ZQOA 5HUOA 3S1UA 1IIHA 3T78A 1EEPA 1OJXA 3M5VA 2IQTA 1O94A 1QO5A 2C18A 3GAKA 3L0KA 5BMXA 3HPXA 3S1VA 3W75A 2QCGA 3GAYA 1WYIA 4DPPA 2NWRA 3EWUA 2H3DA 5L9FA 1AL7A 4FNQA 3IRDA 3E96A 1Z42A 4NQ1A 1GVFA 4DPQA 1EX5A 4GUHA 4GUJA 1M7PA 2QJHA 4H6KA 4LW7A 3DFSA 4O15A 2HS8A 4ML9A 1W5NA 5FF2A 3OG3A 1FCBA 1LP6A 4WY0A 3IEBA 4O17A 2JGQA 1OK6A 4WQ6A 4N9DA 3O06A 2A21A 3EWWA 4GUFA 4X3ZA 3EWBX 4CLMA 1K8YA 2C16A 3M5ZA 3L5MA 3OBKA 5I3JA 1J5TA 2B0MA 1L6WA 4WXZA 4FNUA 3UWQA 2I9EA 1FCUA 4UC5A 1OABA 1TPB1 1G4SA 4DO5A 3CT7A 1H63A 3BG3A 2VC6A 4IMDA 1LOQA 3TE9A 2GQ9A 3N73A 4JTHA 4CCDA 3MP3A 3PG8A 4Q33A 4A2SA 1YLVA 4FX6M 2Y7DA 3P7YA 3G18A 3FS2A 1DBTA 1W5QA 3QC3A 5KTLA 4LWWA 1KV8A 5C5YA 5E93A 4ZZ9A 3KXQA 1TSIA 1QOQA 2PC4A 4KWWA 2Y62A 3AJXA 3S1XA 4PL1A 1W56A 3HG5A 1PL9A 4JTGA 3C4UA 3NPWA 2FJKA 3NG3A 3THQA 3FIGA 3KVMA 2VOMA 1NFBA 1KM3A 1ZCOA 1Q6LA 3B8DA 4C1LA 4TIMA 1YTKA 1Z44A 4MYAA 1IXNA 3WJYA 4K8EA 3TROA 1LZOA 4ICNA 3HO8A 2ZZ6A 4IPIA 3PSVA 1OFQA 4ZQMA 2J9YA 2VEMA 3STCA 5G4WA 2OT1A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1Q45A

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